MICROSATELITES

En gentica, los microsatlites (SSR o STR por sus acrnimos en ingls para simple
sequence repeat y short tandem repeat) son secuencias de ADN en las que un fragmento
(cuyo tamao va desde dos hasta seis pares de bases) se repite de manera consecutiva. La
variacin en el nmero de repeticiones crea diferentes alelos.
Generalmente se encuentran en zonas no codificantes del ADN. Son neutros, co-dominantes y
poseen una alta tasa de mutacin, lo que los hace muy polimrficos. A pesar de esto, la
variabilidad que presentan resulta til para su uso como marcadores moleculares, es respecto
al nmero de repeticiones, no de la secuencia repetida. Son utilizados como marcadores
moleculares en una gran variedad de aplicaciones en el campo de la gentica como
parentescos y estudios de poblaciones.

CONSTITUCION
Un microsatlite esta tpicamente conformado por un motivo repetitivo, en el cual se encuentra
contenido la secuencia repetida, y dos regiones flanqueantes, las cuales se encuentran a
ambos lados del motivo repetitivo. Sin embargo en algunos casos, pueden haber dos motivos
repetitivos o ms dentro de un microsatlite. Para que un microsatlite sea considerado til
como marcador molecular, toda la variacin de la secuencia o polimorfismo debe hallarse
dentro del motivo repetitivo, y por el contrario, las regiones flanqueantes deben estar
altamente conservadas al punto de no presentar ninguna variacin de secuencia.
Partiendo de esta hiptesis se disean primers o iniciadores (tambin llamados cebadores) es
decir, fragmentos de ADN que tienen la misma secuencia que los extremos de las regiones
flanquentes para poder amplificar (o producir un alto nmero de copias) un microsatlite a
travs de una PCR.
Los fragmentos as producidos son separados de acuerdo a su longitud en pares de base a
travs de una electroforesis en gel de agarosa. Partiendo de la hiptesis de que en un
microsatlite slo vara el nmero de repeticiones dentro del motivo repetitivo; fragmentos que
tienen el mismo tamao, as determinado por la Electroforesis en gel depoliacrilamida (PAGE),
tienen la misma secuencia, de manera que todos los fragmentos de un mismo tamao
representaran un alelo.
Estos alelos se herederan de manera codominante, es decir, que en cada locus un individuo
podra presentar uno o ms alelos, dependiendo del nmero de juegos decromosomas que
posea. Por ejemplo, los humanos somos diploides, es decir, poseemos dos juegos completos
de cromosomas y por lo tanto para un locus microsatlite podemos presentar un alelo (si

ambos progenitores nos transmitieron alelos de la misma secuencia y tamao) o dos alelos (si
cada progenitor nos hered un alelo de tamao diferente).
Se ha probado que los microsatlites son verstiles marcadores moleculares, particularmente
para los anlisis poblacionales, pero no por ello se encuentran ausentes de limitaciones.
Los microsatlites desarrollados para unas especies particulares pueden con frecuencia ser
aplicadas a especies emparentadas, pero el porcentaje de loci que se amplifican
satisfactoriamente puede disminuir cuando aumenta la distancia gentica.

CLACIFICACION

Los microsatlites se clasifica de acuerdo al nmero de nucletidos que posea el motivo de

repeticin como: mono, di, tri, tetra, penta o hexanucletido.
La clasificacin tambin incluye el patrn de orden de los motivos:

Puro o perfecto: Un solo motivo repetido n veces en serie. ej: (AC)9

Puro interrumpido: Un solo motivo repetido n veces, donde se intercalan nucletidos

entre las distintas repeticiones. ej: (CA)2AA(CA)12

Compuestos: Dos o ms motivos repetidos en serie. ej: (GT)2(TG)10

Compuestos interrumpidos: Al menos uno de sus motivos presenta nucletidos

intercalados. ej: (CT)4(GT)2CTAT(GT)15

Complejos: Combinaciones entre cualquiera de las clases anteriores, sin ningn patrn
de orden definido. ej: (ACC)8+TG+(GA)12+(TTA)5+GC+(TTA)4