CONTENIDO 1. Introduccin 2. Objetivos Generales 3. Objetivos especficos 4. Justificacin 5.

Los microarreglos de ADN y las sondas de RNAr para determinar la diversidad microoganica 6. Determinar la importancia del uso del organismo modelo en biodiversidad 7. La diversidad biolgica de hongos filamentosos (Hf) en la baha de bengalaindia. Como es la diversidad alfa de especies de hongos filamentosos 8. Utilizacin de redundancia en la determinacin de diversidad de hongos en bosques templados. 9. Modelacin del Canal Bolvar En Las Islas Galpagos con el mtodo de Ecopath, zonas de surgencia y su relacin con la diversidad biolgica.

INTRODUCCIN

Este trabajo pretende comprender y explicar el uso de los organismos modelos en el estudio de los seres vivos y la metodologa usada para determinar la diversidad biolgica en los hongos filamentosos (Hf) en la baha de bengala-india (BBI) basndonos en los trabajos como Model organisms realizado por Bruno Mller y Ueli Grossniklausa, y trabajos como Filamentous fungal population and species diversity from the continental slope of Bay of Bengal, India, realizado por Surajit Dasa,b, y Parameswari Somasundharan Lyla. Sirviendo estos como base para comprender el uso de los organismos modelo.

JUSTIFICACION Se quiere investigar sobre las diferentes formas que se puede evaluar la biodiversidad en los ecosistemas para as comprender mejor el funcionamiento de los organismos de acuerdo a las relaciones con su hbitat. OBJETIVO GENERAL Estudiar los diferentes mecanismos para evaluar la biodiversidad de ecosistemas marinos y hongos en diferentes zonas, y as comprender como afectan las diferentes variables en el comportamiento de los organismos de las zonas estudiadas. OBJETIVOS ESPECFICOS Conocer cmo se pueden usar los microarreglos de ADN y las sondas de RNAr para determinar la diversidad microoganica tomando como referencia el artculo de metfies&medlin . Determinar la importancia del uso de organismos en los modelos de

biodiversidad y De qu manera mejoran el estudio de la diversidad Explicar la metodologa usada en la determinacin de la diversidad biolgica de hongos filamentosos (Hf) en baha de bengala-india (BBI).

Como es la diversidad alfa de las especies de hongos filamentosos, respecto de la misma diversidad en ecosistemas similares. Determinar la importancia de un anlisis de redundancia en el estudio de la diversidad de hongos en bosques templados. Mostrar la importancia del uso de modelos como Ecopath para estudiar las cadenas troficas de los ecosistemas marinos. Definir zonas de surgencia y su importancia en la diversidad biolgica marina.

CONOCER CMO SE PUEDEN USAR LOS MICROARREGLOS DE ADN Y LAS SONDAS DE RNAR PARA DETERMINAR LA DIVERSIDAD

MICROOGANICA TOMANDO COMO REFERENCIA METFIES&MEDLIN

EL ARTCULO DE

Teniendo en cuenta el papel fundamental de los microorganismos en la ecologa, y debido a la dificultad de clasificar los diferentes microorganismos debido a su pequeo tamao y presencias de caractersticas morfolgicas poco informativas, se desarrollaron tecnologas como los microarreglos de ADN y las sondas de ARN. En 1960 se determin que las sondas de ARNr podan utilizarse para hacer un anlisis comparativo de secuencias de RNA para hacer una clasificacin taxonmica de los microorganismos, ya que las sondas moleculares sirven para determinar sitios nicos dentro de la secuencia ribosomal del microbio estudiado. Hace unos 10 aos se introdujeron los microarreglos de ADN que aumentan las aplicaciones de las sondas de ARN ya que permiten un anlisis simultaneo de muchas sondas al mismo tiempo en un solo microchip de ADN, los microarreglos de ADN se usan para investigar la expresin gentica de los microorganismos sin necesidad de realizar una etapa previa de cultivo. Estos dos anlisis conjuntos permiten identificar los cidos nucleicos de cada microorganismo en un tiempo corto y buscar diferencias entre ellos para as determinar por medio de bases de

