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UNIVERSIDAD INDUSTRIAL DE SANTANDER,VIERNES 4 DE MAYO 2012

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´ DE PATRONES IDENTIFICACION ´ CEREBRALES DESCRIPTORES ANATOMICOS DE LAS COORDENADAS TALAIRACH A PARTIR DEL ESTUDIO DE IMAGENES ´ TOMOGRAFICAS
Autores ILMER JOSE GRANADOS CUELLO ilgracu@hotmail.com ANDRES EDUARDO LINEROS PINTO andres eduardo32@hotmail.com

Abstract— aqui va Index Terms— Talairach.

I. Introduction II. Objetivos A. Obejtivo General Determinar autom´ aticamente puntos caracter´ ısticos ´ anatmicos cerebrales para ajustar Coordenadas Talairach B. Obejtivos Especificos

Por esta raz´ on, muchas t´ ecnicas desarrolladas para im´ agenes monocrom´ aticas pueden extenderse a im´ agenes con color, procesando individualmente las im´ agenes que la componen. Una imagen puede ser continua respecto a las coordenadas x e y, as´ ı como su amplitud. Para convertir dicha imagen a su forma digital requiere que tanto las coordenadas como la amplitud sean digitalizadas. Digitalizar los valores de las coordenadas se llama muestreo, la digitalizaci´ on de los valores de amplitud se llama cuantizaci´ on. B. DICOM Digital Imaging and Communication in Medicine (DICOM), es el nombre dado al est´ andar para el intercambio de im´ agenes m´ edicas, est´ a destinado al cumplimiento de tareas como el manejo, almacenamiento, impresi´ on y transmisi´ on de im´ agenes m´ edicas. Una de sus ventajas es la posibilidad de intercambiar este tipo de ficheros entre entidades que posean la capacidad de recibir im´ agenes y datos de pacientes en formato DICOM. Adicional a la naturaleza propia de la imagen, DICOM contiene la informaci´ on necesaria para la identificaci´ on del ´ sta accidentalmente. paciente evitando que sea separado de e Ofrece flexibilidad entre sistemas de almacenamiento y comunicaci´ on de im´ agenes, se evita inconvenientes de comunicaci´ on independientemente del fabricante del dispositivo y facilita la creaci´ on y consulta de sistemas de diagn´ ostico en lugares locales y remotos. ´ C. MEJORAMIENTO DE IMAGENES las t´ ecnicas para el mejoramiento digital de im´ agenes tienen y se basan principalmente en el objetivo de procesar una imagen para hacerla m´ as adecuada de acuerdo a la aplicaci´ on o al posterior procesamiento que quiera ´ sta, y el uso de una u otra t´ hacerse con e ecnica depende del problema espec´ ıfico a resolver. Los m´ etodos para el mejoramiento de im´ agenes pueden dividirse en dos campos:

Implementar algoritmos que permitan delimitar diferentes contrastes de color sobre la imagen DICOM del cerebro en estudio. ´ reas como la comisura anterior y la comisura Localizar a posterior fundamentales para la definici´ on de las coordenadas a implementar. Utilizar una t´ ecnica de inteligencia artificial para que de forma autom´ atica queden delimitados puntos anat´ omicos: Punto m´ as frontal, punto m´ as temporal, punto m´ as posterior y el punto m´ as occipital.

III. MARCO TEORICO A. REPRESENTACION DIGITAL DE UNA IMAGEN Una imagen se puede definir como una funci´ on bidimensional,f (x, y ), donde x e y son coordenadas espaciales, y a la amplitud de f de cualquier par de coordenadas (x,y) se le conoce como intensidad de la imagen en dicho punto. El termino nivel de grises se usa normalmente para referirse a la intensidad de im´ agenes monocrom´ aticas. Las im´ agenes a color est´ an formadas por una combinaci´ on de im´ agenes 2D individuales. Por ejemplo, en el sistema de colores RGB, un color se constituye de tres componentes individuales de im´ agenes [Red(R), Green(G), Blue(B )].

