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GENTICA
GENTICA
ERRNVPHGLFRVRUJ
Ariel
NDICE
Autores..........................................................................................................................................
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PRIMERA PARTE
INTRODUCCIN
CAPTULO 1. Introduccin..........................................................................................................
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SEGUNDA PARTE
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1. Conjugacin bacteriana.............................................................................................................
1.1. El factor de fertilidad epismico F....................................................................................
1.2. Cartografa por apareamiento interrumpido.......................................................................
1.3. Factores F portadores de genes bacterianos: sexduccin...................................................
2. Transformacin bacteriana........................................................................................................
3. Transduccin.............................................................................................................................
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TERCERA PARTE
GENTICA MOLECULAR
CAPTULO 11. Replicacin del material gentico......................................................................
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1. Concepto de epigentica...........................................................................................................
2. Fundamentos moleculares........................................................................................................
2.1. Modificaciones del ADN y las histonas.............................................................................
2.2. Patrones de metilacin del genoma de mamferos.............................................................
3. Inactivacin de un cromosoma X en la lnea somtica de las hembras de mamfero..............
4. Los fenmenos de imprinting o marcado..................................................................................
5. Alteraciones de los procesos epigenticos y enfermedades humanas......................................
6. Silenciamiento gentico mediado por ARN..............................................................................
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8. Secuenciacin............................................................................................................................
9. Amplificacin en cadena de la polimerasa................................................................................
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Lecturas recomendadas................................................................................................................
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Lecturas recomendadas................................................................................................................
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CUARTA PARTE
VARIACIN GENTICA
CAPTULO 22. Fundamentos moleculares y citogenticos de la variacin gentica...............
1. Tipos de mutaciones gnicas.....................................................................................................
2. Mutaciones germinales y somticas.........................................................................................
3. Sistemas de deteccin y seleccin en procariotas y eucariotas.................................................
3.1. Reversin de auxtrofos.....................................................................................................
3.2. Enriquecimiento por filtracin...........................................................................................
3.3. Enriquecimiento por penicilina (y otros antibiticos)......................................................
3.4. Seleccin de resistencias a agentes no tolerados por las cepas salvajes............................
4. Carcter preadaptativo de la mutacin......................................................................................
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Lecturas recomendadas...............................................................................................................
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1. Mecanismos de reparacin........................................................................................................
1.1. Sistemas preventivos.........................................................................................................
1.2. Sistemas de reparacin directa...........................................................................................
1.3. Sistemas de reparacin por escisin..................................................................................
1.4. Sistemas de reparacin posreplicativa: reparacin de emparejamientos errneos (MMR)
1.5. Reparacin recombinatoria (HR).......................................................................................
1.6. Reparacin inducida ante un dao generalizado: respuesta SOS......................................
1.7. Reparacin inducida en clulas eucariotas.........................................................................
2. Enfermedades humanas debidas a fallos en los sistemas de reparacin...................................
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1. Transposones procariticos.......................................................................................................
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QUINTA PARTE
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Lecturas recomendadas...............................................................................................................
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SEXTA PARTE
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Lecturas recomendadas................................................................................................................
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1. Fuentes de variacin..................................................................................................................
2. Procesos sistemticos................................................................................................................
2.1. Mutaciones..........................................................................................................................
2.2. Recombinacin...................................................................................................................
2.3. Migracin............................................................................................................................
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Lecturas recomendadas.................................................................................................................
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1. Seleccin....................................................................................................................................
1.1. Seleccin contra el alelo dominante...................................................................................
1.2. Seleccin contra el alelo recesivo.......................................................................................
1.3. Seleccin en contra y a favor de los heterocigotos.............................................................
1.4. Seleccin dependiente de la frecuencia..............................................................................
2. Deriva gentica..........................................................................................................................
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Lecturas recomendadas................................................................................................................
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1. Teoras evolutivas......................................................................................................................
2. Divergencia de las poblaciones.................................................................................................
3. El proceso de especiacin..........................................................................................................
4. La evolucin a nivel molecular.................................................................................................
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Lecturas recomendadas.................................................................................................................
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Autores
JOS FERNNDEZ PIQUERAS (1952)
Licenciado en Ciencias Biolgicas por la Universidad de Granada, Doctor por la Universidad Autnoma de Madrid y Catedrtico de Gentica en la Universidad Autnoma de Madrid. Ha
realizado estancias y mantenido relaciones de trabajo con numerosos Centros de Investigacin
nacionales e internacionales de prestigio (Max Planck, Medical School of the NY University,
CBM, CNB, CNIO, Instituto Pasteur de Pars, etc.) y ha dirigido o participado en numerosos proyectos de investigacin.
Sus lneas actuales de investigacin se centran en la caracterizacin de genes supresores y
modificadores implicados en el desarrollo de linfomas, y en la bsqueda de genes de susceptibilidad en enfermedades psiquitricas.
Autor de ms de 200 publicaciones en las revistas internacionales del mayor prestigio en sus
reas de investigacin: Cancer Research, Oncogene, American Journal of Medical Genetics,
Leukemia, Carcinogenesis, Molecular Psychiatry, Neuropsychopharmacology, Pharmagenetics,
etc.
Ha sido Director del Departamento de Gentica y del Departamento de Biologa y en la actualidad dirige el Laboratorio de Gentica Molecular Humana en la Universidad Autnoma de
Madrid.
Es miembro de numerosas Sociedades Cientficas como: la International Mammalian Genome Society, SEG, The American Association for the Advancement of Science, AEG, Asociacin
Espaola de Investigacin contra el Cncer, etc.
ANTONIA MARA FERNNDEZ PERALTA (1953)
Licenciada en Ciencias Biolgicas por la Universidad de Granada y Doctora en Ciencias
por la Universidad Autnoma de Madrid.
Sus lneas de investigacin se centran en el anlisis de alteraciones genticas implicadas en
el desarrollo del cncer (cncer colorrectal, gstrico y neoplasias hematolgicas), con especial
incidencia en las alteraciones en genes de predisposicin en sndromes de cncer hereditario.
Es autora de numerosas publicaciones en revistas internacionales de prestigio (Leukemia,
Cancer Genetics and Cytogenetics, British Journal of Cancer, Human Genetics, Annals of
Oncology, American Journal of Clinical Oncology, etc.) y ha dirigido o participado en numerosos proyectos de investigacin (CAyCYT, CICYT, FIS, Comunidad Autnoma de Madrid, Cooperacin con Iberoamrica, Unin Europea, etc.).
Colabora con diversos Centros de Investigacin y Hospitales (tanto nacionales como extranjeros) de reconocido prestigio. Ha recibido numerosos premios, entre los que destaca el Premio
Braun-Dexon, entregado por el Ministro de Sanidad en 1995, a la mejor publicacin en la revista
Ciruga Espaola.
Ha sido Vicedecana de Nuevas Titulaciones de la Facultad de Ciencias de la Universidad
Autnoma de Madrid.
Es miembro de varias Sociedades Cientficas como: The American Association for the
Advancement of Science, Sociedad Espaola de Gentica, Asociacin Espaola de Gentica
Humana, Asociacin Espaola de Investigacin contra el Cncer, etc.
FRANCISCO JAVIER SANTOS HERNNDEZ (1958)
Doctor en Ciencias Biolgicas por la Universidad Autnoma de Madrid (premio extraordinario de doctorado). Profesor Titular de Gentica de la Universidad Autnoma de Madrid.
Ha realizado estancias en Hahnemann University, Medical Center, Dpt. Neoplastic Diseases, New York University, Medical Center, Dpt. Pathology, Institut Pasteur de Paris, Unit Gntique des Mammifres.
18
GENTICA
Captulo
Introduccin
JOS FERNNDEZ PIQUERAS
22
GENTICA
INTRODUCCIN
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INTRODUCCIN
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GENTICA
do aislar las variantes mutacionales de los genes que los controlan. Se sabe que existe un
gen cuando se encuentra alguna variante del
alelo salvaje producida por mutacin. La
prueba de alelismo o el anlisis de complementacin constituye una herramienta gentica esencial para decidir si las diferentes
mutaciones que afectan a un mismo carcter
son variantes allicas de un mismo gen o pertenecen a genes diferentes no allicos. Por este
motivo los genetistas han tenido siempre un inters primordial en el anlisis de las mutaciones, seleccionando las que ocurren de manera
espontnea, o inducindolas artificialmente. La
investigacin sobre mutagnesis tuvo sus
principales antecedentes en los trabajos de
Muller, que recibi el Premio Nobel de 1946
por el descubrimiento del efecto mutagnico
de los rayos X, y los de Stadler, quien demostr el efecto mutagnico de algunos productos
qumicos. Desde entonces la mutagnesis inducida es una prctica generalizada que se
proyecta tanto en la investigacin bsica como
en la aplicada (mejora gentica animal y vegetal).
Una vez conocida la naturaleza, la estructura y la accin primaria del gen las investigaciones se centraron en la bsqueda de los mecanismos de regulacin de la expresin gnica.
Se hizo pronto evidente que los procesos de
desarrollo eran el resultado de un programa
gentico que funcionaba creando unos patrones
de expresin gnica diferencial, porque los genes eran los mismos en todos los tipos celulares. Adems, la expresin de los genes pareca
poder cambiar (ahora de modo reversible) en
funcin de las necesidades de la clula. Una
vez ms las bacterias fueron la puerta de entrada al conocimiento de los mecanismos de
regulacin al demostrarse el modelo del opern bacteriano. Jacob, Monod y Lwoff fueron
galardonados con el Nobel de 1965 por sus
contribuciones al conocimiento del control de
la expresin gnica. Ms tarde Lewis, Nusslein-Volhard y Wieschaus recibieron el Nobel
de 1995 por sus descubrimientos sobre el control gentico del desarrollo temprano del embrin. La Gentica del Desarrollo ha tenido
otros ilustres investigadores que tuvieron el
acierto de incorporar organismos especialmen
te aptos para este tipo de estudios como Drosophila y el nematodo Caenorhabditis elegans (Brenner, Gehring, Lewis, Bellido, Morata, etc.). Matizando una frase anterior, el
material gentico puede en realidad sufrir
reordenaciones o cambios durante el
desarrollo en tejidos especficos, y uno de
los ms significativos est relacionado con la
capacidad de respuesta inmunolgica de los
organismos. En este sentido los trabajos de
Tonegawa (que recibi el Nobel de 1987)
fueron esenciales para el descubrimiento de
los mecanismos genticos responsables de la
gran diversidad de anticuerpos que puede
producir un organismo. Ms recientemente,
Hartwell, Nurse y Hunt fueron galardonados
con el Nobel de 2001 por su descubrimiento
de las protenas bsicas que controlan el ciclo celular (ciclinas y quinasas dependientes
de ciclinas). Estos hallazgos han tenido gran
trascendencia en el estudio de los mecanismos genticos que originan el cncer, puesto
que muchos de los genes implicados (oncogenes y genes supresores) actan directa o
indirectamente descontrolando el ciclo celular. Bishop y Varmus recibieron el Nobel de
1989 por sus descubrimientos sobre el origen celular de los oncogenes virales. Finalmente, los experimentos de donacin de
mamferos a partir de clulas diferenciadas
del adulto, y los mecanismos de regulacin
de naturaleza epigentica (basados en modificaciones qumicas de las histonas, y de
secuencias reguladoras especficas del
ADN), constituyen dos de los focos de mayor atencin de los genetistas en los ltimos
aos.
A mediados de los setenta tuvo lugar
una autntica revolucin tecnolgica en el
campo de la Gentica Molecular: fue el nacimiento de la llamada Ingeniera Gentica o Tecnologa del ADN recombinante.
Aprovechando la universalidad de los
procesos genticos esenciales, y la incorporacin de las endonucleasas de restriccin,
fue posible construir nuevas combinaciones de material gentico mezclando el de
organismos tan dispares como una bacteria y
el ser humano. La inclusin de un fragmento
gnico humano dentro de un plsmido bacte
INTRODUCCIN
riano (donacin molecular), en condiciones tales que era posible incluso su expresin, fue un
logro autnticamente revolucionario. Arber,
Smith y Nathans recibieron el Nobel de 1978
por el descubrimiento de las endonucleasas de
restriccin y su aplicacin en Gentica Molecular. Ms tarde Berg, Gilbert y Sanger recibieron el Nobel de 1980 por sus estudios sobre
el ADN recombinante, y el desarrollo de una
metodologa eficaz para la secuenciacin de
los cidos nucleicos. En 1993 Mullis fue galardonado con el premio Nobel de Qumica por
el desarrollo de la tcnica de amplificacin en
cadena de la polimerasa (PCR), que consiste
bsicamente en la posibilidad de replicar in
vitro cualquier fragmento de ADN de una
forma rpida y eficaz, sin necesidad de clonarlo. Las posibilidades abiertas por la Ingeniera
Gentica son extraordinarias. As, por ejemplo,
se ha hecho posible la mutagnesis dirigida,
es decir el diseo in vitro de mutaciones ad
hoc, el anlisis de la variabilidad gentica a
travs de las secuencias de nucletidos del
ADN (polimorfismos de ADN que sirven para
definir las huellas dactilares de ADN de los
organismos, y para completar la elaboracin de
los mapas genticos), la modificacin de organismos por transferencia gnica (organismos
transgnicos), la terapia gnica, y el desarrollo
de una nueva Biotecnologa que est revolucionado los planteamientos de la economa
mundial, y provocando sentimientos encontrados.
En los ltimos aos la comunidad cientfica internacional ha afrontado el reto de la secuenciacin de genomas completos para conseguir una visin integrada de la estructura y
funcin del genoma de los organismos (Genmica). El Proyecto Genoma Humano, la
aventura ms paradigmtica en este nuevo
campo, ha sido posible gracias a los notables
avances alcanzados en otras disciplinas como
la robtica y la bioinformtica. El mes de febrero de 2001 un Consorcio Internacional y la
empresa privada Celera Genomics hicieron
pblica la secuencia de bases nucleotdicas del
primer gran borrador del Genoma Humano. El
anlisis de los genomas secuenciados est
25
Lecturas recomendadas
De Frutos Illn, R. (2000): Gentica y
Genmica, Universidad de Valencia.
Garrod, A. E. (1909): Inborn Errors of
Metabolism, Hodder & Stoughton, Londres.
Lacadena, J. R. (1995): Historia novelada de la Gentica, Instituto de Espaa/Real
Academia de Farmacia (pp. 1-83).
Lander, E. S. y Weinberg, R. A. (2000):
Genomics: journey to the center of biology, Science, 287, pp. 1.777-1.782.
Orel, V. (1996): Gregor Mendel. The
first geneticist, Oxford Univ. Press.
Ridley, M. (2000): Genoma, Taurus.
Watson, J. D. (1968): The double helix,
Signet, Nueva York.
Captulo
1.
2.
3.
4.
5.
Lecturas Recomendadas
32
GENTICA
FIG. 2.1. Tcnica de castracin y aislamiento, y los siete caracteres estudiados por Mendel en el guisante.
33
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GENTICA
35
al azar, sin sufrir modificacin alguna, para formar los gametos de un individuo dihbrido para
los caracteres correspondientes.
Cuando se trata de ms de dos pares de
caracteres considerados a la vez se hablara de
polihibridismo (fig. 2.4).
2. Teora cromosmica de la herencia
2.1. LOS GENES ESTN EN LOS CROMOSOMAS
36
GENTICA
FIG.2.4. Polihibridismo.
37
tene, paquitene, diplotene y diacinesis), metafase I, anafase I y telofase I. En leptotene los cromosomas inician su con-densacin y comienzan
a visualizarse. En cigotene se inicia la formacin de los complejos sinaptonmicos que median el apareamiento de los cromosomas homlogos para formar los bivalentes (estructuras
cudruples con cuatro cromtidas). En paquitene se completa la formacin de los complejos
sinaptonmicos y se inicia el fenmeno del
crossing-over o entrecruzamiento. En diplotene desaparecen los complejos y se visualizan
con claridad los quiasmas en los lugares del
intercambio fsico entre cromtidas homlogas.
En diacinesis se inicia la co-orientacin de los
centrmeros de los bivalentes hacia la placa
ecuatorial del huso, y desaparecen la membrana
nuclear y el nuclolo. En metafase I los bivalentes estn perfectamente co-orientados en la
placa ecuatorial y se inicia la resolucin (terminalizacin) de los quiasmas. En anafase I se
produce la segregacin (reduccin cromosmica) de cromosomas homlogos quedando
38
GENTICA
FIG. 2.6. Representaciones esquemticas de los procesos mittico (a) y meitico (b).
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GENTICA
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GENTICA
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GENTICA
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GENTICA
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GENTICA
5. EI problema de la compensacin
de la dosis gnica
clonalmente en todas las clulas descendientes. Este hecho puede generar situaciones de mosaicismo en el adulto que seran
especialmente detectables en algunas mujeres,
como las heterocigticas para una mutacin
recesiva ligada al X que determina la ausencia
de glndulas sudorparas. En estas mujeres se
pueden observar sectores de su cuerpo con o sin
glndulas dependiendo del cromosoma X que se
haya inactivado.
5.1. HERENCIA LIGADA AL Y
gen
presente
49
Lecturas recomendadas
Captulo
Naturaleza y estructura
del material gentico
JOS FERNNDEZ PIQUERAS
1.
2.
3.
Los Priones
4.
5.
Lecturas Recomendadas
52
1.
GENTICA
en su sangre bacterias S del mismo tipo serolgico que las utilizadas en la inyeccin (fig.
3. la y b). Como era tambin de esperar cuando
la inoculacin se realizaba con extractos de
bacterias S muertas por calor los ratones no
sufran la infeccin (fig. 3.1c) pero,
sorprendentemente, la inoculacin con extractos
de bacterias S muertas por calor y bacterias R
vivas de distinto tipo serolgico, produca la
muerte del animal y se podan recoger en su
sangre bacterias S vivas del mismo tipo
serolgico que las R (fig. 3.ld). Estos resultados
no podan explicarse por la ya obsoleta teora de
la generacin espontnea (revitalizacin de
las S muertas), ni por un fenmeno mutacional
(dada la frecuencia del evento, y el tipo
serolgico de las S que se recogan despus de
la doble infeccin). Se trataba por tanto de un
nuevo
fenmeno
que
se
denomin
transformacin bacteriana provocado por la
presencia de algn tipo de principio transformante en el extracto de las S muertas.
Adems, ese principio transformante tendra
que ser el material gentico de las bacterias,
puesto que era capaz de cambiar de forma
estable una de sus caractersticas genticas: el
carcter inocuidad/virulencia. Unos aos
despus se demostr que el fenmeno de la
transformacin bacteriana poda suceder
tambin in vitro, sustituyendo el ratn por un
tubo de ensayo que contena las soluciones con
los distintos tipos bacterianos (Dawson y Sia,
1931).
La bsqueda de la naturaleza del principio
transformante tuvo sus primeros frutos en 1933
cuando se demostr que tena que estar en el
extracto de las clulas S muertas por calor
(Alloway, 1933). Sin embargo el xito definitivo lleg con los trabajos de Avery, MacLeod y
McCarty (entre 1944 y 1946) quienes consiguieron aislar con un grado de pureza suficiente
los componentes mayoritarios del extracto de
las bacterias S muertas por calor (polisacridos,
lpidos, protenas, ARN y ADN), y lograron
demostrar que bastaba con la inoculacin de
ADN para transformar las bacterias R vivas. El
material gentico de las bacterias debera ser
por
tanto
el
ADN
(fig.
3.2).
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GENTICA
3.
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Los priones
El material gentico es siempre (sin excepcin) ADN o ARN, pero hay un caso realmente
singular de protenas infectivas que son responsables de la transmisin de algunas enfermedades infecciosas. Se conocen al menos tres
de estas enfermedades que afectan al sistema
nervioso en el ser humano (el kuru, la enfermedad de Creutzfeldt-Jacob y la enfermedad de
Gerstmann-Straussler-Scheinker) y algunas
que afectan a los animales (el prurigo lumbar de
ovejas y cabras, la encefalopata espongiforme
bovina, la encefalopata contagiosa del visn y
la diarrea crnica de ciervos y alces). Todas
ellas pueden transmitirse por la ingestin de una
protena alterada procedente de
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GENTICA
Fig. 3.4. Demostracin de la naturaleza del material gentico en el virus del mosaico del tabaco.
4.
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GENTICA
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lelas (una en direccin 5'P-3'OH y la otra 3'OH5'P), con enrollamiento plectonmico (las dos
cadenas se entrelazan como los cabos de una
cuerda), unidas por puentes de hidrgeno entre
bases complementarias (dos entre A y T; tres
entre G y C). La doble hlice tendra un
dimetro de 20 A, con diez nucletidos por
vuelta de hlice (34 ), dos surcos exteriores
(mayor y menor), las bases nucleotdicas apiladas en su interior, y los grupos fosfato hacia el
exterior. La unin de las dos cadenas mediante
puentes de hidrgeno (lbiles) se complementaba con fuerzas de naturaleza hidrofbica
(mucho ms fuertes) para mantener la estabilidad de la doble hlice en un medio esencialmente acuoso como el de las condiciones fisiolgicas de una clula. Este modelo encajaba con
las dimensiones cristalogrficas, tena en cuenta
la ley de Chargaff, explicaba los cambios de
naturaleza fsico-qumica que se producan
durante los procesos de desnaturalizacinrenaturalizacin, y reuna (aparentemente) los
requisitos esenciales para ser el material
gentico: estabilidad, propuesta implcita de un
modelo de replicacin, etc. (fig. 3.10).
60
GENTICA
polinucleotdica.
5.
FIG. 3.10.
61
La doble hlice.
para
que
reasocie
la
mitad
62
GENTICA
moderadamente
repetidas
(pendiente
intermedia de la curva) y, finalmente, una
tercera compuesta por las secuencias poco o
nada repetidas que seran las ltimas en
renaturalizar. En la figura 3.12 se indican los
tipos de secuencias que caracterizan un
genoma tan complejo como el humano. Las
secuencias nicas o poco repetidas estn
constituidas por secuencias gnicas codificantes (exones), secuencias no codificantes
relacionadas con los genes (pseudogenes, intrones, regiones anteriores o posteriores a los
genes que se transcriben pero no se traducen UTRs-, etc.) y secuencias espaciadoras
intergnicas.
Las
secuencias repetidas
corresponden al ADN de familias
multignicas (globinas, histonas, genes que
codifican para los
ARN ribosmicos,
etc.),
y
a
secuencias
extragnicas
63
64
GENTICA
Lecturas recomendadas
Adams, R. P. L., Knowler, J. T. y Leader, D. P.
(1992): Biochemistry of the nucleic acids, Chapman
and Hall.
Avery, O. T., MacLeod, C. M. y McCarty, M. (1944):
Studies of the substance inducing transformation
of
pneumococcal
types.
Induction
to
transformation by deoxyribonucleic acid fraction
isolated from Pneumococcus type III, J. Exp Med,
79: 137-158.
Fraenkel, Conrat, H. y Singer, B. (1957): Virus reconstitution II. Combination of protein and nucleic
acid from different strains, Biochem. Biophys.
Acta, 24: 540-548.
Gardiner, K. (1995): Human genome organiza
tion, Curr. Opin. Genet. Dev., 5: 315-322.
Hershey, A. D. y Chase, M. (1952): Independent
El proyecto genoma humano: varios artculos publicados en dos nmeros especiales de las revistas
Nature (409: 745-964) y Science (291: 1145-1434) el
15 y 16 de febrero de 2001.
Prusiner, S. B. (1991): Molecular biology of prion
diseases, Science 252: 1.515-1.522.
Strachan, T. y Read, A. P. (1999): Human molecular
genetics, 2, Bios Sci.
Watson, J. D. y Crick, F. H. C. (1953): The molecular structure of nucleic acids. A structure for
deoxyribose nucleic acid, Nature 171: 737-738.
Captulo
1.
2.
3.
La Cromatina Nuclear
Materila Gentico Nuclear y Extranuclear
Organizacin de la Cromatina Nuclear
Eurocromatina y Heterocromatina
4.
Cromosomas especiales
5.
Lecturas Recomendadas
66
GENTICA
menores o secundarios denominados plsmidos, constituidos tambin por ADN de cadena doble y circular, que pueden contener genes
esenciales para funciones tan importantes como
la conjugacin bacteriana, la resistencia a
drogas, etc. El genoma principal de Escherichia
coli (3,2 X 106 pb = 1,3 mm de ADN) est organizado en dominios (donde se discute el papel
estructural de unas molculas de ARN), y adquiere un superenrollamiento helicoidal gracias
a su interaccin con una serie de protenas estructurales que recuerdan a las histonas nucleares (HU, H, IHF, H1, HLPI, etc.).
2. Organizacin de la cromatina
en organismos eucariticos
2.1. LA CROMATINA NUCLEAR
Cada cromosoma contiene una sola molcula de ADN de cadena doble lineal o abierta,
pero sumadas las longitudes de todas las molculas de ADN de todos los cromosomas se
pueden alcanzar cifras sorprendentes (casi 2 m
de longitud en el caso de los cromosomas
humanos). Si se tiene en cuenta que hay ms de
un trilln de clulas en un cuerpo humano
adulto, todo su ADN llegara a medir ms de 2
X 1013 m; es decir, habra suficiente ADN
67
68
GENTICA
69
3. Elementos diferenciados
en la estructura cromosmica
y tcnicas de bandeado
3.1. ELEMENTOS DIFERENCIADOS
La organizacin de la cromatina no es uniforme, pudindose distinguir una serie de elementos diferenciados a lo largo de la estructura
cromosmica: los centrmeros (o constricciones
primarias), los telmeros (o extremos cromosmicos), las regiones organizadoras del
nuclolo (NORs, segn la abreviatura en lengua
inglesa), los crommeros y las bandas, caracterizados todos ellos por contener secuencias
especficas de ADN (fig. 4.3).
Los
centrmeros
son
las regiones
cromosmicas donde se anclan las fibras del
huso, y se hacen visibles como unas
constricciones primarias en los estadios de
mayor condensacin de los cromosomas. Segn
la posicin de los centrmeros los cromosomas
se
denominan
metacntricos
(posicin
centrada),
submetacntricos
(un
brazo
cromosmico
mayor
que
el otro),
acrocntricos (el brazo corto es extremadamente pequeo) y telocntricos ( cromosomas que tendran tericamente un solo
brazo) (fig. 4.6a). Como se ha mencionado,
los centrmeros suelen estar rodeados de
regiones de heterocromatina constitutiva
compuestas de secuencias de ADN satlite
70
GENTICA
FIG. 4.3.
71
FIG. 4.4. Caractersticas de las secuencias del ADN centromrico. a) Secuencia consenso para el centrmetro
de diez cromosomas de la levadura de gemacin (segn Clarke y Carbon, Review of Genetics, 19: 29-56, 1985).
Pu, cualquier purina; Py, cualquier pirimidina; X, cualquier base nucleotdica. b) Secuencia centromrica del
cromosoma X humano, segn Schueler et al., 2001, Science, 294: 109.
