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CAPTUL04

Energa

Resumen del captulo

T~OIM

l. Todos los seres vivos requieren energa de forma i!"!evitable.


La bioenergtica estudia las transformaciones energticas y
puede usarse para determinar la direccin y la cuanta con
las que proceden las reacciones bioqumicas. La entalpa
(una medida del contenido de calor) y la entropa (una magnitud del desorden) se relacionan, respectivamente, con la
primera y la segunda ley de la termodinmica. La energa
libre (la porcin de la energa total disponible para realizar
trabajo) est vinculada con una relacin matemtica entre
la entalpa y la entropa.
2. Las transformaciones energticas y calorficas suceden en
un "universo" formado por un sistema y sus alrededores.
En un sistema abierto se intercambian materia y energa entre el sistema y su entorno. Si puede intercambiarse energa,
pero no materia, con el entorno, se dice que el sistema es
cerrado. Los seres vivos son sistemas abiertos.
3. Varias magnitudes termodinmicas son funciones de estado; es decir, su valor no depende de la va utilizada para
crear o degradar una sustancia especfica. Algunos ejemplos de funciones de estado son la energa total, la energa
libre, la entalpa y la entropa. Algunas magnitudes como el

fWitCA

trabajo y el calor no son funciones de estado, pues dependen de la va utilizada.


4. La energa libre, una funcin de estado que relaciona la
primera y la segunda leyes de la termodinmica, representa
el mximo trabajo til que puede obtenerse de un proceso.
Los procesos exergnicos, o sea, aquellos en los que disminuye la energa libre (t:.G < 0), son espontneos. Si el
cambio de energa libre es positivo (t:.G > 0), el proceso se
denomina endergnico. Un sistema se encuentra en equilibrio cuando el cambio de energa libre es cero. La energa
libre estndar (t:.G 0 ) est definida para reacciones a 25 C,
l atm de presin y concentraciones de soluto 1 M. El pH
estndar en bioenergtica es 7. En este libro se utiliza el
cambio de energa libre estndar t:.G 0 ' a pH 7.
5. La hidrlisis del ATP proporciona la mayor parte de la energa libre que requieren los procesos vivos. El ATP est perfectamente adaptado para su funcin como moneda energtica universal, dado que es un fosfoanhdrido relativamente
inestable y tiene un potencial de transferencia de grupos
fosforilo, el cual es intermediario en la produccin de otras
biomolculas fosforiladas .

Pret.
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104
CAPITULO 3

proteo mas

Investigacin en protenas y

solamente las estructuras de protenas relativamente pequeas (40 kDa), pero es


seguro que su poder de resolucin va a aumentar. El poder de la RMN se ha potenciado notablemente por la posibilidad de producir, utilizando la tecnologa del DNA
recombinante, protenas marcadas uniformemente con 13 C, 15 N y 2H en sitios especficos (Captulo 5).
A finales de 2009 se haban resuelto cerca de 60.000 estructuras proteicas por
cristalografa de rayos X y espectroscopia de RMN, y cada da se determinan varias
estructuras nuevas. Las coordenadas se recogen en el banco de datos de protenas
(PDB, Protein Data Bank) (www. pdb.org), donde las estructuras estn accesibles
para su visualizacin y anlisis. El conocimiento de la arquitectura molecular detallada de las protenas ha permitido ver cmo las protenas reconocen y se unen a
otras molculas, cmo funcionan como enzimas, cmo se pliegan y cmo evolucionan. Esta cosecha extraordinariamente rica contina a un ritmo acelerado y est
influyendo sobremanera en todo el rea de la bioqumica as como en las ciencias
biolgicas y fsicas .

