RECOLECCIN Y CLASIFICACIN FENTICA DE ORGANISMOS VEGETALES A PARTIR

DE LA FLORA EN LA USC.

Collection and phenetic classification of plant organisms from the USC flora.

LILIAN DANIELA CARMONA C.1, ISABELLA GARCA C.2, DIANA MARA LARRAHONDO A.3,
JUAN CAMILO CAICEDO O.4
Resumen.

Abstract.

La clasificacin de organismos se ha
convertido en objeto de estudio de todas las
ramas de la biologa, sin embargo, podra
decirse que en esta actividad no se ve la
participacin del reino vegetal, claro est,
por fuera de la botnica.

The classification of organisms has become

in object of study of all branches of biology,
however, it could be said that in this activity
there is not participation of the vegetable
Kingdom, is clear, outside of Botany.

En la clasificacin de este reino por fuera de

su campo general, se tienen en cuenta los
conocimientos brindados por la taxonoma,
comenzando con la recoleccin de los
diferentes objetos de estudio, llevados a
discusin mediante caracteres relevantes,
escogidos a partir de la aplicacin de los
mtodos de la filogentica.
Ahora, a travs de la taxonoma numrica,
quien busca la clasificacin filogentica de
los seres vivos, se pone en prctica la
investigacin en el rea del campus de la
Universidad Santiago de Cali, basndose en
un estudio detallado de la diversidad de su
flora, con el fin de adquirir habilidades
cientficas en campos como la fentica.

For the classification of this kingdom out of

their general field, we take into account the
expertise provided by the taxonomy, starting
with the collection of the different objects of
study, brought to discussion by relevant
characters, chosen through the application
of the phylogenetic methods.
Now, through the numerical taxonomy,
which is looking for the phylogenetic
classification of living organisms, we put into
practice the research in the area of the
campus of the University Santiago de Cali,
based on a detailed study of the diversity of
its flora, in order to acquire scientific skills in
fields such as the phenetics.

1. Estudiante de microbiologa USC.

2. Tcnica en salud y nutricin; estudiante de microbiologa USC.
3. Auxiliar en enfermera; estudiante de microbiologa USC.
4. Tcnico en instalaciones elctricas residenciales; estudiante de microbiologa USC; juan.caicedo07@usc.edu.co

Palabras clave:
-

Matriz
Caracter
OTU (unidad taxonmica operativa)
CAS (coeficiente de agrupacin
simple)
CAJ (coeficiente de agrupacin
jaccard)

Keywords:
-

Matrix
Character
OTU (operational taxonomic unity)
JGC (Jaccard grouping coefficient)
SGC (Simple grouping coefficient)

Introduccin.
Los entes slo existen cuando se
[1]
contemplan
,
frase
mencionada
anteriormente por Aristteles, nos lleva a
pensar que el inters de las personas hacia
los temas expuestos anteriormente es
limitado y normalmente ignorado.
En la Universidad Santiago de Cali se
demuestra poco inters acerca de su flora y
el mundo de posibilidades que implica. El
objetivo principal de este trabajo es salir de
dichos contextos rutinarios y mostrar al
interesado lector, que cosas simples o
triviales pueden ser fascinantes.
Sabiendo que las hojas han sido objeto de
estudio alrededor de nuestra evolucin, se
asume que todos deberamos saber acerca
de ellas, sin embargo, la realidad es otra ya
que se desconoce an mucho de ellas,
incluyendo sus relaciones evolutivas.
De diez objetos de estudio (OTUS), se
evidencian sus relaciones evolutivas y
taxonmicas, esto a travs del mtodo
impuesto por la fentica, un mtodo que a
pesar de no ser sencillo, con atencin se
puede apreciar lo increblemente til y
eficiente que resulta.

Introduction.
"Bodies exist only when they are
contemplated" [1], phrase above mentioned
by Aristotle, it leads us to think that the
interest of the people towards the themes
above is limited and usually ignored.
The University Santiago de Cali shows little
interest about its flora and the world of
possibilities that implies. The main objective
of this work is to leave these routine
contexts and show the reader interested,
that simple or trivial things can be
fascinating.
Knowing that the leaves have been studied
around our evolution, it is assumed that
everyone should know about them,
however, the reality is another that is still
much unknown of them, including their
evolutionary relationships.
In ten objects of study (OTUS), we
appreciate their evolutionary and taxonomic,
relationships through the method imposed
by the phenetics, a method that despite not
being simple, carefully you can see how
incredibly useful and efficient it is.