72
GENTICA
cas. Su naturaleza molecular sigue siendo controvertida, pero podran ser la consecuencia de
un cierto grado de compartimentacin en la
distribucin de las secuencias de ADN y en la
organizacin de los cromosomas. Desde hace
algn tiempo el grupo de Bernardi sostiene que
hay una distribucin compartimentada de
secuencias relativamente grandes de ADN
(llamadas iscoras) en el genoma de los vertebrados de sangre caliente, de modo que cada
iscora tiene un contenido en bases nucleotdicas (% G+C) relativamente homogneo pero
diferente al de las dems. Con la publicacin en
febrero de 2001 del primer borrador del
Proyecto Genoma Humano en la revistas
Nature y Science, parece confirmarse la exis-
Los cromosomas son normalmente estructuras que se tien uniformemente con los colorantes bsicos (con la excepcin de las constricciones primarias y secundarias). Sin embargo existen tratamientos especiales, denominados
tcnicas de bandeado, capaces de crear
unos patrones especficos de bandas (regiones
FIG. 4.6.
73
74
GENTICA
eucariotas. Sin embargo hay algunos casos especiales, como los cromosomas gigantes de
Drosophila y los cromosomas plumulados de
los anfibios, que merecen ser comentados.
Los cromosomas gigantes de Drosophila
son un caso especial de cromosomas mitticos,
que se pueden encontrar sobre todo en algunos
tejidos secretores (tubos de Malpigio, epitelio
intestinal, y glndulas salivares de tercer
estadio), y se caracterizan esencialmente por su
carcter politcnico (replican su ADN
repetidas veces sin que haya una separacin
cromatdica), por el apareamiento de los cromosomas homlogos a lo largo de toda su longitud, por la unin de todos los cromosomas a
travs de las regiones de heterocromatina pericentromrica (en una estructura llamada cromocentro), y por el escaso grado de compactacin de su cromatina. Por tanto se trata de cro
75
76
GENTICA
Captulo
Interacciones Gnicas
JOS FERNNDEZ PIQUERAS
1.
2.
3.
4.
5.
6.
Penetrancia y Expresividad
Lecturas Recomendadas
78
GENTICA
FIG. 5.1.
79
80
GENTICA
FIG. 5.5.
81
82
GENTICA
FIG. 5.6.
mrfica de una serie allica, contendra los genes deletreos o letales (por ejemplo los alelos
que causan diferentes tipos de enfermedades
humanas como la Fibrosis Qustica, la Distrofia
Muscular de Duchenne, etc.). En este caso los
alelos tienden a ser eliminados de las poblaciones por seleccin natural, y su mantenimiento
en la poblacin slo se explica por la ocurrencia
de nuevas mutaciones (mutaciones de novo). En
el argot de la Gentica Humana se suele hablar
de polimorfismos, para referirse al conjunto de
alelos no deletreos, y de mutaciones para referirse a los implicados en el desarrollo de una enfermedad, pero la fuente primaria de variacin
(y por tanto el origen esencial de todas las variantes allicas) es la mutacin, y esta costumbre debera ser rechazada.
En su acepcin clsica las variantes allicas
de los genes se deducen a travs de los cambios
en la apariencia externa de los organismos
(fenotipo externo): color de los ojos, patrn de
coloracin en la hoja de trbol, etc. Despus, el
anlisis de las protenas permiti descubrir
nuevos tipos de polimorfismos bioqumicos
basados en la reaccin antgeno-anticuerpo o en
la deteccin de variantes electroforticas de las
protenas (grupos sanguneos, antgenos de
histocompatibilidad, variantes isoenzimticas,
etc.). Finalmente la posibilidad de analizar
comparativamente las secuencias primarias de
las bases nucleotdicas de fragmentos de ADN
supuso el nacimiento de los polimorfismos de
ADN o marcadores polimrficos de ADN.
entendidos como la existencia de dos o ms
formas alternativas de un fragmento de ADN
gnico o no gnico. En este nuevo contexto se
83
ambos.
Todo lo expuesto justifica la clasificacin de
los diferentes tipos de alelos propuesta por
Muller en 1932, que sigue an vigente sobre
todo entre los Genetistas del Desarrollo. Tomando como referencia el alelo salvaje, los
alelos mutantes podran ser: amorfos (inoperantes o ausentes), hipomorfos (funcionan imperfectamente en relacin con el salvaje), hipermorfos (determinan un exceso de producto
en relacin con el salvaje), antimorfos (accin
opuesta al salvaje) y neomorfos (accin cualitativamente diferente).
Los alelos letales constituyen una clase especial de alelos recesivos capaces de causar la
muerte en homocigosis, aunque en heterocigosis
influyan en algn aspecto fenotpico aparentemente inocuo. Este es el caso del alelo A ' del
ratn que provoca la muerte en homocigosis,
pero en heterocigosis determina coloracin de la
piel amarilla (dominante con respecto al color y
recesivo con respecto a la viabilidad); tambin
es el caso de un gen presente en los gatos Manx,
que en heterocigosis afecta el desarrollo normal
de la espina dorsal provocando la ausencia de
cola, pero en homocigosis resulta letal; o el
ejemplo del gen beaded de Drosophila que se
ilustra en la figura 5.7. En la especie humana los
84
GENTICA
FIG. 5.8.
85
86
GENTICA
A pesar de su carcter nocivo los alelos letales recesivos persisten en las poblaciones naturales como sistemas equilibrados, posiblemente para mantener combinaciones gnicas
con valor adaptativo. En el caso de Drosophila
los sistemas formados por los genes letales recesivos Beaded-le, Curly-Plum y HairlessStubble
permiten
mantener
inalteradas
las
combinaciones allicas de los genes situados
entre cada una de estas parejas de loci, porque
de otro modo se producira la homocigosis para
alguno de los letales y la muerte del organismo.
Ms adelante se ver el caso paradigmtico de
la
planta
Oenothera
87
6. Penetrancia y expresividad
Captulo
1.
2.
3.
Lecturas Recomendadas
90
GENTICA
91
HETEROGENEIDAD GENTICA
EN LA ENFERMEDAD DE ALZHEIMER
92
GENTICA
FIG. 6.2. Genes candidatos en la diabetes de tipo 2 y MODY (J. Marx, 2002, Science, 296: 686-689).
1.5.
El cncer engloba un conjunto de enfermedades genticas, aunque no necesariamente heredables, que se caracterizan por las alteraciones
genticas y epigenticas de dos tipos fundamentales de genes mayores de predisposicin denominados pro-oncogenes y genes supresores. Los alelos normales o salvajes de
este tipo de genes contribuyen normalmente a
la homeostasis celular controlando los proce-
sos de crecimiento y divisin celular: los protooncogenes (Ras, Myc, etc.) tienden a favorecer
la ocurrencia de estos procesos, y los genes
supresores (TP53, p16INK4a, PTEN, etc.) actan como frenos naturales. Sin embargo, los
proto-oncogenes pueden sufrir mutaciones de
carcter dominante que los transforman en oncogenes capaces de impulsar la divisin celular
aunque no existan los estmulos adecuados en el
medio (factores de crecimiento, etc.), y los
genes supresores pueden sufrir mutaciones
inactivantes (de carcter recesivo) que los inhabilitaran para cumplir su funcin de vigilancia o contrapunto.
Lgicamente, el riesgo gentico a padecer
un cncer puede verse aumentado notoriamente
con la presencia de factores ambientales como
la exposicin a agentes fsicos, qumicos o
biolgicos mutagnicos, que contribuiran de
forma decisiva al desarrollo de los tumores espordicos. Pero adems, hay tambin toda una
cohorte de genes modificadores que son capaces
de modular el fenotipo tumoral inducido por los
oncogenes y genes supresores, y son los
responsables ltimos de los diferentes grados de
susceptibilidad, y de los diferentes tipos de
respuesta a los tratamientos en diferentes personas. Estos genes modificadores pueden codificar productos que no estn relacionados con
los producidos por oncogenes y los genes supresores (seran los modificadores extrnsecos
como, por ejemplo, los genes que codifican enzimas hepticas capaces de modificar sustancias
potencialmente cancergenas), o pueden ser
variantes allicas de los oncogenes o genes
supresores que expresan en mayor o menor
grado las protenas correspondientes, o producen protenas variantes con alguna diferencia
cualitativa (seran los modificadores intrnsecos)
(Santos y Fernndez Piqueras, 2002).
2. Caracteres cuantitativos: genotipos
y distribuciones fenotpicas
93
tas. Es decir, caracteres donde la relacin fenotipo-genotipo era clara y manifiesta. Como se ha
ido viendo a lo largo de estos captulos esta
relacin deja de ser evidente cuando aparecen
nuevas formas de interacciones gnicas o
cuando hay ms de un gen implicado en la determinacin del carcter y va aumentando la
influencia de los factores ambientales. Pero el
caso de mayor complejidad es el de los llamados caracteres cuantitativos, como la talla, el
peso, etc., donde no se pueden distinguir clases
fenotpicas discretas porque los fenotipos definen variaciones continuas.
La existencia de este tipo de caracteres llam ya la atencin de los cientficos a finales del
siglo xix. Galton y Pearson defendieron el
carcter hereditario de estos caracteres y sugirieron la existencia de una variacin gentica
subyacente que sera tambin de naturaleza
continua (bimetras). Con el redescubrimiento
de las leyes de Mendel, y la aceptacin de la
naturaleza particulada o discreta del gen, se
propuso, en cambio, que la variacin fenotpica
continua se poda explicar en base a un nmero
limitado de genes mendelianos y la influencia
moduladora de los factores ambientales. Es
decir, se propona que la herencia de los
caracteres continuos estaba gobernada por los
mismos principios mendelianos que regan la
herencia de los caracteres cualitativos (mendelianos).
2.1. LAS LNEAS PURAS DE JOHANNSEN
A principios del siglo xx Johannsen demostr la base gentica de un carcter cuantitativo: el peso de la semilla del guisante Phaseolus vulgaris var. Princesa. Tomando muestras
de una poblacin original extraordinariamente
heterognea, Johannsen consigui obtener 19
lneas puras caracterizadas cada una por un peso
medio concreto que se mantena estable a lo
largo de las sucesivas rondas de autofecundacin. La constancia en el peso medio tena
una base gentica evidente porque, adems, las
descendencias obtenidas con semillas de diferentes pesos dentro del rango de distribucin de
una lnea o raza pura volvan a definir el
94
GENTICA
95
96
GENTICA
de su mayor dificultad, resulta fundamental conocer el grado de heredabilidad de estos caracteres, e identificar al menos los genes ms
importantes que contribuyen a su varianza gentica.
Todos los procesos de desarrollo estn controlados bsicamente por los genes, pero hay
una parte de la varianza fenotpica que se debe
exclusivamente al medio ambiente, o al resultado de la interaccin genotipo-ambiente. La
97
FIG. 6.7.
Determinacin de la heredabilidad de un
carcter cuantitativo en organismos xperimentales
98
GENTICA
Captulo
1.
2.
3.
4.
Plsmidos Extragenmicos
5.
Lecturas Recomendadas
100
GENTICA
FIG. 7.1. Patrones de herencia uniparental del carcter variegacin en Mirabilis jalapa.
101
102
GENTICA
y resistencia a drogas especficas. Las mutaciones en el genoma de los cloroplastos se pueden traducir adems en fenotipos carentes de
color por su interferencia con la sntesis de clorofila.
Los mutantes ant, mit y petite de
levaduras, los poky de Neurospora, y otras
muchas citopatas humanas, se deben a alteraciones en los genes mitocondriales. Las mitocondrias contienen unos espacios denominados
nucleoides que pueden albergar uno o ms
genomas compuestos cada uno de ellos por una
cadena doble de ADN circular o cerrado. El
genoma mitocondrial humano contiene 16.569
bp y fue secuenciado en su totalidad por el
grupo de Anderson en 1981. Contiene 37 genes
implicados en el sistema de fosforilacin
oxidativa, y en la sntesis de sus propias
protenas. Todos ellos carecen de intrones y
dos de ellos (ATPasa 6 y 8) estn solapados
(fig. 7.4). A diferencia del genoma mitocondrial
humano, que es todo un modelo de economa, el
genoma mitocondrial de las levaduras alcanza
las 78 kb, tiene secuencias espaciadoras sin
sentido aparente, y sus genes estn salpicados
103
FIG. 7.4. El genoma mitocondrial humano. OH y OL, orgenes de replicacin de las cadenas pesada y ligera,
respectivamente. PL y PH, marcan la situacin de las regiones promotoras de ambas cadenas.
104
GENTICA
gado, se podan explicar fcilmente por la coexistencia de cloroplastos con clorofila y sin
clorofila (heteroplasmia), y la ocurrencia de fenmenos de segregacin citoplasmtica (distribucin aleatoria de los cloroplastos de una
clula madre en las dos clulas hijas) como los
mostrados en la figura 7.5. Pero la razn ltima
del problema radicaba en la existencia de un
genoma propio en los cloroplastos que se poda
separar del genoma nuclear mediante ultracentrifugacin en gradientes autogenerados de
sales pesadas. El genoma de estos orgnulos
consiste tambin en una doble hlice de ADN
circular o cerrada que ocupa unos espacios denominados nucleoides similares a los comentados en el caso de las mitocondrias. Sin embargo
el genoma de un cloroplasto contiene un nmero mayor de genes, destacando los implicados en la propia maquinaria de sntesis de protenas y en la fotosntesis (fig. 7.6). El anlisis
de las alteraciones del genoma de los
camino entre una mayora de genomas normales hasta imponerse como el genoma mayoritario o exclusivo. Es decir, deberan ser bastante frecuentes los casos de heteroplasmia y
la observacin de diferentes grados de expresividad marcados por el porcentaje de genomas
mutantes. En el caso de las mitocondrias humanas, hay un cuello de botella despus de la fecundacin al producirse una reduccin muy
considerable del nmero de mitocondrias en las
clulas germinales. Por tanto, si la situacin de
partida era ya heteroplstica, este cuello de
botella, y los fenmenos de segregacin citoplasmtica que se producen durante las divisiones celulares (reparto al azar de las mitocondrias de la clula madre en las clulas hijas) podran explicar una relativamente rpida imposicin del genotipo mutante.
3.
Las investigaciones desarrolladas en los ltimos aos han confirmado la implicacin de las
mitocondrias en los procesos de fosforilacin
oxidativa, en la produccin de radicales libres
105
106
GENTICA
drome de Leigh que suele ser mortal. De manera anloga, el sndrome de MELAS (una miopata mitocondrial con ataques) se debe a una
mutacin en el gen del RNAt de la leucina que
ha de afectar a ms del 85 % de los genomas
mitocondriales, pero si el porcentaje de afectacin oscila entre el 5 y el 30 % se producen un
tipo especial de sordera y diabetes.
Con respecto a la apoptosis, se sabe que las
mitocondrias contienen factores pro-apoptticos
esenciales como el citocromo C, un factor
inductor (AIF) y formas latentes de caspasas
(proteasas). Cuando se produce una prdida
excesiva de calcio, en situaciones de estrs
oxidativo, ante una merma importante en la
produccin de energa, y como respuesta
defensiva al desarrollo de muchos procesos
neoplsicos, se puede desencadenar una
respuesta apopttica a travs de un canal
mitocondrial (PTPmt). Entonces el citocromo C
activa las caspasas citoslicas producindose
una degradacin del citoplasma, y el factor AIF
se transloca hasta el ncleo donde contribuye a
la degradacin de la cromatina.
Finalmente, el estrs oxidativo es probablemente la causa principal de la acumulacin
de alteraciones en el ADN mitocondrial con la
edad. El msculo esqueltico de las personas se
mantiene esencialmente intacto hasta los 40
aos, pero a partir de los 50 se empiezan a acumular mutaciones. En el cerebro (sobre todo en
los ganglios basales y en varias regiones del
rea cortical) es bastante comn la acumulacin
de una delecin de 5 kb en las personas de edad
avanzada.
4. Plsmidos extragenmicos
Otra forma especial de herencia citoplasmtica es la protagonizada por los genes contenidos en algunos plsmidos extragenmicos.
Adems de los plsmidos bacterianos, algunos
organismos eucariotas tienen tambin plsmidos
extragenmicos repartidos por el nucleoplasma
o en el interior de las mitocondrias. Uno de los
casos mejor conocidos es el plsmido de 2,um
de las levaduras que ha sido utilizado (como se
ver ms adelante) para la construccin de
cromosomas artificiales. Pero los casos de
Todos los casos descritos hasta ahora se podran considerar verdaderos ejemplos de herencia citoplasmtica atribuibles a genes que estn presentes de manera regular en el
citoplasma, ya sea en el genoma de los
orgnulos
celulares
o
en
plsmidos
extragenmicos. Pero hay otros casos de
aparente herencia uniparental que se deben a
genes contenidos en organismos endosimbiontes
(herencia infectiva), o a los productos de la
expresin de unos genes matemos (protenas o
ARNs) que actan con efectos retardados en la
descendencia (efectos matemos).
Los casos mejor conocidos de herencia
infectiva son los del carcter matador en
paramecios (que se debe a la presencia de unas
bacterias kappa productoras de paramecina en
el citoplasma de los paramecios resistentes), la
sex-ratio en Drosophila (debida a una espiroqueta endosimbionte), y la sensibilidad al
CO2 tambin en Drosophila (que se debe al factor sigma). En el caso del paramecio los llamados mutadores o paramecios asesinos se
caracterizan por la presencia de las bacterias
kappa en el citoplasma de paramecios que
tienen un gen nuclear dominante (KK o Kk),
mientras que los sensibles tienen una consti-
107
108
GENTICA
Captulo
Ligamento y Recombinacin
JOS FERNNDEZ PIQUERAS
1.
2.
Mapas de Ligamento
3.
4.
Ligamento Absoluto
5.
Lecturas Recomendadas
110
GENTICA
111
FIG. 8.2. Morgan y Sturtevan confirmaron la hiptesis de Bateson y Punnet en Drosophila. Se favorecen
siempre las combinaciones allicas parentales (haplotipos parentales).
112
GENTICA
cambio fsico consiguiente entre sus cromosomas, como se poda demostrar mediante su
anlisis al microscopio (fig. 8.5).
2. Mapas de ligamiento
113
114
GENTICA
FIG. 8.5. Experimento de Creighton y McClintock para demostrar que los quiasmas son la expresin citolgica
de la recombinacin gentica.
FIG. 8.6. Fundamentos del cartografiado mediante anlisis de ligamiento: al aumentarla distancia entre a y b,
aumenta el nmero de meiosis con entrecruzamiento entre ambos loci.
115
FIG. 8.7. Clculo de la frecuencia de recombinacin en Drosophila: FR = 900/2.441 X 100 = 36,8 % = 36 cM.
116
GENTICA
FIG. 8.8. La FR mxima entre genes ligados es del 50 % aunque los genes estn ligados.
FIG. 8.9.
117
formacin de ningn quiasma entre los cromosomas homlogos durante la meiosis. Tambin se han descrito otros casos de ligamiento
absoluto en las hembras del gusano de seda
(Bombix mor). Finalmente, hay algunos ejemplos
de ligamiento absoluto de carcter regional en
las regiones diferenciales de los cromosomas
sexuales heterlogos. Recurdese el caso
paradigmtico de los cromosomas X e Y
humanos que slo tienen dos regiones pequeas
(sobre todo una) de homologa.
La elaboracin del mapa gentico de la especie humana contaba desde el principio con
dos grandes hndicaps: la disponibilidad de pocos marcadores polimrficos y el tamao reducido de los ncleos familiares. El primer problema se fue resolviendo poco a poco con la incorporacin de nuevas tcnicas y metodologas, de
modo que a los polimorfismos iniciales basados
118
GENTICA
Fig. 8.10. Mapas de tres puntos. En este caso b es el marcador central; y las distancias genticas entre
los loci son: a-b = 1,56 cM y b-c = 4,06 cM.
en la observacin del fenotipo externo de los organismos, siguieron los basados en el anlisis de
las protenas y, finalmente, los polimorfismos
de ADN (basados en el anlisis comparativo de
las secuencias de ADN (fig. 8.11), que se detectan mediante las tcnicas que se describen en los
captulos dedicados a la Tecnologa del ADN
Recombinante. En cualquier caso, la utilidad
de cualquier tipo de polimorfismo depende de
su grado de informatividad, es decir, del grado de variabilidad que presente en las poblaciones naturales. La informatividad se podra estimar a travs del ndice de heterocigosidad
(porcentaje de organismos heterocigticos),
pero sera ms adecuado hacerlo a partir del parmetro estadstico PIC (ndice de polimorfismo), puesto que este ndice recoge todas las
variantes allicas posibles distinguiendo los organismos heterocigotos que tengan combinaciones allicas diferentes
119
120
GENTICA
FIG. 8.12. Clculo del valor lod para la estimacin de ligamiento en la especie humana.
lidad conjunta sera el producto de las probabilidades individuales, pero puesto que el valor
lod es de naturaleza logartmica en realidad
se iran sumando los resultados hasta conseguir
significacin estadstica. Lgicamente la realizacin de todos estos clculos puede llegar a ser
extraordinariamente complicada conforme se
aaden nuevos grupos familiares y, sobre todo,
cuando aparecen individuos no informativos,
es decir, individuos donde no es posible
establecer con claridad la ubicacin cromosmica (fase) de los alelos de ambos marcadores. En estos casos el clculo manual ha de
sustituirse por el empleo de un paquete estadstico, como el Linkage, que contiene los programas adecuados para solventar estos problemas
(LINKMAP). Finalmente el problema de las
diferencias existentes entre la frecuencia de recombinacin en el genoma de los hombres y el
de las mujeres, obliga a presentar dos mapas de
ligamiento por separado o a promediar los datos
obtenidos en ambos sexos.
Lecturas recomendadas
Captulo
1.
2.
3.
4.
Lecturas Recomendadas
122
GENTICA
El anlisis de las ttradas ordenadas permite deducir con facilidad los patrones de segregacin de un marcador gentico durante la
meiosis. En la figura 9.2 se recoge el ejemplo
terico de una ttrada ordenada y lineal (que podra corresponder a Neurospora crassa) procedente de un cruce entre dos parentales con diferencias fenotpicas atribuibles a dos alelos (A y
a) del mismo gen. Cuando las cuatro ascosporas
superiores presentan fenotipos indicativos de la
presencia del alelo A, y las cuatro inferiores fenotipos correspondientes al alelo a se puede in
123
terpretar que la segregacin tuvo lugar en la primera divisin meitica (ttrada de tipo M-I), sin
que haya habido recombinacin entre el locus y
el centrmero. Por el contrario, en la figura 9.3
la disposicin de las ascosporas se aparta de la
proporcin 4:4 anterior. Ahora se trata de una
distribucin alternante 2:2:2:2 que slo se puede
explicar si los alelos segregaron en la segunda
divisin meitica (ttradas de tipo M-II) como
consecuencia de un fenmeno de entrecruzamiento entre el locus y el centrmero. Por
tanto la distancia gentica entre un locus y el
centrmero se puede calcular fcilmente mediante el cociente entre el nmero de astas recombinantes (M-II) dividido por dos y el nmero total de astas (M-I + M-II). La razn para dividir por la mitad el nmero de aseas M-II estriba en el hecho de que cada fenmeno de entrecruzamiento afecta slo a dos de las cuatro cro-
124
GENTICA
mticas, y por tanto slo cuatro de las ocho ascosporas contienen en realidad material gentico recombinado. Como se puede ver se trata de
un procedimiento muy sencillo donde el anlisis
de los productos meiticos se hace directamente
mediante el recuento del nmero de ascas de los
dos tipos.
La determinacin de la distancia gentica
existente entre dos loci cualesquiera (A y B), se
puede ver beneficiada igualmente por la singularidad de este tipo de organismos. En la figura
9.4 se presenta el esquema de las cuatro cromtidas que integran un bivalente meitico, y seis
tipos diferentes de meiosis. En la meiosis de la
parte superior izquierda no hay entrecruzamiento y, por tanto, resultan cuatro productos
meiticos (o ascosporas) iguales dos a dos y a
sus parentales: por ello el asca se denomina
ditipo parental (DP). Como ya se explic en
125
te, por los alelos A o a, lo normal sera que despus de la mitosis resultasen dos clulas hijas
idnticas a la clula madre, sin que se haya producido la segregacin de esas variantes allicas.
Sin embargo, ocasionalmente se pueden
producir fenmenos de no-disyuncin como los
mencionados en captulos anteriores para
demostrar que los genes estaban en los cromosomas. En este caso los dos alelos a podran
quedar en una de las clulas hijas producindose
un fenmeno de segregacin mittica. De
igual modo, la eliminacin de un cromosoma
durante la meiosis podra provocar tambin la
ausencia de este alelo en una de las dos clulas
hijas. Cuando estos fenmenos se producen
durante el desarrollo de los organismos se generan fenotipos variegados (porque coexisten
sectores de tejidos somticos con diferentes
126
GENTICA
FIG. 9.5. 1) Mitosis normal; 2) segregacin somtica mediante no-disyuncin, y 3) eliminacin cromosmica.
127
128
GENTICA
129
una ruta principal a partir de un azcar y aminocidos, que puede ser bloqueada selectivamente con Aminopterina (o metotrexato), y una
ruta de emergencia a partir de bases preexistentes y nuclesidos donde la HPRT catalizara el
paso de hipoxantina a purinas, y la TK el paso
de timina a pirimidinas. En estas condiciones el
medio HAT (H, de hipoxantina; A, de aminopterina; y T de timina) bloqueara la ruta principal de sntesis de nucletidos (por la aminopterina) de modo que slo podran crecer las clulas hbridas al ser las nicas que tienen la capacidad de sintetizar las dos enzimas. Con el sistema G418 el criterio de seleccin se basa en la
utilizacin del antibitico neomicina, porque
slo seran resistentes los hbridos que contuviesen un segmento cromosmico humano que
lleva incorporado un gen de resistencia a la neomicina (neoR).
La disponibilidad de bateras completas
de este tipo de colonias (hbridos somticos) es
130
GENTICA
Lecturas recomendadas
131
Julio, 36-44.
Stern, C. (1936): Somatic crossing over and
segregation in Drosophila melanogaster,
Genetics, 21: 625-730.
Strachan, T. y Read, P. (1999): Human
Molecular genetics, 2, Bios.
Captulo
10
Transferencia de Genes
en Bacterias y Bacterifagos
Francisco Javier Santos Hernndez
1.
Conjugacin Bacteriana
1.1. El Factor de Fertilidad Epismico F
1.2. Cartografa por Apareamiento Interrumpido
1.3. Factores F Portadores de Genes Bacterianos: Sexduccin
2.
Transformacin Bacteriana
3.
Transduccin
Lecturas Recomendadas
134
GENTICA
135
Las clulas portadoras del plsmido F se denominan F', mientras que las que carecen de l
reciben el nombre de F-. Las clulas de E. coli
estn normalmente cubiertas por fimbrias (pelos). Las clulas F' tienen, adems, de dos a tres
pelos sexuales (pili) que les permiten adherirse
a las clulas F- y facilitar el proceso de conjugacin. Cuando se produce la conjugacin, el
ADN del plsmido F se replica y la molcula
circular recin sintetizada se transfiere a la clula receptora, quedando siempre una copia del
factor F en la clula donadora (fig. 10.3).
El plsmido F contiene ocasionalmente en
su genoma una o ms secuencias de insercin
(IS) (un tipo de elementos mviles procariticos). La existencia de elementos IS tanto en el
plsmido F como en el cromosoma principal es
de una gran relevancia biolgica puesto que
proporciona lugares especficos en los cuales se
puede producir recombinacin homloga,
pudiendo llevar a la integracin del plsmido F
en el cromosoma bacteriano.
