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Erick Denamur, Universit Paris Diderot, UFR Mdecine, PAES

LADN, lARN et le flux de linformation gntique

Structure et rplication


I. Un acide nuclique consiste en 4 types de bases lies par un squelette sucre-phosphate

Les acides nucliques
ADN : acide dsoxyribonuclique
ARN : acide ribonuclique
sont les porteurs de linformation gntique.

Ce sont des polymres linaires faits dunits similaires connectes entre elles.
Chaque unit monomrique est compose de 3 constituants : sucre, phosphate, base.
La squence des bases caractrise un acide nuclique et reprsente une forme dinformation
linaire.

A. LARN et lADN diffrent par le sucre et une des bases

Formules du ribose et dsoxyribose. Le sucre dans lADN est le dsoxyribose. Le prfixe
dsoxy indique que le C en 2 na pas datome dO linverse du ribose, le sucre de
lARN.
On met des sur les C pour les distinguer de ceux des bases.
Les sucres dans les acides nucliques (AN) sont lis entre eux par des liaisons phosphodiester.
Le groupe 3OH dun sucre dun nuclotide est estrifi par un groupe phosphate qui est joint
au groupe OH en 5 du sucre adjacent.
La chane des sucres lis par les liaisons phosphodiester reprsente le squelette de lAN.
Sur ce squelette sont fixs les bases : puriques, drivant dun noyau purine (Adnine,
Guanine) et pyrimidiques, drivant dun noyau pyrimidine (Uracile, Thymine, Cytosine).
Formule des bases avec la numrotation des atomes. Les atomes sont numrots sans .
Labsence du groupement OH en 2 de lADN augmente sa rsistance lhydrolyse. Cette
plus grande stabilit de lADN explique probablement son utilisation plutt que lARN
comme matriel hrditaire dans toutes les cellules modernes et beaucoup de virus.


B. Les nuclotides sont les units monomriques des AN

Une unit consistant dune base lie un sucre est appelle nucloside. Les 4 nuclosides de
lARN sont adnosine, guanosine, cytidine, uridine. Ceux de lADN sont dsoxyadnosine,
dsoxyguanosine, dsoxycytidine, thymidine.
Dans tous les cas, N-9 de la purine et N-1 de la pyrimidine est li au C-1 du sucre.
Un nuclotide est un nucloside li un ou plusieurs groupse phosphate par une liaison ester.
Exemples : ATP, dGMP.
Les 4 units nuclotidiques de lADN sont dAMP, dGMP, dCMP, TMP. Ceux de lARN sont
AMP, GMP, CMP, UMP.
pApCpG ou pACG = trinuclotide dADN compos de dAMP, dCMP et dGMP lis par des
liaisons phosphodiester. Lextrmit 5 aura un phosphate attach au groupe 5-OH.
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Comme pour un polypeptide, la chane dADN a une polarit. Une extrmit de la chane a un
groupe 5-OH attach un phosphate alors que lautre extrmit a un groupe 3-OH qui peut
tre li un autre nuclotide.
Par convention, la squence des bases est note 5 vers 3. ACG veut donc dire que 5-OH
non li est celui du dAMP, celui du 3-OH non li sur le dGMP. A cause de cette polarit,
ACG et GCA sont des composs diffrents.

Une caractristique tonnante des molcules dADN naturelles est leur taille.Virus : 5000 pb.
Escherichia coli 4 10
6
pb. Homme 3 10
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pb divises en 24 molcules distinctes (22
autosomes, X et Y) de tailles diffrentes.

II. Une paire de chanes dacide nuclique avec des squences complmentaires peut
former une double hlice avec une squence complmentaire

La structure covalente des AN rend compte de leur capacit porter une information sous la
forme dune squence de bases le long de la chane dAN. La possibilit de former des paires
de bases spcifiques de telle faon quune structure secondaire en hlice se forme facilite la
rplication (gnration de 2 copies partir dune) du matriel gntique.