este comportamiento esta descrito por la siguiente ecuaci´ on: ρ = x cos θ + y sin θ donde ρ es la longitud desde el origen hasta la l´ ınea y θ es ´ ngulo de ρ con respecto al eje x. j ) 4) TRANSFORMADA DE HOUGH: La transformada de Hough es una t´ ecnica utilizada para aislar caracter´ ısticas de forma particular dentro de una imagen. Filtros pasaaltas y Filtros detectores de bordes • • las siguientes condiciones en cualquiera de los casos. las zonas como los bordes que presentan grandes ´ reas de cambios o r´ apidas transiciones se conocen como a altas frecuencias. se confundan y as´ ı poder eliminar las partes no deseadas de la misma. El procedimiento b´ asico para realizar este tipo de filtrado es remplazar el valor de cada pixel en una imagen por el promedio de los niveles de grises del vecindario definido por la m´ ascara. • Distinta de cero al principio o al final de un cambio del tipo rampa o escal´ on en el nivel de gris. Se puede anal´ ıticamente describir un segmento de l´ ınea en varias formas. • Distinta de cero a un cambio escal´ on o rampa en el nivel de gris.UNIVERSIDAD INDUSTRIAL DE SANTANDER. TOMOGRAFIA AXIAL COMPUTARIZADA La tomograf´ ıa axial computarizada (TAC) es una modalidad de imagen medica que produce im´ agenes donde se puede observar el interior del cuerpo humano. a trav´ es de cortes transversales al eje cefalo-cudal (cortes tansaxiales). ´ DE LINEAS: ´ 3) DETECCION El uso de m´ ascaras como las presentadas en la figura 1 al ser aplicadas con cada uno de los pixeles de la imagen presenta diferentes respuestas de acuerdo a la orientaci´ on de l´ ıneas del ancho de un pixel. con lo cual se logra que los objetos dentro de la imagen con niveles de grises similares. ver Fig 2 el a 2) FILTRO PASALTAS: Producen el efecto contrario a los pasabajos. • Distinta de cero en toda la zona con un cambio de tipo rampa. Para la segunda derivada: • Cero en zonas con nivel de gris constante. vertical. la imagen obtenida . Si bien es cierto el uso m´ as com´ un de los filtros pasabajas es atenuar los detalles irrelevantes de una imagen. La forma general de implementar un filtro pasabajos con m´ ascaras promediadas es la siguiente: a i=−a b j =−b f (x + i. ya que fundamentalmente la magnitud de la aplicaci´ on del operador derivada es proporcional al grado de discontinuidad presentado en cada punto donde es aplicado este operador. Los filtros pasaaltos presentados a continuaci´ on se basan en el uso de la primera y segunda derivada y deben cumplir con D. de forma general. se orientan a acentuar las altas frecuencias y de esta manera. ´ TECNICAS DE FILTRADO 1) FILTRO PASABAJAS: Se puede decir que aplicar un filtro pasabajas a una imagen. en el mejoramiento espacial se hacen manipulaciones directas sobre los pixeles de la imagen mientras que en el frecuencial se modifica la transformada de Fourier de la imagen. simplemente es el resultado de promediar todos los pixeles contenidos en vecindario de la m´ ascara utilizada. que es una imagen de muchos planos superpuestos. M´ ascaras para la detecci´ on de l´ ıneas ∗ h(i. mientras que las que muestran transiciones ´ reas de bajas frecuencias. mejorar los l´ ımites de la imagen. Para la primera derivada: • Debe ser cero en las zonas con nivel de gris constante. a 45◦ o a −45◦ responder´ a mejor a cada una de las m´ ascaras descritas en el mismo orden. Cuanto m´ as grande es el tama˜ no de la m´ ascara utilizada. Si la l´ ınea se encuentra orientada de forma horizontal. Si se compara con la radiograf´ ıa convencional. j ) Fig. graduales son definidas como a Basados en esto los filtros espaciales pueden dividirse en tres categor´ ıas principales: Filtros pasabajas. mayor ser´ a el borroneado en la imagen. Adem´ as se pueden utilizar estos filtros para la atenuaci´ on de ruido. Sin embargo una ecuaci´ on conveniente para describir un conjunto de l´ ıneas es la notaci´ on param´ etrica o normal. • Cero en toda la zona con cambio del tipo rampa y pendiente constante.VIERNES 4 DE MAYO 2012 2 m´ etodos para el mejoramiento espacial y m´ etodos para el mejoramiento frecuencial. De esta manera la diferenciaci´ on de una imagen realza los bordes ´ reas donde el nivel de gris var´ y aten´ ua a ıa gradualmente. Para este tipo de filtrado se hace uso de la diferenciaci´ on. y + j ) b a i=−a j =−b h(i. La idea b´ asica es encontrar curvas que puedan ser parametrizadas como l´ ıneas rectas. polinomios y c´ ırculos. de hecho tomograf´ ıa proviene del griego thomos que significa rebanada. 1. tambi´ en se puede utilizar este tipo de filtro para suavizar los falsos contornos producidos por la cuantizaci´ on con un n´ umero insuficiente de niveles de gris. FRECUENCIA ESPACIAL La magnitud de cambios en el nivel de gris que se da en una determinada zona de la imagen est´ a definida por la frecuencia espacial.