136
GENTICA
137
Posteriormente, mediante rplica en placa y utilizando medios de cultivo especficos se cartografiaron los alelos azi, tonA, lac y galB. Los resultados obtenidos a partir de estos experimentos indicaban una entrada secuencial en las clulas F- de los genes procedentes de la estirpe Hfr
(fig. 10.5). Las unidades de mapa en este caso
son los minutos. Mediante el uso de diferentes
cepas Hfr que contenan el factor F integrado en
diferentes sitios del cromosoma bacteriano se
demostr su circularidad.
1.3. FACTORES F PORTADORES DE GENES
BACTERIANOS: SEXDUCCIN
138
GENTICA
tos (diploides parciales) que contienen un genoma bacteriano completo y fragmento concreto
contenido en el factor F. El proceso por el cual
se originan estos merocigotos se define como
sexduccin o F-duccin (fig. 10.4). Aunque no
demasiado utilizada, la sexduccin constituye
una herramienta ms que el investigador puede
usar para cartografiar genes en bacterias, cuyo
fundamento, al ser similar al de la transduccin,
se estudiar ms adelante cuando hablemos de
dicho fenmeno. La sexduccin permite
tambin el estudio de la interaccin entre alelos
(relaciones de dominancia) en un organismo
normalmente haploide.
2. Transformacin bacteriana
139
El fenmeno de la transduccin fue descubierto por Zinder y Lederberg (1952) en Salmonella y consiste en la transferencia de material gentico entre dos bacterias por medio de un
bacterifago (un virus que infecta a una bacteria). Esto puede suceder porque antes de la lisis bacteriana, cuando el material gentico del
fago est siendo empaquetado, puede incorporarse de manera errnea ADN bacteriano dentro
de la cubierta del fago (fig. 10.7). De esta
140
GENTICA
141
Lecturas recomendadas
Captulo
11
1.
2.
3.
4.
Telmeros y Replicacin
4.1. El Problema de la Replicacin Terminal y el Acortamiento de
los Telmeros
4.2. La Telomerasa y el Mantenimiento Telomrico
4.3. Alteraciones de la Actividad Telomerasa
5.
Lecturas Recomendadas
146
GENTICA
Uno de los requerimientos bsicos del material gentico es su capacidad de autoperpetuarse. El modelo de la doble hlice del ADN, propuesto por Watson y Crick (1953), llevaba ya
implcito un mecanismo para explicar un modelo de replicacin del material gentico, segn el
cual las dos cadenas se separaran y cada una de
ellas servira de molde para la sntesis de una
nueva cadena complementaria. De este modo, al
final del proceso de replicacin se obtendran
dos dobles hlices compuestas cada una de ellas
por una cadena parental y otra de nueva sntesis:
modelo semiconservativo. Pero sta no era la
nica manera por la que podra producirse la replicacin del ADN y consecuentemente se propusieron dos modelos alternativos: conservativo
y dispersivo. Segn el modelo conservativo
despus de la replicacin del ADN obtendramos dos tipos de doble hlice diferentes, una
formada totalmente por cadenas de ADN de
nueva sntesis y otra por ADN de origen paren
tal; en el modelo dispersivo las molculas de
semiconservative
FIG. 11.1. Experimento de Meselson y Stahl demostrativo del carcter semiconservativo de la replicacin
del ADN en procariotas.
GENTICA MOLECULAR
tes dos tipos de ADN, uno con esta nueva densidad y otro con la densidad de un ADN marcado
con "N (ADN ligero). En la tercera generacin
el 75 % del ADN era ligero y el 25 % mostraba
una densidad intermedia. Aumentando el
nmero de generaciones se obtena un
incremento progresivo del ADN ligero y una
disminucin del ADN de densidad intermedia.
Estos resultados slo resultaban congruentes
con un modelo de replicacin del ADN
semiconservativo.
Unos resultados similares fueron obtenidos
por Taylor (1958) trabajando con cromosomas
obtenidos de clulas de races de judas y utilizando tcnicas citolgicas. Las clulas de la raz
se sumergieron en una solucin que contena
timidina tritiada (el nucletido timidina
marcado con tritio [H3], un istopo radiactivo
del hidrgeno). Dej que las clulas llevaran a
cabo la mitosis en esta solucin para permitir la
incorporacin de la timidina radiactiva. Las lav
y las transfiri a una nueva solucin que
contena timidina no radiactiva. Por ltimo,
aadi colchicina para detener las clulas en
metafase y obtener los cromosomas metafsicos. Los resultados obtenidos del anlisis autorradiogrfico durante la primera divisin en
ausencia de timidina-[H3] o durante la divisin
mittica siguiente se interpretaban de acuerdo a
un modelo semiconservativo.
147
148
GENTICA
GENTICA MOLECULAR
149
150
GENTICA
3. Caractersticas diferenciales
de la replicacin del material gentico
en eucariotas
A pesar de que muchos detalles de la replicacin del ADN son similares en procariotas y
eucariotas existen notables diferencias. La razn
hay que buscarla en el hecho de que las clulas
eucariticas deben resolver el problema de la
replicacin coordinada de ms de un cromosoma y duplicar la estructura compleja del
propio cromosoma.
En las clulas eucariticas, la replicacin del
ADN est confinada a una parte del ciclo celular
(ste ser estudiado ms en detalle en el captulo
29 cuando se hable del control gentico del
ciclo de divisin celular). Dentro del ciclo
celular podemos distinguir dos grandes periodos, interfase y mitosis (periodo de divisin
celular). La sntesis del ADN tiene lugar en el
periodo de interfase en lo que se conoce como
fase S del ciclo celular.
Una de las cuestiones ms importantes que
se plantean a la hora de entender el proceso de
la replicacin del ADN en eucariotas es cmo
pasa la maquinaria enzimtica de la replicacin
a travs de los nucleosomas. stos no parecen
abandonar el ADN durante el proceso de la replicacin, pero podran desmontarse in situ.
Existe todava cierta controversia sobre la forma
de disponerse los nucleosomas viejos y
nuevos sobre las dos molculas hijas del
ADN. La mayora de las pruebas favorecen un
modelo dispersivo, segn el cual cada molcula
de ADN hija lleva asociados tanto nucleosomas
viejos como nuevos.
En organismos eucariticos, la replicacin
del ADN tiene, al igual que en procariotas, un
carcter bidireccional y semiconservativo, pero
a diferencia de las bacterias la replicacin
progresa desde muchos orgenes de replicacin,
dando lugar a mltiples unidades de replicacin
o replicones. El nmero de replicones en los
eucariotas vara desde cerca de 500 en levaduras
hasta unos 60.000 en una clula diploide de
mamfero. Los orgenes de replicacin mltiples
permiten a los eucariotas replicar sus grandes
cantidades de ADN en un tiempo relativamente
corto, incluso aunque la replicacin del ADN
eucaritico sea considerablemente ms lenta por
la presencia de las protenas histnicas
4. Telmeros y replicacin
GENTICA MOLECULAR
4.1.
151
4.2.
LA TELOMERASA Y EL MANTENIMIENTO
TELOMRICO
152
GENTICA
FIG. 1 1.4b. La telomerasa aade repeticiones telomricas al saliente G a partir de la secuencia molde
de su componente ARN.
subpoblaciones del tejido linftico hematopoytico muestran niveles bajos pero detectables de actividad telomerasa. Los estudios
de ratones deficientes para la actividad telomerasa han demostrado que dicha actividad es
esencial para los tejidos con alto ndice de proliferacin. Parece claro, por tanto, que la actividad telomerasa y la estabilizacin de la longitud de los telmeros son dos hechos que van
estrechamente ligados en las clulas de tejidos
con alto ndice proliferativo.
GENTICA MOLECULAR
153
Lecturas recomendadas
Greider, C. W. (1996): Telomere length regulation, Ann. Rev. Biochem., 65: 337-365.
Kornberg, A., Lehman, I. R., Bessman, M. J. y
Simms, E. S. (1956): Enzymatic synthesis
of deoxyribonucleic acid, Biochem. Biophys.
Acta, 21: 197-198.
Captulo
1.
2.
3.
Colinealidad
4.
El Gen Eucariota
Lecturas Recomendadas
156
GENTICA
reaccin
metablica
catalizada
enzimticamente, precisamente en el paso de
cido homogentsico a cido maleilacetoactico.
La ruta metablica sera como sigue:
GENTICA MOLECULAR
TABLA 12.1.
157
158
GENTICA
FIG. 12.1. Resumen del metabolismo de la fenilalanina y enfermedades asociadas a diferentes bloqueos metablicos.
GENTICA MOLECULAR
159
160
GENTICA
FiG. 12.3. Herencia mendeliana resultante del cruzamiento entre un mutante nutricional y la cepa salvaje de Neurospora.
GENTICA MOLECULAR
161
Los tests de complementacin entre mutantes arg demostraron que existan varios genes
controlando el proceso de sntesis de este
compuesto, puesto que era posible reconstruir el
tipo salvaje mediante cruces entre diferentes
mutantes.
TABLA 12.2. Resultados de restitucin del fenotipo
salvaje para distintos mutantes arg de Neurospora
crassa
162
GENTICA
TABLA 12.3. Resultados de restitucin del fenotipo salvaje para distintos mutantes trp
de Salmonella typhimurium
Por otra parte, aunque la enzimas son protenas (con la salvedad de los RNAs catalticos),
no todas las protenas son enzimas. Se plante
entonces si tambin los genes controlaban la
produccin de estas otras protenas sin funcin
enzimtica. La respuesta a esta ltima cuestin
se obtuvo de los experimentos realizados con
molculas
mutantes
de
hemoglobina
provenientes de personas afectadas de anemia
falciforme, que desemboc en una ampliacin
de la hiptesis gen-enzima para convertirla en
gen-protena.
La anemia falciforme fue descrita por primera vez en 1910 por Ernest Irons, un mdico
interno de un hospital de Chicago que descubri
eritrocitos alargados en un frotis de sangre de un
paciente aquejado de una anemia severa. Con
posterioridad se ha descubierto que los
eritrocitos de los individuos afectados, en condiciones de baja concentracin de oxgeno, adquieren una forma curvada y alargada, por po
GENTICA MOLECULAR
163
162
GENTICA
Fig. 12.6. Anlisis de la hemoglobina HbA y Hbs: a) Perfiles electroforticos en gel de almidn de la hemoglobina e los
individuos HbA, HbA (AA simplificadamente); HbA, HbS(AS) y HbS, HbS (SS). b) Huella molecular e la hemoglobina normal
(HbA) (izquierda) y falciforme (HbS) (derecha). c) Secuencia parcial de aminocidos el pptido diferente para ambas
hemoglobinas.
GENTICA MOLECULAR
3. Colinealidad
165
166
GENTICA
FIG. 12.7. a) Colinealidad entre las mutaciones del gen TrpA y las sustituciones aminoacdicas de la subunidad A e la
enzima triptfano sintetasa. b) Explicacin de las mutaciones en la posicin 234 de acuerdo con la asignacin de posicin 234
ms de 7.000 pares de bases mientras su protena presenta 386 aa. El gen contiene 7 intrones
(A-G) que se eliminan, antes del transporte al
citoplasma, unindose las 7 regiones codificantes o exones (1-7) para formar el RNAm
funcional, colineal con la protena.
De hecho, en la actualidad, pocos genes eucariticos parecen no contener intrones. Un
ejemplo extremo de gran nmero de intrones en
un gen lo constituye el gen de la distrofina
humana (2.500 kb), con ms de 80 intrones en
su secuencia. En el otro extremo se encontra-
GENTICA MOLECULAR
167
Fig. 12.8. Dibujo representativo de la molcula hbrida formada por la cadena molde de ADN de un gen
eucariota y el ARNm maduro de dicho gen. Se observan 6 bucles (A-F) no apareados en el ADN (intrones),
que no tendran secuencias complementarias en el ARN.
Fig. 12.9. Representacin esquemtica de la composicin en exones (regiones claras) e intrones (regiones oscuras) del
gen de la ovoalbmina de gallina (a) y del gen de la /3-globina de conejo (b).
especifica.
Lecturas recomendadas
168
GENTICA
Captulo
1.
2.
3.
Lecturas Recomendadas
170
GENTICA
Benzer utiliz las tcnicas clsicas de recombinacin con virus bacterianos, concretamente con el fago T4, virulento para E. coli, y
para proporcionar estimaciones de los detalles
de la estructura de un gen utiliz el locus rII.
Las caractersticas de los lagos se manifiestan
en la morfologa de las calvas que se forman
despus de la lisis de las clulas bacterianas.
Los loci r (como ya se ha visto en la recombinacin de fagos) son los responsables de la rapidez de lisis bacteriana, de tal manera que los
alelos salvajes producen una lisis lenta de E.
coli sembrada en una placa Petri, lo que origina
calvas pequeas y rodeadas de un halo difuso en
el csped bacteriano. Los mutantes r- (de ahora
en adelante los denominaremos simplemente r)
producan calvas ms grandes y de bordes ms
ntidos (ms redondeados) despus de infectar a
E. coli, por lo que se denominaron mutantes de
lisis rpida, porque aparentemente resultaban
de un ciclo biolgico del fago ms rpido y
eficiente. Hoy da se sabe que los fagos salvajes
se inhiben en su reproduccin una vez que se ha
formado una calva de un tamao dado, mientras
los mutantes r son capaces de superar esta
inhibicin, originando calvas ms grandes.
Adems, aunque el tipo salvaje y los mutantes
rII podan infectar y lisar a la cepa B de E. coli,
en otra cepa, la K12(), slo poda multiplicarse
el tipo salvaje. Esta ltima cepa est
lisogenizada por el fago y por ello los
mutantes rII no pueden lisarla. Benzer
aprovech la circunstancia para establecer su
sistema de deteccin. De ese modo, cuando la
progenie de un cruce entre dos mutaciones rII se
pona a infectar la cepa K12(), slo los escassimos recombinantes salvajes formaran
calvas (de morfologa salvaje, es decir calvas
pequeas).
FiG. 13.1. Procedimiento seguido por Benzer para seleccionar los recombinantes (salvajes) entre dos mutacio
nes rll (nicamente se muestra el segmento del genoma del fago correspondiente al locus rll).
172
GENTICA
FIG. 13.2. Protocolo para el clculo de la frecuencia de recombinacin entre dos mutaciones r11.
GENTICA MOLECULAR
Benzer ampli su anlisis a cientos de mutaciones que fue posicionando dentro del locus
mediante el mismo procedimiento empleado
para las primeras. La tarea era muy laboriosa, al
tener que testar los mutantes dos a dos en
mltiples combinaciones, pero en un momento
de su investigacin descubri que algunas mutaciones rII eran deleciones de fragmentos
dentro del locus. Estas deleciones podan identificarse por su incapacidad para revertir al tipo
salvaje (la reversin s era posible para las mutaciones puntuales). Adems, cuando se reali
173
FIG. 13.3. Procedimiento seguido por Benzer para la utilizac n (le mutantes de delecin en su anlisis del locus rII.
174
GENTICA
Fig. 13.4. Asignacin de tres mutaciones puntuales, M, P10 y P12, a subregiones dentro del locus r1l mediante la
utilizacin de deleciones solapantes (DI a D7). Los resultados de la produccin de descendencia recombinante de
tipo salvaje (+ o -), con el procedimiento de infecciones de mezcla entre mutante puntual y de defeccin indicado en
la figura 13.3, permite la asignacin de los mutantes a las distintas regiones. As, M se localizara en la regin V,
Pl0 se localizara en ll y P12 en VI. La utilizacin de una segunda serie de deleciones solapantes dentro de cada una
de las regiones de delecin iniciales (mostradas tres en la regin V) permite una localizacin ms precisa de las mu
taciones. En el caso que se muestra, la mutacin M se asignara a la regin 5c.
GENTICA MOLECULAR
175
este modo, determin que las casi 2.000 mutaciones analizadas por este procedimiento no se
distribuan uniformente dentro del locus, existiendo puntos en los que se acumulaban las mutaciones, a los que denomin puntos calientes
(hot spots) (fig. 13.5).
Por tanto, el gen era una secuencia lineal de
material gentico en la cual las mutaciones
pueden producirse en lugares diferentes (mutones) y recombinar entre s, de forma que se restituya el genotipo normal. A las unidades de recombinacin les llam recones. El mutn, en
ltimo extremo, sera un par nucleotdico y el
recn, la distancia entre dos pares nucleotdicos
consecutivos. Se rompa, pues, con la idea
clsica del gen como unidad mutacin y de recombinacin. La recombinacin intragnica
puede existir dentro de cualquier locus, el problema existente es que su deteccin slo es posible si se cuenta con un potente sistema de seleccin de recombinantes, tal como ofrecen los
fagos.
FIG. 13.5. Mapa de mutaciones del locus rll del fogo T4. Cada crculo representa una mutacin independiente,
en rojo para el cistrn A y en verde para el cistrn B. En algunos lugares se aislaron gran nmero
de mutaciones; son los llamados puntos calientes (en A6c y B4).
FIG. 13.6. Procedimiento de Benzer para establecer la complementacin (a) o la no complementacin (b) entre pare
jas de mutaciones. Los superndices de los mutantes (1, 6 y 7) se corresponden con mutantes posicionados por Benzer
en sus primeros estudios. nicamente se muestra el segmento del genoma del fago que corresponde al locus rII.
GENTICA MOLECULAR
3.
Complementacin y el
concepto de gen
177
un cistrn-un polipptido.
Conviene sealar que la complementacin
y la recombinacin no son sucesos excluyentes: para dos mutaciones pertenecientes a cis~
trones distintos, que complementan sobre la
cepa K12, si se recogieran los lisados y se
utilizasen para infectar, en unicidad de
infeccin, a esa misma cepa, se obtendra un
nmero pequeo de calvas salvajes
provenientes
de
los
escasos
fagos
recombinantes salvajes que se habran
formado durante la primera infeccin. Los
procedimientos para poner de manifiesto una
u otra s son diferentes y tambin lo son las
consecuencias genticas de ambos procesos.
La complementacin es inmediata (un solo
ciclo de infeccin), en gran cantidad (gran
nmero de calvas salvajes) y no hereditaria,
mientras la recombinacin nunca es
inmediata (se observa despus de dos ciclos
de infeccin), se manifiesta en un pequeo
nmero de los fagos hijos y es hereditaria (los
fagos
recombinantes
transmiten
sus
caractersticas a sus descendientes). Durante
un tiempo se populariz el trmino cistrn
como sustituto de gen, pero en la actualidad
ha cado en desuso, mantenindose la
denominacin de gen como la unidad de
herencia, pero en los trminos de funcionalidad
que
describi
Benzer.
FIG. 13.7. La prueba cis-trans de Benzer, para determinar si dos mutaciones se encuentran en el mismo cistrn o en
cistrones diferentes. En todos los casos se utiliza como husped la cepa K12(2) de E. coli. En la prueba cis (recuadros
de la izquierda), que se utiliza como control, para la doble infeccin se usa un fago salvaje y otro con las dos mutacio
nes sobre el mismo cromosoma. Siempre se produce lisis puesto que el fago salvaje fabrica los productos necesarios
para ella. En la prueba trans (recuadros de la derecha), que es el verdadero test, las mutaciones se localizan en cromo
somas distintos (en fagos distintos). La complementacin se representa con el signo + e indica que las mutaciones se
localizan en cistrones distintos dentro del locus. La no complementacin se representa con el signo - e indica que
ambas mutaciones se localizan en el mismo cistrn.
178
Lecturas recomendadas
GENTICA
Captulo
14
Biologa Molecular
de la Funcin Gnica
Antonia Mara Fernndez Peralta
1.
2.
3.
La Transcripcin en Eucariotas
4.
Lecturas Recomendadas
180
GENTICA
encontraba en el ncleo y nunca se diriga al citoplasma, mientras que las protenas se sintetizaban en el citoplasma. En bacterias las protenas se sintetizaban por todo el citoplasma,
mientras el ADN se encontraba de forma ms o
menos compacta en una regin determinada, el
nucleoide. En todos los tipos celulares exista
sntesis de ARN, de vida media corta y en cantidades proporcionales a las de protenas. Gran
parte de estas observaciones se realizaron mediante la administracin de precursores radiactivos a las clulas. As, experimentos de pulso
y caza en clulas eucariotas con precursores de
ARN marcados radiactivamente (UTP marcado,
especfico del ARN) evidenciaron que, despus
del pulso, las seales radiactivas de ARN se
localizaban en el ncleo, sealando que en l se
produca la sntesis. Tras pasar a las clulas a un
medio normal y proceder a la caza de las
molculas radiactivas de ARN despus de un
cierto tiempo (que no poda dilatarse demasiado
debido a la corta vida media de las molculas de
ARN), stas aparecan por todo el citoplasma
(fig. 14.1), evidenciando su desplazamiento
despus de sintetizadas, para ejercer sus
funciones en el citoplasma celular, donde se
llevaba a cabo la sntesis de protenas. Eran,
pues, buenas candidatas para ser las molculas
intermediarias en la sntesis proteica. A partir de
todas estas evidencias indirectas, las primeras
pruebas experimentales de la existencia de un
intermediario de ARN (formado a partir de
ADN) que diriga la sntesis de protenas, se
realizaron en investigaciones con bacterias y sus
fagos. En dos artculos, publicados en Virology
en 1956 y 1958, Elliot Volkin, Lawrence
Astrachan y colaboradores analizaron el ARN
producido tras la infeccin de E. coli con los
fagos T2 y T7. Utilizando 32P observaron que el
suceso molecular ms patente, tras la infeccin,
era la sntesis de gran cantidad de ARN, cuya
composicin nucleotdica era similar a la del
ADN del fago utilizado (y diferente a la del
ARN bacteriano) (tabla 14.1). Aunque el ARN
era inestable (o tena una vida media muy
corta), su produccin siempre preceda a la
sntesis de las protenas del fago, pareciendo ser
un
paso
necesario
para
la
misma.
GENTICA MOLECULAR
181
FIG. 14.1. Experimentos de pulso y caza con precursores radiactivos de ARN. Despus del pulso, las seales
radiactivas de ARN se localizaban en el ncleo, indicando que era ah donde se sintetizaba. Tras un tiempo se
cazaba el material radiactivo en el citoplasma, evidenciando su desplazamiento, despus de sintetizado, para
ejercer sus funciones.
TABLA 14.1. Composicin de bases de los ARN producidos despus de la infeccin de E. coli con los fagos T2
y T7, comparados con la composicin de bases de los ADN de los fagos y con la del ARN de E. coli sin infeccin.
(Datos tomados de Volkin y Astrachan, 1956; Volkin et al., 1958)
182
GENTICA
Fig. 14.2. Mecanismo general de sntesis de ARN, catolizada por la enzima ARN polimerasa, utilizando como
molde una cadena de ADN. Ntese el apareamiento Adenina-Uracilo, correspondiente a la sustitucin
de Timing por Uracilo en el ARN.
rigir la sntesis de las protenas en los ribosomas. Tal propuesta fue formalmente postulada
por F. Jacob y J. Monod en 1961, en el contexto
de su modelo de regulacin de la expresin gentica (que ser tratado en otro captulo). La similitud entre el ADN y el ARN sugera que la
transcripcin, el proceso de transferencia de la
informacin contenida en el ADN al ARN, se
realizaba en base a la complementariedad de las
bases (fig. 14.2), de un modo similar a como se
realizaba la replicacin, pero fabricndose slo
una cadena de ARN y siguiendo las reglas de
apareamiento de la replicacin con la salvedad
del apareamiento Adenina-Uracilo (en vez de
Timing; vase el captulo dedicado a la
estructura del material gentico). Ello no deca
nada acerca de si el ARN se fabricaba a partir
de una o ambas cadenas del ADN, pero
mediante nuevos experimentos Marmur y
colaboradores, despus de purificar por separado las dos cadenas de ADN del fogo SP8
aprovechando sus diferentes densidades en
CsCI, aislaron transcritos de ARN de dicho fogo
y, mediante hibridacin molecular, demostraron
que cada transcrito era complementario de una
sola de las cadenas del fogo, aunque no siempre
era la misma cadena para todos ellos.
Finalmente, la confirmacin citolgica de la
transcripcin se ha llevado a cabo gracias a los
trabajos de O. Miller, B. Hamkalo y C. Thomas
en oocitos de anfibios, visualizndose la
transcripcin de enormes cantidades de ARNr a
partir de sus genes (fig. 14.3).
GENTICA MOLECULAR
183
FIG. 14.3. Dibujo representativo de la confirmacin citolgica del modelo de transcripcin de genes del ARN ribosmico
(ARNr), repetidos en tndem, transcribindose en el nuclolo de un anfibio. Las molculas de ARN en crecimiento aparecen
como ramas que salen de un tronco que es el ADN. El aspecto es el de un rbol de Navidad. En cada rbol (un gen en
transcripcin), las ramas ms cortas representan transcritos incipientes, mientras que las ramas ms largas seran
molculas de ARNr prcticamente formadas (copias de una de las cadenas del gen).
184
GENTICA
Fig. 14.4. La sntesis de ARN se realiza por complementariedad de secuencias, a partir de una de las dos cadenas
de ADN, la molde, tambin llamada cadena antisentido, ya que su secuencia es complementaria a la secuencia del
gen. La cadena de ADN que no se transcribe es la acompaante o cadena con sentido, ya que su secuencia es la del
gen, que quedar en forma de ARN (con la salvedad de la sustitucin de las Timinas por Uracilos). La direccin de la
sntesis es 5' 3' (igual que en replicacin).
'
2
)..
GENTICA MOLECULAR
185
186
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FIG. 14.6. Segmento de ADN que contiene ungen estructural que se transcribe. Se marcan todos los elementos
ms relevantes tanto en el ADN como en el ARNm. En los procariotas, transcripcin y traduccin estn
acopladas. El segmento que posteriormente se va a traducir es menor que el ARNm transcrito, ya que ste
presenta las regiones lder (en 5', que contiene las secuencias para enganche del ribosoma) y trailer (en 3').
GENTICA MOLECULAR
187
Fig. 14.7. a) Representacin esquemtica de un promotor en la que se marcan las regiones indispensables para el
inicio de la transcripcin. Ntese que dichas regiones se localizan en la cadena acompaante. b) Secuencias nucleo
tdicas de algunos promotores de E. coli y sus jugos, en la cadena de polaridad 5' - 3'. El punto +1 que se marca no
es el de inicio de la sntesis, ya que ste estar localizado en la cadena molde y contendr una pirimidina (timina,
principalmente, o citosina).
Fig. 14.8. Iniciacin de la transcripcin: a) La holoenzima ARN polimerasa va explorando el ADN, buscando la se
cuencia promotora. b) Una vez localizado el promotor se ancla a l, gracias a la subunidad sigma (a). Esta primera
unin es laxa y la estructura que se forma se denomina complejo del promotor cerrado. c) La unin se incrementa y
se produce un desenrollamiento de la doble hlice alrededor de la regin -10. A esta estructura se le denomina com
plejo del promotor abierto. d) Transicin hacia la fase de elongacin con la incorporacin del primer nuclesido tri
fosfato y, sobre ste, secuencialmente varios ms mediante enlaces fosfodister. Se disocia la subunidad a.
190
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191
192
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TABLA 14.3. Especializacin en la sntesis de ARN por parte de las ARN polimerasas de eucariotas
lo que establece ms oportunidades y mecanismos para llevar a cabo la regulacin de la expresin de los genes eucariotas, en asociacin
con este transporte. El transcrito primario de
ARNm debe sufrir una serie de modificaciones,
relacionadas con su transporte al citoplasma, su
proteccin en ese medio y la eliminacin de
secuencias intrnicas para convertirse en un
ARNm funcional. Este ltimo proceso tambin
lo realizan los ARNr y ARNt.
