Chapitre 1 :

LES BACTERIES.

On a deux grands groupes, les archobactries et les eubactries.
La classification est base sur des caractres gnotypiques, sur la filiation volutive
(techniques de squenage, types de parois, . !ar exe"ple, la paroi des archobactries ne
renfer"e pas d#acide "ura"ique qui est le co"posant typique des peptidoglycanes. Les lipides
"e"branaires prsentent des cha$nes aliphatiques ra"ifies, alors que che% les eubactries,
ces "&"es cha$nes ne le sont pas. 'e plus, les archobactries possdent des gnes discontinus.
I\ Les eubactries.
A\ Morphologie des eubactries.
(lles sont en gnral unicellulaires "ais on les trouve parfois sous for"e de colonies plus
ou "oins structures. Les cellules sont soit sphriques ) cocco*des, soit en b+tonnets ) bacillus.
L#enveloppe ) c#est la "e"brane la plus interne, elle est cytoplas"ique, rare"ent en contact avec
le "ilieu externe dont elle est spare par la paroi. ,he% certaines espces, la "e"brane
cytoplas"ique peut s#invaginer pour donner un e"pile"ent de "e"brane interne ) le "soso"e.
,ela se retrouve particulire"ent che% les bactries photosynthtiques ou, che% les bactries
ayant des changes ga%eux i"portants.

La coloration de -ra" per"et de sparer les eubactries en deux groupes ) les g. et les
g/. ,ette coloration est rvlatrice d#une diffrence de structure de la paroi.
/ ,he% les g., la "e"brane cytoplas"ique est recouverte d#une %one paisse de
peptidoglycane qui enfer"e la cellule dans une coque relative"ent rigide et paisse. ,ette
gangue est responsable de la for"e cellulaire et est charge de constituants secondaires
co""e l#acide te*cho*que.
/ ,he% les g/, la couche de peptidoglycanes est faible et est recouverte d#une seconde
"e"brane externe de co"position spciale renfer"ant des Lippo!oly0accharides (L!0. (ntre
la "e"brane interne et la "e"brane externe, se situe un espace troit appel le !riplas"e o1
se situe le peptidoglycane.
Les bactries s#entourent souvent d#une enveloppe suppl"entaire plus ou "oins
structure, parfois paisse, appele le -lycocalyx.
B\ Le go!e.
'ans une bactrie, il est reprsent par un double brin d#2'3 circulaire. Le gno"e est
parfois co"plt par des anneaux d#2'3 suppl"entaires plus petits ) ce sont les plas"ides. 4ls
offrent au "onde bactrien des possibilits extraordinaires d#adaptation car ils sont souvent
trans"issibles d#une cellule 5 l#autre. Les bactries changent entre elles des portions de
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squences d#2'3 ou de plas"ides qui peuvent s#intgrer co"plte"ent dans le gno"e de la
bactrie receveuse.
C\ Les cils et les "lagelles.
4ls sont co"parables aux flagelles des cellules "obiles des algues. 4ls sont constitus par
un petit no"bre de fibrilles et s#insrent au niveau du plas"al"e sur un blpharoblaste. La
protine constituant ces flagelles est lastique et contractile co""e la "yosine des "uscles.
#\ La !ultiplicatio ase$ue.
Les bactries se divisent par scissiparit. La division cellulaire peut/&tre rapide (de 67 5
87 "inutes, 5 partir d#une cellule, on peut en obtenir 9usqu#5 :7;< en 6= heures. ,#est un
phno"ne de parasexualit. ,he% certaines bactries, il existe des processus parasexus
aboutissant 5 des reco"binaisons gntiques voisines de celles rsultant de la reproduction
sexue des eucaryotes.
On conna$t trois processus ) transfor"ation, transduction, con9ugaison qui ont des
caractristiques gnrales qui per"ettent de les distinguer de la reproduction sexue des
eucaryotes.
,he% ces derniers, la contribution des deux ga"tes pour constituer le "atriel gntique
du %ygote est sy"trique. >n %ygote diplo*de redevient haplo*de 5 la suite d#une "iose. 'ans
les processus parasexus, il n#y a pas de ga"tes, "ais deux cellules 5 r?le oppos ) un parent
donneur qui introduit dans l#autre parent (receveur ou accepteur, une partie de son "atriel
gntique et donne un "ro%ygote qui contient la totalit du "atriel gntique de l#accepteur.
,e "atriel gntique est appel endognote.
'e plus, un ou plusieurs frag"ents d#2'3 du donneur (exognote rentre dans ce nouveau
"atriel gntique "ais les exognotes sont incapables de se "ultiplier et finissent par
dispara$tre. 'e te"ps en te"ps, l#exognote peut s#intercaler avec la rgion ho"ologue de l#2'3
du receveur. !ar la suite, des descendances du "ro%ygote vont appara$tre et donneront des
bactries 5 "atriel gntique reco"bin. @outefois, la "a9eure partie du gno"e provient du
receveur.

