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Glossaire
Dans ce glossaire, seuls certains termes importants dont lemploi est courant sont
mentionns, avec dans certains cas lquivalent en anglais, tant donn la prdominance
des publications dans cette langue. Ce glossaire ne fait pas double emploi avec lindex
des matires. Certains termes sont dfinis brivement car leur signification est
gnralement bien connue. Dautres font lobjet dun dveloppement plus important,
avec incorporation de donnes rcentes complmentaires.
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A
Acclimatation (acclimatation) : modification temporaire dun organisme qui lui permet
de rsister un stress d des variations importantes des caractristiques du milieu. Les
cas les mieux connus concernent lacclimatation aux basses tempratures ou aux
tempratures leves chez des animaux tels que des poissons ou des insectes. La
rsistance aux basses tempratures hivernales dinsectes des rgions arctiques et des
poissons des mers antarctiques est due la scrtion de molcules qui fonctionnent
comme des antigels. Le phnomne dacclimatation se manifeste aussi, chez les
poissons des rgions tempres, par des variations saisonnires de la temprature ltale
suprieure qui est plus leve en t quen hiver. La production de protines de choc
thermique (Heat Shock Proteins ou HSP) est un phnomne dacclimatation qui permet
un insecte comme la fourmi du Sahara Cataglyphis bombycina de rsister une
temprature de 50 C pendant dix minutes.
Accomodat (accomodat) : modification morphologique non hrditaire dun organisme
soumis des facteurs abiotiques diffrents de ceux de son milieu habituel. Le botaniste
Gaston Bonnier a montr quune plante de plaine comme Helianthemum vulgare
acquiert, lorsquelle est cultive en montagne, une morphologie (tiges courtes, feuilles
petites, fleurs vivement colores) qui rappelle celle de diverses plantes de montagne.
Adaptation (adaptation) : type particulier de structure ou de fonction dun organisme
qui lui permet de subsister et de se reproduire dans un milieu avec plus de succs que si
cet tat tait diffrent.
Agroforesterie (agroforestry) : type de culture dans lequel une ou plusieurs plantes
herbaces ou arbustives sont cultives sous le couvert des arbres. Les arbres produisent
lombre ncessaire pour viter la perte deau par vaporation et le desschement du sol.
En outre, les arbres fournissent du bois et divers fruits. Lagroforesterie pratique dans
certains pays tropicaux permet le maintien dun couvert forestier et vite la destruction
totale de la fort.
Agrosystmes (agrosystems) : cosystmes artificiels constitus le plus souvent par une
seule plante cultive ou par un seul animal lev, qui sont caractriss par leur
homognit spatiale et leur faible biodiversit, surtout dans les zones de grande
monoculture. Luniformit gntique des plantes cultives les rend sensibles aux
attaques des ravageurs. Les agrosystmes sont dpendants de lhomme qui doit le plus
souvent apporter des engrais, lutter contre les ravageurs, pratiquer lirrigation dans le
cas des cultures qui, comme le mas, consomment beaucoup deau, etc.
Allee (effet) (Allee effect) : nom donn lavantage que procure certains animaux la
vie en groupes de quelques individus de la mme espce. Leffet Allee a t nomm
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daprs lcologiste amricain Walter Clyde Allee qui le proposa en 1931 comme
explication de lagrgation des animaux, et qui a beaucoup insist sur le rle de la
coopration dans la rgulation des comportements. Les avantages lis leffet Allee
sont de deux ordres : la rduction des menaces causes par les prdateurs, et
laugmentation de lefficacit de lexploitation des ressources. Chez le Ctac Orcinus
orca (orque ou paulard) qui chasse en groupes, lefficacit dans lingestion des proies
est maximale pour les groupes de trois individus et elle baisse ensuite. Chez les pigeons
ramiers, la vie en groupe augmente la vigilance et la distance de fuite et rduit beaucoup
le succs des attaques par un autour des palombes.
Allle (allele) : un des divers tats que peut prendre un gne.
Amensalisme (amensalism) : interaction dans laquelle une espce est limine par une
autre qui scrte une substance toxique. Les Pridiniens du genre Gonyaulax,
responsables du phnomne des eaux rouges (ou mares rouges), rejettent des
substances toxiques qui diffusent dans leau et peuvent entraner la mort de toute la
faune environnante. Le phnomne des eaux rouges est frquent dans certaines lagunes
littorales de Mditerrane. Le terme alllopathie (allelopathy), employ pour les
vgtaux est synonyme de amensalisme. La scrtion par la petite Compose Hieracium
pilosella dune substance toxique pour de nombreuses plantes annuelles et qui inhibe
leur croissance est un phnomne dalllopathie. Il en est de mme de la production par
le noyer Juglans nigra dune substance, la juglone, qui inhibe le dveloppement de
certaines plantes. Antibiose (antibiosis), galement synonyme damensalisme, est un
terme utilis dans le cas des bactries. Pour lutter contre le crown gall, une maladie due
la Bactrie Agrobacterium tumefasciens qui attaque plus de 500 espces vgtales, on
utilise une souche dune autre bactrie, Agrobacterium radiobacter, qui produit une
nucloprotine capable de bloquer la formation des tumeurs dues au crown gall.
Amoco Cadiz : Deux causes importantes de pollution ptrolire qui ont touch les ctes
de France et provoqu des mares noires catastrophiques sont laccident du Torrey
Canyon le 18 mars 1957 et celui de lAmoco Cadiz le 16 mars 1978. LAmoco Cadiz est
un ptrolier gant qui sest chou sur la cte nord de la Bretagne en face du port de
Port Sall. Cet accident a libr 223 000 tonnes de ptrole lger et 4 000 tonnes de
ptrole lourd. Lors de son extension maximale la pollution a touch 300 km de ctes de
la Bretagne et elle sest tendue jusqu 50 km au large Dans le fond de certaines baies
abrites et dans des vasires littorales qui avaient reu dimportantes quantits de
ptrole la pollution a persist plus de 13 ans aprs le naufrage. Des tudes sur les effets
de cette mare noire ont t poursuivies pendant plusieurs annes dans la zone
intertidale de deux baies bretonnes, lAber Wrachs et lAber Benoit, et dans la zone
subtidale de la baie de Morlaix. La bonne connaissance de la faune et de la flore de cette
rgion a permis de comparer ltat des lieux avant et aprs la catastrophe. La mare
noire a caus une destruction immdiate de la totalit de la faune. Au bout de quelques
mois les hydrocarbures avaient perdu une partie de leur toxicit et lon a pu observer de
profonds changements dans la faune, dans limportance relative des diverses espces
dont certaines sont restes presque absentes tandis que dautres espces opportunistes
ont mme dpass leur abondance primitive, ainsi que lapparition despces trangres
au peuplement originel. La situation tait redevenue peu prs normale la fin de
lanne 1980. Des recherches biochimiques ont rvl certaines ractions du
mtabolisme des animaux en prsence des produits ptroliers. On peut citer
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laugmentation importante, chez le poisson Blennius parvo, dune enzyme la
benzopyrne-mono-oxydase.
Aquaculture : le mot aquaculture est dintroduction rcente. Il dsigne lensemble des
activits ayant pour but llevage dorganismes marins animaux et vgtaux utiliss
pour lalimentation des hommes. Cet levage se fait gnralement dans des structures
fermes situes sur le littoral. Les espces concernes par laquaculture sont des
poissons (saumon, bar, anguille, daurade, poisson lait Chanos chanos, mulet, etc.), des
Crustacs (crevettes, Pnides), des mollusques (hutres, moules et divers autres
Lamellibranches) ainsi que des algues comme le nori Porphyra tenella, une algue
rouge consomme au Japon. lexception despces comme les hutres leves depuis
longtemps, laquaculture a surtout t dveloppe pour augmenter la quantit de
produits extraits de la mer tant donn que le rendement de la pche des poissons
sauvages semble avoir atteint un maximum compatible avec une exploitation durable.
Des difficults rsident dans la recherche de sites favorables, non pollus, dans la
matrise des cycles de dveloppement souvent complexes, dans la lutte contre les divers
ennemis (prdateurs et parasites) des espces leves, et dans la mise au point dune
alimentation convenable. Environ 75 % des produits de laquaculture viennent de la
rgion Indo-Pacifique. Le rendement lchelle mondiale tait le suivant, en millions de
tonnes, en 1975 : poissons : 4 5 ; algues : 1,1 ; hutres : 0,6 ; moules : 0,2 ; coquilles
Saint Jacques : 0,06 ; autres Mollusques : 0,07 ; crevettes et Pnides : 0,02.
Archobactries (archaebacteria) : organismes Procaryotes et unicellulaires qui, en
raison de leurs diffrences importantes avec les autres bactries, ont t classs par Carl
Woese en 1990 dans un phylum indpendant. Les Archobactries possdent des
caractristiques biochimiques originales et un gnome de trs petite taille. Beaucoup
sont classes dans la catgorie cologique des organismes extrmophiles, car elles
vivent dans des milieux ayant des caractristiques physico-chimiques trs particulires :
temprature leve, pH trs bas, salinit leve, etc. Les Archobactries ont une grande
importance thorique car ce sont des organismes pionniers qui ont colonis la terre ds
le Prcambrien et qui subsistent encore de nos jours. Au point de vue pratique les
Archobactries ont des enzymes actives dans des conditions de temprature ou de pH
inhabituelles pour les autres enzymes. Ces enzymes sont dj utilises largement dans
lindustrie.
Atmosphre (atmosphere) : totalit de la masse dair qui entoure la terre. On divise
latmosphre en quatre zones superposes : la troposphre, la stratosphre, la
msosphre et la thermosphre. La troposphre est la couche la plus interne. Elle a une
paisseur moyenne de 17 km et elle renferme 95 % de la masse totale de latmosphre.
Elle est constitue par 78 % dazote, et 21 % doxygne, ainsi que par des gaz rares dont
1 % dargon, 0,035 % de CO
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et de la vapeur deau. La temprature moyenne dans la
troposphre dcrot rapidement avec laltitude et passe de 20 C au niveau de la mer
-50 C la limite de la stratosphre. La tropopause spare la troposphre de la
stratosphre. La stratosphre stend de 17 km 48 km. Elle renferme la majeure
partie de lozone atmosphrique qui absorbe prs de 95 % du rayonnement ultraviolet
dorigine solaire, ce qui rend la vie possible sur la terre. Lozone agit aussi comme un
gaz effet de serre, et la temprature au niveau de la stratosphre remonte vers 0 C. La
msosphre correspond une couche qui stend jusqu 90 km et la temprature y
descend jusqu -90 C. La thermosphre est la couche la plus externe ; son paisseur
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atteint 600 km et sa temprature peut dpasser 1 000 C en raison de lintensit du
rayonnement solaire. Lensemble msosphre + thermosphre constitue lionosphre
dans laquelle le rayonnement solaire ionise les constituants et sur laquelle se
rflchissent les ondes radio.
Autocologie, syncologie (autecology, synecology) : lautocologie est ltude des
rapports qui existent entre une seule espce (ou mme entre quelques individus dune
espce) avec divers facteurs du milieu comme la temprature, la pluviosit,
lclairement, la nature du sol, etc. La syncologie est ltude des rapports des individus
de toutes les espces, entre eux (prdation, comptition, mutualisme, parasitisme, etc.)
et le milieu. Le terme biocnotique, peu employ, est peu prs synonyme de
syncologie. La syncologie est statique et descriptive lorsquelle dcrit les
caractristiques des groupements despces ou biocnoses. Elle est dynamique ou
fonctionnelle lorsquelle tudie lvolution de ces groupements.