A. La double hlice est stabilise par des liaisons hydrogne

Deux chanes polynuclotidiques sont enroules en hlice autour dun axe commun. Ces
chanes sont en direction oppose. Les squelettes sucre-phophate sont en dehors, et les bases
lintrieur. Les bases sont perpendiculaires laxe de lhlice et les bases adjacentes sont
spares par 3,4 angstrms. La structure hlicodale se rpte tous les 34 angstrms, soit
toutes les 10 bases = 1 tour dhlice. Il y a donc une rotation de 36 par base. Le diamtre de
lhlice est de 20 angstrms.
Comment une structure aussi rgulire peut elle saccommoder dune squence arbitraire de
bases, tant donn les tailles diffrentes des purines et des pyrimidines ? G-C 3 liaisons
hydrogne, A-T 2 liaisons hydrogne. Cet appariement tait support par des tudes
antrieures sur la composition en bases dADN de diffrentes espces. Les ratios A/T et G/C
sont proches de 1 dans toutes les espces alors que le ratio A/G varie considrablement.

B. La double hlice facilite la transmission de linformation hrditaire

Le modle de la double hlice et la prsence dappariement spcifique des bases a
immdiatement suggr comment le matriel gntique se rplique => Rplication semi-
conservative. Les expriences de Meselson et Stahl confirment cette rplication semi-
conservative chez E. coli par marquage de lADN parental avec un isotope lourd du N,
15
N,
pour le faire plus dense que le normal
14
N. Quand lincorporation du
15
N est complte, la
bactrie est mise dans un milieu avec du
14
N. On regarde lvolution du
15
N et
14
N par
centrifugation au cours des gnrations.

C. La double hlice peut tre dnature de faon rversible

Durant la rplication de lADN, les 2 brins de la double hlice doivent tre spars lun de
lautre, au moins localement (hlicases + nergie ATP). Au laboratoire, ceci peut tre obtenu
en chauffant une solution dADN. Le chauffage dtruit les liaisons hydrogne liant les bases.
Les bases dans la double hlice absorbent moins la lumire UV que ne le font les bases quand
lADN est simple brin = hyperchromisme. La temprature de dnaturation (Tm) est la
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temprature laquelle la moiti de la structure hlicodale est perdue. La forme de la courbe
montre que la dnaturation est un phnomne coopratif (fermeture clair). Il existe une
relation entre le Tm et la composition en bases. Le Tm est proportionnel au G/C.
Les brins spars complmentaires de lADN vont spontanment se rassocier de faon
spcifique pour former une double hlice quand la temprature va descendre sous le Tm.
Principe dhybridation en biologie molculaire.

D. Les acides nucliques simple-brin peuvent adopter des structures labores

Les AN simple brin se replient sur eux mme pour former des structures dfinies. La plus
simple est la tige-boucle . Structures plus complexes, ARNr dans les ribosomes.

III. LADN est rpliqu par des polymrases qui prennent leur instruction sur des
matrices

A. Les ADN polymrases ncessitent une matrice et une amorce

Les ADN polymrases catalysent la formation de chanes polynuclotidiques par laddition
successive de nuclotides drivant de dsoxyribonuclosides triP (dNTP). La raction de
polymrisation prend place seulement en prsence dune matrice dADN. Chaque nucloside
triP forme dabord une paire de bases avec une base de la matrice. Seulement ensuite lADN
polymrase lie la nouvelle base avec la base prcdente dans la chane. Les ADN polymrases
sont donc des enzymes dpendantes de la matrice.
Les ADN polymrases ajoutent des nuclotides lextrmit 3 de la chane
polynuclotidique. Sens 5->3.
(ADN)n + dNTP -> (ADN)n+1 + PPi
Pour initier cette raction, lADN polymrase a besoin dune amorce apparie avec un 3-OH
libre. Les ARN polymrases peuvent elles commencer la synthse dARN sans amorce.

1. Toutes les ADN polymrases ont des caractristiques structurales en commun

Fragment de Klenow de lADN polymrase I de E. coli
2 paries principales :
unit polymrase 5-3
unit exonuclase 3-5 correctrice
Le pouce et les doigts senroulent autour de lADN. Le site actif est compos de rsidus du
domaine de la paume. Ncessite la prsence de Mg
++
.

2. La spcificit de la rplication est dicte par la formation de liaisons hydrogne et la
complmentarit entre les bases

La fixation du bon dNTP est favorise par la formation de la bonne paire de bases, avec
les liaisons hydrogne.

