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Sera vida del rizobioma

los organismos que habitan el rizobioma


la clasificacin organismos que son benficos, patgenos y patgenos para humanos

microbioma vegetal (es decir, las comunidades colectivas de


microorganismos sobre y en las plantas, sus genomas e
interacciones) para prcticas agrcolas mejoradas y
sostenibles. Las plantas son colonizadas por un sorprendente
nmero de microorganismos que pueden tener efectos
profundos en la germinacin de las semillas, el crecimiento y
desarrollo de las plantas, la nutricin, las enfermedades y la
productividad. En este contexto, las plantas pueden ser vistas
como superorganismos que dependen en parte de su
microbioma para funciones y rasgos especficos. A cambio, las
plantas depositan una parte sustancial de su carbono
fotossintticamente
fijado
en
su
entorno
directo
(espermiosfera, rizosfera, filosfera).
Los nutrientes, oligoelementos, compuestos orgnicos
voltiles y otros metabolitos depositados por las races de las
plantas atraen a microorganismos como bacterias, arqueas,
hongos, nematodos y protozoos, haciendo de la rizsfera un
punto caliente de actividad e interacciones microbianas
(Raaijmakers et al., 2009.
En los ltimos cinco decenios, numerosos estudios han
demostrado que miembros especficos del microbioma de la
rizsfera pueden afectar el crecimiento y desarrollo de las
plantas, la nutricin de las plantas y la tolerancia al estrs
(Berendsen et al., 2012, y Philippot y otros, 2013). En este
contexto, Cook et al. (1995) postul que las plantas pueden
pedir ayuda "mediante la estimulacin selectiva de
microorganismos que los protegen de patgenos invasores.
Los microorganismos de la rizsfera que han sido bien
estudiados por sus efectos beneficiosos sobre el crecimiento y
la salud de las plantas son las bacterias fijadoras de
nitrgeno, hongos micorrzicos, Las rizobacterias promotoras

del crecimiento (PGPR) y los hongos


micoparsitos (Mendes et al., 2013).
Dar forma a la microbioma de la rizsfera

saprofticos

Varias especies y cepas de gneros de rizobacterias y hongos,


incluyendo Bacillus, Se ha demostrado que Pseudomonas,
Collimonas,
Trichoderma,
Piriformospora
y
Fusarium
oxysporum no patgeno promueven el crecimiento de las
plantas y protegen a las plantas del estrs por diferentes
mecanismos (Lugtenberg y Kamilova 2009, Raaijmakers y
Mazzola 2012, cap.3). Estos incluyen la biofertilizacin (Chaps
23, 24 y 25), la estimulacin del crecimiento de las races
(captulo 26), la antibiosis (captulo 18), la resistencia
sistmica inducida (captulo 14), el parasitismo y la
rizoremediacin (cap.29). Estos mecanismos estn bien
documentados para las rizobacterias pertenecientes a
Proteobacteria y Firmicutes, es decir Pseudomonas (Cap. 18) y
Bacillus (Cap. 40), as como para los hongos micoparsitos
Trichoderma (Cap. 36) y Gliocladium. Por lo tanto, existe un
gran inters en desarrollar estrategias que reestructuren el
microbioma de la rizsfera a favor de microorganismos que
promuevan el desarrollo de las races y el crecimiento de las
plantas y que eviten la proliferacin de plagas y
enfermedades.
identificados que estaban asociados con el crecimiento y la
supresin de la enfermedad por un Bacillus cereus
beneficioso. Rudrappa et al. (2008) demostraron adems que
las plantas pueden estimular, a travs del cido mlico, los
efectos protectores de una cepa beneficiosa de Bacillus
subtilus en la rizosfera.
En las ltimas dcadas, se han estudiado muchas cepas
bacterianas y fngicas con diferentes rasgos beneficiosos por
su capacidad para aumentar el rendimiento de las plantas y
para controlar las plagas y las enfermedades. Aunque hay
varios
casos
exitosos
(por
ejemplo,
Agrobacterium
radiobacter, Bacillus subtilis),

el microbioma mnimo de la rizsfera se define aqu como el


conjunto mnimo de microorganismos, rasgos microbianos y
genomas que se necesitan para ejecutar eficaz y
consistentemente un especfico Funcin en la rizosfera, por
ejemplo La proteccin de las races de las plantas contra las
infecciones por hongos o la rizoremediacin de compuestos
txicos (Mendes et al., 2013).
Para el control de las enfermedades de las plantas, el diseo
de un microbioma de rizosfera mnimo separado para cada
uno de los principales grupos de patgenos (bacterias,
hongos, nematodos, oomicetos) puede ser factible.
Usando un enfoque de modelado, Scheuring andYu (2012)
sugiri tres sencillos pasos para montar un microbioma
beneficioso. En sus modelos, el primer paso es que el
microbioma del nuevo anfitrin comienza con una proporcin
ms alta de beneficiosos ya sea por transmisin vertical o por
una mayor tasa de inmigracin. El segundo paso implica un
alto suministro de recursos desde el husped a los
beneficiosos, que a su vez (tercer paso) alimenta la
competencia de interferencia intensa a travs de la
produccin de antibiticos conduciendo a la dominacin
competitiva de los microbios beneficiosos. Aunque Scheuring
y Yu (2012) se centraron principalmente en la antibiosis como
una funcin clave de un microbioma beneficioso, sus modelos
son altamente instrumentales para identificar los procesos
principales que impulsan el ensamblaje de un microbioma
beneficioso. Queda por determinar si estos modelos tambin
podran utilizarse para otros rasgos importantes de los
microbiomas beneficiosos de la rizsfera, como el parasitismo,
la resistencia inducida y la competencia de los recursos.
Tanto la microbiota de las hojas como la raz contienen
bacterias que proporcionan proteccin indirecta a los
patgenos, pero los miembros de la microbiota de las races
parecen servir funciones adicionales del husped a travs de
la adquisicin de nutrientes del suelo para el crecimiento de

