Apa in sistemele

biologice

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Cuprins:
❒
Notiuni de fizica moleculara a lichidelor
❒
Fenomene de interfata
❒
Molecula de apa
❒
Structura si proprietatile apei
❒
Solutii apoase
❒
Apa in sistemele biologice

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Notiuni de fizica moleculara
a lichidelor

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Notiuni de baza
❒
Tipuri de legaturi moleculare in lichide

Legaturi Van der Waals
➔
dipol permanent – dipol permanent
➔
dipol indus – dipol indus
➔
dipol permanent – dipol indus


Legaturi de hidrogen (H) (coordinative)

Interactii ion-ion

Interactii ion-dipol

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Dipoli
❒
Dipoli permanenti:

Molecule in care exista o distributie permanenta a
sarcinilor pozitive spre unul din polii moleculei si a
sarcinilor negative spre celalalt pol (molecule
polarizate permanent)

❒
Dipoli indusi:

Molecule nepolarizate permanent, dar care devin
polarizate sub influenta unui camp electric extern

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Dipoli

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Legaturi Van der Waals

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Legaturi de H

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Tipuri de lichide
❒
Lichide simple

Contin doar legaturi Van der Waals
 Exemplu: gaze rare lichefiate, halogeni - Br2

❒
Lichide complexe

Contin tipuri multiple de legaturi

Exemplu: apa

❒
Structuri particulare: Cristale lichide

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Modele moleculare ale starii
lichide
❒
Modelul cinetico-molecular

Lichidele sunt considerate gaze foarte comprimate

Aplicabil doar lichidelor formate din molecule monoatomice
❒
Modelul cristalin

Lichid format din celule identice, ocupate de o molecula /
neocupate

Moleculele pot trece dintr-o celula in alta
❒
Modelul vacantelor fluidizante

In lichid exista goluri = vacante fluidizante

Vacantele au o miscare similara cu agitatia termica

Numarul de vacante pe unitatea de volum = nr. Avogadro

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Modele moleculare ale starii lichide

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Cristale lichide
❒
Sunt faze intermediare (mezofaze),
anizotrope, de trecere de la solid la lichid
pentru anumite substante

❒
Au proprietati:

De lichid – fluiditatea

De solid (cristalin) – structura ordonata spatial

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Cristale lichide
❒
Tipuri:

Termotrope: tranzitia la faza de cristal lichid este
influentata de temperatura
➔
Nematice
➔
Smectice (ex: mielina)
➔
Colesterice – sunt optic active (ex: colesterolul)


Liotrope: tranzitia la faza de cristal lichid e
influentata de concentratie (si mai putin de
temperatura)
➔
Exemplu: Membranele celulare

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Cristale lichide termotrope

❒
Nematice ❒
Smectice

Moleculele ordonate cu axul 
Moleculele ordonate cu axul
mare paralel mare paralel

Nu se diferentiaza straturi 
Ordonare in straturi care pot
aluneca unul peste celalalt

Optic active

Tip A: axul perpendicular pe
planul stratului

Tip C: axul oblic fata de planul
UMF Carol Davila stratului Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Cristale lichide termotrope
❒
Colesterice

Moleculele orientate paralel intr-
un strat

Structura helicoidala

Optic active

Isi schimba culoarea in functie de
temperatura:

Reflecta lumina cu lungimea
de unda = pasul helicoidei (p)

Temperatura modifica pasul
helicoidei

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Cristale lichide liotrope

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Fenomene de interfata

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Interfete
❒
Suprafete de demarcatie intre doua faze:

Solid – lichid

Lichid – aer

Solid – aer, solid – solid, lichid – lichid, aer – aer

❒
La nivelul lor apar forte (tensiuni)
rezultante dintre:

Fortele de atractie intre moleculele din interiorul
fazelor (forte de coeziune)

Fortelor de atractie dintre moleculele fazelor
diferite (forte de adeziune)

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Interfete solid - lichid
❒
Formarea meniscurilor


Menisc concav
➢ Fadeziune > Fcoeziune


Menisc convex
➢ Fadeziune < Fcoeziune

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Interfete solid - lichid
❒
Fenomene de capilaritate

Ascensiune capilara
➢ Fadeziune > Fcoeziune


Descensiune capilara
➢ Fadeziune < Fcoeziune

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Interfete lichid - gaz
❒
Fenomene de tensiune superficiala
❒
In interiorul lichidului fortele
de atractie intermoleculare se
anuleaza
❒
In stratul de suprafata:

O componenta paralela cu
suprafata – se opune strapungerii
stratului superficial

O componenta perpendiculara pe
suprafata – forta de compresie
interna a lichidului
❒
→ tendinta de minimizare a
suprafetei (ex: formarea de
picaturi)
UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Coeficientul de tensiune
superficiala
❒
La interfata dintre un lichid si un gaz apare o
forta care tinde sa micsoreze aceasta suprafata
❒
Marime caracteristica: σ [N/m] = coeficientul
de tensiune superficiala

dF = forta necesara pentru a mari
=
dl lungimea conturului suprafetei cu o
unitate

dL
=
dS =lucrul mecanic necesar pentru a
mari suprafata cu o unitate
UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Substante tensioactive
= Substante care modifica valoarea σ