datos la clase de microorganismo estudiado y de esta manera evaluar la diversidad microorganismica en entornos complejos sin necesidad de un cultivo previo y as evitar posibles contaminaciones con otros microorganismos que puedan afectar nuestros resultados DETERMINAR LA IMPORTANCIA DEL USO DE LOS ORGANISMO MODELO EN BIODIVERSIDAD Los modelos de referencia son utilizados para buscar una respuesta "sobre la herencia, el desarrollo, la fisiologa y los procesos celulares y moleculares"(Mullera B: 2010) y aunque los seres vivos muestran un alto grado de complejidad, se han buscado organismos que permitan dilucidar con el mnimo de obstculos, los mecanismos de la vida. Estos organismos son importantes ya que gracias a ellos se han logrado resultados en mltiples investigaciones. Entonces, tenemos que estos han permitido la obtencin de informacin muy valiosa, aunque representen slo una pequea parte de la biodiversidad que existe en el planeta" 1. y se haya optado por la eleccin de tal o cual organismo para que sirva de modelo, considerando su abundancia y su facilidad de cultivar/criar y manipular en el laboratorio. Igualmente, los organismos modelos se utilizan para obtener informacin acerca de otras especies (incluyendo los humanos) que son ms difciles de estudiar directamente. Por medio del conjunto de ciencias y tcnicas dedicadas al estudio integral del funcionamiento, el contenido, la evolucin y el origen de los genomas. gracias a las tecnologas avanzadas de secuenciacin de ADN, a los avances en bioinformtica, y a las tcnicas cada vez ms sofisticadas para realizar anlisis de genomas completos como la genomia y la transcriptmia que" se caracteriza por el

monitoreo y anlisis de expresin simultneo de muchos genes utilizando macroo micro-matrices de ADN (microarrays o chips de ADN)
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De modo que,

la importancia del uso de organismos modelo en biodiversidad es porque aunque no podamos "explicar las particularidades de muchas formas de vida"

(Mullera B:2008)

nos da una luz para entender que la biodiversidad, tiene una

base comn de "principios compartidos" (cromosomas)y la historia de la evolucin de las formas orgnicas" ( la herencia gentica) creando mapas genticos altamente detallados como el de la levadura de pan (Saccharomyces cerevisiae), la mosca de la fruta (Drosophila melanogaster) y el gusano nematodo (Caenorhabditis elegans). Ahora bien, organismos con el pollo, los anfibios o el ratn facilitan el estudio ya que son fciles de manipular y los recientes avances cientficos permiten cada vez estudiar ms organismos modelo, dando un paso ms al anlisis de las diferentes especies buscando un registro referencial global de todos los

organismos que habitan la tierra. Digamos que, desde Mendel, los espectaculares avances en este campo han

fomentado el estudio a gran escala de todos los organismos en busca de nuevos compuestos bioactivos, as como el aislamiento de genes con aplicaciones en agricultura, farmacia o servicios ecolgicos. y esto tambin "abre todo un mundo de nuevas posibilidades a la biodiversidad, en el que los organismos vivos pueden tener un potencial valor econmico. La Convencin sobre Diversidad Biolgica (CDB) ha fomentado la aparicin de nuevas actitudes y la implantacin de nuevas normativas. Asimismo, tambin ha cambiado la manera en que las comunidades cientficas y no cientficas contabilizan, documentan, protegen y utilizan las especies de fauna y flora."(Duarte M : 2006) De manera que un registro mas avanzado el estudio de los organismos modelo permite que a partir de los datos recogidos se ampli el conocimiento de la biodiversidad y los filos con mayor nmero de especies, y como estas se deben preservar o manejar, puesto que todo tiene una razn de ser. Y la variacin en la diversidad que intrigaron a los primeros investigadores naturalistas como Mendel sigue hoy en vigencia.

