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TEMA 1.

INTRODUCCIÓN
1. CONCEPTO DE MICROBIOLOGÍA

MICRO (pequeño), BIO (vida) y LOGOS (tratado): Es el estudio de los MICROORGANISMOS, o seres de
pequeño tamaño que sólo son visibles al microscopio.

1 μm = 0,001 mm

MICROBIOLOGÍA AMBIENTAL es una subdisciplina de la MICROBIOLOGÍA que estudia la función y
diversidad de los microorganismos en los ambientes naturales (suelo, agua, aire, “macroorganismos”), y
también el papel de estos seres vivos en los procesos de biorremediación, o en los de producción de
“bienes de interés medioambiental”.

Es el estudio de todos los procesos efectuados por microorganismos que ocurren en el suelo, el agua,
alimentos, etc. es decir, considera los efectos a gran escala de la presencia de microorganismos y su
actividad.

La ecología microbiana es el estudio del comportamiento y las actividades de los microorganismos en
sus medios naturales (medio ambientes).

2. BREVE HISTORIA DE LA MICROBIOLOGÍA AMBIENTAL

Antiguedad - S. XVII (primeros microscopistas):

Período Especulativo sobre la existencia y naturaleza de los microorganismos. “Las enfermedades están
causadas por organismos invisibles”.

Año 1676, Leeuwenhoek observa microorganismos (“animálculos”).

Año 1688, Redi publica su trabajo sobre la generación espontánea de gusanos.

Hook inventa el primer microscopio.

S. XVIII – S. XIX: Nacimiento de la Microbiología como Ciencia

1. Polémica sobre la generación espontánea de los microorganismos

A favor: Needham (Año 1748); Pouchet (Año 1859)

En contra: Spallanzani (Años 1765/76); Schwann y Scheleiden (Año 1838); Pasteur (Año 1861); Tindall
(Año 1877).

 Spallazani: Hizo un experimento en el que puso en un recipiente un líquido llamado “caldo
nutritivo”, tapó dicho recipiente y lo calentó, demostrando que no aparecían microorganismos.
 Pasteur: En un recipiente de vidrio colocó un “caldo nutritivo” y deformó la entrada de aire del
recipiente en forma de s de manera que el cuello tuviera forma sigmoidal. Hirvió ese caldo
nutritivo y, a pesar de que el caldo estaba en contacto con el aire, permanecía inalterable.
dedujo que los microorganismos eran transportados por el aire (polvo o adheridos a aerosoles
atmosféricos). Conforme pasaba el tiempo se depositaba polvo en el cuello, pero no aparecían
microorganismos. tanto si inclinaba el caldo permitiendo que entrara en contacto con el polvo
como rompiendo el matraz, crecían microorganismos. Esto era producido por el contacto del
caldo con el polvo, demostrando así que los microorganismos eran producto del inóculo de
otros microorganismos.