Por otra parte, en eucariotas existen tres
ARN polimerasas diferentes, ms grandes, especializadas (tabla 14.3) y complejas que la
polimerasa bacteriana, aunque mantienen ciertas
similitudes en las subunidades mayores que
constituyen el ncleo enzimtico.
El proceso de transcripcin ms analizado
en eucariotas es el realizado por la ARN polimerasa II, la encargada de transcribir los ARNm
y a l nos referiremos a partir de este momento.
Las secuencias que constituyen los promotores
eucariticos son ms extensas y complejas. En
ellos existen regiones equivalentes a las
secuencias consenso de los promotores
bacterianos. La primera de ellas es la caja
TATA o de Goldberg-Hogness, situada a -25
pares de nucletidos (corriente arriba) del punto
de inicio de la transcripcin. Sera la regin
equivalente a la regin -10 de los promotores
bacterianos. Su secuencia consenso es ms
amplia, un heptanucletido, y se encuentra en la
mayora de los promotores eucariticos, siendo
la responsable de la puesta en marcha del inicio
de la transcripcin a travs de su unin a una
protena, TBP (TATA binding protein), que
facilita su desenrollamiento. Esta protena, a su
vez, forma parte de un complejo de mltiples
subunidades denominado TFIID, responsable de
la unin inicial al ADN, necesaria para que se
ancle la ARN polimerasa, que, a diferencia de la
enzima procariota, no puede establecer
directamente su unin al ADN de la regin
promotora. Una segunda regin se localiza
GENTICA MOLECULAR
Este residuo de guanina adopta una orientacin inversa a la de los dems nucletidos,
bloqueando el extremo 5'. sta sera la estructura cap, sobre la cual se van a generar metilaciones que establecern distintos tipos de
cap (resumidos en la fig. 14.11).
Si sobre la guanina de este nucletido incorporado postranscripcionalmente se incorpora
un grupo metilo en N7 (reaccin catalizada por
la enzima guanina-7-metil transferasa), se
origina la caperuza bsica, denominada cap 0,
que se encuentra en todos los ARNm
eucariticos (y es la caperuza tpica de los eucariotas unicelulares).
Sobre cap 0 pueden realizarse nuevas
metilaciones del transcrito. As, puede ocurrir
una segunda metilacin en el C2' de la ribosa
del primer nucletido procedente de la transcripcin (que ahora sera el segundo nucleti
do del transcrito), llevada a cabo por otra enzi-
193
COLA
DE
194
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GENTICA MOLECULAR
4.3.
PROCESO DE PODA DE
SECUENCIAS INTRNICAS
(SPLICING)
195
196
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Fig. 14.13. Mecanismo de splicing mediado por el spliceosoma: complejo enzimtico que catoliza el proceso. Son ri
bonucleoprotenas complejas (ARNsn+protenas). Los ARNsn (Us) ayudan en los alineamientos de las secuencias
para los cortes y empalmes, por complementariedad de secuencias con regiones muy conservadas de los intrones. La
funcin cataltica la realizan las protenas del complejo.
GENTICA MOLECULAR
197
Fig. 14.14. Mecanismo de autosplicing del intrn del ARNr 35S en Tetrahymena (Intrn autocataltico = Ribozima).
Las reacciones de transesterificacin se indican con flechas discontinuas.
hacia la secuencia consenso central. Las subunidades U4-U6, junto a un conjunto de protenas,
serviran de estabilizantes del complejo. Entonces se origina una primera reaccin de transesterificacin entre el nucletido de Adenina altamente conservado de la secuencia consenso
198
GENTICA
GENTICA MOLECULAR
199
Captulo
15 Cdigo Gentico
Antonia Mara Fernndez Peralta
1.
2.
3.
La Traduccin
3.1. El ARN Transferente
3.2. El Ribosoma
3.3. Fases del Proceso de la Traduccin
4.
Lecturas Recomendadas
202
GENTICA
GENTICA MOLECULAR
203
204
GENTICA
Fig. 15.2. Consecuencias genticas de una mutacin de alteracin de la pauta de lectura sobre una protena
(se representa slo un pequeo fragmento del gen y de la cadena polipeptdica) en el supuesto de un cdigo
sin signos de puntuacin internos (a) o con ellos (b).
GENTICA MOLECULAR
FIG. 15.3. Restitucin del fenotipo salvaje mediante una mutacin supresora (en realidad es una segunda
mutacin de cambio de pauta de lectura compensatoria de la primera).
205
206
GENTICA
GENTICA MOLECULAR
codificaba fenilalanina:
2.2.
207
2.3.
208
GENTICA
Fig. 15.4. Ejemplo de un experimento tpico con copolmeros de proporciones nucleotdicas fijadas. En este
caso se ha utilizado una relacin 5C:IA. Para todos los clculos se utilizan, realmente, las frecuencias relativas
respecto a la tripleta en mayor proporcin y respecto al aminocido en mayor porcentaje. Los datos se han
mantenido en porcentajes para facilitar la comprensin del experimento.
GENTICA MOLECULAR
209
Fig. 15.5. Tripletas producidas en copolmeros fabricados a partir de di-, tri- y tetranucletidos,
segn como se desplace el inicio de la sntesis.
Tabla 15.1. Algunos ejemplos de polmeros de secuencia conocida y los aminocidos (Aas) incorporados en cada caso. La
asignacin que se ofrece es la correcta, pero para ello es necesario combinar estos resultados con los de la experimentacin
con copolmeros de proporciones nucleotdicas fijadas (ver explicacin en el texto)
210
GENTICA
que se muestran sera necesario combinar los resultados de di-, tri y tetranucletidos entre s y/o
con los obtenidos a partir de la experimentacin
con copolmeros de proporciones nucleotdicas
fijadas. Por poner unos ejemplos del procedimiento que se sigui, fijmonos en el resultado
del experimento marcado como 1 en la tabla
15.1. Los codones ACA y CAC especifican
treonina e histidina, pero no se puede determinar cul a cada uno. Si volvemos a los datos de
la figura 15.4, vemos que, de los dos aminocidos, la treonina es el nico que se asigna a un
codn 1C:2A (adems de uno 2C:1A). Si la
histidina slo se especifica con un codn 2C:1
A, entonces el codn CAC ser de histidina y
ACA de treonina. Un poco ms complicada
resulta la asignacin de codones a senna y
leucina, a partir de los datos combinados de la
tabla 15.1. A partir del experimento 2 no se
puede conocer la asignacin especfica, pero si
vemos el experimento 3 y el 5 se puede llegar a
concluir que CUU es codn de leucina, pues es
el nico comn a ambos experimentos y leucina
el nico aminocido tambin comn en ambos.
Una vez fijado ese codn para leucina, tanto en
el experimento 5 como en el 3, entonces UCU
sera el codn de senna pues es comn a los
experimentos 2 y 3 y tambin senna lo es. Por
tanto, el codn de fenilalanina es UUC y leucina
vendra adems especificada por el codn CUC
(experimento 2).
Con todo este ingenioso procedimiento se
hicieron nuevas asignaciones y se reafirmaron
otras ya establecidas. Adems, mediante la utilizacin de los copolmeros de los tetranucletidos en los experimentos marcados en la tabla
15.1 como 6 y 7, que no incorporaban ningn
aminocido, se indic la existencia, entre sus
tripletas, de codones de terminacin, al menos
uno por cada secuencia (los subrayados), al no
compartir ningn codn.
2.4.
Al tiempo que se iban realizando los experimentos del apartado anterior, el grupo de Niren
GENTICA MOLECULAR
211
Fig. 15.6. Afinidad entre complejos de transferencia (aa*-ARNt) y tripletas especficas en sistemas acelulares
(Nirenberg): Para el mini-ARNm 5'-CUC-3', si se utiliza el transferente Leu*-ARNt en la reaccin, se fija
al ribosoma y todo el complejo queda inmovilizado en el filtro, observndose ah la radiactividad.
212
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GENTICA MOLECULAR
213
Fig. 15.8. Emparejamiento bases segn las reglas del tambaleo. En la parte superior se muestra un ejemplo ilustrati
vo en el que se observa que, en el ARNt, en el extremo S' del anticodn, la G puede adoptar dos posiciones de tamba
leo, apareando con tripletas que tengan U o C en la tercera posicin codnica (extremo 3').
Tabla 15.2. Especies moleculares de ARNtSer de acuerdo con las reglas del tambaleo
214
GENTICA
La traduccin del ARNm es la polimerizacin biolgica de aminocidos en cadenas polipeptdicas, de acuerdo con las especificaciones
contenidas en su secuencia de bases (que provienen de la secuencia del gen que se trate),
mediante el concurso de las molculas adaptadoras (ARNt) y todo ello inmerso en una compleja maquinaria de sntesis cuyo elemento determinante es el ribosoma (junto a otros factores
proteicos adyuvantes para la sntesis).
Antes de entrar en detalles del proceso deberemos detenernos en la estructura del ARN
transferente y del ribosoma, dos elementos
esenciales en el proceso de la traduccin.
3.1. EL ARN TRANSFERENTE
Las molculas de ARNt, debido a su tamao, estabilidad e importancia biolgica se encuentran entre los ARN mejor conocidos y caracterizados. Son las encargadas de adaptar el
aminocido correcto a los codones especficos.
Fue Crick, en 1957, quien postul esa funcin
adaptadora que se confirm poco despus.
En 1965, el grupo de R. Holley dio a conocer la secuencia completa del ARNtAla (el superndice se refiere a especificidad del ARNt
por el aminocido, no necesariamente al aminocido que lleva incorporado, que se indicara
como aa-ARNt) aislado de levadura y, desde
entonces, se han caracterizado infinidad de estas
molculas, encontrndose que su estructura es
muy similar en todos los organismos.
Una molcula de ARNt est formada por
75-90 nucletidos y su secuencia presenta
varios nucletidos especiales con bases raras:
GENTICA MOLECULAR
3.2. EL RIBOSOMA
215
216
GENTICA
Fig. 15.9. Estructura de un ARNt: a) Estructura secundaria en hoja de trbol y b) estructura funcional
tridimensional en hoja de trbol plegada en forma de L.
GENTICA MOLECULAR
217
218
GENTICA
Fig. 15.11. Esquema que representa la incorporacin de un aminocido a la cadena polipeptdica en formacin.
Para una mejor comprensin se han numerado algunos codones y se han especificado con sus bases los codones y
anticodones de las posiciones internas al ribosoma y las dos posiciones flanqueantes.
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219
GENTICA MOLECULAR
221
GENTICA MOLECULAR
223
TABLA 15.3. Excepciones a la universalidad del cdigo gentico (Mt = Mitocondrias, L = Levaduras,
C = Candida, Ps = Plantas superiores, D = Drosophila, H = Hombre, My = Mycoplasma, P = Paramecium,
T = Tetrahymena, S = Stylonichia, E = Euplotes)
polynucleotides:
Polynucleotide
phosphorilase , J. Am. Chem. Soc, 77:
3.165-3.166.
Holley, R. W. et al. (1965): Structure of an
RNA,
Science, 147: 1.462-1.465.
Joyce, G. F. (2002): The antiquity of RNAbased evolution, Nature, 418: 214-221.
Klug, W. S y Cummings, M. R. (1999):
Conceptos de Gentica (55 a ed.), Prentice
Hall.
Matthaei, J. H. y Nirenberg, M. W. (1961):
Characteristics and stabilization of DNAsesensitive protein synthesis in E. coli
extracts, Proc. Nat. Acad. Sci, 47: 1.5801.588.
Michael, S. (2002): Recent emergence of the
modern genetic code: a proposal, Trends in
Genetics, (18) 5: 245-248.
Nirenberg, M. W. y Leder, P. (1964): RNA
code words and protein synthesis. The effect
of ttrinucleotides upon the binding of sRNA
to ribosomes, Science, 145: 1.399-1.407.
Segr, G. (2000): The Big Bang and the
genetic code, Nature, 404: 437.
Captulo
de la expresin gentica
16 Regulacin
en procariotas
Antonia Mara Fernndez Peralta
1.
2.
3.
Lecturas Recomendadas
226
Hemos establecido en los anteriores captulos cmo el ADN se organiza en genes que almacenan la informacin gentica. Hemos visto
cmo son esos genes y cmo se expresan transcribindose en ARN que, en la inmensa mayora
de los casos, se traduce a protenas. Entonces
surge una pregunta clave en gentica: Cmo se
regula la expresin de los genes? En cualquier
eucariota superior todas sus clulas tienen la
misma informacin gentica, pero resulta evidente que, espacial y temporalmente, todos sus
genes no se estn expresando a la vez. Por citar
unos simples ejemplos, los sistemas enzimticos
que produce una clula heptica son muy diferentes a los que produce una clula sangunea
precursora de eritrocitos, muchos genes implicados en el desarrollo de ciertas etapas de la
vida dejan de expresarse en otras, etc. Incluso
en un organismo unicelular, como una bacteria,
la produccin enzimtica no es continua y total,
sino que responde a las necesidades celulares.
El anlisis de las protenas de E. coli demuestra
que las concentraciones de los casi 4.000 polipptidos que fabrica varan enormemente. As,
para las protenas implicadas en la gluclisis
hay ms de 100.000 copias por clula, mientras
de otras las cantidades son mnimas. Aunque en
bacterias siempre hay un cierto nivel basal de
cualquier producto gnico, en determinadas circunstancias las cantidades de ciertas protenas
se incrementan enormemente para despus volver a su estado inicial.
Resulta, adems, evidente que los sistemas
reguladores de procariotas y eucariotas deben
ser diferentes, en tanto en cuanto que ambos tipos de organismos presentan profundas diferencias en muchas de sus caractersticas vitales.
Un procariota es un organismo vivo que crece y
se divide mientras las condiciones del medio
sean las adecuadas y mantenga un suministro
correcto de nutrientes. Sus sistemas regulatorios
deben estar adaptados para optimizar esas
tareas. En el otro extremo, un eucariota superior
con diferentes tejidos y sistemas no slo crece y
se reproduce; pasa por diferentes etapas de
desarrollo y sus clulas se diferencian y
especializan, etc. Todo ello conlleva profundos
cambios
morfolgicos,
fisiolgicos
y
bioqumicos que deben ser mantenidos, por
GENTICA
lo que los genes expresados en unas determinadas etapas y tipos celulares (y tambin en ellos
en cantidades diferentes) dejan de hacerlo en
otros, y viceversa. De esa manera, en la vida
adulta, determinados circuitos estn permanentemente cerrados, mientras otros siguen expresndose, pudiendo hablarse de una regulacin irreversible, mientras que cada tipo tisular
debe no slo realizar sus funciones especficas
sino hacerlo del modo adecuado en cada momento (regulacin reversible).
En resumen, resulta obvio que deben existir
mecanismos complejos que regulen la expresin
de los genes. De modo general, desde la
secuencia de nucletidos del ADN hasta la
protena, hay varios niveles en los que se puede
ejercer el control: transcripcin (y procesamiento en eucariotas), traduccin y funcionalidad de la protena. En este y el siguiente captulo abordaremos los distintos procesos de control
del flujo de la informacin gentica.
La regulacin del proceso de sntesis proteica podra hacerse a tres niveles: replicacin,
transcripcin y traduccin. Sea cual sea, el resultado final podra consistir en la ausencia de
sntesis proteica (cuando no se requiera) o la
sntesis (cuando sea necesaria).
De todos los posibles sistemas de regulacin, el que acta a nivel de la transcripcin es
el mejor conocido, sobre todo en bacterias, y
este modelo, evidentemente el ms simple,
puede servir de base para comprender la regulacin de la accin gnica en los sistemas complejos de los organismos superiores.
1.
GENTICA MOLECULAR
227
2.1.
La lactosa (azcar de la leche) es un disacrido perteneciente al grupo de los -galactsidos. E. coli puede utilizarla como fuente de
energa y de carbono despus de degradarla,
convirtindola en glucosa y galactosa (fig.
16.1). La enzima que lleva a cabo el proceso de
hidrlisis en sus dos monosacridos es lap-galactosidasa. Esta enzima, adems, cataliza la
transformacin de lactosa en alolactosa.
En 1946, Monod y Andureau encontraron
que la capacidad de metabolizar lactosa (fenotipo lac+) de E. coli estaba bajo control gentico
y, a su vez, se necesitaba la presencia de galactsidos en el medio (que actuaban como
inductores del sistema). As, en presencia de
lactosa, la concentracin de -galactosidasa se
incrementaba rpidamente, de 5-10 molculas
por clula a miles de ellas. A partir de entonces,
diversos investigadores, entre los que se
encontraban J. Lederberg, E. Wollman, A.
Lwoff, A. Pardee, F. Jacob, y el propio J.
Monod, fueron realizando numerosos descubrimientos genticos y bioqumicos acerca de
esa funcin bacteriana, y sentaron las bases
hasta culminar en el establecimiento del modelo
de regulacin del opern lac. Por una parte,
cuando se induca la produccin de -galactosidasa, tambin se induca la sntesis de otras
dos enzimas: la galactsido permeasa y la galactsido transacetilasa. La primera de ellas facilita la entrada de lactosa a la clula bacteriana
y la segunda, aunque no est directamente implicada en el metabolismo de la lactosa, y su
funcin fisiolgica permaneci oscura por mucho tiempo (incluso no se la consider en muchos de los trabajos originales que resumiremos
a continuacin), actualmente se cree que entre
sus funciones est la de proteger a otros
galactsidos (mediante acetilacin) de la ac-
228
GENTICA
Fig. 16.1. Metabolismo de la lactosa: la enzima -galactosidasa catalina la rotura del enlace glucosidico
originando galactose y lactosa.
GENTICA MOLECULAR
229
sntesis enzimtica se produca tanto en presencia como en ausencia de lactosa. La cartografa de estos mutantes mostr que se localizaban en una regin del cromosoma de E. coli
cercana a los genes estructurales, pero no
exactamente en la misma regin. A ese locus se
le llam lacI (I, de ahora en adelante). El
anlisis gentico de las mutaciones constitutivas
del gen I demostr que eran recesivas (I -)
respecto al alelo salvaje. Al combinar los dos
alelos (I+/I-) en merocigotos de conjugacin, la
accin (reguladora) del alelo salvaje sobre los
genes estructurales siempre domina respecto al
mutante, lo que quiere decir que I+
es
dominante en trans sobre I-. Ello quera indicar que el producto del gen I salvaje actuara a
inductor (IPTG) mientras las I - lo hacen siempre (con stitutivamente). Si nos fijamos en la
estirpe 3 de la tabla 16.1, se produce enzima galactosidasa (producto del gen Z+) slo en
presencia de inductor, aunque I* no se encuentra en el mismo segmento de ADN, luego ejerce
su accin en trans. Ya hemos hablado de los
trminos cis y trans en otros captulos, pero
conviene indicar que, en el contexto de la
regulacin, un elemento regulador en cis es
aquel que ejerce su accin sobre otros genes o
secuencias siempre que se localicen en la misma
molcula de ADN, mientras que un elemento
regulador en trans es aquel que ejerce su
accin sobre otros genes o secuencias que no
tienen por qu estar fsicamente sobre el mismo
segmento de ADN, luego su accin la ejecuta a
travs de un factor difusible. La prueba
experimental de la existencia de una molcula
represora producida por el gen I fue llevada a
cabo por Pardee, Jacob y Monod y se denomin
Tabla 16.1. Combinaciones de alelos I que permitieron establecer las caractersticas de los mutantes constitu
tivos (F) del gen I. El alelo salvaje es dominante en trans respecto al mutante, lo que indica que el alelo mutante
produce un represor inactivo. La presencia de niveles altos de enzima se indican con el signo + y su ausencia
con el signo -. El smbolo V indica delecin.
230
GENTICA
Tabla 16.2. Combinaciones de alelos I que permitieron establecer las caractersticas de los mutantes I' del gen 1.
Son dominantes en trans respecto al alelo salvaje y a I-. I' elimina la respuesta a cualquier inductor, presumiblemente
por modificacin estrica del represor, lo que indica una interaccin directa entre el producto del gen I y el inductor.
La presencia de niveles altos de enzima se indican con el signo + y su ausencia con el signo -.
del cromosoma bacteriano, las bacterias receptoras (I+Z+/I- Z-) recuperan la capacidad de
sntesis de -galactosidasa en ausencia de inductor (IPTG) durante unas dos horas (muestra
2) y despus la sntesis de enzima finalizaba.
GENTICA MOLECULAR
231
Tabla 16.3. Combinaciones de alelos O que permitieron establecer las caractersticas del operador. Los mutantes Oc son
dominantes en trans respecto al operador, lo que indica que se tratara de una regin adyacente a los genes es tructurales
(diferente al promotor de la transcripcin). Sus mutaciones permitieron establecer sus caractersticas. La presencia de
niveles altos de enzima se indican con el signo + y su ausencia con el signo -.
aislaron y combinaron muchos tipos de mutantes para llegar a establecer las caractersticas
esenciales de los elementos del sistema. As, por
ejemplo, se aislaron mutaciones opuestas a I-,
llamadas Pen las que, en lugar de afectarse la
interaccin con el operador, como ocurra con
las primeras, se impeda la unin con la lactosa,
reprimiendo la sntesis de las enzimas. Estos
mutantes eran dominantes en trans, respecto al
gen I normal.
Merece recordarse en este punto que el modelo del opern se publica cuando estn en plena efervescencia las experimentaciones acerca
de la posible existencia de un intermediario entre el ADN y las protenas y, en su trabajo, Jacob y Monod lo sugieren (incluso en un primer
momento apuntan a que el represor fuese ARN).
Posteriormente, el modelo se fue completando y
perfeccionando, sin que, en ningn caso, esto
quiera quitar importancia a la propuesta inicial
de Jacob y Monod.
Unos aos despus se aisl el represor, que
ha sido caracterizado, demostrndose que se trata de una protena homotetramrica, con monmeros de 136 aminocidos que presentan cuatro
sitios de unin a lactosa y un sitio de unin al
operador (pero no a los mutantes Oc). Tambin
se ha caracterizado la secuencia de bases del
operador que, como se muestra en la figura
16.5, es una corta secuencia palindrmica (~25
pb), localizada justo delante del primer gen estructural (se localiza, por tanto, en el extremo 3'
del promotor y sus bases se transcribirn en la
232
GENTICA
GENTICA MOLECULAR
233
REPRESIN CATABLICA
CONTROL POSITIVO
DEL
OPERN
LAC:
de
la
regin
operadora
Fig. 16.7. a, b y c) Funcionamiento del opern lac bajo el doble control de glucosa y lactosa. nicamente en
situaciones de bajos niveles de glucosa y altos niveles de lactosa se producen altas tasas de transcripcin. La
unin del complejo (protena CAP-AMPc) facilita, en la situacin mostrada en (c), la unin de ARN
polimerasa.
GENTICA MOLECULAR
tintas alternativas de funcionamiento del opern, bajo este control combinado negativo y
positivo.
Finalmente, con todas estas evidencias, y
recordando que el modelo del opern se integra
en la transcripcin, podemos retomar la figura
14.5 del captulo 14 e integrar, en la unidad de
transcripcin que en ella se representa, los elementos controladores de la transcripcin que
acabamos de ver, quedando aqulla del modo
que se muestra en la figura 16.8.
3. El opern trp: modelo de atenuacin
235
Fig. 16.8. Esquema parcial de la unidad transcripcional del opern lac en la que se sitan los elementos controladores (sitio
CAP y Operador). Se marcan tambin los elementos ms relevantes de la transcripcin, tanto en el ADN como en el ARNm.
En los procariotas transcripcin y traduccin estn acopladas (el segmento que posteriormente se va a traducir es menor que
el ARNm transcrito). El operador cubre parte de la regin que se transcribir como lder.
236
GENTICA
Fig. 16.9. a) Elementos bsicos del opern trp (P = promotor, O = operador y regin atenuadora). b) Se destaca
especialmente la composicin de la regin que se transcribir como regin lder, que contiene en su secuencia el gen
para el pptido lder y la regin atenuadora.
3.1. ATENUACIN
GENTICA MOLECULAR
237
presenta en su interior una unidad de transcripcin y traduccin del pptido lder hacia 5' y,
adems, presenta en su extremo 3' (justo antes
del comienzo del ARNm del primer gen estructural) un terminador rho independiente.
De hecho la regin lder presenta cuatro regiones de autoapareamiento, 1, 2, 3 y 4 (fig.
16.1Oa), siendo el apareamiento 3-4 la horqui
Fig. 16.10. a) Todas las posibilidades de autoapareamiento en la regin lder del opern trp. b) Apareamiento 3-4
formado cuando existen altas concentraciones de triptfano en el medio. Ntese que se forma un terminador de la
transcripcin. c) Apareamiento 2-3 formado cuando existen bajas concentraciones de triptfano. El terminador 3-4
no se forma. d) Situacin posible en estados carenciales graves.
238
GENTICA
Fig. 16.11. Secuencia de aminocidos del pptido lder y la correspondiente secuencia de bases del ARNm
de la regin lder del opern fenilalanina (a) y opern histidina (b).
y 3 que se aparean tan pronto como estn transcritas y la regin 4 queda libre. En esas circunstancias no se forma el terminador (3-4), la polimerasa contina unida y sigue transcribiendo
los genes estructurales para la produccin de las
enzimas implicadas en la sntesis del aminocido.
Incluso existira una tercera posibilidad en
estados carenciales extremos (fig. 16.1Od); se
forman los apareamientos 1-2 y 3-4 con lo que
empieza la transcripcin y acaba en el terminador 3-4, pero no se realiza traduccin alguna.
La atenuacin no es exclusiva del opern
triptfano; muy al contrario la regulacin por
atenuacin es caracterstica de muchos operones
biosintticos de aminocidos, incluso como
mecanismo regulatorio nico o predominante en
algunos de ellos (opern his). En la figura 16.11
se muestran las secuencias y los pptidos lder
de los operones fenilalanina e histidina, en los
que, como puede observarse, existen varios
residuos del aminocido correspondiente.
Por ltimo, existe un tercer mecanismo de
control del opern trp, denominado retroinhibicin, que coopera con los ya relatados para un
control ms fino de la sntesis de triptfano.
Consiste en la inhibicin, producida por el triptfano, de la primera enzima de la ruta, tratndose por tanto de un mecanismo postraduccional.
No se conoce exactamente por qu coexis-
GENTICA MOLECULAR
239
Captulo
de la expresin gentica
17 Regulacin
en eucariotas
Antonia Mara Fernndez Peralta
1.
2.
3.
4.
Regulacin Postranscripcional
Lecturas Recomendadas
242
La mayora de los procesos genticos bsicos presentan grandes similitudes entre procariotas y eucariotas, aunque en estos ltimos
siempre existe un mayor grado de complejidad
(se remite al lector a los captulos dedicados a
replicacin, trascripcin o traduccin). En la
regulacin de la expresin gentica tambin se
puede aplicar esta regla, pero resulta evidente
que los organismos eucariontes, sobre todo los
superiores, con su enorme complejidad celular,
estructural y fisiolgica y sus complicadas y
diversas etapas en su ciclo de vida, han desarrollado intrincados y variados mecanismos regulatorios.
GENTICA
GENTICA MOLECULAR
243
2.1. EL PROMOTOR
Es la regin en la que se localizan las seales que sirven para el reconocimiento por parte
de la ARN polimerasa. Aunque en eucariotas
hay tres ARN polimerasas diferentes, nos referiremos al promotor de ARN polimerasa II, la
encargada de transcribir los ARNm.