Fig. similar a las rebanadas de una hogaza de pan. la cual describe una serie de mapas cerebrales dentro de un sistema de coordenadas dependientes de dos puntos anat´ omicos de origen: La comisura anterior y la Comisura posterior. Tambi´ en conocido plano sagital medio. perpendiculares al plano sagital y pasan a trav´ es de la longitud del cuerpo. a) Espacio Cartesiano. Planos anat´ omicos en sus 3 vistas • PLANO SAGITAL El plano sagital se llama as´ ı por la sutura sagital.UNIVERSIDAD INDUSTRIAL DE SANTANDER. Pasan por el ancho del cuerpo en direcci´ on horizontal o direcci´ on transversal. La tomograf´ ıa axial computarizada se usa rutinariamente en ex´ amenes radiol´ ogicos para diagn´ ostico y en aplicaciones especiales como planeaci´ on de tratamiento en radioterapia o en imagenologia tridimensional para planeaci´ on quir´ urgica. Para tener una percepci´ on de los planos anat´ omicos que forman las vistas del cerebro humano. Planos paralelos pero que no pasan por la l´ ınea media son denominados parasagitales. 4.. Los planos coronales son por lo tanto. Estas proyecciones son adquiridas electr´ onicamente utilizando un arreglo de detectores de estado s´ olido y una fuente de rayos X que gira alrededor de un paciente. axial o secciones transversales. en las Fig. ANATOMIA Dentro de los sistemas que buscan dar una descripci´ on adecuada de la anatom´ ıa cerebral se encuentra la t´ ecnica de Talairach . 5. es cualquier plano que pase a trav´ es del cuerpo paralelo a la sutura coronal del cr´ aneo. SISTEMA DE COORDENADAS En el sistema de coordenadas de Talairach existen una serie de puntos que determinan unos planos que forman el sistema. Fig. ver Fig 3. PLANO TRANSVERSAL Los planos transversales son perpendiculares a ambos planos. 4. Una imagen tomogr´ aficas es reconstruida matem´ aticamente a partir de un gran n´ umero de proyecciones en una dimensi´ on del plano elegido. Y son los siguientes: . tambi´ en llamado plano frontal. que es una articulaci´ on fibrosa tipo sutura en la l´ ınea media del cr´ aneo.F Fig.VIERNES 4 DE MAYO 2012 3 • PLANO CORONAL El plano coronal. Corte Axial Fig. • ´ CEREBRAL F. dividiendo el cuerpo en una porci´ on anterior y otra posterior. Los planos transversales dividen al cuerpo en una secci´ on superior y otra inferior y tambi´ en son denominados plano horizontal. Transversal planos son perpendiculares a ambos planos coronal y sagital. sagital y coronal. PLANOS ANATOMICOS Son superficies imaginarias que dividen al cuerpo en secciones para la descripci´ on y ubicaci´ on de sus componentes. divide el cuerpo en mitades derecha e izquierda. 3. Representaci´ on gr´ afica transformada de Hough. b) Espacio Param´ etrico por tomograf´ ıa axial computarizada muestra una mejora significativa en el contraste de los tejido que componen la estructura del cuerpo humano. se muestra de forma gr´ afica los tres planos principales que conforman la topolog´ ıa del cerebro. 2. Corte Sagital G. ´ E.