las plantas. As, la microbiota vegetal surge como un rasgo


fundamental que incluye el mutualismo habilitado a travs de
diversos mecanismos bioqumicos, como lo revelan los
estudios sobre las bacterias promotoras del crecimiento de las
plantas y promotoras de la salud de las plantas.
As, la microbiota vegetal surge como un rasgo fundamental
que incluye el mutualismo permitido a travs de diversos
mecanismos bioqumicos, como lo revelan los estudios sobre
el sistema promotor del crecimiento de las plantas y promotor
de la salud de las plantas, explicando cmo las plantas
reconocen las estructuras moleculares no modificadas para
desencadenar respuestas inmunes Y cmo patgenos
adaptados al husped subvertir la respuesta inmune para
causar la enfermedad (74]. En el trabajo paralelo se definieron
las vas de sealizacin celular
En la naturaleza, las plantas sanas albergan una notable
diversidad de microbios conocidos como microbiota vegetal
rhizodeposition. Este proceso se refiere a las actividades
entrelazadas de desarrollo y secrecin de plantas en el
sistema radicular. Las clulas Rhizodermis secretan una
amplia gama de compuestos, incluyendo iones de cidos
orgnicos, iones inorgnicos, fitosiderforos, azcares,
vitaminas, aminocidos, purinas y nuclesidos, y la cpsula de
raz produce muclago polisacrido
Se piensa que el secuestro neto de carbono orgnico y
nitrgeno por las races estimula la multiplicacin microbiana
del suelo en las proximidades de los tejidos radiculares debido
a que (a) las bacterias del suelo ms conocidas son
organotrofos, es decir, derivan la energa para el crecimiento
a partir de sustratos orgnicos, y (b) La accesibilidad y la
disponibilidad de compuestos orgnicos estn limitadas en la
mayora de los suelos
. La evidencia que apoya esta hiptesis proviene del trabajo
gentico-molecular sobre la quimiotaxis de la bacteria
patgena Ralstonia solanacearum, que invade plantas
hospederas a travs de las races (148). R. solanacearum es

atrado especficamente por diversos aminocidos, cidos


orgnicos y exudados de raz de su planta husped
Aunque muchos miembros del microbioma de la rizsfera son
beneficiosos para el crecimiento de las plantas, tambin los
microorganismos patgenos vegetales colonizan la rizsfera
tratando de romper el escudo microbiano protector y superar
los mecanismos innatos de defensa de las plantas para causar
enfermedades. Un tercer grupo de microorganismos que se
pueden encontrar en la rizosfera son las verdaderas y
oportunistas bacterias patgenas humanas, que pueden ser
transportadas o en tejido vegetal y pueden causar
enfermedad cuando se introducen en humanos debilitados.
). Los organismos que se encuentran en la rizosfera son las
bacterias, hongos, oomicetos, nemtodos, protozoos, algas,
virus, arqueas y artrpodos
Cook et al. (1995) postul que las plantas pueden modular el
microbioma de la rizosfera en su beneficio estimulando
selectivamente microorganismos con rasgos que son
beneficiosos para el crecimiento y la salud de las plantas
Los organismos de la rizsfera que han sido bien estudiados
por sus efectos beneficiosos sobre el crecimiento y la salud de
las plantas son las bacterias fijadoras de nitrgeno, los hongos
micorrzicos, las rizobacterias promotoras del crecimiento de
las plantas (PGPR), los microbios biocontrol, los hongos
mycoparasitic y los protozoarios. Los organismos de la
rizsfera que son perjudiciales para el crecimiento y la salud
de las plantas incluyen los hongos patgenos, los oomicetos,
las bacterias y los nematodos. Un tercer grupo de
microorganismos que se pueden encontrar en la rizosfera son
los patgenos humanos
. En esta revisin, nos centraremos en la frecuencia, la
diversidad y las actividades de los microorganismos
patgenos de las plantas ( "los buenos"), patgenos de las
plantas ( "los malos") y patgenos humanos ( "los feos") en la
rizosfera y su impacto en Salud y enfermedad. Debe
subrayarse que el uso de los trminos lo bueno, lo malo y
lo feo es arbitrario, ya que una especie microbiana

especfica puede ser beneficiosa


abundancia (Maurhofer et al., 1992).

nociva

Adquisicin de

Crecimiento y
Adquisicin de

segn

su

Tolerancia al estrs
Proteccin contra

Fisiologa

LOS
BUENOS

EL MICROBIOMA DE LA

Respuesta inmune

RIZOSFERA

LOS FEOS
LOS MALOS
Contaminacin
Enfermedades de
las plantas

alimenticia