METODOLOGIA USADA EN LA DETERMINACIN DE LA DIVERSIDAD BIOLOGICA DE HONGOS FILAMENTOSOS (HF) EN BAHIA DE BENGALAHINDIA Y COMO ES LA DIVERSIDAD ALFA DE ESPECIES DE HONGOS RESPECTO DE LA MISMA DIVERSIDAD EN

FILAMAMENTOSOS,

ECOSISTEMAS SIMILARES. QU FACTORES HICIERON

A DIVIPOINT, EL

SITIO MS DIVERSO. CUALES VARIABLES AMBIENTALES MODELAN LA DIVERSIDAD DE HF EN BBI. CUALES 23 ESPECIES DE HF FUERON

INFLUYENTES EN LA DIVERSIDAD PORQUE? El estudio realizado a la diversidad de hongos filamentosos de los sedimentos de la plataforma continental del Golfo de Bengala se realiz recogiendo muestras de sedimentos durante dos cruceros en el 2004 y 2005. Encontrando que Aspergillus era el gnero dominante y la incidencia del porcentaje global: Deuteromycotina 74%, 17% Ascomycotina, Basidiomycotina 4 % y no esporulante 5 %. Los ndices de diversidad se calcularon y la riqueza de especies variaron desde 0,912 hasta 3,622 y 1,443 a 4,588; la equitatividad desde 0,9183 hasta 1,000 y 0,8322 a 1,000 y el ndice de Shannon Wiener ( H0 log 2 ) vari de 0.9183 a 1,000 y 1,000 a 3,690 y La mayor diversidad se encontr en Divipoint. Las muestras de sedimentos recogidos se utilizan para el anlisis de poblacin de hongos en agar Rosa de Bengala ( HiMedia , India ) medio suplementado con cloranfenicol 100 mg / l de malta y medio de agar de extracto ( HiMedia , India ) suplementado con 0,1 g de estreptomicina y 10.000 unidades de ml de penicilina/100 para inhibir el crecimiento bacteriano ( Raghukumar 2001 , 2004 ) . Un inculo de 0,5 ml por el mtodo de extensin en placa de las muestras sin diluir ( 50 % w / v ) .Todas las muestra se analizaron por duplicado y se incubaron durante una semana a 15 das a temperatura de 27 oC, tan pronto como

aparecieron las colonias antes de la formacin de esporas para evitar sobre estimacin debido a la auto inoculacin . Las colonias formadas en las placas se contaron a continuacin y se expresan como CFU / g de peso de sedimento seco.

Todas las colonias fueron posteriormente recogidas, sub -cultivadas y mantenidas en tubos inclinados para estudios adicionales. La identificacin se logr mediante procesos taxonmicos tales como la comparacin directa de las muestras y por el uso de llaves, descripciones e ilustraciones. Los exmenes microscpicos se realizaron mediante la preparacin de los portaobjetos semipermanentes con mancha azul de algodn lactofenol y se observaron los portaobjetos bajo el microscopio e identificando con la ayuda de las teclas dadas por Barghoorn y Linder ( 1944), Johnson y Sparrow ( 1961 ), Barnett y Hunter ( 1972 ), Anisworth ( 1973), Kohlmeyer y Kohlmeyer ( 1979 , 1991 ) y siguiendo la disposicin taxonmica propuesto en la sexta edicin del Diccionario de Ainsworth y Bisby de los hongos ( Anisworth , 1971 ) . La biodiversidad fngica se analiz estadsticamente. Univariada y

multivariadamente y se hizo el anlisis de los datos electrnicamente arrojando un resultado condensado de la poblacin de hongos entre las estaciones y los 2 crucero; que fueron anotados al principio de este texto. La riqueza de especies en ambos cruceros vari desde 0,912 hasta 3,622 ( St. 66 ) y 1,443-4,588 ( St. 67 ) respectivamente y el anlisis de correlacin mostr que la riqueza de especies disminuye significativamente con el aumento de la profundidad ( r = _0.3254 , P < 0,05 ) Por lo tanto , se concluy que la diversidad de especies de hongos

filamentosos disminuye al aumentar la profundidad en el talud continental. Casi todas las estaciones cayeron bien dentro del lmite de confianza del 95 % de la distribucin simulada excepto st. 54, st. 51 y 67 , que cay en el lmite superior e inferior de la distribucin simulada y dentro de la envolvente de probabilidad del 95 % se compararon las comunidades sobre la base de la identidad de las

especies que lo componen, as como su importancia relativa en trminos de abundancia o biomasa. El anlisis de agrupamiento se realiz para encontrar las similitudes entre los grupos y los resultados se representaron mediante un diagrama de rbol, con el