Los promotores eucariotas siempre se encuentran delante (5') de los genes que regulan,
son ms extensos y complejos que los bacterianos pero presentan regiones equivalentes a las
secuencias consenso de aqullos. De algunas de
ellas ya hemos hablado al referirnos a la
transcripcin pero analizaremos ahora su contribucin a la regulacin (fig. 17.1). La caja
TATA
o
de Goldberg-Hogness, situada
aproximadamente a -25 pares de nucletidos (co
Fig. 17.1. a) Representacin de un promotor de eucariotas superiores, en el que se muestran las regiones
conservadas o cajas. b) Mutaciones del promotor del gen de la /3-globin y su efecto sobre la transcripcin.
El nivel 1 indica la tasa de transcripcin del promotor salvaje.
244
GENTICA
Fig. 17.2. Complejo basal de iniciacin de la transcripcin. Los distintos factores de transcripcin (TFII)
para la ARN polimerasa II (Pol II) se indican resumidamente II, seguido de la letra indicativa del factor
de que se trate.
rriente arriba) del punto de inicio de la transcripcin es la equivalente a la regin -10 de los
promotores bacterianos. Su secuencia consenso
es ms amplia, un heptanucletido, siendo la
responsable de la puesta en marcha del inicio de
la transcripcin. En la figura 17.2 se resume la
cascada de uniones de factores de transcripcin
hasta llegar a formarse el complejo basal,
necesario para el inicio de la transcripcin. El
suceso desencadenante siempre es la unin, a la
caja TATA, de la protena TBP (TATA bin-
GENTICA MOLECULAR
riormente se unen otros factores de transcripcin hasta formar el complejo basal (que se
muestra ensamblado al final de la fig. 17.2) necesario para el inicio de la transcripcin, sobre
el cual se ejercern las acciones reguladoras por
parte de otros elementos.
La segunda regin de importancia es la caja
CCAAT, de posicin mucho ms variable, pudiendo encontrarse en cualquier punto de un
segmento entre -50 y -500 nucletidos con
distintas orientaciones, segn los genes, y cuyas
mutaciones afectan a las tasas de transcripcin.
Una tercera regin conservada es la caja GC
que se localiza, generalmente, alejada del punto
de inicio de la transcripcin (aproximadamente
a unas 200 bases corriente arriba del punto de
inicio de la transcripcin), aunque su posicin y
orientacin puede variar bastante entre los
distintos promotores. Realmente esa sera la
estructura consenso de un promotor tipo, pero
la realidad es que los promotores eucariticos
son sumamente variables en cuanto al nmero,
localizacin y orientacin de estos elementos
controladores (a excepcin de la caja TATA).
El anlisis mutacional del promotor demuestra la importancia de estas regiones para el
inicio de la transcripcin. As, en la figura
17.1b, que muestra el anlisis mutacional del
gen de la /3-globina y su relacin con las tasas
de transcripcin, las mutaciones dentro de las
cajas reducen, de un modo espectacular, la
transcripcin, lo que no ocurre cuando las mutaciones se localizan fuera de ellas dentro del
promotor.
La enorme variabilidad y separacin entre
ellas indicara que, para su interaccin con el
complejo basal formado alrededor de la caja 10, las interacciones deben realizarse a travs de
uniones protena (del complejo basal)-protena
245
2.2. INTENSIFICADORES
Son secuencias de ADN cuya funcin consiste en incrementar las tasas basales de transcripcin de los promotores. Su posicin es extremadamente variable respecto al gen que regulan, pudiendo localizarse muchos cientos,
incluso miles, de pares de bases hacia 3', 5' o
internos al propio gen. En la figura 17.3 se
muestran dos intensificadores de SV40 que
ejercen su accin sobre los genes tempranos (se
localizan en 5' respecto a ellos) y tardos
(localizndose en 3' respecto a ellos). Su accin
activadora necesita, por tanto, realizarse a travs
de unin a protenas. En levaduras, se
encuentran secuencias similares a los intensificadores (denominadas UAS), salvo por su incapacidad de funcionar cuando se encuentran
corriente abajo (hacia 3') del gen. Un intensificador del virus SV40 ha sido uno de los primeros en ser caracterizado. Se localiza unos 200
pares de bases hacia 5' del punto de inicio de la
transcripcin, en una regin que presenta dos
secuencias idnticas de 72 pares de bases, dentro de las cuales se han identificado, mediante
mutaciones, cinco dominios funcionales de especial importancia para la activacin de la
transcripcin. Mediante la realizacin de construcciones genticas se ha puesto de manifiesto
que pueden activar cualquier gen que se localice
en su vecindad (relativa). Aunque son elementos que actan sobre genes situados en el
mismo segmento cromosmico en el que ellos
se encuentran, su localizacin tan alejada del
punto donde actan, incluso en el lado opuesto
al promotor, en relacin con el gen que regu-
Fig. 17.3. Regin controladora de SV40, en la que se seala la caja TATA, una caja GC y dos intensificadores.
La caja TATA y la GC seran elementos controladores de la transcripcin nicamente de los genes tempranos,
mientras los intensificadores actuaran sobre los genes tempranos y sobre los tardos.
246
GENTICA
Fig. 17.4. a) Aislantes HS4 y 3'HS del gen de la l3-globina de gallina. b) Aislantes de genes para ARNr.
lan, hizo plantearse a los investigadores distintas propuestas de su mecanismo de accin. As,
se pens que podan cambiar la densidad de
enrollamiento de la doble hlice, accesibilizando regiones del genoma; o ubicar una determinada regin cromosmica en un lugar preciso
(fijndola a la matriz nuclear, por ejemplo).
Tambin se supuso que podan actuar como un
punto de entrada para que otras protenas se
asociaran con la cromatina. Hoy en da se sabe
que su funcin es la de interaccionar con la regin promotora, no directamente sino a travs
de elementos en trans, protenas que interactuaran con el intensificador y, mediante la formacin de un bucle, se asociaran a protenas
localizadas en el complejo basal de la transcripcin.
2.3. AISLANTES (INSULATORS)
ejercer funciones muy diversas sobre los intensificadores, siempre mediante unin a protenas
especficas. Se han encontrado desde efectos
posicionales
de
activacin/desactivacin,
asociados a su modulacin por protenas, hasta
una accin facilitadora del acercamiento de los
intensificadores a regiones promotoras, el secuestro de un intensificador entre dos secuencias aislantes, etc. En la figura 17.4 se muestran
dos ejemplos de aislantes que actuaran de
barrera para impedir que determinados intensificadores ejerzan su accin sobre otros genes
diferentes a aquellos sobre los que deben actuar.
As, en el caso mostrado en la figura 17.4a, dos
aislantes HS4 y 3'HS, del gen de la -globina
de gallina bloquean la accin del intensificador
LCR de ese gen, hacia los genes A y B
respectivamente. Hacia el gen A existen
tambin otras seales inactivantes (metilacin).
As, LCR slo ejercera su accin intensificadora sobre el gen diana. Un ejemplo similar se muestra en la figura 17.4b, donde se representan los aislantes de intensificadores de
genes repetidos en tndem para ARNr. Se impide que cada intensificador pueda escapar en
su accin del segmento cuya actividad transcripcional promueve. El tiempo nos dar toda la
dimensin de su importancia en la regulacin de
la expresin de los genes, que puede ser mucha
si, como parece, estn involucrados en la
regulacin de patrones de desarrollo de algunos
organismos. Al menos en Drosophila esto
parece
estar
demostrado.
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247
248
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249
250
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251
Lecturas recomendadas
Bell, A. C. et al (2001): Insulators and Boundaries:
Versatile Regulatory Elements in the Eukaryotic
Genome, Science, 291: 447-450.
Brennan, R. (1993): The winged-helix DNA-binding
motif: another helix-turn-helix tajeoff , Cell, 74:
773-776.
Fesenfeld, G. (1992): Chromatin as an essential part
f the transcriptional mechanism, Nature, 355:
219-224.
Harrison, S. C. (1991): A structural taxonomy of
DNA-binding proteins, Nature, 353: 715-719.
Harwell, L. H. et al. (2000): Genetics. From Genes to
Genomes (3.a ed.), Mc Graw Hill.
Klug, W. S. y Cummings, M. R. (1999): Conceptos
de Gentica (5.a ed.), Prentice Hall.
Lassar, A. B. et al. (1991): Functional activity of
myogenic HLH proteins requires hetero-oligo
merization with E12/E47- like proteins in vivo,
Captulo
18
Epigentica
JOS FERNNDEZ PIQUERAS
1.
Concepto de Epigentica
2.
Fundamentos Moleculares
2.1. Modificaciones del ADN y las Historias
2.2. Patrones de Metilacin del Genoma de Mamferos
3.
4.
5.
6.
Lecturas Recomendadas
254
1. Concepto de epigentica
Por qu se inactiva una fraccin considerable de los genes de un cromosoma X en la lnea somtica de las hembras de mamferos?
Por qu se producen sndromes diferentes en
las disomias uniparentales de una misma regin
cromosmica dependiendo de su origen paterno
o materno? Cmo se inactivan algunos genes
supresores durante el desarrollo de un proceso
neoplsico sin que se produzcan alteraciones en
la secuencia de sus bases nucleotdicas? La
respuesta est en los fenmenos de naturaleza
epigentica, que actan a travs de la
metilacin del ADN, y la metilacin, fosforilacin y acetilacin/deacetilacin de las
histonas, provocando cambios en la configuracin de la cromatina que facilitan o impiden la
expresin de los genes. Este tipo de fenmenos
se han descrito en una amplia variedad de organismos (animales y vegetales), aunque existen
excepciones tan notorias como el caso de Drosophila cuyo genoma no tiene unos niveles significativos de metilacin.
En su acepcin ms moderna, la Epigentica
sera la parte de la Gentica que estudia los
cambios en la expresin de los genes que no se
deben a modificaciones en la secuencia primaria
de bases del ADN, pero que se pueden heredar
clonalmente durante las divisiones celulares o
incluso de unas generaciones a otras. Sin
embargo el trmino Epigentica no se ha utilizado siempre con el mismo sentido. La epignesis fue propuesta por Aristteles como
alternativa a las teoras preformacionistas de
Demcrito y Leucipo. En el siglo xvii William
Harvey y Casper Wolf presentaron nuevas formulaciones de la epignesis para referirse a
los mecanismos misteriosos que permitan la
aparicin de nuevas estructuras durante el desarrollo embrionario (como los rganos corporales) que no estaban presentes en el momento
de la fecundacin. En 1942 Waddington propuso su hiptesis epigentica para referirse a
los cambios en los patrones de expresin gnica
que tendran que producirse durante el desarrollo embrionario para explicar la formacin de
los distintos tipos de clulas y tejidos. Finalmente Wu y Morris propusieron la utilizacin
GENTICA
del trmino epigentica, para referirse al estudio de los cambios en la expresin gentica
que se heredan a travs de las mitosis o las
meiosis, pero que no se pueden explicar por alteraciones en la secuencia de bases del ADN.
Las primeras evidencias sobre la existencia
de este tipo de procesos epigenticos se podan
atribuir a Barbara McClintock. Esta investigadora observ que algunos transposones del maz
experimentaban ciclos de inactividad (que ella
denomin cambios de fase) que no se podan
explicar por reordenaciones cromosmicas
(cambios de estado). Estos cambios de fase
eran fcilmente distinguibles porque dejaban
sentir su efecto sobre la expresin de genes
vecinos como los implicados en la formacin de
pigmentos (efectos de posicin). Se empez a
hablar de epimutaciones en el maz y de
paramutacin. En la paramutacin, el alelo
paramutagnico puede inducir un cambio
heredable en la expresin de otro alelo
(paramutable) sin que medie ninguna
alteracin en la secuencia de sus bases nucleotdicas. La presencia de transposones cerca de
genes paramutables llev a proponer que las
paramutaciones se deban en realidad a la accin indirecta de los elementos mviles.
2. Fundamentos moleculares
2.1.
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255
256
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Fig. 18.1. Fundamentos moleculares de los procesos epigenticos (basado en Bird, 2001. Science, 294).
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258
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Fig. 18.3. Inactivacin del cromosoma X en la lnea somtica de hembras de mamferos (1). a) Mecanismo
de recuento. b) El carcter aleatorio puede traducirse en mosaicismo gentico.
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Los fenmenos de
imprinting o marcado
Se sabe desde hace muchos aos que el cruce entre una yegua y un asno produce un mulo,
pero que el cruzamiento recproco deriva en un
burdgano con orejas ms cortas y patas ms
robustas. La explicacin de estas diferencias, y
de otros muchos ejemplos que se comentarn
ms adelante, radica en la expresin diferencial
de los alelos paternos y maternos de algunos
genes. Se trata de los fenmenos de imprinting o marcado (tambin llamados mar-
259
Fig. 18.4. Inactivacin del cromosoma X en la lnea somtica de hembras de mamferos (2).
a) Los genes que se inactivas aparecen en rojo y subrayados. b) Mecanismo molecular de la inactivacin.
260
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Fig. 18.5. Regin del cromosoma 11 humano afectada por el fenmeno de imprinting.
GENTICA MOLECULAR
6.
261
FIG. 18.6. Inactivacin de un gen supresor humano hipottico mediante hipermetilacin de sus promotores.
a) Forma activa. b) Forma inactiva. A: activadores; CA: coactivadores; DNMTs: ADN metil- transferasas; MBP:
protena de unin a ADN metilado; HA: acetilasas de historias; HDCA: deacetilasa de histonas; FTs: factores de
transcripcin basales; R: represores; CR: correpresores; CTCF y GCF2: protenas de unin a otros elementos re
guladores; Pro: promotor (basado en Jones y Takai, 2001. Science, 293: 1.068).
262
GENTICA
Lecturas recomendadas
Baylin, S. B. y Herman, J. G. (2000): DNA hypermethylation in tumorigenesis. Epigenetics
joins genetics, Trends Genet., 16, 168: 174.
Ehrlich, M. (ed.) (2000): DNA alterations in cancer.Genetic and Epigenetic changes, Section
VI: 273-365, Eaton Pub.
Epigenetics (2000): Science, 293: 1.063-1.105.
Robertson, K. D. y Wolffe, A. P. (2000): DNA
methylation in health and disease, Nature
Rev. Genet., 1: 11-19.
Storz, G. (2002): An expanding universe of
noncoding FNAs, Science, 296: 1.260-1.262.
Stracham, T. y Read, A. P. (1999): Human Molecular genetics, 2 (2.a ed.), Bios.
Captulo
19
1.
2.
Enzimas de Restriccin
3.
Vectores de Clonaje
4.
Estrategias de Clonaje
5.
6.
7.
8.
Secuenciacin
9.
Lecturas Recomendadas
264
GENTICA
Uno de los objetivos esenciales de la Gentica es estudiar la estructura y funcin de los genes. Para ello resulta imprescindible conseguir
aislar dichos genes y caracterizar sus secuencias
nucleotdicas. Una pieza clave en el aislamiento
de secuencias gnicas fue el desarrollo de una
serie de procedimientos experimentales que
permiten unir fragmentos de ADN de distinta
procedencia en condiciones que pueden ser incluso aptas para la expresin gentica. Este conjunto de tcnicas reciben el nombre genrico de
tecnologa del ADN recombinante o ms coloquialmente ingeniera gentica.
1. Construccin de molculas de ADN
recombinante
El procedimiento de construccin de molculas de ADN recombinante se inicia con la extraccin de ADN del organismo objeto de estudio, u organismo donante, y el posterior frac-
cionamiento de ese ADN con enzimas de restriccin, que producen cortes especficos en el
ADN. A continuacin tiene lugar la insercin de
los fragmentos de ADN procedentes del organismo donante en pequeas molculas de
ADN capaces de replicarse autnomamente, o
vectores, las cuales permiten la amplificacin
selectiva de dichos insertos en hospedadores
adecuados. A las molculas de ADN que resultan de la unin de un inserto y de un vector se
las define como ADN recombinante porque representan combinaciones de ADN nuevas que
resultan de la unin de fragmentos de ADN de
distinta procedencia. Las molculas de ADN
recombinante se usan entonces para transformar
bacterias y generar numerosas copias de s
mismos, amplificando as los fragmentos de
ADN deseados. Este proceso de amplificacin
recibe el nombre donacin (fig. 19.1). La razn
del nombre surge del hecho de que una nica
bacteria transformada con un nico vector
recombinante es capaz de dar lugar a una colo-
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265
Fig. 19.2. El mecanismo corte de algunas enzimas de restriccin genera extremos cohesivos.
266
3. Vectores de clonaje
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4. Estrategias de clonaje
Con
respecto a este segundo aspecto
podemos clasificar las genotecas en libreras
de ADN genmico o de ADNc. En el primer
caso se parte de una muestra de ADN
aislado que posteriormente es digerido
con una determinada enzima de restric-
267
Una de las principales aplicaciones que tiene el ADN donado es su utilizacin como sonda
para detectar y aislar molculas de ADN especficas que se encuentren dentro de una mezcla de cidos nucleicos. Esta estrategia requiere,
como paso previo, la separacin de los distintos
cidos nucleicos que componen la mezcla
mediante un procedimiento conocido como
electroforesis. Esta tcnica consiste bsicamente
en depositar la mezcla de ADN en el pocillo de
un gel (de agarosa o de poliacrilamida segn los
casos), situado cerca del ctodo de un campo
elctrico, que cuando se establezca producir el
movimiento de las molculas de ADN a travs
del gel hacia el nodo a una velocidad que
depende de su tamao. Si la mezcla la
componen molculas de diferente tamao, stas
se separarn en bandas especficas. Las bandas
obtenidas despus de que hemos lleva-
268
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Para detectar un gen clonado entre una coleccin de fragmentos de ADN donados de una
genoteca hay que utilizar una sonda de ADN
especfica, previamente marcada, que seleccione
aquellos clones que contienen el gen de inters.
De esta explicacin surge una paradoja
interesante. De dnde viene el ADN que
vamos a utilizar como sonda para detectar y
aislar un determinado gen? Si se dispone de un
ADN como sonda complementario al gen de
inters es porque se tiene aislado dicho gen y no
hara falta clonarlo. La pregunta que uno se
plantea es de dnde se obtiene el ADN que se
utiliza como sonda para detectar genes cionados? Existen varias maneras de obtenerlo.
1. Hibridacin con sondas heterlogas.
Esta estrategia consiste en utilizar una sonda
269
correspondiente al mismo gen que se desea aislar pero de otro organismo e hibridarla con el
ADN clonado candidato.
2. Hibridacin con ARNm/ADNc. Este
mtodo consiste en hibridar el ADN clonado
candidato contra un Northern blot que contiene
un panel de ARNm aislados de diferentes tejidos. Una hibridacin positiva nos estara indicando la presencia de un gen dentro del fragmento clonado. El siguiente paso sera analizar
una de librera de ADNc con el fragmento clonado anteriormente mencionado. Si el gen que
queremos aislar sospechamos que se tiene que
expresar en un determinado tejido podemos ir
directamente a la construccin de una librera de
ADNc de ese tejido para, posteriormente,
proceder a la hibridacin con el ADN donado
candidato.
3. Seleccin de ADNc. Esta tcnica consiste
en la purificacin repetida de un sub-
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271
272
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9.
Amplificacin en cadena
de la polimerasa
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Lecturas recomendadas
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Captulo
20
1.
Mutagnesis in Vitro
2.
Identificacin Gentica
3.
Gentica Inversa
4.
Organismos Transgnicos
4.1. Animales Transgnicos
4.2. Plantas Transgnicas
5.
6.
7.
Lecturas Recomendadas
276
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278
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Fig. 20.2. La tecnologa del ADN permite un nuevo tipo de anlisis gentico.
2. Identificacin gentica
GENTICA MOLECULAR
4. Organismos transgnicos
El procedimiento usual de generacin de organismos transgnicos (p. ej., ratones) es la microinyeccin de oocitos fecundados (fig. 20.3).
Este proceso se inicia con el cruzamiento entre
machos y hembras frtiles (estimuladas para
una superovulacin) para obtener los corres-
279
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Como ya hemos apuntado, el gene targeting es un procedimiento de mutagnesis dirigida in vivo consistente en la modificacin total o
parcial de un gen endgeno seleccionado. La
modificacin se basa en la recombinacin entre
una molcula exgena de ADN portadora de la
mutacin a introducir y su secuencia homloga en
el ADN genmico receptor de clulas en cultivo.
Si la mutacin diseada produce la inactivacin
del gen se habla de una mutacin knockout. Hay
dos tipos de vectores de targeting: de insercin y
de reemplazamiento. En los de insercin, se
produce la integracin completa de todo el vector
281
Este tipo de tecnologa hoy por hoy es aplicable exclusivamente al ratn. Las etapas que se
siguen en la generacin de los ratones
knockout son las siguientes (fig. 20.4b):
1. Inactivacin por insercin del gen neo'
(resistencia a neomicina) dentro de una secuencia exnica del gen preseleccionado, seguida de la insercin de un segundo marcador
gnico en uno de los extremos del gen preseleccionado, por ejemplo el gen tk del virus del
herpes que codifica para una timidinaquinasa.
2. Introduccin del gen mutado (vector de
targeting) en clulas madre embrionarias
indiferenciadas (o clulas ES, del ingls Embryonic Stem Cells) en cultivo.
3. Aislamiento de aquellas clulas que
llevan la mutacin en el gen preseleccionado,
crecindolas en un medio que contiene unas
drogas seleccionadas (neomicina y ganciclovir
en este caso). Cuando se produce la recombinacin homloga, la secuencia modificada del
gen donado, y el gen neo-r, sustituyen a la secuencia diana presente en el cromosoma. El gen
tk no se integra en el cromosoma y es degradado por la clula. Si el vector se inserta
aleatoriamente, el genoma receptor acaba englobando todo: secuencia gnica, gen neo-r y
gen tk. Las clulas que no han recibido nada se
distinguen fcilmente por la ausencia total de
marcadores. Todas estas posibilidades se pueden
distinguir cultivando las clulas ES en medios
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Fig. 20.5. Sistema de dos componentes para la expresin del gen que codifica para el factor
de coagulacin VIII humano.
promotores del fago T7. Por tanto, no habr expresin alguna de genes bacterianos en esa etapa. Otro aspecto interesante de este sistema es
que la expresin de la ARN polimerasa est bajo
el control del promotor lac bacteriano, que est
regulado por el represor lac, el cual a su vez se
puede inactivar por un anlogo de la lactosa
(que acta como inductor), el IPTG. En
presencia de IPTG se producen grandes cantidades de ARN polimerasa T7, dirigiendo la
sntesis del gen inters en grandes cantidades.
Este tipo de estrategia se ha seguido, por ejemplo, en la produccin del factor VIII de coagulacin humano. En el caso de las cadenas A y B
de la insulina humana el gen que las cifra se ha
insertado junto al gen /3-galactosidasa de E. coli
y, por lo tanto, est bajo el control del promotor
bacteriano.
7. Diagnstico gentico y terapia
gnica
7.1 . DIAGNSTICO GENTICO
GENTICA MOLECULAR
dades durante el periodo de gestacin para posibilitar la opcin de abortar los fetos afectados:
amniocentesis (extraccin de clulas fetales a
partir del lquido amnitico) y muestreo de las
vellosidades corinicas (extraccin de clulas
de la placenta).
Este tipo de anlisis est limitado a aquellas
enfermedades que afectan a protenas que se
expresan en clulas en cultivo. La tecnologa del
ADN recombinante ha mejorado el diagnstico
de estas enfermedades puesto que permite un
anlisis directo del ADN. Con esta metodologa
podemos detectar alteraciones de un sitio de
restriccin por mutacin (por ejemplo la anemia
falciforme) o de secuencias alteradas que no
incluyan un sitio de restriccin mediante el uso
de oligonucletidos sintticos como sonda o
bien mediante el anlisis por PCR y
secuenciacin.
7.2. TERAPIA GNICA
285
Lecturas recomendadas
286
Gillam, S. y Smith, M. (1979b): Site-specific mu
tagenesis using synthetic oligodeoxyribonu
cleotide primers: II. In vitro selection of mutant
DNA, Gene., 88: 99-106.
Griffiths, A. J. F. et al. (2000): An introduction to
Genetic Analysis, W. H. Freeman.
Montoliu, L. (1997): Transgnesis por microin
GENTICA
Captulo
21
Genmica
Francisco Javier Santos Hernndez
1.
2.
Lecturas Recomendadas
288
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GENTICA MOLECULAR
289
2.
290
GENTICA
Los
micro-arrays
de
ADNc son
muestras
de
ADNc clonados que se
disponen de manera ordenada sobre un
portaobjetos. Con la ayuda de mquinas
robotizadas , cada ADNc que va a ser
GENTICA MOLECULAR
291
hibridadas simultneamente sobre el portaobjetos que contiene fijados los distintos ADNc (fig.
21.1). Despus de la hibridacin, se excita con
la longitud de onda correcta el fluorocromo que
define a cada uno de los dos tipos de sondas
marcadas que se estn utilizando. La fluorescencia emitida en cada una de las dos situaciones es recogida por separado. Las dos imgenes
obtenidas son posteriormente normalizadas y
superimpuestas. Aquellos genes que se expresen
diferencialmente aparecern como puntos rojos
o verdes, indicando sobreexpresin o expresin
disminuida segn los casos.
292
GENTICA
Lecturas recomendadas
Clayton, R. A. et al. (1997): Nature, 387: 459.
Fleischmann, R. D. et al. (1995): Science, 269:
496.
Griffiths, A. J. F. et al. (2000): An introduction to
Genetic Analysis, W. H. Freeman.
Lander, E. S. y Weinberg, R. A. (2000): Science,
287: 1.777.
Rubin et al. (2000): Science, 24.
Strachan, T. y Read, A. P. (1999): Human molecu
lar genetics 2, Bios Sci.
The C. Elegans Sequencing Consortium (1998):
Science, 282: 2.012.
The chipping forecast (1999): Nature Genet, 21:
supplement.
The Human Genome (2001): Nature, 409: 745964.
Captulo
22
1.
2.
3.
4.
Reversin de Auxtrofos
Enriquecimiento por Filtracin
Enriquecimiento por Penicilina (y Otros Antibioticos)
Seleccin de Resistencias a Agentes no Tolerados
por las Cepas Salvajes
Lecturas Recomendadas
296
GENTICA
VARIACIN GENTICA
297
298
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VARIACIN GENTICA
299
Tabla 22.1. Tipos de mutaciones de acuerdo con el cambio molecular producido en la protena
clulas de tejidos somticos, y mutaciones germinales, si se producen en clulas de tejido germinal. Las consecuencias genticas sern muy
diferentes segn el caso de que se trate.
Las mutaciones somticas no se transmiten a
la descendencia, salvo para aquellos organismos
con reproduccin asexual y siempre que el
sector o la clula mutante participe en ella. Las
consecuencias, si las hubiera, son nicamente
300
GENTICA
hasta que se extienda por la poblacin y un cruzamiento al azar entre dos individuos portadores
la ponga de manifiesto en descendientes homocigticos recesivos.
