Apa in sistemele biologice

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Cuprins:

Notiuni de fizica moleculara a lichidelor Fenomene de interfata Molecula de apa Structura si proprietatile apei Solutii apoase Apa in sistemele biologice

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Notiuni de fizica moleculara a lichidelor

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Notiuni de baza

Tipuri de legaturi moleculare in lichide

Legaturi Van der Waals
➔ ➔ ➔

dipol permanent – dipol permanent dipol indus – dipol indus dipol permanent – dipol indus
(coordinative)

  

Legaturi de hidrogen (H) Interactii ion-ion Interactii ion-dipol

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Dipoli

Dipoli permanenti:

Molecule in care exista o distributie permanenta a sarcinilor pozitive spre unul din polii moleculei si a sarcinilor negative spre celalalt pol (molecule polarizate permanent)

Dipoli indusi:

Molecule nepolarizate permanent, dar care devin polarizate sub influenta unui camp electric extern

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Dipoli

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Legaturi Van der Waals

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Legaturi de H

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Tipuri de lichide

Lichide simple

Contin doar legaturi Van der Waals Exemplu: gaze rare lichefiate, halogeni - Br2

Lichide complexe
 

Contin tipuri multiple de legaturi Exemplu: apa

Structuri particulare: Cristale lichide
Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Modele moleculare ale starii lichide

Modelul cinetico-molecular

Lichidele sunt considerate gaze foarte comprimate Aplicabil doar lichidelor formate din molecule monoatomice

Modelul cristalin

Lichid format din celule identice, ocupate de o molecula / neocupate Moleculele pot trece dintr-o celula in alta

Modelul vacantelor fluidizante

In lichid exista goluri = vacante fluidizante Vacantele au o miscare similara cu agitatia termica Numarul de vacante pe unitatea de volum = nr. Avogadro
Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Modele moleculare ale starii lichide

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Cristale lichide

Sunt faze intermediare (mezofaze), anizotrope, de trecere de la solid la lichid pentru anumite substante Au proprietati:
 

De lichid – fluiditatea De solid (cristalin) – structura ordonata spatial

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Cristale lichide

Tipuri:

Termotrope: tranzitia la faza de cristal lichid este
influentata de temperatura
➔ ➔ ➔

Nematice Smectice (ex: mielina) Colesterice – sunt optic active (ex: colesterolul)

Liotrope: tranzitia la faza de cristal lichid e
influentata de concentratie (si mai putin de temperatura)

Exemplu: Membranele celulare
Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Cristale lichide termotrope

Nematice

Smectice

Moleculele ordonate cu axul mare paralel Nu se diferentiaza straturi Optic active

Moleculele ordonate cu axul mare paralel Ordonare in straturi care pot aluneca unul peste celalalt Tip A: axul perpendicular pe planul stratului Tip C: axul oblic fata de planul stratului Apa in sistemele biologice (AP)
An universitar 2008-2009

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Cristale lichide termotrope

Colesterice

Moleculele orientate paralel intrun strat Structura helicoidala Optic active Isi schimba culoarea in functie de temperatura:

Reflecta lumina cu lungimea de unda = pasul helicoidei (p) Temperatura modifica pasul helicoidei

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Cristale lichide liotrope

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Fenomene de interfata

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Interfete

Suprafete de demarcatie intre doua faze:
  

Solid – lichid Lichid – aer Solid – aer, solid – solid, lichid – lichid, aer – aer

La nivelul lor apar forte (tensiuni) rezultante dintre:

Fortele de atractie intre moleculele din interiorul fazelor (forte de coeziune) Fortelor de atractie dintre moleculele fazelor diferite (forte de adeziune)
Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Interfete solid - lichid

Formarea meniscurilor

Menisc concav

Fadeziune > Fcoeziune

Menisc convex

Fadeziune < Fcoeziune
Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Interfete solid - lichid

Fenomene de capilaritate

Ascensiune capilara

Fadeziune > Fcoeziune

Descensiune capilara

Fadeziune < Fcoeziune

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Interfete lichid - gaz

Fenomene de tensiune superficiala

In interiorul lichidului fortele de atractie intermoleculare se anuleaza In stratul de suprafata:

O componenta paralela cu suprafata – se opune strapungerii stratului superficial O componenta perpendiculara pe suprafata – forta de compresie interna a lichidului

→ tendinta de minimizare a suprafetei (ex: formarea de picaturi)
Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Coeficientul de tensiune superficiala

La interfata dintre un lichid si un gaz apare o forta care tinde sa micsoreze aceasta suprafata Marime caracteristica: σ [N/m] = coeficientul de tensiune superficiala

dF = dl dL = dS
UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

= forta necesara pentru a mari lungimea conturului suprafetei cu o unitate

=lucrul mecanic necesar pentru a mari suprafata cu o unitate
Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Substante tensioactive
= Substante care modifica valoarea σ

Legea lui Traube: tensioactivitatea creste cu
numarul de grupari hidrofobe

Exemple:
  

Detergenti Saruri biliare

Scad tensiunea superficiala a lipidelor, faciliteaza dizolvarea lor in solutii apoase