8 IV. Ubicaci´ on L´ ınea CA-CP En la Fig. 8 se muestra la localizaci´ on de los Puntos de referencia antes mencionados as´ ı como los planos que forman. • La l´ ınea VCP es una l´ ınea vertical tangencial al margen anterior de la Comisura Posterior. • El punto m´ as posterior del c´ ortex occipital. 9. Luego de definir la l´ ınea divisoria de los dos hemisferio(izquierdo y derecho) como se observa en la Fig. Una vez ubicada la parte posterior de la comisura anterior (l´ ınea vertical Fig. Para ubicar la comisura anterior y la comisura posterior se debe realizar un corte sagital en la divisi´ on de los 2 hemisferios cerebrales. Debajo de la l´ ınea en cuatro partes. El espacio entre las l´ ıneas VCA y VCP se divide en tres partes para una localizaci´ on m´ as exacta de las estructuras centrales. Verticalmente.UNIVERSIDAD INDUSTRIAL DE SANTANDER. numeradas de 9 a 12.VIERNES 4 DE MAYO 2012 4 Fig. se obtiene el corte sagital de esta secci´ on. El volumen total se divide horizontalmente. • El punto m´ as anterior del c´ ortex frontal. Posteriormente a la l´ ınea VCP en cuatro partes. En la Fig. el sistema se establece de acuerdo a las dimensiones m´ aximas del cerebro en los tres planos del espacio. • El punto m´ as inferior del c´ ortex temporal. L´ ınea divisoria de los 2 hemisferios comisura anterior VCA) y la parte anterior de la comisura anterior (l´ ınea vertical comisura anterior VCP). numeradas de F a I. numeradas de D a A. 8. Para establecer una subdivisi´ on adecuada en el sistema tridimensional se utiliza la siguiente t´ ecnica. El origen de coordenadas est´ a localizado en el punto de intersecci´ on de los 3 planos. 6. como se indica en la Fig. • El punto m´ as lateral del c´ ortex parietemporal. METODOLOGIA Y RESULTADOS Para determinar los puntos caracter´ ısticos de las coordenadas Talairach. 7. corte de donde se procede a localizar los dos puntos comisurales. 9. La l´ ınea VCA es una l´ ınea tangencial al margen posterior de la Comisura Anterior y define este plano. se marcan 2 l´ ıneas perpendiculares a la recta que los une. encima de la l´ ınea CA-CP en ocho partes numeradas del 1 al 8. • Fig. • La l´ ınea media en el plano interhemisf´ erico sagital es la base para las medidas en los desplazamientos laterales y viene determinada por la comisura interhemisf´ erica. Localizaci´ on de las coordenadas Talairach en un sistema de 3 dimensiones Fig. Corte Coronal Plano horizontal que se determina por la l´ ınea CA-CP donde CA es la Comisura Anterior y CP es la Comisura Posterior. • Plano vertical. y las divisiones que en ella aparecen son las siguientes. CARGAR IMAGENES DICOM Para el almacenamiento de las im´ agenes se hace uso de una hipermatriz. concretamente la denominaci´ on t´ ecnica de los puntos que determinan este volumen es la siguiente: • El punto m´ as alto del c´ ortex parietal. se sigue sigue el esquema presentado en la Fig. parte central identificada como E. 7 se muestra el sistema de coordenadas de Talairach. dicha hipermatriz se define mediante tres . anterior a la l´ ınea VCA en cuatro partes. 10 A. donde se podr´ a observar los 2 puntos que demarcan las coordenadas iniciales del sistema.