3. Sistemas de deteccin y seleccin
en procariotas y eucariotas
VARIACIN GENTICA
Partiendo del hecho de que muchas mutaciones son recesivas respecto a su correspondiente alelo salvaje, cualquier sistema de deteccin tiene que disearse de manera que no se
enmascaren las mutaciones que se produzcan
por la presencia del alelo dominante. Una
manera simple y ampliamente utilizada para
solventar este problema consiste en escoger organismos haploides, en los que este problema
no se plantea. Precisamente muchas experimentaciones genticas de las que conforman el
bagaje histrico de esta ciencia se han realizado
en este tipo de organismos debido, en parte, a su
haploida (entre otras muchas cualidades que se
sealarn ms adelante). Pero en muchas
ocasiones esto no es posible y se necesitan
establecer procedimientos ingeniosos para evidenciar el suceso mutacional, de modo inmediato, tras su produccin. Un ejemplo sumamente ilustrativo proviene de uno de los primeros estudios en los que se llev a cabo un sistema de deteccin, el realizado por L. Stadler en
los aos 20 para analizar la tasa de mutacin del
alelo C (color del endospermo en el grano de
maz) hacia c (ausencia de color del grano de
maz). Teniendo en cuenta que el endospermo
es triploide y se forma por la fusin de dos
ncleos haploides femeninos y un ncleo
haploide masculino (y la condicin de dominancia del alelo C sobre c), para poder
analizar la tasa de mutacin necesitaba partir de
un endospermo Ccc, de manera que un nico
cambio C - c se manifestara de modo inmediato
en el fenotipo. El planteamiento experimental
fue realizar un cruzamiento con una planta
parental femenino homocigtica recesiva y el
parental masculino homocigtico dominante
para el carcter, tal como se aprecia en el
esquema.
De esta manera, la aparicin de un grano
301
302
GENTICA
Fig. 22.2. Sistema de deteccin de reversin de auxtrofos. En el ejemplo se seleccionan re vertientes prototrficos a partir
de mutantes auxotrficos deficientes para leucina.
El mtodo pretende, como su nombre indica, recoger, a partir de una poblacin de mutantes nutricionales para un compuesto dado (a-),
los escasos individuos salvajes (a+) que se originen por reversin (a- - a+). Es una tcnica muy
utilizada en bacterias que sirve de mtodo para
establecer tasas de reversin de los genes. Ha
servido, adems, de base para los tests de mutagenicidad de un compuesto (que veremos al final del siguiente captulo). En la figura 22.2 se
muestra un ejemplo del procedimiento: se man-
VARIACIN GENTICA
mentosos y precisamente aprovecha sus caractersticas biolgicas para seleccionar mutantes nutricionales. El procedimiento (resumido en la fig. 22.3) consiste en cultivar, en
medio mnimo, una suspensin de esporas. Las
esporas prototrficas crecern originando
micelios, pero las esporas mutantes autotrficas
no podrn hacerlo, permaneciendo en la
suspensin an vivas. Transcurridas unas 12
horas se pasa el contenido por un filtro que retiene los micelios pero deja pasar las esporas
junto al medio, recogindose en otro tubo. El
medio estar enriquecido en mutantes nutricionales (todas las esporas que no lograron
formar micelios). En ese momento se puede
testar los mutantes para una serie de compuestos, realizando siembras sobre placas petri que
contengan, en el medio, un nico suplemento
nutritivo. La observacin de formacin de
micelios en cada caso correspondern a
mutantes nutricionales para cada uno de los
suplementos. Mediante este mtodo pueden
seleccionarse muchos mutantes nutritivos a
partir de un nico procedimiento experimental.
303
304
GENTICA
Fig. 22.3. Mtodo de seleccin de mutantes nutricionales en hongos filamentosos mediante enriquecimiento
por, filtracin.
VARIACIN GENTICA
305
306
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VARIACIN GENTICA
307
308
GENTICA
Lecturas recomendadas
Editorial Sntesis.
Luria, S. E. y Delbrck, M. (1943): Mutations of
bacteria from virus sensitivity to virus resistance, Genetics, 28: 491-511.
Captulo
23
Bases moleculares
de las mutaciones gnicas
Antonia Mara Fernndez Peralta
1.
2.
Lecturas Recomendadas
310
GENTICA
Tabla 23.1. Tipos de mutaciones segn el cambio molecular que se produce en el ADN
VARIACIN GENTICA
1. Mecanismos de origen
de las mutaciones
espontneas
e
inducidas
MECANISMOS DE ORIGEN
DE LAS MUTACIONES ESPONTNEAS
311
que son ismeros estructurales (formas qumicas alternativas) que se diferencian por el desplazamiento de un protn en la molcula. En el
ADN las formas tautomricas predominantes de
las bases son las formas ceto (de la Guanina y la
Timina) y las amino (de la Citosina y la
Adenina). Las formas tautomricas enol (de la
Guanina y la Timina) y las mino (de la Citosina
y la Adenina) no se encuentran normalmente
(formas raras). Estas formas raras muestran
relaciones de emparejamiento diferentes (figs.
23.lb y 23.2b) a las existentes entre los
tautmeros normales del ADN (figs. 23.la y
23.2a). En ocasiones alguna base puede adquirir
una forma tautomrica rara y, durante la replicacin, se emparejar incorrectamente lo
que originar una transicin (fig. 23.3).
Los deslizamientos de las hlices en regiones con repeticin de nucletidos durante la replicacin (fig. 23.4) es otro tipo de fallo replicativo que origina inserciones y deleciones de
bases (segn la cadena que sufra el deslizamiento) lo que, en ltimo extremo, dar lugar a
cambios de la pauta de lectura de un gen. El
modelo fue propuesto por G. Streisinger en los
aos sesenta y, unos aos ms tarde, mediante
secuenciacin de puntos calientes de mutacin
en ciertos genes (vase fig. 13.5, cap. 13) se demostr que esas regiones eran secuencias repetidas del tipo de las propuestas por Streisinger.
La hipermutabilidad de esas regiones demostraba que los errores por deslizamiento de las
cadenas ocurren frecuentemente durante la replicacin y, si no se reparan, dan lugar a mutacin. En humanos estos deslizamientos de hlices, denominados bucles de insercin/delecin
(IDL) deben ser frecuentes y existen mecanismos especiales de reparacin de los mismos,
que se vern en el siguiente captulo. Se ha demostrado en diversas enfermedades hereditarias
como la distrofia miotnica, la enfermedad de
Huntington, el sndrome del X frgil, la atrofia
muscular espinobulbar, algunos tipos de ataxia,
etc., que la patologa se origina por el
incremento importante en el nmero de
tripletas (expansin de tripletas) en los
genes
responsables
de las mismas que
muestran en su secuencia regiones con
repeticiones de nucletidos (trinucletidos).
312
GENTICA
VARIACIN GENTICA
313
314
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Fig. 23.3. Transicin AT - GC producida, tras dos rondas replicativas, como consecuencia del cambio
tautomrico de la Adenina (A - A*). Se muestra, en recuadros, el par nucleotdico original y el resultado final.
VARIACIN GENTICA
315
Fig. 23.4. Modelo de Streisinger de deslizamiento de hlices durante la replicacin, para explicar
la produccin de inserciones y deleciones de bases (mutaciones de alteracin de la pauta de lectura) en el ADN.
na), por destruccin trmica, formndose un sitio apurnico (AP). La transcripcin puede verse
alterada directamente y si la clula con este tipo
de lesiones se replica la consecuencia inmediata
es la mutacin, pudiendo originarse tanto
transiciones como transversiones, en ambos
sentidos (bidireccionales).
El proceso de desaminacin de la citosina (o
la adenina ms infrecuentemente) (fig. 23.5) por
ataque hidroltico es otra lesin espontnea que
puede sufrir el ADN. En el primer caso se produce uracilo, que aparea con la adenina y, tras la
replicacin, se produce una transicin (CG TA). En el segundo caso se produce hipoxantina
(Hx) que aparea con la citosina producindose
una transicin (par AT - par GC). Dada la alta
frecuencia con que se producen estas lesiones,
se han seleccionado sistemas muy eficientes de
reparacin de las mismas, que reconocen la base
errnea (U o Hx) y la sustituyen por la correcta.
Sin embargo, la desaminacin de 5-metilcitosina (5-mC) origina timina y la clula, por razones obvias, no dispone de ningn mecanismo de
reparacin que reconozca esta base como errnea, por lo que las regiones donde se acumulan
residuos 5-mC son puntos calientes de mutacin
(y el dinucletido CpG, sustrato para la formacin de 5-mCpG, est subrepresentado en el
ADN de las clulas eucariotas).
La oxidacin de las bases, fundamentalmente la guanina, causada por las formas reactivas del oxgeno presentes en el medio celular,
es otra lesin espontnea que puede originar
tanto transiciones como transversiones, debido a
los peculiares apareamientos que se pueden
producir (vase captulo de reparacin).
1.2.
Mecanismos de origen
de las mutaciones inducidas
316
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VARIACIN GENTICA
317
318
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319
2.
320
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VARIACIN GENTICA
Fig. 23.7. Esquema resumido del test del Ames. Las siglas MS y MM se refieren a medio suplementado
con histidina y medio mnimo, respectivamente.
321
322
GENTICA
Lecturas recomendadas
Ames, B. N. et al. (1975): Method for detecting
carcinogens and mutagens with the Salmonella/mammalian microsome mutagenicity test,
Mut. Res., 31: 347-364.
Bogen, K. y Keating, G. A. (2001): U.S. dietary
exposures to heterocyclic amines 1, Journal of
Exposure Analysis and Environmental Epidemiology, 11: 155-168
Coulondre, C. et al. (178): Molecular basis of base
substitution hotspots in E. coli, Nature, 274:
775-780.
Crow, J. F. (2000): The origins, patterns and implications of human spontaneous mutation, Nature
Reviews Genetics, 1: 40-47.
Klug, W. S. y Cummings, M. R. (1999): Conceptos
de Gentica (5.a ed.), Prentice Hall.
Kooiman, G. G. et al. (2000): The influence of dietary and environmental factors on prostate cancer
risk, Prostate Cancer and Prostatic Diseases, 3:
256-258.
Liu, D. et al. (2000): Genetic screens in mammalian
cells by enhanced retroviral mutagens,
Oncogene, 19: 5.964-5.972.
Lacadena, J. R. (1999): Gentica General, Editorial
Sntesis.
Patterson, M.(2000): CANCER: The trouble with
smoking, Nature Reviews Genetics, 1, 168.
Su, H. et al. (2000): Nested chromosomal deletions
induced with retroviral vectors in mice, Nature
Genetics, 24, 92-95.
Weiner, A. M. (2000): Do all SINEs lead to
LINEs? , Nature Genetics, 24: 332-333.
Captulo
24
1.
Mecanismos de Reparacin
1.1.
1.2.
1.3.
1.4.
Sistemas Preventivos
Sistemas de Reparacin Directa
Sistemas de Reparacin por Escisin
Sistemas de Reparacin Posreplicativa: Reparacin
de Emparejamientos Errneos (HMR)
1.5. Reparacin Recombinatoria (HR)
1.6. Reparacin inducida Ante un Dao Generalizado:
Respuestas SOS
1.7. Reparacin Inducida en Clulas Eucariotas
2.
Lecturas Recomendadas
324
GENTICA
VARIACIN GENTICA
325
Superxido dismutasa
Catalasa
Radicales superxido____________________> Perxido de hidrgeno__________ > HzO
te conservados a lo largo de la evolucin, si bien
en eucariotas intervienen un mayor nmero de
protenas debido a la mayor complejidad de su
genoma.
1.1. SISTEMAS PREVENTIVOS
326
GENTICA
Fig. 24.3. Reparacin de un dmero de timina por el sistema de reparacin por escisin.
VARIACIN GENTICA
327
el enlace fosfodister del sitio AP, lo que dispara el sistema de reparacin por escisin.
1.3.4. Reparacin GO
Es un sistema muy especfico para la reparacin del dao causado por la oxidacin de la
guanina en el ADN o por la incorporacin de 8oxodG (GO) (fig. 24.6). En este sistema intervienen tres glicosilasas: MutM, MutY y MutT.
MutM elimina la lesin 8-oxodG producida por
la oxidacin espontnea, dejando un sitio AP,
que es reparado por el sistema de AP
endonucleasas. No obstante, en el caso de que la
ADN polimerasa que interviene en la replicacin est prxima a la lesin, sta aade un
residuo A, lo que produce un apareamiento de
bases incorrecto. MutY elimina la A introducida
errneamente y se puede realizar normalmente
la reparacin del sitio AP. Si la que acta es la
polimerasa de reparacin sta introduce una C,
por lo que nuevamente comienza el proceso de
reparacin con MutM.
Finalmente, existe tambin un mecanismo
de prevencin de las lesiones producidas
328
GENTICA
1.4.
SISTEMAS DE REPARACIN
POSREPLICATIVA: REPARACIN
DE EMPAREJAMIENTOS ERRNEOS (MMR)
mente la actividad exonucleasa que posee la polimerasa debera reparar el error, y as ocurre en
la mayora de los casos pero, ocasionalmente, el
error escapa de la correccin por lo que tiene
que ser eliminado antes de que ocurra una nueva
replicacin, con el fin de eliminar la posibilidad
de introduccin de mutaciones.
Estos errores introducidos durante la replicacin son reparados por los sistemas de reparacin de apareamientos errneos, que en
eucariontes han extendido sus capacidades
siendo capaces de corregir alteraciones de mayor tamao como son los bucles originados por
inserciones y deleciones (IDL).
En E. coli la reparacin de bases mal apareadas es un mecanismo de reparacin especializado en la correccin de los errores que se
producen cuando se replica el ADN. El siste-
VARIACIN GENTICA
329
Fig. 24.6. Sistema de reparacin GO. Formacin de 8-oxoGMP a partir de su precursor 8-oxoGTP.
330
GENTICA
que afectan a las secuencias repetidas en eucariotas. En humanos se han descubierto genes de
este sistema, homlogos a los de levadura (por
lo que se le nombra anteponiendo una h a los
de levaduras) (tabla 24.1). Se ha podido
comprobar que la protena hMSH2 no slo se
une a nucletidos puntuales mal apareados, tal
como lo hacan sus homlogos en bacterias y
levaduras, sino que reconoce eficientemente los
bucles de insercin/delecin (IDL: insertion/deletion loops) de oligonucletidos mal
apareados, confirmndose su papel en el
VARIACIN GENTICA
El papel de la protena RecA durante la recombinacin se analizar en el captulo dedicado al anlisis de este mecanismo a nivel molecular. Bsicamente, RecA reconoce el ADN
de cadena sencilla y promueve la invasin de
esta cadena de ADN, hacia una doble hlice que
est en su proximidad. Si encuentra homologa
desplaza a la cadena de igual polaridad a la que
gua. Las cadenas invasoras buscan la
posibilidad de apareamiento y cuando
encuentran la zona con bases complementarias
se fijan mediante el establecimiento de puentes
de hidrgeno entre bases complementarias.
Adems, RecA tiene un papel fundamental
en la reparacin, pues al activarse en presencia
de ADN de cadena sencilla inhibe el represor de
una serie de genes implicados en la reparacin
(tal como veremos a continuacin en el
mecanismo de reparacin SOS). Por otra parte,
RecA tiene la funcin de rellenar los huecos, en
una cadena de ADN recin sintetizada, originados por paradas replicativas. Para ello invade
dichos huecos con trozos de cadena de ADN de
idntica polaridad que provienen de la hlice
complementaria al molde daado. En esta
situacin la polimerasa I y la ligasa se encargarn de reconstruir la doble hlice.
1.6.
331
332
GENTICA
2.
VARIACIN GENTICA
333
Lecturas recomendadas
Cleaver, J. E. (1990): Do we do know the cause of
Xeroderma pigmentosum? , Carcinogenesis, 11:
875-856.
Friedberg, E. C. (2001): How nucleotide excision
repair protects against cancer, Nature Review, 1:
22-33.
Griffiths, A. J. F. et al. (2000): An introduction to
Genetic Analysis, W. H. Freeman, Nueva York.
Ischenko, A. A. et al. (2002): Alternative nucleoti
de incision repair pathway for oxidative DNA
damage, Nature, 415: 183-187.
Jiricny, J. y Nystrom-Lahti, M. (2000): Mismatch
Captulo
25
Mutaciones cromosmicas
estructurales
Juan Jos Gonzlez Aguilera
1.
2.
Deleciones
3.
Duplicaciones
4.
Inversiones
5.
Translocaciones
Lecturas Recomendadas
336
GENTICA
VARIACIN GENTICA
Fig. 25.2a. Origen de los cambios estructurales. A: dos roturas en el mismo cromosoma y reunin errnea.
Fig. 25.2b. Origen de los cambios estructurales. B: dos roturas en cromosomas homlogos.
337
338
GENTICA
Fig. 25.2c. Origen de los cambios estructurales. C: entrecruzamiento desigual entre cromosomas homlogos.
o transposones.
Puede ser mediado por segmentos de ADN repetido
nin, cada cromosoma originado por la reordenacin debe contener estructuras telomricas, y
al menos, un centrmero. Las reordenaciones
que produzcan la abolicin de las funciones de
estas estructuras sern letales para la clula en
que se produzcan; por ello, aquellas reordenaciones que en la observacin citolgica parecen
afectar el final del cromosoma (deleciones
terminales), deben realmente incluir dos roturas,
una de las cuales debe estar prxima al telmero
sin incluirlo.
2. Por entrecruzamiento desigual entre
regiones cromosmicas, bien porque contengan
ADN repetido o elementos transponibles (fig.
25.2c).
2. Deleciones
Fig. 25.3. Reconocimiento de las deleciones a nivel citolgico. a) Mitosis: acortamiento de cromosomas
homlogos, desaparicin de bandas. b) Bucle en el apareamiento meitico en un heterocigoto.
VARIACIN GENTICA
339
Fig. 25.4. Localizacin de genes en Drosophila analizando la pseudodominancia en heterocigotos para deleciones. Regin
white-notch del cromosoma X
de Drosophila (Slizinska, 1938). El sombreado negro indica el tamao de la delecin.
VARIACIN GENTICA
341
Fig. 25.5. Recomocimiento de las duplicaciones a nivel citolgico. a) Mitosis: alargamiento de cromosomas
homlogos, aparicin de bandas repetidas. b) Bucle en el apareamiento meitico de un heterocigoto. e) Bucle
de apareamiento en los cromosomas politnicos de Drosophila.
cromosoma y una en su homlogo; en esta situacin el nmero de facetas del ojo se reduce a
358. La presencia de regiones repetidas en los
cromosomas homlogos conduce a la existencia
de entrecruzamientos asimtricos. Una hembra
de Drosophila homocigota Bar, tiene cuatro
dosis de la regin 16A (2 en cada uno de los
cromosomas homlogos) y muestra una
reduccin del nmero de facetas a 68. Una
hembra Ultrabar, tiene igualmente cuatro dosis
de dicha regin (tres en un cromosoma X y slo
una en el homlogo) y, sin embargo, el efecto
de las cuatro dosis no es el mismo pues en esta
situacin (3/1) la reduccin del nmero de
facetas es ms severa (45). El mutante Bar
pone de manifiesto que las dosis gnicas y, por
tanto, sus productos estn estrictamente
regulados y una disminucin o aumento de
las copias de un gen puede conducir a efectos
indeseables en el fenotipo al afectar las relaciones con otros genes. Por otra parte, el compor-
342
GENTICA
VARIACIN GENTICA
343
344
GENTICA
4. Inversiones
VARIACIN GENTICA
345
Fig. 25.9. Reconocimiento de las inversiones a nivel citolgico. a) Inversin pericntrica: cambio en la morfologa
cromosmica. en la ordenacin de bandas cromosmicas durante la mitosis. b) Inversin paracntrica: cambio en
la ordenacin de bandas cromosmicas durante la mitosis. c) Observacin durante la anafase I meitica de un puen
te y un fragmento acntrico resultado de un entrecruzamiento en el bucle de una inversin paracntrica.
es
5. Translocaciones
346
GENTICA
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347
348
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Fig. 25.13. Translocacin t(9; 22) (q34; q11): Leucernia mieloide crnica. a) Cariotipo de un individuo afecto.
b) Origen de la protena de fusin como consecuencia de la translocacin.
VARIACIN GENTICA
349
Lecturas recomendadas
Lacadena, J. R. (1988): Gentica, A.G.E.S.A.,
Madrid.
Ohno, S. (1970): Evolution by gene duplication,
Springer, Nueva York.
Patterson, D. (1987): The causes of Down Syndrome, Sci. Amer., Aug.: 52-60.
Snchez-Monge, E. y Jouve, N. (1989): Gentica,
Ediciones Omega, Barcelona.
Stebbins, G. L. (1971): Chromosomal evolution in
higher plants, Reading, Mass., Addison-Wesley.
Sturtevant, A. (1925): The effects of unequal crossing over at the Bar locus in Drosophila ,
Captulo
26
Mutaciones cromosmicas
numricas
Juan Jos Gonzlez Aguilera
1.
2.
3.
Lecturas Recomendadas
352
GENTICA
zan como 2n. El nmero de juegos cromosmicos puede variar de una forma espontnea en la
naturaleza y ello ha ocurrido repetidamente a lo
largo del proceso evolutivo, con incrementos en
el contenido de ADN de los genomas, aumento
en el nmero de genes y la posibilidad de
alcanzar una mayor complejidad estructural y
funcional.
1.1. MONOPLOIDIA
VARIACIN GENTICA
353
chos). Sin embargo, de manera anormal en algunas especies diploides se producen espordicamente individuos haploides, que se denominan monoploides por presentar un solo juego
cromosmico de la especie. Estos individuos, si
consiguen desarrollarse, son de pequeo tamao
y poco vigorosos. Adems, cuando sufren la
meiosis, durante la metafase los cromosomas
permanecen como univalentes al no existir
cromosomas homlogos que se apareen
(bivalentes). Esto conduce a una segregacin
anafsica anmala, con prdidas de cromosomas
que no se incluyen en los polos y grandes
desequilibrios numricos, de manera que los
gametos tienen un nmero inferior al complemento n de la especie, lo que provoca que estos
individuos sean estriles. En general, se ha observado que las especies vegetales capaces de
generar monoploides en la naturaleza de forma
espontnea, tienen un origen poliploide.
La monoploida tiene un gran inters para
la gentica aplicada, pues se puede inducir artificialmente la aparicin de individuos monoploides a partir de plantas diploides (fig. 26.3)
y, una vez obtenidos, puede duplicarse fcilmente su nmero cromosmico tratado con
colchicina. Los individuos as generados sern
homocigticos en todos sus loci, evitando un
largo programa de cruzamientos para obtener
una lnea pura. Adems, estos individuos estarn libres de genes letales pues si existieran se
expresaran y no conseguiramos que se desarrollaran y, partir de plantas libres de genes letales, es de gran importancia al abordar un programa de mejora.
1.2. POLIPLOIDIA
354
GENTICA
cia en la naturaleza de forma espontnea, estando ampliamente extendidos en el reino vegetal (ms del 50 % de las angiospermas tiene
un origen poliploide) aunque se da raramente en
animales, como lo demuestra el hecho de que en
la mayora de animales los nmeros gamticos
oscilan entre 6 y 20, mientras que en las plantas
este rango se ampla considerablemente (1-220).
Es decir, mientras que la poliploida se muestra
como uno de los mecanismos ms
trascendentales en la evolucin de las especies
vegetales, su papel ha sido escaso en animales.
La explicacin a este hecho puede atribuirse, en
primer lugar, a que en los animales para
producirse una raza poliploide se requiere que
ocurra un fenmeno de poliploidizacin en un
macho y en una hembra y que stos se apareen,
con lo que los dos sucesos mutacionales deben
coincidir espacial (en la misma poblacin) y
temporalmente (en la misma generacin). En
segundo lugar, en los animales la
poliploidizacin
produce
un
mayor
desequilibrio gnico que en las plantas, incluyendo el desequilibrio entre cromosomas sexuales y autosomas. De hecho, la existencia de
animales poliploides se reduce, casi exclusivamente, a animales hermafroditas o a formas con
hembras partenogenticas, con la excepcin de
algunos peces (salmnidos).
VARIACIN GENTICA
355
356
GENTICA
Fig. 26.5. Autopoliploides: cromosomas mitticos en dos variedades de Narcissus bulbocodium subsp.,
bulbocodium. a) Var. bulbocodium (2n = 14). b) Var graelsii (2n = 28). c y d) Configuraciones tetravalentes
en la meiosis del autotetraploide Reseda alba (n = 20).
VARIACIN GENTICA
357
358
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359
360
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Fig. 26.8. Efectos morfolgicos de los aneuploides. Trismicos en Datura stramonium (Blakeslee, 1913).
- Sndrome de Down: trisoma del cromosoma 21, por lo que los individuos portadores muestran 2n = 47 cromosomas (fig. 26.9).
En ocasiones este sndrome se produce por la
presencia de tres dosis del cromosoma 21, pero
una de ellas es el brazo largo del cromosoma
unido a otro cromosoma del complemento, debido a la existencia de una translocacin. En
estos casos los individuos muestran 2n = 46
cromosomas. Este sndrome presenta una incidencia de 1 caso de cada 700 nacidos vivos
(1/700), aumentando con la edad materna (fig.
26.9) y los efectos deletreos que produce en
sus portadores son bien conocidos.
- Sndrome de Patau: trisoma del cromosoma 13, con una incidencia de 1/5.000-6.000
individuos nacidos vivos, y que produce ano-
malas fsicas y mentales, con cabeza malformada y la muerte en los primeros das de vida.
- Sndrome de Edward: trisoma del cromosoma 18 con una incidencia de 1/10.000 y
que produce un gran nmero de anomalas fsicas que conducen a la muerte a su portador en
las primeras semanas de vida.
El Sndrome de Klinefelter (XXY) es una
aneuploidea de los cromosomas sexuales, compatible con la vida, pero que da lugar a varones
con retraso mental y estriles.
Actualmente estas anomalas pueden ser
diagnosticadas prenatalmente en cultivos de clulas amniticas, vellosidades coriales o en sangre de cordn umbilical mediante tcnicas convencionales de citogentica (bandas G), para lo
VARIACIN GENTICA
361
Fig. 26.9. Sndrome de Down: a) Origen de una trisoma del cromosoma 21. b) Aumento de la incidencia
del sndrome de Down con la edad materna.
aneuploides tienen utilidades tericas y prcticas. Entre las primeras est la localizacin de
genes en cromosomas particulares. Desde el
punto de vista prctico se han utilizado en los
programas de mejoras de plantas, pues permiten
sustituir cromosomas entre variedades de una
especie e incluso entre especies mediante cruzamientos dirigidos (ingeniera cromosmica).
Lecturas recomendadas
La aneuploida se puede inducir artificialmente en plantas, mediante distintos procedimientos de formacin de gametos desequilibrados (radiacin, agentes qumicos, ultrasonidos, etc.). Los nulismicos obtenidos suelen ser
individuos poco vigorosos, mientras que los
monosmicos y trismicos presenta un mayor
vigor y cierta fertilidad. En cualquier caso, estos
362
GENTICA
Fig. 26.10. Deteccin de las anomalas numricas ms frecuentes en humanos mediante citogentica molecular
de interfase.
Captulo
27
Mecanismos de recombinacin
Juan Jos Gonzlez Aguilera
1.
2.
3.
4.
Lecturas Recomendadas
364
GENTICA
VARIACIN GENTICA
Cuando se observan los quiasmas y el entrecruzamiento a nivel citolgico los cromosomas homlogos realizan un intercambio fsico
de segmentos (vase experimentos de Creighton-McClintock en el cap. 8), lo que supone la
existencia de procesos de rotura y reunin de las
molculas de ADN. M. Meselson y J. Weigle,
en 1961, demostraron la existencia de este
proceso de rotura y reunin durante la recombinacin en el fago lambda (A), en un experimento similar al realizado para esclarecer el
modo de replicacin del ADN (vase cap. 11).
