UNIDAD DIDCTICA I: COMPOSICIN QUMICA DE LOS SERES VIVOS
1.- INTRODUCCIN A la hora de abordar el estudio de los seres vivos, la comprensin de su estructura y funcionamiento debe ir precedida por la comprensin de la estructura y funcionamiento de sus componentes qumicos. Como estos compuestos siguen las mismas leyes fsicas y qumicas que rigen el comportamiento de la materia, su estudio guarda una estrecha relacin con esas ciencias. 2.- LA COMPOSICIN ELEMENTAL DE LA MATERIA VIVA: BIOELEMENTOS Se denominan elementos biognicos o bioelementos a aquellos elementos qumicos que forman parte de los seres vivos. En la actualidad se han identificado unos 70 (todos ellos de la tabla peridica), pero no todos ellos son indispensables o comunes a todos los seres vivos. A.- Bioelementos primarios: Son el C, H, O, N, P y S. Constituyen, aproximadamente, el 95% del total de la materia viva y sin los cuales no se pueden construir las molculas fundamentales de los seres vivos. La importancia y abundancia de estos elementos se deben a sus propiedades: - El presentar las capas electrnicas externas incompletas le permite formar enlaces covalentes, y dar lugar a las biomolculas. - El C, N y O pueden compartir ms de un par de electrones, formando enlaces dobles o triples, lo cual ampla mucho la posibilidad de formar molculas diferentes. - El C puede formar enlaces estables carbono carbono, constituyendo cadenas carbonadas lineales, ramificadas, anillos..., de estructuras tridimensionales complejas. Asimismo se puede unir a otros elementos qumicos, dando nuevos grupos funcionales (aldehdo, cetona, alcohol, amina...) que originan compuestos orgnicos muy diversos. - Al poseer un n atmico bajo los electrones compartidos en los enlaces se hallan prximos al ncleo, y las molculas originadas son estables. - Al ser el O y el N elementos electronegativos, muchas biomolculas son polares y por ello solubles en agua, requisito imprescindible para que tengan lugar las reacciones biolgicas fundamentales para la vida. - Son elementos que se incorporan fcilmente desde el medio externo, ya que se encuentran en molculas (CO 2 , H 2 O, nitratos...) que pueden ser captadas de manera sencilla. - Los compuestos orgnicos formados por estos tomos se hallan en estado reducido, por lo que reaccionan con facilidad con el oxgeno existente en la superficie del planeta, para dar compuestos inorgnicos (CO 2 y H 2 O), de baja energa. La energa desprendida en esas oxidaciones es aprovechada para las funciones vitales de los organismos. B.- Bioelementos secundarios: Forman parte de todos los organismos vivos, si bien en conjunto no suelen superar el 4% del total de la masa del ser vivo. En ellos se incluyen el Na, K, Ca, Mg y Cl. C.- Oligoelementos: Estn presentes en proporciones inferiores al 0,1%, pero son elementos imprescindibles, pues desempean funciones esenciales en diferentes procesos bioqumicos y fisiolgicos. Entre ellos tenemos el Fe, Mn, Cu, Zn, F, Ni, Co, I, Si, Li, B, Mo, Al, Cr... 3.- LAS MOLCULAS BIOLGICAS A.- Introduccin Se denominan biomolculas a los compuestos qumicos, formados por la unin de bioelementos, que forman parte de los seres vivos. Clsicamente reciban el nombre de principios inmediatos, nombre que hace referencia a que se trata de compuestos que se obtienen a partir de los seres vivos de forma inmediata cuando se utilizan medios fsicos (filtracin, destilacin, trituracin, decantacin, disolucin...).
2 Dentro de ellas se distinguen dos tipos: - Biomolculas inorgnicas: Presentes en la materia inerte, aunque se encuentran tambin en los seres vivos. Son el agua, las sales minerales y algunos gases (CO, CO 2 ). - Biomolculas orgnicas: Estn formadas por carbono, al que se unen, al menos hidrgeno y oxgeno,; frecuentemente se aade nitrgeno y, en menor proporcin, fsforo y azufre. Son compuestos exclusivos de los seres vivos, y se clasifican en 4 grandes grupos: Glcidos, Lpidos, Protenas y cidos nucleicos. Algunas biomolculas orgnicas son muy grandes y se denominan macromolculas o polmeros. Los polmeros estn formados por la unin de molculas ms sencillas llamadas monmeros. Los monmeros de las protenas son los aminocidos y los de los cidos nucleicos los nucletidos. Algunas molculas como las enzimas, vitaminas y hormonas, que en ocasiones se consideran grupos independientes, qumicamente se encuadran en los grupos anteriores. (Importante: Lar materia orgnica forma parte de un ser vivo, pero no est viva. Ninguna molcula tiene vida) B.- Biomolculas inorgnicas a.- Agua: Es una molcula de enorme importancia biolgica, tanto por su abundancia, como por las funciones que desempea en la materia viva y por el papel que ha jugado en el origen y evolucin de la vida. a.- Abundancia: La cantidad de agua presente en un ser vivo depende de la especie de que se trate (los organismos acuticos contienen un porcentaje muy elevado mientras que los valores ms bajos corresponden a especies adaptadas a vivir en condiciones de desecacin o en zonas desrticas), la edad del individuo (en los individuos jvenes la proporcin es mayor que en los de ms edad) y del tipo de tejido u rgano que consideremos, pues aquellos de gran actividad bioqumica contienen una proporcin de agua mayor que los menos activos.
Contenido hdrico en algunos organismos Contenido hdrico en algunos rganos y tejidos humanos Contenido hdrico en algunos rganos vegetales Algas 98% Plasma sanguneo 92% Sanda 95% Medusas 97% Corteza cerebral 86% Esprrago 93% Hongos 80% Sangre 79 Zanahoria 87% Cangrejo de ro 77% Msculos 75% Patata 78% Feto humano 94% Piel 72% Pltano 76% Hombre adulto 63% Tejido conjuntivo 60% Grano de trigo 11% Liguen 55% Huesos 22% Semilla de guisante 11% Pino 47%
Dientes 10%
Grano de arroz 10%
b.- Papel en el origen y evolucin de los seres vivos: La mayora de las hiptesis actuales sobre el origen de la vida en la Tierra coinciden en aceptar que la vida, tal y como hoy la conocemos, se origin en el agua: pero incluso antes de eso debi de participar en las reacciones qumicas que dieron lugar a las molculas ms complejas que forman la materia viva. A lo largo del tiempo los organismos evolucionaron en el ambiente acuoso y ms tarde consiguieron adaptarse a la vida fuera del agua, pero hasta los que la han abandonado, adaptndose totalmente al medio terrestre, no han podido prescindir de ella y mantienen grandes proporciones de este lquido en su medio interno. En ese sentido, el medio interno no es otra cosa que un medio acuoso que permite la vida celular en condiciones semejantes a la del medio marino donde surgi.
3 c.- Estructura qumica: La unin entre el tomo de O y los dos de H se realiza mediante enlaces covalentes, en los que cada tomo de H de una molcula comparte un par de e - con el tomo de O. Sin embargo, y a pesar de ser una molcula elctricamente neutra, como la electronegatividad del O es mayor que la del H, los pares de e - compartidos se ven atrados con ms fuerza por el ncleo del O que por el del H, lo que hace que el enlace O-H est polarizado, apareciendo una densidad de carga negativa en el oxgeno y una densidad de carga positiva en el hidrgeno. Este permanente carcter dipolar del agua hace que sus molculas puedan atraerse entre s, establecindose puentes de hidrgeno, ms dbiles que los covalentes y de corta duracin, pero al formarse un gran nmero de ellos, sus efectos determinan la mayor parte de las propiedades tpicas del agua. Tambin se pueden formar puentes de hidrgeno entre el agua y otras molculas polares distintas. d.- Disociacin inica: El agua pura es capaz de disociarse en iones, lo que hace que en realidad sea una mezcla de tres especies: agua molecular (H 2 O), protones hidratados (H 3 O + ) e iones hidroxilos (OH - )
2H 2 O H 3 O + +
OH -
En agua pura esta disociacin es muy dbil, siendo la concentracin de molculas ionizadas a 25C de 10 -14 mol/L, y, por tanto [H + ] = [OH - ] = 10 -7
Hay sustancias que al disolverse en el agua liberan H + . A estas sustancias se les llama cidos. Si la sustancia disminuye la concentracin de H + o aumenta la de OH - se denomina base. Para conocer el grado de acidez o basicidad de una disolucin se debe medir la cantidad de iones H + presentes en ella. Al ser cantidades muy pequeas, habra que usar exponenciales. Por eso se denomina pH a la expresin
pH = - log [H + ].
