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07/01/2014

GENOMICA ESTRUCTURAL
Blgo. Genetista Biotecnólogo ARTURO TAMO DÍAZ Especialista en Genética y Medicina Genómica Director Científico IPEGEN

GENOMA NUCLEAR
GENOMA HAPLOIDE
 

3.200 Mb (megabases) 2.950 Mb de eucromatina y unas 250 Mb de heterocromatina (ADN satélite).

Genes, secuencias relacionadas con genes y secuencias entre genes.
Secuencias relacionadas con genes: exones, intrones, secuencias reguladoras, etc)  Secuencias que está entre los genes o ADN extragénico o ―de relleno‖ y que no codifica ninguna proteína ni contiene ningún elemento funcional. Contenido repetitivo.

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8-2. que se ha retrotranscrito e insertado en otra posición del genoma (también llamados retropseudogenes). muy variable. Aprox. 2 .           El tamaño promedio de un gen humano es de 20-30 kb. El tamaño medio de un exón es de 150 nucleótidos. El tamaño medio de un ARNm es de 1. habitualmente originadas por duplicación del gen original y posteriores mutaciones que hacen que la copia pierda su capacidad codificante. No tienen intrones. y tampoco tienen capacidad codificante por la ausencia de promotor y por la presencia de codones de parada. El número de exones que forman un gen es muy variable (de 1 a 100 o más). Versiones ―incorrectas‖ de genes Contienen diversos tipos de mutaciones y No se transcriben.4 kb.2 kb incluyendo las regiones no-traducidas flanqueantes. Cromosoma Y: zona pobre en genes.000 son pseudogenes procesados. Procesados son copias del ARN mensajero de un gen. 50% del GH = ADN repetitivo.000 . pero carecen de promotor y habitualmente tienen codones de parada prematuros.000 genes.30. Alta cantidad de pseudogenes  No procesados: son copias de un gen. G + C: 41%: mas genes presentes 5% de duplicaciones segmentarias (dos ó más segmentos cromosómicos >1 kb con >90% de identidad). excepciones   Cromosoma 19: zonas ricas en genes. Antigüedad de 40 millones de años.  11 – 20 mil pseudogenes en el genoma humano:  8. Contienen exones e intrones.5 a 2% EXONES 25% de secuencias relacionadas con genes son: intrones y reguladoras 70% ADN de relleno DATOS DE PGH    PSEUDOGENES     GH tiene 20. Promedio: 7-8 exones por gen. Tamaño en intrones. Densidad media de genes: 1 gen cada 100 kb.07/01/2014 1. La longitud media de una región codificante es de 1. Pseudogenes no procesados y pseudogenes procesados.

2006 GENES PARA MICROARN MicroARN regula la expresión de genes diana mediante degradación de sus mensajeros o por represión de la traducción.  De 300 – 500 genes de miARN en el genoma humano  Situados en intrones de genes codificantes. lo que les confiere una extraordinaria importancia.  20-30% de todos los genes del genoma humano pueden estar regulados por miARN. y además están bastante conservados en primates.07/01/2014 FUENTE: INVESTIGACION Y CIENCIA.  FUENTE: WIKIPEDIA 3 .

No son ricos en G + C Retrotransposones pseudogenes procesados Po tanto. flanqueado por repeticiones invertidas.   Retrovirus endógenos humanos Representan copias de los retrovirus humanos que se han ido integrando en el genoma humano en el curso de la evolución Origen de proto-oncogenes celulares. separados entre sí por un espaciador intergénico que mide unas 30 kilobases. ADN Satélite beta (repetición de 68 nucleótidos) ADN satélite gamma (repetición de 220 nucleótidos). Ejemplos: MER1 ó MER2 y Hsmar2: responsables de algunas reordenaciones cromosómicas importantes en patología humana 80% de los genes humanos tienen L1 en sus intrones 4 . el ADN ribosomal ocupa 2 Megabases.500. 15. ADN REPETITIVO – SECUENCIAS NO CODIFICANTES . Distribuidos en todo el genoma humano Valido como marcadores genéticos porque el número de repeticiones varía entre individuos.  Ejemplo: las secuencias de los telómeros de los cromosomas humanos. que también se encuentran en la cromatina centromérica de varios cromosomas. 8% del genoma. y se clasifican en función del tamaño de la unidad repetida: Los SINE     Los HERV:    Short Interspersed Nuclear Elements 13% del genoma humano.TANDEM   Se clasifica según el tamaño total que origina la repetición: ADN satélite: 250 Mb    Repetidos miles de veces. ya que puede copiarse e insertarse en otras regiones del genoma. en el que la secuencia repetida tiene un tamaño de 171 nucleótidos. Por ejemplo:  ADN ribosomal  brazos cortos de los cromosomas acrocéntricos (13. 3 ó 4 nucleótidos que se repiten hasta dar bloques con un tamaño total habitualmente no superior a 150 nucleótidos. 21 y 22)  formado por tres genes que dan lugar a los tres ARN ribosomales de 5.DISPERSAS  45% de todo el genoma humano. 20% del genoma humano tamaño de varias kilobases.  Ejemplo en ADN codificante:  ADN REPETITIVO – SECUENCIAS NO CODIFICANTES . ElementosAlu. con unas 1.     ADN alfoide ó Satélite alfa.  Los tres genes ocupan 13 kilobases.000 veces en el genoma.    250 . En conjunto.25 nucleótidos que se repiten en tándem hasta dar un tamaño total entre 100 nucleótidos y 20 kb. repetidos unas 50 veces. formado por una secuencia de unas 6 kb repetida unas 800. en los que el hexanucleótido (TTAGGG) se repite miles de veces en tándem dando lugar a bloques de 5 20 kb de tamaño  El ADN Microsatélite: 2. de 18S y de 28S. y que forma parte del ADN de los centrómeros de los cromosomas humanos.07/01/2014 ADN REPETITIVO Llamado ADN basura  Tanto en ADN codificante como en ADN nocodificante (mayor parte).  Los LINE         Long Interspersed Nuclear Elements. Regiones repetidas desde 100 kb hasta varias megabases. llegando a constituir alrededor de un 15% del genoma. 14. que es específica de primates y constituye un 10% de nuestro genoma.8S. Contienen el gen truncado de la transposasa.000 copias por genoma y una repetición cada 4 kb como promedio rico en G + C Actúa como un retrotransposón. Ejemplos de ADN microsatélite son los dinucleótidos (CA). pueden jugar un importante papel como elemento modificador del genoma:   Transposones:    3% del total del genoma. Ejemplo: LINE-1 ó L1.    En ADN no codificante: en tanden o dispersas.  El ADN Minisatélite: 6 . ó las repeticiones de trinucleótidos (CAG).280 nucleótidos.