Surfactantul pulmonar

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Rolul surfactantului pulmonar

Surfactantul pulmonar – lichid cu proprietati
tensioactive care acopera suprafata alveolelor pulmonare

Roluri:

Creste complianta pulmonara si scade travaliul respirator Previne colapsul alveolelor la sfarsitul inspirului

Complianta pulmonara: ΔVpulm / Δp

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Rolul surfactantului

Legea Laplace:
 

2  p= r

Δp – presiunea aerului alveolar r – raza alveolei pulmonare

Δp = 12-24 torr ptr apa, doar cativa torri ptr surfactant → travaliu respirator mai mic

Contribuie la egalizarea presiunilor in arborele respirator

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Molecula de apa

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Structura moleculei de apa

Aranjament spatial tetraedric

Dipol electric
UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

http://www.northland.cc.mn.us
UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Structura apei

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Apa in stare lichida

Legaturi de H;

distanta atom O – atom H al altei molecule este de aprox. 1.8 Å; o molecula poate lega 1-4 alte molecule

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Modele ale apei lichide

Modelul retelei cristaline partial distruse

Datorita agitatiei termice unele legaturi de H se rup → domenii microcristaline intre care circula molecule libere

Modelul gramezilor temporare

Cooperativitate in formarea si desfacerea legaturilor de H → domenii dinamice

Modelul domeniului unic

Modelul actual; un domeniu unic cu discontinuitati locale
Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Modelul actual

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Shigeo Maruyama Group Department of Mechanical Engineering, The University of Tokyo

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Apa in stare solida

Forme diferite de cristalizare, in functie de:
  

Temperatura Presiune Existenta unor nuclei de cristalizare

Cele mai comune forme, la presiune atmosferica:
 

Gheata hexagonala (temperaturi -80 – 0 ºC) Gheata cubica (temperaturi < -80 ºC)

Legaturile de H formate sunt permanente
Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Gheata hexagonala

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Gheata cubica

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Proprietatile apei

Densitate maxima la 4°C Constanta dielectrica mare

Favorizeaza disocierea electrolitica

Tensiune superficiala mare Caldura specifica foarte mare, conductibilitate termica mare, caldura latenta de vaporizare mare

Importanta in autoreglarea termica a organismului

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Solutii apoase

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Solutii electrolitice

Fenomen de solvatare a ionilor

Disocierea ionilor (favorizata de constanta dielectrica mare a apei) Orientarea dipolilor de apa in jurul ionului, cu polul de polaritate opusa spre ion

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

http://www.mhhe.com/physsci/chemistry/essentialchemistry/flash/molvie1.swf

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Substante care formeaza legaturi de H

Se interpun in reteaua de legaturi de hidrogen a apei

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Substante hidrofobe

Sunt substante fara moment dipolar (nepolarizate) Sub influenta apei formeaza dipoli instantanei → legaturi Van der Waals slabe cu moleculele de apa Sistemul tinde catre stabilizare energetica prin formarea unui numar maxim de legaturi:

Intre moleculele de apa → cavitati de clatrare (clatrati)
Moleculele hidrofobe sunt cuprinse in cavitatile de clatrare

Intre moleculele hidrofobe → legaturi hidrofobe

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Clatrati

http://ferrisholding.com http://www.lsbu.ac.uk

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Molecule amfifile

Zone hidrofile → legaturi electrostatice; apa de hidratare Zone hidrofobe → legaturi hidrofobe intre ele, apa formeaza clatrati

Structura apei din jurul unei macromolecule este reorganizata => apa legata

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Disocierea apei

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Reactii de disociere a apei
H2O = H+ + HO+ + H + H 2 O = H3 O 2H2O = HO- + H3O+

pH = - log[H+]

Apa pura, 25 °C:

[H+]=[HO-]=10-7 mol/l pH = 7 pH = 7.4
Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

In organism:

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Forme de apa intra- si extracelulara

Compartimentalizare a apei:
  

Apa libera Apa partial legata Apa legata:
   

Se evapora greu Ingheata la temperaturi sub 0 °C Nu dizolva cristaloizi Nu participa la osmoza

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Apa legata

http://www.lsbu.ac.uk

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Apa legata

http://sciencenotes.wordpress.com

http://thglab.berkeley.edu

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Molecular model of the complete GPCR (rhodopsin) in an atomistic representation of its environment. The protein is rendered in gold color, with the retinal in red. The lipid portion of the phospholipids is shown in green, and their head groups are rendered in yellow. The surrounding water molecules are rendered in blue.

Weinstein H. Hallucinogen Actions on 5-HT Receptors Reveal Distinct Mechanisms of Activation and Signaling by G Protein-coupled Receptors. AAPS Journal. 2006; 7(4): E871-E884.

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

I. Kosztin/Univ. of Missouri (made with VMD)

UMF Carol Davila Catedra de Biofizica Medicala

Apa in sistemele biologice (AP) An universitar 2008-2009

Sign up to vote on this title
UsefulNot useful