Resumen
El progreso rpido en la secuenciacin gnica ha propiciado otro de los xitos
de la bioqumica, -el conocimiento del proteoma. El proteoma es el conjunto
completo de protenas expresadas e incluye la informacin sobre cmo se modifican, cmo funcionan y cmo interaccionan con otras molculas.
3.1 La purificacin de las protenas es un primer paso esencial para el

conocimiento de su funcin
Se pueden separar las protenas entre ellas y de otras molculas en base a caractersticas como solubilidad, tamao, carga y afinidad de unin. La electroforesis en gel de SDS-poliacrilamida separa las cadenas de polipptido de las protenas en condiciones desnaturalizantes principalmente de acuerdo con su
masa. Las protenas tambin se pueden separar electroforticamente en base a
su carga neta por isolectroenfoque en gradiente de pH. La ultracentrifugacin
y la cromatografa de filtracin en gel separan las protenas de acuerdo con su
tamao, mientras que la cromatografa de intercambio inico las separa principalmente en base a su carga neta. La alta afinidad de muchas protenas por
grupos qumicos especficos se utiliza en la cromatografa de afinidad, en la que
las protenas se unen a columnas que contienen bolitas que llevan unidos covalentemente sustratos, inhibidores u otros grupos reconocidos especficamente.
La masa de una protena se puede determinar de forma precisa por medidas de
sedimentacin en el equilibrio.
3.2 Las secuencias de aminocidos de las protenas se pueden determinar

experimentalmente
Las secuencias de aminocidos son ricas en informacin relativa a la afinidad
de las protenas, sus relaciones evolutivas, y las enfermedades producidas por
las mutaciones. El conocimiento de una secuencia proporciona claves vlidas
sobre la conformacin y la funcin. La composicin en aminocidos de una
protena se puede averiguar hidrolizando la protena hasta sus aminocidos
constitutivos en HCl 6 N a 11 O C. Los aminocidos se pueden separar por
cromatografa de intercambio inico y cuantificar por su reaccin con ninhidrina o fluorescamina. Las secuencias de aminocidos se pueden determinar
mediante la degradacin de Edman, que libera uno a uno los aminocidos,
secuencialmente desde el extremo amino terminal del pptido. Las cadenas
polipeptdicas ms largas se fraccionan en otras ms cortas para su anlisis,
rompindolas especficamente con reactivos como el bromuro de ciangeno,
que rompen los enlaces peptdicos en el lado carboxlico de residuos de metionina, o el enzima tripsina, que corta en el lado carboxlico de los residuos de
lisina y arginina.

3.3 La inmunologa proporciona tcnicas importantes para la investigacin

105

en protenas
Se pueden detectar y cuantificar protenas mediante anticuerpos altamente
especficos; los anticuerpos monoclonales son especialmente tiles porque son
homogneos. Los ensayos de inmunoabsorcin unida a enzimas y la transferencia Western de geles de SDS-poliacrilamida se usan con regularidad.
Tambin se pueden localizar las protenas dentro de las clulas mediante la
microscopa de inmunofluorescencia y la microscopa inmunoelectrnica.

Trminos clave

3.4 La espectrometra de masas es una tcnica poderosa para la

identificacin de pptidos y protenas


Tcnicas como la espectrometra de desercin/ionizacin en matriz inducida
por lser (MALDI) y la ionizacin por electroespray (ESI) permiten la generacin de iones de protenas y pptidos en fase gaseosa. La masa de estos iones de
protena se puede determinar con gran exactitud y precisin. Las masas determinadas por estas tcnicas actan como etiquetas nominales de las protenas
debido a que la masa de la protena est determinada de modo preciso por su
composicin en aminocidos y, por lo tanto, por su secuencia. La espectrometra de masas en tndem es una alternativa a la degradacin de Edman que
permite la secuenciacin rpida y muy precisa de los pptidos. Las tcnicas de
espectrometra de masas son fundamentales en la protemica porque hacen
posible analizar los constituyentes de los grandes complejos macromoleculares
u otras muchas protenas.
3.5 Los pptidos se pueden sintetizar por mtodos automatizados en fase

slida
Las cadenas de polipptidos se pueden sintetizar por mtodos en fase slida automatizados en los que el extremo carboxlico de la cadena creciente se une a un
soporte insoluble. El grupo carboxilo del arninocido entrante se activa con diciclohexilcarbodiimida y se une al grupo arnino de la cadena creciente. Los pptidos sintticos pueden servir como frmacos y cama antgenos para estimular la
formacin de anticuerpos especificas. Tambin pueden ser fuente de conocimiento de la relacin entre la secuencia de aminocidos y su conformacin.
3.6 La estructura tridimensional de las protenas se puede determinar por