Autotrophe, chimiotrophe : le terme autotrophe dsigne lautonomie dun tre vivant
qui est capable de fabriquer lui-mme la matire organique ncessaire la formation de
ses tissus. Les organismes autotrophes sont les plantes vertes chlorophylliennes et
certaines Bactries chlorophylliennes qui utilisent la lumire solaire comme source
dnergie. Ce sont des organismes phototrophes. Dans la raction de la photosynthse
qui peut tre reprsente schmatiquement par
CO
2
+ 2 H
2
O _ (CH
2
O) + H
2
O + O
2
Le donneur dlectrons est leau H
2
O. Certaines autres Bactries peuvent fabriquer de la
matire organique en utilisant comme source dnergie loxydation de substances
minrales simples : ce sont des organismes chimiotrophes. Par exemple des Bactries
qui vivent prs des sources thermales profondes des ocans oxydent des sulfures pour
fabriquer de la matire organique, et elles remplacent ainsi les vgtaux chlorophylliens
dans un milieu o la lumire ne parvient pas. Les autres tres vivants (animaux,
champignons) doivent se nourrir aux dpens de la matire organique quils trouvent soit
chez les vgtaux, soit chez dautres animaux. Ce sont des htrotrophes. Actuellement
la production de matire organique par les organismes chimiotrophes est trs faible si on
la compare celle des vgtaux chlorophylliens phototrophes. Dans les ocans elle nest
que de 0,2 % de la production totale. On admet que lexistence actuelle des organismes
chimiotrophes rappelle les conditions de vie qui existaient sur terre au moment de
lapparition des premiers tres vivants.
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B
Bhopal : localit de lInde o en 1984 un accident est survenu dans une usine de
pesticides appartenant lUnion Carbide. Laccident a libr environ 36 tonnes
disocyanate de mthyle, un gaz hautement toxique utilis pour la fabrication des
pesticides du groupe des carbamates. On estime que 3 700 personnes ont pri et que
300 000 ont t intoxiques. Lusine est dfinitivement ferme et 2 800 personnes ont
perdu leur emploi. Laccident aurait pu tre vit un moindre cot en prenant des
mesures de scurit plus efficaces.
Bioamplification, (biological amplification) : l a bioamplification dsigne
laugmentation de la concentration dun produit non ou peu mtabolisable le long des
divers niveaux dune chane alimentaire, depuis le milieu ambiant et les producteurs
primaires jusquaux niveaux les plus levs des superprdateurs. La bioamplification est
un phnomne de grande importance lorsquelle concerne des substances toxiques.
Dans le cas des mtaux la bioamplification concerne le mercure et le csium 137
radioactif et, dans le cas des substances organiques, elle concerne divers insecticides
comme de DDT. Dans le milieu marin la concentration de DDT chez lhutre peut tre
100 000 fois suprieure celle de leau de mer. Le terme bioaccumulation (biological
magnification) est peu prs synonyme.
Biocnose (biocenose) : ensemble des espces qui peuplent un milieu bien dlimit
dans lespace, le biotope. La biocnose comprend des vgtaux, des animaux et des
micro-organismes. Elle est caractrise par une composition spcifique peu prs
constante et par des interactions nombreuses (comptition, prdation, parasitisme,
symbiose, etc.) entre les espces, ce qui assure le maintien de la stabilit. Le terme
communaut peut tre considr comme un synonyme de biocnose.
BIODEPTH (programme) : exprience cologique ralise simultanment dans
plusieurs pays europens. Cette exprience tait destine rechercher des relations entre
la diversit vgtale et la productivit des cosystmes. Elle a consist cultiver dans
un grand nombre de parcelles, et sous des climats diffrents allant de celui de la Sude
celui de la Grce, un ensemble de 2 16 espces vgtales. Elle a confirm lexistence
dune relation positive entre la biodiversit vgtale et la productivit.
Biodiversit ou diversit biologique (biodiversity, biological diversity) : ce concept,
apparu dans les annes 70, sapplique ltude des diverses formes de variabilit chez
les tres vivants, dans tous les milieux terrestres ou aquatiques. La biodiversit est
tudie trois niveaux de complexit croissante : la diversit gntique au niveau de
lespce ; la diversit des espces dans les divers taxa et au niveau de lensemble de la
biosphre ; la diversit des cosystmes. Mme dans des groupes que lon croit bien
connus comme les Vertbrs terrestres, la biodiversit relle est encore mal connue. La
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dcouverte despces, parfois de grande taille, a lieu tous les ans. On a dcouvert au
Viet-Nam en 1980 trois espces nouvelles de Ruminants voisins des antilopes. Dix
espces nouvelles de grenouilles ont t dcouvertes au Sri Lanka en 2002. Lexemple
peut-tre le plus remarquable est une dcouverte faite par une quipe internationale, qui
vient dtre publie en 2006. Les Foja Mountains en Nouvelle-Guine renferment
700 000 ha de fort primaire presque intacte, dont 300 000 ha qui navaient jamais t
pntrs par lhomme. Dans ce monde perdu , lexpdition a dcouvert en un mois
les espces nouvelles suivantes : 20 espces de grenouilles (dont une de moins de
14 mm), plusieurs espces doiseaux et de Marsupiaux, 4 espces de papillons et
5 espces de Palmiers. Chez les insectes, dont on a dcrit environ un million despces,
les estimations du nombre rel despces varient de 5 30 millions et mme plus selon
les auteurs. La destruction acclre de la biodiversit par les activits humaines est une
des plus graves menaces qui psent sur notre plante (voir biologie de la conservation).
La conservation de la biodiversit est ncessaire en agriculture. En effet lhomognit
des plantes cultives signifie souvent vulnrabilit envers les ravageurs. Un exemple le
montre. Dans les annes 70 une maladie virus a dvast les cultures de riz en Asie, de
lInde lIndonsie. Heureusement une espce sauvage, Oryza nivara, dcouverte
seulement en 1966, possde le gne de rsistance au virus. Elle a t croise avec le riz
cultiv et lhybride rsistant est maintenant cultiv sur plus de 100 000 km_.
Biogographie insulaire (insular biogeography) : la thorie de lquilibre dynamique
ou de la biogographie insulaire a t propose par Preston en 1962, dveloppe par
Mac Arthur et Wilson en 1963 et 1967, puis par leurs successeurs. Selon cette thorie la
richesse spcifique des peuplements insulaires dpend de lquilibre qui stablit entre
le taux dimmigration et le taux dextinction, ces taux tant exprims en nombre
despces par unit de temps. Le taux dimmigration diminue avec la distance de lle au
continent-source, et au fur et mesure que le nombre despces installes augmente. Le
taux dextinction augmente avec le nombre despces en raison des interactions lies en
particulier la comptition. Il augmente aussi lorsque les espces ont des faibles
effectifs, donc lorsque lle a une faible superficie. La combinaison de ces deux
processus permet dexpliquer la richesse du peuplement. La relation qui lie la surface S
de lle et le nombre N despces est :
N = kS
z
ou log N = log k + zlog S,
dans laquelle z est un coefficient gnralement compris entre 0,18 et 0,35 pour les les
vraies. surface et diversit structurale gales, une le renferme moins despces que le
continent voisin. La thorie de la biogographie insulaire a permis de prvoir et
dexpliquer de nombreuses observations, et elle a suscit beaucoup de travaux
thoriques et exprimentaux de grande importance. Mais elle a aussi des dfauts. Elle ne
tient compte que la surface de lle et ignore dautres caractristiques comme la diversit
des milieux (altitude, etc.) ; elle ignore aussi la biologie des espces et leurs diverses
aptitudes la colonisation ; elle ne tient pas compte du cas des espces endmiques
souvent nombreuses dans les les. La richesse spcifique de la faune des les est aussi
fonction de lanciennet. Aux les Mascareignes, lle Maurice dont la surface est de
1 865 km_ a plus despces de Coloptres de la famille des Chrysomlides que la
Runion dont la surface est de 2 512 km_. Ceci sexplique par lanciennet des les : la
Runion a seulement 3 millions dannes et Maurice 10 millions. On pense que dans les
les volcaniques comme les Mascareignes un genre nouveau peut arriver en moyenne
tous les 450 000 ans. La thorie de la biogographie insulaire a t tendue des les
terrestres (basins fluviaux, massifs forestiers, etc.) pour lesquelles le coefficient k est
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gnralement infrieur ou gal 0,17 en raison de la plus grande facilit qui est offerte
la colonisation par des espces nouvelles.
Bioindicateur (indicator species) : espce ou ensemble despces qui permettent de
caractriser ltat dun cosystme et de mettre en vidence le plus rapidement possible
toute modification naturelle ou provoque par lhomme. Exemples : espces des zones
de saprobies dans les rivires ; espces qui pullulent aprs une pollution. Des vgtaux
particulirement sensibles comme certains cultivars de tabac sont utiliss comme
rvlateurs prcoces de la pollution par lozone car ils prsentent des ncroses foliaires
faciles distinguer. Les espces sentinelles sont des bioindicateurs particulirement
sensibles aux variations des facteurs du milieu comme la temprature ou les pollutions
et qui ragissent suffisamment rapidement pour permettre de dtecter ces variations. Un
taux de mortalit anormalement lev, ou une accumulation rapide de polluants sont des
ractions des espces sentinelles. Il existe aussi des rgions sentinelles qui sont
caractrises par des conditions de temprature ou de pluviosit extrmes et dont
lensemble de la flore et de la faune peut prsenter des modifications bien plus rapides
que dans les autres rgions et rvler des changements des caractristiques du milieu.
La rgion antarctique dont la flore et la faune ont ragi trs tt laugmentation de
temprature due leffet de serre est une rgion sentinelle. Les indicateurs de
biodiversit sont des espces ou des groupes supragnriques comme des familles dont
la prsence permet de penser que les autres groupes danimaux sont galement bien
reprsents. lchelle mondiale les Coloptres de la famille des Cicindlids et les
Lpidoptres de la famille des Papilionids sont des indicateurs de biodiversit.
Biologie de la conservation (conservation biology) : expression rcente dsignant la
partie de lcologie qui recherche des approches scientifiques pour assurer la
conservation des espces, et plus particulirement de celles qui sont menaces de
disparition. La biologie de la conservation a t qualifie par M. Soul de science of
rarity and diversity . La biologie de la conservation a pris une grande importance
thorique et pratique depuis que lon a conscience de la destruction acclre des
espces et des milieux et de ses consquences catastrophiques. La connaissance de la
biologie, de la gntique, de la dmographie et du comportement des espces est
indispensable pour proposer des mesures de conservation efficaces. Par exemple, lors
des tentatives de rintroduction des espces, on sest aperu quil ne suffisait pas de
fournir de la nourriture et des abris pour que la population introduite augmente ses
effectifs et se rinstalle dfinitivement. Le maintien de populations assez nombreuses
est indispensable pour assurer leur variabilit gntique. Il faut aussi conserver des
milieux suffisamment vastes qui puissent hberger une population viable dans laquelle
la consanguinit ne conduit pas une simplification gntique nfaste. Il faut galement
faciliter les dplacements des animaux et leur reproduction. Cest pour cette raison que
lon installe sous les routes des tunnels (appels crapauducs) qui permettent au crapaud
Bufo bufo et au triton Triturus cristatus de se dplacer depuis leurs lieux dhabitat
jusqu la pice deau o ils vont pondre. La gntique a permis, en ralisant des tudes
de lADN des lphants partir de leurs dfenses, de distinguer les diverses populations
et de reprer sur les marchs livoire qui provient de rgions o lespce, bien que
protge, est dcime par les braconniers. Une bonne connaissance de la systmatique
est galement ncessaire. Des tudes gntiques ont montr que lours europen
comprend plusieurs populations distinctes, dont lours pyrnen qui forme une
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population originale au bord de lextinction. La conservation de la diversit gntique
des espces et de la biodiversit spcifique est ncessaire en agriculture.