El pH del agua pura es 7 neutro. Las sustancias cidas disueltas en agua lo disminuyen (1 a 6) y las bsicas lo suben (8 a 14) e.- Funciones biolgicas: Vienen determinadas por sus propiedades fsico-qumicas que, a su vez, derivan de la estructura qumica que acabamos de estudiar. En el cuadro siguiente se resumen las principales funciones del agua en los seres vivos, relacionndolas con la/s propiedad/es correspondiente/s
4
Propiedad Debida a Funcin biolgica Lquida a temperatura ambiente Los puentes de hidrgeno mantienen a las molculas unidas Es vehculo de transporte dentro del organismo y medio lubricante Alto calor de vaporizacin El agua no se evapora hasta que la energa calorfica es lo suficientemente alta como para romper los puentes de hidrgeno. Alto calor especfico Para poder elevar su temperatura debe absorber gran cantidad de calor, que emplea en romper los puentes de hidrgeno. Funcin termorreguladora: Es buen regulador trmico ayudando a mantener constante la temperatura corporal de los animales homeotermos (mamferos, aves) gracias a su alto calor especfico. Tambin el alto calor de vaporizacin influye (el sudor enfra el cuerpo al evaporarse) Elevada tensin superficial (su superficie forma una pelcula elstica tensa) Las molculas superficiales estn fuertemente unidas a otras del interior, pero no a las externas de aire. Causa de la mayora de las deformaciones celulares y de los movimientos citoplasmticos Es uno de los mejores disolventes que se conocen La mayora de las sustancias polares se disuelven en ella al formar puentes de hidrgeno. Posibilidad de transporte de muchas sustancias y de que en su seno se den todas las reacciones metablicas Alta cohesin (unin entre sus molculas) y adhesin (unin a otras molculas con cargas elctricas) Los puentes de hidrgeno mantienen juntas las molculas de agua, que puede as formar columnas continuas, y, adems es prcticamente incompresible. Permite que se mantenga la forma y volumen de las clulas, los cambios y deformaciones del citoplasma y el ascenso de la savia bruta Mayor densidad en estado lquido que en slido Los puentes de hidrgeno congelados mantienen las molculas ms separadas que en estado lquido Mares y ros se hielan slo en su superficie; el fondo permanece lquido y los organismos sobreviven al invierno Capacidad de disociacin inica El agua pura es capaz de disociarse en iones 2H 2 OH 3 O + +
OH - Funcin bioqumica: Interviene en muchas reacciones bioqumicas, aportando hidrogeniones o hidroxilos. Por ejemplo, reacciones de hidrlisis
b.- Sales minerales: a.- Introduccin: Se pueden encontrar en los seres vivos disueltas o precipitadas. Las precipitadas tienen una funcin de sostn, formando esqueletos, caparazones o depsitos diversos. Las disueltas estn en forma de iones, siendo los ms frecuentes: Aniones: Cl - , CO 3 2- , HCO 3 - , PO 4 3- , HPO 4 2- SO 4 2- Cationes: Na + , K + , Ca +2 , Mg +2 , Fe +2 , Fe +3 Algunos cationes pueden aparecer tambin asociados a determinadas molculas orgnicas (protenas), como el in ferroso, que interviene en el transporte de oxgeno asociado a la hemoglobina. b.- Funciones biolgicas: a.- Sales precipitadas: El carbonato clcico forma el caparazn de moluscos, corales y muchos protozoos, impregna el caparazn de crustceos, endurece los huesos de vertebrados y forma la parte dura de sus dientes. El Fosfato clcico contribuye al endurecimiento de los huesos de los mamferos. La slice (SiO 2 ) impregna y endurece muchas plantas (gramneas, p.e.) y forma el caparazn de muchos microorganismos (diatomeas p.e.) y las espculas de determinadas esponjas b.- Sales disueltas: Intervienen fundamentalmente en dos tipos de procesos: La regulacin de los fenmenos osmticos y regulacin del pH. Adems, determinados iones son imprescindibles para que se lleven a cabo muchos procesos biolgicos. En el cuadro siguiente se describen brevemente los ms importantes:
5 In In Mg 2+ Forma parte de la molcula de clorofila Activador y cofactor de algunas enzimas K + Transmisin de la corriente nerviosa Contraccin muscular Regulacin de la actividad cardiaca Ca 2+ Coagulacin de la sangre Contraccin muscular Transmisin sinptica Activador y cofactor de algunas enzimas Regulacin de la actividad cardiaca Na + Transmisin de la corriente nerviosa I - Forma parte de la hormona tiroidea
Fe 2+ Forma parte de los citocromos y la hemoglobina Biocatalizador
a.- Regulacin de los fenmenos osmticos: Todos los medios lquidos biolgicos (sangre, plasma intersticial...) constituyen disoluciones de sales en agua de cuyo grado de concentracin depende la estabilidad celular. Los procesos biolgicos dependientes de la concentracin de soluto (molculas e iones) en agua se denominan osmticos y tienen lugar cuando existen dos soluciones de diferente concentracin separadas por una membrana semipermeable (aquella que no deja pasar el soluto pero s el disolvente). Se observa, entonces, el paso del disolvente (agua) desde la disolucin ms diluida (hipotnica o hipoosmtica) hacia la ms concentrada (hipertnica o hiperosmtica) a travs de las membranas, de manera que la hipertnica se va diluyendo y la hipotnica concentrando, hasta que las dos soluciones adquieren la misma concentracin (isotnicas o isoosmticas). Para evitar el paso de agua sera necesario aplicar una presin, denominada Presin osmtica, tanto ms intensa cuanto mayor fuera la diferencia de concentracin entre ambas disoluciones. Como la membrana plasmtica es semipermeable, es necesario mantener una concentracin salina dentro de la clula igual a la del medio externo para que sta no tenga prdida ni ganancia neta de agua. Si la concentracin del medio intracelular es mayor que la del medio externo, la entrada excesiva de agua producir un hinchamiento, conocido como turgencia celular, que puede provocar la rotura de la membrana y la muerte de la clula. Si, por el contrario, la concentracin en el medio interno es menor que en el externo, la clula pierde agua y disminuye su volumen, proceso que recibe el nombre de plasmolisis, y puede ocasionar tambin la muerte celular. Las clulas poseen sistemas de regulacin para evitar problemas osmticos cuando el medio externo es hipotnico o hipertnico en relacin con el medio intracelular. b.- Regulacin del pH: En los organismos es conveniente que el pH de sus fluidos no cambie bruscamente, pues eso podra ocasionar el cambio de estructura de muchas biomolculas, o la alteracin de muchas reacciones qumicas. Para ello, en las soluciones acuosas de los seres vivos estn presentes los denominados Sistemas tampn o Sistemas amortiguadores de pH. Dichos sistemas son disoluciones de un cido dbil y su base conjugada, de manera que si se aaden pequeas cantidades de H + la base los neutraliza, y si lo que se aade son OH - , es el cido el que los neutraliza. En los lquidos intercelulares el tampn que existe es el bicarbonato, que se encarga de mantener el pH prximo a 7,4 HCO 3 - + H + H 2 CO 3 CO 2 + H 2 O
6 y en los intracelulares el tampn fosfato mantiene el pH en torno a 6,86 HPO 4 2- + H + H 2 PO 4 -
En ambos casos, si aumenta la concentracin de hidrogeniones del medio, el equilibrio se desplaza a la derecha, y si disminuye, lo hace hacia la izquierda. C.- Biomolculas Orgnicas: a.- Introduccin a.- Algunos grupos funcionales biolgicamente importantes
Grupo Nombre Importancia biolgica OH Hidroxilo (alcohol) Polar y, por esta razn, soluble en agua. Forma puentes de hidrgeno O C OH Carboxilo (cido) cido dbil. Cuando pierde un in hidrgeno adquiere carga negativa. Polar. Forma puentes de H. O C O - + H +
H
C = O Aldehdo
Polar y, por esta razn, soluble en agua. Forma puentes de hidrgeno
C = O
Cetona Carbonilo
H N H Amino Base dbil. Cuando acepta un in hidrgeno adquiere carga positiva H
N + H
H O
P OH
OH Fosfato cido (dador de hidrgeno; en solucin presenta habitualmente carga negativa O
P O - + 2H +
O -
b.- Isomera: Es muy frecuente que dos o ms molculas orgnicas compartan la misma frmula molecular (mismo n de tomos de cada elemento), pero que posean distinta forma estructural, es decir, que sus tomos se encuentren unidos entre s de forma diferente. A estos compuestos se le denominan ismeros estructurales, y qumicamente son compuestos de propiedades distintas. Dimetilamina: CH 3 NH CH 3 (C 3 H 7 N) y Etilamina: CH 3 CH 2 NH 2 (C 3 H 7 N) Si dos compuestos comparten la misma frmula estructural, pero la diferencia entre ellos se debe a la posicin relativa de los tomos en el espacio, se dice que presentan Isomera espacial o estereoisomera. Esto se produce siempre que hay algn tomo de carbono asimtrico, es decir, un carbono que est unido a cuatro grupos distintos (se les suele identificar en la frmula con un *). Para representar en el plano del papel estas molculas, se utiliza habitualmente la Proyeccin de Fischer, en la que la cadena carbonada se dispone en vertical y los grupos unidos a los carbonos asimtricos se sitan a la izquierda y a la derecha de stos. En el caso de los monosacridos, aquellos estereoismeros en los que, segn la representacin de Fischer, el grupo OH ms alejado
7 del grupo aldehdo o cetona queda a la derecha, se dice que son de la serie D. Los que lo poseen a la izquierda son de la serie L. Una forma D es la imagen en el espejo, o enantimero de su forma L, y no se pueden superponer, por lo que son molculas distintas. Aunque tienen las mismas propiedades qumicas difieren en que cada una desva la luz polarizada en sentido opuesto. El que desve hacia la derecha o hacia la izquierda la luz polarizada no est relacionado con que sea forma D o L. Las formas D son ms frecuentes en la naturaleza que las formas L. Si dos monosacridos se diferencian nicamente en la posicin que ocupa el grupo hidroxilo en un carbono se dice que son epmeros (D-Glucosa y D- Galactosa, p.e.) b.- Glcidos: a.- Concepto: Son biomolculas orgnicas formadas por C, H y O cuya frmula general es: C m (H 2 O) n (de ah el nombre de hidratos de carbono) y en muchas ocasiones de sabor dulce (de ah el nombre de azcares). Qumicamente son polialcoholes con un grupo funcional carbonilo (aldehdo o cetona).
b.- Clasificacin de los glcidos
a.- Monosacridos: a.- Concepto: Son los glcidos ms sencillos. En ellos m = n. Son blancos, dulces, solubles en agua, cristalizables y no pueden ser hidrolizados. La presencia del grupo carbonilo les confiere, adems, propiedades reductoras, que se utilizan para identificarlos (prueba de Felhing). Su principal funcin en los organismos es energtica (los organismos las usan como fuente de energa), aunque algunos de ellos entran a formar parte de la composicin de molculas con funciones muy diferentes (nucletidos p.e.). b.- Estructura de los monosacridos: Los ms importantes estn formados por cadenas carbonadas de 3 a 7 tomos de carbono (triosas, tetrosas, pentosas, exosas, heptosas), y como poseen un grupo aldehdo o ceto, tendremos aldosas y cetosas. En el cuadro se representan las frmulas de las diferentes formas D de los monosacridos existentes. Para cada uno de ellos, existe su correspondiente forma L. - Formas cclicas: En disolucin acuosa, el grupo aldehdo o el cetona puede reaccionar fcilmente con un grupo hidroxilo de la misma molcula para dar lugar a Hemiacetales (aldehdo) y Hemicetales (cetona). Cuando esto le sucede a monosacridos de 5 o ms tomos de carbono, se forman molculas con estructura cclica o de anillo de cinco eslabones (Furansicos) o de 6 eslabones (Piransicos). Las estructuras cclicas se representan mediante Proyecciones de Haworth: Los grupos que en la estructura lineal quedan a la derecha de la cadena carbonada, se sitan abajo, y los de la izquierda se sitan arriba. Cuando el oxgeno queda detrs (alejado del espectador) y el carbono 1 a la derecha, los monosacridos de la serie D tienen el grupo CH 2 OH arriba. Osas o Monosacridos Oligosacridos Homopolosicridos Holsidos Polisacridos Heteropolisacridos sidos Hetersidos
D-Gliceraldehdo L-Gliceraldehdo
8 Al formarse las formas cclicas, aparece un nuevo carbono asimtrico, aquel en el que estaba el grupo aldehdo o cetona, que recibe el nombre de Carbono anomrico. Aparecen, por tanto, dos nuevos estereoismeros, que reciben el nombre de anmeros o formas anomricas, y se nombran anteponiendo al nombre del monosacrido las letras griegas o segn que el grupo OH del carbono anomrico quede abajo o arriba de la estructura cclica.