El primer paso que debe hacerse es el de preparar la imagen para poder realizar la Transformada de Hough. ´ 1) CISURA INTERHEMISFERICA VISTA AXIAL: Para la detecci´ on de la Cisura Interhemisf´ erica se hace uso de ´ sta a su vez es usada para calcular la Transformada de Hough. IDENTIFICACION Para la identificaci´ on del este plano se deben conocer la cisura interhemisf´ erica en la vista axial y en la vista axial ˜ y en la vista coronal. la segunda parte ser´ an los u caracteres del nombre del archivo pues estos indican el n´ umero de la imagen y pueden ponerse a variar. 11. Fig. Para almacenar las im´ agenes desde la 1 hasta la 9 var´ ıa la ´ ltima cifra. Por la forma en la que se acomoda el paciente en la camilla del tom´ ografo pueden darse dos condiciones: en la primera la l´ ınea puede tener un Fig. como se explicar´ a m´ as adelante.VIERNES 4 DE MAYO 2012 5 Fig. e ´ ngulo de rotaci´ el a on axial. el a la desviaci´ on en el plano axial se determina a partir de dos puntos sobre la l´ ınea recta. la primera parte corresponde a la ruta y la parte inicial del ´ ltimos tres nombre del archivo. para detectar los bordes se usa el algoritmo de Canny. Cargar Imagenes ´ PLANO INTERHEMISFERICO ´ B. 10. esta matriz H nos permite relacionar el n´ umero de veces en las que una misma l´ ınea recta pasa por cada pixel de la imagen. la tercera dimensi´ on hace referencia al n´ umero de tomograf´ ıas con las que se cuenta para cada paciente. de esta forma el primer pico hace referencia a la l´ ınea de mayor longitud y m´ as representativa. ´ ngulo es necesario debido a que el paciente puede no este a encontrarse con la cabeza correctamente ubicada y alineada en los tres planos(axial. 13 Luego de preparar la imagen se aplica la transformada de Hough. este primer paso consiste en eliminar las dos zonas de la imagen en las que se observa el soporte de la camilla del tom´ ografo y detectar los bordes. de esta forma se tiene el n´ umero de tomograf´ ıas.UNIVERSIDAD INDUSTRIAL DE SANTANDER. desde la 10 hasta la 99 var´ ´ ltimas u ıan las dos u cifras del nombre del archivo y para almacenar desde la 100 ´ ltimas cifras. Esquema Metodolog´ ıa ˜ o mero de columnas de dimensiones: el n´ umero de filas y el nA las im´ agenes corresponden respectivamente al largo y ancho de cada matriz. En la Fig. ya que es all´ ı donde se observa con claridad esta cisura.Se usa un ciclo for hasta la 999 se toman las tres u para la variaci´ on de las cifras en cada una de las tres etapas. sino que tambi´ en ser´ a ´ ngulo de rotaci´ usada para determinar el a on coronal que deber´ a usarse para corregir la segunda de las tres desviaciones Para ahorrar tiempo de ejecuci´ on se hace un barrido de las im´ agenes de la parte superior del cerebro comenzando desde la que est´ a m´ as cercana al centro y desplaz´ andose hacia arriba. definiendo de esta manera las dos primeras dimensiones. 14 las zonas blancas representan los picos de la transformada de Hough. A partir de este an´ alisis la l´ ınea obtenida se observa en la Fig. como se mencion´ o anteriormente. el ´ ltimo ciclo for se detiene cuando se llega al final de im´ u agenes contenidas en la carpeta. Fig. Para poder acceder a cada tomograf´ ıa se hace necesario dividir la ruta de acceso y el nombre de cada imagen en dos partes. 12 . que proyectadas forman el plano interhemisf´ erico. La Cisura Interhemisf´ erica juega un papel de gran importancia. ya que no solo hace parte del Sistema de Coordenadas de Talairach y sirve como referencia para determinar la rotaci´ on en sentido axial. 12. pueden usarse uno o varios picos de la matriz H pero para este caso se usar´ a solo uno puesto que la Cisura ˜ Interhemisf´ erica es la mayor lAnea recta que puede observarse. Estructura de una Hipermatriz En primer lugar se determina la cantidad de archivos con formato Dicom(. 15 De esta figura puede observarse uno de los grados de ´ ngulo que representa inclinaci´ on que debe corregirse. coronal y sagital) y corrigi´ endolo se logra solucionar una de estas tres desviaciones. lo cual da como resultado 2 lAneas perpendiculares entre si.dcm) dentro de la carpeta de im´ agenes del paciente. Fig. Cuando se cumplan los requisitos de tama˜ no y ubicaci´ on se detiene el barrido. a fin de encontrar la l´ ınea de mayor tama˜ no que se localice en la parte central de la tomograf´ ıa.

Sabiendo esto ´ ngulo para dar rotaci´ se procede a calcular dicho a on a las im´ agenes. 14. es un plano perpendicular al plano interhemisf´ erico demarcado por una l´ ınea que pasa por las comisuras anterior y posterior (CA-CP) Fig.UNIVERSIDAD INDUSTRIAL DE SANTANDER. 15. Division Interhemisferica Fig. 15. La imagen rotada y su comparaci´ on con la original dada por el tom´ ografo se muestran en la Fig. Se toman dos puntos de cada l´ ınea para determinar la ecuaci´ on de la recta que las representa. IDENTIFICACION DEL PLANO COMISURAL El plano comisural. en ´ ngulo ser´ la segunda este a a mayor a 90◦ pero no superior a ´ ngulo se diera el paciente deber´ 180◦ . esto debido a que las l´ ıneas que se encuentran en esas im´ agenes no se destacan de igual forma luego de obtener los bordes. Bordes de la Imagen Con el Algortimo de Canny Fig. menor a 90 . Rotaci´ on Fig. Luego de encontrar esa u ınea tenemos dos l´ ıneas rectas que representan la Cisura Interhemisf´ erica a diferentes profundidades. se hace un barrido desde la parte superior ◦ C. 18. por esto se hace necesario encontrar las 2 estructuras anteriormente mencionadas las cuales se ubica en el plano sagital Fig. referenciado a una l´ a ınea horizontal. por lo tanto se hace necesario hacer el barrido tanto por im´ agenes como por las l´ ıneas que se obtienen a partir de ´ ltima l´ cada imagen.VIERNES 4 DE MAYO 2012 6 Fig. 16. 17. Fig. ´ 2) CISURA INTERHEMISFERICA VISTA CORO´ ngulo de rotaci´ NAL: El a on en el plano coronal se establece de forma similar. Para encontrar el plano sagital y el plano coronal se debe hacer una proyecci´ on en los diferentes ejes de coordenadas de las im´ agenes DICOM del corte axial que ofrece el tom´ ografo . Cisura Interhemisf’erica Vista Coronal ´ ngulo. lo m´ as separadas posible. 16. 13. Matriz H del cerebro hacia la parte inferior hasta encontrar la primer l´ ınea cuya posici´ on y tama˜ no permitan decir que se trata de la Cisura Interhemisf´ erica. con esta ecuaci´ on se encuentra un punto de la l´ ınea ubicado a igual distancia en el eje de coordenadas Y(filas de la matriz) para ambas l´ ıneas. para esto deben tomarse un mayor n´ umero de picos de la Transformada de Hough. la uni´ on de dichos puntos vistos desde el plano coronal representan la Cisura Interhemisf´ erica en ese plano. pues para que ese a ıa estar acostado sobre un lado de su cuerpo.