3. De nombreuses polymrases vrifient que la base ajoute est la bonne et excise les
bases errones

Augmentation de la fidlit de rplication par un mcanisme de proofreading = domaine
exonuclasique situ 35 angstrms du site actif de polymrisation. Enlve le nuclotide mal
appari par hydrolyse.
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Comment lenzyme sent que la base ajoute nest pas correcte ?
Pas la bonne base, msappariement, pas de liaison hydrogne stabilisatrice, fluctuation du
brin nosynthtis qui se retrouve dans le site exonuclasique. Pause dans la synthse.
Cette activit augmente la spcificit de la rplication par un facteur 1000.

B. La rplication de lADN se fait rapidement partir de sites spcifiques

Chez E. coli, la rplication de lADN commence en un site unique, lorigine de rplication,
locus oriC, 245 pb. Quatre rptitions dune squence permettent la fixation de la protine
DnaA. Puis fixation de DnaB, hlicase qui utilise de lATP. Ouverture de la double hlice
dADN en une rgion riche en AT. Formation dune rgion ADN simple brin, fixation de SSB
single strand binding protein .

1. Une amorce dARN synthtise par une primase permet la synthse dADN de
dbuter

LADN simple brin est accessible, mais la synthse dADN ne peut pas commencer car il faut
une amorce avec une extrmit 3- OH libre. En fait, une ARN polymrase spcialise, la
primase, synthtise un court brin dARN (5 nuclotides) complmentaire de la matrice
dADN.
Les ARN polymrasse ont un taux derreurs trs leve, mais peuvent dmarrer des chanes
de novo.
Puis ADN polymrase. Lamorce dARN est hydrolyse par une exonuclase 5->3, domaine
additionnel de lADN pol I.

2. Un brin dADN est synthtis de manire continue alors que lautre est synthtis par
fragments (discontinue)

Deux brins antiparallles rpliquer. ADN polymrase 5-3.
Okazaki a montr quune portion importante de lADN nouvellement synthtis existe sous
forme de courts fragments (1000 nuclotides) = fragments dOkazaki. Fourche de rplication.
Puis jonction des fragments dOkazaki grce une ligase qui catalyse la formation dune
liaison P diester entre le 3- OH la fin dune chane dADN et le 5- P lextrmit de
lautre.

3. La rplication de lADN ncessite des polymrases hautement processives

Lenzyme responsable de la rplication de lADN chez E. coli est lADN pol III
(multimrique), caractrise par : pouvoir catalytique lev (1000 nuclotides ajouts par
seconde), fidlit, processivit (la capacit de lenzyme catalyser de nombreuses ractions
conscutives sans relcher son substrat).

4. Les brins continu et discontinu sont synthtiss de faon coordonne

LADN pol III synthtise simultanment les brins continu et discontinu au niveau de la
fourche de rplication.
Brin continu, primase (amorce dARN) puis synthse dADN 5->3.
Brin discontinu, primase, synthse du fragment dOkazaki avec une boucle de la matrice du
brin discontinu qui le place en position par une polymrisation 5->3. Les trous entre les
5
fragments dOkazaki sont combls par lADN pol I qui utilise lactivit exonuclasique 5-3
pour enlever lamorce dARN puis ADN ligase.
En plus de lhlicase et SSB, topoisomrase (ADN gyrase) qui introduit des supertours
ngatifs pour rsoudre la crise topologique.
La rplication chez les eucaryotes est mcanistiquement similaire la rplication chez les
procaryotes, mais plus complexe.

IV. Lexpression gnique est la transformation de linformation de lADN en molcules
fonctionnelles

Linformation stocke dans lADN va devenir utile quand elle va tre exprime par la
production dARNs et de protines. ADN = forme de stockage de linformation labri des
modifications (mutations).

A. Plusieurs types dARN jouent un rle cl dans lexpression

ARNm, la matrice pour la synthse des protines (traduction)
ARNt, transporte les acides amins (AA) dans une forme inactive au ribosome pour la
formation de liaisons peptidiques, dans une squence dicte par la matrice dARNm. Il y a au
moins un type dARNt pour chacun des 20 AA.
ARNr, la majeure partie des ribosomes. Rle catalytique et structural dans la synthse des
protines.
Petits ARNs non codants, rle dans la rgulation

Chez E. coli

Quantit relative (en %) Nb de nuclotides
ARNr 80 3700/1700 /120
ARNt 15 120
ARNm 5 Htrogne (moyenne 1200)
pARNnc <1 <300