en los ciclos biogeoquímicos del carbono. y con ellas la obtención de “cultivos puros” también llamados “cultivos axénicos” a partir de un microorganismo. Reconocimiento de los m.  Tindall: A pesar de calentar el caldo. Pasteur prepara la vacuna contra el carbunco Año 1882. El tratamiento de pasteurización mata a células microbianas que están metabólicamente activas. ilustra cómo diferentes microorganismos desarrollan sus ciclos y la interdependencia que llega a existir entre ellos (las actividades de un microorganismo permiten crecer a otro y viceversa). La columna de Winogradsky En contraste con los estudios sobre cultivos puros de otros microbiólogos como Pasteur o Koch. células microbianas idénticas procedentes del crecimiento celular de una única célula microbiana). como agentes infecciosos. que sólo utilizaban para la fermentación la forma L de una sustancia química con proporciones iguales de D y L. donde éstos formaban colonias (población clonal. pero el calentamiento hasta ebullición no mata a aquellos microorganismos que están en células de resistencia o esporas. mantenido sólo por la energía de la luz. además. pero se podría desarrollar en otros ciclos biogeoquímicos equivalentes para el nitrógeno. . Pasteur demuestra que la fermentación ácido-làctica es producida por un microorganismo. carbono y otros elementos. nitrógeno y azufre. Iwanovsky descubre el virus de la “enfermedad del mosaíco” del tabaco 3. Pasteur prepara la vacuna contra la rabia Año 1892. Winogradsky y Beijerinck demuestran la participación de m. Jenner prepara una vacuna contra la viruela Año 1876. Koch descubre el bacilo de la tuberculosis: Mycobacterium tuberculosis Año 1885. pensó que este hecho era debido a la actividad microbiana. dicha población clonal será la denominada cultivo axénico. El cultivo axénico consiste en inocular un a muestra de microorganismos sobre una superficie sólida nutritiva (rodaja de patata cocida). Año 1798. Observó que el producto final de la fermentación era un compuesto orgánico en constituido únicamente por moléculas en forma L. y un segundo calentamiento tras 8h mata todos los microorganismos activados anteriormente (tindalización). esta columna es un sistema completo y autónomo de crecimiento.o.o. Elaboran un método de cultivo de microorganismos denominado columna de Winogradsky. La columna de Winogradsky es una demostración clásica de cómo los microorganismos ocupan microespacios altamente específicos de acuerdo con sus tolerancias ambientales y sus necesidades vitales (requerimientos de C y energa) y que. estos investigadores se centraron en estudiar las relaciones entre diferentes tipos de microorganismos en comunidades mixtas. al cabo de un tiempo podían crecer microorganismos. Koch demuestra que el carbunco está causado por una bacteria: Bacillus anthracis Año 1880. Función de los microorganismos en las transformaciones de la materia Año 1857. responsables de las enfermedades El cultivo “axénico” y los “Postulados de Koch” Robert Koch fue el primero que desarrolló las técnicas de aislamiento de microorganismos en cultivo en medio sólido. para algunas esporas microbianas un tratamiento por calor supone la activación. 2. Años 1887/90. a columna aquí descrita se centra sobre todo en el ciclo del azufre. Laveran descubre el agente de la malaria: Plasmodium Año 1881.

 Zona aeróbica (con oxígeno) . raíces. e el 2 ambiente con alta concentración de SH y celulosa. Como resultado se liberan sulfuros que difunden a la zona superior oxigenada creando un gradiente en el que se desarrollan bacterias fotosintéticas del azufre. que a su vez es sustrato para el desarrollo de bacterias reductoras de sulfato. que se caracterizan por ser las únicas que realizan una fotosíntesis similar a la de las plantas (teoria endosimbiotica). aparecerán bacterias fermentadoras de celulosa 2 (género Clostridium) y bacterias reductoras del azufre (Desulfovibrio) generando grandes cantidades de SH . Hay dos tipos de organismos anoxigénicos: los que fermentan la materia orgánica (degradan MO inorgánica) y los que realizan la respiración anaerobia (degradación completa a CO utilizando una 2 sustancia distinta a O como aceptor de electrones).bacterias anoxigénicas En la zona inferior se desarrollan organismos que desarrollan procesos fermentativos que producen alcohol y ácidos grasos como subproducto de su metabolismo. En el nivel más bajo de la columna. En las zonas superiores pueden crecer cianobacterias fotosintéticas. se añaden restos orgánicos de diferente origen (celulosa. Las bacterias verdes del azufre (Chlorobium) procesan los sulfatos a azufre y un poco más 2 arriba.bacterias toxigénicas La parte superior de la columna es más rica en oxígeno y más pobre en azufre. se desarrolla una zona de bacterias púrpuras del azufre (Chromatium). con una concentración menor de sulfato. que será oxidado a sulfato por bacterias sulfato oxidadoras 2 (Beggiatoa y Thiobacillus).El montaje consta de un cilindro ancho de cristal que se lena con lodos ricos en materia orgánica (1/3). Sin embargo. por difusión llega cierta cantidades de SH . a lo largo de la columna se formarán diferentes poblaciones bacterianas en función de los requerimientos ambientales:  Zona anaerobia (sin oxígeno) . Un poco por encima de esta zona nos encontramos una franja de bacterias púrpuras no del azufre (Rhodospirillum y Rhodopseudomonas). . etc) y un suplemento compuesto de CaSO y CaCO (que actúan como fuente de sulfato y tampón respectivamente). la mezcla se cubre con 4 3 papel de aluminio y se deja reposar. carne.