9 c.- Nomenclatura de pentosas y exosas: El nombre completo de un monosacrido debe indicar: 1- El tipo de anmero ( o ) 2- El tipo de enantiomorfo (D o L) 3- El nombre de la molcula (glucosa, fructosa...) 4- El tipo de estructura cclica (furanosa o piranosa) d.- Principales monosacridos: - Triosas: - El D-gliceraldehdo y la dihidroxiacetona son importantes intermediarios en el metabolismo energtico de las clulas. - Pentosas: - La -D-ribosa (ribofuranosa) forma parte de molculas tan importantes como el ATP, el NAD y el ARN. - La -D-Desoxirribosa (sin grupo -OH en el C 2) se encuentra en los nucletidos del ADN. - La D-ribulosa participa en la fotosntesis. - Exosas: - La Glucosa (D-glucopiranosa, mezcla de anmeros y , una aldoexosa) es la principal fuente de energa para muchos organismos, es precursora de muchos otros compuestos y el monmero a partir del cual se sintetizan muchos otros glcidos. - La Galactosa (D-galactopiranosa, mezcla de anmeros y , una aldoexosa) forma parte de la lactosa, de diferentes polisacridos estructurales y de ciertos glucolpidos. - La Fructosa (D-fructofuranosa, mezcla de anmeros y , una cetoexosa) se encuentra libre en muchas frutas, forma parte de la sacarosa y sus steres fosfatos son intermediarios del metabolismo. - La Manosa (D-manopiranosa, mezcla de anmeros y , una aldoexosa) forma parte de la estructura de muchos polisacridos. b.- sidos: Glcidos ms complejos derivados de las osas. Se clasifican en: a.- Holsidos: Formados por unin de monosacridos. Dentro de ellos se distingue entre los Oligosacridos y los Polisacridos - Enlace O-glucosdico: Los monosacridos pueden unirse entre s para constituir otros glcidos ms complejos. Esta unin es una reaccin de polimerizacin y normalmente se establece entre el hidroxilo del carbono anomrico de un monosacrido y un grupo hidroxilo de un carbono no anomrico del otro monosacrido, liberndose una molcula de agua y quedando los dos monosacridos unidos por el oxgeno de uno de los grupos hidroxilos implicados, formando un enlace denominado O-glucosdico. La reaccin inversa es una Hidrlisis, en la que mediante la adicin de una molcula de agua se rompe el enlace O-glucosdico y se regeneran los dos grupos hidroxilos, quedando separados ambos monosacridos.
10 - Oligosacridos: Glcidos que resultan de la unin de dos a diez monosacridos. Entre ellos destacan * Los Disacridos, formados por la unin de dos monosacridos mediante un enlace O-glucosdico. Normalmente siguen teniendo libre un grupo aldehdo o cetona que puede oxidarse, por lo que tienen carcter reductor. Son tambin dulces, solubles en agua y cristalizables, pero, a diferencia de los monosacridos, s que son hidrolizables, dando lugar a los monosacridos constituyentes. Aunque se suelen utilizar nombres propios para designar a los distintos disacridos, existe una nomenclatura qumica para designarlos : 1.- Nombre del monosacrido que emplea el OH del grupo carbonilo en la unin, terminado en -osil 2.- Entre parntesis los C participantes en el enlace, separados por una flecha corta 3.- Nombre del segundo monosacrido terminado en osa (en sido si el 2 -OH implicado en el enlace es anomrico tambin). ** Principales Disacridos: Sacarosa: -D-glucopiranosil (1 2) -D- fructofuransido. Es el azcar corriente de mesa. Se obtiene comercialmente de la remolacha o de la caa de azcar, aunque se encuentra tambin en el nctar de muchas flores y en algunos frutos, como dtiles o higos. Es el principal componente de la savia elaborada de los vegetales. No tiene carcter reductor. Lactosa: -D-galactopiranosil (1 4) -D- glucopiranosa. Se encuentra libre en la leche, y forma tambin parte de glucolpidos.
Maltosa: -D-glucopiranosil (1 4) -D- glucopiranosa: Es el azcar de malta. Procede de la hidrlisis del almidn y del glucgeno. Se encuentra en semillas en germinacin, que comienzan a emplear el almidn acumulado. La cebada germinada artificialmente sirve para la fabricacin de cerveza y whisky, y para obtener malta, sustituto del caf. Celobiosa: -D-glucopiranosil (1 4) - D-glucopiranosa: Se obtiene en la hidrlisis de la celulosa. Isomaltosa: -D-glucopiranosil (1 6) -D- glucopiranosa: Se obtiene tambin del almidn y el glucgeno. * Otros Oligosacridos: Existe una gran diversidad de oligosacridos, pues puede variar su nmero, ramificaciones, tipo de monosacridos que se unen y forma de enlazarse stos para formar la cadena de oligosacridos. Suelen encontrarse en las membranas celulares, unidos a protenas o a lpidos, glucoprotenas y glucolpidos
Isomaltosa
11 respectivamente, y gracias a su gran variedad sirven como seas de identidad para los distintos tipos celulares y tambin como receptores de sustancias especficas. Por ltimo, algunos antibiticos (estreptomicina y neomicinas, p.e.) son oligosacridos. - Polisacridos: Resultan de la unin de muchos monosacridos mediante enlaces o- glucosdicos, con prdida de una molcula de agua por cada enlace. Constituyen macromolculas polimricas, aunque el nmero de monosacridos es variable, oscilando entre unos pocos cientos y varios miles, pero siempre con pesos moleculares muy elevados. No son dulces, ni cristalizan, ni son solubles en agua (aunque algunos, como el almidn forma soluciones coloidales), ni poseen carcter reductor. S son hidrolizables. Se clasifican en: * Homopolisacridos: Cuando tienen un nico tipo de monosacrido * Heteropolisacrido: Cuando tienen ms de un tipo de monosacrido ** Principales Homopolisacridos: Almidn: Constituye la principal reserva energtica de los vegetales, acumulndose en forma de grnulos en los plastos y formando enormes depsitos en tubrculos y semillas. Es en realidad una mezcla de dos polisacridos, la Amilosa, y la Amilopectina. La Amilosa es un polmero de D- glucosas unidas por enlaces (1 4). Su estructura es helicoidal, con seis monmeros por cada vuelta. En caliente es soluble en agua. Con yodo se tie de azul negruzco. La Amilopectina: Se diferencia de la anterior en que peridicamente se ramifica mediante enlaces (1 6) y en que la estructura es lineal. Glucgeno: Es el polisacrido de reserva de los animales, en los que forma grnulos visibles y abundantes en hgado y msculos estriados. Su estructura es parecida a la de la amilopectina, pero con ramificaciones ms frecuentes (cada 10 12 molculas de glucosa). Celulosa: Polisacrido estructural que constituye el principal componente de la pared celular de las clulas vegetales. Est formado por un n elevado de molculas de glucosa (a veces hasta 15.000) unidas mediante enlaces glucosdicos (1 4) en cadenas lineales no ramificadas. La estructura se estabiliza mediante puentes de hidrgeno que se establecen entre molculas de una misma cadena y entre molculas de cadenas paralelas, lo que hace que sea una molcula rgida y resistente al ataque qumico. Pocos animales (p.e. los herbvoros s) poseen enzimas que permitan su hidrlisis (celulasa). La celulosa tiene importantes aplicaciones industriales, ya que es materia prima para la fabricacin de papel o tejidos. A M I L O S A
12 Quitina: Es un polisacrido estructural similar a la celulosa. El monmero constituyente es un derivado de la glucosa (N-acetil-D-glucosamina) unidos mediante enlaces glucosdicos (1 4). Forma la pared celular de hongos y el esqueleto externo de artrpodos. Pectina: Es otro componente de la pared celular de las clulas vegetales. Se usa para fabricar mermeladas. Est formada por un monmero derivado de la galactosa (cido metilgalacturnico). ** Principales Heteropolisacridos: Hemicelulosa: Forma parte de la pared celular. Contiene Xilosa y arabinosa (pentosas las dos) y otros monosacridos. Muclagos: Es un grupo variado que tiene la propiedad de absorber gran cantidad de agua. Se encuentran en bacterias, algas y vegetales. Entre ellos destaca el Agar-agar (producido por algas rojas y que contiene D y L galactosa) que se usa como espesante en la industria alimentaria para elaborar sopas, flanes, helados, etc. y para preparar medios de cultivos de microorganismos. Gomas: Forman parte de algunas secreciones vegetales que las plantas segregan para cubrir y cerrar heridas. Al secarse al aire se convierten en masas cristalinas que disueltas en agua sirven de pegamento (goma arbiga, p.e.). Presentan una composicin diversa en la que predomina la arabinosa, la ramnosa, la galactosa y el cido glucurnico. Mucopolisacridos o glucosaminoglucanos: Son de origen animal. Suelen asociarse a protenas para formar productos viscosos que forman parte de sustancias intercelulares de tejidos y, a veces, como lubricantes. Entre ellos tenemos el cido Hialurnico (en tejidos conectivos y en el lquido sinovial), la Condroitina (en huesos y cartlagos) y la Heparina (anticoagulante presente en algunas clulas de las paredes de las arterias y en la sustancia intercelular de hgado y pulmones). c.- Hetersidos: Formados por glcidos unidos a otro tipo de componente, que se llaman, en general agluconas. Existen multitud de ejemplos: Adenosina, Glucosa-6-fosfato, glucoprotenas, glucolpidos (ya mencionados)... c.- Mtodos de identificacin de glcidos: - La solubilidad, capacidad de cristalizar y el sabor dulce permiten diferenciar a mono y disacridos de polisacridos. - Prueba de Fehling: Consiste en calentar una disolucin compuesta por el glcido que se investiga y sulfato de cobre (II). Si el glcido es reductor (mono y disacridos excepto la sacarosa), se oxidar, reduciendo al sulfato de cobre (II), de color azul, a xido de cobre (I), de color rojo anaranjado. Si no es reductor, la reaccin no se producir y el color no cambiar. - El almidn da un color azul con el reactivo de lugol (disolucin de yodo y yoduro de potasio), y el glucgeno, por el contrario, da color rojo con ese mismo reactivo. - La celulosa tratada con verde brillante, se observa al microscopio teida de ese color.
13 d.- Sntesis de las funciones biolgicas de los glcidos
Sntesis de las funciones biolgicas de los glcidos F. energtica F. estructural F. de informacin Otras Constituyen el material energtico de uso inmediato para los seres vivos, siendo la Glucosa el ms utilizado como fuente de energa. El Almidn (vegetales) y el Glucgeno (animales) permiten almacenar miles de molculas de glucosa en forma de reserva energtica. La Celulosa, Pectina y Hemicelulosa forman parte de la pared celular (vegetales). La Quitina forma el exoesqueleto de artrpodos y los caparazones de crustceos. La Ribosa y Desoxirribosa forman parte de los c. Nucleicos. Los Oligosacridos de glucoprotenas y glucolpidos presentes en el exterior de las membranas celulares permiten reconocer los distintos tipos celulares. Lubricantes: como el c. Hialurnico Cementantes: como la Condroitina Anticoagulantes: como la Heparina
c.- Lpidos: a.- Concepto: Son compuestos apolares, insolubles en agua, pero solubles en disolventes orgnicos no polares (benceno, ter, cloroformo, acetona...). Tienen un tacto caracterstico (grasiento, untuoso), y manchan el papel de forma caracterstica. Desde el punto de vista qumico y funcional son muy heterogneos. Muchos de ellos tienen nicamente C, H y O, formando largas cadenas lineales o varios anillos aromticos. En otros aparece tambin P, N y/o S. En cuanto a las funciones, los hay energticos, estructurales, hormonas, mensajeros celulares, vitaminas, colorantes, aromatizantes...
a.- cidos grasos: Son cidos carboxlicos formados por largas cadenas carbonadas (entre 12 y 24 tomos de Carbono), con un n par de tomo de carbonos. Las cadenas pueden ser saturadas (no presentan dobles enlaces y las cadenas son lineales) o insaturadas (existen uno o varios enlaces dobles entre tomos de carbono, en los que se forman codos donde las cadenas cambian de direccin). Entre los grupos CH 2 se forman enlaces de Van der Waals. Los diferentes cidos grasos se diferencian entre s en la longitud de la cadena y en el n y posicin Saturados cidos grasos Insaturados
Isoprenoides o Terpenos b.- Clasificacin de los lpidos
Lpidos insaponificables
Prostaglandinas
14 de los dobles enlaces, caractersticas de las que tambin dependen algunas de sus principales propiedades fsicas, como el punto de fusin (mientras ms larga y saturada, ms alto porque el empaquetamiento entre mol-culas es mayor) y la solubilidad. En cuanto a la solubilidad, los cidos grasos son molculas anfipticas, es decir, bipolares, que tienen una zona hidrfila (cabeza polar) con afinidad por el agua, constituida por el grupo carboxilo (-COOH), y una zona hidrfoba (cola apolar), formada por la cadena hidrocarbonada, que es repelida por el agua. El gran tamao de esta zona es la responsable de que los cidos grasos sean insolubles en el agua y solubles en disolventes orgnicos. Debido a esta caracterstica, al entrar en contacto con el agua, los cidos grasos orientan las cabezas polares hacia ella, mientras que las colas apolares se sitan en posicin opuesta. Esto da lugar a formacin de estructuras esfricas (micelas) o en empalizada, en este ltimo caso en monocapa (si los cidos grasos se sitan en la interfase entre agua y un medio no polar como el aire) o en bicapa (con las colas apolares enfrentadas y las cabezas polares hacia el exterior, en contacto con el agua). Existen cidos grasos que no pueden ser sintetizados por el hombre (linoleico, linolnico y araquidnico, p.e.), y se denominan c. grasos esenciales. Su carencia impide la sntesis de otras molculas (lpidos saponificables, p.e.), y deben ser aportados por la dieta (aceites de semilla o pescado azul lo contienen).
