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Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation relative la


conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires

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Luxembourg: Office des publications de lUnion europenne, 2011

ISBN 978-92-79-19374-3
doi: 10.2779/44451

Union europenne, 2011
Reproduction autorise, moyennant mention de la source












Ce document reflte le point de vue de la Commission et nest pas de nature contraignante.

Commission europenne, janvier 2011
Reproduction autorise avec mention de la source



Photo: istockphoto

Les prsentes orientations sont essentiellement fondes sur les discussions menes dans le
cadre du groupe de travail de la CE sur les estuaires et les ports avec les experts des tats
membres et les principaux groupes de parties prenantes, ainsi que sur les informations
rcoltes lors de ces changes.


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Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation de l'UE relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires

ORIENTATIONS RELATIVES LA MISE EN UVRE DES
DIRECTIVES OISEAUX ET HABITATS DANS LES ESTUAIRES ET LES
ZONES CTIRES
Notamment dans le cadre du dveloppement portuaire et des activits de dragage











janvier 2011






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Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
SOMMAIRE

Rsum ...............................................................................................................5

1 CONTEXTE POLITIQUE .................................................................................10

1.1 Estuaires, zones ctires et lgislation de lUE relative la conservation de la nature
................................................................................................................................ 10
1.2 La politique maritime intgre et la politique portuaire europenne...................... 13


2 SOURCES DINQUITUDE.............................................................................15

2.1 Pressions sur les estuaires et les zones ctires.................................................. 15
2.2 Principales inquitudes du secteur portuaire concernant la mise en uvre des .
directives Oiseaux et Habitats ........................................................................ 17
2.3 Changement climatique: une source dinquitude particulire pour les estuaires et
les zones ctires................................................................................................... 20


3 ORIENTATIONS..............................................................................................20

3.1 Objectifs de conservation dans les environnements dynamiques ........................ 20
3.1.1 Comprendre et grer les estuaires et les zones ctires, des cosystmes
dynamiques complexes............................................................................... 20
3.1.2 Protection des habitats et espces dintrt communautaire ..................... 22
3.1.3 Fixer les objectifs de conservation pour les habitats des estuaires et des zones
ctires........................................................................................................ 24

3.2 Planification intgre............................................................................................. 26
3.2.1 Plans de gestion.......................................................................................... 26
3.2.2 Planification spatiale.................................................................................... 27
3.2.3 Les avantages des partenariats et de la participation du public.................. 30

3.3 Dveloppement de projets et activits de maintenance........................................ 31
3.3.1 Projets intgrs et uvrer avec la nature ................................................... 31
3.3.2 Comment grer lvaluation approprie et les incidences notables quun
projet est susceptible davoir sur lenvironnement?................................... 32
3.3.3 Relation entre ESIE, EIE et valuations appropries................................... 33
3.3.4 Les systmes de compensation et leur suivi ............................................... 35
3.3.5 Gestion des activits de dragage et de maintenance.................................. 36

3.4 Faire face aux incertitudes: la gestion adaptative ................................................. 39


ANNEXES.............................................................................................................41

GLOSSAIRE.........................................................................................................49



5
Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation de l'UE relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
RSUM

Le prsent document fournit des orientations sectorielles spcifiques relatives la mise en
uvre des directives Oiseaux et Habitats dans les estuaires et les zones ctires. Ces
orientations sont le fruit des discussions qui se sont tenues dans le cadre dun groupe de
travail spcifique compos de reprsentants des tats membres, dorganisations intresses
et dONG de dfense de l'environnement.

Leur laboration rpond une demande du secteur portuaire et maritime. Les ports, en
particulier en Europe de lOuest, sont souvent situs au sein ou proximit destuaires. Ces
derniers sont des cosystmes dynamiques extrmement productifs, et nombre dentre eux
font partie du rseau Natura 2000. Les estuaires fournissent les abris ncessaires et offrent
des conditions favorables pour accder aux ports depuis la mer.

Les ports jouent quant eux un rle stratgique dans le dveloppement et le droulement
des changes au niveau mondial, et doivent rgulirement s'tendre. Si les exigences
environnementales dans ce secteur taient autrefois peu nombreuses, lapplication et
linterprtation de la lgislation relative lenvironnement, et notamment des directives
Nature de lUE, reprsentent aujourdhui de nouveaux dfis pour cette industrie, lesquels
ont parfois, au cours des dernires annes, entran des retards dans les projets de
dveloppement portuaire.

Les ports contribuent de manire essentielle au dveloppement conomique; la scurit
juridique est pour eux une condition pralable tout nouveau projet de dveloppement. La
politique portuaire europenne, telle que formule par la Commission europenne,
recommande le rexamen de certaines contraintes juridiques pouvant constituer des
obstacles pour les projets de dveloppement (procdure acclre). Le prsent document
dorientation comporte donc une srie de recommandations et dlments de bonnes
pratiques en vue damliorer le dveloppement et la gestion portuaires au sein ou
proximit des sites Natura 2000.

Parmi les principales recommandations figurent les points suivants:
llaboration de plans ou projets doit toujours se fonder sur des stratgies mutuellement
bnfiques de manire atteindre la fois les objectifs de conservation du rseau
Natura 2000 et les objectifs de dveloppement socio-conomique, conformment au
concept consistant travailler en tenant compte de la nature;
les mesures de prvention ou dvitement des dommages doivent toujours tre prfres
aux mesures de compensation;
il convient de toujours prvoir une valuation prliminaire des incidences potentielles dun
plan ou projet sur les sites Natura 2000, de sorte pouvoir dterminer s'il est susceptible
d'avoir des incidences significatives sur le site Natura 2000 concern et si une
valuation approprie au sens de larticle 6, paragraphe 3, de la directive Habitats
est requise;
il est recommand de toujours procder en temps voulu une consultation dtaille des
parties prenantes afin dviter toute objection durant la procdure dautorisation du projet;
La maintenance des ports et des voies d'accs empruntes par les navires doit tre
effectue dans le cadre de plans de gestion intgrs tenant compte de lensemble des
voies navigables ou du site Natura 2000 concern. Les travaux neufs de dragage doivent
tre conus de manire faire partie intgrante de programmes de gestion durable des
activits de dragage et des sdiments.

6
Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
Dans le cas o des incertitudes scientifiques mineures subsistent eu gard aux
incidences dun plan ou projet ou aux mesures compensatoires ou dattnuation qui sy
rapportent, les mesures doivent prvoir un systme prtabli et valid de suivi des effets
rels ainsi qu'un cadre permettant dadapter les mesures compensatoires et dattnuation
en fonction des incidences constates.



Introduction

Les estuaires et les zones ctires comptent parmi les cosystmes les plus productifs au
monde et prsentent un grand intrt, tant sur le plan cologique quconomique. Ils revtent
une importance primordiale pour la faune et la flore sauvages, notamment pour les oiseaux
migrateurs et nicheurs, et la richesse de leurs ressources naturelles en fait des zones de
grande valeur (ils peuvent par exemple constituer des zones de reproduction pour des
espces de poissons ayant une valeur commerciale importante). Ils offrent en outre un large
ventail de services cosystmiques importants, tels que la stabilisation des ctes, la
rgulation des nutriments, la squestration du carbone, la dtoxification des eaux pollues et
la fourniture de ressources nergtiques (valuation des cosystmes pour le Millnaire,
2005).

Les estuaires et les zones ctires apportent donc une multitude davantages conomiques
de nombreux secteurs, dont la pche, les complexes industriels et les services dagrment
tels que le tourisme et les loisirs. En outre, les estuaires constituent gnralement des
emplacements idaux pour la cration de ports, bassins et chantiers navals car ils
permettent aux navires de s'abriter tout en leur ouvrant un accs vers l'intrieur des terres
par les fleuves.

Par ailleurs, les estuaires et les zones ctires font galement partie des cosystmes les
plus dynamiques et les plus complexes au monde car ils sont constitus dhabitats divers et
varis au sein dune structure en mosaque en perptuelle volution. Parmi les habitats
typiques qui composent les estuaires figurent les bancs de sable, les replats boueux et
sableux, les marais sals ainsi que, le long de leurs ctes, les dunes de sable, les lagunes
ctires, les criques et baies peu profondes, les rcifs et les petites les, plages de sable et
falaises maritimes.

La plupart de ces habitats sont protgs au titre de la directive 92/43/CEE concernant la
conservation des habitats naturels ainsi que de la faune et de la flore sauvages (dite
directive Habitats). Les oiseaux de rivage, par exemple, dpendent des estuaires et des
zones ctires durant leurs priodes de migration entre leur lieu de reproduction et leur zone
dhivernage. Par ailleurs, de nombreuses espces doiseaux se reproduisent dans les
habitats des estuaires et des ctes. Par consquent, de nombreux estuaires et zones
ctires sont galement protgs au titre de la directive 2009/147/CE concernant la
conservation des oiseaux sauvages (dite directive Oiseaux).

Aujourdhui encore plus quhier, de nombreux ports europens servent de plateformes
logistiques pour la gestion du fret en provenance du monde entier. Limportance du transport
maritime et la demande en la matire ont considrablement augment au cours des
30 dernires annes, une croissance susceptible de se poursuivre lavenir. La Commission
europenne soutient donc ce rseau de transport au moyen de sa politique portuaire ainsi
quen encourageant les autoroutes de la mer et le transport maritime courte distance.


7
Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation de l'UE relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
Comme le prcise la communication sur une politique portuaire europenne
1
, les quelque
100 000 km de ctes europennes comptent plus de 1 200 ports de commerce. Ces ports
constituent des points cls de transfert modal et jouent un rle vital dans le traitement de
90 % du commerce international de l'Europe. En outre, justifiant la politique gnrale des
transports de lUE
2
, ils assurent 40 %, en tonnes-kilomtres, du commerce
intracommunautaire. La Commission europenne reconnat par ailleurs leur importance dans
sa Communication intitule Une politique maritime intgre pour lUnion europenne,
laquelle indique que les ports maritimes et le secteur du transport maritime permettent
l'Europe de tirer parti de la croissance rapide du commerce international et de jouer un rle
prpondrant dans l'conomie mondiale
3
.

Enfin, les ports maritimes, et notamment ceux qui sont relis aux voies navigables et aux
chemins de fer ou qui sont situs lintrieur des terres dans des estuairesrelis ces voies
de communication, peuvent galement contribuer de manire apprciable la rduction des
missions de CO
2
, mme sils devront eux aussi faire face aux effets du changement
climatique.

Il arrivera invitablement que les activits de dveloppement et de maintenance des ports et
des voies navigables empitent sur des sites appartenant au rseau Natura 2000, sans quil
soit parfois possible de concilier ces deux objectifs. Les directives Habitats et Oiseaux
nexcluent pas a priori les possibilits de dveloppement et dutilisation des estuaires et des
zones ctires au sein ou proximit des sites Natura 2000. Elles tablissent au contraire
des procdures par tapes visant garantir la compatibilit entre ces dveloppements et la
protection des espces et des habitats dintrt communautaire pour lesquels les sites ont
t dsigns. Dans le cas de projets dintrt public majeur, et en labsence de solutions de
substitution, la directive prvoit en outre la possibilit dautoriser des dveloppements portant
atteinte lintgrit dun site, condition que des mesures compensatoires et dadaptation
soient adoptes afin de garantir que la la cohrence globale de Natura 2000 ne sera pas
compromise.

Par ailleurs, les pressions exerces sur les zones ctires et les estuaires poussent mettre
en uvre des stratgies damnagement du territoire plus efficientes et davantage intgres.
Cette nouvelle approche, associe un dialogue prcoce avec les parties prenantes, sest
rvle tre au fil des annes un moyen efficace de promouvoir un dveloppement durable
en adquation avec la lgislation environnementale de lUE (relative notamment la
protection de la nature, leau et lenvironnement marin), sa politique portuaire et sa
politique maritime intgre.



Objectif du prsent document

La Commission europenne a dj publi plusieurs documents dorientation en vue d'aider
les tats membres mettre en uvre les directives Oiseaux et Habitats dans le
contexte de la protection du rseau Natura 2000 (voir annexe 1). Ces orientations ont
galement pour vocation daider les citoyens et les parties prenantes mieux comprendre
les dispositions cls desdites directives.

1
COM(2007) 616
2
COM(2006) 314.
3
(CE, 2007)

8
Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
Cependant, certaines clarifications, explications et perspectives davenir demeurent
ncessaires concernant lapplication de la rglementation de lUE relative la conservation
de la nature aux dveloppements portuaires et la gestion des estuaires et des zones
ctires, notamment compte tenu de leur importance en tant que voies daccs pour les
navires de mer.

Lobjectif du prsent document d'orientation est donc dexpliquer le rgime de protection,
dfini larticle 6 de la directive Habitats, sappliquant aux sites Natura 2000 dans le cadre
des estuaires et des zones ctires. Il sattache avant tout clarifier et expliquer la mise en
uvre de la lgislation de lUE relative la conservation de la nature dans les sites
Natura 2000 situs dans ou comprenant des estuaires, des chenaux navigables et des
zones ctires, en accordant une attention particulire aux activits portuaires et notamment
au dragage et lindustrie (chantiers navals par exemple).

Les autres rglementations environnementales telles que la directive-cadre sur leau
(200/60/CE), la directive-cadre dfinissant une stratgie pour le milieu marin (2008/56), la
directive 2001/42/CE relative l'valuation stratgique des incidences sur l'environnement
(dite directive ESIE) ou la directive 85/337/CEE concernant l'valuation des incidences sur
lenvironnement dpassent le champ dapplication des prsentes orientations et ne sont
donc pas abordes en dtail. En outre, les aspects relatifs lurbanisation, lagriculture ou
dautres dveloppements dans des secteurs similaires ou associs des pressions
rsultant du transport par navigation intrieure ne sont pas traits dans ce guide, bien que
ces activits doivent tre galement prises en compte dans le cadre des plans de gestion
concernant les sites estuariens Natura 2000, de la gestion intgre des zones ctires ainsi
que de lvaluation des effets cumulatifs des diffrentes activits.

Les prsentes orientations sont le fruit de discussions menes au sein dun groupe de travail
spcifique sur les estuaires, les zones ctires et les ports, mis en place par la Commission
europenne (DG ENV et DG TREN). Ce groupe comprenait des parties prenantes de
diffrents secteurs et sest runi six reprises au cours de la priode 2007-2009. Outre ces
orientations, un document dassistance technique comportant des informations techniques et
scientifiques de rfrence a t labor.

Ce document dassistance technique comporte des informations caractre gnral sur
lapproche adopte au cours de ltude, la littrature utilise ainsi que sur les rsultats de
lchange dinformations entre le groupe de travail et le bureau dtudes charg de la
coordination gnrale du projet. Le document dassistance technique peut tre tlcharg
depuis la plateforme publique Circa: http://circa.europa.eu/Public/irc/env/estuary/home.

Les prsentes orientations refltent fidlement les dispositions des directives concernes
mais aussi les grands principes soutenant la politique de lUE en matire denvironnement et
dactivits portuaires. De nature non lgislative, elles ntablissent aucune nouvelle
rglementation; mais visent apporter des clarifications supplmentaires fondes sur les
lignes directrices dj existantes. Elles exposent le point de vue des services de la
Commission eu gard la mise en uvre des directives Habitats et Oiseaux dans les
estuaires et les zones ctires.

Les prsentes orientations ne sont pas juridiquement contraignantes. Il appartient en effet
la Cour de justice de lUnion europenne de procder linterprtation dfinitive des
directives. Ces orientations visent donc respecter la jurisprudence existante et devront, le
cas chant, tre adaptes la lumire des nouvelles dcisions prises par la Cour et faisant
jurisprudence.


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Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation de l'UE relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
Enfin, les prsentes orientations ont pour ambition de concilier les besoins en matire de
dveloppement portuaire et les impratifs de protection de lenvironnement. Les lecteurs et
utilisateurs viss par ce document sont les autorits comptentes locales, rgionales,
nationales ou encore fdrales, les autorits portuaires et en charge des voies navigables,
les exploitants, les industries, les entreprises et associations de dragage, le secteur des
services maritimes, les ONG de dfense de l'environnement, les agences de protection de la
nature ainsi que les gestionnaires des sites Natura 2000.

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Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
1. CONTEXTE POLITIQUE



1.1. Estuaires, zones ctires et lgislation de lUE relative la conservation de la
nature

Face au rapide dclin de la biodiversit dans le monde, lUnion europenne sest fix
lobjectif, lors du sommet europen de Gteborg en 2001, denrayer la perte de biodiversit
dans lUE dici 2010
4
ainsi que de restaurer les habitats et les systmes naturels
5
. Cet
engagement est fermement ancr dans tous les aspects de la politique de lUE. Le sixime
programme daction pour lenvironnement (6
e
PAE)
6
qui dfinit le cadre de la politique
environnementale europenne pour la priode 2002-2012, a fait de la nature et
biodiversit lun de ses quatre domaines daction prioritaires. Conformment au trait, ce
programme prne galement la pleine intgration des impratifs de protection de
l'environnement dans lensemble des actions et politiques de lUE, et notamment de ceux
ayant trait la conservation de la biodiversit.