Biomasse (biomass) : poids des organismes vivants exprim soit en poids frais, soit en
poids sec, soit en carbone organique. La biomasse peut tre value pour une superficie
dtermine, pour une espce ou un groupe dorganismes dtermin. La biomasse
exploitable des poissons marins est appele standing crop par les auteurs de langue
anglaise.
Biome (biome) : macrosystmes (cest--dire cosystmes de dimensions rgionales)
qui sont peu prs homognes au point de vue climatique, en particulier en ce qui
concerne la temprature et les prcipitations, et qui possdent galement une vgtation
caractristique. En raison de la distribution frquente des grands climats en zones plus
ou moins parallles depuis les ples jusqu lquateur, les biomes ont aussi, le plus
souvent, une rpartition zonale. Le nombre de biomes que lon peut distinguer varie
selon la prcision que lon apporte dans leur dfinition. Les principaux biomes sont les
suivants :
- biomes des rgions tempres froides : taga, forts de conifres de la cte ouest
de lAmrique du Nord ;
- biomes des rgions tropicales humides : forts quatoriales, laurisylve ;
- biomes des rgions arides et semi-arides : savanes, steppes continentales, dsert,
toundra ;
- biomes constitus par les formations herbaces naturelles : prairie, steppe ;
- biomes de montagne : ces derniers, en raison de linfluence prpondrante de
laltitude, nont pas de distribution zonale.
Biosphre : concept cr par le gologue autrichien Suess en 1875 et dvelopp par le
russe V. I. Vernadsky en 1929. La biosphre est la partie superficielle de la terre qui
hberge lensemble des tres vivants. Cest une mince pellicule ( lchelle de la plante
dont le diamtre est de 6 000 m) qui recouvre en partie la lithosphre, lhydrosphre et
latmosphre. Dans les ocans la vie est prsente jusquaux plus grandes profondeurs
cest--dire jusqu 11 100 m. Dans lHimalaya, on peut voir voler des oiseaux jusqu
plus de 8 000 m. Dans la lithosphre ltendue connue de la biosphre a
considrablement augment puisque lon a dcouvert la profondeur de 2 700 m, la
bactrie Bacillus infernus qui vit dans un milieu dont la temprature est suprieure
100 C. Le terme cosphre peut tre considr comme synonyme de biosphre.
Biotope : surface (ou volume) dont les caractristiques physiques et chimiques
relativement uniformes permettent linstallation et le maintien dune espce ou dune
biocnose.
Burgess (schistes de) (Burgess Shale) : gisement fossilifre du Canada qui a fourni une
remarquable faune dInvertbrs datant du Cambrien et tudie en 1989 par le gologue
Simon Conway Morris. Cette faune a t interprte de deux faons opposes. Selon
S. J. Gould, il existe dans les schistes de Burgess de nombreux reprsentants de phyla
qui ont t dcims et sont aujourdhui disparus. Dautres palontologistes admettent
que, malgr leurs formes parfois tranges, ces fossiles appartiennent des phyla encore
prsents de nos jours.
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C
Capacit biotique (biotic capacity) : nombre maximum dindividus dune espce (ou
biomasse maximale) quun milieu peut hberger. Dans lquation de la croissance
logistique la capacit biotique est reprsente par le paramtre K.
Cascades trophiques (trophic cascades) : interactions qui se produisent principalement
en milieu aquatique dans des systmes plusieurs niveaux trophiques, les modifications
de labondance des organismes autotrophes producteurs pouvant ragir sur labondance
des prdateurs et rciproquement. Les cascades trophiques sont qualifies de bottom-
up (cest--dire de bas en haut) lorsque les modifications des lments nutritifs
disponibles pour le phytoplancton entranent des variations dabondance au niveau des
prdateurs, et de top-down (cest--dire de haut en bas) lorsque la rduction de
labondance des producteurs retentit sur labondance du phytoplancton. Exemple de
cascade trophique top-down : dans un lac des tats-Unis une mortalit massive des
poissons mangeurs de plancton, ainsi que la quasi-disparition des corgones qui sont
des poissons prdateurs, ont t provoques par une vague de chaleur. Ceci a permis
un grand Cladocre, la daphnie Daphnia pulicaria qui navait plus de prdateurs de se
multiplier aux dpens de la petite espce Daphnia galatea. Laugmentation de la taille
et de labondance des daphnies a augment la prdation sur le phytoplancton qui est
devenu rare.
Changement global (global change) : on dsigne ainsi un ensemble de modifications
dues laction de lhomme qui affectent lensemble ou une grande partie de la terre.
Les principales manifestations du changement global sont : laugmentation de la
temprature moyenne du globe et ses consquences (fonte des glaces, lvation du
niveau de la mer, modifications de la rpartition de beaucoup despces terrestres et
marines qui migrent vers le nord) ; les perturbations du rgime des pluies et
laugmentation du nombre et de la force des ouragans, la destruction de la couche
dozone stratosphrique ; les chutes de pluies acides sur de nombreuses rgions.
Chimiotrophe (chemoautotrophic) : organisme qui produit de la matire organique en
utilisant des molcules non organiques simples comme source dnergie. Beaucoup de
Bactries sont chimiotrophes. Les Thiobacillus obtiennent leur nergie en oxydant le
sulfure dhydrogne, et dautres Bactries utilisent lnergie obtenue en transformant
par oxydation les composs ferreux en composs ferriques.
Chane alimentaire (food chain) : suite dtres vivants dans laquelle les uns mangent
ceux qui les prcdent avant dtre mangs par ceux qui les suivent. Une chane
alimentaire simple comprend des organismes producteurs autotrophes (les vgtaux
chlorophylliens), les consommateurs de premier ordre (les animaux herbivores), de
second ordre (les animaux carnivores), les organismes dcomposeurs (gnralement des
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bactries). Les chanes alimentaires ne sont pas isoles, mais elles sont relies entre
elles par des organismes polyphages pour former des rseaux trophiques.
Chloroflurocarbones (chlorofluorocarbons) ou chlorofluoromthanes, en abrg
CFC : Composs organiques renfermant du chlore et du fluor qui sont connus sous le
nom commercial de frons. Il existe plusieurs CFC. Les composs CFCl
2
et CF
2
Cl
2
taient utiliss comme propulseurs pour les arosols. Les composs CFHCl
2
et CF
2
HCl
servaient dans les rfrigrateurs et les appareils air conditionn. Les CFC sont des
molcules trs stables dont labsence de toxicit et la non inflammabilit les ont rendues
trs attractives dans lindustrie. Mais une fois dans la haute atmosphre elles sont
dissocies sous laction des rayons UV et elles librent leur chlore, ce qui provoque la
destruction de la couche dozone. Pour cette raison la production des CFC a t rduite
de 50 % par le Protocole de Montral en 1987, et elle est totalement interdite dans tous
les pays.
CITES (Convention on International Trade in Endangered Species) : cette convention
internationale connue aussi sous le nom de convention de Washington rgle le
commerce international des espces menaces.
Cline (cline) : Le mot cline dsigne, dans une espce, des diffrences morphologiques
ou physiologiques qui sont lies la rpartition gographique. Les populations situes
aux deux extrmits dun cline sont souvent suffisamment diffrentes les unes des
autres pour tre confondues avec des espces diffrentes. Exemples de clines : la
msange charbonnire Parus ater comprend 21 sous-espces qui sont distribues dans
lhmisphre nord en Europe, en Afrique du Nord et en Asie. Le trfle europen
Trifolium repens forme un cline qui est caractris par une augmentation, dans le sud de
son aire de rpartition, de laptitude librer du cyanure lorsque les feuilles sont
dilacres. Cette aptitude est sous contrle gntique et elle est considre comme une
adaptation qui permet de lutter contre les insectes phytophages plus nombreux dans les
rgions mridionales.
Covolution (coevolution) : notion introduite en 1964 par P. Ehrlich et P. Raven. La
covolution est lensemble des changements qui apparaissent lorsque deux espces, qui
sont en interaction, voluent paralllement. La covolution fournit une meilleure
adaptation en modifiant la morphologie et/ou le comportement des deux espces en jeu.
Parmi les nombreux cas de covolution connus, le plus frquent est celui des insectes et
des plantes fleurs qui ont volu paralllement durant toute lre tertiaire, ce qui a
permis une importante spciation au niveau des insectes phytophages (en particulier
chez les insectes pollinisateurs) et au niveau des vgtaux qui ont adapt la structure de
leurs fleurs et la composition chimique de leurs tissus selon les insectes qui les
exploitent.
Commensalisme (commensalism) : tat dun animal qui vit en contact troit avec une
autre espce et qui en tire un avantage non rciproque, par exemple en profitant de ses
rsidus alimentaires ou en trouvant une protection contre des ennemis. Exemple de
commensalisme : lanmone de mer Adamsia palliata qui est associe au bernard-
lhermite Eupagurus prideauxi le protge contre ses ennemis grce ses filaments
urticants et la production dune membrane rsistante qui prolonge et protge louverture
de la coquille dans laquelle vit le bernard-lhermite. La phorsie, qui est le transport
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passif dAcariens vivant fixs parfois en nombre sur le tgument de certains insectes
comme les Geotrupes, peut tre considre comme une forme de commensalisme.
Composs secondaires des plantes ou CSP (secondary plant chemicals) : les CSP sont
des molcules fabriques par les plantes qui, le plus souvent, ninterviennent pas dans
leur mtabolisme. On les considre gnralement comme des moyens de dfense contre
les attaques des insectes car ils ont soit une action rpulsive, soit une action toxique. Il
existe au moins 10 000 CSP dont 4 500 alcalodes et 1 100 terpnes. Les tannins sont
des CSP prsents dans les feuilles du chne qui se combinent aux protines de
lalimentation et qui inhibent les enzymes digestives des insectes. Du mois davril au
mois de septembre les feuilles du chne vieillissent et se chargent de plus en plus en
tannins ; simultanment le nombre despces de Lpidoptres dont les chenilles
attaquent les feuilles de ces chnes diminue. Dans les forts tropicales, les arbres
possdent davantage de CSP qui assurent la dfense chimique et lintensit de la
consommation des feuilles par les insectes y est nettement infrieure ce quelle est
dans les forts tempres. La nature des CSP joue un rle important dans la
dtermination de la richesse en espces et en individus des insectes phytophages qui
attaquent une plante dtermine. La grande majorit des insectes mineurs de feuilles
sont monophages. Les diverses espces de saules renferment des phnylglucosides en
proportions diverses et chaque espce de saule est attaque prfrentiellement par
diverses espces de Chrysomlides.
Les coumarines sont des CSP toxiques particuliers qui sont prsents dans une
trentaine de familles, dont les Ombellifres. Ils protgent les vgtaux contre les
attaques des insectes. Les plantes ainsi protges ont subi une intense radiation
volutive en labsence dattaques des insectes ; tandis que les insectes qui se sont
adapts des plantes renfermant des coumarines ont pu, en labsence de comptiteurs,
se diversifier en de nombreuses espces.
Confrence de Rio, ou Confrence des Nations Unies sur lEnvironnement et le
Dveloppement . Cette confrence, qui sest tenue Rio de Janeiro en 1992, a eu des
consquences pratiques peu importantes. Elle a cependant eu le mrite dattirer
lattention du grand public sur les menaces qui psent sur la biodiversit.
Consanguinit (inbreeding) : ce terme dsigne le croisement entre individus apparents
et gntiquement proches. Dans une population panmictique les croisements entre
individus se font au hasard ; dans certaines autres populations, les croisements ne se
font pas toujours au hasard et la frquence des htrozygotes peut tre diffrente de
celle qui est calcule partir du thorme de Hardy-Weinberg. Si H est la frquence
relle observe et H
o
la frquence thorique calcule, le coefficient de consanguinit F
est donn par la formule :
F = (H
o
H) / H
o.