N C Estructura Nombre P.Fusin C12:0 CH 3 -(CH 2 ) 10 -COOH
b.- Lpidos saponificables: a.- Concepto: Son steres, resultado de la unin covalente entre cidos grasos y alcoholes (o amidas, si la unin es entre cido graso y amina). En esa reaccin de esterificacin se pierde agua. Por ello, estos lpidos se pueden hidrolizar, liberndose los cidos grasos de los alcoholes al aadir una molcula de agua a cada enlace ster. Si la reaccin se produce en medio alcalino (en presencia de KOH o NaOH, p.e.) se denomina saponificacin, pues se producen los alcoholes y jabones (sal del cido graso correspondiente).
15 Esterificacin R COOH + R OH R COO R + H 2 O c. Graso Alcohol Hidrlisis Lpido saponificable
Saponificacin R COO R + KOH (R COO) - K + + R OH Lpido saponificable lcali Jabn Alcohol
b.- Tipos de lpidos saponificables: - Triacilglicridos o grasas Formados por tres molculas de cidos grasos (iguales o distintas) unidas por enlaces ster a una molcula de glicerina (o glicerol). Si los tres cidos grasos son iguales, se denominan grasas simples, y se nombran con el prefijo tri-, seguido del nombre del cido graso y la terminacin ina (triestearina, tripalmitina, trioleina). Si los cidos grasos son diferentes se denominan grasas mixtas. Las grasas naturales estn formadas por mezclas de triacilglicridos simples y mixtos. Pueden ser slidas, como los sebos mantecas y tocinos de los animales, o lquidas como los aceites vegetales, ms ricos en cidos grasos insaturados que las animales. Son molculas apolares, insolubles en agua, sobre la que flotan debido a su baja densidad. Desempean dos funciones importantes: Constituyen la principal reserva energtica en los animales, debido a que poseen un valor energtico superior al de los glcidos y protenas. As se consigue almacenar la mxima energa con el mnimo peso, lo que facilita la movilidad del animal. Las acumuladas en las semillas vegetales proporcionan energa al embrin durante su desarrollo. Proporcionan aislamiento trmico y fsico. El panculo adiposo de la piel acta como aislante trmico contra el fro. Las grasas depositadas alrededor del corazn o riones actan como proteccin contra los traumatismos. - Ceras: steres de un cido graso de cadena larga con un alcohol de cadena larga. En general son slidas y totalmente insolubles en agua, ya que son hidrfobas. La funcin que desempean suele ser protectora e impermeabilizante. As forman la cubierta impermeable que recubre a hojas, frutos y plantas, impidiendo la prdida de agua y protegindolos frente a parsitos. La piel, escamas y plumas de los animales estn cubiertos con una capa de cera que los mantiene flexibles, lubricados e impermeables. Entre las ceras ms conocidas est la Lanolina (cera protectora de la lana de las ovejas), el Cerumen del conducto auditivo externo (dificulta el acceso de parsitos y cuerpos extraos) y la Cera de los panales de las abejas.
16 - Fosfoglicridos: Son tristeres de la glicerina, pero de los tres cidos unidos a ella, dos son cidos grasos y el tercero es un cido ortofosfrico. Esta molcula se denomina cido fosfatdico. El grupo fosfato, a su vez, se une a un aminoalcohol, originando el fosfoglicrido completo. Junto a las esfingomielinas constituyen los Fosfolpidos. Entre ellos destacan: la fosfatidilcolina (lecitina), presente en la yema del huevo y en el tejido nervioso, la fosfatidiletanolamina (cefalina), presente en el cerebro o la fosfatidilserina. Los fosfoglicridos son tambin molculas anfipticas, ya que tienen dos partes diferentes: una cabeza hidrfila polar, que comprende el grupo fosfato y el compuesto polar, y una cola hidrfoba apolar constituida por las dos cadenas de cidos grasos. De esta propiedad deriva su funcin biolgica. Todas las membranas celulares estn constituidas por una doble capa fosfolipdica, en la que las colas apolares de ambas capas quedan enfrentadas entre s, mientras que las cabezas polares se orientan hacia el medio interno y externo, ambos acuosos. - Esfingolpidos: Son tambin componentes de las membranas celulares, aunque en menor proporcin que los fosfoglicridos. Qumicamente son amidas del alcohol esfingosina (o uno de sus derivados) con un cido graso, lo que forma una ceramida, que, a su vez, se une a un grupo polar formando el esfingolpido. Segn el grupo polar, se distinguen dos clases de esfingolpidos: Esfingomielinas: El grupo polar es una molcula de c. fosfrico esterificada con colina, por lo que son fosfolpidos. Se encuentran en la vaina de mielina que asla a los axones de las neuronas. Glucoesfingolpidos: Su grupo polar es un glcido. Si es un monosacrido se forman los cerebrsidos y si es un oligosacrido es un ganglisido. Desempean un papel fundamental como antgenos celulares, es decir, molculas identificativas de clulas que permiten el reconocimiento entre ellas, y que se relacionan con mltiples procesos, sobre todo inmunitarios.
17 c.- Lpidos insaponificables: a.- Concepto: Se incluyen en este grupo los lpidos que no contienen cidos grasos en su composicin qumica (tampoco son steres) y, por tanto, no llevan a cabo la reaccin de saponificacin. Se encuentran en los seres vivos en menor cantidad que los saponificables, pero comprenden algunos compuestos biolgicos de funcin importante. b.- Tipos de lpidos insaponificables: - Terpenos o isoprenoides: Son polmeros de la molcula de isopreno (2-metil-1,3-butadieno) CH 3
CH 2 = C CH = CH 2 La presencia de los dos dobles enlaces conjugados hace que tengan electrones deslocalizados que pueden absorber fcilmente la energa luminosa, por lo que dan lugar a compuestos coloreados. Se clasifican segn el n de molculas de isopreno que tengan:
Tipo Caractersticas Ejemplos Monoterpeno 2 unidades de isopreno. Compuestos voltiles que dan aroma a muchas plantas. Limoneno (limn), Mentol (menta), Geraniol (geranio), Timol (tomillo) Diterpeno 4 unidades de isopreno Fitol (componente de la clorofila), Vitaminas E y A Triterpeno 6 unidades de isopreno. Escualeno (precursor del colesterol) Tetraterpeno 8 unidades de isopreno. En ellos se incluyen pigmentos de importancia fotosinttica. Carotenoides: Licopeno (rojo del tomate), Xantofila (Amarillo del maz o de la yema de huevo), -caroteno (naranja de la zanahoria y precursor de la Vitamina A) Politerpeno Ms de 8 unidades de isopreno. Caucho natural. Cadenas laterales de quinosas (coenzima Q o plastoquinona, p.e.)
- Esteroides: Derivan del ciclopentanoperhidro- fenantreno (hidrocarburo tetracclico, tambin llamado esterano). Se diferencian entre s por el n de dobles enlaces y por el tipo y localizacin de los grupos funcionales sustituyentes. Los principales esteroides son: El Colesterol: Forma parte de las membranas de las clulas animales y se encuentra tambin unido a protenas en el plasma sanguneo. Es el precursor del resto de esteroides del organismo. Cuando se encuentra en elevadas cantidades en la sangre contribuye a formar los ateromas o placas en las paredes de las arterias.
