You are on page 1of 55

Apa in sistemele

biologice

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Cuprins:

Notiuni de fizica moleculara a lichidelor

Fenomene de interfata

Molecula de apa

Structura si proprietatile apei

Solutii apoase

Apa in sistemele biologice

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Notiuni de fizica moleculara
a lichidelor

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Notiuni de baza

Tipuri de legaturi moleculare in lichide

Legaturi Van der Waals

dipol permanent – dipol permanent

dipol indus – dipol indus

dipol permanent – dipol indus


Legaturi de hidrogen (H) (coordinative)

Interactii ion-ion

Interactii ion-dipol

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Dipoli

Dipoli permanenti:

Molecule in care exista o distributie permanenta a
sarcinilor pozitive spre unul din polii moleculei si a
sarcinilor negative spre celalalt pol (molecule
polarizate permanent)


Dipoli indusi:

Molecule nepolarizate permanent, dar care devin
polarizate sub influenta unui camp electric extern

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Dipoli

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Legaturi Van der Waals

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Legaturi de H

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Tipuri de lichide

Lichide simple

Contin doar legaturi Van der Waals
 Exemplu: gaze rare lichefiate, halogeni - Br2


Lichide complexe

Contin tipuri multiple de legaturi

Exemplu: apa


Structuri particulare: Cristale lichide

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Modele moleculare ale starii
lichide

Modelul cinetico-molecular

Lichidele sunt considerate gaze foarte comprimate

Aplicabil doar lichidelor formate din molecule monoatomice

Modelul cristalin

Lichid format din celule identice, ocupate de o molecula /
neocupate

Moleculele pot trece dintr-o celula in alta

Modelul vacantelor fluidizante

In lichid exista goluri = vacante fluidizante

Vacantele au o miscare similara cu agitatia termica

Numarul de vacante pe unitatea de volum = nr. Avogadro

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Modele moleculare ale starii lichide

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Cristale lichide

Sunt faze intermediare (mezofaze),
anizotrope, de trecere de la solid la lichid
pentru anumite substante


Au proprietati:

De lichid – fluiditatea

De solid (cristalin) – structura ordonata spatial

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Cristale lichide

Tipuri:

Termotrope: tranzitia la faza de cristal lichid este
influentata de temperatura

Nematice

Smectice (ex: mielina)

Colesterice – sunt optic active (ex: colesterolul)


Liotrope: tranzitia la faza de cristal lichid e
influentata de concentratie (si mai putin de
temperatura)

Exemplu: Membranele celulare

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Cristale lichide termotrope


Nematice ❒
Smectice

Moleculele ordonate cu axul 
Moleculele ordonate cu axul
mare paralel mare paralel

Nu se diferentiaza straturi 
Ordonare in straturi care pot
aluneca unul peste celalalt

Optic active

Tip A: axul perpendicular pe
planul stratului

Tip C: axul oblic fata de planul
UMF Carol Davila stratului Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Cristale lichide termotrope

Colesterice

Moleculele orientate paralel intr-
un strat

Structura helicoidala

Optic active

Isi schimba culoarea in functie de
temperatura:

Reflecta lumina cu lungimea
de unda = pasul helicoidei (p)

Temperatura modifica pasul
helicoidei

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Cristale lichide liotrope

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Fenomene de interfata

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Interfete

Suprafete de demarcatie intre doua faze:

Solid – lichid

Lichid – aer

Solid – aer, solid – solid, lichid – lichid, aer – aer


La nivelul lor apar forte (tensiuni)
rezultante dintre:

Fortele de atractie intre moleculele din interiorul
fazelor (forte de coeziune)

Fortelor de atractie dintre moleculele fazelor
diferite (forte de adeziune)

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Interfete solid - lichid

Formarea meniscurilor


Menisc concav
➢ Fadeziune > Fcoeziune


Menisc convex
➢ Fadeziune < Fcoeziune

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Interfete solid - lichid

Fenomene de capilaritate

Ascensiune capilara
➢ Fadeziune > Fcoeziune


Descensiune capilara
➢ Fadeziune < Fcoeziune

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Interfete lichid - gaz

Fenomene de tensiune superficiala

In interiorul lichidului fortele
de atractie intermoleculare se
anuleaza

In stratul de suprafata:

O componenta paralela cu
suprafata – se opune strapungerii
stratului superficial

O componenta perpendiculara pe
suprafata – forta de compresie
interna a lichidului

→ tendinta de minimizare a
suprafetei (ex: formarea de
picaturi)
UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Coeficientul de tensiune
superficiala

La interfata dintre un lichid si un gaz apare o
forta care tinde sa micsoreze aceasta suprafata

Marime caracteristica: σ [N/m] = coeficientul
de tensiune superficiala

dF = forta necesara pentru a mari
=
dl lungimea conturului suprafetei cu o
unitate

dL
=
dS =lucrul mecanic necesar pentru a
mari suprafata cu o unitate
UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Substante tensioactive
= Substante care modifica valoarea σ


Legea lui Traube: tensioactivitatea creste cu
numarul de grupari hidrofobe


Exemple:
Scad tensiunea superficiala a

Detergenti
lipidelor, faciliteaza dizolvarea lor in

Saruri biliare solutii apoase

Surfactantul pulmonar

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Rolul surfactantului pulmonar