cristalografa de rayos X y espectroscopia de RMN


La cristalografa de rayos X y la espectroscopia de resonancia magntica
nuclear han enriquecido sobremanera nuestro conocimiento de cmo las protenas se pliegan, reconocen a otras molculas y catalizan reacciones qumicas.
La cristalografa de rayos X es posible porque los electrones dispersan los
rayos X . El patrn de difraccin que se produce se puede analizar para revelar
el orden de los tomos en una protena. Actualmente, se conoce la estructura
tridimensional de decenas de miles de protenas a detalle atmico. La espectroscopia de resonancia magntica nuclear revela la estructura y dinmica de las
protenas en disolucin. El desplazamiento qumico de los ncleos depende de
su entorno local. Adems, los espn de los ncleos vecinos interaccionan entre
s de modo que proporcionan informacin estructural concluyente. Esta informacin se puede utilizar para establecer las estructuras tridimensionales completas de las protenas.

Trminos clave
proteoma (p . 66)
ensayo (p. 67)
actividad especfica (p. 67)
homogenado (p. 67)

precipitacin salina (p. 68)


dilisis (p. 69)
cromatografa de filtracin en gel
(p. 69)

cromatografa de intercambio inico (p. 70)


intercambio catinico (p. 70)
intercambio aninico (p. 70)
cromatografa de afinidad (p. 70)

11

212
CAPTULO 7 La hemoglobina:
instantnea de una protena en accin

Un examen reciente de la secuencia del genoma humano ha puesto de manifiesto la existencia de dos globinas suplementarias. Ambas protenas son monomricas y son ms parecidas a la mioglobina que a la hemoglobina. La primera, la
neuroglobina, se expresa mayoritariamente en el cerebro y a niveles espectaculares
en la retina. Se cree que la neuroglobina puede desempear su funcin protegiendo los tejidos neuronales de la hipoxia (insuficiencia de oxgeno). La segunda, la
citoglobina, se expresa homogneamente por todo el cuerpo. Estudios estructurales y espectroscpicos indican que, tanto en la neuroglobina como en la citoglobina, las histidinas proximal y distal estn coordinadas con el tomo de hierro en la
forma desoxi; la histidina distal se desplaza al unirse el oxgeno. Las funciones de
estos miembros de la familia de las globinas se dilucidarn por completo en estudios venideros.

Resumen
y la hemoglobina unen el oxgeno a los tomos de
hierro del grupo hemo
La mioglobina es una protena estructurada principalmente en a-hlice que
tiene el hemo como grupo prosttico. El hemo est formado por la protoporfirina, un componente orgnico con cuatro anillos pirrlicos unidos, y un ion de
hierro en su centro en estado Fe 2 + . En la mioglobina, el ion de hierro est coordinado con la cadena lateral de un residuo de histidina. Uno de los tomos de
oxgeno del 0 2 se une a un centro de coordinacin libre del hierro. Debido a la
transferencia parcial de electrones desde el hierro al oxgeno, al unirse oxgeno
el hierro se desplaza al plano de la porfirina. La hemoglobina consiste en cuatro
cadenas polipeptdicas, dos cadenas a y dos 3. Cada una de estas cadenas es
similar a la mioglobina en su secuencia aminoacdica y se pliega en una estructura tridimensional parecida. El tetrmero de hemoglobina se describe mejor
como una pareja de dmeros a3.