Estos autores marcaron dos cepas del fago )L
hacindolas crecer en medios con istopos ligeros y pesados de carbono y nitrgeno (fig.
27.1). Con ellas infectaron E. coli, bajo condiciones que no permitan la replicacin del fago
(para evitar interferencias de la replicacin en el
experimento). Al realizar esta coinfeccin se
podr dar recombinacin entre los dos fagos
(ligero y pesado). Pasado el tiempo necesario
para que las partculas virales se empaqueten,
aislaron los fagos, los lisaron y analizaron sus
ADNs en un gradiente de densidad. Los fagos
que no haban recombinado se situaban en las
bandas correspondientes a los istopos con los
que iban marcados, sin embargo los fagos recombinantes se situaban en bandas intermedias
situadas entre las dos anteriores, segn el tamao del segmento intercambiado, lo que demostraba que la recombinacin a nivel molecular
implicaba la rotura y reunin de las molculas
de ADN.
3.
Mecanismos moleculares
de la recombinacin general homloga
365
VARIACIN GENTICA
367
rio de Holliday: dos dobles hlices entrecruzadas por una de sus cadenas (fig. 27.3[4]).
- Migracin: El intermediario de Holliday
crea un cruce entre las cadena que puede
moverse a lo largo del heterodplex (doble hlice hbrida). Este movimiento se origina desde
el punto en que se produjo la invasin y, en su
movimiento, incrementa la regin de ADN heterodplex (fig. 27.3[5]). Las protenas RuvA y
RuvB son responsables de la migracin. Se denominan protenas Ruv, porque los mutantes
Ruv son ms sensibles a la luz ultravioleta debido a que no reparan por recombinacin los
daos causados por dicha radiacin. RuvA es un
tetrmero que reconoce especficamente el
punto de entrecruzamiento y, entonces, dos
molculas de RuvB la flanquean, constituyendo
un complejo hexamrico. El complejo se
desplaza por la doble hlice, abriendo la hlice
368
GENTICA
Fig. 27.3b.
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373
Captulo
28
1.
Transposones procariticos
1.1. Transposones Simples: Secuencias de Insercin en Bacterias
1.2. Transposones Compuestos
2.
3.
Transposones Eucariotas
3.1. Elementos Controladores en el Maz
3.2. Elementos P de Drosophila
4.
Retrovirus y Retrotransposones
5.
Lecturas Recomendadas
376
GENTICA
1. Transposones procariticos
1.1.
VARIACIN GENTICA
377
378
GENTICA
de una zona apareada (como una seal de trfico) (fig. 28.2). Las regiones que renaturalizaban
rpidamente eran repeticiones inversas IRs, luego en la secuencia interna del plsmido existan
repeticiones inversas que realmente eran secuencias flanqueantes de un elemento de insercin (ISs), que quedaba formando el bucle. Posteriores investigaciones pusieron de manifiesto
que los factores R eran complejos, conteniendo
una regin en la que se codifican las funciones
de transferencia de la resistencia (RTF) y una
regin que corresponde a un transposn (Tn).
Se han aislado numerosos transposones
compuestos que se denominan con el prefijo Tn,
seguido de un nmero (Tn1, Tn2 ). Los Tn se
caracterizan por sus marcadores internos (genes
de resistencia) y sus elementos flanqueantes que
pueden ser IS en orientaciones similares, opuestas e incluso distintos IS en cada lado (por ejemplo: Tn9 tiene IS 1 a ambos lados en repeticin
VARIACIN GENTICA
379
2.
Mecanismos de transposicin en
procariotas
380
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3. Transposones eucariotas
3.1. ELEMENTOS CONTROLADORES EN EL MAZ
382
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VARIACIN GENTICA
vibles, que en este caso se denominan LTR (repeticiones terminales largas) (fig. 28.8). La caracterstica ms sobresaliente de los retrovirus,
fue descubierta por H. Temin y D. Baltimore en
los aos setenta, y es su capacidad para
transcribir su material gentico, ARN, a ADN,
para lo que utiliza una transcriptasa inversa o
retrotranscriptasa (RT) (ADN polimerasa dependiente de ARN).
Se conocen un buen nmero de transposones que se comportan como retrovirus, utilizando la transcriptasa inversa, por lo que se denominan retroposones o retrotransposones. Tal
es el caso de los elementos Copia de Drosophila
que aparecen en mltiples copias en su genoma
y de los que se conocen al menos siete familias
(con secuencias parecidas) que en total suponen
alrededor del 10 % del genoma de Drosophila.
Estos elementos tienen un tamao que oscila
entre 5 y 8 kb y su estructura es similar a la de
los retrovirus. Los elementos Copia se
caracterizan por producir mutaciones por insercin.
383
Fig. 28.8. Ciclo de vida (a) y estructura bsica de un retrovirus (b) (gag: protena de la cubierta;
pol: transcriptasa inversa; int: protena de la membrana).
384
GENTICA
Fig. 28.9. a) Produccin de reordenaciones cromosmicas por los elementos genticos movibles.
b) Relocalizacin de genes: transposones compuestos.
VARIACIN GENTICA
Lecturas recomendadas
Berg, D. y Howe, M. (1989): Mobile DNA, Ameri
can Society of Microbiology, Washington.
Brow, A. J. L. y Moss, J. E. (1987): Transposition of
the I element and copia in a natural population of
Drosophila melanogaster, Genet. Res., 49: 121128.
Cohen, S. N. y Shapiro, J. A. (1980): Transposable
genetic elements, Sci. Am., 242: 40-49.
El proyecto genoma humano: varios artculos publicados en dos nmeros especiales de las revistas: Nature (409: 745-964) y Science (291: 1.1451.434) el 15 y 16 de febrero de 2001.
Engels, W. R. (1983): The P family of transposable
elements in Drosophila , Ann. Rev. Genet.,
17:315-344.
Federoff, N. V. (1984): Transposable genetics elements in Maize, Sci. Am., 250: 85-98.
385
Captulo
29
1.
2.
Lecturas Recomendadas
390
GENTICA
1.1.
391
de, entre otros factores, de los productos codificados por dos genes supresores de tumores: Rb
y p53. En este control participan tambin una
serie de factores proteicos de pequeo tamao,
denominados genricamente CKIs (Inhibidores
de las quinasas dependientes de ciclinas). Estas
protenas estn codificadas por genes que se
pueden clasificar en dos familias. La primera de
ellas est definida por los genes p21, p27 y p57
(familia Cip/Kip), cuyos productos se asocian
con diferentes tipos de complejos CDK/cyc. La
segunda incluye a los genes p16INK4a p15INK4b
p18INK4c y p19INK4d (familia INK4), cuyos
productos se unen de manera especfica slo a
ciertos complejos tales como cyc-CDK4/6 en el
caso de p15, p16 y p18 o cycA-CDKs para p19.
Un momento crucial del ciclo celular tiene
lugar al final de la fase G,, en el punto de control R, cuando la clula decide si debe o no continuar con el proceso de divisin celular. El
punto de restriccin es un parmetro biolgico
392
GENTICA
393
2.1. Oncogenes
394
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Lecturas recomendadas
399
Captulo
30
1.
2.
3.
4.
Lecturas Recomendadas
402
GENTICA
Aspectos fundamentales
de la gentica del desarrollo
403
404
GENTICA
2.2.
ria del sexo, tanto en reptiles como en mamferos. Sin embargo, este tipo de secuencias
apenas aparecan en el cromosoma Y humano, y
la propuesta fue pronto descartada.
Algo ms duradera fue la hiptesis que
consideraba el papel primario de un antgeno
menor de histocompatibilidad exclusivo del
sexo masculino: el antgeno H-Y. Esta hiptesis
fue cuestionada al comprobarse la formacin de
testculos en ratones carentes de antgeno H-Y.
Hoy se sabe que el gen estructural del antgeno
H-Y est localizado en el cromosoma 6 humano
y el cromosoma Y contiene un factor regulador
(activador) de dicho gen.
A partir de aqu, los intentos para aislar el
autntico TDF se han basado fundamentalmente
en el anlisis gentico molecular tanto en el
ratn como en la especie humana de individuos
del sexo masculino con determinismo XX (sex
reversals), buscando la secuencia mnima de
ADN capaz de inducir la masculinizacin de las
tericamente hembras XX. La construccin de
un mapa gentico a partir de los fragmentos del
cromosoma Y humano presentes en varones
XX, limit la regin candidata a contener el
TDF a la parte distal del cromosoma Y (zona
sexual),
muy
cerca
de
la
regin
pseudoautosmica (es decir, la zona terminal de
homologa con el cromosoma X).
El anlisis detallado de esta regin mediante
la tcnica del paseo cromosmico llev a
identificar un locus, denominado ZFY, como
candidato a ser el gen TDF, ya que posea una
isla CpG, una caracterstica propia de secuencias gnicas. Sin embargo, este gen, que codifica para un factor de transcripcin con un motivo
de unin al ADN del tipo dedos de zinc, se
descart cuando se comprob que existan
secuencias homlogas del mismo en el cromosoma X. La demostracin de secuencias similares en autosomas de marsupiales, la expresin
nica del gen Zfy del ratn en clulas germinales y la existencia de varones XX portadores de secuencias del Y que no contienen el gen
ZFY, fueron pruebas adicionales que contribuyeron a descartarlo.
En 1990, el grupo de Goodfellow llev a
405
406
GENTICA
Fig. 30.2. Separacin de las lneas germinal y somticas durante el desarrollo embrionario temprano
de C. elegans.
4.
Una de las principales cuestiones que pretende dilucidar la Biologa del Desarrollo es el
diseo gentico del cuerpo de los organismos
multicelulares. Muchos de los avances que han
permitido descifrar una gran parte de los principios genticos que gobiernan la generacin de
la diversidad morfolgica corporal han venido
de estudios realizados con Drosophila
melanogaster, un organismo metamerizado
donde cada uno de los segmentos se desarrollan
de manera independiente. Una serie programada
de instrucciones genticas que estn operando
durante el proceso de desarrollo son las
responsables de esta organizacin. El plan
corporal bsico de Drosophila se establece ya
en el embrin temprano, en el que ya se en-
SINOPSIS DE LA OOGNESIS
Y DEL DESARROLLO EMBRIONARIO DE
DROSOPHILA
407
408
GENTICA
periferia despus del ciclo 10 de divisin sufriendo cuatro divisiones adicionales. En el ciclo 13 tiene lugar la formacin del blastodermo
celular compuesto por aproximadamente 6.000
ncleos individualizados. Es en el ciclo de divisin 14 cuando se produce un aumento significativo del nivel de transcripcin global y comienza formalmente la gastrulacin. A partir de
este momento irn ocurriendo una serie de
movimientos morfogenticos que culminarn
con la eclosin de larva 24 horas despus de la
fecundacin.
El plan corporal bsico de Drosophila es el
mismo en el embrin, larva y adulto, estando
formado por seis segmentos ceflicos, tres torcicos y diez abdominales, con dos estructuras
no segmentadas, una en la parte ms anterior
(acron) y otra en el extremo ms posterior del
cuerpo (telson).
4.2.
clasificar, a su vez, en dos categoras principales: los genes de segmentacin que subdividen
al embrin en unidades segmentales sucesivamente ms pequeas, y los genes hometicos
que determinan una identidad concreta para
cada uno de los segmentos formados.
En Drosophila, el proceso que conduce al
establecimiento del patrn segmental (nmero
correcto de segmentos) y a la asignacin de la
identidad de cada uno de los distintos segmentos comienza antes de que se produzca la fecundacin del oocito. La madre va a aportar
unos determinantes localizados (ARNm) que
establecen la polaridad (asimetra qumica) a lo
largo del eje A/P del oocito. Esta polaridad es
necesaria para definir regiones geogrficas en el
embrin (informacin posicional). La informacin posicional a lo largo del embrin temprano de Drosophila se establece mediante la
creacin de gradientes de concentracin de
protenas difusibles (morfgenos) sintetizadas a
partir de los determinantes localizados (fig.
30.3a). Este tipo de informacin posicional se
establece exclusivamente durante la embriognesis temprana, porque en esa etapa el embrin
es un sincitio multinucleado unicelular. A partir
de la etapa de blastodermo celular cobra especial relevancia otro tipo de informacin posicional basada en la generacin de gradientes
de concentracin de protenas difusibles extracelulares (fig. 30.3b).
Genes maternos. Las etapas del desarrollo
embrionario de Drosophila comprendidas entre
la fecundacin del oocito y el final de la
divisin sincitial nmero 13 se caracterizan por
la existencia de unas tasas de transcripcin muy
bajas, sugiriendo que la formacin del plan
corporal bsico requiere inicialmente productos
gnicos depositados en el citoplasma del oocito
durante la oognesis. Estimulados por estas
observaciones Nlssein-Volhard y Wieschaus
realizaron bsquedas de mutaciones letales
recesivas de efecto materno saturando el
genoma de mutaciones que alteraban el patrn
corporal de la larva.
Gracias a los trabajos de Nlssein-Volhard
(Premio Nobel de Fisiologa y Medicina en
1995) y sus colaboradores se han podido identificar aproximadamente 30 genes letales de
409
Fig. 30.3. Tipos de informacin posicional establecidos durante el desarrollo embrionario de Drosophila.
efecto materno diferentes que afectan a los fenotipos embrionarios A/P o D/V. stos se clasifican en cuatro grandes categoras atendiendo
a los fenotipos larvarios mutantes producidos
por madres homocigticas para la mutacin: 1)
terminales (los fenotipos mutantes larvarios se
caracterizan por la carencia de todas las
estructuras que derivan de los polos del embrin), 2) anteriores (carencia de todas las estructuras torcicas y de la cabeza), 3) posteriores (carencia de todos los segmentos abdominales) y 4) dorsoventrales (un subtipo se caracteriza por la prdida de las estructuras dorsales y
ventrales, y el otro por la prdida de las estructuras ventrales y laterales).
De los genes maternos que se necesitan para
formar la porcin anterior del embrin el ms
importante es bicoid (bcd). El producto del gen
bcd es un factor de transcripcin, cuyo ARNm
se localiza en una pequea regin del polo
anterior del citoplasma del oocito (fig. 30.4).
La traduccin de los transcritos bcd tiene
lugar despus de la fecundacin difundindose
410
GENTICA
Fig. 30.4. Las interacciones entre los productos de genes maternos son las responsables de la distribucin
en gradientes de los distintos morfgenos a lo largo del AP del embrin temprano.
411
La distribucin a lo largo del eje anteroposterior del embrin de los productos proteicos
codificados por los genes de la regla de los
pares determina la activacin de una serie de
genes cigticos de segmentacin, encuadrados
todos ellos en una nueva categora, los genes de
polaridad segmental. La expresin de estos
genes va a estar restringida a 14 bandas
peridicas (una por segmento), estableciendo la
primera unidad metamrica en el embrin, el
412
GENTICA
Fig. 30.6. La mayora de las mutaciones hometicas se localizan en el cromosoma 3 en dos agrupaciones
gnicas: el complejo Antennapedia (C-ANT) y el complejo Bithorax (c-BX).
los que dos genes Hox se expresen en una misma regin del cuerpo, la identidad del segmento
vendr dada por aquel que se exprese ms
posteriormente. Esta nueva propiedad se conoce
como supresin fenotpica. El desarrollo de ltimo segmento corporal, la analia, est bajo el
control del gen caudal (cad), un gen selector que
no pertenece a ninguno de los dos complejos
gnicos.
Todos los genes hometicos tienen una regin de homologa de 180 pb localizada dentro
de la secuencia codificante denominada homeobox. La secuencia de 60 aminocidos (homeodominio) codificada por dicha regin es un
dominio de unin al ADN estructuralmente relacionado con el motivo hlice-giro-hlice de
muchas protenas reguladoras. El hecho de que
todos los genes hometicos compartan una secuencia homeobox tiene dos implicaciones
fundamentales. Por un lado, las caractersticas
estructurales del homeodominio con un motivo
capaz de unirse al ADN indican que los genes
Hox se comportan como factores de transcripcin. Por otro lado, la presencia de secuencias
conservadas en genes adyacentes sugiere un
origen evolutivo comn para dichos genes.
La regulacin de los genes hometicos es un
proceso bastante complejo, que implica en
algunos casos la interaccin entre distintos genes selectores. Por ejemplo, el control de la expresin del gen Antennapedia (Antp) viene definido principalmente por el uso alternativo de
promotores (P1 o P2), pudindose transcribir en
dos ARNm precursores diferentes. Distintos
factores de transcripcin codificados por
algunos genes maternos y genes gap son capaces de activar la transcripcin bien desde Pl o
bien a partir de P2. Paradjicamente, ambos
transcritos dan lugar a un mismo tipo de protena. Existen igualmente una serie de represores
de la actividad del gen Antp, como es por ejemplo la protena codificada por el gen hometico
Ultrabithorax (Ubx) que inhibe especficamente
la transcripcin llevada a cabo desde P1. A su
vez, la regulacin del gen Ubx se lleva a cabo
mediante un procesamiento alternativo de su
ARNm precursor. Durante la embriognesis
temprana el proceso de corte y empalme del
transcrito primario Ubx incluye dos microexo-
413
LA SENALIZACIN CLULA-CLULA
Y LA GENERACIN DE LA DIVERSIDAD
MORFOLGICA EN EL EJE DORSO-VENTRAL
tolloid
(tld).
414
GENTICA
Fig. 30.7. Ruta de sealizacin que determina la formacin del morfgeno DL.
Lecturas recomendadas
Beachy, P. A.; Helfand, S. L. y Hogness, D. S.
(1985): Segmental distribution of bithorax
complex proteins during Drosophila development, Nature, 313: 545-551.
Drier, E. A. y Steward, R. (1997): The dorsoventral
signal transduction pathway and Rel-like
transcription factors in Drosophila , Semin.
Cancer Biol., 8: 83-92.
Fernndez-Piqueras, J. (1990): Fundamentos genticos de la masculinidad, en Poltica Cientfica
(edit. por Comisin Interministerial de Ciencia y
Tecnologa), vol. 24, pp. 45-51.
Garber, R. L.; Kuroiwa, A. y Gehring, W. J. (1983):
Genomic and cDNA clones of the homeotic locus
Antennapedia in Drosophila, EMBO J., 2: 2.0272.036.
Griffiths, A. J. F. et al. (2000): An introduction to
Genetic Analysis, W. H. Freeman.
Hartwell, L. H.; Hood, L.; Goldberg, M. L.; Rey-
415
1.675-1.681.
Scott, M. P.; Weiner, A. J.; Hazelrigg, T. I.; Polisky,
B. A.; Pirrotta, V.; Scalenghe, F. y Kaufman, T. C.
(1983): The molecular organization of the
Antennapedia locus of Drosophila , Cell, 35:
763-776.
Captulo
31
1.
2.
Inmunogentica
3.
Lecturas Recomendadas
418
GENTICA
Una vez caracterizadas las secuencias hometicas presentes en los homeogenes de Drosophila, McGinnis y colaboradores las utilizaron como sondas en experimentos de hibridacin de ADN para comprobar si existan secuencias similares en genomas tales como el de
Xenopus, el de ratn o el humano. Concretamente, realizaron zoo blots (aplicacin de la
tcnica de Southern blota ADN de distintos
tipos de organismos digeridos con diferentes
enzimas de restriccin) utilizando como sonda
la secuencia hometica del gen Antennapedia
de Drosophila. Los resultados obtenidos de-
mostraron la existencia de secuencias hometicas homlogas en los distintos genomas eucariticos analizados. De hecho una de las secuencias homeobox de Xenopus es muy similar
a la secuencia homeobox de Antennapedia en
Drosophila, encontrndose tan slo un cambio
en 1 de los 60 aminocidos que forman el homeodominio.
El siguiente descubrimiento fue constatar
que los genes hometicos de vertebrados
tambin forman un complejo de genes adyacentes. Ms sorprendente an fue comprobar la similitud tan grande que existe entre las agrupaciones de genes hometicos de mamferos,
llamadas complejos Hox, y las agrupaciones
ANT-C y BX-C de Drosophila (presentes tambin en otros insectos), denominadas colectivamente como complejos de genes hometicos
(HOM-C). En el ratn y en el hombre los complejos Hox muestran caractersticas parecidas en
cuanto a su estructura (el orden de sus genes),
aunque se pueden distinguir cuatro agrupaciones
situadas cada una en un cromosoma diferente,
denominadas en el ratn Hox-1, Hox-2, Hox-3 y
Hox-4 (HOX-1, HOX-2, HOX-3 y HOX-4 en
humanos) (fig. 31.1). As, por ejemplo, los genes
cercanos al extremo 3' de cada agrupacin Hox son
muy parecidos, no slo entre s, sino tambin a
algunos de los genes de la regin 3' HOM-C (ANTC) de insectos. Entre las distintas agrupaciones
Hox se establecen relaciones similares. De esta
manera, dos genes situados en la misma posicin
en dos complejos Hox diferentes presentarn ms
Fig. 31.1. Anlisis comparado de la estructura de los genes hometicos de Drosophila y de mamferos.
420
GENTICA
421
422
GENTICA
Lecturas recomendadas
Beeman, R. W.; Stuart, J. J.; Haas, M. S. y Denell,
R. E. (1989): Genetic analysis of the
homeotic gene complex (HOM-C) in the beetle
Tribolium castaneum , Dev. Biol., 133: 196209.
Brack, C.; Hirama, M.; Lenard-Schuller, R. y
Tonegawa
(1978):
A
complete
immunoglobulin gene is created by somatic
recombination, Cell, 15: 1-14.
Davis, M. M.; Calame, K.; Early, P. W.; Livant, D.
L.; Joho, R.; Weissman, I. L.; y Hood, L. E.
(1980): An immunoglobulin heavy-chain
gene is formed by at least two recombinational
events, Nature, 283: 733-739.
Duboule, D. y Dolle, P. (1989): The structural
and functional organization of the murine
HOX gene family resembles that of Drosophila
homeotic genes, EMBO J., 8: 1.497-1.505.
Early, P.; Huang, H.; Davis, M.; Calame, K. y
Hood L. (1980): An immunoglobulin heavy
chain variable region gene is generated from
three segments of DNA: VH, D and JH, Cell,
19: 981-992.
Edelman, G. M. (1973): Antibody structure and
molecular immunology, Science, 180: 830840.
Graham, A.; Papalopulu, N. y Krumlauf, R.
(1989): The murine and Drosophila
homeobox gene complexes have common
features of organization and expression, Cell,
57: 367-378.
Griffiths, A. J. F. et al. (2000): An introduction to
Genetic Analysis, W. H. Freeman.
Hartwell, L. H.; Hood, L.; Goldberg, M. L.; Reynolds, A.
E.; Silver, L. M. y Veres, R. C. (2000): Genetics:
from genes to genomes, McGraw Hill.
423
Captulo
32
1.
2.
3.
4.
Lecturas Recomendadas
426
GENTICA
Los primeros estudios en los que se analizaron de un modo cientfico rasgos de comportamiento humano se deben a Sir Francis Galton,
mdico, matemtico y naturalista, contemporneo de Mendel y primo de Darwin. Puede
considerrsele el padre de la gentica cuantita-
Metodologas genticas
para el estudio del comportamiento
Existen varios procedimientos metodolgicos para el anlisis gentico del comportamiento, pero antes de entrar en ellos debemos
hacer una serie de consideraciones generales.
Una premisa esencial para cualquier estudio
gentico de comportamiento (particularmente en
la especie humana) consiste en definir claramente el rasgo de comportamiento que se estudia, al objeto de no introducir ruido gentico
que impida que se llegue a una asignacin correcta de los genes implicados en la etiologa
427
428
GENTICA
vidad) se asocia a una escasa conducta emocional y viceversa. El modo de medir estas
pautas de comportamiento consiste en contar los
movimientos en un suelo de cuadrculas, para
cuantificar el carcter exploratorio, y contar el
nmero de micciones y defecaciones, como
ndices de su conducta emocional (un ratn es
muy emocional si realiza gran nmero de
micciones y defecaciones). De este modo se
distinguen cepas con intensos movimientos
exploratorios y poco emocionales (C57BL)
frente a cepas con escasas actividades
exploratorias y muy emocionales (BALB/c). La
cepa BALB/c es albina, hornocigtica recesiva
para el color del pelaje (cc), mientras que la
C57BL presenta pelaje normal, siendo
homocigtica dominante (CC). El anlisis del
comportamiento en los descendientes de los
cruzamientos entre ambas cepas y de los
posteriores cruces entre ratones de la F,, con la
consiguiente segregacin de ratones albinos en
la F,, ha puesto de manifiesto que los ratones
albinos se comportan como la lnea progenitora
BALB/c mientras que los ratones pigmentados
siguen un comportamiento similar a la lnea
progenitora pigmentada C57BL, indicando que
el gen del albinismo afecta al comportamiento
de los ratones. Las pruebas de heredabilidad indican que el gen del albinismo justifica un 12 %
de la varianza gentica de la actividad
exploratoria y un 26 % de la varianza de la
capacidad emocional, lo que refleja que este
locus es un componente importante, pero no
nico, de estas caractersticas del comportamiento en ratones, que estarn bajo un control
polignico.
La implicacin del gen del albinismo en estas pautas de comportamiento reside en su
afectacin a la pigmentacin de los ojos y, por
tanto, a la visin. La falta de visin en los ratones albinos explica su baja actividad exploratoria y su alta emotividad. Como corroboracin de
ese hecho, cuando ambas cepas se colocaban en
experimentos a campo abierto con luz roja (que
dificulta la visin de los ratones aunque estn
pigmentados) se comportaban de un modo
similar, poco exploratorio y altamente emotivo.
429
430
GENTICA
de manera que se dirigen hacia el final cometiendo cada vez un nmero menor de errores.
Mediante estas primeras pruebas se seleccionaron 9 parejas de ratas listas (las que haban
aprendido ms rpido y cometan menos errores
en el laberinto) y otras 9 parejas de ratas
torpes, continundose la seleccin a lo largo
de varias generaciones de cruzamientos
controlados (listas x listas, por un lado, y torpes
x torpes, por otro). Despus de 18 generaciones
de seleccin se obtuvieron dos lneas (ratas
listas y ratas torpes) significativamente
diferentes en relacin con su capacidad de
aprender a pasar sin errores por el laberinto (fig.
32.2); incluso despus de slo 8 generaciones se
evidenciaba esta delimitacin, de manera que
las ratas ms torpes de la lnea de las listas se
comportaban mejor en el laberinto que cualquier
rata lista que perteneciera a la lnea de las
torpes. Posteriormente se analiz si Ia
superioridad para la bsqueda de alimento en
el laberinto llevaba aparejada una superioridad
en otras pautas de comportamiento que estaran
integradas en el rasgo general de ratas ms
inteligentes pero, de modo sorprendente, las
ratas listas en el laberinto eran inferiores en
sus respuestas de huida frente al agua y, en las
pruebas en campo abierto, se mostraban ms
emocionales y con menor capacidad exploratoria que las ratas torpes del laberinto.
431
432
2.3.
GENTICA
433
Fig. 32.5. Cruzamientos que explican el modo de herencia del comportamiento higinico en las abejas.