Les directives Habitats et Oiseaux sont les pierres angulaires de la politique de lUE en
matire de biodiversit. Elles permettent aux tats membres de lUE de travailler
conjointement au sein dun cadre lgislatif commun solide, afin de protger certains des
habitats et espces les plus prcieux dans lensemble de leurs aires de rpartition naturelles
au sein de lUE, indpendamment des frontires administratives ou politiques.

Ces deux directives requirent que les tats membres dsignent des sites terrestres et
marins spcifiques, qui forment ensemble le rseau Natura 2000. Ce rseau est compos de
zones de protection spciale (ZPS) protgeant certaines espces doiseaux et de zones
spciales de conservation (ZSC) protgeant les habitats et les autres espces dintrt pour
lUE. Lobjectif du rseau Natura 2000 est de garantir la survie long terme des espces et
habitats les plus menacs en Europe. Dautres dispositions des directives prvoient un
systme strict de protection des espces ainsi que des programmes de suivi et de
notification.

Larticle 6 de la directive Habitats joue un rle crucial dans le cadre de la gestion et de
lutilisation durable des sites qui constituent le rseau Natura 2000. Dans un esprit
dintgration, il prvoit une srie de garanties procdurales visant faire en sorte que
dveloppement conomique et conservation de la nature aillent de pair. Il incombe aux tats
membres de transposer les directives en droit national et dinstaurer des mcanismes
appropris permettant la mise en uvre concrte de leurs dispositions.

Larticle 6 de la directive Habitats inclut trois types de mesures:

1. des mesures de conservation positives pour les zones spciales de conservation
(ZSC), conformment larticle 6, paragraphe 1, notamment des plans de gestion et
des mesures rglementaires, administratives ou contractuelles
7
;


4
Conclusions de la prsidence, Conseil europen de Gteborg des 15 et 16 juin 2001.
5
COM(2001) 264 final
6
Dcision n 1600/2002/CE, JO L 242, 10.9.2002, p. 1
7
Pour les ZPS, les obligations prvues l'article 4, paragraphes 1 et 2, de la directive Oiseaux sappliquent, lesquelles sont
galement considres comme des mesures positives.

11
Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation de l'UE relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
2. des mesures prventives pour tous les sites, conformment aux dispositions de
larticle 6, paragraphe 2 afin dviter des dtriorations sur les habitats naturels (ainsi
que des perturbations significatives touchant les espces) et conformment au
paragraphe 3 pour valuer les incidences des nouveaux plans et projets;

3. des garanties procdurales, comprenant un systme de drogation et des mesures
compensatoires en vertu de larticle 6, paragraphe 4, lqui permettent d'autoriser des
plans et projets susceptibles davoir des effets nfastes sur un site Natura 2000.


Les habitats ctiers et estuariens protgs au titre de la directive Habitats couvrent une
surface totale de plus de 45 000 km sur le territoire de lUE (voir tableau 1, partie marine et
intertidale, hors systmes de dune et autres zones humides deau douce associes).

Ces habitats protgs fournissent galement des zones de repos pour les oiseaux et les
phoques, de reproduction pour les poissons et dalimentation pour les mammifres, et
abritent des vgtaux spcifiques. En outre, les cosystmes estuariens et ctiers peuvent
comprendre dautres habitats protgs dintrt communautaire, tels que les dunes grises
(code directive Habitats 2130).
Article 6 de la directive Habitats 92/43/CEE
1. Pour les zones spciales de conservation, les tats membres tablissent les mesures de conservation ncessaires
impliquant, le cas chant, des plans de gestion appropris spcifiques aux sites ou intgrs dans d'autres plans
d'amnagement et les mesures rglementaires, administratives ou contractuelles appropries, qui rpondent aux
exigences cologiques des types d'habitats naturels de l'annexe I et des espces de l'annexe II prsents sur les sites.
2. Les tats membres prennent les mesures appropries pour viter, dans les zones spciales de conservation, la
dtrioration des habitats naturels et des habitats d'espces ainsi que les perturbations touchant les espces pour
lesquelles les zones ont t dsignes, pour autant que ces perturbations soient susceptibles d'avoir un effet significatif
eu gard aux objectifs de la prsente directive.
3. Tout plan ou projet non directement li ou ncessaire la gestion du site mais susceptible d'affecter ce site de
manire significative, individuellement ou en conjugaison avec d'autres plans et projets, fait l'objet d'une valuation
approprie de ses incidences sur le site eu gard aux objectifs de conservation de ce site les autorits nationales
comptentes ne marquent leur accord sur ce plan ou projet qu'aprs s'tre assures qu'il ne portera pas atteinte
l'intgrit du site concern...
4. Si, en dpit de conclusions ngatives de l'valuation des incidences sur le site et en l'absence de solutions
alternatives, un plan ou projet doit nanmoins tre ralis pour des raisons impratives d'intrt public majeur, y
compris de nature sociale ou conomique, l'tat membre prend toute mesure compensatoire ncessaire pour assurer
que la cohrence globale de Natura 2000 est protge lorsque le site concern est un site abritant un type d'habitat
naturel et/ou une espce prioritaires, seules peuvent tre voques des considrations lies la sant de l'homme et
la scurit publique.

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Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires

Tableau 1: superficie des habitats ctiers et estuariens protgs au titre de la lgislation
de lUE relative la conservation de la nature (selon la base de donnes Natura 2000
datant de novembre 2009)


Habitats ctiers et estuariens Natura 2000 pertinents dans
le cadre des prsentes orientations
Surface totale au sein du
territoire de lUE-27 (2009)
Estuaires - code directive Habitats: 1130 (306 sites) 643 704,44 ha
Lagunes ctires* - code directive Habitats: 1150 (644 sites) 503 263,71 ha
Grandes criques et baies peu profondes
- code directive Habitats: 1160 (373 sites)
1 250 743,52 ha
Bancs de sable faible couverture permanente deau marine -
code directive Habitats: 1110 (517 sites)
2 436 613,35 ha
Replats boueux ou sableux exonds mare basse
- code directive Habitats: 1140 (422 sites)
809 204,53 ha
Total 5 643 529,55 ha

Les directives europennes ci-dessous relatives aux valuations des incidences sur
l'environnement portent galement sur les plans et projets de dveloppement dans les
estuaires et les zones ctires (voir le chapitre 3.3.3):

- la directive 2001/42/CE relative l'valuation des incidences de certains plans et
programmes sur l'environnement (dite directive ESIE)
8
. Lobjectif de cette directive est
de garantir que les rpercussions de certains plans et programmes sur lenvironnement
sont recenses, values et prises en compte lors d'laboration de ces plans et
programmes et avant leur adoption;
- la directive 85/337/CEE concernant l'valuation des incidences de certains projets
publics et privs sur l'environnement, telle que modifie en 1997 (97/11/CE), 2003
(2003/35/CE) et 2009 (2009/31/CE) (dite directive EIE
9
). Tandis que le processus
dESIE concerne les plans et programmes relevant du secteur public, lvaluation des
incidences sur lenvironnement (EIE) est destine aux projets individuels de nature
publique et prive.

Les estuaires et les masses d'eaux ctires prsenten galement un intrt communautaire
au titre de la directive-cadre sur leau 2000/60/CE (DCE). La DCE tablit un cadre pour la
protection de lensemble des eaux de surface (fleuves, lacs, eaux de transition et ctires) et
des eaux souterraines dans le but datteindre un bon tat cologique (ou un bon potentiel
cologique pour les masses deau fortement modifies) ainsi quun bon tat chimique
dici 2015.

Les estuaires et les eaux ctires sont rpertoris comme eaux de transition ou ctires.
Conformment aux dispositions de la DCE, leur dtrioration doit donc tre vite et ltat de
leurs cosystmes aquatiques protg et amlior. Les chevauchements gographiques
entre les sites Natura 2000 et les masses deau recenses par la DCE dans les estuaires et
les cosystmes ctiers sont frquents. Bien que la DCE et les directives Nature aient
pour vocation de protger les cosystmes, leurs objectifs, mesures et outils ne sont pas
totalement complmentaires. Une attention particulire doit donc tre apporte aux
synergies existant le cas chant entre ces directives.

8
JO L 197, 21.7.2001, p. 3037 voir http://ec.europa.eu/environment/eia/home.htm (en anglais).
9
JO L 156, 25.6.2003, p. 17, JO L 140, 5.6.2009, p. 114 voir http://ec.europa.eu/environment/eia/home.htm (en anglais).

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Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation de l'UE relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires

Conformment la directive-cadre sur leau, une stratgie de mise en uvre commune a
t labore afin de relever les enjeux de manire cooprative et coordonne. Un ensemble
de documents dorientation a en outre t rdig (voir annexe 1). Il est important de garder
lesprit quen vertu de l'article 4, paragraphe 2, de la DCE, si les objectifs de conservation de
la directive Habitats sont plus stricts que les obligations dcoulant de la DCE, ce sont
alors eux qui sappliquent, et inversement. Pour des informations et orientations dtailles
sur la mise en uvre de la DCE, consulter le site Internet suivant:
http://ec.europa.eu/environment/water/water-framework/index_en.html (en anglais).

La directive-cadre stratgie pour le milieu marin (DCSMM, 2008/56/CE) fournit une
vision plus complte et aborde galement les services cosystmiques dans les zones
marines. Elle tablit un cadre pour la protection et la restauration des cosystmes marins.
En vertu de cette directive, les tats membres doivent prendre les mesures ncessaires pour
atteindre ou maintenir un bon tat cologique du milieu marin dici 2020. Si le champ
dapplication gographique de la DCSMM chevauche celui de la DCE en ce qui concerne les
eaux ctires, ltat cologique de la DCSMM sapplique dans le cadre de la DCE
uniquement dans la mesure o les aspects particuliers de ltat cologique de
lenvironnement marin ne sont pas dj couverts par cette dernire (tels que les dtritus, le
bruit et les ctacs par exemple). Toutefois, la DCSMM ne sapplique pas aux eaux de
transition telles que les estuaires.
Les deux directives plus rcentes compltent les directives Nature en mettant davantage
laccent sur le rle des cosystmes. Comme susmentionn, les estuaires sont des
cosystmes aux caractristiques trs dynamiques: ils sont sujets des changements
journaliers et saisonniers ainsi qu une volution hydromorphologique. Leurs paramtres de
biodiversit et espces caractristiques volueront donc galement avec le temps. Bien que
la conservation de la biodiversit soit ici au cur de toutes les proccupations, il nest pas
difficile dimaginer que s'il est normal que certains habitats changent la suite d'une
volution morphologique, certains autres risquent de disparatre ou dtre modifis de
manire notable. Il est donc important de prendre conscience de la nature dynamique de cet
environnement, en particulier dans le cas des estuaires.


1.2. La politique maritime intgre et la politique portuaire europenne

Limportance conomique des ctes europenne a t souligne par la Communication de la
Commission sur une politique maritime intgre pour l'Union europenne
10
. Les rgions
maritimes de l'Union europenne contribuent hauteur de 40 % environ de son PIB et
reprsentent galement prs de 40 % de sa population. Les chantiers navals et le transport
maritime, les ports et la pche restent des activits maritimes cls, mais la production
d'nergie en mer ainsi que le tourisme ctier et maritime gnrent galement des revenus
importants. Selon la politique maritime de lUE, le dveloppement des capacits portuaires et
des voies daccs ctires doit voluer paralllement la croissance du commerce intrieur
et extrieur de l'Europe et tre compatible avec les objectifs des politiques europennes
connexes, en particulier les objectifs environnementaux et les objectifs en matire de
comptitivit.


10
Commission europenne (2007), une politique maritime intgre pour lUnion europenne, COM(2007) 575.

14
Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
La Communication sur une politique portuaire europenne
11
vise la cration dun systme
portuaire performant pour l'UE, capable de faire face aux futurs enjeux que constitueront les
besoins de l'UE en matire de transport. Lun des objectifs de son plan daction est
daugmenter la capacit daccueil des ports afin de permettre une intensification des
transports maritimes et fluviaux. Il existe plus de 1 200 ports de commerce en Europe, dont
certains constituent des points cls de transfert modal et revtent un intrt conomique vital
puisquils absorbent 90 % du commerce international de l'Europe. Si ces chiffres varient en
raison des fluctuations conomiques, les tendances long terme indiquent nanmoins une
croissance continue. Paralllement, le transport par navigation intrieure met moins de CO
2

par rapport aux autres modes de transport (transport routier mais aussi ferroviaire).

Cest durant la phase de consultation prcdant ladoption de la communication sur une
politique portuaire europenne qua merg la problmatique relative la protection de
lenvironnement dans les ports. Les acteurs des zones portuaires ont en effet exprim leurs
inquitudes propos de l'incertitude juridique quon fait natre les directives Habitats et
Oiseaux quant aux consquences de ces dernires sur leurs activits. Toutefois, dans le
mme temps, les ports adoptent de plus en plus souvent des approches de dveloppement
durable afin d'tre autoriss se dvelopper.

De nombreux ports et voies de navigation sont situs dans des estuaires et zones ctires
abritant des zones cologiquement sensibles et haute valeur cologique. La ncessit,
dune part, de dsigner des sites Natura 2000 dans les estuaires et zones ctires et, de
lautre, daugmenter les capacits daccueil des ports afin de rpondre la demande
europenne en matire de transports, se rvle tre un vritable dfi pour de nombreux
tats membres, et cette situation a dbouch sur des diffrends au niveau local et sur
plusieurs dcisions de la Cour de justice de lUnion europenne et cas de jurisprudence.
Nanmoins, certains tats membres, en rponse cet enjeu, ont dores et dj labor des
approches destines faciliter un dveloppement portuaire conforme aux obligations de la
directive Habitats.

Dans sa Communication sur une politique portuaire europenne, la Commission mesure
toute la difficult que reprsente le respect des directives environnementales dans le cadre
du dveloppement dinfrastructures portuaires. Par consquent, les services de la
Commission ont rpondu la demande du secteur portuaire en lui fournissant des
orientations pour linterprtation des deux directives Nature. C'est en effet dans le contexte
de ces directives que s'inscrivent les prsentes orientations, lesquelles ont pour ambition de
concilier les besoins en matire de dveloppement portuaire et les normes de lUE relatives
la protection de lenvironnement.


11
Commission europenne, (2007), communication sur une politique portuaire europenne, COM(2007) 616 du 18.10.2007.


15 Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation de l'UE en matire
de protection de la nature dans les estuaires et les zones ctires
2. SOURCES DINQUITUDE




2.1. Pressions sur les estuaires et les zones ctires

Parmi les activits humaines dans les zones ctires et estuariennes figurent la navigation,
le dragage, lextraction de granulats et de sable, les pcheries, laquaculture, lindustrie (y
compris lextraction de ptrole et de gaz, le dveloppement des parcs oliens), le drainage
des eaux uses, lextraction deau (notamment pour les centrales lectriques et lindustrie),
la scurit (notamment la dfense maritime et la protection contre les inondations), les loisirs
(lobservation des oiseaux et la chasse), lurbanisation, les protections pour les cbles, les
conduites et les tunnels, ainsi que les activits militaires et de recherche.

Toutes ces activits prises individuellement ou dans leur globalit peuvent potentiellement
entraner des incidences notables sur les objectifs de conservation de la nature fixs pour les
estuaires et les zones ctires. Les rpercussions directement associes aux voies
navigables et aux activits portuaires sont rpertories ci-dessous.

1. Oprations de dragage
Les travaux neufs de dragage, le dragage de maintenance et le dplacement des matriaux
dragus modifient le rgime hydrodynamique ainsi que la gomorphologie des estuaires: la
sdimentation s'effectue naturellement dans les estuaires en fonction des forces
hydrauliques et de la quantit de sdiments prsentes dans le bassin. Les sdiments
proviennent soit de lrosion dans le bassin versant, soit de lenvironnement marin, soit des
deux. Au-del dun certain temps, une sorte dquilibre est atteint et lestuaire commence
rejeter des sdiments au lieu de les retenir. Tout facteur influant sur le rgime
hydrodynamique et/ou la gomorphologie de ce dernier est susceptible de modifier lquilibre
et le flux de sdiments et d'entraner des modifications de lemplacement des habitats qui
composent les cosystmes estuariens et ctiers (replats boueux et bancs de sable, par
exemple).

Les travaux neufs de dragage requirent par ailleurs une attention particulire car ils peuvent
inverser la tendance au remplissage de lestuaire et porter atteinte lquilibre de ce dernier.
En effet, le creusement de lestuaire peut entraner lintrusion deau sale plus en amont,
accrotre laction des vagues sur le littoral, modifier l'amplitude et les courants des mares,
ainsi que la charge solide en suspension et la sdimentation. En outre, les modifications de
nature hydrodynamique et leurs effets sur lrosion, le dpt et le transport des sdiments
peuvent provoquer des changements gomorphologiques secondaires loin de la zone de
dragage, et notamment lrosion potentielle des replats boueux et marais sals.