1\ La tras"or!atio.
(xe"ple avec 0treptococcus pneu"oniae ) >n change gntique peut se produire, quand,
dans un "ilieu de culture o1 se dveloppe une population bactrienne avec un gnotype donn, on
introduit de l#2'3 correspondant 5 un gnotype diffrent. La transfor"ation ne peut se
produire que si les bactries sont dans un tat Aco"ptent B.
'ans le cas de l#agent de la pneu"onie (g., l#tat de co"ptence est confr par un
facteur de co"ptence (une protine soluble de faible poids "olculaire, produite et excrte
par les bactries dans le "ilieu de culture qui est absorb sur certains sites de la surface
cellulaire. ,e facteur induit une cascade de ractions per"ettant l#entre dans la cellule de
l#2'3 transfor"ant.
0i l#2'3 est originaire d#un organis"e diffrent "ais s#il prsente suffisa""ent
d#ho"ologies avec celui de l#endognote, il est intgr 5 ce dernier sous for"e de courtes
squences. La bactrie rceptrice, en intgrant une partie de l#infor"ation gntique de l#2'3
donneur, acquire donc, une ou plusieurs caractristiques du donneur.


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%\ La trasductio.
,e "canis"e de reco"binaison gntique s#opre par l#inter"diaire d#un bactriophage.
4l y a infection d#une bactrie par un virus (virion, qui se "ultiplie 5 l#intrieur et qui provoque
sa destruction. !endant cette "ultiplication, ce virus peut intgrer 5 son 2'3 une partie du
gno"e de la cellule infecte. 2u cours de l#infection d#une nouvelle bactrie, le virion introduit
dans celle/ci, une squence du gno"e de la cellule infecte prcde""ent. ,es virions sont
appels ) A vecteur de transduction B.
&\ La co'ugaiso (sur Escherichia coli).
>ne vritable diffrenciation de type sexuel existe. 'eux bactries entrent en contact
par un pont cytoplas"ique. La bactrie "+le est plus petite que la bactrie fe"elle (rceptrice.
La bactrie "+le in9ecte un brin d#2'3 reprsent par un plas"ide ou un chro"oso"e.
>n trait do"inant du "onde bactrien est une grande varit et un i"portant
"tabolis"e. Les bactries peuvent fixer l#a%ote at"osphrique.
(xe"ple ) 'es bactries sont 5 l#origine du ga% naturel et de la houille. (lles ont donc un
r?le fonda"ental. 0ur l#Co""e, elles peuvent avoir un r?le bnfique ou pathogne.
Les bactries peuvent &tre )
- arobies strictes.
- arobies facultatives (elles vivent avec ou sans oxygne.
- anarobies strictes (elles vivent sans oxygne.
- anarobies qui supportent la prsence d Doxygne en faibles concentrations.
Les bactries anarobies sont les plus anciennes. ,ertaines bactries, co""e les vgtaux,
sont capables d#utiliser les radiations lu"ineuses co""e source d#nergie. ,e sont des
phototrophes, "ais leurs pig"ents sont diffrents de ceux des vgtaux. (n gnral, la
photosynthse a lieu en "ilieu, 5 peu prs, anarobie.
Les bactries qui effectuent toutes leurs synthses 5 partir du ,O6 co""e seule source
de carbone sont dites Aphotoautotrophes B.
'#autres bactries vivent au dpend des co"poss organiques tout en continuant 5 utiliser
l#nergie lu"ineuse. ,e sont les Aphotohtrotrophes B.
'es bactries vertes utilisent le ,O6 co""e source de carbone et C60 co""e source de
pouvoir rducteur. ,es bactries sont dites ) A chi"io/litho/htrotrophes B.
Les bactries peuvent vivre partout.
Ee"arque ) Les pig"ents per"ettant la photosynthse sont les bactriophylles et les
carotno*des.
II\ Les c*aobactries.
,#est le deuxi"e grand groupe des procaryotes. On les appelle aussi cyanophyces ou blue/
green algae.
A\ +ralits.
Les cyanobactries n#ont pas de reco"binaison gntique. 2u niveau des pig"ents, on note
la prsence de chlorophylle 2, ainsi que d#autres pig"ents ) les billiprotines qui sont solubles
dans l#eau (exe"ple ) la !hycorythrine qui est rouge et la phycocyanine qui est bleue.
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2u "icroscope, la cellule bactrienne appara$t souvent ho"ogne car elle n#a pas de plastes
individualiss. @outefois, on arrive 5 distinguer une %one priphrique ) le chro"atoplas"e, et une
partie centrale ) le centroplas"e ou nucloplas"e. La cellule est entoure d#une paroi paisse.
,elle/ci est si"ilaire 5 la paroi des gra"/. 'ans un certain no"bre de genres, on note la prsence
d#une gaine. ,elle/ci peut avoir une structure la"ellaire trs paisse. Les cellules sont dans une
sorte de gele.
B\ Structure et "octios.