7.1 La mioglobina

7.2 La hemoglobina se une al oxgeno de forma cooperativa


La curva de unin de oxgeno para la mioglobina pone de manifiesto que el
proceso de unin es de un simple equilibrio. La mioglobina se semisatura
de oxgeno a una concentracin de oxgeno de unos 2 torr. La curva de
unin de oxgeno para la hemoglobina tiene forma de "S" (es sigmoidea), lo
que indica que la unin de oxgeno es cooperativa. La unin de oxgeno a un
centro del tetrmero de hemoglobina afecta la afinidad para unirse al oxgeno de los dems centros desocupados. La unin y liberacin cooperativa de
oxgeno aumenta de forma significativa la eficacia del transporte de oxgeno. El porcentaje de capacidad potencial para transportar oxgeno de los
pulmones (a una presin parcial de oxgeno de 100 torr) a los tejidos (a una
presin parcial de oxgeno de 20 torr) es del66%. Este valor es muy superior
al 7%, valor que se hubiera obtenido empleando la mioglobina como transportador de oxgeno.
La estructura cuaternaria de la hemoglobina cambia al unirse oxgeno.
Se alude a la estructura de la desoxihemoglobina como estado T, y a la de la
oxihemoglobina como estado R. Durante la transicin entre los estados T y
R, los dos dmeros a3 giran unos 1 S grados uno respecto del otro. La unin
cooperativa puede explicarse potencialmente por los modelos concertado y
secuencial. En el modelo concertado, cada hemoglobina adopta el estado T o
el R; el equilibrio entre estos dos estados depende del nmero de centros de
unin ocupados por el oxgeno. Los modelos secuenciales permiten estructuras
intermedias. Los cambios estructurales en los centros del hierro en respuesta
a la unin de oxgeno se transmiten a la interfase entre los dmeros a3, lo que
afecta al equilibrio entre T y R.

Los hemates contienen 2,3-bisfosfoglicerato a concentraciones cercanas a


las de hemoglobina. El 2,3-BPG se une firmemente al estado T pero no al R,
estabilizando el estado T y disminuyendo la afinidad de la hemoglobina por
el oxgeno. La hemoglobina fetal se une al oxgeno ms firmemente que la del
adulto, debido a su unin ms dbil al 2,3-BPG. Esta diferencia permite la
transferencia del oxgeno desde la sangre materna a la fetal.

213

Apndice

7.3 El efecto Bohr: los hidrogeniones y el dixido de carbono estimulan

la liberacin de oxgeno
Las propiedades de la hemoglobina para unirse al oxgeno estn muy afectadas
por el pH y por la presencia de dixido de carbono, un fenmeno conocido
como efecto Bohr. Ai aumc:ntar la concentracin de hidrogeniones -esto es, al
disminuir el pH- disminuye la afinidad de la hemoglobina por el oxgeno,
debido a la protonacin del amino terminal y ciertos residuos de histidina. Los
residuos protonados facilitan la estabilizacin del estado T. Concentraciones
elevadas de dixido de carbono tambin disminuyen la afinidad de la hemoglobina por el oxgeno por dos mecanismos. Primero, el dixido de carbono se
convierte en cido carbnico, que disminuye la afinidad de la hemoglobina por
oxgeno al bajar el pH dentro del hemate. Segundo, el dixido de carbono se
incorpora al amino terminal de la hemoglobina para formar carbamatos. Estos
grupos cargados negativamente estabilizan la desoxihemoglobina mediante
interacciones inicas. Debido a que los hidrogeniones y el dixido de carbono
se producen en tejidos de metabolismo rpido, el efecto Bohr ayuda a liberar
oxgeno en los sitios donde ms se necesita.
7.4 las mutaciones en los genes que codifican las subunidades de

la hemoglobina pueden producir enfermedades


La enfermedad de las clulas falciformes se debe a una mutacin en la cadena ~
de la hemoglobina que sustituye un residuo de valina por uno de glutamato.
Como resultado, se forma un parche adhesivo en la superficie de la desoxihemoglobina (en estado T) lo que conlleva a la formacin de polmeros fibrosos.
Estas fibras deforman los hemates hasta que adquieren forma de hoz. La
enfermedad de las clulas falciformes fue la primera enfermedad asociada a
cambios en la secuenci:l aminoacJica de una protena. Las talasemias son
enfermedades causadas por la deficitaria produccin de las cadenas u o ~ de la
hemoglobina. Se sintetizan tetrmeros de hemoglobina que contienen un solo
tipo de cadena de hemoglobina. Estas molculas de hemoglobina se caracterizan por presentar escasa solubilidad y una pobre liberacin de oxgeno, lo que
origina la destruccin de los hemates durante su desarrollo. Los precursores de
los hemates producen normalmente un ligero exceso de cadenas u de hemoglobina respecto de cadenas~- Para evitar la agregacin del exceso de cadenas u,
producen una protena estabilizadora de hemoglobina u, que se une especficamente a los monmeros de cadenas u formando complejos solubles.