buscado sobre es cuerpo calloso esta misma coordenada.con esto se busca tener las im´ agenes en los 3 planos paralelas a cada uno . 21 Fig. Fig 24. 20. Para lograr este prop´ osito se utiliz´ o la t´ ecnica de crecimiento de regiones (RegionGrowing) teniendo en cuenta que la semilla de crecimiento ser´ a el nivel de intensidad gris de la zona m´ as oscura perteneciente a dicha estructura.VIERNES 4 DE MAYO 2012 7 Fig. La comisura posterior se encuentra por encima del acueducto cerebral. Fig. 18. Lo primero que se debe hacer es un pre-procesado (filtrado) de la imagen para eliminar los efectos de ruido y de inhomogeneidad. este proceso permitir´ a el reconocimiento de los puntos CA (comisura anterior) y CP (comisura posterior). Localizaci´ on CP Dadas las diferencias anat´ omicas distintivas de cada individuo se debe procesar un rango de im´ agenes amplio para encontrar las estructuras.Para este efecto se recorre el contorno de la imagen (cuerpo calloso) hasta que encontrar los punto extremos y se demarca el siguiente pixel Fig. pero que pueden descartarse teniendo en cuenta la ubicaci´ on tipica de la estructura tomogrsa. Fig 22. Luego de encontrar todas las im´ agenes donde los ventr´ ıculos se hacen visibles. 19. se realiza sobre las im´ agenes un preprocesado con el fin de separar esta estructura de las dem´ as. ´ 1) LOCALIZACION CP: Ubicada esta estructura se procede a ubicar el punto inferior de la parte posterior de la misma que corresponde a la comisura posterior CP (tala). Dada la resolucio´ on que brindan las im´ agenes tomograf´ ıcas. siguiendo el mismo procedimiento utilizado anteriormente en la segmentaci´ on del cuerpo calloso.Fig. esto se consigue encontrando el punto mas exterior (recorriendo la imagen de izquierda-derecha) del cuerpo calloso y realizando los cortes en el plano coronal a partir de ese punto. por su parte la comisura anterior se encuentra al otro lado del cuerpo calloso. Luego de tener ubicados CA y CP se encuentra la inclinaci´ on de la im´ agen respecto al eje horizontal. el niveles de intensidad cercanos a los de los niveles pertenecientes al cuerpo calloso pueden encontrarse en otras zonas de la imagen.Fig 25. Imagen de un corte en el plano sagital Fig. por los cual se hace indispensable segmentar de la imagen para separar esta estructura del resto de la misma. ya que la ubicaci´ on de estas cambia de un sujeto a otro.UNIVERSIDAD INDUSTRIAL DE SANTANDER. luego este punto es proyectado al plano sagital. 20 ´ CA: Para la ubicaci´ 2) LOCALIZACION on de este punto es necesario localizar los ventr´ ıculos. Luego de tener todas las im´ agenes con los ventr´ ıculos segmentados se encuentran el punto inferior (punto mayor Coordenada Y)de todas las im´ agenes. se marca el pixel siguiente el cual ubica CA. 21. guardando estas coordenadas para luego compararlas entre se y obtener el m´ aximo de todas las coordenadas en el eje y. m´ as concretamente en la parte inferior de la zona posterior del acueducto cerebral. Fig 23. Para ahorrar tiempo de procesamiento se deben encontrar los cortes a partir de los cuales esta estructura se hace visible. estructura cerebral que se puede apreciar en el plano coronal. Comisuras::::::: Localizaci´ on y Segementaci´ on Del Cuerpo Calloso y luego se debe realizar una interpolaci´ on para encontrar lo niveles intermedios de grises que aportar´ an la informaci´ on para tener la cantidad de cortes necesarios para la ubicaci´ on de las estructuras que describen el sistema de coordenadas Talairach.