18 En realidad el colesterol forma parte de los esteroles, que se caracterizan por tener un grupo alcohol en el carbono 3 y una cadena hidrocarbonada en el 17. Otros esteroles son el ergosterol presente en hongos, y los fitosteroles, presentes en las clulas vegetales. Los cidos biliares: Producidos por el hgado. Emulsionan las grasas en el intestino para favorecer su digestin. Su sntesis es el principal destino metablico del colesterol. Vitamina D: En realidad es una prohormona, a partir de la cual se sintetiza una hormona esteroidea que regula el metabolismo del calcio y del fsforo. Nuestro organismo puede fabricarla en las clulas de la piel a partir de un precursor, por accin de los rayos ultravioletas del sol. Hormonas esteroideas: - Prostaglandinas: Se forman por ciclacin de cidos grasos poliinsaturados, como el cido araquidnico. Sus funciones son muy variadas: estimulan la agregacin de plaquetas, activan las respuestas inflamatorias de los tejidos, provocan la subida de la temperatura corporal (fiebre), controlan el descenso de la tensin arterial, intervienen en la contraccin del msculo uterino, inhiben la secrecin gstrica... c.- Mtodos de identificacin de lpidos: - Comprobar la insolubilidad en H 2 O y la solubilidad en compuestos orgnicos (ter, acetona...) - Las grasas se identifican con una solucin alcohlica saturada con un colorante especfico: el Sudn III. La aparicin de una coloracin roja o rosada revela la presencia de grasas. d.- Sntesis de las funciones biolgicas de los lpidos
F. de reserva energtica F. estructural F. protectora F. Transportadora F. Biocatalizadora Son un importante material energtico de uso biolgico que, al no almacenarse con agua, resulta relativamente ligero. La combustin metablica de un gramo de lpido produce unas 9,4 kcal. El carcter bipolar de fosfoglicridos y esfingolpidos les permiten organizarse en bicapas en medios acuoso y formar parte fundamen-tal de las membranas biolgicas. Las grasas actan como aislantes tr- micos y mec- nicos Las lipoprotenas plasmticas son las encargadas del transporte de lpidos, como el colesterol y los triglicridos. Las hormonas esteroideas y las vitaminas A, D, E y K (liposolubles) facilitan las reac- ciones qumicas que se producen en los seres vivos. Tipo de hormona esteroidea Nombre Funcin Ecdisona Muda de artrpodos Progesterona Regula el embarazo, el ciclo ovrico y son precursores metablicos de las dems hormonas esteroideas Femeninas Estrgenos (estradiol) Fomenta el desarrollo sexual femenino y mantiene los caracteres sexuales femeninos Sexuales Masculinas Testosterona Fomenta el desarrollo sexual masculino y mantiene los caracteres sexuales masculinos Glucocorticoides Cortisol Cortisona Fomentan la gluconeognesis y, a dosis elevadas, son inmunodepresores. Corticoides Mineralocorticoides Aldosterona Regula el equilibrio inico en el interior del organismo
19 d.- Protenas: Son las biomolculas orgnicas compuestas de C, H, O y N, y en la mayor parte de los casos, tambin contienen S. Su importancia biolgica se debe, por un lado a su abundancia en los seres vivos (hasta el 50% del peso celular seco), y, sobre todo, a la variedad de funciones biolgicas que desempean: estructural, de transporte, movimiento, regulacin... Qumicamente son macromolculas formadas por la unin (a travs de un tipo de enlace caracterstico, denominado enlace peptdico) de muchas molculas ms simples denominadas aminocidos y poseen una estructura tridimensional caracterstica y una funcin propia. a.- Los aminocidos: a.- Concepto: Como su nombre indica, los aminocidos son molculas que poseen, al menos, un grupo amino (- NH 2 ) y un grupo carboxlico (- COOH). Los aminocidos que constituyen las protenas presentan siempre el grupo amino unido al carbono (el ms cercano al grupo carboxlico). Existen 20 aminocidos distintos de este tipo, que se diferencian entre s por el otro grupo unido al carbono , el llamado R o cadena lateral. b.- Propiedades de los aminocidos: a.- Carcter anftero: Una molcula se dice que es anftera cuando puede comportarse como cido o como base dependiendo del pH del medio donde se encuentre. Este es el caso de los aminocidos: al tener un grupo carboxilo pueden desprender H + , por lo que tienen carcter cido; por otro lado, al tener un grupo amino, son capaces de aceptar H + y, por tanto, tambin tienen carcter bsico. Al pH existente habitualmente en los medios biolgicos (prximo a 6), ambos grupos suelen estar ionizados y los aminocidos aparecen como iones dobles. A un pH ms cido, los aminocidos tendrn carga neta positiva, pues los H + del medio son captados por el grupo COO - , neutralizando ste y quedando nicamente la carga del grupo -NH 3 + . Por el contrarios, en un pH ms bsico, el grupo - NH 3 + ceder un H + al medio y el aminocido quedar con carga negativa. La cadena lateral (R), a su vez, puede tener grupos ionizables que participan en la carga elctrica del aminocido. b.- Estereoisomera: El carbono es asimtrico en todos los aminocidos (excepto en la glicina en la que R = -H), por lo que existen dos estereoismeros con diferente actividad ptica. El L es el que posee el grupo amino a la izquierda, y el aminocido D el que lo posee a la derecha. Los aminocidos proteicos son todos L-aminocidos, aunque en la naturaleza existen D- aminocidos (p.e. formando parte de antibiticos). c.- Clasificacin de los aminocidos: Segn la cadena lateral, los aminocidos proteicos se clasifican en tres grupos: Aminocidos neutros: La cadena lateral no posee carboxilo ni amino y, por tanto, a pH neutro su carga elctrica neta es 0. A su vez se subdividen en:
20
* Aminocidos neutros polares: Su cadena lateral posee grupos hidrfilos (con enlaces covalentes polares)que le permiten formar puentes de hidrgeno por lo que, aunque no tiene carga elctrica neta, son muy solubles en agua. * Aminocidos neutros apolares: la cadena lateral slo contiene enlaces covalente apolares y, por tanto, son hidrofbicos e insolubles en agua. Aminocidos cidos: Presentan un grupo carboxilo en la cadena lateral y poseen carga elctrica negativa, ya que ese grupo desprende H + . Aminocidos bsicos: Contienen algn grupo amino en la cadena lateral que, debido a su carcter bsico, puede tomar H + , lo que har que el aminocido tenga carga positiva.
21 b.- El enlace peptdico: Los aminocidos se unen entre s al reaccionar el grupo carboxlico principal del primero con el grupo amino del siguiente, formando una amida y liberndose una molcula de agua. A este tipo de unin se le denomina Enlace peptdico, y el compuesto resultante de la unin de dos aminocidos, Dipptido. Como ste contina teniendo un extremo con un grupo amino y otro con un grupo carboxilo, puede reaccionar con otro aminocido, formando un nuevo enlace peptdico, y as sucesivamente, dando lugar a un polipptido.
El enlace peptdico se estabiliza por resonancia, ya que posee cierto carcter de doble enlace, al desplazarse continuamente una pareja de electrones desde el grupo carbonilo al enlace peptdico y al revs, lo que hace que aparezcan dos formas resonantes. Como consecuencia de ello, el enlace peptdico es rgido (no admite giros) y los cuatro tomos del grupo pptido y los dos tomos de carbono quedan en el mismo plano. Sin embargo, los enlaces del carbono con el carbono carbonlico y con el nitrgeno son covalentes sencillos puros, alrededor de los cuales la molcula puede girar libremente.
c.- Estructura de las protenas: La actividad biolgica de una protena depende en gran medida de la disposicin espacial de su cadena polipeptdica. Efectivamente, dicha cadena sufre una serie de plegamientos que proporcionan una gran complejidad a la estructura de las protenas, habindose definido cuatro niveles diferentes, conocidos como estructura primaria, secundaria, terciaria y cuaternaria, cada uno de los cuales se construye a partir del nivel anterior. a.- Estructura Primaria: Se denomina as a la secuencia de aminocidos en la cadena polipeptdica. El n, tipo y orden de los aminocidos que constituyen dicha estructura son distintos para cada protena, y viene determinado, como veremos en otro tema, por la informacin gentica que posee la clula. Una variacin, aunque sea pequea, de esta estructura puede alterar la forma espacial de la protena, e incapacitarla para realizar su funcin. Por convenio, el extremo amino se escribe al principio (izquierda) de la cadena y el carboxilo al final.
22 b.- Estructura Secundaria: En realidad, la estructura primaria constituye una serie de planos articulados pues, como ya hemos visto, los enlaces peptdicos no pueden girar, y los tomos de carbono, nitrgeno y oxgeno que participan en ellos se sitan en un mismo plano. Entre estos tomos se establecen puentes de hidrgeno (sin que intervengan los grupos laterales de los aminocidos) que pliegan la cadena. Aunque la disposicin de la cadena polipeptdica en el espacio puede variar, existe una conformacin ms estable que ninguna otra que, lgicamente, es la que se mantiene y a la que se le denomina estructura secundaria. Existen dos tipos bsicos: La Hlice : Consiste en un plegamiento en espiral de la cadena polipeptdica sobre s misma, en el sentido de giro de las agujas del reloj y contiene 3,6 aminocidos por vuelta. La estructura se mantiene estable por puentes de hidrgeno entre el oxgeno del grupo carbonilo de un aminocido y el hidrgeno del cuarto aminocido consecutivo. Los grupos laterales quedan extendidos perpendicular-mente hacia fuera de la hlice. Las protenas (o parte de protenas) con esta estructura tienen una cierta elasticidad, ya que los puentes de hidrgeno se pueden romper y volver a formar. Asimismo la estructura se distorsiona en agua. Lmina plegada o plegada: Los planos de los enlaces peptdicos sucesivos se disponen en zig-zag, y la estructura se estabiliza mediante puentes de H entre los grupos C=O y N-H de Aa pertenecientes a diferentes segmentos de la cadena polipeptdica, que pueden pertenecer a la misma o a diferente cadena. Las cadenas laterales de los aminocidos se disponen alternativamente por encima y por debajo de esta estructura. Estas dos estructuras no son las nicas posibles, pero s las ms frecuentes. As, el colgeno, p.e., posee una estructura secundaria caracterstica en la que tres cadenas peptdicas se enrollan entre s. El que una protena adquiera una u otra estructura secundaria depende, en definitiva, de su estructura primaria. Por ltimo, una misma cadena polipeptdica puede presentar diferentes estructuras secundarias en diferentes segmentos de la misma. c.- Estructura Terciaria: La cadena polipeptdica, aunque estabilizada por su estructura secundaria, puede an sufrir giros y plegamientos, adquiriendo una disposicin tridimensional conocida como estructura terciaria de la protena. Es consecuencia de uniones que se realizan por medios de enlaces entre las cadenas laterales (R) de los aminocidos. Los enlaces pueden ser de cuatro tipos:
23 Puentes disulfuros: Debidos a la formacin de fuertes enlaces covalentes entre dos grupos SH que pertenecen a sendos aminocidos cistena. Fuerzas electrostticas: Enlaces de tipo inico entre grupos con cargas elctricas opuestas (p.e. un grupo carboxilo de una cadena lateral de un aminocido cido y un grupo amino de otra de uno bsico). Puentes de hidrgeno: Se establecen entre grupos polares no inicos en los que existen cargas parciales en su cadena lateral (p.e. grupos OH de la serina o treonina). Fuerzas de Van der Waals e interacciones hidrofbicas: Son uniones dbiles que se producen bien entre grupos no polares que se polarizan por la presencia de una carga o por desplazamientos electrnicos temporales o que, al no poder interaccionar con el agua, tienden a hacerlo entre s, ocultndose del agua que envuelve la molcula. En general, se considera que existen dos tipos de estructuras terciarias: Globular: Las protenas poseen un alto grado de plegamiento y adquieren forma compacta (no necesariamente esfrica). Son formas tpicas en enzimas, p.e. Generalmente son solubles en agua. Fibrilar: Las protenas presentan forma alargada, con un grado de empaquetamiento menor. Tienen funciones estructurales y generalmente son insolubles en agua. Para terminar, como de la estructura terciaria depende la funcin de la protena, cualquier cambio en su disposicin puede provocar la prdida de su actividad biolgica. d.- Estructura Cuaternaria: Slo est presente en protenas formadas por ms de una cadena polipeptdica, cada una de las cuales se denomina subunidad. Las subunidades pueden ser iguales o distintas, y se unen entre s mediante interacciones del mismo tipo de las vistas para la estructura terciaria. La disposicin relativa de las subunidades entre s es lo que se denomina estructura cuaternaria. En algunos casos son muchas subunidades las que se ensamblan, como en la actina o en las cpsidas de los virus. En otros casos la complejidad es menor, como en la hemoglobina, formada por 4 subunidades iguales 2 a 2.