B. Tous les ARN sont synthtiss par des ARN polymrases

La synthse de lARN partir dune matrice dADN est appele transcription et est catalyse
par lARN polymrase qui ncessite les composs suivants :
Une matrice. La matrice prfre est lADN double brin. ADN simple brin aussi.
Des prcurseurs activs. Les 4 ribonuclosides tri P (ATP, GTP, UTP, CTP)
Un ion divalent (Mg
++
).
LARN polymrase catalyse linitiation et llongation des chanes dARN
(ARN)n + NTP -> (ARN)n+1 + PPi
La synthse de lARN ressemble celle de lADN dans plusieurs aspects :
direction de la synthse 5-3
le mcanisme de llongation est similaire, le 3- OH lextrmit de la chane naissante fait
une attaque nuclophile sur le P le plus interne du nouveau nucloside tri P,
Mais a des aspects diffrents :
ne ncessite pas damorce pour dbuter
na pas de capacit nuclasique pour exciser les nuclotides mal apparis.
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Chez E. coli, tous les types dARNs sont synthtiss par la mme ARN polymrase. Chez les
eucaryotes, il y a une division du travail selon les types dARNs entre diffrents types dARN
polymrases.

C. Les ARN polymrases prennent leurs instructions partir des matrices dADN

La squence de bases de lARN est le complment de celle du brin matrice de lADN. Le brin
codant ADN a la mme squence que lARNm lexception de T la place de U.

D. La transcription dbute prs des sites promoteurs et se termine des sites terminateurs

Quest ce qui marque le dbut de lunit transcriptionelle ?
Chez les bactries, 2 boites -10 (TATAAT) et -35 (TTGACA) nuclotides du site
dinitiation de transcription. Ces squences sont retrouves dans la majorit des promoteurs
procaryotes. Chaque promoteur diffre de ce consensus par 1 ou 2 bases.
Chez les eucaryotes, boite TATA (TATAA) -25 et boite CAAT (GGNCAATCT) -75 du
site dinitiation de transcription. La transcription est stimule (ou inhibe) par des squences
distance (peut tre plusieurs kilobases) en 5 ou 3 en dehors du gne ou dans le gne (introns)
: Enhancers ( Silencers ).
LARN est synthtis le long de la matrice dADN -> squence terminatrice : signal de fin.
Chez E. coli, structure en pingle cheveu (tige-boucle) riche en GC plus squence de U. La
chane dARN synthtis se dtache de lARN polymrase quand cette structure est forme.

Les signaux de dbut et de fin de transcription sont cods par la matrice dADN.

Chez les eucaryotes, lARN est modifi aprs la transcription :
Rajout dun nuclotide coiffe en 5 (stabilit de lARN)
ARN cliv par une endonuclase qui reconnat la squence AAUAAA puis rajout dune
squence de A en 3 par une poly(A)polymrase.

E. LARNt est une molcule adaptatrice dans la synthse des protines

Un ARNt contient un site dattachement lacide amin et un site de reconnaissance de la
matrice.
Le groupement carboxyl de lacide amin est estrifi au groupement 3- OH du ribose
lextrmit 3 de la chane dARNt.

ARNt + AA -> aminoacyl-ARNt par aminoacyl-ARNt synthtase avec clivage dATP

Le site de reconnaissance est une squence de 3 bases appele anticodon qui reconnat la
squence complmentaire de 3 bases sur lARNm appel codon.

V. Les acides amins sont cods par des groupes de 3 bases partir dun point fixe

Le code gntique est la relation entre la squence de bases dans lADN (ou son transcit en
ARN) et la squence des acides amins dans les protines.

3 nuclotides codent pour un acide amin
Le code est non chevauchant
Le code est dgnr
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Quelques acides amins sont cods par plus dun codon. 64 triplets des 4 bases possibles. 20
acides amins. 61 triplets -> acides amins, 3 triplets (UAA, UAG, UGA) terminaison de
traduction, codons stop .