23. Tambi´ mayor intensidad que describa el a en se debe encontrar el contorno del resultado de la segmentaci´ on. Luego de tener el contorno de la corteza cerebral el punto m´ as anterior de la corteza frontal se encuentra recorriendo el per´ ımetro y en marcando el punto m´ as a la izquierda de la imagen que corresponde al pixel en la posici´ on menor de la coordenada x.y. Fig. 27 . Punto Referencia CA Plano Coronal de los ejes coordenados(x.Fig. 26.UNIVERSIDAD INDUSTRIAL DE SANTANDER. para lo cual se utilizara la t´ ecnica de crecimiento de regiones tomando como semilla inicial el valor del pixel de ´ rea a segmentar.VIERNES 4 DE MAYO 2012 8 Fig. Ventr´ ıculos vistos en el plano coronal Fig. 22. 29. 26 Adem´ as del plano del plano comisural y el plano interhemisf´ erico se debe trazar los planos que pasan por cada comisura y que son perpendiculares a los planos anteriores y paralelos entre si. L´ ınea CA-CP que pasa por las dos comisuras y describe el plano comisural Fig. Luego de hallar este angulo de inclinaci´ on y de rotar la imagen se traza el plano (CA-CP) descrito por estas 2 estructuras y que es perpendicular al plano interhemisf´ erico y paralelo al eje x.z). L´ ınea CA y CP que describen los planos ´ PUNTOS LIMITES D. Comisura Anterior CA Fig. 27. Ventr´ ıculos Segmentados Fig. IDENTIFICACION Para ubicar el volumen total de la estructura cerebral dentro de la rejilla descrita por las coordenadas Talairach se deben encontrar los punto extremos de la estructura: • Punto m´ as anterior de la corteza frontal • Punto m´ as posterior de la corteza occipital • Punto m´ as alto de corteza Parietal • Punto m´ as inferior de la corteza Temporal Se debe realizar un una segmentaci´ on de toda la corteza cerebral. de igual manera para encontrar el punto m´ as Fig. Fig. para tener una mayor fiabilidad en la ubicaci´ on de los puntos de inter´ es. 25. 24.

. es por esta raz´ on que pueden diferenciarse con facilidad tres grandes zonas dentro de la tomograf´ ıa de la cual se necesita solo la correspondiente al rango de intensidad entre 0 y 60.Fig. con el prop´ osito de obtener de ese conjunto de im´ agenes el punto con la menor coordenada en el eje X(punto extremo izquierdo) y el punto con la mayor coordenada en X(punto extremo derecho). 30. de no hacerse as´ ı se obtendr´ ıan lecturas err´ oneas a causa de la inclinaci´ on de la cabeza del paciente. la zona exterior de la tomograf´ ıa donde no se encuentra la cabeza del paciente tiene valores de intensidad negativos entre -1000 y -2048.VIERNES 4 DE MAYO 2012 9 Fig. posterior de la corteza occipital se marcara el punto m´ ass a la derecha en la imagen el cual corresponde al pixel en la posici´ on mayor de la coordenada X.. Luego de tener las coordenadas de este punto. se toman un rango de im´ agenes a partir de la imagen central y se analizan de igual forma im´ agenes hacia arriba y ´ sta.. ´ reas toman el valor de 0. Estos puntos extremos que ´ rea cerebral se determinan luego indican la finalizaci´ on del a de rotar las im´ agenes en los tres planos. dentro de este rango quedan tambi´ en peque˜ nas zonas alrededor del cr´ aneo por lo tanto es necesario eliminarlas antes de continuar con el procedimiento. . tomar´ estructuras o a el valor 0. 32. Corte en el plano coronal Fig. Ubicaci´ on puntos extremos Los puntos anteriores se localizaron sobre la vista sagital ya que permite una mejor localizaci´ on de los mismo.. Para determinar estos puntos se procede a analizar una serie de im´ agenes a diferentes niveles. Se procede a hacer un conteo ´ reas con valor 1. y la zona del cerebro toma valores de intensidad entre 0 y 60 aproximadamente. El procedimiento necesario para la segmentaci´ on de la estructura cerebral es el mismo realizado en la vista sagital para la localizaci´ on de los dem´ as puntos caracter´ ısticos. 28. 31 se traslada a la vista sagital para tener todos los cuatro puntos limites que caracterizan las coordenadas talairach en esta vista. de esta forma queda el resto de a totalmente diferenciada la regi´ on a analizar. Ademas de los puntos anteriormente mencionados. los valores de los puntos se guardan hacia debajo de e en un vector para luego de este vector seleccionar la mayor y la menor coordenada en X con sus respectivos valores de . la zona de inter´ es tomar´ a el valor 1 y el resto de zonas. 30 Fig. la zona o que oscilan entre los valores de 500 a 1200 en promedio. Crecimiento de regiones para localizar puntos limites Fig. Sabiendo que existe esta diferencia de intensidad se procede a hacer un barrido por la imagen binariz´ andola. El primer paso para encontrar la localizaci´ on de estos extremos consiste en separar la regi´ on del cerebro del resto de ´ sea tiene intensidades con valores positivos la imagen. El punto m´ as alto de corteza Parietal se localiza ubicando el pixel en la menor posici´ on de la coordenada Y. la de las ´ seas y la externa a la cabeza. se deben calcular los puntos que dan el ancho del cerebro. 31. Para finalizar se encuentran los puntos anteriormente mencionados. 29.Fig. pero para la localizaci´ on del punto m´ as inferior de la corteza Temporal es necesario encontrar el punto m´ as inferior de la estruectura cerebral en la vista coronal. Contorno estructura cerebral para localizaci´ on de los punto extremos Fig. de e ´ stas se selecciona de las diferentes a ´ rea con el mayor n´ el a umero de pixeles y sus coordenadas.UNIVERSIDAD INDUSTRIAL DE SANTANDER.