están codificados en el genoma nuclear. así como el Complejo II completo.ROS y regulación de la muerte celular programada o apoptosis. requeridos para la síntesis de proteínas mitocondriales en la misma matriz mitocondrial.  Es importante no perder de vista que el resto de las subunidades polipeptídicas de estos complejos. Genes que codifican 13 polipéptidos que forman parte de los complejos multienzimáticos del sistema OXPHOS.569 kb.  Al contrario que el genoma nuclear. Molecula circular fosforilación oxidativa (OXPHOS): especies reactivas de O2 . de manera que no todas las enfermedades mitocondriales están necesariamente causadas por alteraciones en el ADN mitocondrial. Genes situados uno a continuación del otro. Los genes para los 22 ARNt (ARN transferencia).07/01/2014 EL GENOMA MITOCONDRIAL  16. el ADN mitocondrial sólo posee un 3% de secuencias no codificantes. 37 genes:       Genes que codifican las 2 subunidades 12S y 16S del ARNr (ARN ribosomal) de la matriz mitocondrial. No hay intrones ni regiones no codificantes entre los genes.  única zona del ADNmt que no codifica ningún gen es la región del bucle de desplazamiento (bucle-D)   5 .

etc) son raras pero casi siempre patogénicas. mientras que los polimorfismos de secuencia —variantes alélicas que no causan ninguna enfermedad— son mucho más frecuentes  ENFERMEDADES RELACIONADAS AL ADN MITOCONDRIAL.  Habitualmente son cambios en la tercera base de un triplete.  Frecuentes en ADN codificante.07/01/2014 MUTACIONES  Tasa mutacional basal (la velocidad a la que se producen nuevas mutaciones en la línea germinal de esa población) Aberraciones cromosómicas (trisomías. FUENTE: WIKIPEDIA POTENCIAL PATOGÉNICO DE LAS MUTACIONES EN EL ADN CODIFICANTE  Substituciones silenciosas o sinónimas o sin cambio de sentido: No cambia ningún aminoácido en la proteína codificada.  Código genético 6 . debido a que la mutación cambia un codón por otro codón sinónimo. monosomías.

Esto tiene como resultado la adición de 30 aminoácidos a la secuencia de la hemoglobina alfa-2. en inglés):     cambio de aminoácidos Se habla de cambio conservativo cuando ambos aminoácidos (el original y el nuevo) pertenecen al mismo grupo bioquímico. Raros: variante de la hemoglobina denominada "Hemoglobina Constant Spring" (variante alélica HBA20001). Según el cambio introducido. podemos distinguir: Mutaciones con cambio de sentido (mis-sense.com FUENTE: WWW. o no conservativo cuando pertenecen a grupo distintos (más graves).ES 7 .GENETICAYCANCER. UAG ó UGA). De codon codificante a codón de parada (UAA.   Gracias… arturo_tamo@yahoo. originada por el cambio de UAA (codón de parada) a CAA.  SI NO SON de 3 nucleotidos se produce un frameshift (desplazamiento del marco de lectura)con un cambio muy importante en la estructura proteica.   Mutaciones sin sentido (non-sense):     Mutaciones con ganancia de sentido:   De codón de parada en un codón codificante. que se hace más inestable y provoca una enfermedad de la sangre llamada alfa-talasemia debida a la presencia de cadenas anormales de hemoglobina.  Deleciones e inserciones introducir o eliminar aminoácidos sin cambiar la pauta de lectura SI ES QUE SON inserciones o deleciones de tres nucleótidos (ó múltiplos de tres). Muy graves. Producen inestabilidad del ARNm.07/01/2014  Substituciones no-sinónimas: cambio en la capacidad codificante del ARNm.