Le dragage de maintenance est une activit priodique ou permanente ncessaire pour
maintenir le tirant deau dans les estuaires ou sur les ctes ouvertes. Les incidences du
dragage de maintenance ou des travaux neufs de dragage sur un site peuvent tre
similaires. La diffrence cruciale entre ces deux activits rside dans le fait que les travaux
neufs provoquent des changements majeurs tandis que la maintenance empche le systme
de revenir son tat original, mais de manire moins radicale. Cela signifie que, pour
maintenir les habitats et espces dans un tat de conservation favorable, il sera ncessaire
de rsoudre en permanence certains problmes. Il est toutefois possible dattnuer certains
de ces impacts en modifiant les pratiques de dragage et en utilisant des techniques
dalimentation en sdiments, bien que celles-ci ne soient pas applicables partout.

16
Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
Par ailleurs, dans certaines circonstances, les matriaux dragus peuvent tre rutiliss de
manire bnfique pour accrotre par exemple lapport en sdiments sur les plages, bien
quil soit ncessaire de veiller dans ce cas ne pas touffer les communauts intertidales,
qui jouent un rle important. Cette complexit illustre la ncessit dvaluer de faon
mticuleuse les incidences hydrodynamiques dans les estuaires et eaux ctires. Aussi une
planification minutieuse du dragage et du dplacement des matriaux dragus fait-elle partie
intgrante des programmes de gestion des sdiments.


2. Activits de maintenance
Les activits de maintenance autres que le dragage, savoir par exemple la maintenance, le
dplacement ou linstallation de marques, de bornes, lumires de navigation, de schmas de
gestion du trafic maritime et de lieux dancrage, lextension des cales de lancement et des
embarcadres ainsi que la maintenance des digues souples, des ouvrages de protection
contre les crues et murs anti-vague, sont susceptibles davoir des effets ngatifs sur les
objectifs de conservation dans les estuaires et les zones ctires.


3. Transport maritime commercial
Le transport maritime commercial peut tre divis en deux grandes catgories: lexploitation
et le dplacement des navires et les oprations de fret. Le dplacement des bateaux dans
les estuaires et les eaux ctires, en raison des vagues quil gnre et de la turbidit
produite par lhlice dans la colonne deau, peut potentiellement entraner des incidences sur
les caractristiques dun habitat. Les rpercussions de ces dplacements peuvent tre soit
nfastes, comme cest le cas de lrosion de la zone intertidale des estuaires et/ou de la
remise en suspension des sdiments, ou bnfiques, lorsquelles contribuent arer la
colonne deau par exemple.

Le bruit (sur et sous leau) associ au transport maritime peut galement perturber certains
animaux marins protgs, tandis que lancrage des navires (hors dune zone prvue cet
effet), drange et endommage potentiellement les animaux et vgtaux prsents sur les
fonds marins (bancs de mollusques, coraux souples, herbes marines). En outre, les
missions atmosphriques des bateaux, la gestion des dchets et le traitement des eaux de
ballast peuvent avoir des incidences sur les habitats ctiers environnants.

La manutention des cargaisons sches en vrac peut par ailleurs gnrer de la poussire
ainsi quune pollution atmosphrique (azote et soufre). Celle des cargaisons liquides en vrac
peut requrir quant elle de dcharger la cargaison via des conduites, ce qui risque
doccasionner fuites, missions et coulements. Le rejet accidentel de marchandises dans
lenvironnement marin est lui aussi susceptible dentraner dimportants impacts sur le plan
environnemental. En outre, la propagation des espces exotiques envahissantes par
lintermdiaire des eaux de ballast ou par les navires eux-mmes peut avoir des effets
ngatifs sur les zones protges. Enfin, le dplacement des navires comporte un risque de
catastrophe (dversement dhydrocarbures ou de marchandises).

Les aspects oprationnels du transport maritime commercial (gestion des dchets, des eaux
de ballast et pollution atmosphrique, entre autres) sont toutefois soumis des lois et
rglementations nationales ou internationales (telles que le trait sur les eaux de ballast de
lOrganisation maritime internationale et les annexes 1 6 de la Convention MARPOL). En
outre, les autorits portuaires peuvent, si elles le souhaitent, participer une initiative
consistant promouvoir, sur la base du volontariat, un transport maritime vert en
dveloppant un indice environnemental. Cet indice sintresse principalement la pollution
atmosphrique provenant des navires de mer.

17
Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation de l'UE relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
4. Amnagement de terres nouvelles et utilisation des terres par les ports
Les ports eux-mmes sont susceptibles davoir des rpercussions sur Natura 2000 dans la
mesure o leur existence entrane la construction de nouvelles infrastructures (terminaux,
voies ferres, conduites, routes, nouvelles industries et vastes zones consacres aux
entreprises de logistique), lesquelles peuvent porter atteinte aux sites Natura 2000
environnants. Dans certaines zones, lespace disponible est insuffisant et les ports ont
besoin de gagner des terres sur la mer. Lamnagement de terres nouvelles au sein du
rseau Natura 2000, quil sagisse de sites terrestres ou marins, requiert dans la plupart des
cas des programmes de compensation des dommages causs la nature.

5. Complexes industriels
Les zones portuaires abritent souvent des complexes industriels tels que raffineries,
installations de production d'nergie, plateformes de marchandises sches et liquides en
vrac et terminaux pour conteneurs. Les effets cumulatifs des oprations industrielles, du
transport et du trafic peuvent conduire des effets nfastes sur le plan cologique dans les
sites Natura 2000 avoisinants. Les problmes environnementaux tels que la qualit de lair,
le bruit et les dchets sont rglements par une lgislation et des politiques spcifiques,
lesquelles ne sont cependant pas abordes dans le prsent document dorientation. Par
ailleurs, le recours aux meilleures technologies disponibles est souvent obligatoire et peut,
en tant que tel, galement limiter la pression environnementale exerce sur les sites
concerns.


2.2 Principales inquitudes du secteur portuaire concernant la mise en uvre des
directives Oiseaux et Habitats

Lune des principales sources dinquitude du secteur portuaire concerne son
dveloppement et sa capacit planifier de nouveaux projets lavance et de manire
certaine. Au cours de ces dernires annes, des retards sur le calendrier prvu ont pu en
effet tre observs lors de lextension de terminaux dans divers ports europens.
LOrganisation europenne des ports maritimes communautaires (ESPO) attribue ces retards
diffrentes causes allant des politiques internes au sein du port aux objections
environnementales en passant par les enqutes sur les implications des parts de march,
les difficults de financement, les affaires judiciaires, etc. (ESPO, 2007).

LESPO a publi en 2007 un code de bonnes pratiques pour lapplication des directives
Oiseaux et Habitats (ESPO, 2007), lequel comporte un nombre de recommandations
pour les autorits portuaires confrontes aux implications juridiques des dispositions des
deux directives Nature dans les zones de dveloppement portuaire au sens large. Le
dernier chapitre de ce code de bonnes pratiques prsente une liste des sujets pour lesquels
la Commission europenne a t invite proposer des orientations.

Les questions suivantes refltent quelques-unes des inquitudes dont ont fait part les
autorits portuaires au regard du dveloppement et de lexploitation des ports situs
proximit ou au sein dune zone estuarienne ou ctire protge. La plupart de ces
inquitudes sont traites dans le prsent document dorientation, lexception de celle
concernant le partage des cots entre les diffrentes parties prenantes.
1. En quoi une approche proactive et une planification intgre peuvent-elles conduire
une plus grande scurit juridique?
2. En quoi la consultation du grand public et la participation de tous les acteurs
concerns ds la phase dlaboration du projet peuvent-elles permettre de trouver
des accords avec lensemble des parties prenantes?

18
Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
3. De quelle manire les cots peuvent-ils tre partags entre les parties prenantes
concernes susceptibles de tirer profit de lintgration des objectifs de dveloppement
socio-conomique dans les objectifs de conservation des sites Natura 2000?
4. Comment la mise en uvre systmatique de mesures dattnuation efficaces,
propres liminer les effets ngatifs avant mme qu'ils ne se produisent, permet-elle
dviter les obligations de compensation?
5. De quelle manire la coopration entre les promoteurs, agences environnementales
et ONG peut-elle tre amliore en vue de promouvoir des approches flexibles et des
situations mutuellement bnfiques?

La gestion des activits de maintenance telles que le dragage au sein ou proximit de sites
Natura 2000 fait galement partie des grandes sources de questionnement des exploitants
portuaires et des voies navigables. Si des lignes directrices fournies relatives larticle 6 de
la directive Habitats existent dores et dj en ce qui concerne les nouveaux plans et
projets, les activits continues ont jusquici t moins souvent abordes. Cest pourquoi le
chapitre 3.3.5 du prsent document apporte des orientations supplmentaires sur ce sujet.

Pour les promoteurs du dveloppement des installations portuaires, il est par ailleurs
important de savoir jusqu' quel niveau de dtail ils doivent aller pour valuer correctement
les effets potentiels des nouveaux plans et projets afin de respecter les obligations dcoulant
des directives Oiseaux et Habitats. Des orientations sur la manire de grer ces
incertitudes semblent donc cruciales cet gard. LESPO a ainsi dvelopp une liste de
contrle pouvant servir de document dauto-orientation (voir annexe 3).


2.3 Changement climatique: une source dinquitude particulire pour les estuaires et
les zones ctires

Les zones ctires et plaines inondables font partie des sites les plus vulnrables face au
changement climatique car elles sont exposes au risque dlvation du niveau des mers
mais aussi un risque accru de temptes, de prcipitations intenses et de crues soudaines,
lesquels entranent gnralement de nombreux dommages aux zones construites et aux
infrastructures.

Les mesures de protection contre les inondations telles que la construction de digues,
lamnagement de terres nouvelles et autres types de protection contre la mer peuvent en
outre conduire un phnomne de constriction ctire savoir que l'espace disponible
pour permettre aux processus ctiers naturels de contenir lrosion et de sadapter aux
changements tels que la monte du niveau des mers est de plus en plus rduit. La
constriction ctire se produit notamment dans les zones de faible altitude et intertidales,
qui savent en temps normal sadapter naturellement aux changements provoqus par
llvation du niveau des mers, les temptes et les mares, mais ne peuvent le faire en
raison de la prsence de barrires rigides telles que les routes, les digues, les constructions
diverses dues lurbanisation, les ports et les infrastructures industrielles.

Des mesures novatrices visant prvenir la constriction des ctes devraient tre mises en
place dans les estuaires et les zones ctires. Une constriction naturelle entranant des
effets similaires se produit par ailleurs aux endroits o la cte jouxte des hautes terres: les
habitats rods ne peuvent plus progresser vers les terres, car celles-ci sont en altitude.


19
Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation de l'UE relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires


Schma 1: la constriction ctire se produit lorsque la migration de lhabitat (en rponse llvation
du niveau des mers) est empche par les ouvrages de protection contre les mares et les crues
(Environnement Agency, RU, 2005).

Le changement climatique aura des consquences lourdes sur le milieu naturel de lEurope
et sur pratiquement tous les pans de sa socit et de son conomie. La monte probable du
niveau des mers rduira le rle protecteur des digues et murs de quai, tandis que les
priodes de faibles prcipitations dans les bassins versants sont susceptibles de conduire
une baisse du volume des ruissellements deau douce et une augmentation du taux de
sdimentation au sein des estuaires. Par consquent, il est possible que les bas niveaux des
fleuves durant les priodes de scheresse estivale entravent le transport intrieur vers les
ports fluviaux.

Llvation du niveau des mers rsultant du changement climatique modifie bien
videmment les caractristiques des mares (augmentation de lamplitude des mares et de
la vitesse des courants, par exemple). Ce phnomne peut intensifier le pompage tidal, qui
lui-mme peut entraner une rduction des zones de grande valeur que sont les eaux peu
profondes et provoquer une sdimentation indsirable, responsable son tour d'un
appauvrissement de la biodiversit et d'une augmentation des besoins en dragage. Le
principal problme pos par la monte du niveau des mers rside cependant dans le fait que
les sdiments risquent alors dtre insuffisants pour permettre aux replats boueux et sableux
de suivre le niveau de la mer. Un tel scnario peut potentiellement conduire une
multiplication des habitats subtidaux. S'il est possible qu'un petit nombre de ports europens
risquent de rencontrer des problmes du fait de la sdimentation subtidale, le risque est bien
plus grand de se trouver face une exportation des sdiments ainsi qu une rosion accrue
due au manque despace pour le renouvellement des sdiments.


20
Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
3. ORIENTATIONS




Les prsentes orientations visent fournir aux autorits nationales comptentes, aux
autorits et exploitants des ports et des voies navigables ainsi quaux ONG de protection de
lenvironnement un ensemble pratique de recommandations concernant la mise en uvre
des directives Oiseaux et Habitats dans les estuaires et les zones ctires, portant
notamment sur le dveloppement portuaire et les activits de dragage. Ces
recommandations sont essentiellement axes sur les aspects suivants: les objectifs de
conservation dans les environnements dynamiques, la planification intgre, les nouveaux
dveloppements et les stratgies souples. L'application de ces orientations renforcera
l'efficacit de la planification et des approches du dveloppement, et favorisera les
procdures acclres pour lexpansion des ports, conformment la communication sur
les objectifs stratgiques et recommandations concernant la politique du transport maritime
de lUE jusquen 2018, COM(2009) 8.

Lexprience a dmontr quune coopration prcoce entre les parties intresses et
concernes est souvent indispensable pour russir la planification et viter les retards. Les
estuaires et les zones ctires sont des environnements extrmement complexes et
dynamiques qui suscitent lintrt de secteurs trs varis. Ces zones prsentent
gnralement un grand intrt pour la conservation des habitats naturels et dun point de vue
socio-conomique. Bien que cette situation complique la planification des projets de
dveloppement, ce processus peut nanmoins tre ralis en temps voulu, de manire
quilibre et intgre, et prsenter un bon rapport cot-efficacit. Lun des principaux
objectifs est, sous rserve que toutes les parties soient conscientes des obligations que la loi
leur impose, dacqurir des connaissances de base en ce qui concene le fonctionnement des
estuaires en tant qu'cosystmes.


3.1. Objectifs de conservation dans les environnements dynamiques


3.1.1. Comprendre et grer les estuaires et les zones ctires, des cosystmes
dynamiques complexes

Avant de fixer des objectifs de conservation dans des environnements dynamiques tels que
les estuaires et les zones ctires, il importe de comprendre le fonctionnement de ces
cosystmes si complexes, leur volution dun point de vue morphologique et les
influences que peuvent exercer les pressions anthropiques et le changement climatique.
Lquilibre fragile existant entre les diffrents composants (physiques, chimiques,
biologiques et hydromorphologiques) des cosystmes des estuaires et des zones ctires
est vulnrable face aux actions de lhomme telles que les activits portuaires, lagriculture ou
les mesures de protection contre les inondations. Pour rpondre aux besoins de la socit, il
est ncessaire de maintenir la fois la valeur cologique et conomique de ces
cosystmes.

Comme le souligne la directive-cadre stratgie pour le milieu marin
12
, une approche
fonde sur les cosystmes est parfaitement adapte la gestion de systmes complexes

12
2008/56/CE (Journal officiel de lUE du 25.6.2008): Dispositions gnrales, article 1, paragraphe 3: approche de la gestion

21
Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation de l'UE relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
tels que les estuaires et les zones ctires. Une telle approche considre lcosystme
comme une entit cologique part entire possdant une structure, des processus et des
fonctions caractristiques qui interagissent avec leur environnement. Ce type dapproche
permet dlargir lanalyse sur le plan spatial par rapport une simple approche fonde sur
les habitats / les masses deau. En effet, le changement climatique pourra avoir des
rpercussions sur la biodiversit et lhydromorphologie des zones estuariennes et ctires,
ainsi que sur les activits humaines comme le dveloppement et lexploitation portuaires.
Orientations pour une planification et une prise de dcision fondes sur la connaissance des
cosystmes
Les processus physiques et lvolution morphologique de chaque estuaire et zone
ctire concerns doivent faire lobjet dune tude dtaille. Les autorits
comptentes doivent rassembler les connaissances scientifiques les plus pointues et
les plus fiables disponibles ce sujet, partir desquelles seront fixs les objectifs de
conservation de la nature dans ces cosystmes.
Avant dtablir des objectifs de conservation dans les estuaires et zones ctires
classs sites Natura 2000, il convient de rpertorier de faon dtaille la prsence, la
rpartition gographique et ltat de conservation de tous les habitats et espces
protgs au titre des directives Nature, ainsi que les risques potentiels auxquels ils
sont exposs.
Des plans de gestion intgrs pour les estuaires devront tre labors et mis en
uvre. Ils constituent des instruments essentiels la conservation et la protection
des processus, zones et espces critiques mais doivent galement laisser
suffisamment de place un dveloppement conomique durable. Lorsque cela est
possible, ces plans de gestion devront sinscrire dans le plan de gestion gnral du
district hydrographique.
Les objectifs de conservation de la nature ainsi que les objectifs de dveloppement
socio-conomique doivent tre pris en compte simultanment lors de llaboration de
plans de gestion intgrs pour les sites Natura 2000. Une approche fonde sur les
cosystmes devra tre adopte, laquelle permettra lutilisation durable de biens et
services respectant totalement les objectifs de conservation du site.
mesure quun estuaire ou une zone ctire volue, la prsence ou labsence de
certains habitats ou espces changera elle aussi. Cest pourquoi les objectifs de
conservation et les mesures prises en faveur des sites Natura 2000 doivent tenir
compte de la dynamique et des tendances volutives propres au systme. Il est
galement ncessaire de faire la distinction entre les volutions naturelles et celles
dcoulant des influences humaines, savoir les pressions exerces sur les zones
ctires ainsi que les modifications morphologiques imposes par
lapprofondissement des chenaux.
Lorsque des incertitudes ou un manque de connaissances relatives aux processus
physiques, morphologiques ou biologiques subsistent, il convient de les rduire
autant que faire se peut en menant des recherches supplmentaires; si malgr cela
des incertitudes demeurent, des programmes souples de suivi doivent tre prvus.

des activits humaines fonde sur les cosystmes, permettant de garantir que la pression collective rsultant de ces activits
soit maintenue des niveaux compatibles avec la ralisation des objectifs de conservation, du bon tat cologique et
environnemental et dviter que la capacit des cosystmes estuariens, ctiers et marins ragir aux changements induits par
la nature et par les hommes soit compromise, tout en permettant lutilisation durable des biens et des services
(cosystmiques) marins par les gnrations actuelles et venir.