1. Estudiante de microbiologa USC.

2. Tcnica en salud y nutricin; estudiante de microbiologa USC.
3. Auxiliar en enfermera; estudiante de microbiologa USC.
4. Tcnico en instalaciones elctricas residenciales; estudiante de microbiologa USC; juan.caicedo07@usc.edu.co

Materiales y mtodos.
Al realizar la clasificacin de los organismos
vegetales, y tomando como base los
caracteres aplicados esencialmente a las
hojas de los mismos, se escogieron como
objetos
de
estudio
diez
OTUS
aleatoriamente
del
campus
de
la
Universidad Santiago de Cali, de las cuales
obtuvimos los datos requeridos a partir de
veinte caractersticas generales de las
hojas, entre las cuales estaban los tipos de
nervaduras, su disposicin, la forma de la
hoja, tipo de borde, tipo de limbo, tipo de
peciolo, tipo de pice y forma de la base.
As, se hizo necesario que los organismos
escogidos contaran con parte del tallo con
el fin de comparar las caractersticas de
manera
adecuada,
realizando
los
respectivos
pasos
de
la
fentica,
principalmente evidenciados a travs de la
herramienta informtica Excel.
La clasificacin de las hojas se hizo
mediante una matriz bsica de datos, en la
cual
ubicamos
las
OTUS
y
las
caractersticas, comparando cuales de ellas
posean la caracterstica en cuestin,
(1posee, 0no posee). Ver anexos: figura
5. Ya conociendo estos datos, se procedi a
realizar la respectiva concatenacin entre
todas las OTUS, y a partir de ello se
sacaron los resultados y convenciones1 que
utilizaramos en el siguiente paso:
coeficiente de similitud entre ellas, para lo
cual, se usaron dos tipos de coeficientes,
Jaccard2 y Coeficiente de asociacin simple
(CAS)3. Ver anexos: figura 6 y 7.
Pasado
el
seleccionaron

proceso
dos

anterior,
mtodos

se
de

agrupamiento, en este caso Simple y

Promedio, siendo estos aplicados a las
tablas que resultaron de los coeficientes de
similitud anteriormente mencionados. En
ambos mtodos, tanto el Simple como el
Promedio, se agrup la pareja con mayor
similitud, fabricando otra tabla en la que
sucesivamente haramos lo mismo. Para la
realizacin de las tablas posteriores, se
encuentra una diferencia entre ambos
mtodos, en el mtodo de agrupamiento
simple, se escoge el mayor valor entre los
dos que existen al haber agrupado la pareja
de mayor similitud, asociado a otra OTU
diferente. En cuanto al mtodo de
agrupamiento promedio, como su nombre lo
indica, se realiz el promedio entre estos
dos valores.
Finalmente, para ver de manera adecuada y
ms sencilla las comparaciones que
realizamos durante el proceso, se realizaron
cuatro fenogramas correspondientes a los
coeficientes usados, con sus respectivos
mtodos de agrupamiento.

Resultados.
Ahora, al haber realizado el experimento
expuesto, se obtuvieron como resultados
las siguientes series de tablas con sus
respectivos fenogramas. En este punto, nos
limitaremos a ubicar los resultados
obtenidos, con el fin de discutirlos
posteriormente en la seccin: discusin de
resultados, donde expondremos lo que se
ha concluido a partir de los cuadros y
diagramas expuestos a continuacin.