24
d.- Propiedades de las protenas: De la estructura de las protenas se derivan importantes propiedades que hacen posible muchas de las funciones que desempean estas biomolculas en los seres vivos. Entre ellas destacan: a.- Especificidad: Gracias al elevado n de combinaciones posibles en la secuencia de aminocidos, las protenas son molculas especficas, es decir, cada especie biolgica posee algunas protenas que otras especies no tienen. Incluso protenas con estructura tridimensional y funciones parecidas suelen tener una secuencia peptdica diferente en distintos organismos, lo que permite establecer parentesco evolutivo entre especies a partir del anlisis de las semejanzas que existen entre algunas protenas. Esta especificidad se observa tambin entre individuos de una misma especie. Hay dos tipos de protenas, las enzimas y las inmunoglobulinas cuyas funciones requieren de manera especial la capacidad de las protenas para presentar una secuencia especfica de aminocidos. b.- Desnaturalizacin: Como ya hemos dicho, la funcin biolgica de una protena depende de su estructura tridimensional, tambin conocida como conformacin nativa. Se denomina Desnaturalizacin a la prdida de esta estructura nativa, por prdida de los enlaces de las estructuras cuaternaria, terciaria y secundaria, conservando tan slo la estructura primaria. Las causas de la desnaturalizacin pueden ser aumento de la T o de la presin, variaciones del pH o cambios en la concentracin salina del medio, todo lo cual dificulta la formacin de los enlaces responsables del mantenimiento de la estructura nativa. La desnaturalizacin puede ser reversible, si al cesar el agente que provoc el cambio de estructura, la protena recupera la conformacin nativa (renaturalizacin), o irreversible, si la protena ya no puede volver a recuperar la estructura nativa (caso de la albmina del huevo cuando se expone a temperaturas elevadas). c.- Solubilidad: Las protenas son ms solubles en agua si presentan ms aminocidos polares que aminocidos apolares, pues en este segundo caso las cadenas laterales interaccionaran entre ellas con ms fuerza que con el agua circundante. La mayor parte de las protenas fibrilares son insolubles en agua, mientras que las globulares son solubles, porque colocan las cadenas hidrfilas en la periferia de la molcula, concentrando los grupos apolares en el interior. La solubilidad se ve afectada por el pH del medio, pues de l depende el n de cargas elctricas y por la concentracin salina del medio, ya que mientras ms concentracin de sales, mayor es la competencia de los iones disueltos con las molculas de protenas por rodearse de molculas de agua y, por tanto, menor solubilidad de las protenas. e.- Clasificacin de las protenas: Podemos hacerlo por su composicin o por su funcin. a.- Clasificacin estructural: a.- Holoprotenas (o Protenas simples). Estn formadas nicamente por cadenas polipeptdicas, ya que en su hidrlisis slo se obtienen aminocidos. Segn su estructura terciaria, se subdividen en Protenas globulares y Protenas fibrilares.
Albminas: Gran tamao. Transporte de molculas. Reserva de Aminocidos Globulinas: Muy grandes Globu- lares Histonas: Bajo peso molecular. Asociadas al ADN forman parte de la cromatina. Regulacin gnica
Queratina: Rica en cistena. Forma parte de pelos, plumas, escamas... Colgeno: Gran resistencia al estiramiento. Presente en tej. Conjuntivo, cartilaginoso y seo Miosina: Participa en la contraccin muscular Fibri- lares Elastina: Muy elstica. Aparece en pulmones, arterias, dermis de la piel
25 b.- Heteroprotenas (protenas complejas). Adems de las cadenas polipeptdicas, estn compuestas tambin por una parte no proteica denominada grupo prosttico. Una heteroprotena desprovista de su grupo prosttico recibe el nombre de apoprotena.
Grupo Grupo Prosttico Ejemplos Fosfoprotenas c. Ortofosfrico Vitelina (yema del huevo) Casena (queso) Glucoprotenas Glcido Antgenos de las membranas Gammaglobulinas Mucus de ap. Digestivo y respiratorio Lipoprotenas Lpido Porfirnicos Metalporfirina Hemoglobina (Fe 2+ ). Transporte de O 2
Mioglobina (Fe 2+ ). Msculos estriados Citocromos (Fe). Transporte de e - en metabolismo Peroxidasas y catalasas (Fe). Enzimas Clorofila ( Mg 2+ y fitol). Fotosntesis Cianocobalamina (Mo). Vitamina B 12
Cromoprotenas (coloreadas) No Porfirnicos No metalporfirina Rodopsina. Capta la luz en la retina Hemocianina (Cu 2+ ). Transporta O 2 en invertebr. Nucleoprotenas c. nucleico Cromatina y cromosomas
f.- Funciones de las protenas: De la enorme variedad de funciones que desempean las protenas podemos destacar: a.- Protenas estructurales: Formacin de estructuras celulares (Histonas), dar rigidez, flexibilidad o forma a tejidos y rganos. Pertenecen a este grupo la mayor parte de las protenas fibrilares (Colgeno, Queratina, Fibrona...) b.- Protenas de reserva: Constituyen un almacn de aminocidos que el organismo utilizar en el crecimiento, desarrollo y reparacin de sus estructuras, por lo que son muy abundantes en las semillas vegetales y los huevos de animales (Albminas...) c.- Protenas activas: Desempean funciones diversas, pero todas tienen en comn que, para desempear su funcin, han de interaccionar con otra sustancia denominada ligando. Dentro de ellas tenemos: Enzimas: Son biocatalizadores que regulan las reacciones qumicas que se producen en los seres vivos, unindose al ligando, denominado en este caso sustrato. Protenas transportadoras: Se unen reversiblemente a un ligando y lo transportan de un lugar a otro (Hemoglobina, Mioglobina, Albminas...) Protenas reguladoras: Interaccionan con el ligando y ponen en marcha determinado procesos celulares (Hormonas como la insulina...) Protenas contrctiles: Al unirse al ligando experimentan un cambio en la conformacin que tiene como consecuencia el acortamiento o alargamiento del rgano u orgnulo del que forma parte (Miosina de las clulas musculares...) Protenas inmunes: Algunas actan como antgenos, proporcionando identidad molecular a los organismos vivos, y otras como anticuerpos, bloqueando a cualquier molcula extraa que se introduzca en ellos. Protenas de regulacin gentica: Participan en los procesos de activacin e inactivacin de la informacin gentica y tambin las hay que controlan la duplicacin del ADN. Adems de todas las ya mencionadas, hay protenas con funcin anticoagulante, luminiscentes, venenos, que responden a estmulos...
26 g.- Mtodos de identificacin de las protenas: Aunque se puede detectar fcilmente la presencia de protenas en una disolucin coagulndola con calor o por adicin de un cido, existen algunas pruebas especficas para identificarlas: Prueba de Biuret: Detecta la presencia de cualquier compuesto con dos o ms enlaces peptdicos. Consiste en alcalinizar el medio con NaOH y aadir una gotas de sulfato de cobre (II). Se obtiene un complejo de color violeta rosado. Pero si molculas no proteicas poseen dos grupos C-N-, tambin dan esta coloracin, por lo que no se puede empelar para detectar protenas en la orina, pues la urea da resultado positivo. Prueba xantoproteica: Permite detectar la presencia de grupos fenilos en una molcula (caracterstica que cumplen casi todas las protenas, pues es raro que no lleven algn aminocido con grupo fenol). Se aade HNO 3 concentrado y se obtiene un precipitado blanco que se vuelve amarillo al calentar, y naranja al alcalinizar con amoniaco. Prueba de Millon: Tambin detecta fenoles. Se emplea Hg disuelto en HNO 3
(reactivo de Millon) y se obtiene un precipitado blanco que se vuelve rojo al calentar, debido a la formacin de complejos de Hg (II). e.- cidos nucleicos: Qumicamente los cidos nucleicos son macromolculas formadas por la unin de muchos monmeros denominados nucletidos. Funcionalmente tienen una gran importancia, pues son las molculas que dirigen y controlan todos los procesos biolgicos. a.- Nuclesidos: Son compuestos formados por la unin de una pentosa y una base nitrogenada. La pentosa puede ser -D- ribofuranosa (ribosa) o -D- 2- desoxirribofuranosa (desoxirribosa). Bases nitrogenadas: Son compuestos heterocclicos con tomos de nitrgeno en el anillo. Pueden ser de dos tipos: Pricas (Guanina y Adenina) y Pirimidnicas (Citosina, Uracilo y Timina)
La unin siempre se realiza mediante un enlace N-glucosdico entre el carbono 1 de la pentosa y el N 1 de la base nitrogenada si es pirimidnica y el N9 si es prica. El compuesto resultante se nombra con el nombre de la base nitrogenada seguido del sufijo osina, para el caso de las bases pricas (adenosina, guanosina) o idina, para el caso de las pirimidnicas (citidina, uridina, timidina). Si la pentosa es la desoxirribosa se antecede del prefijo desoxi- (desoxicitidina, desoxiadenosina...)
27 b.- Nucletidos: Resultan de la unin entre un nuclesido y molculas de cido fosfrico. La unin es un enlace ster entre la pentosa y el cido fosfrico. Lo ms frecuente es que este enlace se realice con el grupo alcohol del carbono 5 de la pentosa, aunque existen nucletidos con el grupo fosfato unido al 3. Un nucletido puede tener una, dos o tres molculas de cido fosfrico enlazadas; por eso, para nombrarlos se suprime la ltima a del nombre del nuclesido y se indica a continuacin el lugar de la unin a la pentosa y el n de fosfatos unidos. Si no se indica el carbono de unin se sobreentiende que es el 5.
28 a.- Nucletidos de inters biolgico: Adems de formar parte de los cidos nucleicos, algunos nucletidos llevan a cabo funciones bsicas para los seres vivos. Entre ellos destacamos: a.- Molculas acumuladoras y donantes de energa: Ciertas reacciones bioqumicas tienen como finalidad la produccin de energa. Si esta energa se desprendiera libremente tendra muy poca utilidad para el organismo. Es ms eficaz disponer de molculas que acumulen la energa liberada, de manera que pueda ser utilizada posteriormente en la cantidad y en el momento preciso. Algunos nucletidos (sobre todo la adenosina y en menor medida la guanosina) con ms de un grupo fosfato desempean esta funcin, debido a que los enlaces entre fosfatos acumulan energa qumica que puede transferirse a otras molculas cuando dichos enlaces se hidrolizan. Inversamente, la energa desprendida en muchas reacciones biolgicas puede aprovecharse para formar estos enlaces ricos en energa:
AMP + P i + Energa (7 kcal/mol) ADP; ADP + P i + Energa (7 kcal/mol) ATP
Es habitual representar los enlaces de alta energa con el smbolo ( ~ ), en lugar de la notacin habitual ( - ) de los enlaces. b.- Coenzimas: Las coenzimas son sustancias orgnicas no proteicas que han de intervenir en reacciones qumicas catalizadas por enzimas, para que stas puedan realizar su funcin. No son especficas en cuanto al sustrato, sino que cada clase de coenzima acta en una misma clase de reaccin, sea quien sea el sustrato. Las coenzimas pueden hacer posible la accin enzimtica de dos maneras: unindose temporalmente a la enzima para facilitar su contacto o su accin cataltica sobre el sustrato, o enlazndose con el sustrato para provocar un cambio en su estructura que facilite la accin de la enzima. Algunos derivados de nucletidos intervienen como coenzimas en reacciones enzimticas importantes. Es el caso de: Nicotinamn adenn dinucletido (NAD + ), Nicotinamn adenn dinucletido fosfato (NADP + ) y Flavn adenn dinucletido (FAD): Los dos primeros estn formados por dos nucletidos unidos: uno cuya base nitrogenada es la adenina, y otro que tiene como base a la nicotinamida (o vitamina PP). En el caso del NADP, existe adems un grupo fosfato en el carbono 2 de una ribosa.
29 El FAD es parecido, pero contiene adenina y una base nitrogenada denominada flavina (derivado de la riboflavina o vitamina B 2 ). Los tres tienen una accin semejante. Participan en reacciones de deshidroge-nacin. Estas deshidrogenaciones toman H + y electrones de algunas molculas y quedan como NADH, NADPH y FADH 2 respectivamente. Estas coenzimas, en estado reducido, pueden ceder fcilmente electrones y H + a otras molculas.