22
Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
Les nouvelles preuves et informations scientifiques recueillies devront tre intgres
au plan de gestion, et le cas chant conduire ladaptation approprie des mesures
de gestion et des systmes de suivi.
Les potentielles mesures dadaptation au changement climatique doivent galement
tre prises en compte lors de llaboration des objectifs de conservation. Il convient
tout particulirement d'agir en cas de dsquilibres sdimentaires au niveau rgional,
car une insuffisance de sdiments peut aggraver le phnomne drosion,
notamment des marais, des habitats de la mer des Wadden (1110, 1130 et 1140),
des bancs de sable, des plages et des dunes.
Il convient de dvelopper des approches proactives et stratgiques en matire de
gestion des zones ctires dont la priorit serait de renforcer la scurit de ces zones
et la rsilience des cosystmes et de maintenir un bilan sdimentaire quilibr au
sein des systmes ctiers et estuariens.
Il serait, lorsque cela est possible, plus judicieux dtendre les zones naturelles de
manire prventive, au lieu de le faire en raction aux incidences des catastrophes
ou du changement climatique. Des couloirs de dispersion, outil dadaptation essentiel,
devraient tre amnags pour certaines espces.
Lorsque les changements de taux de sdimentation entranent la perte dimportants
habitats tels que les eaux peu profondes, la mise en place de programmes de gestion
des sdiments adapts pourrait se rvler opportune pour atteindre les objectifs de
conservation.


3.1.2. Protection des habitats et espces dintrt communautaire

Sur la cte atlantique nord-est, les estuaires sont soumis aux mares. Les estuaires fluviaux
sont des anses ctires o, contrairement aux grandes criques et baies peu profondes,
l'apport en eau douce est gnralement important. L'interaction des eaux douces avec les
eaux marines ainsi que la rduction du flux des eaux dans l'estuaire provoquent le dpt de
fins sdiments sous forme de larges tendues de replats boueux et sableux. Les
cosystmes estuariens se caractrisent par leurs habitats subtidaux et intertidaux (la
slikke), qui incluent les marais sals (littoral). Lembouchure des fleuves donnant sur les
mers Baltique, Mditerrane et Noire, considre comme un sous-type destuaires, prsente
des eaux saumtres et peu de mare.

Les estuaires et zones ctires sont des systmes dynamiques constitus de diffrents
types dhabitats et divers habitats despces. Les bancs de sable (1110
13
), replats boueux ou
sableux (1140), les rcifs (1170) et les marais sals (1310 1330) peuvent galement tre
des composants de lhabitat 1130 Estuaires. Ces derniers comprennent aussi des couloirs
emprunts par les espces migratrices (telles que les poissons) et des zones de repos pour
un grand nombre doiseaux. Les estuaires et les zones ctires sont parfois relis aux
lagunes ctires (1150*) ou aux grandes criques et baies peu profondes (1160).

Les ventuels chenaux et/ou routes de navigation font partie intgrante de lhabitat de type
Estuaire quelles que soient ses conditions gographiques; ils jouent un rle dans le
fonctionnement hydrologique des estuaires et des zones ctires voisines, notamment dans
la circulation de leau et le dpt des sdiments.


13
Code d'habitat utilis par la directive Habitats.

23
Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation de l'UE relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
Les estuaires doivent gnralement tre considrs comme une mosaque de diffrents
habitats. Par ailleurs, lorsque des objectifs de conservation sont fixs pour des estuaires ou
des zones ctires, il convient de prendre en considration dautres zones ctires
contigus. Le Manuel dinterprtation des habitats de lUE donne davantage de prcisions
sur la dfinition des habitats, dont certains ont t rviss en 2007 (notamment les habitats
marins 1110, 1170 et 1180). En outre, il existe quelques documents dorientation nationaux,
mme si les dfinitions/interprtations du type dhabitat Estuaires (1130) diffrent parfois
selon les tats membres.

Les fonctions biologiques au sein des estuaires et des zones ctires sont dtermines par
plusieurs paramtres cls. La prsence ou labsence de certaines espces (angiospermes,
faune benthique invertbre, poissons, oiseaux et mammifres) dpendent ainsi du
comportement du systme et de son rseau trophique, et sont influences par des facteurs
physiques comme la turbidit ou la salinit. En outre, des modifications significatives au
niveau des lments physiques des estuaires et des zones ctires, tels que les projets de
dveloppement des ports et des voies navigables, sont susceptibles davoir un impact sur la
survie de certaines espces de la chane alimentaire.

Pour ce qui est des habitats aquatiques spcifiquement cibls par la directive Habitats, les
lments chimiques, biologiques et hydromorphologiques composant le bon tat cologique
dcrit dans la directive-cadre sur leau (DCE) constituent une premire tape dans la
ralisation des objectifs fixs par les directives Nature. Certaines espces caractristiques
des habitats figurant lannexe I (angiospermes, faune benthique, poissons) servent
dindicateurs pour valuer ltat cologique de leau conformment la DCE.

Ltat de conservation des espces et des habitats protgs au titre des directives en
matire de protection de la nature ne dpend pas toujours uniquement de la bonne qualit
cologique des masses deau telle que dfinie par la DCE, bien quelle en soit lun des
principaux paramtres. Ltat de conservation des espces au niveau local peut ainsi
reposer sur dautres lments spcifiques qui doivent tre dtermins au cas par cas.

Parmi les mesures autres que celles prvues par la DCE, mais potentiellement imposes par
la directive Oiseaux ou Habitats, citons notamment: des aires de repos calmes
destines aux phoques, des zones dalimentation dans des habitats intertidaux pour les
otaries ou pour les oiseaux mare basse, ou encore la cration de lieux de nidification
appropris pour les oiseaux. Le principal dfi consistera trouver une approche
mutuellement bnfique et harmoniser les objectifs et mesures de la DCE et du rseau
Natura 2000 un stade prcoce.

Orientations concernant la dsignation des sites Natura 2000 et leur intgration dans la
directive-cadre sur leau
Un estuaire ou une zone ctire forme une unit cologique avec les types dhabitats
terrestres et ctiers sublittoraux environnants. En termes de conservation de la
nature, ces diffrents types dhabitats ne doivent donc pas faire lobjet dun traitement
isol et cet tat de fait doit tre pris en compte lors de la dlimitation des sites.
Les chenaux et/ou les routes de navigation font partie intgrante des sites classs
Natura 2000 et doivent donc faire partie des plans de gestion.
Les tat membres et les autorits locales doivent coordonner ltablissement des
objectifs de conservation avec la mise en uvre et le suivi des mesures dans le
cadre des directives Nature et de la DCE. Lorsque cela est possible, il convient de
mettre en place des plans de gestion intgrs tenant compte la fois de la directive-
cadre sur leau et de Natura 2000.

24
Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires


3.1.3. Fixer les objectifs de conservation pour les habitats des estuaires et des zones
ctires

Llaboration des objectifs de conservation pour les estuaires et les zones ctires
reprsente un vritable dfi, car il sagit dcosystmes dynamiques extrmement
complexes. La responsabilit finale quant aux objectifs de conservation appropris, aux
priorits et aux instruments adapts aux contextes nationaux, rgionaux et locaux revient
toujours aux tats membres.

Dans ce contexte, les questions suivantes peuvent tre souleves:
- Comment les objectifs de conservation sont-ils fixs au niveau national/local?
- Comment les plans de gestion Natura 2000 peuvent-ils adopter une approche fonde sur
les cosystmes tout en contribuant la quantification des objectifs de conservation et
la mise en place de mesures de conservation pour les habitats et les espces?
- Comment intgrer les objectifs socio-conomiques aux objectifs de conservation et aux
plans de gestion du rseau Natura 2000?

Les objectifs et les mesures de conservation doivent tre fixs la fois lchelle nationale
et au niveau du site. Conformment larticle 2, paragraphe 1, de la directive Habitats, la
directive a pour objet de contribuer assurer la biodiversit par la conservation des habitats
naturels ainsi que de la faune et de la flore sauvages sur lensemble du territoire europen
des tats membres o le trait s'applique.

En vertu de larticle 4, paragraphe 4, de la directive Habitats, les tats membres doivent
classer les sites dintrt communautaire comme zones spciales de conservation, en
tablissant les priorits en fonction de l'importance des sites pour le maintien ou le
rtablissement, dans un tat de conservation favorable, d'un type d'habitat naturel de
l'annexe I ou d'une espce de l'annexe II et pour la cohrence de Natura 2000, ainsi qu'en
fonction des menaces de dgradation ou de destruction qui psent sur eux.

Conformment larticle 6, paragraphe 1, les tats membres doivent tablir des mesures de
conservation pour chaque zone spciale de conservation. Les objectifs de conservation
propres chaque site prennent en considration les priorits fixes selon les termes de
larticle 4, paragraphe 4, et contribuent dterminer les mesures de conservation
spcifiques chaque site.

Les objectifs de conservation au niveau des tats membres et du site sont complmentaires;
en effet, Natura 2000 est un rseau au sein duquel chaque site possde une fonction
particulire sinscrivant dans la cohrence densemble du systme. Cela signifie que les
objectifs de conservation fixs au niveau de chaque site contribueront galement atteindre
les objectifs de conservation lchelle nationale.

Les mesures de conservation spcifiques chaque site peuvent, aux termes de larticle 2,
paragraphe 3, de la directive Habitats, tenir compte des exigences conomiques,
sociales et culturelles, ainsi que des particularits rgionales et locales. Toutefois, ces
aspects ne doivent en aucun cas compromettre lobjectif gnral du rseau Natura 2000, qui
est dassurer le maintien ou, le cas chant, le rtablissement, dans un tat de
conservation favorable, des types d'habitats naturels et des habitats d'espces concerns
dans leur aire de rpartition naturelle. Tous les sites apporteront leur contribution cet
objectif, bien que cette contribution ne soit pas forcment quivalente dun site lautre.


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Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation de l'UE relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
Les ZSC doivent se conformer trois types dobligation: les mesures de conservation
proactives prvues par larticle 6, paragraphe 1; les mesures de prvention mentionnes
larticle 6, paragraphe 2, visant viter la dtrioration des habitats naturels; et enfin les
mesures spcifiques mettre en uvre aux fins de l'valuation et de l'autorisation de
nouveaux plans et projets, prvues aux paragraphes 3 et 4 de larticle 6. Les objectifs de
conservation de chaque site doivent donc respecter toutes ces contraintes. En outre, les
mesures de conservation spciale nonces larticle 4 de la directive Oiseaux exigent
des mesures quivalentes celles figurant larticle 6, paragraphe 1, de la directive
Habitats pour les zones de protection spciale. Les dispositions de larticle 6, paragraphes
2, 3 et 4, de la directive Oiseaux sappliquent galement aux zones de protection spciale.

Orientations pour fixer les objectifs de conservation
Lorsquun site dimportance communautaire a t choisi conformment la
procdure nonce larticle 4, paragraphe 2, de la directive Habitats, ltat
membre concern doit dsigner ledit site zone de conservation spciale ds que
possible et au plus tard dans les six annes qui suivent, en fixant des priorits en
fonction de limportance des sites pour le maintien ou le rtablissement, dans un tat
de conservation favorable, d'un type d'habitat naturel de l'annexe I ou d'une espce
de l'annexe II et pour la cohrence de Natura 2000, ainsi qu'en fonction des menaces
de dgradation ou de destruction qui psent sur eux (article 4, paragraphe 4, de la
directive Habitats).
En ce qui concerne les objectifs de conservation, les autorits nationales
comptentes doivent prendre en compte la nature dynamique des estuaires et des
eaux ctires, ainsi que les fluctuations naturelles de ces sites du point de vue des
espces et des types dhabitats protgs.
Les rflexions sur les objectifs de conservation doivent tre entirement axes sur les
processus morphologiques, chimiques et biologiques, de manire reconnaitre les
fonctions cologiques des estuaires et des eaux ctires, notamment leur rle
hydrologique et leur fonction en qualit de zone de frai, de reproduction ou dhabitat
saisonnier pour les espces migratrices.
Les objectifs et les mesures de conservation dfinies pour un site Natura 2000
doivent se fonder sur lvaluation de ltat de conservation local des habitats et
espces protgs ainsi que sur limportance relative du site en question pour la
cohrence de Natura 2000 et pour le maintien ou le rtablissement, dans un tat de
conservation favorable, de ces habitats et espces. Ils doivent galement rpondre
aux menaces de dgradation ou de destruction qui psent sur eux. Les incidences
dun plan ou dun projet sur lintgrit du site doivent faire l'objet d'une valuation
(article 6, paragraphe 3) la lumire des objectifs de conservation de ce site.
Ltat de conservation la date de dsignation du site doit servir de rfrence pour
valuer sa dtrioration (article 6, paragraphe 2). Dans ce contexte, il convient
galement de prendre en considration les progrs imputables aux mesures de
rtablissement mises en uvre ou dautres amliorations, telles que laugmentation
de la population doiseaux, dues des pressions exerces en dautres endroits ou
des rponses au changement climatique, mais aussi les pertes causes par des
volutions naturelles ou le changement climatique. Le formulaire standard de
donnes du site reste un document de rfrence important cet gard.
Les autorits portuaires et celles responsables des voies navigables doivent tre
consultes ds les premiers processus de dveloppement et de mise en uvre des
mesures de conservation pour les sites Natura 2000 situs prs des ports ou relis

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Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
aux voies daccs empruntes par les navires. Lors de llaboration des mesures de
conservation pour un site donn, il convient de prendre en considration les
exigences conomiques, sociales et culturelles ainsi que les caractristiques
rgionales et locales telles que lemplacement au sein des zones portuaires et les
dveloppements conomiques attendus, sans toutefois remettre en cause la
contribution dudit site aux objectifs gnraux et la cohrence du rseau
Natura 2000.
Les objectifs de conservation ne doivent pas tre figs mais au contraire adapts en
fonction de lvolution constate de ltat de conservation des espces et des habitats
et de celle dautres facteurs cologiques dans un environnement complexe et
dynamique.
Il convient de mettre en place des systmes de suivi court et long termes,
notamment de lvolution des dynamiques morphologiques et de la circulation /
redistribution des sdiments. En se fondant sur les tendances mesures, les objectifs
de conservation et les mesures de gestion pourront tre rviss si et quand
ncessaire (en appliquant les principes de gestion adaptative).


3.2. Planification intgre


3.2.1. Plans de gestion

Il est recommand dtablir des plans de gestion pour les sites Natura 2000, bien quils ne
soient pas obligatoires au titre de la directive Habitats. Ces plans savrent tre un moyen
appropri de mettre en place des objectifs de conservation transparents et de dvelopper
des mesures visant prserver ou amliorer les richesses naturelles, tout en respectant les
processus du systme. Un plan de gestion permet de concilier dveloppement conomique
durable, problmatiques de scurit et accessibilit avec les objectifs de conservation de la
nature. Il offre par ailleurs la possibilit dintgrer ces objectifs des activits de
maintenance rcurrentes et de routine.

Les plans de gestion constituent en outre un outil adapt pour trouver un quilibre entre ces
activits rcurrentes et de routine, telles que le dragage de maintenance, et la protection de
lenvironnement, et pour faire participer les autorits portuaires et autres parties concernes
la gestion des sites Natura 2000.

Si les activits de maintenance sont directement lies la gestion du site et, ce titre,
intgres dans un plan de gestion Natura 2000, elles seront conues de manire ne pas
entraner d'effets ngatifs sur l'intgrit du site ou compromettre ses objectifs de
conservation. Dans ce cas, ces activits peuvent tre autorises sans faire lobjet dune
valuation approprie conformment larticle 6, paragraphe 3 de la directive Habitats.

Lintgration de plans stratgiques concernant les installations portuaires, de plans de
gestion de districts hydrographiques conformment la DCE et de plans de gestion
Natura 2000 peut rduire la charge administrative, les retards et les incertitudes juridiques.