La

consanguinit a un effet dpresseur sur les populations et elle peut conduire leur
disparition.
Coopration (cooperation) : interaction non obligatoire entre deux individus de la
mme espce ou despces diffrentes, dont chacun peut vivre isolment. La
coopration procure des avantages aux individus en interaction. Elle peut se faire entre
individus appartenant la mme espce. Exemples : la nidification collective de certains
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oiseaux comme le pic amricain Melanerpes formicivorus qui vit en groupes familiaux
dune quinzaine dindividus, dfend un territoire commun et constitue un stock collectif
de glands destins lalimentation. Elle peut aussi se faire entre individus despces
diffrentes comme les sternes et les hrons, ce qui permet ces oiseaux de se protger
plus efficacement contre les prdateurs.
Croissance des populations : au point de vue thorique la croissance des populations
peut se faire selon deux modalits : la croissance exponentielle (exponential growth) et
la croissance logistique (logistic growth). La croissance exponentielle se produit dans
un milieu o les ressources et lespace disponibles sont abondants et quasi illimits. Si
N est leffectif de la population et t le temps, la croissance exponentielle est reprsente
par lquation dN / dt = rN, ce qui scrit aprs intgration N = N
0
e
rt
. Le coefficient r est
appel taux daccroissement naturel. Il varie beaucoup selon les espces et il est gal
la diffrence bd entre le taux de natalit b et le taux de mortalit d. Dans une
croissance exponentielle, la population crot de plus en plus rapidement, et elle tend vers
linfini. La courbe reprsentative des effectifs en fonction du temps a la forme de la
lettre J. En coordonnes semi-logarithmiques, lorsque les valeurs des effectifs sont
reprsentes selon une chelle logarithmique, la courbe reprsentative devient une
droite. Un calcul simple montre que le temps de doublement des effectifs dune
croissance exponentielle est constant. Une anecdote illustre la rapidit de la croissance
exponentielle : supposons que des nnuphars recouvrent un tang en 30 jours, en
doublant leurs effectifs chaque jour. Le 29
e
jour la moiti seulement de ltang est
recouverte et le 30
e
jour suffit pour recouvrir le reste de ltang. La croissance
exponentielle est trs rare dans les conditions naturelles. La population humaine a subi
une croissance exponentielle pendant longtemps. La consommation de ptrole a subi
une croissance exponentielle, au moins entre les annes 1870 et 1980, avec un temps de
doublement de 10 ans. La croissance logistique est reprsente par une courbe en
forme de S appele courbe logistique dont la dcouverte revient au mathmaticien belge
P. F. Verhulst en 1838. Dans les conditions naturelles lespace et les ressources sont
limits et la croissance dune population est soumise des rsistances de la part du
milieu qui ne peut supporter quun nombre maximum dindividus K. Cette rsistance
est reprsente par le facteur (K-N) / K et lquation de la croissance exponentielle
devient lquation logistique :
dN / dt = rN(K-N) / K
ou, en intgrant : N = K / (1e
art
) dans laquelle a est une constante dintgration
gale la valeur de N lorigine. K est la capacit limite du milieu ou capacit biotique
maximale. Aprs une priode de croissance rapide quasi exponentielle, la population
passe par un stade de croissance maximale, puis par une phase de ralentissement
progressif. La courbe logistique qui fait intervenir des facteurs dpendants de la densit
est plus raliste que la courbe exponentielle. Cependant elle ne se vrifie dans quelques
cas simples. Cette conception a cependant eu lavantage de permettre lintroduction du
concept despce stratgie r et despce stratgie K qui a eu une grande valeur
heuristique.
Cultures associes (intercropping) : pratique consistant cultiver deux ou plusieurs
vgtaux simultanment dans le mme champ. Souvent la pratique des cultures
associes rduit les attaques des insectes ravageurs et elle procure un rendement
suprieur celui dune culture seule. Exemple de cultures associes : une crale
produisant des glucides et prlevant beaucoup dazote dans le sol et une lgumineuse
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riche en protines qui enrichit le sol en nitrates en fixant lazote atmosphrique. Dans
certaines rgions du sud-ouest de la France on cultive ensemble du mas et des haricots.
Autres exemples : pois et avoine, soja et avoine, canne sucre et mas, tomates et
concombres, banane et caf.
Cycle biogochimique (biogeochemical cycle) : processus naturel qui permet le
recyclage des lments minraux nutritifs prsents sous diverses formes depuis le milieu
jusquaux tres vivants et, rciproquement, depuis les tres vivants jusquau milieu. Les
cycles biogochimiques principaux concernent le carbone, lazote, le soufre, le
phosphore. Le cycle de leau diffre des autres cycles puisque la molcule deau nest
pas modifie.
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D
Demande Biochimique en Oxygne (DBO
5
) (biochemical oxygen demand BOD) :
quantit doxygne ncessaire pour oxyder la matire organique prsente dans un
volume deau dtermin, la temprature de 20 C et pendant 5 jours. La valeur de
la DBO
5
donne une mesure de limportance de la pollution organique des eaux. Elle
varie de 3 4 mg/L dans le cas des eaux pures, plusieurs dizaines de mg/L dans le cas
des eaux trs pollues.
Dme : petite population dont les individus sont adapts un seul arbre et qui sont
incapables de subsister sur un autre arbre. Lexistence de dmes a t signale surtout
chez des insectes suceurs de sve comme la cochenille Nuculaspis californica qui vit en
Amrique du Nord sur Pinus ponderosa. La spcialisation est parfois si troite que le
dme peut disparatre la mort de larbre hte, la cochenille tant incapable de
coloniser un autre arbre. La formation de dmes peut conduire lapparition de races et
mme despces sympatriques si les flux de gnes entre les populations sont
interrompus. Un exemple est celui du Lpidoptre Choristoneura fumiferana qui existe
sous une forme lie Abies balsamea et quelques Picea, et une forme lie divers
Pinus. Ces deux formes constituent deux populations sympatriques suffisamment
isoles pour tre considres comme des espces jumelles.
Dendrochronologie (dendrochronology) science qui utilise ltude des cernes annuels
de croissance des arbres pour rechercher les variations passes du climat et dater des
vnements historiques. Ltude de sujets trs vieux appartenant lespce Pinus
aristata ( bristle-cone pine ) qui poussent en altitude dans les White Mountains de
Californie a montr que ces arbres atteignent 4 600 ans. En tablissant des corrlations
avec des chantillons de bois mort trouvs au pied de ces arbres, il est possible de
remonter 8 200 ans. Ces recherches ont tabli que les dates obtenues laide du
radiocarbone 14 et antrieures 1 000 ans avant notre re taient en ralit beaucoup
trop jeunes. Daprs une calibration publie en 1970, les dates antrieures -6 000 ans
devaient en ralit tre proches de -7 000 ans et que, par consquent, les datations
publies avant cette date de 1970 devaient tre considres comme vraisemblablement
errones. En Caroline du Nord, ltude des cernes dun Taxodium distichum a montr
que lanne 1587 avait t la plus sche depuis 800 ans. Une nouvelle priode de
scheresse aussi svre a dur de 1606 1612. Elle a concid avec larrive de
104 colons venus dEurope. La famine lie la scheresse a eu de terribles
consquences : les archives rvlent que 38 seulement des 104 colons ont survcu.
Dplacement de caractre (character displacement) : ensemble des changements
morphologiques qui apparaissent chez une espce sous linfluence des pressions de
slection dues la prsence dans le mme milieu de une ou de plusieurs espces
voisines. Des exemples classiques de dplacement de caractres peuvent tre trouvs en
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particulier chez les Gospizins ou pinsons de Darwin des les Galpagos, et chez deux
espces de Gastropodes marins du genre Hydrobia des ctes du Danemark.
Drive (drift) : le mot drive a deux sens. Un premier sens dsigne lentranement par le
courant des torrents et des rivires dune partie des Invertbrs dont la plupart sont des
larves dinsectes aquatiques. On admet quil existe un courant compensant la drive et
lappauvrissement du cours suprieur des cours deau. En effet, les insectes adultes et
ails issus des larves aquatiques ont tendance remonter le cours des rivires avant de
pondre.
Le deuxime sens correspond la drive gntique (genetic drift) qui est une
modification alatoire dans les frquences de divers allles au sein dune population. La
drive gntique est surtout importante dans les petites populations.
Dtritivore (ou dtritiphage) : organisme vivant qui se nourrit de substances organiques
mortes, de dtritus divers.
Dveloppement durable (sustainable development) : dveloppement qui rpond aux
besoins du prsent sans compromettre les chances de survie des gnrations futures. Le
dveloppement durable ne peut se raliser que si les progrs de lconomie plantaire ne
se font pas aux dpens de la biosphre et de la biodiversit.
Dispersion (dispersal) : La dispersion des tres vivants peut tre passive ou active. La
dispersion passive est un mode de dplacement qui se fait sans intervention de
lorganisme, soit grce lintervention de facteurs abiotiques comme le vent, soit grce
lintervention dautres tres vivants. Le transport des Acariens phortiques par divers
insectes est un type de dispersion passive. Un exemple rcemment lucid de dispersion
passive est fourni par la rpartition gographique des diverses espces de Gastropodes
du genre Balea qui sont connues dans une vaste rgion allant de lEurope aux les
atlantiques (Madre, Azores) et aux les australes Tristan Da Cunha et Gough, trs
isoles dans le sud de locan Atlantique. Ltude de lADN a tabli que les affinits
des diverses espces de Balea sont souvent sans rapport avec leur rpartition
gographique. Cette contradiction disparat si lon tient compte du mode de dispersion
qui se fait grce des oiseaux se dplaant souvent au hasard et transportant les
Mollusques colls par de la boue sur leurs pattes. Il semble que lespce primitive de
Balea occupait larchipel des Aores do elle aurait t propage dans diverses rgions
du globe o des espces distinctes se sont ensuite diffrencies en raison de lisolement
gographique. La dispersion active existe chez des individus qui quittent leur habitat
dorigine pour un autre habitat. Les espces qui restent dans leur habitat dorigine sont
appeles philopatriques. La dispersion soppose la migration qui suppose un retour
lhabitat dorigine, ce qui est le cas de beaucoup doiseaux. Les causes de la dispersion
sont nombreuses. Il peut sagir dun comportement destin viter la consanguinit
comme cela a t tabli chez divers Mammifres ; de la fuite dun milieu devenu
inhospitalier ; de la comptition. Laptitude la dispersion varie beaucoup selon les
espces. Elle est faible chez les espces insulaires.
Dynamique des populations (population dynamics) : tude des variations de
labondance des populations animales et vgtales et de la recherche de leurs causes. La
thorie des pches utilise essentiellement pour la pche industrielle en mer, peut tre
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considre comme une partie de la dynamique des populations. Elle consiste
considrer le pcheur comme un agent prdateur responsable de la mortalit dune
certain pourcentage de poissons, et den dduire les consquences pour tablir des
modles prvisionnels qui serviront tablir des quotas de pche, surtout dans le cas
despces menaces par la surexploitation (surpche ou overfishing).
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18
E
cotone (ecotone) : zone de transition plus ou moins tendue entre deux cosystmes,
par exemple entre un massif forestier et les champs cultivs, au niveau des rives dun
lac ou des rivages marins. Dans le cas dune transition rapide (parfois quelques mtres
ou mme moins) lcotone est une l i si re. Les conditions microclimatiques
intermdiaires entre celles des deux cosystmes qui rgnent dans lcotone permettent
le mlange despces, et souvent (mais pas toujours) linstallation despces
particulires. Il en rsulte un enrichissement du nombre despces qui est qualifi
deffet de lisire.
cotron : structure exprimentale construite lImperial College de Londres pour
ltude de divers sujets dcologie. Cet cotron est constitu par 16 enceintes dans
lesquelles on simule divers milieux en contrlant la temprature, lclairement,
lhumidit, la pluie, etc. Des micro-cosystmes comportant jusqu 30 espces de
plantes et 4 niveaux trophiques ont pu ainsi tre tudis dans des conditions de milieu
rigoureusement dtermines. Un cotron est en construction en France prs de
Montpellier. Aux tats-Unis, la structure Biosphere 2 construite prs de Tucson
dans lArizona est un cotron gigantesque o sont reconstitus divers biomes temprs
et tropicaux, terrestres et aquatiques.
cotype (ecotype) : variation lintrieur dune espce dun ensemble dindividus
prsentant des adaptations des conditions de vie particulires.