A. Les principales caractristiques du code gntique

Seuls le tryptophane et la mthionine sont cods par un seul triplet. Les autres 18 acides
amins sont cods par 2 ou plus triplets. Leucine, arginine et srine sont cods par 6 codons
chacun. Le nombre de codons pour un acide amin corrle avec sa frquence doccurrence
dans les protines.
Les codons spcifiant le mme acide amin sont appels synonymes. Pas au hasard. GUU,
GUC, GUA, GUG = valine. La plupart des codons synonymes diffrent seulement sur la
troisime base du triplet.
Quelle est la signification biologique de cette dgnrescence extensive du code gntique ?
Si le code gntique ntait pas dgnr, 20 codons dsigneraient des acides amins et 44 des
stop . Beaucoup de mutations -> stop : trs dltre, inactivation de la protine. La
dgnrescence du code minimise leffet dltre des mutations.
La dgnrescence permet aussi la composition en bases de lADN de varier
considrablement sans changer la squence des protines codes par lADN. Le G+C% de
lADN des bactries varie de 30 plus de 70%.

B. LARNm contient des signaux de dbut et de fin pour la synthse des protines

LARNm est traduit en protines sur les ribosomes, gros complexe molculaire fait de
protines et dARNs ribosomiques.
Les codons stop dsignent la terminaison de la chane polypeptidique. Ils ne sont pas lus par
un ARNt mais par des protines spcifiques appeles facteurs de terminaison . La fixation
de ces protines sur les ribosomes libre la protine nouvellement synthtise.
Le signal de dbut est plus complexe. Chez les bactries, un ARNt spcifique, lARNt
initiateur porte la formylmthionine, un acide amin modifi. Cet ARNt reconnat le codon
AUG. Mais il existe des AUG autres dans lARNm qui correspondent des mthionines
internes. Donc AUG est seulement une partie du signal. Il existe aussi en amont une squence
riche en purines qui est complmentaire dune squence de lARN ribosomique : site de
fixation du ribosome, - 10 en amont AUG.

VI. La plupart des gnes eucaryotes sont des mosaques dintrons et dexons

Chez les bactries, les chanes polypeptidiques sont codes de faon continue par les codons
conscutifs. Chez les eucaryotes, prsence de squences non traduites = introns ( intervening
sequences ), traduites = exons ( expressed sequences ).

A. Lpissage de lARNm gnre lARN mature

Transcription, ajout de la coiffe et du polyA. Transcrit primaire. Epissage au niveau dun
complexe form de protines et de petits ARNs. Les introns commencent par un GU et
finissent par un AG prcd dune squence riche en pyrimidines.

B. De nombreux exons codent pour des domaines protiques

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De nombreux exons codent pour des units structurales ou fonctionnelles des protines.
Cration au cours de lvolution de nouvelles protines par rarrangement des exons.
Possibilit dpissage alternatif qui donne des protines proches avec des choix de
diffrents exons.

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Mutations et rparation de lADN


I. Les mutations

Au cours du temps, le gnome subit des changements avec altrations de squences.
Les mutations, changement dans la squence nuclotidique dune courte rgion du gnome :
ponctuelles (remplacement dune base par une autre), insertion/dltion de 1
quelques bases.
Elles rsultent derreurs de rplication, dhydrolyses spontanes (spontanes) ou de laction
de mutagnes chimiques ou physiques (provoques).
Rarrangements, recombinaison et vnements apparents.

A. Les erreurs de rplication

Elles sont sources de mutations ponctuelles. La substitution dune base purine par une purine,
dune pyrimidine par une pyrimidine est appele une transition. Dune purine par une
pyrimidine et dune pyrimidine par une purine est appele une transversion.

Elles peuvent aussi conduire des petites insertions/dltions de bases. Ces erreurs peuvent
survenir nimporte o dans le gnome mais surtout au niveau de squences rptes (drapage
de lADN polymrase durant la rplication).
Raison du polymorphisme des squences microsatellites entre les individus. A servi pour
localiser les gnes impliqus dans les maladies gntiques. Mdecine lgale.

B. Les hydrolyses spontanes

Un gnome humain dune cellule, par jour, perd 5000 purines (G,A) (dpurination).
Hydrolyse de la liaison N-glycosidique avec cration dun site apurique (ou abasique). Arrt
de la rplication.

100 cytosines sont spontanment dsamines (dsamination). Survenue dune transition (G-C
-> A-T).