434
GENTICA
Del mismo modo, se han inducido y caracterizado numerosas mutaciones de comportamiento en el nematodo Caenorhabditis elegans,
organismo extensamente utilizado en estudios
genticos, sobre todo de desarrollo, debido a su
relativa simplicidad, la facilidad de induccin
de mutaciones y de deteccin de las mismas, la
existencia
de
hermafroditismo
y
la
disponibilidad de cruzamientos genticos (entre
hermafroditas y machos). Adems, el cuerpo del
gusano es transparente con lo que se visualizan
fcilmente sus estructuras, lo cual es idneo
para el seguimiento de mutaciones de
muchos tipos (morfolgicas, de motilidad, etc.).
Desde la dcada de los sesenta, numerosos
grupos de investigacin, entre los que ha
implicados, que se distribuyen en los seis grupos de ligamiento que constituyen el nmero
haploide de cromosomas de la especie.
Tambin en ratones se conocen numerosos
genes concretos que alteran las pautas de comportamiento, entre los que destaca, incluso por
motivos histricos, el mutante danzarn, que
se describi en China hace ms de 2.000 aos.
El fenotipo danzarn se produce por homocigosis recesiva para el alelo mutante y su defecto
molecular consiste en la degeneracin del odo
interno que origina sordera y movimientos
incontrolados y en crculos, como si quisiera
alcanzar su propia cola. Muchas de las mutaciones de comportamiento en ratones son de
naturaleza neurolgica y, dado el alto grado de
conservacin de las funciones del sistema nervioso a lo largo de la escala evolutiva, el conocimiento de los defectos moleculares subyacentes puede ser de gran utilidad para la comprensin de enfermedades neurolgicas de la
especie humana.
3. Gentica del comportamiento
en Drosophila
Drosophila es un organismo ampliamente
utilizado en estudios de comportamiento, como
en tantas otras especialidades genticas, debido
al exhaustivo conocimiento gentico que se
tiene del mismo, a la facilidad de cultivo, su
idoneidad para la induccin y recogida de
mutaciones, la posibilidad de obtencin de
mosaicos, etc.
A comienzos del siglo xx, A. Sturtevant indic que la mutacin yellow (color amarillo del
cuerpo) afectaba, adems, a las preferencias de
apareamiento, de manera que los machos yellow
y los salvajes preferan aparearse con hembras
yellow, en situaciones de competencia con
hembras salvajes, mientras que las hembras
yellow y las salvajes preferan aparearse con
machos salvajes cuando stos se encontraban en
situaciones de competencia con machos yellow.
Estos comportamientos pudieron ser explicados
(en parte) al observarse que los machos
mutantes mostraban deficiencias en la
realizacin del cortejo, lo que condiciona-
435
436
GENTICA
Tabla 32.2. Mutantes de comportamiento en Drosophila
437
438
GENTICA
De modo similar, se ha demostrado la asociacin entre anomalas cromosmicas y alteraciones del comportamiento, pero entre todas
destaca, por su controversia, la asociacin entre
varones XYY y el comportamiento antisocial
violento y peligroso. Los resultados de una
encuesta citogentica sobre 197 varones recluidos en instituciones penitenciarias escocesas
por delitos de la ndole indicada demostraron
que el 4,5 % de estos reclusos eran XYY, cifra
muy por encima de la frecuencia de varones
XYY en la poblacin normal (0,1 %). Esto
parecera indicar que algunas formas de comportamiento violento tendran una predisposicin gentica y, de hecho, ha sido utilizado
como argumento legal de defensa, sin xito,
Otros estudios han demostrado resultados discrepantes con los anteriores, poniendo de manifiesto que en el primer estudio poda existir un
error en la eleccin de la muestra control. As,
al introducir dentro del grupo control, XY,
nicamente a individuos altos (ms de 1,84 m),
para hacer las muestras ms comparativas (ya
que los XYY son de elevada estatura) y combinar otros parmetros educacionales, no parece
evidenciarse la asociacin genotpica a la criminalidad, sino ms bien la combinacin de una
elevada talla y un bajo cociente intelectual,
independientemente del cariotipo. Actualmente
estos estudios han sido abandonados, en parte
por el temor a las repercusiones sociales y a las
dificultades de los procedimientos metodolgicos.
Por otra parte, se han hecho importantes
contribuciones al conocimiento de las bases
genticas de enfermedades complejas que cursan con alteraciones graves del comportamiento,
como la esquizofrenia y las enfermedades
maniacodepresivas, entre otras. Los estudios de
gemelos y de adopcin parecen apoyar la
existencia de un componente gentico subyacente en la maniacodepresin. As, la concordancia es mayor entre MZ que entre DZ y en
sujetos adoptados existe una relacin entre su
padecimiento y el de sus padres biolgicos. Los
anlisis de ligamiento han resultado, hasta el
momento, infructuosos (e incluso discrepantes),
en el intento de localizar loci asociados. Las
causas pueden estar en la identificacin in-
439
440
GENTICA
Tabla 32.3. Resultados combinados de diversos estudios sobre la proporcin de parientes en primer grado de
individuos esquizofrnicos que muestran la misma enfermedad o un trastorno esquizoide
441
Bourke, A. F. G. (2002): Genetics of social behaviour in fire ants, Trends in Genetics, 18 (5):
221-223.
Brenner, S. (1974): The genetics of Caenorhabditis elegans, Genetics, 77: 71-94.
Brunner, H. et al. (1993): Anormal behavior associated with a point mutation in the structural
gene for monoamino oxidase A, Science, 262:
578-580.
Cummings, M. R. (1995): Herencia humana: principios y conceptos (3.a ed.), InteramericanaMcGraw Hill.
Devor, E. J. y Cloninger, C. R. (1989): Genetics of
alcoholism, Anna. Rev. Genet., 23: 19-36.
Drayna, D. et al. (2001): Genetic Correlates of
Musical Pitch Recognition in Humans, Science, 291: 1.969-1.972.
Emery, A. E. H. y Mueller, R. F. (1992): Elements of
Medical Genetics (8 ed.), Churchill Livingston.
Hamer, D. et al. (1993): Linkage between DNA
markers on the X chromosome and male
sexual orientation, Science, 261: 321-327.
Hartwell, L. H. et al (2000): Genetics:from genes to
genomes (3.a ed.), McGraw Hill.
Hazelbaner, G. L. et al. (1993): Bacterial motility
and signal transduction, Cell, 73: 15-22.
Jacobs, P. A. et al. (1965): Aggressive behaviour,
mental subnormality and the XYY male, Nature, 208: 1.351-1.352.
Krieger, M. J. B. y Ross, K. G. (2002): Identification of a major gene regulating complex social
behaviour, Science, 295: 328-332.
Klug, W. S y Cummings, M. R. (1999): Conceptos
de Gentica (5.a ed.), Prentice Hall.
Levay, S. (1991): A difference in hypothalamic
structure
between
heterosexual
and
homosexual men, Science, 253: 1.034-1.037.
Mange, A. P. y Mange, E. J. (1990): Genetics: Human Aspects (2.a ed.), Sinauer Associates, Inc.
McInnes, L. A. y Freimer, N. B. (1995): Mapping
genes for psychiatric disorders and behavioral
traits, Curr. Opin. Genet. Dcv., 5: 376-381.
Noel, B. et al. (1974): The XYY syndrome: reality
or myth?, Clin. Genet., 5: 387-394.
Propping, P. et al. (1992): Alcoholism, en: King,
R. A., Rotter, J. I., Motulsky, A. G. (eds). The
genetic basis of common diseases, Oxford University Press, Nueva York, pp. 837-865.
Salathia, N. et al. (2002): QTL for timing: a
natural diversity of clock genes, Trends in
genetics, 18 (3): 115-118.
Strachan, T. y Read, A. P. (1999): Human
molecular genetics 2, Bs Sci.
442
GENTICA
Captulo
33
1.
La Variacin Gentica
2.
3.
Lecturas Recomendadas
446
GENTICA
447
han detectado pequeas inversiones en determinados cromosomas que no afectan a los individuos portadores y que son frecuentes en la
poblacin.
El desarrollo de las tcnicas de electroforesis de protenas puso de manifiesto que existe
448
GENTICA
Fig. 33.3. Polimorfismo intraespecfico de los loci de la isoenzima esterasa-1 (E-]) y esterasa-2 (E-2)
en varias especies de Reseda L.
dos por cambios en la secuencia diana de enzimas de restriccin. Adems, las secuencias repetidas en los genomas tienden a originar variaciones en el nmero de repeticiones. Entre estos
polimorfismos podemos sealar las VNTRs (repeticiones en tndem en nmero variable), Minisatlites y Microsatlites (fig. 33.4). Por ltimo,
la secuenciacin del genoma de diversos
organismos ha puesto de manifiesto abundantes
polimorfismos de un nico nucletido (SNPs),
de los que en el genoma humano ya hay descritos ms de dos millones.
La utilizacin de estos polimorfismos permite establecer los patrones de variacin en los
poblaciones naturales, hacer estimaciones de la
proporcin de loci gnicos que son polimrficos
en una especie determinada y, por tanto,
susceptibles de cambiar. Ello permite, adems,
analizar los mecanismos e intensidad de los
procesos que producen los cambios en las frecuencias de los distintos genotipos y hacer predicciones sobre la futura composicin de la poblacin segn la intensidad de las fuerzas que
acten sobre ella.
2.
449
Tabla 33.1
450
GENTICA
o bien,
q = Frecuencia de L' = 0,202 +'/z 0,496 = 0,45
En definitiva, la frecuencia de ambos alelos
en la poblacin ser 1, es decir (p + q) = 1, donde p y q representan las frecuencias gnicas,
allicas o gamticas.
Igualmente podemos describir la variacin
en trminos de varios loci, en vez de uno slo,
es decir calcularamos las frecuencias gamticas
de mltiples loci simultneamente, tambin
conocidas como frecuencias de haplotipos. Para
calcular las frecuencias de haplotipos podemos
continuar con el ejemplo de los grupos
sanguneos MN. Con posterioridad al
descubrimiento de Landsteiner y Levine, en
1947, Race y Sanger establecieron que el sistema S/s, descubierto por Walsh y Montgomery
en ese mismo ao, estaba estrechamente ligado
al grupo MN. El locus S (factor secretor)
determinaba que las protenas M y N se
expresaran en la saliva, de manera que los individuos pertenecientes al grupo M podran ser
S o s (MS o Ms), al igual que los N (NS o Ns).
Podramos hacer un clculo de la frecuencia
de
la
combinacin
de los alelos MS
(haplotipo) en la poblacin; para ello procederemos como antes pero tendremos presente que
se generan un mayor nmero de heteroci-
451
Tabla 33.2
3.
Los principios de Mendel consideran la herencia a nivel de individuos pero no de poblaciones. Supongamos el cruzamiento de dos individuos heterocigotos para un locus (Aa): de
acuerdo con Mendel en la siguiente generacin
aparecer una proporcin fenotpica 3 [dominante]: 1[recesivo]. De una forma intuitiva podra esperarse que en la poblacin los individuos dominantes fueran ms frecuentes (3) que
los recesivos (1). Sin embargo, estas proporciones se cumplen a nivel de cruzamientos individuales pero al considerar la poblacin en su
totalidad en una generacin, adems del cruzamiento indicado arriba, ocurren otros muchos
cruzamientos entre individuos con otras combinaciones genotpicas (homocigotos AA, aa),
de manera que en la poblacin ocurre como si
todos los gametos posibles originados en una
generacin se mezclaran al azar y originaran
todas las combinaciones posibles.
Hardy y Weinberg en 1908 argumentaron
matemticamente el comportamiento de las
frecuencias de los genes en las poblaciones en la
que se conoce como Ley del equilibrio de
Hardy-Weinberg, demostrando que la herencia
en s misma no produce cambios en las frecuencias allicas ni genotpicas. Bsicamente,
esta ley establece que en una poblacin idealizada, en la que no actan fuerzas para el cambio, las frecuencias gnicas y genotpicas se
mantienen constantes (en equilibrio) de generacin en generacin. Adems, si los apareamientos son al azar (la probabilidad de
apareamiento entre individuos es independiente
de su constitucin gentica) las frecuencias
452
GENTICA
Lecturas recomendadas
ce Hall.
Captulo
34
1.
Fuentes de Variacin
2.
Procesos Sistemticos
2.1. Mutacin
2.2. Recombinacin
2.3. Migracin
Lecturas Recomendadas
454
GENTICA
1. Fuentes de variacin
La mutacin es la principal fuente de variabilidad gentica. Sin mutacin no existira evolucin, pero el cambio que sta produce por s
misma en la constitucin gentica de las poblaciones es muy lento, porque la tasa de muta-
cin es muy baja, lo que conducira a un proceso evolutivo extremadamente lento. En realidad
la mutacin va a producir la materia prima
(variantes) sobre la que actuarn otros procesos
para producir la evolucin.
Consideremos el efecto de la mutacin recurrente sobre una poblacin en relacin con el
cambio de frecuencias gnicas que sta produce
en el tiempo.
En una poblacin en la que todos los individuos son homocigticos (AA) para el locus A,
se puede producir una mutacin que origine el
alelo a. Si esta mutacin es un acontecimiento
nico, la probabilidad de que se expanda por
toda la poblacin en generaciones sucesivas es
muy pequea y, adems, por efecto del muestreo la mutacin podra no llegar a pasar a la siguiente generacin. Si la mutacin es recurrente
tiene ms posibilidades de pasar a generaciones
sucesivas y propagarse. Analicemos las
consecuencias de este tipo de mutacin sobre
las frecuencias gnicas.
Supongamos que el gen A, muta a A2 con
una frecuencia u (usualmente 10-s).
Gen A: 2 alelos = A, y A2.
Tasa de Mutacin: A, -+ A2 = u (por gameto y
generacin).
Si po es la frecuencia inicial de A, y q0 la del
nuevo mutante A2.
En esta generacin inicial la mutacin
cambiar un cierto nmero de alelos A, en A2.
Como la frecuencia inicial de Al = po; pon alelos
A, cambian a A2.
1.generacin:
Frecuencia de A1 despus de la generacin
bajo el efecto de la mutacin:
P1, = [alelos A, iniciales menos los que han
cambiado a A2] = PO - (upo) = Po (1 - u).
2. generacin:
P2= p1-up1, = p l (1 -[sustituimos el valor de pl ]
= po (1- u) (1 - u) = Po (1 - u)2.
Despus de t-generaciones:
La frecuencia de A, ser:
pt = po (1-u)t
Como 1 - u es menor que 1, cuando t aumenta
[= aumenta el n.' de generaciones] p, llega a ser
cero, es decir, desaparecera A, de la poblacin y
su constitucin gentica habra cambiado a ser A2.
No obstante, el cambio originado por la
mutacin en las frecuencias gnicas de la poblacin es extremadamente lento, de manera que,
si u = 10-5 y aplicamos las frmulas deducidas, se
necesitarn 1.000 generaciones para pasar de una
frecuencia de A, = 1 a 0,999; 2.000 generaciones
para pasar desde una frecuencia de 0,50 a 0,49 y
10.000 generaciones para cambiar desde A, = 0,10
a 0,09. A medida que disminuye el nmero de
alelos A, en la poblacin el cambio se va haciendo,
lgicamente, ms lento pues existen menos alelos
A, que puedan cambiar a A2.
Si consideramos adems que las mutaciones
gnicas suelen ser reversibles el cambio todava se
ralentizara ms, pues en cada generacin pasaran
[upo] alelos A, a A2, pero algunos de estos alelos
A2 recin originados pasaran nuevamente a A,
debido a la tasa v de reversin [vq0], llegndose a
un equilibrio entre los dos sentidos de la mutacin
en el que el cambio sera cero. Realmente, este
equilibrio rara vez se alcanza pues sobre las
variantes originadas por la mutacin actan otras
fuerzas, como la seleccin, favoreciendo a alguno
de los alelos.
2.2. RECOMBINACIN
455
a(a + 1)
2
En el caso de que fueran tan slo 3 loci, cada
uno de ellos con 4 alelos, se originarn [4 X 5/2]3 =
1.000 genotipos diferentes, pero si elevamos el
nmero de loci considerados a 100, cada uno con 4
alelos, se originaran [4 x 5/2]100 = 10'0 = cien mil
millones de genotipos diferentes. Si tenemos en
cuenta que, por ejemplo, en la especie humana
existen alrededor de 30.000 genes, el nmero de
genotipos
diferentes
producidos
por
la
recombinacin puede llegar a ser tremendamente
elevado.
Por tanto, podemos concluir que la recombinacin potencia fuertemente la variabilidad
gentica producida en las poblaciones al combinar
las diferentes posibilidades (alelos) existentes en
cada locus gnico, posibilitando que con relativa
facilidad se produzcan combinaciones gnicas
favorables, sobre las que acte la seleccin natural.
En los organismos asexuales, por ejemplo las
bacterias, la produccin de variabilidad gentica
mediante recombinacin es un camino casi vetado
al no existir la meiosis; en cambio estos
organismos poseen altas tasas de proliferacin que
compensan la lentitud de los cambios producidos
por mutacin. A pesar de lo cual, sus tasas de
evolucin resultan mucho ms bajas que las de los
organismos con reproduccin sexual.
Indudablemente, la produccin de un elevado
nmero de combinaciones de alelos por recombinacin puede ser una ventaja de las poblaciones frente al proceso evolutivo, pero la recombinacin tambin puede destruir grupos de
alelos que proporcionan a los individuos ventajas
adaptativas para las condiciones en que se
456
GENTICA
2.3. MIGRACIN
q=q1-q0=q0-(q0-qM)M-q0=q0-q0
M+qMM-q0=M(qM-q0)
O sea, cuanto mayor sea el nmero de emigrantes [M] y mayor la diferencia en las frecuencias gnicas entre poblacin donadora y
receptora, mayor ser el cambio que se producir en las frecuencias gnicas de la receptora.
Aq es cero slo cuando se detiene la migracin
(M = 0), o cuando se igualan las frecuencias
gnicas entre la poblacin donadora y receptora
(qM - q0 = 0). En este punto se alcanza el
equilibrio.
Mediante las frmulas deducidas tambin
podemos calcular la intensidad de la migracin:
M=
q
qM q0
M10 =
q 0,4460,028
=
= 0,694
qM q0 0,6300,028
O sea el 69,4 % de los genes se han conservado desde la poblacin original africana en la
poblacin afroamericana. Si tenemos en cuenta
que esto ha ocurrido en 10 generaciones, en una
generacin:
M= 10 0,694 = 0,036
457
Lecturas recomendadas
Ayala, F. J. et al. (1980): Evolucin Molecular, Ediciones Omega, Barcelona.
Clarke, B. (1973): Mutation and population size,
Captulo
35
1.
Seleccin
1.1.
1.2.
1.3.
1.4.
2.
Deriva Gentica
Lecturas Recomendadas
460
GENTICA
1. Seleccin
-spq 2
1pq 2
-pq 2
=
= 2 = -p
2
2
1- s - sq 1-1-1q
-q
461
q - sq 2 q - q 2
q(1- q)
=
=
=
1- sq 2 1- q 2 (1+ sq)(1- q)
q
1- q
462
GENTICA
Tabla 35.1
q:
q - sq 2
-spq 2 -pq 2
-q =
p =
=
=
1- sq 2
1- sq 2 1- q
-(1- q)q 2
-q 2
=
=
(1+ q)(1- q) 1+ q
En este caso el alelo no desaparece en una
generacin, sino que la tasa de disminucin del
alelo a (Aq) se ir haciendo ms pequea a
medida que el alelo vaya desapareciendo de la
poblacin (su frecuencia q se hace ms
pequea). Es decir, la eliminacin de un alelo
recesivo letal mediante seleccin es un proceso
muy lento que puede extenderse a lo largo de
miles de generaciones.
1.3.
463
Tabla 35.2.
1.3.1.
Seleccin en contra
de los heterocigotos (Inferioridad
Cuando los heterocigotos tienen una eficacia biolgica inferior a la de ambos homocigotos, es decir, hay una seleccin en contra
de los heterocigotos. Este es el caso de los
heterocigotos para reordenaciones cromosmicas, pues presentan una fertilidad baja, tal como
se analiz en el captulo correspondiente. Para
que esto ocurra, adems, la eficacia biolgica
de ambos alelos debe ser igual [ WAA =
Waa > WAa],. y se alcanzar un equilibrio
[Aq = 0] cuando se igualen las frecuencias
de los dos alelos [p = q]. No obstante, en
los casos en que los dos homocigotos tengan
eficacias biolgicas diferentes, aunque superiores a los heterocigotos [WAA = Waa > WAa],
464
GENTICA
--- Cy ----- Pm+ ------ --- Cy+ ----- Pm -------- Cy ----- Pm+ ------ --- Cy+ ----- Pm -----Letal
Letal
el heterocigoto es viable, por ejemplo los mutantes Curly (Cy) y Plum (Pm) de Drosophila
(vase esquema).
a 0,7 y 0,3 respectivamente, no porque la moneda est pesada hacia una de las caras (seleccin a favor de uno de los alelos) sino por efectos del azar. Aunque conocemos la magnitud del
cambio producido sobre las frecuencias gnicas,
por su efecto aleatorio es impredecible su
direccin (no sabemos hacia cul de las caras de
la moneda).
La deriva gentica conduce a lo largo de las
generaciones a una prdida de variabilidad y,
por tanto, a la homocigosis en las poblaciones
pequeas que la experimentan y a la fijacin de
alelos diferentes a los que se fijan en poblaciones grandes, con lo cual conduce a una divergencia entre poblaciones y finalmente a especiacin.
La deriva gentica tambin acta cuando
una poblacin reduce mucho su efectivo, por
ejemplo debido a un cambio medioambiental
adverso, pasando la poblacin lo que se denomina un cuello de botella. En ese momento el
nmero de individuos de la poblacin es pequeo y susceptible, por tanto, de sufrir los
efectos de muestreo descritos.
Otra situacin favorable para la actuacin de
la deriva gentica es el efecto fundador. La
colonizacin de nuevos territorios, por ejemplo
islas, se lleva a cabo por unos cuantos individuos procedentes de una poblacin grande
continental. Los pocos individuos que comienzan la nueva colonia representan una muestra
aleatoria de los genes de la poblacin original,
conduciendo a una divergencia de las frecuen
cias allicas y finalmente de los alelos fijados
465
Lecturas recomendadas
Captulo
36
Gentica evolutiva
Juan Jos Gonzlez Aguilera
1.
Teoras Evolutivas
2.
3.
El Proceso de Especiacin
4.
Lecturas Recomendadas
468
GENTICA
469
la formacin de nuevas especies, pues la existencia de estas nuevas ordenaciones cromosmicas disminuan drsticamente la fertilidad de
los cruzamientos entre portadores y no portadores de la reordenacin (tal como analizamos
en el captulo dedicado a las reordenaciones
cromosmicas), por lo que los individuos
portadores quedan aislados reproductivamente
del resto, lo que abre tambin la posibilidad de
la especiacin simptrica (en la misma localidad). Este modelo de especiacin a travs de
reordenaciones cromosmicas, sin necesidad de
una divergencia gradual, ha podido ser demostrado posteriormente en otras muchas especies de plantas y animales.
En 1972 los paleontlogos N. Eldredge y S.
J. Gould (recientemente fallecido) en sus estudios de la evolucin del gnero Trilobites han
corroborado la existencia del saltacionismo en
el registro fsil. Estos autores demostraron que
cada especie permaneca estable durante
millones de aos (periodo de stasis: ausencia
de evolucin) para luego ser reemplazada
bruscamente por otra que muestra claras
diferencias con la anterior; a este tipo de evolucin se le denomina de equilibrios intermitentes.
2. Divergencia de las poblaciones
470
GENTICA
Tabla 36.1. Efecto sobre la variabilidad y la divergencia de las distintas fuerzas que actan sobre
las poblaciones
471
3. El proceso de especiacin
472
GENTICA
La similitud en las clulas de todos los organismos conocidos, en cuanto a procesos genticos, bioqumica y orgnulos subcelulares,
sugiere que la amplia variedad de formas de
vida que existen actualmente provienen de una
clula original que surgi al comienzo de la
vida. No existen evidencias fsiles de los albores de la vida, pero puede deducirse que comenz a partir de una molcula con capacidad
de contener informacin y de autorreplicarse,
suficientemente simple como para poder formarse de una manera espontnea. Actualmente
parece claro que esta molcula primordial pudo
ser de ARN, pues adems de cumplir las
caractersticas reseadas tiene la posibilidad de
plegarse y desempear actividades catalticas,
por ello se denomina a esta vida primitiva, el
mundo ARN.
El hecho de que todos los organismos vivos
compartan las cuatro bases (A, U, G, C) en su
ARN, nos induce a pensar en un nico origen de
toda la informacin gentica. No obstante, el
ARN es una molcula relativamente inestable
por lo que a lo largo del proceso evolutivo debi
evolucionar hacia una molcula ms estable
como es el ADN.
Se piensa que las primeras clulas, originadas en altas temperaturas volcnicas, estaran
constituidas por una membrana que rodeara la
molcula de ARN. Los representantes actuales
de estas formas primitivas, las arqueobacterias,
son organismos unicelulares que contienen en
su material gentico genes fuertemente empaquetados carentes de intrones. Los intrones
aparecieron con los eucariotas; estos organismos fueron capaces de incorporar orgnulos
intracelulares, y evolucionaron hacia la compartimentalizacin del interior de la clula, aislando en el ncleo el material que contena la
informacin gentica. Posteriormente en esta
misma lnea evolutiva apareceran los organismos pluricelulares. A lo largo de este proceso
la cantidad de material gentico se ha ido incre-
473
474
GENTICA
York.
Dobzhansky, T. et al. (1980): Evolucin,
Ediciones Omega, Barcelona.
Eldredge, N. y Gould, S. J. (1972): Punctuate
equilibria. An alternative to phyletic
gradualism, en T. J. M. Schopf (ed.), Models
in paleobiologa, Freeman, San Francisco, 82115.
Fay, J. C. y Wu, C.-I. (2001): The neutral theory
in the genomic era, Current Opinion in
Genetics & Development, 11: 642-646.
Gilbert, W. (1987): The RNA world, Cold
Spring Harbor Symp. Quant. Biol., 52: 325-326.
Haldane, J. B. S. (1957): The cost of natural
selection, Journal of Genetics, 55: 511-524.
Higgie, M. et al. (2000): Natural Selection and
the Reinforcement of Mate Recognition,
Science, 290: 519-521.
Joyce, G. F. (1989): RNA evolution and the
origin of Life, Nature, 338: 217-224.
Kimura, M. (1989). The neutral theory of
molecular evolution and the world view of the
neutralist, Genome, 31: 24-31.
Lewis, H. (1966): Speciation in flowering
plants, Science, 152: 167-172.
Mayr, E. (1963): Animal species and evolution,
Harvard University Press, Mass.
Ohno, S. (1970): Evolution by gene duplication,
Springer, Nueva York.
Simpson, G. G. (1944): Tempo and mode in evolution, Columbia University Press.
Simpson, G. G. (1953): The majorfeatures of
evolution, Columbia University Press.
Speciacin: Special Issue (2001): Science, 293.
Stebbins, G. L. (1950): Variation and evolution in
plants, Columbia University Press, Nueva
York.
White, M. J. D. (1977): Modes of speciation, Freeman, Nueva York.
Woese, C. R. (1987): Bacterial evolution,
Microbiol. Rev., 51: 221-271.
Rundle, H. D. et al. (2000): Natural Selection and
Parallel
Speciation
in
Sympatric
Sticklebacks,
Science,
287:
306-308
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