APNDICE. Los modelos para la unin pueden formularse en trminos


cuantitativos: la representacin de Hill y el modelo concertado
la representacin de Hill
Una manera til de describir procesos en los que se da unin
cooperativa, como en la hemoglobina, fue desarrollada en
1913 por Archibald Hill. Consideremos el hipottico equilibrio que se da entre una protena X cuando se une a su ligandoS:
X+ nS ~ X(S)n
(1)

donde n es una variable que puede adoptar valores tanto


enteros como fraccionales. El parmetro n es una medida del
grado de cooperatividad en la unin de ligando, aunque no
tiene ningn significado especial, ya que la ecuacin 1 no
representa ningn proceso fsico real. Si suponemos que X =
hemoglobina y S = z, el valor mximo den es 4. Se empleara este valor de n = 4 si fuera totalmente cooperativa la

247

Resumen

Resumen

8.1 Los enzimas son catalizadores eficaces y muy especficos

Los enzimas son los catalizadores de los sistemas biolgicos y casi todos los
enzimas son protenas. Los enzimas son muy especficos y tienen gran poder
cataltico. Pueden aumentar las velocidades de reaccin por factores de 10 6 o
aun mayores. Muchos enzimas requieren cofactores para su actividad cataltica. Dichos cofactores pueden ser iones metlicos o coenzimas, pequeas molculas orgnicas derivadas de vitaminas.
8.2 La energa libre es una funcin termodinmica til para la

comprensin de los enzimas


La energa libre (G) es la funcin termodinmica ms valiosa para determinar
si una reaccin puede tener lugar y para entender la energtica de la catlisis.
Una reaccin transcurre de forma espontnea solo si es negativo el cambio en la
energa libre (ilG). Se denomina cambio de energa libre estndar (LlG 0 ), al
cambio de energa libre que se produce en una reaccin en la que las actividades
de los reactantes y de los productos es la unidad. Los bioqumicos utilizan normalmente el LlG 0 ' , que es el cambio de energa libre estndar a pH 7. Los enzimas no modifican el equilibrio de la reaccin, sino que aumentan las velocidades
de la reaccin.
8.3 Los enzimas aceleran las reacciones facilitando la formacin del
est;~do

de transicin
Los enzimas actan como catalizadores disminuyendo la energa libre de activacin de las reacciones qumicas. Los enzimas aceleran las reacciones, ya que
proporcionan nuevas vas de reaccin en las que el estado de transicin (la
forma de mayor energa) tiene menor energa libre, y, por tanto, se forma ms
rpidamente que en las reacciones no catalizadas
La primera etapa en !a catlisis es la formacin de un complejo enzima-sustrato. Los sustratos se unen a los enzimas en la cavidad del centro activo, de la
que se elimina el agua al unirse el sustrato. La especificidad de las interacciones
enzima -sustrato provienen, fundamentalmente, de los puentes de hidrgeno
formados, que son direccionales, y de la configuracin del centro activo, que
rechaza las molculas que no presentan una forma suficientemente complementaria. El reconocimiento de los sustratos por los enzimas va acompaado
de cambios conformacionales de los centros activos, que facilitan la formacin
del estado de transicin.
8.4 El modelo de Michaelis-Menten explica las propiedades cinticas de

muchos enzimas
El modelo de Michaelis- Menten explica las propiedades cinticas de muchos
enzimas. En este modelo, un enzima (E) se combina con un sustrato (S) para
formar un complejo enzima-sustrato (ES), que puede proseguir hasta formar
un producto (P) o disociarse en E y S.