eje x que representa el conjunto completo de muestras y el eje que define el nivel de similitud en la que se funden las muestras o grupos. Adems, el escalamiento multidimensional no mtrico se utiliz para encontrar las similitudes (o diferencias) entre cada par de entidades para producir un "mapa" que evidencio que el talud continental del Golfo de Bengala abraza menor poblacin de micoflora, y registro las diferentes densidades en los diferentes cruceros y en las diferentes estaciones de profundidad. Ahora bien, estos hongos facultativos en el medio marino pueden ocurrir en la forma de micelio fragmentado asociado con detritus (Nadimuthu, 1998).concepto que ms adelante aclarare. Por otro lado, como he anotado antes, se encontr que los ndices varan con la profundidad y que esta, disminuye los ndices de diversidad, como es evidente en la poblacin bacteriana heterotrfica en el talud continental de la Baha de Bengala, no obstante, se mostr comparativamente mayor poblacin y diversidad; y arrojo 23 especies que relacionamos a continuacin: Aspergillus flavus Aspergillus foetidus Aspergillus fumigatus Aspergillus nidulan Aspergillus niger Aspergillus terreus Aspergillus ustus Aspergillus versicolor Cephalosporium Acremonium Chaetomium globosum Lignincola laevis Lignincola sp. Lulworthia grandispora Lulworthia sp. Paecilomyces variotii

Cladosporium algarum Penicillium chrysogenum Cladosporium sp. Corollospora gracilis Corollospora maritima Halocyphina villosa Penicillium citrinum Penicillium griseofulvumI

Ahora bien, La Baha de Bengala es una cuenca nica que recibe una cantidad considerable de agua dulce y sedimentos vertidos en los ros principales a saber. Ganges , Brahamaputra, Mahanadi, Godavari, Krishna y Cauvery y el sistema fluvial Ganga- Brahamaputra transporta alrededor de 1,4 x109 toneladas de

sedimentos en suspensin a la baha , la ms alta entre todos los ros mundiales ( Madhupratap et al. , 2003 ) . El muestreo se llev a cabo en 33 estaciones en 11 trayectos en la Baha de Bengala (lat. 10_360N - 20_010N y largo plazo. 79_590E - 87_300E). En cada uno de los lugares a una profundidad de aprox. 200, 500 y 1.000 m .Las muestras de sedimentos fueron recogidas por Smith McIntyre Grab en los viajes realizados l( Cruise # 225 en 2004 y Cruise # 236 en 2005 ) auspiciados por el Ministerio de Tierra ciencias del Gobierno de la India. Por tanto, muchos de los Hf encuentran un ambiente propicio para su proliferacin, teniendo como el sitio de mayor diversidad de HF Divipoint, gracias a que all se cuenta con el medio ambiente que lo propicia por ejemplo, se encuentra en un punto medio del estudio y la diversidad y riqueza microbiana es mayor, su rea es pantanosa y dominada por los manglares, aunque en el mapa de las muestras, podemos observar que sus comunidades biolgicas prximas son muy similares, y las muestras que estn muy distantes tienen pocas especies en comn o de la misma especie y son diferentes los niveles de biomasa. Aunque los resultados arrojaron una buena representacin de la interrelacin entre las especies de cada estacin. Igualmente, las variables ambientales que modelan la diversidad de HF en BBI tambin, tiene que ver con el detritus puesto que cuando llega a la orilla son colonizados por el hongo facultativo y deriva en el mar por el viento y las acciones de las corrientes de agua, los movimientos de las mareas, y etc. Pronto, junto con los hongos de onda, los restos se dispersan en la columna de agua y, posteriormente, los hongos se asientan en la parte inferior colonizando. En el presente estudio fueron dominantes, Penicillium, Fusarium, Cladosporium , Cephalosporium , Paecilomyces. Lo que demuestra que el talud continental del Golfo de Bengala es ms diverso en trminos de especies fngicas que el fondo del mar. Esto nos permite decir que las 23 especies fueron influyentes en la diversidad porque fueron capaces de crecer y esporular y participar activamente en el proceso ecolgico, beneficiando la descomposicin y el proceso de