8/03/2013.S. XX– XXI: Interacción de la Microbiología con otras disciplinas [Bioquímica. Ingeniería Industrial]  Descubrimiento de viroides y priones  Desarrollo de la quimioterapia  Desarrollo de la Biotecnología Industrial  Desarrollo de la Biotechnología Ambiental  Desarrollo de Técnicas moleculares para el estudio de los microorganismos en el ambiente 3. animales y microbios son también recursos renovables” EL PAIS 15/02/2013  “Un nuevo antibiótico nacido en el fondo del mar” EL MUNDO 05/08/2013 4. Los microorganismos como agentes de biorremediación  “Una salida para el biocombustible” EL PAIS 15/08/2013  “Debajo del oro hay arsénico” EL PAIS 18/12/2012 4. 8/07/2013. La biodiversidad microbiana como fuente de recursos:  “Plantas. LOS RETOS ACTUALES EN MICROBIOLOGÍA AMBIENTAL Noticias en prensa en el último año: 1. Bacteriófagos . Influencia de la actividad microbiana en la biosfera/geosfera/atmósfera:  “Un incremento súbito de O2 explica el origen de los animales” EL PAIS 29/07/2013  “Bacterias en las nubes” EL PAIS 30/01/2013  “El plancton es una esponja de carbono” EL PAIS 18/03/2013  “Bacterias de peso” EL PAIS 08/09/2013 2. Virus del “Mosaïco del Tabaco” B. Biología Molecular. NATURALEZA DEL MUNDO MICROBIANO Virus A. 12/07/2013  “La vida bulle en la sima del mundo” EL PAIS 18/03/2013  “El proyecto Malaespina está secuenciando genomas del océano profundo” EL PAIS 12/06/2013 3. Las últimas fronteras de la vida:  “Noticias relacionadas sobre la diversidad microbiana del lago Volstok” EL PAIS 15/01/2013.

Bacterias: Escherichia coli Levaduras: Saccharomyces cerevisiae Hongos filamentosos: Penicillum sp Protozoos Plasmodium malariae Trypanosoma gambiense .

LOS MICROORGANISMOS EN LOS HITOS ESENCIALES DE LA EVOLUCIÓN BIOLÓGICA . LOS MICROORGANISMOS EN LOS SISTEMAS DE CLASIFICACIÓN DE LOS SERES VIVOS 6.Algas unicelulares 5.

y de las cuales depende el funcionamiento de las células. ÁRBOL FILOGENÉTICO UNIVERSAL DE LOS SERES VIVOS Relaciones evolutivas basadas en la secuencia del 16S/18S rRNA .Secuencia primaria informativa (compuesta por muchos nucleótidos).7. gen rRNA. Genes rRNAs Estructuras primaria y secundaria del 16S rRNA de E. Así son moléculas estables relacionadas con los procesos de replicación.8S 8. trascripción y traducción (síntesis proteica). DNA. ANÁLISIS EVOLUTIVO DE LOS MICROORGANISMOS: EL GEN rRNA COMO RELOJ MOLECULAR ¿Qué es un reloj molecular?. 1450 bases) RNA ribosómico Procariotas 16S 23S 8S Eucariotas 18S 28S 5S 5. . gen tRNA ¿Qué reloj molecular es óptimo para medir la “evolución celular”?. Estos cambios no interfieren en la función génica (no hay presión selectiva). son moléculas presentes en todos los tipos celulares. coli (aprox. Los cambios de nucleótidos (al azar) se acumulan en la secuencia proporcionalmente al tiempo transcurrido.

(b) de una Bacteria (ancestro de la actual mitocondria) y una Arquea. o bien.9. EL ORIGEN DE LA CELULA EUCARIOTA La célula eucariota se formó por endosimbiosis primaria (a) de una Bacteria (ancestro de la actual mitocondria) y una célula primitiva con núcleo diferenciado. 10. la endosimbiosis primaria de una Bacteria (ancestro del actual cloroplasto) y un Eucariota. PRINCIPALES CARACTERISTICAS DE LOS DOMINIOS BACTERIA ARQUEA Y EUKARYA Los dominios Bacteria. provocando en la célula resultante el posterior desarrollo de un núcleo diferenciado. Posteriormente. provoco la divergencia de los eucariotas fotosintéticos. indicándonos que compartieron algún momento de su historia evolutiva. . Arquea y Eukarya presentan. no obstante. caracteres comunes entre ellos (“dos a dos”).