NAD + + H + +
2e - NADH Forma oxidada Forma reducida Coenzima A (CoA): Est compuesto por adenosn difosfato, al que se le une el cido pantotnico (vitamina B 5 ), y acta como transportador de grupos acilo (CH 3 CO). Se enlaza con facilidad con cidos orgnicos. c.- AMP cclico (AMPc): Es un derivado del AMP. Acta como segundo mensajero en la recepcin de seales por parte de la clula. Cuando una molcula (hormona, neurotransmisor..) que ha desencadenar una respuesta en una clula es incapaz de atravesar la membrana, se unen a protenas receptoras especficas de la membrana plasmtica, y activa a una enzima (adenil ciclasa) que cataliza la reaccin de sntesis del AMPc en el interior de la clula. El AMPc sintetizado activa a su vez las enzimas necesarias para dar respuesta a la seal recibida del exterior de la clula, actuando como mediador entre la informacin externa y la respuesta final. Adenil ciclasa ATP AMPc + P P
c.- El enlace fosfodister (nucleotdico). Polinucletidos: Los nucletidos se unen entre s mediante enlaces tipo ster que se realizan entre el grupo fosfato situado en posicin 5 de un nucletido y el grupo hidroxilo que se encuentra en el carbono 3 de otro nucletido, liberndose una molcula de agua. As se forma un dinucletido que al hidrolizarse liberar los dos mononucletidos. Dado que existen an grupos hidroxilos libres, el dinucletido se puede unir a ms nucletidos y formar tri, tetra, pentanucletidos... La unin de cientos o miles de nucletidos constituyen los polinucletidos o cidos nucleicos.
30 En todos los polinucletidos existe un extremo (denominado extremo 3) con una pentosa con el grupo OH del carbono 3 libre, y otro extremo (llamado extremo 5) donde se localiza un grupo fosfato libre unido al carbono 5 de otra pentosa. Como la unin entre nucletidos se produce entre pentosas y fosfatos, se establecen largas cadenas sin ramificar formadas por la secuencia pentosa fosfato pentosa fosfato..., quedando las bases nitrogenadas unidas lateralmente a las pentosas. La secuencia de bases nitrogenadas es la que proporciona especificidad a una cadena polinucleotdica determinada, por lo que, de manera simplificada, se usa una notacin en la que se indica dicha secuencia y los extremos 5 y 3. Existen dos tipos de cidos nucleicos, el ADN y el ARN d.- El ARN: a.- Caractersticas generales: Est formado por largas cadenas de nucletidos unidos entre s por enlaces fosfodister entre las posiciones 3 y 5 de los nucletidos consecutivos. La pentosa es la Ribosa (-D- ribofuranosa ) y las bases nitrogenadas la Adenina, Guanina, Citosina y Uracilo. Siempre que no se especifique la polaridad las cadenas se escriben de 5 a 3. El orden de los nucletidos en la cadena o secuencia es lo que diferencia a unos ARN de otros y constituye la estructura primaria del ARN. Excepto en los reovirus, el ARN est constituido por una nica cadena, aunque en el ARN transferente existe un apareamiento de bases dentro de la cadena, lo que hace que aparezcan tramos bicatenarios, originados por el plegamiento de la cadena sobre s misma (estructura secundaria). El ARN es la molcula encargada de sintetizar las protenas de un organismo, a partir del mensaje gentico codificado por el ADN. Este proceso es sumamente complejo y requiere la intervencin de varios b.- Tipos de ARN: a.- ARN mensajero(ARNm): Es la copia complementaria de un fragmento de ADN (la que corresponde a un gen o grupos de genes que vayan a expresarse) y lleva la informacin necesaria para fabricar una protena. Est constituido por un filamento simple y es bastante inestable, por lo que se destruye rpidamente (su vida es de unas 10 horas en clulas eucariticas), evitndose as la superproduccin de protenas. Se forma en el ncleo, aunque ejerce su funcin en el citoplasma. Constituye entre el 3 y el 5% del total de ARN celular. b.- ARN ribosmico (ARNr): Forma parte de los ribosomas e interviene en el proceso de unin de los Aa para sintetizar las protenas. Es el ms abundante (75-85% del total) y es bastante estable. La cadena aparece plegada con zonas en las que las bases estn apareadas. Existen cadenas distintas de ARNr, que se diferencian por su velocidad de sedimentacin.
31 c.- ARN transferente (ARNt): Se encuentra disperso por el citoplasma y se encarga de transportar aminocidos. Estn formados por cadenas cortas (entre 70 y 95 nucletidos), adoptando la molcula una estructura muy caracterstica en forma de hoja de trbol: Existen 4 zonas (brazos) de doble cadena, con las bases apareadas, en cuyos extremos existen zonas sin aparear (bucles). El extremo 3 de la cadena tiene siempre la secuencia de bases CCA. A este nucletido de adenina terminal se une el aminocido que va a ser transportado. En el bucle opuesto a este brazo se encuentra el anticodn, triplete de bases nitrogenadas que indica el aminocido que puede unirse a esa molcula de ARNt. d.- Otros tipos de ARN: En el ncleo celular pueden observar pequeas molculas de ARN que son precursoras de los tipos celulares. Muchos virus almacenan su informacin gentica en molculas de ARN, normalmente simples pero, en ocasiones, dobles.
ADN ARN Pentosa Desoxirribosa Ribosa Bases nitrogenadas No hay Uracilo No hay Timina Longitud de la cadena Generalmente ms largas Generalmente ms cortas Tipo de molcula Generalmente cadena doble con las bases nitrogenadas enfrentadas: A-T y C-G Generalmente cadena sencilla, aunque en algn tramo puede plegarse, enfrentndose las bases: A-U y C-G Localizacin en la clula En el ncleo celular (cromosomas); en mitocon- drias y cloroplastos. Ncleo: disperso en el jugo nuclear o concentrado en los nuclolos. En citoplasma disperso en el citosol o concentrado en los ribosomas. Estabilidad Ms estable, debido al arrollamiento de la molcula formando la doble hlice. Menos estable al no ser tan compacta por no existir doble hlice.
e.- El ADN: a.- Caractersticas generales: Est formado por la unin de desoxirribonucletidos, es decir, sus nucletidos contienen desoxirribosa (-D- 2- desoxirribofuranosa). Las bases nitrogenadas nunca son uracilos. Excepto en algunos virus, est constituido por dos cadenas polinucletidas unidas entre s en toda su longitud. Esta doble cadena se dispone en forma lineal (ADN del ncleo de las clulas eucariticas) o circular (ADN de las clulas procariotas, ciertos virus y de algunos orgnulos citoplasmticos de las clulas eucariticas). Se considera la molcula ms importante de un ser vivo, ya que constituye los genes o unidades de la herencia, y, por tanto, porta la informacin necesaria para el desarrollo de las caractersticas biolgicas de un individuo y contiene las instrucciones para que las clulas realicen sus funciones.
32 b.- Estructura del ADN: Fue determinada en 1953 por Watson y Crick, y presenta varios niveles de complejidad: a.- Estructura primaria: Est formada por la secuencia de desoxirribonucletidos, en cuyo extremo 5 de la cadena existe un fosfato libre y en el extremo 3 una pentosa con el OH del carbono 3 libre. La diferencia entre las molculas de ADN de los distintos organismo radica nicamente en el orden de las bases nitrogenadas unidas a las pentosas, que slo pueden ser Adenina, Timina, Guanina y Citosina. b.- Estructura secundaria: Se determin a partir de dos descubrimientos previos: Que siempre haba la misma cantidad de bases pricas que pirimidnicas y que el n de adeninas era siempre igual al de timinas, y el de guaninas al de citosinas. Mediante difraccin de rayos X se dedujo que la molcula posee una estructura helicoidal con dos periodicidades, una cada 0,34 nm y otra cada 3,4 nm. A partir de estos datos Watson y Crick elaboraron su modelo tridimensional del ADN, que presenta las siguientes caractersticas: El ADN est constituido por dos cadenas de po- linucletidos unidas entre s en toda su longitud. Las dos cadenas son antiparalelas, lo que significa que el extremo 3 de una de ellas se enfrenta con el 5 de la otra. La unin entre las cadenas se realiza por medio de puentes de hidrgeno entre las bases nitrogenadas de ambas. Concretamente, la adenina forma dos de estos puentes con la timina y la citosina tres con la guanina. Luego las cadenas no son idnticas, sino complemen- tarias. As, si se conoce la secuencia de bases de una, es posible deducir la complementaria. Las dos cadenas estn enrolladas en espiral formando una doble hlice alrededor de un eje imaginario. La doble hlice es dextrgira: el enrollamiento gira en el sentido de las agujas del reloj. El enrollamiento de la doble hlice es plectonmico, es decir, las cadenas no se pueden separar sin desenrollarlas. Las bases nitrogenadas quedan en el interior de la doble hlice, mientras que los esqueletos pentosa-fosfato se sitan en la parte externa. Los planos de las bases nitrogenadas enfrentadas son paralelos entre s y perpendiculares al eje de la hlice.
33 La anchura de la hlice es de 2 nm, la longitud de cada vuelta de 3,4 nm y cada 0,34 nm se encuentra un par de bases complementarias, por lo que existen 10 bases por vuelta. c.- Estructura terciaria: La doble hlice sufre nuevos plegamientos que dan lugar a un tercer nivel estructural. As las largas cadenas de ADN se acoplan al reducido espacio disponible en el interior celular. La actividad del ADN depende en gran medida del grado de plegamiento que posea su molcula. Como resultado final, el ADN aparece constituyendo la cromatina o los cromosomas del ncleo celular. d.- Desnaturalizacin, renaturalizacin e hibridacin del ADN: Cuando la doble hlice del ADN se somete a temperaturas elevadas, cambios de pH del medio o a altas concentraciones salinas, las dos cadenas se separan, al romperse los puentes de hidrgeno entre las bases nitrogenadas. Este proceso denominado desnaturalizacin es reversible, si el tratamiento aplicado no ha sido muy drstico. Si se mezclan molculas desnaturalizadas de ADN de diferente procedencia (diferentes cromosomas de una misma clula, o molculas de diferentes individuos o especies), al enfriar la solucin se pueden obtener molculas hbridas en las que cada cadena tiene distinta procedencia. Segn el grado de emparejamiento que exista entre las dos cadenas, se puede estudiar el parentesco entre los dos ADN (investigaciones policiales, estudios filogenticos, procesos biotecnolgicos...) f.- Biocatalizadores: Enzimas y Vitaminas: a.- Las Enzimas: a.- Caractersticas generales: Son catalizadores biolgicos que actan acelerando la velocidad de las reacciones qumicas y permitiendo que se produzcan en condiciones fisiolgicas (a temperatura, pH y presin propios del medio intracelular). Como caractersticas generales podemos indicar que las enzimas no alteran los equilibrios de la reaccin que regulan, simplemente hacen que suceda ms deprisa, no experimentan cambios estructurales al final del proceso qumico que catalizan, por lo que una misma molcula puede actuar miles de veces en un segundo, son eficaces a muy baja concentracin y son especficas, es decir, cada enzima slo reconoce, se une y modifica a sustratos determinados y para una sola de las posibles reacciones que ese sustrato puede sufrir (especificidad de sustrato y de accin). b.- Naturaleza qumica: Casi todas son protenas globulares. Muchas necesitan unirse a otras sustancias no proteicas, es decir, son heteroprotenas. La parte de la molcula que tiene naturaleza proteica se llama Apoenzima, y la no proteica Cofactor. El conjunto recibe el nombre de Holoenzima, y constituye la enzima funcional, con actividad cataltica.