remineralizacin; sorteando el problema que representa el agua del mar con sus concentraciones de iones capaces de ejercer efectos en los procesos celulares y el Ph alcalino; y adatarse a la presin hidrosttica y la baja temperatura, lo cual nos lleva a concluir que la diversidad alfa de especies de hongos filamentosos es mucho ms abundante porque hay ms hongos facultativos que vienen a acompaar a los hongos marinos obligatorios, ahora bien cabe anotar que son contados los estudios comparativos que se han realizado al respecto, de cmo es la diversidad en ecosistemas similares, sin embargo; en su ecologa y fisiologa no creemos que vare a otros sistemas costeros, puesto que hay estudios, como por ejemplo el realizado en playas y manglares, del estero Zacatecas e Isla San Jos, en la baha de La Paz, en el golfo de California, Mxico que hacen referencia a su ecosistema y como los hongos marinos conviven con los

facultativos y registra mltiples especies y como los hongos ascomicetes marinos saprobiontes, son quienes degradan los restos vegetales compuestos por lignocelulosa, liberando los nutrimentos para su reciclaje. Entonces tenemos que a pesar de la importancia de la funcin ecolgica que realizan, su diversidad se encuentra poco estudiada a nivel mundial, de all la importancia de tomar conciencia que este estudio, contribuir al conocimiento de la diversidad de los hongos, y a la toma de conciencia que, debido a la destruccin o fragmentacin de los ecosistemas marinos, la diversidad fngica (hongo) se est perdiendo antes de poder describirla, conservarla y analizar cmo nos puede dar respuesta a muchos problemas e incognitas ambientales. DE QUE MANERA UN ANALISIS DE REDUNDANCIA, ES UTIL EN LA DETERMINACION DE LA DIVERSIDAD DE HONGOS ASOCIADOS A

ARBOLES DE BOSQUES TEMPLADOS. COMO SE INTERPRETA EL HECHO QUE HUBO 15% DE VARIANZA EN LA INFECCION DE TEJIDOS DE ESTOS ARBOLES POR LA COMUNIDAD DE HONGOS ESTUDIADOS, Y QUE LOS BROTES TUVIERAN TASAS DE INFECCION FUNGICA MAS ALTAS

El anlisis de redundancia es til en la determinacin de la diversidad de hongos asociados a arboles de bosques templados, ya que nos permita hacer una relacin entre las diferentes variables medidas en un estudio, en este caso podemos relacionar el nmero de especies de endfitos encontradas con el anfitrin, es decir en con la especie de rbol en la que se encontr, y tambin con el tejido en el que se encontr la especie de endfito, con estas relaciones podemos determinar el comportamiento de cada especie (si tienen una alta especificidad o en que tejido se encuentran habitualmente), y as diferenciarlas para su posterior clasificacin taxonmica. La varianza de 15,1% en la infeccin de tejidos de los arboles por parte de los hongos, se da ya que la mayora de tejidos los hongos prefieren infectar las ramas de los rboles, o simplemente se encuentran ms en la rama de los arboles ya que estas tienen mayor permanencia que las hojas, esto hace que se d una mayor poblacin de hongos en esta pare del rbol y por lo tanto all se den las tasas de infeccin fngica ms altas. PORQUE SE US ECOPATH, PARA MODELAR EN CANAL BOLVAR DE LAS ISLAS GALPAGOS? CMO SE APROVECHA LA MODELACIN DE UN SISTEMA MARINO EN TRMINOS DE VALORACIN DE SU DIVERSIDAD BIOLGICA? QUE SON SURGENCIAS Y PORQUE SE ORIGINAN? LAS ZONAS DE SURGENCIA TIENEN ALGUNA RELACIN CON LA DIVERSIDAD BIOLGICA MARINA? El desarrollar un modelo con Ecopath permite presentar estimaciones biolgico pesqueras, describir los flujos de materia y energa del ecosistema, y comparar estos resultados con otros ecosistemas tropicales y de surgencia tropical. En este caso se utiliz el modelo ecopath-ecosim para caracterizar las cadenas trficas del sistema de islas galpagos y para explorar la dinmica del sistema y as proponer soluciones para el problema de sobrepesca en la isla, con nfasis en el pepino de mar.