C. Les mutations sont aussi causes par des mutagnes chimiques

Certains mutagnes agissent en modifiant chimiquement les bases. Par exemple, lacide
nitreux ragit avec les bases qui contiennent un groupement amine. Ladnine subit une
dsamination oxydative en hypoxanthine et lhypoxanthine sapparie avec la cytosine plutt
que la thymine. On a donc une transition A-T -> G-C.

D. Un exemple dagent physique causant des mutations est la lumire ultraviolette

Son effet majeur est de lier de manire covalente des rsidus pyrimidiques adjacents le long
du brin dADN. De tels dimres de pyrimidines perturbent la structure de la double hlice, et
donc la rplication et lexpression des gnes sont bloques.




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II. La rparation

Nous avons vu quau cours du temps, le gnome subissait des changements avec altrations
de squences. La maintenance de lintgrit du message gntique est toutefois indispensable
la vie. En consquence, toutes les cellules possdent des systmes qui leur permettent de
rparer lADN endommag et les erreurs de rplication.
Tous ces systmes sont conservs, tout au moins dans leurs grandes lignes, de la bactrie E.
coli lhomme.

A. Le systme de rparation des msappariements permet de dtecter les erreurs de
rplication qui nintroduisent pas de nuclotides anormaux

Cest un systme qui agit aprs la rplication et qui dtecte les bases mal apparies et les
petites insertions / dltions de 1 3 nuclotides. Il est compos chez E. coli de 3 protines :
MutS, MutL et MutH. Le msappariement G-T est reconu par MutS. MutH (endonuclase)
clive le brin dADN nosynthtis au niveau dune liaison P diester dans la proximit du
msappariement. MutL permet linteraction entre MutS et MutH. Un segment du brin dADN
contenant la base errone (T) est enlev par lexonuclase I puis une resynthse correcte du
brin est effectue par lADN polymrase III.

B. Une varit de systmes est utilise pour rparer lADN endommag

Rparation directe sur place (peu frquent)
Rparation par excision de base (cas de luracile ADN glycosylase). La base endommage est
enleve et remplace.
Rparation par excision de nuclotide (cas des dimres de thymines), un bout dADN autour
du site endommag est enlev et excis.
E. coli, excision dun fragment de 12 nuclotides par les excinuclases UvrABC. Synthse
dADN par lADN polymrase I. Ligase.

C. La prsence de thymine la place de luracile dans lADN permet la rparation des
cytosines dsamines

La prsence dans lADN de thymine plutt que duracile a t une nigme pendant de
nombreuses annes. Les 2 bases sapparient avec ladnine. La seule diffrence entre elles est
la prsence dun groupement mthyl dans la thymine la place dun hydrogne dans luracile
sur le C5. Pourquoi une base mthyle est-elle utilise dans lADN et pas dans lARN ?
Lexistence dun systme de rparation actif corrigeant la dsamination de la cytosine apporte
une solution convaincante cette nigme.
Comme nous lavons vu, la cytosine dans lADN est spontanment dsamine en uracile un
taux non ngligeable. Nous avons vu que cela tait mutagnique avec transition G-C->A-T.
Cette mutation est prvenue par un systme de rparation qui reconnat luracile comme tant
tranger lADN. Cette enzyme est luracile ADN glycosylase.
Lenzyme hydrolyse la liaison glycosidique entre luracile et le dsoxyribose mais nattaque
pas les nuclotides contenant de la thymine. Le site abasique (qui na plus la base U) est
rpar avec rinsertion dune cytosine.
Donc, le groupe mthyl sur la thymine est un marqueur qui distingue la thymine de la
cytosine dsamine. Si la thymine ntait pas utilise dans lADN, luracile en place serait
indistinguable de luracile forme par dsamination. Le dfaut persisterait non dtect et
conduirait une transition.
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Cette mutation est prvenue par un systme de rparation qui cherche les uraciles et laisse
les thymines. La thymine est utilise la place de luracile dans lADN pour augmenter la
fidlit du message gntique. A linverse, lARN nest pas rpar et donc luracile est utilis
dans lARN car cest un bloc de construction moins coteux.

