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Estructuras terciaria y cuaternaria

 Se refiere a la configuración 3D de la
proteína globular, incluyendo las cadenas
laterales y el grupo prostético o cofactor si
ésta tuviera.
 Suma de estructuras secundarias (hélices,
láminas, etc.)
 A la fecha se conoce la estructura 3D de
cientos de proteínas, cada una de las cuales
es una entidad única y compleja.
 El plegamiento no es aleatorio sino
específico para cada proteína globular y está
determinado por la estructura primaria (el
cual a su vez está determinado
genéticamente)
Formas de representación de la estructura terciaria
 Los AA no polares (hidrofóbicos) se ubican en el
interior de la molécula.
 Los AA polares cargados (- ó +) se sitúan en la
superficie de la molécula.
 Los AA polares sin carga pueden ubicarse dentro o
fuera de la molécula.
 Las cadena polipeptídicas muy largas (≥ 200 residuos)
pueden formar dominios dando apariencia
multilobular.
 El plegamiento de la proteína es tan compacto que
incluso es imposible la penetración de una molécula
de agua (está densamente empaquetado de átomos)
 Entonces, el agua juega un rol primordial en el
plegado de una proteína (interacciones hidrofóbicas)
 El plegamiento de la proteína se logra y mantiene gracias a una
serie de interacciones covalentes y sobre todo no covalentes
que se produce dentro de la misma molécula o con el ambiente
que lo rodea (agua e iones). Las fuerzas son:
 De tipo covalente
◦ Puentes disulfuro (S-S).-, por tanto, la más fuerte, producido entre
residuos Cis. No todos poseen.
 De tipo no covalente:
◦ Interacciones iónicas (puentes salinos)
◦ Puentes de H.
◦ Contactos de van der Waals
◦ Interacciones hidrofóbicas.- Es la fuerza más importante.
Formación de puentes de hidrógeno entre átomos de la misma o
diferentes cadenas polipeptídicas
Formación de puentes disulfuro
Formación de puentes iónicos e interacciones hidrofobicas
 Presente en el sarcoplasma del músculo
esquelético de mamíferos. Muy abundante en
mamíferos acuáticos (10x más que terrestres).
 Función: Transporte y almacenamiento de O2 a
nivel muscular.
 Contiene 153 residuos y PM=16700. Grupo
prostético: Heme, unido a la globina por
enlaces no covalentes y capaz de experimentar
oxigenación y desoxigenación reversible.
 El grupo heme consta de una parte orgánica
(protoporfirina IX) y otra inorgánica: Fe++
 La globina consta de 8 segmentos α-
helicoidales (A, B, C, .. H).
Unión del O2 al Fe2+ del grupo heme de la mioglobina
 Enzima sintetizada por el
páncreas.
 Hidroliza enlaces del RNA de la
dieta.
 Consta de 124 residuos
 PM=13700
 Contiene 26% de α-hélices y 35%
de estructuras laminares y el
resto de estructuras aleatorias.
 Posee 4 puentes S-S.
 No tiene cofactor o grupo
prostético.
 Es la conformación 3D de las
proteínas globulares que posean 2 o
más subunidades (diméricas,
triméricas, etc.)
 Se refiere a la orientación específica
de las cadenas polipeptídicas y a la
naturaleza de las interacciones que
estabilizan esta orientación.
 Las subunidades pueden ser
idénticas o diferentes.
 Las fuerzas que mantienen la
estructura 4ria son netamente no
covalentes.
Características de las subunidades de algunas proteínas

No. de
Proteína PM Subunid Denominación PM
HbA 64500 4 2 cadenas α 15700
2 cadenas β 16500
Lactato DHasa 135000 4 0-4 cadenas A 33600
4-0 cadenas B 33600
IgG 15000 4 2 cadenas L 25000
2 cadenas H 50000
Asp transcarbamilasa 306000 12 6 cadenas C 34000
6 cadenas R 17000
L-arabinosa isomerasa 360000 6 Cadenas idénticas 60000
Apoferritina 456000 24 Cadenas idénticas 19000
Tiroglobulina 670000 2 Cadenas idénticas 335000
 Una de las proteínas globulares más abundantes de la naturaleza.
 Constituye el 80% de la proteína total de los GR.
 Un GR humano contiene ~300 millones de moléculas de Hb.
 Perutz M. en 1962 obtuvo P.N. por su contribución en la dilucidación
de la estructura y función de la Hb.