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Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation de l'UE relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
Orientations pour les plans de gestion Natura 2000
Il convient dlaborer des plans de gestion intgrs pour les sites Natura 2000, en
particulier pour les sites attenants aux installations portuaires ou dautres activits
industrielles.
Les autorits portuaires et celles responsables des voies navigables devraient participer
activement llaboration de plans de gestion pour les sites Natura 2000 situs
proximit des ports et des voies navigables qui y sont relies.
Les plans stratgiques concernant les installations portuaires, les plans de gestion de
districts hydrographiques au titre de la DCE et les plans de gestion Natura 2000
devraient tre coordonns et intgrs lorsque cela est possible, de manire tirer
pleinement parti des ventuelles situations avantageuses pour toutes les parties.
Les activits de maintenance rcurrentes, ncessaires pour faciliter les activits
portuaires et laccs aux voies empruntes par les navires, doivent tre intgres aux
plans de gestion et conues de manire ne pas nuire aux objectifs de conservation du
site.


3.2.2. Amnagement du territoire

L'amnagement du territoire et la gestion intgre, fonds sur des approches prospectives et
proactives, peuvent contribuer la mise en uvre des mesures de conservation sur les sites
et renforcer la scurit juridique pour les projets de dveloppement portuaire. La
planification intgre est un moyen de rechercher les synergies et la complmentarit, un
outil servant promouvoir la responsabilit sociale et le dveloppement durable et qui
devrait contribuer viter certaines situations paradoxales ou conflictuelles, et terme les
rivalits pour lespace. Anticiper les tensions permettra de gagner du temps et dchapper
des batailles procdurales.

La recommandation du Parlement europen 2002/413/CE sur la gestion intgre des zones
ctires (GIZC) ouvre la voie une meilleure planification stratgique. La GIZC vise mettre
en place une gestion des zones ctires durable sur le plan environnemental, quitable
conomiquement, responsable socialement et sensible culturellement, qui maintienne
lintgrit de cette ressource essentielle tout en tenant compte des activits traditionnelles et
des coutumes locales qui ne reprsentent pas une menace pour les zones naturelles fragiles
ni pour ltat de conservation des espces sauvages de la faune et de la flore ctires
(Janssen, 2005).

Lapproche stratgique propose par la GIZC met laccent sur la protection de
lenvironnement ctier (en adoptant une approche fonde sur les cosystmes qui prserve
leur intgrit et leur fonctionnement) mais aussi sur le danger que reprsentent le
changement climatique ou encore les activits conomiques et possibilits demploi non
durables. Les recommandations de la GIZC proposent de suivre certains principes tels que
le recours un ventail dinstruments conus pour faciliter la cohrence entre les objectifs
politiques sectoriels dune part, et entre la planification et la gestion dautre part.

De mme, en vertu de la directive-cadre stratgie pour le milieu marin 2008/56 (DCSMM),
les tats membres sont tenus dadopter dici 2016 des programmes de mesures pouvant
comporter des Rgulation de la rpartition spatiale et temporelle: mesures de gestion qui
influent sur le lieu et le moment o une activit est autorise (annexe VI). Ces mesures
fournissent ainsi un socle rglementaire la planification spatiale maritime pour les milieux
marins tombant dans le champ dapplication de la directive-cadre.

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Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires

L'amnagement intgr du territoire permet d'anticiper les difficults et les incidences
environnementales ngatives et d'viter d'ventuels conflits et retards dans le
dveloppement des projets. La rsolution des problmes au niveau spatial permet de rduire
les difficults relatives lobtention des autorisations auxquelles les projets individuels sont
confronts, dans la mesure o les promoteurs et lautorit charge de dlivrer les
autorisations peuvent alors se fier ces plans fonds sur une approche globale lors dun
processus de prise de dcision faisant suite des valuations anticipes ou appropries qui
ont t menes au niveau spatial.

La planification spatiale et intgre ne soppose pas au concept de procdures acclres
proposes par la Commission europenne
14
, lanticipation pouvant rsoudre certains
problmes rencontrs en aval. Une meilleure planification ncessite certes davantage de
temps, mais elle permet en contrepartie dviter certains conflits au cours des procdures
dautorisation, et contribue enfin liminer les incertitudes et certains facteurs de retard.

Les plans doccupation des sols et les plans sectoriels, y compris les plans de gestion des
risques dinondation, comptent lvidence parmi les plus pertinents. Certains ont en effet
des rpercussions juridiques directes sur laffectation des terres, dautres nayant que des
incidences indirectes. Par exemple, il est frquent que les planifications spatiales rgionales
ou extensives d'un point de vue gographique ne soient pas appliques directement, mais
quelles servent de socle pour des plans plus dtaills ou de cadre pour des demandes
dautorisation, lesquelles ont par la suite des effets juridiques directs. Les plans stratgiques
intgrs sont conus pour garantir au pralable que les conditions de rfrence sont runies
pour entreprendre des projets intgrs. De tels plans doivent tre soumis des valuations
stratgiques environnementales et des valuations appropries conformment au
paragraphe 3 de larticle 6 de la directive Habitats.

Lamnagement du territoire est un processus intgrateur au cours duquel diffrentes
demandes dutilisation sont soumises un processus dvaluation. En vertu de larticle 6,
paragraphe 3 de la directive Habitats, les valuations appropries procdent des
valuations critiques des incidences potentielles du plan sur les sites Natura 2000 et
recensent dventuels amendements aux politiques ou aux propositions afin dviter les
rpercussions nfastes sur les sites Natura 2000. Lun des principaux avantages de
lvaluation approprie au stade de la planification rside dans la ncessit de prendre des
dcisions concernant le contenu du plan, lesquelles contribueront viter dventuelles
incidences ngatives de taille sur les sites Natura 2000, et ainsi de possibles conflits et
retards au niveau du projet. cet gard, les dispositions de larticle 6 ont non seulement une
valeur juridique contraignante, mais elles constituent galement un prcieux instrument pour
la planification stratgique.

La rsilience des cosystmes estuariens et ctiers peut tre renforce par des mesures
proactives damnagement des espaces naturels. De telles mesures peuvent galement tre
mises en uvre sur des terrains qui appartiennent des autorits portuaires ou
responsables des voies navigables, et destins de futurs dveloppements de ports ou de
voies deau sans tre actuellement utiliss ces fins, ou sur des terrains appartenant des
tierces parties (tat, organisations de protection de la nature, propritaires privs, etc.).
Ladoption de plans de gestion intgrs pour les estuaires classs Natura 2000 fournit ainsi
un cadre au systme de gestion et de protection devant tre mis en place pour ces zones.

14
Commission europenne, (2009), Objectifs stratgiques et recommandations concernant la politique du transport maritime de
l'UE jusqu'en 2018, Communication de la Commission au Conseil, au Parlement europen, au Comit conomique et social
europen et au comit des rgions, 13 p.

29
Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation de l'UE relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
Enfin, il convient de souligner que la contribution du public et des ONG, via une approche
participative, est indispensable un processus de planification russi. Une gestion
transparente, couple une approche qualitative, devrait inciter le public participer et
sapproprier les projets, mme si cela nvite pas forcment le risque de contentieux.

Orientations pour la planification spatiale
Lamnagement du territoire doit se fonder sur un socle de connaissances solides et
attestes comprenant toutes les informations ncessaires sur les objectifs de
conservation de la nature et sur les zones portuaires et les objectifs de
dveloppement qui y sont lis. Les besoins conomiques en termes daugmentation
des capacits des voies deau et des infrastructures portuaires constituent une
problmatique majeure, qui devra tre clairement dmontre au travers dune
planification stratgique moyen/long terme. En outre, lutilisation des capacits
existantes devra tre optimise ( laide dune meilleure coordination des
infrastructures et des capacits entre les diffrents ports europens notamment).
La planification spatiale doit tre effectue lchelle approprie (autorits
comptentes au niveau national, rgional ou local, autorits portuaires, etc.).
La planification spatiale intgre, soumise une valuation stratgique
environnementale, doit tre applique lorsque cela est possible en vue danticiper les
difficults et les incidences nfastes pour lenvironnement, et dviter dventuels
conflits et retards dans le dveloppement du projet.
Afin de mieux intgrer les politiques en faveur de la nature et des ports, il convient de
dvelopper une planification stratgique pour lunit cologique la plus prcise
possible (estuaire, district hydrographique, etc.).
La planification spatiale doit effectuer une distinction claire entre le niveau stratgique
et le niveau du projet. Il est possible de simplifier les valuations au niveau du plan
stratgique lorsque celles-ci vitent de traiter des considrations concernant de
simples dtails lis au projet.
Les plans spatiaux intgrs doivent trouver le juste quilibre entre vises
conomiques et objectifs de conservation de la nature. Ils doivent tre considrs
comme des instruments permettant de concilier et dintgrer les objectifs profitant aux
entreprises et ceux favorisant la biodiversit.
Les autorits nationales, rgionales et locales comptentes responsables de la
slection et de la gestion des sites Natura 2000 doivent travailler en troite
coopration avec les autorits charges de la planification spatiale. Toutes les parties
concernes, y compris les autorits portuaires et les autorits responsables des voies
navigables, les exploitants de terminaux, les ONG environnementales et dautres
parties prenantes publiques doivent participer ds la phase de planification, en vue de
concilier les intrts sociaux et conomiques avec les objectifs de conservation de la
nature au sein ou proximit des sites Natura 2000.
Les autorits portuaires et les administrations des voies navigables doivent tre
reprsentes dans tous les exercices de planification pertinents (y compris les plans
de gestion Natura 2000). En effet la planification stratgique contribue scuriser les
investissements synchroniss, rsoudre les problmes transfrontires, trouver
des solutions de substitution moins nfastes et, lorsque cela est justifi, des raisons
impratives dintrt public majeur ainsi qu promouvoir lamnagement despaces
naturels de manire proactive.

30
Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
Lorsquun plan ou un programme stratgique nest pas suffisamment dtaill pour
pouvoir entreprendre une valuation approprie complte conformment larticle 6,
paragraphe 3 de la directive Habitats, le rapport environnemental prpar pour
lvaluation stratgique des incidences sur l'environnement (ESIE) devrait ouvrir la
voie la ralisation dune valuation approprie au niveau du projet et, si ncessaire,
aider prparer une procdure de drogation selon les termes du paragraphe 4 de
larticle 6 de la directive Habitats. Dans ce cas, lESIE doit tout dabord recenser les
projets susceptibles davoir des impacts ngatifs significatifs sur les sites Natura 2000
et qui ncessiteraient une valuation approprie prvue par larticle 6, paragraphe 3
au cours du processus dautorisation du projet.
Il est prfrable que les effets cumulatifs des projets soient rpertoris et valus ds
le stade dlaboration des plans spatiaux.
Les autorits portuaires et celles responsables des voies navigables doivent
rechercher une affectation des sols efficace en optimisant lallocation de lespace des
activits industrielles portuaires et en faisant le meilleur usage possible des diffrents
modes de transport (navigation maritime, intrieure ou rail).
Les autorits portuaires et les autorits en charge des voies navigables doivent
envisager de prendre des mesures proactives damnagement des espaces naturels
visant amliorer la rsilience de lcosystme estuarien. La cration daires
naturelles temporaires doit tre considre lorsque lespace allou au dveloppement
portuaire nest provisoirement pas utilis cette fin. La gestion et la protection de ces
terrains devraient alors se faire dans le cadre de plans de gestion intgrs.


3.2.3. Les avantages des partenariats et de la participation du public

Orientations pour la participation du public
Les promoteurs de nouveaux projets devraient procder une valuation pralable des
consquences du dveloppement et consulter les autorits comptentes en matire de
conservation de la nature pour dterminer si leur plan est susceptible d'avoir des
incidences notables sur l'intgrit d'un site Natura 2000 ou sur ses objectifs de
conservation. Les autorits de planification doivent consulter les autorits comptentes et
les ONG ds le dbut de la phase de planification.
Au vu de la complexit de la lgislation en matire denvironnement et de zonage, il est
recommand dinstaurer des processus de consultations et de communication structurs
entre les diffrentes autorits comptentes, les parties concernes et les ONG. Les
administrations en charge du transport et de lenvironnement doivent rgulirement
communiquer entre elles et cooprer afin dassurer la progression efficace du processus
au niveau de la planification et du projet. Les autorits portuaires et responsables des
voies navigables, les exploitants ou les usagers ainsi que les ONG environnementales
doivent tre reprsents dans les processus de mise en uvre, y compris dans les
projets transfrontires.
Il convient daccorder une attention particulire aux plans et projets qui auront un impact
au-del des frontires nationales. Les pays limitrophes doivent sinformer mutuellement
et cooprer ds les premiers stades du processus de planification.




31
Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation de l'UE relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
3.3. Dveloppement de projets et activits de maintenance

On pense souvent tort que les directives Nature adoptent une approche restrictive. Il
sagit dune interprtation partant du principe que les objectifs de la politique
environnementale prvalent toujours sur ceux de la politique conomique. Mais cette logique
est en contradiction avec les principes du dveloppement durable qui visent concilier
bnfices environnementaux et exigences socitales et conomiques (voir larticle 2,
paragraphe 3, de la directive Habitats). Aussi est-il primordial de procder une
planification intgre en amont et de dvelopper des projets intgrs, puisque cela permettra
de passer une approche toujours au cas par cas mais, a contrario, inclusive et douvrir la
voie des solutions gagnant-gagnant.

Dans le domaine des voies d'eau et des ports, le statut RTE-T UE ou toute autre priorit
nationale devrait pouvoir permettre de classer un projet dans la catgorie des projets
d'intrt public majeur. Nanmoins, si, pour des raisons impratives d'intrt public majeur,
un plan ou un projet doit tre autoris, alors la directive Habitats exige une justification de
ces raisons.

Il conviendra dtudier au pralable et de manire suffisamment dtaille des solutions de
remplacement dont les incidences ngatives seraient moindres ou nulles. En outre, un plan
ou projet susceptible dentraner des effets ngatifs significatifs sur un site Natura 2000 ne
pourra tre autoris quen labsence de telles solutions. Par ailleurs, les procdures
dautorisation peuvent engendrer une incertitude juridique puisque les permis dlivrs sont
susceptibles dtre rviss, mis jour ou dtre finalement annuls. Toutefois, la bonne
application des dispositions de la directive Habitats ainsi que lintgration des objectifs de
conservation de la nature ds les premiers stades de la planification permettront de rduire
ces incertitudes.

Les orientations suivantes mettent des recommandations sur le concept de projets intgrs,
sur lutilisation correcte des valuations appropries et des problmatiques relatives aux
effets significatifs, sur le recours la gestion adaptative et lvaluation des
compensations ncessaires en dernier recours.


3.3.1. Projets intgrs et uvrer avec la nature

En 2008, la PIANC, Association internationale de navigation
15
a publi un document de prise
de position intitul uvrer avec la nature qui appelle un changement radical de
conception des projets de dveloppement en matire de navigation afin de proposer des
solutions mutuellement bnfiques. Lassociation promeut donc une approche proactive et
intgre se concentrant sur les points suivants:
- atteindre les objectifs des projets tout en tenant compte des cosystmes plutt
quvaluer les consquences dun projet prdfini;
- rechercher des solutions mutuellement bnfiques plutt que de simplement minimiser
les dommages cologiques;
- uvrer avec la nature considre en premier lieu les objectifs du projet du point de vue
du systme naturel plutt que de celui de la conception technique. Il sagit avant tout
dappliquer cette logique dans les phases initiales dun projet, lorsque la marge de
manuvre est encore grande. Cependant, une approche proactive telle quuvrer avec

15
http://www.pianc.org

32
Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
la nature ne doit pas sappliquer uniquement aux projets mais aussi au dveloppement
de plans et de programmes stratgiques (voir la partie sur planification intgre).

Si la conception dtaille dun projet a progress avant que les questions environnementales
naient t prises en considration, lvaluation de limpact du projet sur lenvironnement
devient invitablement un exercice de compensation ou de limitation des dommages, ce qui
risque daboutir des solutions non optimales ou des opportunits non saisies. uvrer
avec la nature a pour objectif de dpasser cette approche consistant viter ou rduire les
impacts environnementaux dune conception prdfinie. Ce concept cherche plutt
identifier les manires datteindre les objectifs du projet en travaillant avec les processus
naturels, afin dobtenir des rsultats de protection environnementale, de restauration ou de
renforcement environnemental.

Une approche comparable a aussi t mise lessai pour des projets de rduction du risque
dinondation aux Pays-Bas puis dveloppe dans le cadre du projet Interreg SAND. Baptise
Conception intgrale, cette approche se fondait sur diffrents plans intgrs visant
maximiser les bnfices pour tous et, dans le mme temps, atteindre lobjectif principal du
projet de manire efficace et rentable.

Cette approche gnrale, en phase avec la directive Habitats, est par ailleurs vivement
recommande puisquelle est en accord avec le principe selon lequel il convient avant tout
d'viter ou de corriger tout dommage cologique la source. Il reste toutefois ncessaire de
procder une valuation approprie (article 6, paragraphe 3) si les effets significatifs sur un
site Natura 2000 ne peuvent tre vits. Dune manire gnrale, les mesures prventives
ou dvitement sont privilgier par rapport aux mesures compensatoires.