Holoenzima = Apoenzima (protena) + Cofactor (no protena)
Elto. metlico Molcula orgnica (Coenzima)
El Cofactor puede ser un in metlico (Mg, Mn, Fe, Cu, Zn...), normalmente oligoelementos, o ser molculas orgnicas, en cuyo caso se denominan Coenzimas, y que ya hemos estudiado anteriormente. Los cofactores a veces pueden unirse fuertemente a la apoenzima por enlaces covalentes y permanecer ligados a ella, denominndose entonces grupo prosttico.
34 c.- Nomenclatura y clasificacin de las enzimas: Se conocen alrededor de 2.000 enzimas por lo que ha sido necesario idear un sistema reglado para nombrarlas (antes se le daban nombres propios: pepsina, tripsina...). Para nombrarlas se emplea un trmino que alude al sustrato y al tipo de reaccin catalizada al que se le aade el sufijo asa (lactato deshidrogenasa o piruvato descarboxilasa, p.e.). La nomenclatura recomendada por la Comisin Internacional de Enzimas consiste en un cdigo de 4 n que hacen referencia a la clase, subclase, subdivisin y enzima concreta de que se trata (se usa con menos frecuencia que la anterior). Actualmente existen 6 clases:
Clase Reacciones que catalizan Tipos Ejemplo I Oxidorreductasas Oxidacin-reduccin, mediante la transferencia de electrones Deshidrogenasas Oxidasas Alcohol deshidrogenasa II Transferasas Transferencia de grupos funcionales (fosfato, amino, metilo...) entre molculas Transaminasas Transcarboxilasas Transmetilasas Aspartato piruvato tran- saminasa III Hidrolasas Hidrlisis. Rotura de enlaces por introduccin de una molcula de agua Carbohidrasas Esterasas Peptidasas Nucleasas Carboxipeptidasa Lipasa IV Liasas Rotura de enlaces no hidroltica, liberndose grupos qumicos Aminasas Hidratasa Piruvato descarboxilasa Fumarato hidratasa V Isomerasas Transformacin de un ismero en otro Triosa-fosfato isomerasa VI Ligasas o sintetasas Unin de molculas o de un grupo funcional a una molcula, utilizando la Eg proporcionada por el ATP Piruvato carboxilasa Acetil-CoA carboxilasa
d.- Mecanismo de la accin enzimtica: Para que ocurra cualquier reaccin qumica (exotrmica o endotrmica), las molculas que participan deben recibir una cierta cantidad de energa, a la que se le denomina energa de activacin, que facilita el que se rompan enlaces qumicos y se puedan formar otros nuevos. Las enzimas facilitan las reacciones al hacer disminuir su energa de activacin. La reaccin catalizada se produce en tres etapas: En primer lugar el sustrato se une reversiblemente al enzima, formando el complejo enzima-sustrato (ES). Esta unin es muy especfica, debido a que la enzima presenta una zona, denominada centro activo, con una forma espacial caracterstica en la que se acopla el sustrato. Su geometra y carga estn relacionadas con la conformacin del sustrato y con el tipo de reaccin, de manera que son responsables de la especificidad de la enzima. Est constituido por unos 10 aminocidos, que pueden estar alejados en la cadena peptdica, aunque el plegamiento los acerca. Dichos aminocidos cumplen dos funciones: Unos son de fijacin, y son necesarios para que la enzima se una al
35 sustrato. Otros son los catalizadores, necesarios para realizar la actividad cataltica, es decir, modifican al sustrato y lo transforman en producto. Por ltimo, existen aminocidos responsables del mantenimiento de la estructura del centro activo. Para explicar el acoplamiento entre enzima y sustrato, Fischer recurri a la teora de la llave-cerradura: los salientes y entrantes del centro activo y del sustrato encajaran exactamente. Posteriormente, Koshland, propuso la teora de ajuste o acoplamiento inducido, ya que el centro activo sufre ligeros cambios para adaptarse al sustrato mientras dura el complejo ES (como una mano y un guante). Una vez formado el complejo, los sustratos sufren la reaccin que los transforma en productos (P). Esta reaccin es rpida e irreversible. El producto posee menor afinidad por la enzima. Se disocia el complejo y la enzima queda libre. e.- Cintica enzimtica: La cintica enzimtica estudia las variaciones de la velocidad de las reacciones enzimticas. Dicha velocidad se define como la cantidad de materia transformada por unidad de tiempo. Si representamos grficamente la velocidad de una reaccin enzimtica respecto a la concentracin de sustrato [S], se observa que al principio aumenta de manera lineal al incrementarse [S], pero llega un momento en que ya no aumenta ms por mucho que aumente [S]. Esto fue explicado por Michaelis-Menten suponiendo que llega un momento en que la [S] es tal, que toda la enzima disponible se encuentra en forma de complejo ES, por lo que la velocidad es mxima. Uno de los valores que ms se utilizan para caracterizar a las enzimas es la denominada constante de Michaelis (K m ), que se define como la concentracin del sustrato a la que la velocidad de reaccin es la mitad de la velocidad mxima, ya que indica la afinidad que presenta la enzima por el sustrato: mientras mayor sea K m , mayor es la [S] necesaria para conseguir la velocidad semimxima y, por tanto, la afinidad enzima-sustrato es menor.
36 Adems de la [S], existen otros factores que modifican la velocidad de la reaccin, como son : Concentracin de la enzima: Siempre que exista un exceso de sustrato, la actividad enzimtica es directamente proporcional a la concentracin de la enzima. Temperatura: La elevacin de la T produce en una aceleracin de las reacciones qumicas. Pero a T elevadas las enzimas se desnaturalizan y dejan de ser activas. De ah que la T ptima de cada enzima resulte de la conjugacin de ambos factores. pH: La accin enzimtica transcurre entre dos valores lmites de pH, fuera de los cuales la actividad es nula, Existiendo un pH ptimo, en que la actividad es mxima, que suele ser bastante prximo al fisiolgico (neutro o dbilmente cido), aunque existen excepciones.
Inhibidores: Se denomina as a cualquier sustancia capaz de disminuir o anular la velocidad de una reaccin enzimtica. Aparte del sustrato y del producto, los inhibidores pueden ser de dos tipos: - Irreversibles: Se unen covalentemente con la enzima y la inactivan o destruyen (sustancias txicas o frmacos). - Reversibles: Se unen dbilmente, y, con condiciones adecuadas, pueden separarse de la enzima. Dentro de ellos tenemos a su vez dos tipos, segn su manera de actuar: . Inhibicin competitiva: El inhibidor compite con el sustrato por unirse al centro activo de la enzima, debido a que existe una gran semejanza estructural entre el sustrato y el inhibidor. La enzima puede unirse al sustrato (formando el complejo ES) o al inhibidor (EI), pero no a ambos. Lo ms caracterstico de esta inhibicin es que se puede neutralizar si se aade una concentracin de sustrato suficiente para desplazar al inhibidor. . Inhibicin no competitiva: El inhibidor se une a la enzima en un sitio diferente al centro activo, alterando la conformacin de la molcula enzimtica, de manera que el centro activo queda modificado. En este caso se forma un complejo ESI que se convierte en producto con menor velocidad que el complejo ES. En este caso la inhibicin depende solamente de la concentracin del inhibidor, sin que importe la del sustrato, pues aunque aumente no se llega a alcanzar la velocidad mxima.
UNIDAD DIDCTICA I: COMPOSICIN QUMICA DE LOS SERES VIVOS
1.- INTRODUCCIN 2.- LA COMPOSICIN ELEMENTAL DE LA MATERIA VIVA: BIOELEMENTOS A.- Bioelementos primarios B.- Bioelementos secundarios C.- Oligoelementos: 3.- LAS MOLCULAS BIOLGICAS A.- Introduccin B.- Biomolculas inorgnicas a.- Agua: a.- Abundancia b.- Papel en el origen y evolucin de los seres vivos c.- Estructura qumica d.- Disociacin inica e.- Funciones biolgicas b.- Sales minerales: a Introduccin b.- Funciones biolgicas a.- Sales precipitadas b.- Sales disueltas: a.- Regulacin de los fenmenos osmticos b.- Regulacin del pH C.- Biomolculas Orgnicas a.- Introduccin: a.- Algunos grupos funcionales biolgicamente importantes b.- Isomera b.- Glcidos: a.- Concepto b.- Clasificacin de los glcidos a.- Monosacridos: a.- Concepto b.- Estructura de los monosacridos c.- Nomenclatura de pentosas y exosas d.- Principales monosacridos b.- sidos a.- Holsidos: - Enlace O-glucosdico: - Oligosacridos: * Disacridos * Otros Oligosacridos - Polisacridos: * Homopolisacridos * Heteropolisacrido c.- Hetersidos c.- Mtodos de identificacin de glcidos d.- Sntesis de las funciones biolgicas de los glcidos c.- Lpidos: a.- Concepto b.- Clasificacin de los lpidos a.- cidos grasos b.- Lpidos saponificables: a.- Concepto b.- Tipos: - Triacilglicridos - Ceras - Fosfoglicridos - Esfingolpidos: * Esfingomielinas * Glucoesfingolpidos c.- Lpidos insaponificables: a.- Concepto b.- Tipos: - Terpenos - Esteroides - Prostaglandinas c.- Mtodos de identificacin de lpidos d.- Sntesis de las funciones biolgicas de los lpidos
d.- Protenas a.- Los aminocidos a.- Concepto b.- Propiedades de los aminocidos: a.- Carcter anftero b.- Estereoisomera c.- Clasificacin de los aminocidos b.- El enlace peptdico c.- Estructura de las protenas a.- Estructura Primaria b.- Estructura Secundaria: - La Hlice - Lmina plegada o plegada c.- Estructura Terciaria d.- Estructura Cuaternaria d.- Propiedades de las protenas: a.- Especificidad b.- Desnaturalizacin c.- Solubilidad e.- Clasificacin de las protenas a.- Clasificacin estructural: a.- Holoprotenas b.- Heteroprotenas f.- Funciones de las protenas a.- Protenas estructurales b.- Protenas de reserva c.- Protenas activas g.- Mtodos de identificacin de las protenas e.- cidos nucleicos a.- Nuclesidos b.- Nucletidos a.- Nucletidos de inters biolgico: a.- Molculas acumuladoras y donantes de energa:ATP b.- Coenzimas: - NAD, NADP y FAD - Coenzima A c.- AMP cclico (AMPc) c.- El enlace nucleotdico. Polinucletidos d.- El ARN a.- Caractersticas generales b.- Tipos de ARN: a.- ARN mensajero b.- ARN ribosmico c.- ARN transferente d.- Otros tipos de ARN e.- El ADN a.- Caractersticas generales b.- Estructura del ADN: a.- Estructura primaria b.- Estructura secundaria c.- Estructura terciaria d.- Desnaturalizacin, renaturalizacin e hibridacin del ADN f.- Biocatalizadores: Enzimas y Vitaminas a.- Las Enzimas a.- Caractersticas generales b.- Naturaleza qumica c.- Nomenclatura y clasificacin de las enzimas d.- Mecanismo de la accin enzimtica e.- Cintica enzimtica f.- Regulacin celular de la actividad enzimtica: a.- Enzimas alostricas b.- Otros mecanismos de regulacin b.- Vitaminas a.- Caractersticas generales b.- Clasificacin: a.- Liposolubles b.- Hidrosolubles