 Función: transporte de O2
desde el exterior a las
diversas células del
organismo animal. Para ello
la Hb experimenta
oxigenación reversible,
según la siguiente ecuación:
Características de las subunidades de algunas proteínas
 Tiene 574 residuos
 4 cadenas: 2 α y 2 β
 Forma de esfera aplanada.
 Diámetro: 55 A
 Cada cadena un grupo Heme
La cadena β de la Hb es semejante a la mioglobina
Curva de saturación de la Mb y Hb
 Se refiere a la oxigenación o
desoxigenación de las moléculas.
 Está en función a la presión parcial
de O2 (pO2). O sea, a la [O2]
disuelto en el plasma y líquidos
circundantes. También el pH y CO2.
 En la Hb, a bajas pO2 no se satura
rápidamente (p.ej. a pO2 solo 21%)
y viceversa (p.ej. entre 20 y 60 de
pO2 la saturación es rápida) = curva
sigmoide.
 En la Mb, la saturación es rápida a
medida que aumenta la pO2 (entre
0 y 20) = curva hiperbólica.  El efecto de la estructura tetramérica de la
Hb es inhibir la unión al O2 a bajas pO2.
 A mayor pH mayor % de saturación  P50 es la pO2 en el cual 50% de la proteína
y viceversa (efecto Bohr). está saturada. Para la Mb es 2.8 y para la
Hb 26.
Alosterismo de la Hb
 La Hb es una molécula
alostérica.
 Uno de los efectores más
importantes de la Hb es el: 2,3-
bifosfoglicerato cuya presencia
aumenta la afinidad de la Hb
por el O2.
 Familia de glucoproteínas presentes en el plasma
y líquidos tisulares de todos los mamíferos.
 Son sintetizado por los linfocitos B y células
plasmáticas.
 Algunos se encuentran en forma libre
(Anticuerpos) y otros unidos a la superficie de los
linfocitos actuando como receptores.

 Función principal: unión a sustancias


extrañas o nocivas y que no es
reconocido por el sistema inmunitario
(antígeno) (reacción antígeno-
anticuerpo) a fin de neutralizarlo y/o
facilitar su eliminación.
Estructura básica
 Tiene 4 cadenas: 2 L (~217 AA) y 2 H (~440 AA) unidas por puentes S-S e
interacciones no covalentes.
 PM de L=25 kD y H=50 kD
 Tiene forma de Y con una región bisagra que le permite mover los brazos.
 Son bivalentes porque tienen dos sitios de unión al Ag (paratopos)
 Pta. 2 fracciones: fracción ab (Fab) o de unión al Ag y Fc (cristalizable).
Ruptura por papaina y pepsina
• La unión Ag-Ac es específica (cada
Ac reconoce y se une a un
determinado Ag)
• La unión se da por medio de
interacciones no covalentes, dando
lugar al Complejo Ag-Ac
Propiedad IgA IgD IgE IgG IgM
PM (kD) 180-500 175 200 150 950
[en suero] mg/mL 3 0,1 0,001 12 1

% en suero 15 <1 <1 75 10


Cad H

Cad L
ó ó ó ó ó
% CH 7-11 9-14 12 2-3 12

Vida media 6 3 2 7-21 10

subclases: IgG1, IgG2, IgG3 e IgG4


IgA1 e IgA2
 Abunda en secreciones seromucosas
como dímero: saliva, lágrimas, mucus,
leche, calostro y secreciones
respiratorias, intestinales y
urogenitales.

 Primera línea de defensa contra


patógenos que invaden mucosas

 En suero circula como monómero (80%)


y dímero (20%).
 Presenta 2 subclases: la A1que
predomina en el suero y la A2 en las
secreciones.
 Su [ ] en baja en suero
(<1%)
 Abunda en la
superficie de linfocitos
B actuando como
receptores antigénicos.
 Poco en suero (<1%).
Pero abunda en el
medio extravascular
 Actúa como receptor
para basófilos y
mastocitos
 Intervienen en las
reacciones alérgicas
 Tienen actividad
antiparasitaria
 Principal Ig de la sangre en donde circula
como monómero en los compartimientos
intra y extravasculares.
 Activa el sistema de complemento (vía
clásica)
 Unicas que ptan actividad frente a
toxinas
 Unicas que atraviesan la placenta
 Ptes. en calostro
 Act. Antiviral y antibacteriana
 Circula como pentámero
 Solo en el espacio intravascular
 Es el primero en aparecer en las
fases tempranas de la RI
 Excelente activador del sistema
de complemento
 Como monómero en la
superficie de Linf B.
 También presentes en
secreciones externas.
 Proceso por el cual se pierden la estructura 3D de la proteína (2ria, 3ria y
4ria) sin afectar la estructura 1ria (no se rompen enlaces peptídicos).
 Sólo se rompen las fuerzas que mantienen la estructura 3D de la proteína
(no covalentes y puentes S-S).
 La desnaturalización implica alteración de sus propiedades físicas, químicas
y biológicas.
 La pérdida de la conformación nativa de la proteína implica necesariamente
la pérdida de su actividad biológica.
 Calor
 pH extremos (ácidos o álcalis).
 Soventes orgánicos (etanol, metanol, acetona)
 Soluciones concentradas de urea
 Detergentes: SDS
 Agentes físicos: rayos X, luz UV
 Agitación mecánica (sacudimiento)
 Ultrasonido y otros.
IRREVERSIBLE
 Cuando retirado el agente desnaturalizante del
medio, la proteína no recupera su
conformación nativa (de hecho, ni su actividad
biológica)
 Ej. La desnaturalización de la ovoalbúmica por
cocción del huevo (cambia sus propiedades).
 La temperatura de desnaturalización depende
de la especie y la propia proteína.

REVERSIBLE = RENATURALIZACION
 Cuando retirado el agente desnaturalizante del
medio, la proteína recupera su conformación
nativa y con ello su actividad biológica.
 Ej. Desnaturalización de la ribonucleasa
realizado por Anfinsen C. (Premio Nobel)