III. Applications volutives et mdicales

A. Les applications volutives

Nous avons tout dabord vu que le gnome subit au cours du temps des changements avec
altration de squences. Puis nous avons vu que la maintenance de lintgrit du message
gntique tait indispensable la vie et que la cellule avait dvelopp de nombreux systmes
pour lutter contre ces altrations de squences au cours du temps.
Mais la rsultante de ces 2 phnomnes nest pas un taux zro de mutation. Par exemple, le
taux spontan de mutation pour la rplication est de lordre de 10
-10
chez E. coli (1 erreur pour
laddition de 10
10
bases), soit une erreur chaque fois que le gnome est copi de lordre de
1000 fois.
Ce taux rsiduel est indispensable pour que les organismes puissent sadapter. Il est
indispensable pour lvolution des espces. Taux zro de mutation = mort volutive.

B. Les applications mdicales

1. De nombreux cancers sont causs par des systmes de rparation de lADN
dfectueux

Les cancers sont causs par des mutations dans les gnes associs au contrle de la
croissance cellulaire. Les dfauts dans les systmes de rparation de lADN vont augmenter la
frquence des mutations en gnral, et donc aussi des mutations qui entranent un cancer.
Le xeroderma pigmentosum est une maladie rare de la peau gntiquement transmise sur un
mode autosomique rcessif. Les sujets homozygotes ont une peau trs fragile au soleil et vont
dvelopper de nombreux cancers de la peau qui entranent souvent la mort par mtastases
avant lage de 30 ans.
UV -> dimres de pyrimidine au niveau de lADN. Des tudes de fibroblastes cutans de
sujets normaux et de sujets atteints de xeroderma pigmentosum ont montr que dans les
fibroblastes normaux, la moiti des dimres de pyrimidine produits par une radiation UV est
excise en moins de 24 heures. A linverse, dans les fibroblastes de patients, aucun dimre
nest excis.
Le xeroderma pigmentosum peut tre caus par un dfaut dans les excinuclases qui
hydrolysent le squelette dADN prs des dimres de pyrimidine. Les consquences cliniques
drastiques observes aprs ce dfaut molculaire touchant ces enzymes illustrent limportance
critique des processus de rparation de lADN.
Des dfauts dans dautres systmes de rparation peuvent augmenter la frquence dautres
cancers. Par exemple, le cancer colorectal hrditaire sans polypose, ou syndrome de Lynch,
rsulte le plus souvent de mutations dans 2 gnes, hMSH2 et hMLH1. Ces gnes sont en fait
les homologues chez lhomme des gnes codant pour les protines MutS et MutL chez E. coli.
Il semble que les mutations dans hMSH2 et hMLH1 conduisent une accumulation de
mutations sur le gnome des futures cellules cancreuses. Au cours du temps, les gnes
important dans le contrle de la prolifration cellulaire deviennent altrs, entranant le dbut
de cancer.

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2. Les bactries qui ont inactiv leur systme de rparation des msappariements (mutS,
mutL, mutH) peuvent plus facilement devenir rsistantes aux antibiotiques

Problme majeur de sant publique : les bactries deviennent de plus en plus rsistantes aux
antibiotiques. Problme thrapeutique des maladies infectieuses. La rsistance aux
antibiotiques est souvent confre par des mutations ponctuelles dans les gnes des bactries
qui codent pour les protines correspondant aux cibles des antibiotiques.
Mme principe que pour la cellule cancreuse, au cours du temps chez les bactries qui ont
inactiv mutS, mutL ou mutH, les gnes qui codent pour les cibles des antibiotiques
deviennent altrs, rsultant en une bactrie multirsistante aux antibiotiques.

3. Certaines maladies gntiques sont causes par lexpansion de rptitions de 3
nuclotides

Certaines maladies gntiques sont causes par la prsence de squences dADN qui sont
intrinsquement sujettes aux erreurs lors de la rplication, des rptitions de 3 nuclotides.
Un exemple est la maladie de Huntington, une maladie neurologique (chore) autosomique
dominante age de dbut variable. Le gne mut dans cette maladie code pour une protine
appelle huntingtine, qui est exprime dans le cerveau et contient une srie de glutamines
conscutives. Ces glutamines sont codes par une srie de squences CAG. Chez les
personnes normales, 6 31 CAG. Chez les atteintes, 36 82. Plus le nombre est grand, plus la
maladie est prcoce.
La tendance de ces rptitions de trinuclotides lextension est explique par la structure
alternative de lADN lors de la rplication.
Comment ces expansions de glutamine conduisent la maladie ? La protine forme des
agrgats quand le nombre de glutamines augmente.