❒
Legea lui Traube: tensioactivitatea creste cu
numarul de grupari hidrofobe

❒
Exemple:
Scad tensiunea superficiala a

Detergenti
lipidelor, faciliteaza dizolvarea lor in

Saruri biliare solutii apoase

Surfactantul pulmonar

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Rolul surfactantului pulmonar
❒
Surfactantul pulmonar – lichid cu proprietati
tensioactive care acopera suprafata alveolelor
pulmonare
❒
Roluri:

Creste complianta pulmonara si scade travaliul
respirator

Previne colapsul alveolelor la sfarsitul inspirului

➔ Complianta pulmonara: ΔVpulm / Δp

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Rolul surfactantului
2
❒
Legea Laplace:  p=
r

Δp – presiunea aerului alveolar

r – raza alveolei pulmonare

●
Δp = 12-24 torr ptr apa,
doar cativa torri ptr
surfactant → travaliu
respirator mai mic

●
Contribuie la egalizarea
presiunilor in arborele
respirator

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Molecula de apa

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Structura moleculei de apa

Aranjament spatial tetraedric

Dipol electric
UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
http://www.northland.cc.mn.us
UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Structura apei

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Apa in stare lichida
❒
Legaturi de H; distanta atom O – atom H al altei molecule
este de aprox. 1.8 Å; o molecula poate lega 1-4 alte molecule

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Modele ale apei lichide
❒
Modelul retelei cristaline partial distruse

Datorita agitatiei termice unele legaturi de H se
rup → domenii microcristaline intre care circula
molecule libere
❒
Modelul gramezilor temporare

Cooperativitate in formarea si desfacerea
legaturilor de H → domenii dinamice
❒
Modelul domeniului unic

Modelul actual; un domeniu unic cu discontinuitati
locale

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Modelul actual

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Shigeo Maruyama Group
Department of Mechanical Engineering, The University of Tokyo

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Apa in stare solida
❒
Forme diferite de cristalizare, in functie
de:

Temperatura

Presiune

Existenta unor nuclei de cristalizare
❒
Cele mai comune forme, la presiune
atmosferica:

Gheata hexagonala (temperaturi -80 – 0 ºC)

Gheata cubica (temperaturi < -80 ºC)
❒
Legaturile de H formate sunt permanente

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Gheata hexagonala

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Gheata cubica

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Proprietatile apei
❒
Densitate maxima la 4°C
❒
Constanta dielectrica mare

Favorizeaza disocierea electrolitica
❒
Tensiune superficiala mare
❒
Caldura specifica foarte mare, conductibilitate
termica mare, caldura latenta de vaporizare
mare

Importanta in autoreglarea termica a organismului

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Solutii apoase

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Solutii electrolitice
❒
Fenomen de solvatare a ionilor

Disocierea ionilor (favorizata de constanta
dielectrica mare a apei)

Orientarea dipolilor de apa in jurul ionului, cu
polul de polaritate opusa spre ion

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
http://www.mhhe.com/physsci/chemistry/essentialchemistry/flash/molvie1.swf

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Substante care formeaza
legaturi de H
❒
Se interpun in reteaua de legaturi de
hidrogen a apei

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Substante hidrofobe
❒
Sunt substante fara moment dipolar (nepolarizate)

❒
Sub influenta apei formeaza dipoli instantanei →
legaturi Van der Waals slabe cu moleculele de apa

❒
Sistemul tinde catre stabilizare energetica prin
formarea unui numar maxim de legaturi:

Intre moleculele de apa → cavitati de clatrare
(clatrati)

Moleculele hidrofobe sunt cuprinse in cavitatile de clatrare

Intre moleculele hidrofobe → legaturi hidrofobe

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Clatrati

http://ferrisholding.com

http://www.lsbu.ac.uk

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Molecule amfifile

❒
Zone hidrofile → legaturi electrostatice; apa de
hidratare
❒
Zone hidrofobe → legaturi hidrofobe intre ele, apa
formeaza clatrati

❒
Structura apei din jurul unei macromolecule
este reorganizata => apa legata

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Disocierea apei

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Reactii de disociere a apei
H2O = H+ + HO-
H + H 2 O = H3 O
+ + pH = - log[H+]

2H2O = HO- + H3O+
❒
Apa pura, 25 °C:

[H+]=[HO-]=10-7 mol/l

pH = 7
❒
In organism:

pH = 7.4
UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Apa in sistemele biologice

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Forme de apa intra- si
extracelulara

❒
Compartimentalizare a apei:

Apa libera

Apa partial legata

Apa legata:

Se evapora greu

Ingheata la temperaturi sub 0 °C

Nu dizolva cristaloizi

Nu participa la osmoza

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Apa legata

http://www.lsbu.ac.uk

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Apa legata

http://sciencenotes.wordpress.com

http://thglab.berkeley.edu

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
Molecular model of the complete
GPCR (rhodopsin) in an atomistic
representation of its environment.
The protein is rendered in gold
color, with the retinal in red. The
lipid portion of the phospholipids
is shown in green, and their head
groups are rendered in yellow.
The surrounding water molecules
are rendered in blue.

Weinstein H. Hallucinogen Actions on 5-HT Receptors Reveal Distinct
Mechanisms of Activation and Signaling by G Protein-coupled
Receptors. AAPS Journal. 2006; 7(4): E871-E884.

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009 
I. Kosztin/Univ. of Missouri (made with VMD)

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009