Effet de serre (greenhouse effect) : augmentation de la temprature moyenne due
labsorption du rayonnement infrarouge mis par la terre, principalement par le CO
2
atmosphrique ainsi que par le mthane et lozone. En labsence datmosphre la
temprature moyenne de la terre, qui est de 15 C, serait voisine de -100 C et la vie
impossible. Leffet de serre est un phnomne naturel, qui a t amplifi par les
importants rejets dus aux activits humaines, de CO
2
et dautres gaz effet de serre
(mthane, CFC). Cette augmentation de leffet de serre a des effets catastrophiques dont
on commence seulement mesurer lampleur.
El Nio : phnomne climatique qui se produit tous les 2 7 ans vers Nol (do son
nom) sur les ctes du Prou. Il sagit dun rchauffement pouvant atteindre 3 C de la
temprature des eaux de surface qui empche la remonte des eaux profondes et qui se
conjugue avec une modification de la pression atmosphrique, (appele Southern
Oscillation) dans lOcan Pacifique au voisinage de lAustralie. Ceci provoque une
lvation de la temprature des eaux de surface pouvant atteindre 3 4 C (le nom de
ENSO parfois utilis provient de la contraction de El Nio et de Southern Oscillation).
Le phnomne contraire appel El Nia est provoqu par des vents forts venus du
continent amricain qui repoussent les eaux chaudes vers le large et qui provoquent un
DUNOD 2006 - Prcis d'cologie - Roger Dajoz
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abaissement de la temprature des eaux de surface de 1 2 C. Les annes de fort
El Nio, des perturbations climatiques importantes se manifestent dans diverses rgions
du globe : pluies diluviennes qui entranent des inondations, ou au contraire vagues de
scheresse accompagnes dincendies. Au niveau de la faune, les populations de
beaucoup danimaux comme les Gospizins des les Galpagos, ou les Pinnipdes des
ctes amricaines sont profondment perturbes et appauvries ; le rendement de la
pche aux anchois sur les ctes pruviennes seffondre, ainsi que les effectifs des
oiseaux producteurs de guano.
Endmisme : une espce endmique est localise dans une rgion plus ou moins
tendue dont laire peut varier de quelques mtres carrs celle dune le ou dun massif
montagneux. Chez les Vertbrs, un exemple dendmisme extrme est fourni par les
petits poissons Tlostens du genre Cyprinodon connus sous le nom de pupfish qui
habitent une partie du dsert du Nevada et de Californie. la suite de la fragmentation
de lancien rseau hydrographique prsent au Quaternaire sous laction de laridification
du climat, des populations se sont isoles et elles ont volu indpendamment les unes
des autres. Une pice deau connue sous le nom de Devils Hole dont la surface nest
que de quelques mtres carrs hberge une espce, Cyprinodon diabolis, strictement
limite cet habitat. Parmi les Invertbrs, le Coloptre Carabus olympiae,
aujourdhui teint aprs la destruction de son habitat, tait limit quelques hectares
dans le val Sessera dans le nord de lItalie. Parmi les vgtaux, la violette Viola
diversifolia et lOmbellifre Xatardia scabra occupent seulement quelques hectares
dboulis haute altitude du massif du Puigmal dans les Pyrnes-Orientales. En raison
de leur extrme localisation et de la faible abondance de leurs populations, les espces
endmiques sont particulirement vulnrables. Les espces, et parfois les genres et
mme les familles endmiques sont particulirement nombreux dans les les. Dans
larchipel des Canaries on connat 13 espces de lzards appartenant au genre
endmique Gallotia, chaque le hbergeant plusieurs espces ou sous-espces. Lespce
la plus grande et la plus rare, que lon a pendant longtemps cru disparue, est Gallotia
simomyi qui atteint 60 cm et qui est localise sur une petite aire de 1 500 2 000 m_
renfermant moins de 100 individus. Cette espce vit parmi des rochers presque
inaccessibles de lle de Hierro. Comme beaucoup despces endmiques, Gallotia
simonyi est menace de disparition par la destruction de son habitat et par ses faibles
effectifs. Les rgions du globe particulirement riches en espces et en endmiques sont
appeles des points chauds (hotspots). Ces rgions, qui sont au nombre de 25, forment
seulement 1,4 % de la surface des terres mais elles hbergent un nombre important
despces dont 13 % des plantes endmiques de la flore mondiale.
Environnement (environment) : selon le Conseil international de la langue franaise, il
sagit de lensemble des agents physiques, chimiques, biologiques et des facteurs
sociaux susceptibles davoir des effets directs ou indirectes, immdiats ou terme, sur
les tres vivants et les activits humaines . Ce nologisme, issu de langlais, est
pratiquement synonyme du mot franais milieu quil a presque totalement supplant.
Espce-cl (keystone species) : espce qui joue un rle important dans le maintien de la
biodiversit et du bon fonctionnement des cosystmes. Dans les marais de Floride
lalligator est une espce cl. Ce Reptile creuse de vastes dpressions ou leau persiste
durant les priodes de scheresse, ce qui fournit de leau et de la nourriture des
espces qui autrement disparatraient. Le bison est aussi une espce cl qui permet le
DUNOD 2006 - Prcis d'cologie - Roger Dajoz
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maintien de la diversit vgtale dans la prairie nord-amricaine. Certains
superprdateurs appartenant un niveau trophique lev sont des espces cls car ils
contrlent labondance des espces prdatrices appartenant un niveau trophique
infrieur, et ils permettent ainsi des espces herbivores de subsister. Lenlvement,
dans un rseau trophique littoral, des toiles de mer du genre Pisaster qui sont des
superprdateurs, se traduit par une diminution du nombre despces et par la pullulation
des moules qui envahissent le peuplement.
Eutrophisation (eutrophication) : phnomne caractris par un enrichissement
important dun milieu aquatique en lments minraux et/ou organiques souvent, mais
pas toujours, dorigine anthropique. Ceci entrane une forte augmentation de la
production de matire organique, des fermentations anarobies dans les couches
profondes, une disparition progressive de loxygne et un remplacement des organismes
primitifs par des espces caractristiques des eaux eutrophises.
vapotranspiration (evapotranspiration) : ensemble de lvaporation provenant de la
surface du sol et de leau transpire par les vgtaux.
ExxonValdez : le ptrole provenant des champs ptrolifres situs dans le nord de
lAlaska prs de Prudhoe Bay est transport par oloduc jusquau port de Valdez au sud
de lAlaska, puis par tankers jusqu la cte ouest des tats-Unis. Le 24 mars 1989, le
ptrolier Exxon Valdez sest chou sur un rcif et 22 % de sa cargaison soit 42 000 m
3
ont t librs en mer, causant la plus importante mare noire des eaux territoriales des
tats-Unis ainsi que la destruction dune zone sauvage rpute pour la richesse de sa
faune. Le bilan officiel de la catastrophe est de 36 471 oiseaux tus (dont 151 aigles
tte blanche, espce protge), 1 016 loutres de mer, 30 otaries et un nombre
indtermin de poissons. Lindustrie de la pche qui rapportait 100 millions de dollars
par an a t mise en pril et 5 000 km de ctes ont t pollus. Les consquences de
cette pollution due la ngligence ont t ressenties pendant au moins une dizaine
dannes.
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21
F-G
Facteur cologique : tout lment du milieu, biotique ou abiotique, susceptible dagir
sur les tres vivants, au moins durant une phase de leur cycle de dveloppement. Un
facteur abiotique (abiotic factor) est un facteur cologique dont lorigine rside dans les
caractristiques physiques ou chimiques du milieu. Un facteur biotique (biotic factor)
est un facteur cologique d laction dun tre vivant, et qui peut tre la prdation, la
comptition, le parasitisme, le mutualisme, etc. Les facteurs cologiques biotiques sont
dpendants de la densit (density-dependent factor) tandis que les facteurs abiotiques
sont indpendants de la densit.
Flux dnergie (energy flow) : cette expression dsigne le passage de lnergie travers
les divers niveaux trophiques dune chane alimentaire. Lnergie lumineuse dorigine
solaire qui est capte par les vgtaux chlorophylliens autotrophes est transmise aux
herbivores puis aux divers niveaux de carnivores. Le faible rendement de la
transmission de lnergie dun niveau lautre est d surtout aux pertes respiratoires. Ce
faible rendement explique que les espces prdatrices et superprdatrices qui se trouvent
au sommet des chanes alimentaires disposent de trs peu dnergie, que leur abondance
numrique est limite, ainsi que le nombre de niveaux trophiques possibles. Un calcul
montre que, dans le cas dun cosystme qui reoit 10
6
kcal/m_/jour dnergie
lumineuse, lnergie disponible au niveau des carnivores secondaires nest plus que de
0,25 0,50 kcal/m_/jour, soit un rendement aussi faible que 0,000025 0,00005 %.
Gaia : Gaa est le nom de la desse de la terre chez les anciens grecs. lhypothse Gaa a
t propose par Lovelock et Margulis en 1974. Selon cette hypothse la terre est
vivante. Cest un vaste superorganisme dou dautorgulation, relativement stable,
qui contrle lvolution des espces et des caractristiques physico-chimiques du milieu
o elles vivent. Parmi les arguments avancs pour justifier lexistence de mcanismes
dautorgulation lchelle de la plante, se trouve la composition de latmosphre
terrestre telle quelle est en prsence des tres vivants et telle quelle serait en labsence
de la vie. Latmosphre actuelle comprend deux gaz prdominants, lazote et loxygne,
et beaucoup dautres moins abondants comme CO
2
, NO
2
, CH
4
, H
2
et divers gaz rares
.
En
labsence de vie CO
2
, O
2
, N
2
et CO seraient les gaz les plus abondants tandis que H
2
et
CH
4
seraient absents. Ces variations de composition de latmosphre retentissent sur la
temprature moyenne de la terre qui serait reste infrieure -20 C si les gaz CO
2
et
CH
4
responsables principaux de leffet de serre taient moins abondants ou absents. La
temprature moyenne est en ralit constamment suprieure 0 C depuis au moins
2 milliards dannes. La comparaison de la terre avec un tre vivant nest pas une ide
nouvelle. Elle remonte 1785 lorsque le gologue cossais James Hutton comparait le
recyclage des lments nutritifs dans le sol et les mouvements de leau avec la
circulation du sang et dclarait que la terre devait tre tudie comme un tre vivant
avec les mthodes de la physiologie. Cette conception du superorganisme nest plus
gure admise de nos jours.
DUNOD 2006 - Prcis d'cologie - Roger Dajoz
22
Greenpeace : organisation internationale dont lactivit essentielle est la lutte contre la
prolifration nuclaire et la protection des milieux et des espces menaces (baleines,
etc.) Lpisode qui a rendu clbre lorganisation Greenpeace est celui du Rainbow
Warrior, un bateau qui tentait dintervenir pour empcher les essais nuclaires effectus
dans latmosphre au-dessus de locan Pacifique, et qui fut coul le 10 juillet 1985
dans un port de la Nouvelle-Zlande sur ordre du gouvernement franais.