Orientations pour uvrer avec la nature
La conception de projet doit se faire sur la base de stratgies gagnant-gagnant visant
atteindre les objectifs de conservation des sites Natura 2000 autant que les objectifs
socio-conomiques.
Les projets doivent intgrer les concepts tablis par uvrer avec la nature, ce qui
suppose de tenir compte la fois des objectifs pertinents de conservation des sites
Natura 2000 et des objectifs techniques du projet ds le dbut de la conception et du
dveloppement de ce dernier.
Dune manire gnrale, les mesures de prvention ou dvitement des dommages sont
toujours privilgier par rapport aux mesures compensatoires.


3.3.2. Comment grer lvaluation approprie et les incidences notables quun projet
est susceptible davoir sur lenvironnement?

La Commission europenne a dj publi un document dorientation destin aider les tats
membres et les exploitants comprendre et appliquer larticle 6 de la directive Habitats
(voir annexe 1). Les orientations ci-aprs touchent spcifiquement aux voies navigables et
aux activits portuaires.

Lcologie et la biodiversit dpendent de conditions locales (variabilit et complexit des
facteurs biotiques et abiotiques) ainsi que de lvolution dans le temps et dans lespace. Les
termes appropri ou notable ne sont en rien des concepts normatifs et toute valuation
doit tenir compte des conditions locales (au cas par cas). Comme le souligne Stojanovic & al.
(2006), chaque port tant unique dun point de vue gographique, hydrographique et

33
Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation de l'UE relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
commercial, une seule stratgie proposant des solutions de gestion environnementale
prdfinies ne saurait tre approprie malgr de nombreuses problmatiques communes.

Le mme raisonnement peut sappliquer la gestion des estuaires tant donn que les
caractristiques des cosystmes sont lies, entre autres, la situation gographique dun
estuaire donn. Il est donc ncessaire de procder une analyse spcifique pour chaque
site. Ainsi, une valuation approprie doit-elle tenir compte de tous les facteurs et objectifs
de conservation locaux et tre fonde sur les meilleures preuves scientifiques disponibles.


3.3.3. Relation entre ESIE, EIE et valuations appropries

Il existe de nombreuses similarits entre les procdures menes au titre de la directive
Habitats dans le cadre dune part des ESIE et des EIE, et dautre part des valuations
appropries des plans et projets touchant les sites Natura 2000. Mais cela ne signifie pas
pour autant quelles sont identiques. Ces valuations prsentent au contraire dimportantes
diffrences. Ainsi, lESIE ou lEIE ne peut se substituer une valuation approprie, aucune
de ces procdures ne supplantant lautre.

Pour autant, les procdures dESIE/EIE et lvaluation approprie peuvent tre menes en
parallle. De mme, les informations affrentes lvaluation approprie peuvent venir
complter le processus de lEIE/ESIE. Cependant, dans de tels cas, lvaluation approprie
devra apparatre de manire claire et distincte dans le rapport sur les incidences
environnementales de lESIE ou dans la documentation environnementale de lEIE, ou bien
tre soumise dans un rapport spar de telle sorte que les rsultats puissent tre
diffrenciables de ceux de lEIE ou de lESIE gnrale

Lune des principales diffrences entre les ESIE/EIE et les valuations appropries de la
directive Habitats, hormis le fait quelles mesurent des aspects distincts du milieu naturel
et ne tiennent pas compte des mmes critres pour dterminer la notion dincidence
notable, rside dans leur manire de faire usage des rsultats de lvaluation. cet gard,
les ESIE et les EIE fixent essentiellement des rgles de procdure et ntablissent aucune
norme environnementale obligatoire. Au contraire, lvaluation mene au titre de la directive
Habitats dfinit des obligations de contenu, principalement parce quelle introduit une
norme environnementale, savoir lobjectif de conservation dun site Natura 2000 et le
besoin de prserver son intgrit.

En dautres mots, si lvaluation approprie ne peut tablir avec certitude que le plan ou
projet nentranera aucune consquence ngative sur lintgrit du site Natura 2000,
lautorit ne peut alors autoriser le plan ou projet en ltat, sauf si, dans des cas
exceptionnels, elle invoque une procdure extraordinaire dans le cadre de plans et projets
considrs comme dintrt public majeur et pour lesquels il nexiste pas de solution
alternative.

Pour leur part, les ESIE/EIE ont pour objectif de faire prendre pleinement conscience aux
autorits charges de lamnagement du territoire des rpercussions sur lenvironnement du
plan ou projet propos, de sorte ce que ces dernires soient prises en compte dans leur
dcision finale. Les prcisions susmentionnes sont rsumes dans le tableau de
lannexe 4.


Orientations pour les valuations

34
Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
Limportance des incidences dun plan ou dun projet dpend fortement des
caractristiques et des objectifs de conservation du site en question (tous prciss
dans le formulaire standard de donnes, les actes de dsignation de zones spciales
de conservation, les priorits de conservation, le plan de gestion, etc.).
Lorsquun projet de dveloppement portuaire ou des voies deau qui y sont relies est
propos, il est impratif de passer par une tape dvaluation prliminaire. Si celle-ci
dmontre une faible probabilit deffets significatifs sur les sites Natura 2000,
lautorit comptente pourra alors dcider de lever lobligation dune valuation
approprie des incidences du projet sur le site au vu des objectifs de conservation,
conformment aux dispositions du paragraphe 3 de larticle 6 de la directive
Habitats. Lvaluation du risque deffets significatifs doit se faire sur la base de
critres scientifiques et, entre autres, la lumire des caractristiques et conditions
environnementales propres au site concern par un tel plan ou projet. Les facteurs
tels que ltendue, lampleur, la complexit, la probabilit, la dure, la frquence et
lventuelle rversibilit des incidences du projet ou plan doivent tre pris en
considration par les autorits comptentes.
Si lanalyse dinformations objectives ne permet pas dexclure quun projet ait des
effets significatifs sur un site Natura 2000, soit individuellement soit en conjugaison
avec dautres plans et projets, alors une valuation approprie, comme prvue par
larticle 6, paragraphe 3, doit tre ralise.
Aprs une valuation approprie approfondie comprenant la compilation de toutes les
donnes pertinentes, et en fonction de la rversibilit des actions, les incertitudes
mineures restantes ne doivent pas retenir ou empcher lvolution du projet
indfiniment. Il convient donc dapprcier ces situations au cas par cas. Si des
incertitudes demeurent concernant certains mcanismes particuliers dcosystmes
ctiers ou estuariens, il incombe alors aux promoteurs du dveloppement des
installations portuaires et des voies deau dvaluer ces incertitudes et de les grer
laide de suivis cibls et de stratgies dadaptation. Des systmes de surveillance
devront tre conus afin de signaler suffisamment tt tout lment ou toute situation
inattendus pour que des mesures correctives efficaces puissent tre prises.
Labsence deffets ngatifs venant parfois du fait que les incidences prvues ne
dpassent pas les valeurs seuils dfinies, le suivi des impacts eu gard aux seuils est
donc important. Par ailleurs, les valeurs seuils doivent toujours tre justifies par des
critres scientifiques.
Dans le cadre dune valuation approprie, les informations fournies doivent traiter de
toutes les caractristiques du projet ou du plan susceptibles davoir une incidence sur
le site, de lintgralit de la zone qui sera touche, des caractristiques des autres
projets ou plans dont les incidences sont susceptibles de produire des effets
cumulatifs avec celles du projet en question, de toute initiative, existante ou prvue,
relative la prservation de la nature et susceptible davoir une incidence sur le
statut du site dans le futur, de la relation (la distance par exemple) entre le projet ou
le plan et le site Natura 2000, et des exigences (EIE/ESIE notamment) des organes
ou agences chargs des autorisations.
Les informations relatives au site protg doivent inclure: les objectifs de
conservation du site Natura 2000 en question, ltat de conservation et autres
attributs essentiels des habitats de lannexe I et des espces de lannexe II sur le
site, les caractristiques physiques et chimiques du site susceptible dtre touch par
le projet, la dynamique et lcologie des habitats, des espces, des aspects du site
sensibles au changement, des principales relations structurelles et fonctionnelles qui
dfinissent et maintiennent lintgrit du site, les autres problmatiques de

35
Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation de l'UE relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
conservation propres au site, notamment les futurs changements naturels probables
et la mesure dans laquelle ces volutions demandent tre gres pour atteindre les
objectifs de conservation du site.
Les mesures visant liminer ou rduire les effets notables (attnuation) devront tre
prvues ds la phase de conception du projet, et pourront si ncessaire tre
compltes lors de lvaluation approprie (rvision du projet, mesures dattnuation
supplmentaires). Il est alors possible que le projet parvienne un stade o il ne
portera plus atteinte lintgrit du site concern.


3.3.4. Les systmes de compensation et leur suivi

Remarque importante: la Commission a publi des orientations en relation directe avec les
dispositions du paragraphe 4 de larticle 6 de la directive Habitats. Il convient de les lire
conjointement avec la section suivante (voir annexe 1 pour les rfrences).

Orientations pour les indemnisations
Dans les cas o des projets dommageables, en labsence de mesures de
remplacement, seraient autoriss, il conviendra de prvoir des mesures
compensatoires pour indemniser toute perte ou dommage inflig au site. Ces
mesures devront tre adaptes au type dincidence prvue et devront porter plus
particulirement sur la cohrence du rseau Natura 2000 et sur les lments
prcisment touchs au niveau du site. Cela implique quelles fassent rfrence aux
aspects structurels et fonctionnels de lintgrit du site, aux diffrents types dhabitats
et despces touchs et la contribution de ces lments la cohrence globale du
rseau Natura 2000.
Les mesures compensatoires doivent tre ralisables et assurer la protection de la
cohrence globale du rseau Natura 2000. Le calendrier prvu ainsi que toute
initiative de maintenance requise pour augmenter la performance devraient tre
prciss ds que possible dans le droulement du projet. Une fois le systme de
compensation dfini, les permis octroys et le programme de suivi mis en place,
lapparition de nouvelles incertitudes imprvues ne devrait en principe pas empcher
lessentiel de la ralisation du plan ou du projet. Mais au cas o une telle situation se
produirait, il conviendra de lancer des recherches cibles et, au besoin, dtendre le
suivi ainsi que les mesures dadaptation ou correctives.
Il convient de quantifier les pertes relatives aux espces et habitats selon les
connaissances actuelles et lavis des experts. Les mesures compensatoires devront
tre tablies sur la base des meilleures connaissances scientifiques et remplir les
fonctions cologiques ncessaires au soutien des espces et habitats touchs.
Le ratio entre dommages cologiques et bnfices environnementaux rsultant des
compensations doit tre valu. tant largement admis que les ratios entre
compensations et dommages doivent gnralement tre bien suprieurs 1:1, les
rapports infrieurs ou gaux 1:1 ne devraient tre tudis que sil est dmontr que
de telles mesures permettent une restauration 100 % de la structure et de la
fonctionnalit du site dans un court laps de temps.
Pour bnficier de compensations, les sites devront tre choisis en tenant compte des
points suivants:


36
Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
(a) compensation au sein du site Natura 2000 si les lments garantissant la
cohrence cologique et la fonctionnalit du rseau existent sur le site en
question;
(b) compensation en dehors du site Natura 2000 si la mme contribution au rseau
cologique est ralisable. Il peut sagir, pour le nouvel emplacement, dun site
Natura 2000 dsign ou non. Dans le second cas, la zone doit tre classe
Natura 2000.
Les mesures compensatoires doivent garantir la continuit des processus
cologiques essentiels pour prserver la cohrence globale du rseau Natura 2000
et devraient tre dj en place au moment o les effets ngatifs se produiront sur le
site. La mise en uvre de ces mesures le plus tt possible demeure essentielle et
lapplication de mesures dattnuation spcifiques visant couvrir les pertes
potentiellement survenues dans lintervalle peut savrer ncessaire.
Toutes les dispositions techniques, juridiques ou financires, ncessaires pour mettre
en uvre les mesures compensatoires devraient tre tablies avant le dmarrage du
plan ou du projet afin dviter tout retard imprvu susceptible de nuire lefficacit
des mesures.
Financement, suivi et rapports: les mesures compensatoires impliquent quun socle
juridique et financier solide soit dfini en avance afin de pouvoir en garantir la mise en
uvre, la protection, le suivi et le maintien long terme.


3.3.5. Gestion des activits de dragage et de maintenance

Dans le cas des ports situs sur des estuaires ou proximit, il peut arriver que la voie
d'accs emprunte par les navires traverse des sites Natura 2000 dsigns. Pour la plupart
des ports, le dragage reste un impratif permettant de maintenir les voies navigables et les
routes maritimes accessibles, ce qui peut tre une source de conflits potentiels avec
lobligation de prserver lintgrit dun site Natura 2000. Cependant, les activits de dragage
de maintenance, telles que le dragage de maintenance priodique ou continu, peuvent tre
conues de manire ne pas entraner d'effets ngatifs pour l'intgrit du site Natura 2000
ou pour ses objectifs de conservation.

Il est possible d'liminer les matires enleves par dragage tout en respectant les estuaires.
En dplaant les sdiments de faon approprie (notamment dans des zones dun estuaire
o il y a un manque de sdiments), les oprations de dragage peuvent mme avoir des
effets positifs sur ltat de conservation des estuaires. Les connaissances et bonnes
pratiques rcentes ont montr que des plans de dplacement de sdiments bien conus
peuvent contribuer la reconstruction de structures morphologiques importantes au sein des
estuaires et quils offrent mme dintressants avantages pour lenvironnement.

Le dveloppement de concepts innovants en matire de dragage, accompagns de stricts
systmes de suivi, peuvent contribuer atteindre la fois les objectifs de navigation et les
objectifs de conservation Natura 2000. Dans un contexte de recherche de solutions
appropries au dragage de maintenance durable, le concept dun systme de gestion
durable des activits de dragage et des sdiments est de plus en plus souvent privilgi. Un
tel systme pourrait contribuer viter problmes, conflits et retards et, le cas chant,
maximiser les effets positifs potentiels sur ltat de conservation des estuaires et des zones
ctires.

Le recours aux pratiques de gestion durable des activits de dragage et des sdiments
attnuera encore les effets potentiels des oprations de maintenance dans les canaux de

37
Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation de l'UE relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
navigation, sans toutefois carter automatiquement la ncessit de lvaluation prvue
larticle 6, paragraphe 3, de la directive Habitats. Les stratgies de dragage durables
proposes devront tre accompagnes des informations dont lautorit comptente aura
besoin pour juger de la probabilit des effets ngatifs possibles sur un site Natura 2000.

En tant quactivits rcurrentes, le dragage de maintenance et le dplacement de sdiments
peuvent tre utiles dans le cadre dun systme de gestion durable des activits de dragage
et des sdiments, tant pour atteindre les objectifs de navigation que pour contribuer aux
objectifs de conservation Natura 2000.

Les six tapes suivantes sont essentielles la prparation et la mise en uvre de
programmes de gestion durable des activits de dragage et des sdiments:
- comprendre les caractristiques physiques (morphologie, hydrologie, salinit, etc.) de la
zone concerne;
- rassembler les informations ncessaires sur les oprations de dragage afin de pouvoir en
valuer lincidence environnementale en dtail;
- valuer lincidence des oprations de dragage sur lenvironnement naturel (sur la
morphologie et lhydrodynamique de lestuaire, sur les espces et habitats sensibles,
court et long termes);
- slectionner les pratiques les plus adaptes, en dcrivant toutes les solutions
susceptibles d'attnuer les effets ngatifs et, en dernier recours, examiner les mesures
compensatoires envisageables sil nest pas possible dviter tous les effets nfastes
majeurs par lapplication des mesures dattnuation;
- mettre en place un programme de suivi faisant le point sur l'tat d'avancement des
objectifs environnementaux;
- assurer la participation des parties prenantes dans les diffrentes tapes afin dviter les
plaintes et les retards;

Lvaluation des activits de dragage ainsi que du devenir des matires enleves par
dragage dans les environnements marins est soumise des conventions internationales,
notamment la Convention de Londres, OSPAR, HELCOM, et les Conventions de Barcelone
et de Bucarest.

Orientations concernant les travaux neufs de dragage
Les travaux neufs de dragage doivent tre intgrs aux programmes de gestion
durable des activits de dragage et des sdiments. Lorsque des effets significatifs sur
un site Natura 2000 ne peuvent tre vits, que ce soit ou non en conjugaison avec
dautres plans ou projets, les travaux doivent faire lobjet dune valuation approprie
conformment aux dispositions de larticle 6, paragraphe 3, de la directive Habitats.
De bonnes stratgies de dragage et de dplacement des sdiments devraient aider
attnuer les effets ngatifs et, le cas chant, restaurer ou amnager des structures
morphologiques importantes et ainsi aboutir des amliorations environnementales
(travailler en tenant compte de la nature).
Les stratgies de dragage et de dplacement des sdiments devront tre conues de
manire maximiser leurs effets positifs potentiels et tre accompagnes de des
systmes de suivi efficaces.