1. Estudiante de microbiologa USC.

2. Tcnica en salud y nutricin; estudiante de microbiologa USC.
3. Auxiliar en enfermera; estudiante de microbiologa USC.
4. Tcnico en instalaciones elctricas residenciales; estudiante de microbiologa USC; juan.caicedo07@usc.edu.co

Fenograma 1

Tabla coeficiente simple, mtodo de agrupamiento simple

Tabla coeficiente simple, mtodo de agrupamiento promedio

Fenograma 2

Tabla coeficiente Jaccard, mtodo promedio

Fenograma 3

Tabla coeficiente Jaccard, mtodo promedio

Fenograma 4

Discusin de resultados.
Al finiquitar el proceso experimental
explicado anteriormente y obtener los datos
registrados en los resultados, podemos ver
ciertas diferencias apreciables entre los
coeficientes de similitud: Jaccard y Simple.
As, vemos que el coeficiente de Jaccard
puede asumirse como un coeficiente ms
preciso dado que omite la ausencia de un
carcter en ambas OTUS, a diferencia del
coeficiente simple, quien toma como dato
relevante la similitud de no poseer el
6

carcter. Por lo tanto, comparando con otros

[2]
artculos
relacionados
al
tema
,
encontramos que la disimilitud, no siempre
es un dato sensato que debemos tomar.
Jaccard, quien relaciona el nmero de
especies compartidas con el nmero total
de especiales exclusivas, result siendo
mejor para concluir el nivel de similitud entre
los objetos de estudio, observacin
apreciable a partir de los fenogramas,
donde se ve que la mayora de OTUS estn
estn dicotmicamente unidas.
En cuanto a los mtodos de agrupamiento:
simple y promedio, nos fue posible
determinar que el promedio resulta ms
apropiado, ya que en vez de ignorar uno de
los datos necesarios para el posterior
agrupamiento, toma ambos valores y los
promedia
logrando
un
valor
ms
significativo.
Ahora, podemos deducir al terminar el
proceso investigativo, pueden aprenderse
conocimientos extropolables a otras reas,
otros aos, otros genotipos, otras especies,
otras sociedades, como lo son los pasos de
la fentica y la recoleccin de datos para
ello.
Finalmente, se lograron los cometidos de la
prctica, comenzando por haber logrado
analizar
las
distintas
modificaciones
estructurales de las hojas que ocurren en
diferentes especies, lo que nos llev a
reconocer la variacin morfolgica de las
hojas, de acuerdo a la presencia de
caracteres tales como el limbo, peciolo,
margen limbo, raquis y disposicin de las
hojas, y como el ms importante,
analizamos
la importancia ecolgica y
taxonmica de las hojas.

Literatura citada.
https://www.google.com.co/url?
sa=t&rct=j&q=&esrc=s&source=web
&cd=5&ved=0CDQQFjAE&url=http
%3A%2F%2Fcmap.upb.edu.co%2Frid
%3D1154442556640_135730134_146
40%2FARIST
%25C3%2593TELES_Y_LA_METAF
%25C3%258DSICA_COMO.doc&ei=gknVZvfEMz8sASNlYC4Cw&usg=AFQjC
NFtKrQUdVHGD46Ntf4i4I6ecAxC7w
[1]

[2]

http://people.revoledu.com/kardi/tutori
al/Similarity/Jaccard.html
Bibliografa.
-

Shape Analysis and Classification:

Theory and Practice Escrito por
Luciano da Fontoura Costa,Roberto
Marcond Cesar, Jr.
Biologa de las plantas, Volumen 2
Escrito por Peter H. Raven,Ray F.
Evert,Susan E. Eichhorn
http://www.autom.teithe.gr/gr/drastiri
otites/impro3Dpos/papers/ICTA05_Pl
ant_Leaves_Classification.pdf
similarity%26catid
%3D38:cat_coding_algorithms_datasimilarity%26Itemid%3D57

Anexos.
1) Fotografas de las OTUS (orden 1-10)

2) Dibujos las OTUS (orden de 1-10)

OTU 1

OTU 1

OTU 2

OTU 2

OTU 3

OTU 3

OTU 6

OTU 4
OTU 4

OTU 5

OTU 5

OTU 8

OTU 6

OTU 9

OTU 7

10

OTU 7

OTU 9
OTU 8

OTU 10

3) Matriz realizada a partir de los caracteres elegidos.

11

OTU 10

Figura 5: Matriz bsica de datos.

3) Tabla de concatenacin y resultados de coeficientes Jaccard y Simple. (Dividido en 2 partes)

12

Figura 6: primera parte tabla de concatenacin y coeficientes.

Figura 7: segunda parte tabla de concatenacin y coeficientes.

13