Guilde (guild) : Notion cre par R. B. Root en 1967 lors de son tude sur un oiseau
amricain, le blue-gray gnatcatcher Polioptila plumbea. Une guilde est un ensemble
despces qui, dans un peuplement, exploitent les mmes ressources de la mme
manire. Une guilde est un ensemble fonctionnel despces qui sont souvent, mais pas
toujours, voisines au point de vue systmatique. Ainsi dans le dsert de lArizona il
existe une guilde danimaux granivores trs diffrents au point de vue systmatique,
forme de Rongeurs et de fourmis. Selon Root les espces dune guilde ont une position
comparable dans la classification des modes dexploitation du milieu, lensemble des
espces dun mme genre en systmatique. En raison de la complexit et de la diversit
de la vgtation, les guildes sont plus nombreuses dans les forts tropicales que dans la
fort tempre. Par exemple, on trouve dans les forts tropicales des guildes de
Mammifres frugivores qui sont absentes des forts tempres.
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H-L
Hardy-Weinberg (thorme de) : thorme qui tablit que la frquence des gnes dans
une population demeure constante dune gnration lautre tant que les croisements
entre individus se font au hasard (panmixie), quil ny a ni mutations, ni slection, ni
migration, ni immigration.
Htrotrophe : qualifie un organisme qui se nourrit de substances organiques.
Lek (lek) : mot dorigine sudoise. Un lek est une surface rduite dans laquelle les
mles de certaines espces doiseaux se runissent pour effectuer leur parades nuptiales
et attirer les femelles. Les leks sont connus en France chez loutarde canepetire et le
coq de bruyre, chez le coq de prairie en Amrique du Nord, etc.
Locus (pluriel loci) : emplacement dun gne sur un chromosome.
LTER (long term experimental research) : certains processus cologiques comme les
successions, ou bien les consquences des perturbations climatiques, des chutes darbres
en fort ou les incendies ne peuvent pas tre tudis seulement durant une courte
priode. Cest la raison pour laquelle un programme de recherches appel LTER devant
se poursuivre durant de longues annes a t lanc aux tats-Unis en 1980. Un
ensemble de 20 sites a t choisi dans des cosytmes varis comme la fort tempre
de conifres de lOregon, la toundra de lAlaska, la prairie herbes courtes (short grass
prairie) du Colorado, le dsert de Jornada au Nouveau-Mexique, un bassin versant
Coweeta en Caroline du Nord, etc. Ce programme a t tendu en 1993 divers autres
pays comme la Grande-Bretagne ( la station exprimentale de Rothamsted) et la fort
de Sude. Parmi les thmes abords figurent la productivit primaire et son contrle, la
formation et laccumulation de la matire organique, la frquence des perturbations,
lrosion dans un bassin versant. La lenteur des processus cologiques est montre par
lexemple de la dcomposition des troncs de sapin de Douglas qui, sous laction de
divers organismes, peut durer plus de 500 ans. Un programme de recherche qui doit tre
poursuivi sur un sicle dans une fort tempre de conifres (Andrews Experimental
Forest) de lOregon consiste abattre un arbre chaque anne pour rechercher les
organismes qui le colonisent et dterminer la vitesse et les modalits de la
dcomposition du bois.
Lutte biologique (biological control) : technique de lutte contre les espces nuisibles
qui nutilise pas des pesticides mais qui fait appel divers ennemis naturels des espces
combattre, comme des prdateurs, des parasites, ou des agents pathognes. Si
lennemi utilis est un micro-organisme, comme un virus ou comme la Bactrie Bacillus
thuringiensis, il sagit de la lutte microbiologique. Un avantage de la lutte biologique
est que, une fois installe, le contrle de lespce nuisible devient, thoriquement,
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permanent. Le but de la lutte biologique nest pas dliminer totalement une espce (ce
qui est impossible), mais de maintenir ses effectifs en dessous dun seuil de nuisibilit
partir duquel les dgts deviennent conomiquement ngligeables. ct de plusieurs
russites, il existe aussi quelques cas dchec de la lutte biologique. La lutte intgre
est la mise en uvre de toutes les techniques qui permettent daugmenter lefficacit de
la lutte biologique : emploi modr dinsecticides peu toxiques et rapidement
dgradables, modification des mthodes culturales comme la rotation des cultures ou la
pratique des cultures associes, modifications du comportement des insectes laide de
phromones, etc.
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M
Mangroves (mangroves) formations marines littorales localises principalement dans
les rgions tropicales et domines par des arbres appels paltuviers qui appartiennent
aux genres Rhizophora, Bruguiera, Sonneratia et Avicennia. Ces arbres possdent de
nombreuses adaptations physiologiques et morphologiques. Ils rsistent des teneurs en
sel variables selon leur emplacement par rapport au rivage et certains produisent des
racines ariennes qui se dressent hors de la vase et dont lpiderme est couvert de
minuscules ouvertures ou lenticelles, ce qui permet la respiration en dehors de la zone
de vase asphyxique.
Mtapopulation : ensemble de populations dune mme espce qui steignent et se
reconstituent grce des individus qui se dispersent dune localit lautre. La
dispersion des individus dune population permet la recolonisation des zones o
lespce est menace et rduit les risques dextinction. Ce phnomne constitue
ltalement des risques (spreading of risk).
Mtaux lourds (heavy metals) : Les mtaux lourds occupent les cases centrales de la
classification priodique. Ce sont, par exemple , larsenic, le cadmium, le cuivre, le
mercure, le plomb, le zinc, le chrome. Ils existent dans le milieu naturel de trs faibles
concentrations, sauf en cas de pollution. Certains comme le zinc ou le magnsium sont
indispensables de trs faibles doses, car ils sont des constituants denzymes. Tous sont
toxiques lorsquun certain seuil de concentration est atteint ou dpass et plusieurs sont
responsables de maladies : maladie de Minamata (mercure), saturnisme (plomb),
maladie dHoffs (arsenic), maladie dIta Ita (cadmium). Certaines plantes dites
mtallophytes peuvent pousser sur des sols anormaux riches en mtaux lourds et les
accumuler sans problmes en quantits importantes. Il existe de nombreuses donnes
qui montrent que des polluants chimiques comme les mtaux lourds reprsentent une
force slective importante dans le milieu aquatique. Certaines espces sont limines ;
dautres comme des Oligochtes ou des Chironomides prsentent, au bout dun certain
nombre dannes, des modifications gntiques qui entranent une rsistance accrue.
Dans tous les cas, les milieux contenant des mtaux lourds ont une plus faible diversit
spcifique que les milieux non pollus.
Mimtisme (mimicry) : Certains animaux peuvent chapper leurs prdateurs grce
un certain nombre de mcanismes de dfense : ils peuvent se dissimuler, senvoler,
rejeter des substances rpulsives et dfensives, tre couvert de poils, dpines ou dune
carapace, devenir trop gros pour tre attaqus ou trop petits pour tre mangs, ou bien
imiter le milieu dans lequel ils se trouvent par leur forme ou leur couleur. Les espces
immangeables se signalent frquemment par des colorations davertissement, ou
aposmatiques, parmi lesquelles le rouge est la plus frquente (cas des coccinelles).
Des prdateurs tels que les oiseaux apprennent vite viter ces proies aprs quelques
essais de consommation. Les espces ayant des colorations aposmatiques servent
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souvent de modles des espces comestibles qui sont ainsi protges. Ce type de
ressemblance est le mimtisme batsien (batesian mimicry). Le papillon amricain
monarch Danaus plexippus est immangeable car sa chenille vit sur des plantes du genre
Asclepias dont elle accumule les alcalodes toxiques. Le monarch est mim par le
papillon viceroi Limenitis archippus qui vit sur le saule et qui nest pas toxique. Dans
dautres cas plusieurs espces immangeables convergent dans leur apparence et elles
bnficient ainsi dune meilleure protection due leur abondance. Cette ressemblance
est le mimtisme mllerien (mllerian mimicry). Les exemples de mimtisme sont
nombreux chez les Lpidoptres des rgions tropicales. Le mimtisme est parfois
marqu par un important polymorphisme : chez le Nymphalide africain Pseudacraea
eurytus il existe 33 formes diffrentes de coloration qui, selon leur rpartition
gographique, imitent les divers modles avec lesquels ils cohabitent. Chez Papilio
dardanus seules les femelles ont, selon les rgions, des morphes diffrentes qui imitent
diverses espces de papillons immangeables de la famille des Danads. Les couleurs
davertissement et le mimtisme existent aussi chez dautres animaux. Des Coloptres
de la famille des Crambycides copient par leur forme et leur couleur des espces
immangeables de la famille des Lycides. Les grenouilles arboricoles amricaines du
genre Dendrobates ont des vives couleurs jaune, rouge, vert, bleu qui signalent quelles
sont immangeables. Parmi les formes de mimtisme moins rpandues, le mimtisme
agressif est connu chez les araignes-crabes Thomisus onustus et Misunema vatia. Ces
araignes chassent lafft en se posant sur des fleurs visites par les insectes butineurs.
Elles choisissent des fleurs dont la couleur jaune est semblable celle de leur corps. Ce
mimtisme offensif les dissimule la vue des insectes qui leur servent de proies, et il les
dissimule aussi la vue de leurs prdateurs qui sont des oiseaux. Les Coloptres
appartenant au genre Lebia imitent les larves ou les adultes de Chrysomlides du groupe
des Altises et les dvorent. Beaucoup dAltises sont toxiques et les Lebia en profitent
car elles acquirent leur toxicit en les consommant. Une plante de Guyane, Ormojea
coccinea ralise un type de mimtisme particulier destin leurrer les oiseaux
dissminateurs de graines. Les fruits de cette plante, qui ont une forme arrondie et une
couleur rouge miment dautres fruits ayant une pulpe rouge comestible. Ils ne
fournissent aucune ressource alimentaire aux oiseaux qui, cependant, se laissent
tromper, les ingrent et les dissminent. Certaines Orchides ont des fleurs qui
rappellent par leur forme celle des Hymnoptres qui assurent leur pollinisation. Elles
pratiquent mme un mimtisme olfactif en produisant des substances dont lodeur
rappelle celle des phromones sexuelles de leurs pollinisateurs.
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N-O-P
Niche cologique (niche) : ensemble des lments (biotiques et abiotiques) du milieu
qui sont ncessaires la survie dune espce. Selon une expression due Elton, la niche
cologique correspond au rle et la profession dune espce dans son milieu,
tandis que lhabitat (habitat) correspond son adresse .
Peuplement : ensemble des individus appartenant un groupe systmatique dtermin
et vivant dans un territoire dtermin. Exemples dans le milieu terrestre : peuplement
des oiseaux dune fort, peuplement des Coloptres de la famille des Carabidae dun
champ de bl ; dans le milieu marin : peuplement des petits Ctacs de la Mditerrane
occidentale.
Phnologie (phenology) : tude des variations que le climat fait subir divers
phnomnes priodiques tels que la germination ou la floraison chez les vgtaux.
Phromones (pheromones) : substances gnralement scrtes par des glandes
spciales mais qui, au lieu dtre rejetes dans lorganisme, sont libres dans le milieu
et modifient le comportement des organismes. Les phromones ont t dcouvertes chez
les insectes o elles jouent en particulier le rle dattractifs sexuels. Elles existent aussi
chez divers autres Invertbrs et chez les Vertbrs. Les phromones sexuelles,
nombreuses chez les Lpidoptres, sont libres par les individus dun sexe et elles
attirent les individus de lautre sexe, ce qui facilite laccouplement. Les phromones de
marquage des pistes existent chez les fourmis. Les phromones dagrgation, surtout
connues chez les Scolytides, incitent les individus se regrouper, ce qui facilite
laccouplement et aide vaincre la rsistance des arbres attaqus. Les allomones sont
des phromones bnfiques pour lespce qui les met ; les kairomones sont bnfiques
pour le rcepteur aux dpens de lmetteur ; les synomones sont bnfiques pour
lmetteur et pour le rcepteur.