1\Le chro!atoplas!a.
,#est une partie trs colore par les pig"ents. On y trouve des thylaco*des (se sont des
sacs aplatis sur lesquels est fixe la chlorophylle. 4ls sont disperss dans le centroplas"e, "ais
ne sont 9a"ais entour de parois pour for"er des chloroplastes.
Le co"plexe pig"entaire. 4l est constitu par la chlorophylle 2 qui est fixe sur les
thylaco*des, et par les carotno*des.
L#nergie lu"ineuse que peuvent capter les carotno*des est faible "ais ils peuvent avoir un
r?le cologique i"portant car ils protgent contre une trop forte intensit lu"ineuse et
e"p&chent donc la photo/inhibition.
Les billiprotines sont des pig"ents, excellents capteurs de l#nergie lu"ineuse et la
retrans"ettent presque 5 :77F 5 la chlorophylle. ,es billiprotines donnent un avantage car la
prsence de ces deux pig"ents per"et de capter tout le spectre de la lu"ire (entre =77 et
G77 n". Huand le "ilieu est carenc en a%ote, les cyanobactries utilisent celui contenu dans les
billiprotines.
%\ Les iclusios cellulaires.
Les granules de carboxyso"e ) elles sont le lieu de localisation des en%y"es fixant le ,O6
(Eubisco
Les granules de polyphosphates (I la volutine. 4ls sont "tachro"atiques (s#ils sont colors
par le bleu de "thylne ils seront rouges. 4ls sont le lieu d#accu"ulation du phosphate. 4ls sont
utiliss quand le "ilieu extrieur est carenc en phosphate.
Les granules de cyanophycine. ,e sont des rserves d#a%ote qui peuvent &tre utilises des
deux c?ts de la paroi cellulaire.
,es granules se constituent quand le "ilieu est riche en un l"ent. ,#est un avantage dans
la co"ptition entre cellules. 2 partir de ses rserves, une cellule peut se "ultiplier J 5 G fois.
,he% les cyanobactries planctoniques, on trouve trs souvent des pseudo/vacuoles
ga%euses (ce sont de petits cylindres creux, re"plis d#air, leur dia"tre est 5 peu prs de J7
n". Leur paroi est per"able 5 l#eau ) c#est un espace creux en quilibre avec les ga% dissous
dans le cytoplas"e
Leur r?le est de per"ettre aux cyanobactries de faire des "igrations verticales soient
9ournalires, soient, plus tales dans le te"ps. Huand ces bactries sont sou"ises 5 une trop
faible intensit lu"ineuse, il y a "ultiplication des pseudo/vacuoles ga%euse ) ce qui per"et une
re"onte vers la surface.
'onc ) plus l#intensit lu"ineuse aug"ente, plus la pression os"otique aug"ente. On assiste
donc a un collapsus ou dgonfle"ent de ces vacuoles qui entra$ne la descente des ces bactries.
Le gno"e ) 4l est constitu de fibrilles d#2'3 localises dans le nucloplas"a.
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&\ C*aobactries coloiales et !ultiplicatio ase$ue.
,ertaines cyanobactries (coloniales possdent des cellules spciales appeles
Ahtrocystes B. ,es cellules se distinguent par une couleur plus verd+tre, "oins dense, avec une
paroi plus paisse et surtout avec 5 chaque extr"it, la prsence d#un pore qui la "et en contact
avec les cellules contiguKs du fila"ent. Les htrocystes perdent leur carboxyso"es (et l#en%y"e
Eubisco LEibulose :,M diphosphate carboxylaseN qui fixe le ,O6, et ne peuvent donc plus
effectuer la photosynthse, et ne peuvent en consquence, plus re9eter d#oxygne.
Les htrocystes sont considrs co""e les cellules les plus aptes 5 fixer l#a%ote
at"osphrique. @out autour des htrocystes, il n#y a pas d#oxygne, c#est ce qui per"et un
"eilleur fonctionne"ent de la nitrognase (c#est l#en%y"e qui fixe l#a%ote.
(n "ilieu anarobie, toutes les cellules fixent l#a%ote at"osphrique. Les htrocystes ont la
facult de produire des asOintes. ,e sont des spores de rsistances ) c#est une cellule nor"ale
qui grandit, se re"plie de "atire organique et se protge avec une paisse "e"brane, puis se
laisse to"ber au fond du "ilieu, puis re"ontera plus tard pour recoloniser le "ilieu.
Ee"arque ) il existe de vrais et de fausses ra"ification che% les cyanobactries.
La "ultiplication asexue ) certaines for"es de cyanobactries for"ent des endospores ou
nannocystes, d#autres for"ent des exospores. Peaucoup de cyanobactries se "ultiplient gr+ce 5
des spores pluricellulaires qui sont appels hor"ospores.
@richo"es
,yanobactries coloniales
Ecologie des c*aobactries :
(lles sont rencontres dans tous les "ilieux. 'ans certains cas, elles ont un r?le utile, par
exe"ple, dans certains cours d#eau, elles fixent l#a%ote et servent ainsi d#engrais naturel. (lles
peuvent aussi avoir des effets ngatifs ) elles peuvent scrter des toxines qui seront toxiques
pour les autres habitants du "ilieu. (lles peuvent aussi &tre nfastes par leur no"bre.
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