Orientations concernant les activits de maintenance rcurrentes, notamment le dragage de
maintenance

38
Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
Les activits de maintenance rcurrentes doivent tre conues et pratiques de
manire faire en sorte quelles ne nuisent pas lintgrit des sites Natura 2000 ou
leurs objectifs de conservation. Dans la mesure du possible, il convient de
maximiser leurs effets positifs potentiels sur ltat de conservation des estuaires et
zones ctires par le recours des stratgies de gestion durable des sdiments.
Lorsque faire se peut, les activits de maintenance rcurrentes devront tre
comprises dans les plans de gestion intgrs Natura 2000, dans des plans de gestion
quivalents ou dans les plans de gestion des districts hydrographiques afin de faire
en sorte que leur valuation et leur rvision seffectuent de manire structure dans
un contexte gnral de conservation des sites.
Les oprations de maintenance au sein ou proximit dun site Natura 2000 devront
tre spcialement conues pour chaque estuaire ou zone ctire et appuyes par un
systme de suivi assurant la dtection et la correction dans les plus brefs dlais de
tout effet ngatif imprvu sur les objectifs de conservation.
Si, eu gard notamment la rgularit ou la nature des oprations de maintenance
ou aux conditions dans lesquelles elles sont ralises, de telles oprations peuvent
tre considres comme une seule opration, plus particulirement lorsquelles sont
prvues pour maintenir le tirant deau dune voie navigable un certain niveau au
moyen dun dragage normal, alors ces activits peuvent tre considres comme un
seul et unique projet au titre de la directive Habitats.
Dans ce cas, si un tel projet a t autoris avant l'expiration du dlai de transposition
de la directive, il ne sera pas soumis un examen pralable de ses incidences sur le
site concern. Cependant, sur un site Natura 2000, les travaux de maintenance sont
soumis lobligation gnrale de protection prvue par larticle 6, paragraphe 2, de la
directive Habitats consistant viter la dtrioration des habitats naturels et des
habitats despces ainsi que les perturbations importantes qui touchent les espces
pour lesquelles le site a t dsign Natura 2000
16
.
Les oprations de maintenance ralises lors de chaque intervention sur les voies
navigables doivent parfois tre considres comme des projets distincts, notamment
cause de changements dans les techniques utilises, des conditions dans
lesquelles elles sont ralises ou de leur rgularit. Dans ces cas prcis, chaque
projet, dans la mesure o il est susceptible davoir un effet significatif sur le site
concern, devra tre soumis une valuation de ses incidences conformment aux
dispositions de larticle 6, paragraphe 3, de la directive Habitats.
Les dispositions de larticle 6, paragraphe 2, restant toujours applicables, les tats
membres devront dterminer si leurs oprations courantes sont susceptibles
dentraner une dtrioration des habitats ou des habitats despces et, si ncessaire,
prendre les mesures ncessaires pour viter une telle dtrioration.


16
Voir aussi le jugement rendu par la Cour de justice de lUnion europenne le 14 janvier 2010 dans laffaire C-226/08 (Stadt
Papenburg v Bundesrepublik Deutschland)


39
Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation de l'UE relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires

3.4. Faire face aux incertitudes: la gestion adaptative

Lors dvaluations appropries de plans ou projets au titre du paragraphe 3 de larticle 6, de
la directive Habitats, il peut tre ncessaire de faire jouer le principe de prcaution.
Lvaluation devrait alors consister dmontrer de manire objective quil ny aura pas
deffets ngatifs sur lintgrit du site Natura 2000. Cette dmonstration devra sappuyer sur
des preuves ainsi que sur les meilleures connaissances scientifiques disponibles et
entreprendre les tudes ncessaires le cas chant. Toutefois, la gestion adaptative peut
galement savrer utile lorsque, du fait des limites de la science ou dincertitudes sur le
fonctionnement dcosystmes complexes et dynamiques, les autorits comptentes ne sont
pas en pleine mesure de garantir labsence deffets ngatifs.

Lorsque labsence deffets ngatifs significatifs dun plan ou dun projet sur un site
Natura 2000 ne peut tre garantie, le rgime de drogation au titre du paragraphe 4 de
larticle 6 de la directive Habitats tablit que le plan ou le projet ne peut tre autoris quen
labsence de solutions de remplacement, sil est justifi par des raisons impratives d'intrt
public majeur et si les mesures compensatoires ncessaires sont prises pour protger la
cohrence globale du rseau Natura 2000. Si un plan ou un projet relve de ces dispositions
(ce qui est probable dans la plupart des projets de dveloppement portuaire), il est alors
essentiel den clarifier les diffrents aspects ds les phases initiales du plan ou du projet
puisquils constituent des lments cls dans le cadre de sa conception, de son financement
et de la procdure dautorisation.

Il peut tre ncessaire d'adopter une approche souple pour la mise en uvre d'un plan, d'un
projet ou d'un rgime compensatoire si, en raison des incertitudes lies diffrents facteurs
(emplacement, fiabilit, retards imprvus) il est impossible de dfinir de manire
suffisamment dtaille tous les effets de ce plan, projet ou rgime, et si ces incertitudes ne
peuvent tre prises en compte au travers de ratios revus la hausse. Dans ce cas, il faut
prvoir un systme de suivi rigoureux ainsi qu'un train de mesures correctives appropries
valid et prtabli. Ces mesures doivent permettre d'adapter les mesures d'attnuation et/ou
les mesures compensatoires en fonction des incidences et de faire en sorte que tous les
effets ngatifs qui n'avaient pas t prvus l'origine soient neutraliss.

Les guides dj publis (voir annexe 1) fournissent des orientations dtailles sur le concept
de raison imprative dintrt public majeur et sur la manire dexaminer les solutions de
remplacement.

Orientations pour la gestion adaptative
Sil savre impossible dviter des incidences ngatives importantes mme laide
de mesures compensatoires, la dcision dautoriser un projet doit alors tre motive
par des raisons impratives dintrt public majeur ainsi que par labsence de
solutions alternatives moins nfastes, conformment aux dispositions du
paragraphe 4 de larticle 6 de la directive Habitats.
Dans le cas o des incertitudes scientifiques demeurent en ce qui concerne les effets
des mesures dattnuation ou compensatoires, ces mesures devront inclure un
systme de suivi des effets rels, valid et prtabli, ainsi quun cadre, tel quun plan
de gestion Natura 2000, un plan intgral ou une srie de mesures, permettant
dadapter les mesures compensatoires et dattnuation aux incidences relles.


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Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
Orientations pour les solutions de remplacement
Dans le cas dincidences ngatives attendues, il convient de dfinir diffrentes
solutions de remplacement permettant datteindre les objectifs du plan ou du projet et
de les examiner au regard de leur incidence potentielle sur les objectifs de
conservation des sites Natura 2000.
Les autorits comptentes ne sauraient se limiter considrer les seules solutions de
remplacement proposes par les promoteurs de projets ou de plans. Il est de la
responsabilit des autorits comptentes denvisager des solutions de substitution.
Lors de lexamen des diffrentes solutions de remplacement, il convient de consulter
lensemble des agences et organismes concerns. Les informations dtailles sur
lesdites solutions et leur incidence sur les sites Natura 2000 touchs devront faire
tat de leurs sources. Par ailleurs, le principe de prcaution devra sappliquer.



41
Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation de l'UE relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
Annexe 1: Communications de la Commission europenne et
documents dorientation
Documents dorientation de la CE relatifs aux directives Oiseaux et Habitats
- Commission europenne (2000), Grer les sites Natura 2000: les dispositions de
larticle 6 de la directive Habitats (92/43/CEE). Luxembourg: Office des
publications officielles des Communauts europennes.
http://ec.europa.eu/environment/nature/natura2000/management/docs/art6/provision_
of_art6_fr.pdf
- Commission europenne, (2002), valuation des plans et projets ayant des
incidences significatives sur des sites Natura 2000. Guide de conseils
mthodologiques de larticle 6, paragraphes 3 et 4, de la directive Habitats
92/43/CEE. Luxembourg: Office des publications officielles des Communauts
europennes.
http://ec.europa.eu/environment/nature/natura2000/management/docs/art6/natura_20
00_assess_fr.pdf
- Commission europenne (2007), Document d'orientation concernant l'article 6,
paragraphe 4, de la directive Habitats 92/43/CEE. Clarification des concepts de:
solutions alternatives, raisons impratives dintrt public majeur, mesures
compensatoires, cohrence globale, avis de la Commission.
http://ec.europa.eu/environment/nature/natura2000/management/docs/art6/guidance_
art6_4_fr.pdf
- Commission europenne (2007), Document dorientation sur la protection stricte des
espces animales dintrt communautaire en vertu de la directive Habitats
92/43/CEE, 87 pp.
http://circa.europa.eu/Public/irc/env/species_protection/library?l=/commission_guidan
ce/french/env-2007-00702-00-00-fr-/_EN_1.0_&a=d (en anglais).
Principaux documents dorientation de la CE relatifs la directive-cadre sur leau
- Commission europenne (2003), Stratgie commune pour la mise en uvre de la
directive-cadre sur l'eau (2006/60/CE), Transitional and coastal waters-Typology,
Reference conditions and classification systems, Guidance Document No 5
(Document dorientation n5, Typologie des eaux ctires et de transition, Conditions
de rfrence et systmes de classification). Luxembourg: Office des publications
officielles des Communauts europennes, 116 pp (en anglais).
http://circa.europa.eu/Public/irc/env/wfd/library?l=/framework_directive/guidance_docu
ments&vm=detailed&sb=Title (en anglais).
- Commission europenne (2003), Stratgie commune pour la mise en uvre de la
directive-cadre sur l'eau (2006/60/CE), Identification and Designation of Heavily
Modified and Artificial Water Bodies, Guidance Document No 4 (Document
dorientation n4, Recensement et dsignation des masses deau fortement modifies
et artificielles), Luxembourg: Office des publications officielles des Communauts
europennes, p. 14 (en anglais).
http://circa.europa.eu/Public/irc/env/wfd/library?l=/framework_directive/guidance_docu
ments&vm=detailed&sb=Title (en anglais).

42
Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
- Commission europenne (2006), Stratgie commune pour la mise en uvre de la
directive-cadre sur l'eau. Exemptions to the environmental objectives under the Water
Framework Directive allowed for new modifications or new sustainable development
activities (WFD Article 4.7) (Drogations aux objectifs environnementaux de la
directive cadre sur leau accordes en raison de nouvelles modifications ou de
nouvelles activits de dveloppement durable (DCE article 4, paragraphe 7)), note
dorientation (en anglais).
http://circa.europa.eu/Public/irc/env/wfd/library?l=/framework_directive/thematic_docu
ments/environmental_objectives&vm=detailed&sb=Title
- Commission europenne (2006), WFD and Hydro-morphological pressures: Focus on
hydropower, navigation and flood defence activities Recommendations for better
policy integration (DCE et pressions hydromorphologiques: zoom sur lnergie
hydrolectrique, la navigation et les activits de protection contre les inondations,
Recommandations pour une meilleure intgration politique), note dorientation, 44 pp
(en anglais).
http://circa.europa.eu/Public/irc/env/wfd/library?l=/framework_directive/thematic_docu
ments/hydromorphology&vm=detailed&sb=Title (en anglais).
- Commission europenne (2006), WFD and Hydro-morphological pressures, Good
practice in managing the ecological impacts of hydropower schemes; flood protection
works; and works designed to facilitate navigation under the Water Framework
Directive (DCE et pressions hydromorphologiques, Bonnes pratiques de gestion des
impacts cologiques des programmes dnergie hydrolectrique; travaux de
protection contre les inondations; et travaux visant faciliter la navigation en
respectant la directive cadre sur leau), 68 pp (en anglais).
http://circa.europa.eu/Public/irc/env/wfd/library?l=/framework_directive/thematic_docu
ments/hydromorphology&vm=detailed&sb=Title (en anglais).
Rapports de la CE relatifs aux politiques maritimes et portuaires
- Commission europenne, (2006), Vers une politique maritime de lUnion: une vision
europenne des ocans et des mers, livre vert, 49 pp. COM (2006) 27
http://eur-
lex.europa.eu/LexUriServ/LexUriServ.do?uri=COM:2006:0275:FIN:FR:HTML
- Commission europenne, (2006), Les autoroutes de la mer: Une alternative au
transport routier de marchandises en Europe, Luxembourg: Office des publications
officielles des Communauts europennes, 6 pp.
http://ec.europa.eu/transport/intermodality/motorways_sea/doc/2006_motorways_sea
_brochure_fr.pdf
- Commission europenne, (2007), Une politique maritime intgre pour l'Union
europenne, 17 pp. COM (2007) 575
http://eur-lex.europa.eu/LexUriServ/LexUriServ.do?uri=COM:2007:0575:FIN:FR:PDF
- Commission europenne, (2007), Communication sur une politique portuaire
europenne, 16 pp. COM (2007) 616.
http://eur-lex.europa.eu/LexUriServ/LexUriServ.do?uri=COM:2007:0616:FIN:FR:PDF
- Commission europenne, (2009), Objectifs stratgiques et recommandations
concernant la politique du transport maritime de lUE jusquen 2018, Communication
de la Commission au Conseil, au Parlement europen, au Comit conomique et
social europen et au Comit des rgions, DG Transport et nergie, 19 pp.

43
Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation de l'UE relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
http://eur-lex.europa.eu/LexUriServ/LexUriServ.do?uri=COM:2009:0008:FIN:fr:PDF
Documents dorientation relatifs la GIZC et aux zones ctires
- Commission europenne, (2002), Recommandation relative la mise en uvre
dune stratgie de gestion intgre des zones ctires en Europe (2002/413/CE).
http://eur-
lex.europa.eu/LexUriServ/LexUriServ.do?uri=OJ:L:2002:148:0024:0027:FR:PDF
- Commission europenne, (2004b), Vivre avec lrosion ctire en Europe, Espaces
et sdiments pour un dveloppement durable, EUrosion, Luxembourg: Office des
publications officielles des Communauts europennes, 44 pp.
http://www.eurosion.org/project/eurosion_fr.pdf
-
Autres documents dorientation de la CE
- Commission europenne, (2004), Development of a Guidance Document on
Strategic Environmental Assessment (SEA) and Coastal Erosion (laboration dun
document dorientation sur lvaluation environnementale stratgique (EES) et
lrosion ctire), Luxembourg: Office des publications officielles des Communauts
europennes, 72 pp (en anglais).
http://ec.europa.eu/environment/iczm/pdf/coastal_erosion_fin_rep.pdf
- Commission europenne, (2006), Enrayer la diminution de la biodiversit
lhorizon 2010 et au-del, Prserver les services cosystmiques pour le bien-tre
humain, Luxembourg: Office des publications officielles des Communauts
europennes, 15 pp. COM (2006) 216.
http://eur-lex.europa.eu/LexUriServ/LexUriServ.do?uri=COM:2006:0216:FIN:FR:PDF
- Commission europenne, (2007), Adaptation au changement climatique en Europe:
les possibilits daction de lUnion europenne, livre vert, 27 pp. COM (2007) 354.
http://eur-lex.europa.eu/LexUriServ/site/fr/com/2007/com2007_0354fr01.pdf
- Commission europenne, (2007), Agenda pour un tourisme europen comptitif et
durable, Communication de la Commission, COM (2007) 621 final.
http://eur-
lex.europa.eu/LexUriServ/LexUriServ.do?uri=CELEX:52007DC0621:fr:HTML
- Commission europenne, (2010), L'Europe, premire destination touristique au
monde - un nouveau cadre politique pour le tourisme europen, Communication de la
Commission, COM (2010) 352 final.
http://ec.europa.eu/enterprise/sectors/tourism/files/communications/communication20
10_fr.pdf




44
EC Guidance on the implementation of the EU nature legislation in estuaries and coastal zones
Annexe 2: Quelques initiatives prives dans le secteur portuaire

1. Ecoports (voir www.ecoports.com, en anglais)
Ecoports est un projet de recherche et dveloppement lanc en 2002 et cofinanc lorigine
par la Commission europenne et 12 ports et organisations portuaires. Ecoports avait pour
principal objectif dharmoniser lapproche de la gestion de lenvironnement dans les
administrations portuaires europennes, via la mise en place dun systme de gestion
environnementale, le partage des expriences ainsi que ladoption de bonnes pratiques
concernant les problmatiques environnementales lies aux zones portuaires.

2. ESPO, Code de bonnes pratiques environnementales (voir www.espo.be, en anglais)
En 1994, lorganisation europenne des ports maritimes communautaires (European Sea
Ports Organisation, ESPO) a publi son premier Code europen de pratiques
environnementales (European Environmental Code of Practice), visant exprimer
lengagement collectif des administrations portuaires en faveur de lamlioration de
lenvironnement. Ce code a donc mis un ensemble de recommandations sur lintgration
des politiques de protection de lenvironnement dans tous les aspects de leurs activits. En
2002, lESPO a ralis une tude sur lincidence des directives Oiseaux et Habitats sur
le dveloppement portuaire. Les principaux rsultats et recommandations ont t publis
en 2007 dans le Code de pratiques de lESPO sur les directives Oiseaux et Habitats.

3. Paralia Nature (voir www.imiparalianature.org, en anglais)
Le projet Paralia Nature, qui date de dcembre 2000, est une plateforme informelle sur
laquelle il est possible de discuter de la directive Habitats et des questions et projets qui
sy rapportent. Il vise dvelopper une large coopration multidisciplinaire entre les
gouvernements, les ports, les universits, les ONG et les centres de connaissance pour
changer les expriences et informations de chacun.