Polymorphisme (polymorphism) : le polymorphisme gntique dsigne la variabilit du
gnome chez les individus dune population. Certaines populations ont leurs effectifs
fortement rduits sous laction de facteurs divers (chasse, catastrophes naturelles,
destruction du milieu). Dans ces petites populations, sous linfluence de la drive
gntique, le polymorphisme gntique devient faible, ce qui peut conduire
lextinction de la population. Ce phnomne de rduction des effectifs et du
polymorphisme a t appel par E. Mayr effet de goulot (bottleneck effect). La
rsistance aux conditions de vie variables et parfois dltres fournies par le milieu
diminue dans les petites populations dont la variabilit gntique est faible (voir
biologie de la conservation). Dans certains cas, la diversit gntique peut se
reconstituer aprs un effet de goulot et les sous-populations isoles peuvent voluer en
espces distinctes. Cest leffet des fondateurs (founder effect) de E. Mayr. Les
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Drosophilides des les Hawai rsultent dun effet des fondateurs : partir dune seule
ou de quelques femelles, plus de 700 espces adaptes souvent des milieux trs
particuliers se sont formes en moins de 700 000 ans, ge des les de larchipel.
Population (population) : ensemble des individus dune mme espce qui occupent
simultanment le mme milieu. Dans lindustrie de la pche on appelle stock la
population dune espce (ou parfois de plusieurs espces) limite une portion de laire
de rpartition. Exemple : le stock de harengs de la mer du Nord.
Potentiel biotique (biotic potential) : valuation du taux daccroissement maximal
dune espce en labsence de comptiteur, de prdateur, de parasite et lorsque la
nourriture et lespace disponibles ne sont pas limits. Le potentiel biotique est
gnralement trs lev mais il ne sexprime gnralement pas en raison de laction des
facteurs du milieu.
Principe de Gause (Gause principle) ou principe dexclusion comptitive (competitive
exclusion principle) : principe tabli aprs les expriences de Gause sur les Paramcies.
Selon ce principe, deux espces partageant les mmes ressources ne peuvent pas
coexister indfiniment dans un milieu stable et homogne et lespce la plus
comptitive finit par liminer lautre. Ce principe, qui a des exceptions, a cependant
permis dintroduire la notion de niche cologique qui a une grande importance
thorique.
Programme Biologique International PBI (International Biological Programm IBP) :
Programme de recherche international ralis de 1964 1974. Ce programme
comprenait 7 sections : productivit des cosystmes terrestres, processus de la
production dans le milieu terrestre et dans le milieu aquatique, conservation des
cosystmes terrestres, productivit des eaux douces, productivit des milieux marins,
adaptabilit de lhomme, utilisation et amnagement des ressources biologiques. Plus de
40 pays ont particip ce programme.
Pyrophile, pyrophyte : une espce dinsecte pyrophile est attire par les incendies de
fort, soit par la chaleur qui est dgage, soit par lodeur de la fume. Parmi les insectes
pyrophiles se trouvent les Coloptres du genre Sericoda et ceux du genre Melanophila.
Ces derniers possdent sur la face ventrale des organes rcepteurs des rayonnements
infra rouges, ce qui leur permet de localiser les arbres brls. Le terme pyrophyte, cr
par le botaniste Kuhnholz-Lordat, dsigne les vgtaux qui rsistent au feu grce
diverses particularits telles que des bourgeons situs au ras du sol ou des graines qui
rsistent la chaleur. Ces vgtaux sont nombreux dans la rgion mditerranenne o
ils sont favoriss par les incendies frquents qui liminent les autres vgtaux.
Exemples de vgtaux pyrophytes : les cistes, le chne kerms et le chne-lige, la
bruyre arborescente. La vgtation mditerranenne primitive a t presque partout
dtruite par le feu et remplace par des stades de dgradation appels selon les rgions
maquis, garrigue, matorral, dans lesquels dominent des buissons feuilles pineuses ou
persistantes souvent rsistantes au feu.
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R-S
Radiation adaptative (adaptive radiation) : diversification dans un espace limit
comme un lac ou une le, de nombreuses espces partir de une ou de quelques espces
originelles. Parmi les Vertbrs, lexemple le plus remarquable de radiation adaptative
se rencontre chez les poissons de la famille des Cichlids des grands lacs de lAfrique
orientale comme le lac Victoria et lac Malawi. Dans le lac Victoria une espce
vraisemblablement dorigine fluviale a colonis le lac il y a environ 10 000 ans et donn
300 espces qui diffrent en particulier entre elles par leur comportement, leur rgime
alimentaire et la forme de leur mchoire. Il existe des poissons fouisseurs, coupeurs de
nageoires, broyeurs de mollusques, brouteurs sur les rochers, piocheurs, mangeurs des
cailles dautres poissons, piscivores, mangeurs de zooplancton, brouteurs de plantes,
etc. Parmi les Invertbrs une radiation adaptative importante a eu lieu chez les
Drosophilides des les Hawaii. Le phnomne de radiation adaptative est
particulirement marqu dans les les.
Rgles cologiques (ecological rules) : Relations existant entre divers facteurs du
milieu et les caractristiques morphologiques de certaines espces animales. Les rgles
cologiques, qui ont t tablies surtout pour les Vertbrs, ont de nombreuses
exceptions : ce ne sont donc pas des lois. Les trois principales concernent laction de la
temprature (rgle de Bergmann) ; la rduction de la surface des oreilles, de la queue
et du cou chez les espces des rgions froides (rgle de Allen) ; un plus grand
dveloppement de la fourrure chez les espces des rgions froides (rgle de la
fourrure). Dautres rgles concernent laptrisme des oiseaux et des insectes des faunes
insulaires, laptrisme des insectes de la haute montagne, etc.
Saprobies (zones de) (saprobic classification) : classification des organismes des
rivires en fonction de leur tolrance envers la pollution organique. On distingue les
organismes polysaprobies tels que certains champignons ou les larves du Diptre
Eristalis tenax qui vivent dans les eaux trs pollues o la dcomposition de la matire
organique se fait souvent en milieu anarobie ; les organismes msosaprobies comme
les crustacs du genre Asellus qui vivent dans des eaux un peu moins pollues o la
dcomposition de la matire organique est soit anarobie, soit arobie ; les organismes
msosaprobies comme la plante Elodea canadensis, des larves dinsectes
Trichoptres, des poissons comme lpinoche et languille qui ne tolrent que des eaux
trs peu pollues ; les organismes oligosaprobies comme les larves de Plcoptres et la
truite, qui exigent des eaux non pollues. La mthode des indices biotiques se fonde
aussi sur les exigences des organismes aquatiques pour dterminer lintensit de la
pollution.
Slection (selection) : processus naturel ou dirig par lhomme par lequel les
caractristiques dune espce sont modifies. Il existe divers types de slection : la
slection stabilisante, la slection directionnelle, la slection diversifiante, la slection
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sexuelle. La slection artificielle est luvre de lhomme qui agit sur les diverses
espces danimaux domestiques pour slectionner les plus intressantes. Lobservation
de la slection artificielle a permis Darwin dtablir la thorie de la slection naturelle.
Seveso : le 10 juillet 1976 un racteur chimique produisant un herbicide, le
2,4,5-trichlorophnol, a explos Seveso prs de Milan en Italie. Cet accident a entran
la libration de 1 5 kg dune dioxine, la 2,3,7,8-TCDD, connue sous le nom de
dioxine de Seveso . la suite de la panique qui sest produite, les habitants les plus
proches ont t vacus, le cheptel abattu et plusieurs btiments rass. Plus de
37 000 personnes ont subi les causes de cet accident. Le contenu du racteur a t plac,
la fin du mois daot 1982, dans des fts qui devaient tre transports en Suisse pour
tre incinrs. Ils ont t perdus et retrouvs seulement en 1983 dans un abattoir
abandonn du nord de la France. Ils sont finalement parvenus en Suisse et ont t
incinrs en 1985. La dioxine est un produit toxique pour les plantes et les animaux et
capable de provoquer des malformations chromosomiques. Les risques causs par la
dioxine sont lorigine de deux directives europennes dites SEVESO et SEVESO 2
qui imposent des mesures de protection envers les usines dangereuses, en particulier
pour le fonctionnement des incinrateurs qui sont connus pour librer de la dioxine
lorsquils fonctionnent mal.
Smog : contraction de smoke et de fog , polluants qui ont caractris des
pisodes de pollution Londres, Glasgow et Manchester parmi dautres cits. Lpisode
de smog de Londres en 1952 a caus la mort dau moins 4 000 personnes et il est
lorigine du Clean Air Act de 1956 et 1968 qui a interdit lusage du charbon,
combustible trs polluant, dans certaines zones. Le terme smog qui a t appliqu
dautres cits comme Los Angeles recouvre un type de pollution provenant non pas de
lmission de fumes, mais de la production doxydes dazote et de particules
dhydrocarbures par les voitures et de laction photochimique du rayonnement ultra
violet solaire sur ces composs.
Sociobiologie (sociobiology) : notion cre par lentomologiste et cologiste
E. O. Wilson et dveloppe en 1975 dans son livre Sociobiology, the new synthesis .
La sociobiologie est dfnie par Wilson comme ltude scientifique des bases
biologiques de toutes les formes de comportements sociaux chez tous les tres vivants,
homme y compris . Elle a comme objectif de prdire les caractristiques de
lorganisation sociale partir de la connaissance des paramtres populationnels
combine linformation sur les contraintes quimpose sur le comportement la structure
gntique des espces . Cette nouvelle synthse sur ltude des comportements
sappuie aussi sur les travaux raliss en cologie et en gntique des populations
depuis 1930. Wilson choisit des exemples parmi tous les groupes animaux et il termine
son livre par un chapitre consacr lhomme. La sociobiologie a longtemps t rejete,
en Europe en particulier, en raisons de ses implications philosophiques dont beaucoup
nont cependant pas t dveloppes par Wilson lui-mme, mais par ses successeurs.
Cest aujourdhui une discipline reconnue qui fait appel la fois des donnes de
nature cologiques et dautres relatives au comportement, qui a un priodique qui lui
est consacr, Behavioral ecology and sociobiology , et qui fait disparatre une
opposition artificielle entre lanimal et lhomme . Aprs les travaux de Wilson, deux
coles continuent sopposer en ce qui concerne ltude de lespce humaine. Certains
attribuent un rle important la slection naturelle, dans le pass, et, aujourdhui, dans
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le dterminisme des comportements humains ; dautres pensent que lapprentissage et la
transmission culturelle jouent un rle essentiel.
Spciation (speciation) : processus qui permet la formation de deux ou plusieurs
espces diffrentes partir dune espce prexistante. Selon les ides de Ernst Mayr, la
spciation peut tre instantane ou graduelle. La spciation est instantane lorsque des
individus dune population subissent des mutations qui les isolent gntiquement des
autres individus. La spciation instantane due des mutations qui conduisent la
polyplodie est surtout rpandue chez les vgtaux et elle est rare chez les animaux. La
spciation graduelle se ralise au niveau des populations. La spciation allopatrique
(allopatric speciation) ou gographique se produit lorsquune population se trouve
divise en deux sous-populations isoles par lapparition dun obstacle de nature
gographique (chane de montagne, rivire). Les deux populations ainsi isoles voluent
sparment sans pouvoir changer de gnes et finissent peu peu par se transformer en
sous-espces puis en espces distinctes, gntiquement isoles et non interfcondes. La
spciation sympatrique (sympatric speciation) apparat chez des individus dune
population qui ne sont pas spars gographiquement. Ce mode de spciation tait bien
tabli dans des cas comme celui des poissons Cichlids des grands lacs africains, dont
on a montr grce lanalyse molculaire quils descendaient dun anctre commun. La
possibilit de la spciation sympatrique a t combattue par Ernst Mayr qui, en raison
de sa grande influence, avait presque russi en faire abandonner lide. Trs
rcemment, au dbut de 2006, des observations ont mis en vidence des cas de
spciation sympatrique qui paraissent indiscutables. Lun concerne deux espces de
poissons, Amphilophus citrinellus et A. zaliosus de la famille des Cichlids qui vivent
au Nicaragua dans le petit lac de cratre Apoyo qui ne mesure que quelques kilomtres ;
lautre deux espces de palmiers, Howea forsteriana et H. belmoreana, qui poussent
cte cte dans la petite le de Lord Howe dont la surface nest que de 12 km_ et qui
est totalement isole dans locan Pacifique. Lisolement de ces deux localits rend
improbable la colonisation par une espce voisine dune espce prexistante. Ces
donnes confirment lide de Darwin qui soutenait lide de la spciation sympatrique.