El modelos de ecopath permite evaluar la produccin y diferentes relaciones de la cadena trfica esto permite medir la diversidad aproximada de las especies pertenecientes a cada cadena trfica, as mismo para usar el modelo ecopath tambin es necesario tener una biomasa aproximada y as establecer un modelo ms adecuado sobre el Canal Bolvar De Las Islas Galpagos. Una surgencia es un desplazamiento ascendente de aguas marinas se produce por el efecto de la fuerza de Coriolis, originada en la rotacin de la Tierra, una columna de agua en movimiento experimenta una rotacin de 90 con relacin a la direccin del viento que la caus y que sopla a lo largo de la costa (este efecto se denomina transporte de Ekman). De esta manera un viento que sople sobre la costa puede provocar un desplazamiento de aguas superficiales hacia mar adentro, compensado por un lento movimiento ascendente de aguas profundas en direccin a la costa este fenmeno tambin es llamado afloramiento de aguas. Estas aguas de surgencia son de baja temperatura, y son altamente ricas en nutrientes como nitrato y fosfato estos son resultantes de la remineralizacion por bacterias de los restos orgnicos que se acumulan en el fondo del mar, cuando se produce la surgencia, estos nutrientes entran en contacto con el fitoplancton que se encuentran en la capa superficial del mar, los cuales utilizan los nutrientes y junto a CO2 disuelto y energa solar, para producir compuestos orgnicos, lo cual se traduce en una gran cantidad de produccin primaria. Esto hace que tengan una gran relacin con la diversidad biolgica marina ya que al tener una alta produccin primaria que lleva a un aumento en la cadena alimentaria y por lo tanto en una mayor biomasa de organismos marinos en estas zonas.

CONCLUSIONES Comprendimos la importancia del uso de organismos modelo para mltiples

investigaciones ya que estos permiten la obtencin de informacin muy valiosa

sirviendo como modelos para obtener mayor informacin de otras especies las cuales son ms difciles de estudiar, permitiendo a partir de estos datos ampliar el conocimiento de la biodiversidad. Entendimos la metodologa usada en la determinacin de la diversidad biolgica de hongos ya que se baso en la recoleccin de muestras de sedimentos y estos se utilizaron para un anlisis de la poblacin; por otro lado la identificacin se hizo por procesos taxonmicos como la comparacin directa de las muestras, con esto se concluy que la diversidad de especies de hongos filamentosos varan con la profundidad y que esta, disminuye los ndices de diversidad, como por ejemplo en talud continental del Golfo de Bengala Concluimos que muchos de los Hf encuentran un ambiente propicio para su proliferacin, teniendo como el sitio de mayor diversidad de HF Divipoint, gracias a que all se cuenta con un medio ambiente que lo propicia. Comparamos que la diversidad alfa de especies de hongos filamentosos es mucho ms abundante porque hay ms hongos facultativos que vienen a acompaar a los hongos marinos obligatorios Entendimos la importancia de la funcin ecolgica que realizan los hongos, su diversidad se encuentra poco estudiada, de all la importancia de tomar conciencia de este estudio, contribuir al conocimiento de la diversidad de los hongos, y a la toma de conciencia que, debido a la destruccin o fragmentacin de los ecosistemas marinos, la diversidad fngica se est perdiendo antes de poder describirla. Comprendimos que los hongos no siempre estn en todos los tejidos de los arboles a los cuales infectan sino que en su mayora infectan a las ramas debido a su mayor permanencia en el rbol

Comprendimos la importancia de modelar los ecosistemas marinos por medio de un Ecopath y asi comprender mejor las cadenas troficas en este tipos de ecosistemas. Entendimos la importancia de zonas de surgencia y su papel en el aumento de la biomasa y diversidad marina REFERENCIAS 1 sobre los modelos, (20011) seres modelicos entre la naturaleza y el laboratorio, Consejo Superior de Investigaciones Cientficas (CSIC), blog consultado en lnea 25 de septiembre 2013. http://seresmodelicos.csic.es/sobre-els-models.html 2 Transcriptmica - Plataforma biotecnolgica (2011) instituto nacional de 25 de septiembre

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