4. NEW! Delta project (Interreg IIIB - Europe du Nord-Ouest, voir www.newdelta.org)
Le projet NEW! Delta, lanc en juillet 2004, tait galement centr sur la mise en uvre des
directives Oiseaux et Habitats. Ce projet a rassembl 10 partenaires issus de 4 pays de
lEurope du Nord-Ouest (Angleterre, France, Belgique et Pays-Bas), notamment des
autorits portuaires, des administrations rgionales et des institutions de recherche.

5. SedNet (5
e
programme cadre RDT, voir www.sednet.org, en anglais)
Le rseau des sdiments (Sediment Network, SedNet) est un rseau europen qui vise
intgrer les problmatiques lies aux sdiments et les connaissances sur le sujet dans les
stratgies europennes afin de soutenir des objectifs environnementaux et de dvelopper de
nouveaux outils pour la gestion des sdiments.

6. TIDE (Interreg IV B programme de la mer du Nord, voir www.tide-project.eu/, en anglais)
Le projet interrgional TIDE a vu le jour en septembre 2009. Il a pour but dintgrer la gestion
des estuaires servant de chenaux de navigation pour accder dimportants ports maritimes
o la mare a une forte influence et o le taux de transport des sdiments est
particulirement lev. Un partenariat form entre des autorits portuaires, des agences
environnementales et la recherche scientifique des estuaires de lElbe, de la Scheldt, de
lHumber et de la Weser permet lchange des expriences de chacun et le dveloppement
doutils et de mesures pilotes pour une gestion intgre des estuaires.

45
Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation de l'UE relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
Annexe 3: liste de contrle de lESPO sur les bonnes pratiques pour
parvenir un quilibre entre Natura 2000 et le dveloppement et le
fonctionnement des ports et voies navigables (dcembre 2009)

Cette liste de contrle sert dexemple aux tat membres qui peuvent envisager de ladopter
pour leur servir dorientation et leur apporter des certitudes juridiques quant leurs activits
en tant que promoteurs et exploitants de ports et de voies navigables.

Amnagement du territoire et planification intgre
Les activits existantes sur les ports et les voies navigables sont soigneusement
values, prises en compte et soupeses tous les niveaux touchant
lamnagement du territoire.
Les nouveaux dveloppements et lexpansion future des ports et voies navigables
existants font partie intgrante des processus damnagement du territoire
concerns.
Les activits des ports et des voies navigables sont soigneusement prises en compte
et soupeses au sein dun plan de gestion Natura 2000 quilibr et intgr.
Planification des nouveaux projets pour les ports et les voies navigables
Le dveloppement portuaire durable est la cl de vote de la croissance des activits
lies au port (optimisation de lutilisation industrielle et de lespace des ports,
amlioration de lexploitation lchelle du port, utilisation efficiente des modes de
transport).
Les incidences de la navigation maritime, dans ou proximit des ports, sont
soumises des programmes de rglementation et traits internationaux (UNCLOS,
OMI, MARPOL). Des programmes tels que le Environmental Ship Index (indice
environnemental pour les bateaux), mis en uvre sur la base du volontariat,
promeuvent une navigation durable.
Ds les premiers stades de la planification, lopinion des actionnaires, du public et des
parties concernes est pris en considration suivant un processus des parties
prenantes bien tabli. Autant que faire se peut, des accords ont t trouvs sur
toutes les problmatiques rsoudre, laide des meilleures connaissances
scientifiques disponibles.
Sil nest pas possible dexclure certaines incidences significatives dans une
valuation prliminaire, il convient de suivre les tapes suivantes prvues par
larticle 6 de la directive Habitats (valuation complte, alternatives, attnuation,
compensation; voir le code de conduite de lESPO et les lignes directrices de lUE sur
le sujet).
Les autorits comptentes doivent approuver et soutenir les rsultats du processus
des parties prenantes ainsi que les valuations du dveloppement portuaire, et
intgrer ces derniers de faon sre (y compris les dcisions prises au cours du
processus) dans les plans intgrs concerns.
Dragage de maintenance
Une stratgie de dragage de maintenance a t mise au point en tenant compte des
aspects hydromorphologiques et cologiques.
Fondes sur les dernires donnes en la matire et sur un processus de retour
dinformations faisant intervenir toutes les parties prenantes concernes, les activits

46
Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
de dragage visent, conformment aux exigences conomiques et juridiques,
rduire au minimum leurs incidences sur les objectifs de conservation de
Natura 2000.
Une stratgie ou un programme de dragage de maintenance durable fait partie de
tout plan de gestion global. Fonde sur des principes gnraux respectueux des
objectifs de conservation, lactivit de dragage dans un systme estuarien, fluvial ou
ctier fortement influenc par la mare exige une certaine souplesse.
Les activits de dragage ont t optimises dans lordre suivant:
- faisabilit technique, disponibilit des dragues;
- sret, exigences nautiques, navigabilit;
- exigences cologiques juridiquement contraignantes (directives Oiseaux et
Habitats, DCE, etc.);
- rglementations administratives (plans de gestion, objectifs spcifiques
certains sites, etc.);
- intgration complte de tous les critres sur le long terme
(hydromorphologiques et relatifs aux sdiments et lcologie);
- critres court terme et/ou locaux;
- rapport cot-efficacit;
- autres aspects non contraignants tels que les accords passs avec les parties
prenantes.
Gestion des sites Natura 2000 et mesures de maintenance
Le but est datteindre des objectifs ralisables de conservation pour les sites, tout en
tenant compte des besoins de dveloppement long terme des ports et des voies
navigables.
Les autorits portuaires et responsables des voies navigables devraient participer
activement llaboration des plans de gestion ds les toutes premires tapes.
Pour rsoudre les incertitudes (connaissance des cosystmes, relations de cause
effet), il serait judicieux dinclure des programmes de recherche et de suivi dans le
plan de gestion.

47
Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation de l'UE relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
Annexe 4: Tableau de comparaison des procdures de lvaluation
approprie, de lvaluation des incidences sur lenvironnement (EIE)
et de lvaluation stratgique environnementale (ESIE)

valuation approprie EIE ESIE
Quels types
de projets sont
viss?
Tout plan ou projet tant
susceptible,
individuellement ou associ
dautres plans/projets,
davoir une incidence
notable sur un site
Natura 2000 ( lexclusion
des plans ou projets
directement lis la gestion
du site pour sa
conservation).
Lensemble des projets
figurant lannexe I.

Pour les projets figurant
lannexe II, le besoin
dune EIE doit tre
dtermin au cas par
cas et dpend des seuils
ou critres fixs par les
tats membres (compte
tenu des critres
mentionns
lannexe III).
Tout plan ou programme tant
(a) destin lagriculture, la
foresterie, la pche, lnergie,
lindustrie, le transport, la gestion des
dchets et de leau, les
tlcommunications, le tourisme,
lamnagement urbain et rural ou
lutilisation des terres et qui fixe le
cadre de dcisions ultrieures
dautorisation des projets rpertoris
aux annexes I et II de la directive
85/337/CEE, ou
b) pour lesquels, au vu de leurs
possibles rpercussions sur les sites,
une valuation a t juge
ncessaire, conformment aux
articles 6 et 7 de la directive
92/43/CEE.
Quelles
incidences
doivent tre
values au
regard de leur
pertinence vis-
-vis de la
nature?
Lvaluation devra tre
effectue compte tenu des
objectifs de conservation du
site (lesquels concernent les
espces/types dhabitats
pour lesquels le site en
question a t dsign).

Les incidences doivent tre
values en vue de
dterminer si elles sont
susceptibles dengendrer ou
non des consquences
nfastes pour lintgrit du
site concern.
Les effets directs et
indirects, secondaires,
cumulatifs, court,
moyen et long terme,
permanents et
temporaires, positifs et
ngatifs du projet sur
() la faune et la
flore.
Les effets notables potentiels sur
lenvironnement, et notamment sur la
diversit, les populations,
l'homme, la faune et la flore, le sol,
l'eau, l'air, le climat, les biens
matriels, le patrimoine culturel,
notamment architectural et
archologique, le paysage et
linteraction entre les diffrents
facteurs viss.
Qui est en
charge de
lvaluation?
Il incombe lautorit
comptente de veiller ce
que lvaluation approprie
soit effectue. Dans ce
contexte, le matre
douvrage est gnralement
Le promoteur. Lautorit comptente charge de
lamnagement territorial.

48
Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
charg deffectuer toutes les
tudes ncessaires et de
fournir toutes les
informations requises
lautorit comptente afin de
permettre cette dernire
de prendre une dcision
claire. Lautorit
comptente pourra
galement recueillir des
renseignements pertinents
partir dautres sources, le
cas chant.
Le
public/dautres
autorits sont-
ils consults?
Consultation non obligatoire
mais encourage (le cas
chant).






Consultation obligatoire
raliser avant
ladoption de la
proposition de projet.

Les tats membres
prennent les mesures
ncessaires pour que
les autorits
susceptibles d'tre
concernes par le projet,
en raison de leur
responsabilit spcifique
en matire
d'environnement aient la
possibilit de donner
leur avis propos de la
demande d'autorisation.
Idem pour le public.
Consultation obligatoire avant
ladoption du plan ou du programme.
Une possibilit relle doit tre
donne, un stade prcoce, aux
autorits ainsi quau public
d'exprimer, dans des dlais
suffisants, leur avis sur le projet de
plan ou de programme et le rapport
sur les incidences
environnementales avant que le plan
ou le programme ne soit adopt ou
soumis la procdure lgislative.

Les tats membres dsignent les
autorits qu'il faut consulter et qui,
tant donn leur responsabilit
spcifique en matire
d'environnement, sont susceptibles
d'tre concernes.

Les rsultats
de lvaluation
sont-ils
contraignants?


Oui. Les autorits
comptentes ne peuvent
donner leur aval un plan
ou projet quaprs avoir
tabli avec certitude que ce
dernier naura pas deffets
nfastes sur lintgrit du
site.
Les rsultats des
consultations ainsi que
les informations
recueillies dans le cadre
de lEIE doivent
obligatoirement tre
pris en considration
dans la procdure
dautorisation.
Le rapport environnemental, ainsi
que les opinions exprimes sont
pris en compte lors de llaboration
du plan ou programme et avant son
adoption ou sa soumission la
procdure lgislative.


49
Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation de l'UE relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
GLOSSAIRE
Solutions alternatives: autres moyens permettant datteindre les objectifs dun plan ou dun
projet. Les services de la Commission suggrent quil pourrait sagir demplacements de
substitution, damnagements ayant une porte ou une conception diffrentes, ou de
processus de remplacement (orientations CE sur larticle 6, paragraphes 3 et 4, 2001).
valuation approprie: processus dcrit larticle 6, paragraphe 3, de la directive
Habitats permettant dvaluer les incidences potentielles dun plan ou dun projet sur un
site Natura 2000 au regard des objectifs de conservation du site, dans le but dtablir avec
certitude que le plan ou le projet ne compromettra pas lintgrit du site.
Mesures compensatoires: obligation nonce larticle 6, paragraphe 4, lorsque des
dgradations sur un site europen sont justifies par labsence de solution alternative ou par
des raisons impratives dintrt public majeur. Des mesures compensatoires doivent alors
tre conues pour protger la cohrence globale du rseau Natura 2000. Elles comportent
en principe la cration dun habitat appropri aussi prs que possible des dommages qui
seront causs, et qui sera en parfait tat de fonctionnement avant que ces derniers ne
surviennent.
Incidences cumulatives: incidences saccumulant dans lespace et le temps, dcoulant de
multiples plans/projets.
Dtrioration: dgradation physique touchant un habitat, un site de reproduction ou de
repos dune espce. Contrairement la destruction, cette dgradation peut se faire
lentement, rduisant progressivement la fonctionnalit du site en termes qualitatifs ou
quantitatifs, et pouvant conduire au bout dun certain temps sa disparition complte.
Perturbation: changement temporaire ou permanent des conditions environnementales
(bruit, source de lumire, etc.) pouvant avoir des rpercussions ngatives sur un habitat
naturel ou une espce. Des perturbations peuvent porter prjudice aux espces protges,
notamment en rduisant leurs chances de survie, la russite de laccouplement ou la
capacit de reproduction, et peuvent entraner dautres effets indirects, tels quune
concurrence accrue pour la nourriture.
tat de conservation favorable: ltat de conservation dun habitat naturel sera considr
comme favorable lorsque l'aire de rpartition naturelle de l'habitat ainsi que les superficies
qu'il couvre au sein de cette aire sont stables ou en extension; que la structure et les
fonctions spcifiques ncessaires au maintien de l'habitat naturel long terme existent et
sont susceptibles de perdurer dans un avenir prvisible; et que l'tat de conservation des
espces qui sont typiques l'habitat naturel est favorable (article 1, paragraphe e de la
directive Habitats).
Ltat de conservation dune espce sera considr comme favorable lorsquune
population viable se maintient long terme; que l'aire de rpartition naturelle de l'espce ne
diminue pas ni ne risque de diminuer dans un avenir prvisible; et quil existe et continuera
probablement d'exister un habitat naturel suffisamment tendu pour que les populations qu'il
abrite s'y maintiennent long terme.

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Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
Habitat dintrt communautaire: type dhabitat naturel figurant lannexe I de la directive
Habitats.
Raisons impratives dintrt public majeur: disposition de larticle 6, paragraphe 4 qui,
dans certaines circonstances, permet un plan ou un projet de suivre son cours mme
lorsquune valuation approprie na pas pu tablir avec certitude que lintgrit dun site
Natura 2000 ne sera pas compromise.
Attnuation: mesures visant minimiser, voire annuler les incidences ngatives dun plan
ou dun projet, pendant et aprs sa mise en uvre.
Suivi: collecte et analyse dobservations ou de mesures rptes permettant dvaluer les
changements et les avances raliss en vue dun objectif de gestion.
Site Natura 2000: sites dsigns, formant le rseau Natura 2000 et comprenant les zones
de protection spciale (ZPS) ainsi que les sites dimportance communautaire (SIC)
approuvs par la Commission europenne et dclars zones spciales de conservation
(ZSC) par les tats membres.
Compensation: les compensations des dommages subis par la biodiversit sont des actions
de conservation visant compenser les dommages rsiduels invitables causs la
diversit biologique par des projets de dveloppement, avec pour objectif de stopper la perte
nette de biodiversit.
Principe de prcaution: lorsque les preuves scientifiques sont insuffisantes, non
concluantes ou incertaines et quune valuation scientifique objective prliminaire indique
quil existe des raisons fondes de craindre que les incidences potentiellement dangereuses
sur lenvironnement ou la sant humaine, animale ou vgtale ne sont pas en adquation
avec le niveau de protection choisi, labsence de certitude scientifique absolue ne doit pas
servir de prtexte pour remettre plus tard l'adoption de mesures effectives visant prvenir
la dgradation de l'environnement (dclaration de Rio, 1992 & CE, 2000).
Intrt ligible: type dhabitat naturel figurant sur la liste de lannexe I ou espce
mentionne lannexe II de la directive Habitats, espce recense lannexe I de la
directive Oiseaux ou espce migratrice apparaissant rgulirement mais ne figurant pas
lannexe I, pour lesquels un site Natura 2000 a t dsign.
Site dimportance communautaire (SIC): dfini dans la directive Habitats (92/43/CEE)
comme un site qui, dans la ou les rgions biogographiques auxquelles il appartient,
contribue de manire significative maintenir ou rtablir un type d'habitat naturel de
l'annexe I ou une espce de l'annexe II dans un tat de conservation favorable et peut aussi
contribuer de manire significative la cohrence de Natura 2000, et/ou au maintien de la
diversit biologique dans la ou les rgions biogographiques concernes. Les SIC sont
soumis la Commission par les tats membres et une fois approuvs, doivent tre dsigns
zones spciales de conservation (ZSC) par les tats membres.
Zone spciale de conservation (ZSC): un site d'importance communautaire dsign par
les tats membres par un acte rglementaire, administratif et/ou contractuel o sont
appliques les mesures de conservation ncessaires au maintien ou au rtablissement, dans

51
Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation de l'UE relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires
un tat de conservation favorable, des habitats naturels et/ou des populations des espces
ayant motiv la dsignation du site en question.
Zone de protection spciale (ZPS): zone de protection dsigne conformment la
directive Oiseaux pour les espces figurant lannexe I de ladite directive et/ou les
espces migratrices y apparaissant rgulirement, et appartenant au rseau Natura 2000.
Espces dintrt communautaire: espces figurant lannexe II et/ou annexe IV ou V de
la directive Habitats.
Parties prenantes: personnes ou organisations qui seront concernes par un programme,
un projet ou une action, ou qui auront une influence dessus.
Surveillance: programme tendu dtudes entreprises systmatiquement pour fournir une
srie dobservations servant dterminer la variabilit susceptible de survenir au fil du
temps.

52
Orientations de la Commission europenne relatives la mise en uvre de la lgislation relative la
conservation de la nature dans les estuaires et les zones ctires


Commission europenne



Luxembourg: Office des publications de lUnion europenne

2011 52 p. 21,0 x 29,7 cm

ISBN 978-92-79-19374-3
doi: 10.2779/44451




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