La spciation est un processus qui peut tre rapide et qui sest ralis en moins
de 23 000 ans dans le cas des palmiers de lle Lord Howe.
Stratgies dmographiques (demographic strategies) : Les adaptations
morphologiques et physiologiques que les tres vivants ont dveloppes en raction aux
pressions de slection exerces par les milieux o ils vivent sont appeles stratgies
adaptatives. Lorsque ces stratgies concernent des caractristiques comme les taux de
natalit et de mortalit ou lesprance de vie la naissance, ce sont des stratgies
dmographiques. On distingue, partir des deux coefficients r et K de lquation
reprsentant la croissance logistique (voir ce mot) deux types de stratgies
dmographiques dont on peut rsumer ainsi les principales caractristiques. La
stratgie r se rencontre chez des espces de petite taille et faible dure de vie,
fcondit leve, qui sont capables dutiliser rapidement la totalit des ressources
disponibles, occupent les milieux pionniers et pullulent souvent. Beaucoup despces
dinsectes et de Rongeurs sont des stratges-r. La stratgie K se rencontre chez des
espces de grande taille longue dure de vie et faible fcondit, qui ont des
populations effectifs relativement stable et qui colonisent souvent les stades avancs
dune succession cologique. Beaucoup de grands Mammifres sont des stratges-K.
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Stress : La notion de stress a t propose par le canadien H. Selye lors de ses tudes
sur la physiologie des Mammifres, puis elle a t tendue des sujets en rapport avec
lcologie. On peut dfinir le stress comme tous les changements du milieu, abiotiques
(climatiques, pollutions) ou biotiques (prdation, parasitisme), qui ont une action
dfavorable sur les espces en produisant des modifications physiologiques,
biochimiques ou comportementales, ou bien sur les cosystmes, par exemple en
provoquant des changements de la structure des communauts vgtales. Le stress peut
aussi avoir des causes intrinsques, telles que laugmentation de lhomozygotie due la
drive gntique ou laugmentation de limportance des allles ltaux. Le stress peut
aussi tre dfini comme toute modification qui diminue la valeur slective ou fitness,
cest--dire les chances de survie des populations. Des adaptations permettant la
rsistance au stress sont apparues grce la slection naturelle Ainsi, chez la
Drosophile, il existe des populations qui rsistent des tempratures leves ; dautres
qui sont peu sensibles aux effets nfastes des vapeurs de lthanol grce la prsence
dune alcool-dshydrognase. Le stress provoqu par les hautes tempratures ou par
lalcool augmente en mme temps que le taux de consanguinit.
Stromatolithes : Les stromatolithes sont parmi les plus anciennes structures formes
par des tres vivants. On les rencontre dans diverses rgions comme celle des Grands
lacs et du Grand Canyon du Colorado en Amrique du Nord, au Maroc, en Chine, etc.
Certains sont apparus au Prcambrien et sont gs de 3,5 milliards dannes. Ce sont
des constructions discodes ou plus ou moins cylindriques, en forme de piliers dont
le diamtre varie de quelques mm plus dun mtre, surface mamelonne, qui sont
luvre de Cyanobactries. Celles-ci ont form du calcaire partir du CO
2
qui tait
abondant dans latmosphre primitive. Les stromatolithes comprennent une matrice de
lames calcaires superposes dans lesquelles sont englobes des Cyanobactries et
diverses autres Bactries. Ces formations subsistent encore de nos jours sur les rivages
marins de quelques rares localits tropicales comme la Basse-Californie ou lAustralie.
Certains stromatolithes sont peu rsistants et peuvent tre entams au couteau. Dautres,
fortement imprgns de calcaire, sont beaucoup plus durs. La dtermination du rapport
13
C/
12
C dans le calcaire des stromatolithes du Prcambrien a permis de connatre les
conditions de vie qui rgnaient sur terre cette poque.
Symbiose (symbiosis) : association obligatoire et bnfique entre deux espces
diffrentes. Les Lichens et les Coraux sont des exemples dorganismes symbiotiques.
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33
T-U-V
Taille : la taille des tres vivants varie, de 10
-4
chez les unicellulaires 10
4
chez la
baleine bleue ; la masse varie de 10
-23
g chez les mycoplasmes 10
8
g chez la baleine
bleue. Cest un lment de grande importance et beaucoup de caractristiques
cologiques des tres vivants en dpendent, comme le taux daccroissement, la dure
dune gnration, la fcondit, etc. En coordonnes logarithmiques, une relation entre la
masse corporelle et le mtabolisme est reprsente par une droite dont la pente est
voisine de 0,75. Des recherches rcentes semblent avoir tabli que cette relation que
lon croyait gnrale sapplique seulement aux animaux, et non aux vgtaux chez qui
la relation entre la masse corporelle et le mtabolisme est isomtrique, la droite de
rgression ayant une pente de 1 et non de 0,75. Ces diffrences sont interprtes comme
une consquence de diffrences dans le mtabolisme des animaux et des vgtaux.
Tldtection : Pendant longtemps ltude des cosystmes na pu se faire qu partir
du niveau du sol et, par consquent, sur des surfaces limites qui ne couvraient
gnralement pas toute ltendue des paysages et des grands biomes. Puis des photos
ariennes ont t prises partir davions quips de matriel adapt. Cest partir de
photos ariennes que le botaniste et gographe C. Troll est parvenu la notion
dcologie du paysage. Par exemple un transect de 1 km effectu dans lOregon laide
dun dtecteur infra rouge embarqu sur un avion a permis de dterminer les variations
de la temprature de surface et de reprer ainsi dans le paysage 13 zones diffrentes par
leur nature, leur structure et leurs limites, telles que les lisires forestires, les zones de
coupe rase, les vieux peuplements de sapins de Douglas, les routes et les tangs.
Lapparition des satellites artificiels, quips pour photographier de trs grandes
surfaces avec une prcision parfois infrieure au mtre, a permis dtendre les
recherches en cologie des surfaces beaucoup plus vastes qui taient souvent,
autrefois, impossibles tudier. Les observations ralises laide de la tldtection
permettent galement dtudier les changements dans loccupation des sols comme la
dforestation, les modifications des milieux littoraux, les bassins versants. Elles
permettent aussi destimer lhumidit des sols, ltendue des pollutions et en particulier
de celles qui sont dues aux mares noires, de dterminer les arbres au niveau spcifique
et de reconnatre ceux qui sont morts ou dprissants grce des photographies en infra
rouge. La tldtection est utilise dans les forts borales du Canada et de la Russie
pour surveiller les feux de fort, particulirement nombreux dans ces rgions, et valuer
leurs dangers. Ltude se fait grce des procdures danalyse en infra rouge. En 2003
au Canada, 7,5 millions dhectares ont t ravags par les incendies et 22 millions en
Russie. La tldtection facilite aussi la cartographie de la vgtation surtout dans les
rgions difficiles daccs.
Traits de vie = histoire naturelle (life histories) : Ensemble des caractristiques dune
espce comme les structures dge, les taux de natalit et de mortalit, la dure de vie,
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etc. Les traits de vie des espces sont sous le contrle de la slection naturelle. Ce sont
des adaptations qui optimisent le succs de la reproduction.
Types biologiques des vgtaux (Raunkiaers life forms) : notion tablie par Raunkiaer
pour classer les vgtaux des rgions tempres et qui peut aussi, avec quelques
modifications, sappliquer aux vgtaux des rgions tropicales. Il existe 5 types
biologiques principaux qui correspondent aux conditions de vie des vgtaux et en
particulier de celles de leurs organes de rsistance au froid (bourgeons, graines,
tubercules, rhizomes). Les phanrophytes sont des arbres ou des arbustes dont les
bourgeons sont situs plus de 5 m au-dessus du sol et qui ne sont pas protgs par la
neige en hiver. Les champhytes comme la bruyre ou les myrtilles ont des bourgeons
situs moins de 30 cm du sol, ce qui leur permet dtre, en gnral, protgs par la
neige. Les hmicryptophytes ont des bourgeons situs au ras du sol. Ce sont des
plantes en rosette comme la pquerette ou des Gramines. Les gophytes sont des
plantes vivaces comme le muguet ou la ficaire dont les organes prennants sont des
bourgeons, des rhizomes ou des tubercules situs dans le sol. Les throphytes sont des
plantes annuelles qui passent lhiver ltat de graines. Les hlophytes et les
hydrophytes sont des plantes aquatiques plus ou moins submerges dont les organes de
rsistance sont enfouis dans la vase. Dans les rgions tropicales, les piphytes
reprsentent un type biologique frquent qui est absent des rgions tempres, tandis
que les phanrophytes sont beaucoup plus abondants que dans les rgions tempres en
raison de la douceur du climat.
UICN : Union Internationale pour la Conservation de la Nature. Organisme cr en
1948 dont le sige est Morges en Suisse. LUICN est une Organisation non
gouvernementale, devenue lAlliance Mondiale pour la Nature, qui regroupe des
organisations qui luttent pour la protection de la nature et des espces. Parmi ses
activits lUICN publie des listes rouges des espces menaces.
Upwelling (upwelling) : remontes vers la surface deaux profondes, froides et riches en
sels nutritifs, qui permettent le dveloppement dune production biologique trs
importante. Les upwellings se produisent le long des ctes sous laction de vents qui
mettent en mouvement les couches superficielles de locan, et les dplace vers le large
en crant un phnomne daspiration. Des zones dupwelling importantes se trouvent le
long des ctes atlantiques de lAfrique (littoral de lAngola, Mauritanie) et pacifiques de
lAmrique (Chili, Prou, Californie). Dans les zones dupwelling qui couvrent environ
400 000 km_ la productivit moyenne est de 300 g/C/m_/an soit environ 3 fois plus que
dans les zones ctires normales, et le nombre moyen de niveaux trophiques est
seulement de 1,5 ce qui explique le rendement lev de la pche qui atteint 120 millions
de tonnes, soit autant que pour les zones ctires normales qui couvrent pourtant une
surface 100 fois plus importante. Dans une colonne deau de 1 m_ stendant sur les
200 m superficiels, la biomasse animale totale est de 5 g dans lupwelling de
Mauritanie ; elle est seulement, selon les saisons, de 1 3 g dans le golfe de Gascogne
et de 0,1 0,5 g en Mditerrane occidentale. Limportante production danchois du
Prou Engraulis ringens est due un upwelling qui est arrt tous les 2 7 ans par le
phnomne mtorologique El Nio, ce qui entrane une baisse brutale du rendement de
la pche.
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Valeur slective (fitness) : Mesure du succs reproducteur dun gnotype daprs ses
variations de frquence dans une population dune gnration lautre. Tous les
gnotypes nont pas la mme valeur slective. Ceux qui ont la valeur slective la plus
leve finissent par liminer ceux qui ont une valeur slective plus faible.
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