L´ ıneas Horizontales: • De la l´ ınea Horizontal que pasa por las 2 comisuras CACP se trazan l´ ıneas paralelas equidistanes hasta el punto mas alto de la corteza parietal de la estructura cerebral. y de rotar y orientar todos los planos se realizan una ultima interpolaci´ on para obetener 512 im´ agenes en el plano axial. las cuales dividir´ an el cerebro en ocho zonas. y en la cual estar´ ıan representada diferentes zonas con la posici´ on que indican el sistema de coordenadas cartesianas Talairach. Rejilla de Talairach En un corte Sagital Fig. CONSTRUCCION TALAIRACH Luego de Definir los puntos caracter´ ısticos en los distintos planos. Puntos para determinar el ancho del cerebro coordenada en Y. 33. Rejilla de Talairach En un corte Coronal estructura cerebral en un cubo. para realizar una reconstrucci´ on en 3D. y la altura del cubo esta determinado por la cantidad de im´ agenes en el plano axial. el cual se forma proyectando en los ejes coordenados x e y las rejillas obtenidas en los cortes sagital y coronal. 36. las cuales dividir´ an el mismo en cuatro zonas de igual tama˜ no 2) Vistas en el Plano coronal : Lineas verticales: • Desde la linea media del cerebro se hace la divisi´ on en 4 zonas equidistantes hasta los puntos m´ as laterales en ambos lados del cerebro La ventaja que se tiene al trabajar con el sistemas de coordenadas Talairach es que permite ubicar todo el volumen de la Fig.UNIVERSIDAD INDUSTRIAL DE SANTANDER. Cubo de Coordenadas Talairach . 33 ´ DEL CUBO DE COORDENADAS E. 34. Estos dos puntos ser´ an los extremos y se muestran en la Fig. • Entre las l´ ıneas comisurales VCA y VCP se definen tres zonas de igual tama˜ no. la cual permitir´ a a un especialista tener un acercamiento a la estructura cerebral en una perspectiva mas optima Fig. 35. La cantidad de im´ agenes se obtienen luego de ubicar todos los puntos que describen el sistema de coordenadas. se define una rejilla la cual contienes todo el volumen cerebral. • Desde la l´ ınea de comisura VCP hasta el punto mas posterior de la corteza occipital de cerebro se delimitan cuatro zonas de igual tama˜ no.VIERNES 4 DE MAYO 2012 10 Fig. La construcci´ on de la rejilla se hace llevando a cabo las siguientes indicaciones 1) Vista en el Plano Sagital : L´ ıneas Verticales: • Desde la l´ ınea de comisura VCA hasta el punto mas anterior de la corteza frontal del cerebro se demarcan cuatro zonas de igual tama˜ no. • De la l´ ınea Horizontal que pasa por las 2 comisuras CA-CP se trazan l´ ıneas paralelas equidistantes hasta el punto mas inferior de la corteza termporal del cerebro.