Surfactantul pulmonar – lichid cu proprietati
tensioactive care acopera suprafata alveolelor
pulmonare

Roluri:

Creste complianta pulmonara si scade travaliul
respirator

Previne colapsul alveolelor la sfarsitul inspirului

➔ Complianta pulmonara: ΔVpulm / Δp

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Rolul surfactantului
2

Legea Laplace:  p=
r

Δp – presiunea aerului alveolar

r – raza alveolei pulmonare


Δp = 12-24 torr ptr apa,
doar cativa torri ptr
surfactant → travaliu
respirator mai mic


Contribuie la egalizarea
presiunilor in arborele
respirator

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Molecula de apa

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Structura moleculei de apa

Aranjament spatial tetraedric

Dipol electric
UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
http://www.northland.cc.mn.us
UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Structura apei

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Apa in stare lichida

Legaturi de H; distanta atom O – atom H al altei molecule
este de aprox. 1.8 Å; o molecula poate lega 1-4 alte molecule

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Modele ale apei lichide

Modelul retelei cristaline partial distruse

Datorita agitatiei termice unele legaturi de H se
rup → domenii microcristaline intre care circula
molecule libere

Modelul gramezilor temporare

Cooperativitate in formarea si desfacerea
legaturilor de H → domenii dinamice

Modelul domeniului unic

Modelul actual; un domeniu unic cu discontinuitati
locale

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Modelul actual

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Shigeo Maruyama Group
Department of Mechanical Engineering, The University of Tokyo

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Apa in stare solida

Forme diferite de cristalizare, in functie
de:

Temperatura

Presiune

Existenta unor nuclei de cristalizare

Cele mai comune forme, la presiune
atmosferica:

Gheata hexagonala (temperaturi -80 – 0 ºC)

Gheata cubica (temperaturi < -80 ºC)

Legaturile de H formate sunt permanente

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Gheata hexagonala

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Gheata cubica

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Proprietatile apei

Densitate maxima la 4°C

Constanta dielectrica mare

Favorizeaza disocierea electrolitica

Tensiune superficiala mare

Caldura specifica foarte mare, conductibilitate
termica mare, caldura latenta de vaporizare
mare

Importanta in autoreglarea termica a organismului

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Solutii apoase

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Solutii electrolitice

Fenomen de solvatare a ionilor

Disocierea ionilor (favorizata de constanta
dielectrica mare a apei)

Orientarea dipolilor de apa in jurul ionului, cu
polul de polaritate opusa spre ion

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
http://www.mhhe.com/physsci/chemistry/essentialchemistry/flash/molvie1.swf

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Substante care formeaza
legaturi de H

Se interpun in reteaua de legaturi de
hidrogen a apei

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Substante hidrofobe

Sunt substante fara moment dipolar (nepolarizate)


Sub influenta apei formeaza dipoli instantanei →
legaturi Van der Waals slabe cu moleculele de apa


Sistemul tinde catre stabilizare energetica prin
formarea unui numar maxim de legaturi:

Intre moleculele de apa → cavitati de clatrare
(clatrati)

Moleculele hidrofobe sunt cuprinse in cavitatile de clatrare

Intre moleculele hidrofobe → legaturi hidrofobe

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Clatrati

http://ferrisholding.com

http://www.lsbu.ac.uk

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Molecule amfifile


Zone hidrofile → legaturi electrostatice; apa de
hidratare

Zone hidrofobe → legaturi hidrofobe intre ele, apa
formeaza clatrati


Structura apei din jurul unei macromolecule
este reorganizata => apa legata

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Disocierea apei

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Reactii de disociere a apei
H2O = H+ + HO-
H + H 2 O = H3 O
+ + pH = - log[H+]

2H2O = HO- + H3O+

Apa pura, 25 °C:

[H+]=[HO-]=10-7 mol/l

pH = 7

In organism:

pH = 7.4
UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Apa in sistemele biologice

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Forme de apa intra- si
extracelulara


Compartimentalizare a apei:

Apa libera

Apa partial legata

Apa legata:

Se evapora greu

Ingheata la temperaturi sub 0 °C

Nu dizolva cristaloizi

Nu participa la osmoza

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Apa legata

http://www.lsbu.ac.uk

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Apa legata

http://sciencenotes.wordpress.com

http://thglab.berkeley.edu

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
Molecular model of the complete
GPCR (rhodopsin) in an atomistic
representation of its environment.
The protein is rendered in gold
color, with the retinal in red. The
lipid portion of the phospholipids
is shown in green, and their head
groups are rendered in yellow.
The surrounding water molecules
are rendered in blue.

Weinstein H. Hallucinogen Actions on 5-HT Receptors Reveal Distinct
Mechanisms of Activation and Signaling by G Protein-coupled
Receptors. AAPS Journal. 2006; 7(4): E871-E884.

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009
I. Kosztin/Univ. of Missouri (made with VMD)

UMF Carol Davila Apa in sistemele biologice (AP)
Catedra de Biofizica Medicala An universitar 2008-2009