La velocidad de formacin de producto, Va, viene dada por la ecuacin de


Michaelis-Menten:

donde V mx es la velocidad de reaccin, cuando el enzima est completamente


saturado de sustrato, y KM, la constante de Michaelis, es la concentracin de
sustrato a la cual la velocidad de reaccin es la mitad de la mxima. La velocidad mxima, V mx es igual al producto de kz o kcat por la concentracin total de
enzima. La constante cintica, kcat llamada nmero de recambio, es el nmero

>,

248
CAPITULO 8
y cintica

Enzimas: conceptos bsicos

de molculas de sustrato convertidas en producto por unidad de tiempo en un


solo centro cataltico, cuando el enzima est completamente saturado de sustrato. Los nmeros de recambio de muchos enzimas estn comprendidos entre 1
y 10 4 por segundo. La razn kcatiKM proporciona una informacin crucial
sobre la eficacia cataltica de los enzimas.
Los enzimas alostricos constituyen una clase importante de enzimas cuya
actividad cataltica se puede regular. Estos enzimas, que no siguen la cintica
de Michaelis-Menten, tienen mltiples centros activos. Estos centros activos
manifiestan cooperatividad, como se demuestra por la dependencia sigmoidea
de la velocidad de reaccin con respecto a la concentracin de sustrato.
8.5 Los enzimas se pueden inhibir mediante molculas especficas

Incluso los enzimas no alostricos se pueden inhibir por pequeas molculas


especficas o por iones. En la inhibicin irreversible, el inhibidor queda covalentemente unido al enzima, o ligado tan fuertemente a l, que resulta muy lenta la
disociacin del enzima. Los inhibidores covalentes constituyen un sistema muy
til para cartografiar el centro activo del enzima. Por el contrario, la inhibicin
reversible se caracteriza por un equilibrio rpido entre inhibidor y enzima. Un
inhibidor competitivo impide al sustrato unirse al centro activo, y reduce la
velocidad de reaccin al disminuir la proporcin de molculas enzimticas que
tienen unido sustrato. La inhibicin competitiva se puede contrarrestar aumentando la concentracin de sustrato. En la inhibicin incompetitiva, el inhibidor
se combina solamente con el complejo enzima-sustrato. En la inhibicin no
competitiva, el inhibidor disminuye el nmero de recambio. La inhibicin
incompetitiva y la no competitiva no se pueden contrarrestar aumentando la
concentracin de sustrato.
La esencia de la catlisis es la estabilizacin selectiva del estado de transicin. Por tanto, los enzimo.s se unen ms fuertemente al estado de transicin
que al sustrato. Los anlogos de los estados de transicin son compuestos estables que ~itan los rasgos claves de las especies de mayor energa. Son inhibidores eficaces y especficos de los enzimas, lo cual demuestra que la estabilizacin
del estado de transicin es un aspecto fundamental de la actividad enzimtica,
que conduce a la generacin de anticuerpos catalticos. Los anlogos de los
estados de transicin se utilizan como antgenos o inmungenos para producir
anticuerpos con propiedades catalticas.
8.6 Las molculas de enzima pueden estudiarse individualmente

Muchos enzimas ahora estn siendo estudiados in singulo, a nivel de una sola
molcula. Dichos estudios son importantes, ya que proporcionan una informacin que es muy difcil de obtener en estudios realizados con poblaciones de
molculas. Los mtodos de una sola molcula revelan una distribucin de las
caractersticas individuales del enzima, mientras que mediante la utilizacin de
mtodos de conjunto se obtiene un valor promedio.

APNDICE. Los enzimas se clasifican en base al tipo de reaccin que catalizan


Muchos enzimas tienen nombres comunes que proporcionan
escasa informacin sobre las reacciones que catalizan. Por
ejemplo, un enzima proteoltico segregado por el pncreas se
denomina tripsina. Pero la mayor parte de los enzimas se
denominan teniendo en cuenta sus sustratos y las reacciones
que catalizan, aadiendo el sufijo "asa". As, la hidrolasa
peptdica es un enzima que hidroliza enlaces peptdicos,
mientras que la ATP sintasa es un enzima que sintetiza A TP.
Para aportar una cierta coherencia a la clasificacin de
los enzimas, en 1964, la Unin Internacional de Bioquni.ca
cre una Comisin de Enzimas para que desarrollara una

nomenclatura para los enzimas. Las reacciones se dividieron


en seis grupos principales numerados del1 al 6 (Tabla 8.8).
Para identificar con precisin todos los enzimas, los grupos
se subdividieron varias veces hasta originar nmeros con
cuatro dgitos precedidos por las letras EC (de Enzyme
Commission).
Consideremos como ejemplo a la nuclesido monofosfato (NMP) quinasa, un enzima que se tratar con detalle en la
Seccin 9. 4 y que cataliza la reaccin siguiente:

ATP + NMP

ADP + NDP

249
Problemas

Tabla 8.8 Las seis clases principales de enzimas

Clase

Tipo de reaccin

Ejemplo

1. Oxidorreductasas

Oxidacin-reduccin
Transferencia de grupo

Lactato deshidrogenasa
Nuclesido monofosfato
quinasa (NMP quinasa)
Quimotripsina

16
9

Fumarasa

17

Triosa fosfato isomerasa


Aminoacil-tRNA sintetasa

30

2. Transferasas
3.

Hidrolasas

4. Liasas

S. Isomerasas
6. Ligasas

Reacciones de hidrlisis (transferencias de


grupos funcionales al agua)
Adicin y eliminacin de grupos para formar
dobles enlaces
Isomerizacin (transferencia intramolecular de grupos)
Unin de dos sustratos a expensas de la
hidrlisis del ATP

La NMP quinasa transfiere un grupo fosforilo desde el ATP


al NMP, para formar nuclesido difosfato (NDP) y ADP.
Por tanto, es una transferasa, es decir miembro de la Clase 2.
Adems del grupo fosforilo, se pueden transferir otros grupos, como, por ejemplo, azcares o unidades de un tomo de
carbono. Las transferasas que intercambian un grupo fosforilo se designan como 2.7. El grupo fosforilo puede ser aceptado por diferentes grupos funcionales. Si el grupo aceptor es

Captulo

16

un fosfato, la transferasa se designa 2. 7.4. El nmero final


designa ms detalladamente al aceptor. Observando la NMP
quinasa, el aceptor es un nuclesido monofosfato, y la designacin del enzima es EC 2. 7. 4. 4. Aunque los nombres comunes se utilizan de manera rutinaria, cuando pueda ser
ambigua la identidad de un enzima concreto, se utiliza el
nmero de clasificacin.

Trminos clave
enzima (p. 220)
sustrato (p. 220)
cofactor (p. 221)
apoenzima (p. 221)
holoenzima (p. 221)
coenzima (p. 221)
grupo prosttico (p. 221)
energa libre (p. 222)
energa libre de activacin (p. 222)
estado de transicin (p. 225)
centro activo (p. 227)

ajuste inducido (p. 228)

KM (constante de Michaelis) (p. 231)


Vmx (velocidad mxima) (p. 232)
ecuacin de Michaelis-Menten (p. 232)
ecuacin de Lineweaver-Burk
(representacin doble recproca) (p. 233)
nmero de recambio (p. 234)
cociente kcatfKM (p. 235)
reaccin secuencial (p. 236)
reaccin de doble desplazamiento
(ping-pong) (p. 237)

enzima alostrico (p. 237)


inhibicin competitiva (p. 238)
inhibicin incompetitiva (p. 238)
inhibicin no competitiva (p. 238)
reactivo especfico de grupo (p. 241)
marcador de afinidad (reactivo
anlogo del sustrato) (p. 241)
inhibicin basada en el mecanismo
(suicida) (p. 242)
anlogo del estado de transicin (p. 243)
anticuerpo cataltico (abozima) (p. 244)

Problemas
1. Razn de ser. Cules son las dos propiedades de los enzimas que
les convierten en catalizadores especialmente tiles?

6. Recovecos. Cul es el fundamento estructural de la especificidad


enzimtica?

2. Socios. Qu necesita un apoenzima para ser holoenzima?

7. Dar con una mano y coger con la otra. Por qu la energa de


activacin de una reaccin no aparece en la expresin final del t:I.G
de la reaccin?

3. Socios diferentes. Cules son los dos principales tipos de cofactores?


4. Una cada da. Por qu son importantes las vitaminas para gozar
de buena salud?
S. Una funcin de estado. Cul es el mecanismo fundamental por el
que los enzimas aumentan la velocidad de las reacciones qumicas?

8. Escalando montaas. Las protenas son inestables termodinmicamente. El t:I.G para la hidrlisis de las protenas es muy negativo,
aunque las protenas son muy estables. Explica esta aparente paradoja. Qu informacin proporciona respecto de la sntesis proteica?