You are on page 1of 48

Гражданская наука в биологии

Кулага Антон

Do-It-Yourself BIOlogy

Чем я занимаюсь в свободное время

“We make e-coli produce salo”

Но чаще приходится делать это

“We make e-coli produce salo”

О чем этот доклад?

Гражданская наука в биологии:

что это такое и “с чем её едят”?

почему это важна и что это даёт?

DIY Bio в исследованиях старения

Сага о маленькой мышке,
которая хотела жить дольше

Полезняшки:

DIY biologist toolkit – что нужно учить и знать

Bio Learning hub

CRISPR и прочие полезные в хозяйстве вещи

План
J
доклада

Do-It-Yourself BIOlogy

z

DIY BIO лабы, США

Do-It-Yourself BIOlogy

Hacking the code of life

Do-It-Yourself BIOlogy

DIY BIO лабы, ЕС

Do-It-Yourself BIOlogy в Киеве

“We make e-coli produce salo

Science and engineering

в чем разница

Citizen Scientist: Researcher who participates in the
systematic collection and analysis of data; development
of technology; testing of natural phenomena; and the
dissemination of these activities on an avocational basis..

Citizen Science: The systematic collection and
analysis of data; development of technology; testing of
natural phenomena; and the dissemination of these
activities by researchers on a primarily avocational
basis.

Что такое гражданская наука?

Что
нужно, чтобы
наукой
занимался каждый?
Громадянська
наука
в біології

История –> известные ученыё-аматоры

Входной порог в науку

Стоимость оборудования

Доступность и качество обучения

Информация о новых достижениях

Ограничение во времени

Социальное (не)признание

т.д.

Некоторые факторы

Закон Мура vs Стоимость секвенирования

Входной
Громадянська
порог в наука
науку->оборудование
в біології

IBM System/360
Год 1964
Стоимость (USD) 971 339 — 40 168 155
Скорость ~ 0.0025 MIPS
Тактовая частота < 1 КГц
Оперативная память ~ 1 Мб
Внешняя память < 8 Мб
Масса > 690 кг
Достижения Управлял экономикой страны

Samsung Galaxy S III
2013
700
2 265 MIPS
1.4 ГГц
1 — 2 Гб
16 — 64 Гб
133 г
Angry Birds не тормозят

История-> Информационные технологии

10 лет тому назад

Сейчас

Секвенирование генома

Do-It-Yourself BIOlogy

Typical DIY BIO lab equipmen

DIY BIO проекти
GoGoFuge
центрифуга

BIO Printer

адаптований до 3д друку
ротор
Algae microscope and cell-picker

OpenSource PCR
за 600$

Darwin toolbox за
1000$
(ПЦР,
центрифуга,
бокс
для электрофареза)

OpenSource оборудование

Входной
Громадянська
порог в наука
науку->образование+информация
в біології

Курсы Coursera на темы Biology & Life Sciences

Новые формы гражданской науки

Crowdsourcing

c

Hacking the code of lif

c

Hacking the code of lif

Синтетическая биология

Typical DIY BIO lab equipmen

International Genetically Engineered Machine
(iGEM) competition
Функціонує з 2003 року, на 2013: 204 команди та 242 лабораторії
Есть несколько лиг, в 2013: Collegiate, High School, Entrepreneurial, Software Division
Участие стоит 3000$ на команду + 450$ на кожного хто поїде на збори (для high school
devision знижка у два рази)
Кожна команда повинна мати щонайменьше 2 ментори та отримує на літо комплект зі
стандартними частинами і повинна приготувати за літо проект

Hacking the code of lif

E-Coli , что убивает
паразитов у пчел

Детектор антибиотиков в молоке

DIY BIO проекти

Производство
краски для джинс

Защита грибов, нужных для
биоразложения пенопласта
от плесени

DIY BIO проекти

Использование C. elegance для переноса колоний
бактерий ускоряет производство биопластика

Використання C. elegans. Для переносу колоній бакте

Адресная доставка лекарств
( early stage)

Лекарство против туберкулеза
(early stage)

DIY BIO проекти

Do-It-Yourself BIOlogy
Мировое DIY Bio сообщество беспокоится
о безопасности, поэтому:
➔ Создало
свой
этический
кодекс
несколько лет назад
➔ Предлагает бесплатные консультации по
биобезопасности на своем сайте
➔ Разными
организациями
проводилось
несколько исследований безопасности DIY
Bio и все они признали DIY Bio
лаборатории безопасными, а вероятность
ризка разработки патогенных организмов
оценивают
гораздо
ниже,
чем
в
профессиональных лабораториях.

ФБР официально финансирует DIY BIO
конференции в течении последних 4 лет.
вопросы безопасности

Исследования старения

Главный стереотип

Исследования старения

Главный стереотип

Борьба со старением

Борьба со старением

Старение – сложный процесс

Нужно проводить вычисления, чтобы понять

Стратегия борьбы со старением

Ничего не предвещало...

Зарождение краудфандинга

Маленькая мышка, которая

http://www.indiegogo.com/projects/i-am-a-little-mouse-and-i-want-to-live-longer

Я маленькая мышка.
Я хочу жить долго и быть здоровой

Я хочу сделать что-то большое в своей жизни!
Я хочу, чтобы вы тоже жили долго!
Помогите мне принять участие в клиническом
исследовании, где я получу плацебо или
комбинацию лекарств продлевающих жизнь
Дорогая маленькая мышка, мы можем
провести этот эксперимент для тебя!
Но для этого нам надо прикупить
пару вещей...
Давай попросим других людей помочь нам
отфинансировать это!
Вы хотите организовать краудфандинг
для эксперимента по продлению
жизни на мышах? Интересно...
Я попробую помочь вам.

Я хочу жить долго и быть здоровым, я

Маленькая мышка, которая хотела жить дольше

Препарат

Группа препаратов

Физиологический
эффект

Аспирин

Нестероидные
противовоспалительные

Ингибитор ЦОГ-1 и
ЦОГ-2

Метформин

Бигуаниды

Сахароснижающий
препарат
используется при
диабете ІІ типа.

Метопролол

Кардиоселективный β1адреноблокатор

Снятие гипертензии,
аритмии

Рамиприл

Ингибитор АСЕ

Снятие гипертензии

Симвастатин

Статины
Синтетичний продукт
гриба Aspergillus terreus

Коррекция
гиперлипидемических состояний

Эверолимус

Цитостатичный
препарат
Синтетичнеский
продукт Streptomyces
hygroscopicus

Ингибитор mTOR

Украинской биологии не хватает связи с ИТ

Смешанное обучение

Полезняшки – полезные курсы

Полезняшки

Что такое персонализированная медицина?

Полезняшки

CRISPR и генмодификация

Некоторые наши проекты

Автоматизация тестов открытого поля

Перспективные проекты

RYBKA PROJECT

Гражданская наука в биологии

Спасибо за внимание!
Email: antonkulaga@gmail.com
Skype: anton_y_k
FB:

Кулага Антон

antonkulaga

Do-It-Yourself BIOlogy

Слайды по вопросам

Какие известные компании борятся со старением?

Слайды по вопросам

Угроза перенаселения?