Table des matières

Introduction générale………………………………………………….…1
CHAPITRE 1 : ÉLÉMENTS D’IMAGERIE
MÉDICAL

1 Introduction………………………………………………………..…..2
2 Imagerie médical et objectifs………………………………….…...….3
3 Principales modalités d’imagerie médicales…………………….….....3
3.1 La radiologie………………………………………………….3
3.2 La tomodensitométrie……………………….....……….........4
3.3 L'échographie…………………………………………..........4
3.4 La spectroscopie par résonance magnétique (SRM)………...5
3.5 La scintigraphie…………………………...…………………5
3.6 La tomographie par émission de positons (TEP)……….…...6
3.7 L’imagerie par résonance magnétique (IRM)……… ……….7
3.7.1 Présentation……………………...……………...…..7
3.7.2 Utilité …………………………………………..…...8
4 Images IRM anatomiques cérébrales………………………….……....10
4.1 Présentation de séquences d’IRM ……………………...…....10
4.2 Différents coupes d’IRM du cerveau …………….………….12
5 Conclusion…………………………………………………….............13
CHAPITRE 2 : RECALAGE D’IMAGES
MÉDICALES

1In

troductio

n …………………………………………………………...14
2 Problématique et contexte de recalage ………………...…….…...…..14
3 Concept de recalage…………………………………………………..15
4 Classification des méthodes de recalage …………………………......17
4.1 La dimension des images utilisées ………………………......17
4.2 La nature de base du recalage ……………………….............17
4.2.1 Intrinsèque ………………...………………………..17
4.2.2 Extrinsèque ……………………...……………….....17
4.2.3 Recalage basé non image ……………………...…....17
4.3 Nature et domaine de transformation ………………....……..18

4.3.1 Nature de transformation …………………..….........18
4.3.2 Domaine de transformation……………...…...…......18
4.4 Procédés d’acquisition ……………………………….….....19
4.5 Interaction ……………………………………………….....20
5 Modalités en recalage d’images médicales .........................................20
5.1 Le recalage mono modalité ……………………….………...20
5.2 Le recalage multi modalité………………………….…….…20
6 Sujets de recalage et organes d’étude …………………………...…...21
6.1 Sujet………………………………………………………….21
6.2 Organe d'étude…………………………………………....….22
7 Cas de recalage d’images anatomiques cérébrales ……………..….....23
8 Mesure de similarité ……………………………………………..…...23
8.1 Critère de similarité quadratique ………………………........24
8.2 Critère de similarité bases sur la corrélation ……………......25
8.3 Le Changement de signe ………………………………........26
8.4 Le Critère de Woods ……………………………………......26
8.5 Les mesures entropiques …………………………………....25
9 Conclusion…………………………………………………………....27
CHAPITRE 3 : LES TRANSFORMATIONS EN
RECALAGE SPATIAL

1 Introduction……………………………………………………..….....30
2 Les transformations paramétriques ………………………………......30
2.1 Les transformations linéaires ………………………………..30
2.2 Les transformations non linéaires …………………………...33
3 Les transformations paramétriques ………………………………......33
4 Les primitives d’images en recalage …………………………….…...33
4.1 Définition ………………………………………………..…..34
4.2 Les types des primitives …………………………………......34
4.2.1Les primitives iconiques ……………………….........34
4.2.2 Les primitives géométriques...…………………...….34
4.2.3 Les primitives points………………………..……….34
4.2.4 les primitives lignes…………………………..…......35
4.2.5 les primitives régions………………………….….....35
5 Conclusion………………..……………………..………….…..…......35

CHAPITRE 4 : DEVELOPPEMENT PAR
APPROCHE OBJET

1 Introduction…………………………………………………………....36
2 Schémas de développement ………………………………………......36
3 Les phases d’abstraction…………………………………………..…..37
3.1 Le modèle conceptuel ……………………………….……....37
3.2 Le modèle logique ………......................................................37
3..3 Le modèle physique :…………...……… …………….…….38
4 Les outils de l’approche objet ………………………………...…..…..38
4.1Les objets ……………………………………………….....…38
4.1.1 Caractéristiques fondamentales d’un objet …..…....39
4.1.2 Les messages entre les objets …………………...…40
4.1.3 Forme de synchronisation de messages …………....41
4.2 Les classes ……………………………………..………....…41
4.2.1 Les attributs et les opérations ……………………...42
4.2.2 Représentation graphique des classes …………....42
4.2.3 Description des classes ………………..............….43
4.2.4 L’encapsulation …………………………………...43
4.3 Les relations entre les classes……………………………...43
4.4 Les hiérarchies de classes ………………………………….46
5 Conclusion…………………………………………………………...48
CHAPITRE 5 : PRINCIPE ET DEVELOPPEMENT
D'UNE METHODE DE RECALAGE

1 Introduction :……………………………………………………...…49
2 Description de la démarche :……………………………………...…49
2.1 Présentation de l’algorithme GICP ………………………...50
2.2 Processus de sélection de point (Xi et Xi') :……… …….…..53
2.3 Extraction des contours des images Source / Référence ..…53
3 Estimation avec appariement………………………………………...53
4 Cas d’étude de transformation de similitude …………………..…....54
5 Développement des algorithmes …………………………………….55
5.1 Algorithme générale ……………………………………….55
5.2 Algorithme similitude ……………………………………...56
6 Conclusion ……………………..……………………………….…..56

CHAPITRE 6 : MODEL CONCEPTUEL DE
L'APPLICATION

1 Introduction …………………………………………………….……57
2 UML …………………………………………………………….…...57
3 Les diagrammes de langage « UML » ………………………….…...59
3.1 Diagrammes des cas d’utilisations …………………............59
3.2 Diagramme de classes …………………………………........60
3.2.1 Les relations interclasses…………………….……..60
3.3 Diagrammes de comportement (behavior diagrams)……......60
3.3.1 Diagrammes d’états–transitions (state diagrams) ….60
3.3.2 Les diagrammes d’activité « activity diagrams » .....61
3.3.3 Les diagrammes de séquence…………………….....61
3.3.4 Les diagrammes de collaboration ………...…….….62
3.4 les diagrammes d’implémentation…………………..…….…63
3.4.1 Les diagrammes de composants …………………....63
3.4.2 Les diagrammes de déploiement…………………....63
4 Définition du problème …………………………………………....….63
4.1 Diagramme de cas d’utilisation ……………………….…......63
4.2 Diagramme de collaboration …………………………….......65
4.3 Diagramme de scénario………………………………….…...65
4.4 Diagramme de Classes …………………………………..…..66
5 Conclusion…………………………………………………………….66
CHAPITRE 7 : MODEL CONCEPTUEL DE
L'APPLICATION

1 Environnement Matriel ……………………………………….…..….67
2 Environnement logiciel ………………………………………….…...67
2.1 Systeme d’exploitation …………………………………..….67
3 Langage de programmation ………………………………………….67
4 Resultats exprémentaux ……………………………………………...68
Conclusion génerale………………………………………………….....73

ANNEXE : EXTRACTION DE CONTOURS

1 Introduction……………………………………………………………1
2 Opérateurs du premier ordre……………………………………......….1
2.1 Opérateurs de Roberts ………………………………………..2
2.2 Opérateurs de Prewitt et Sobel………………………….….…2
2.3 Opérateurs gradients directionnels ……………….…………..3
3 Opérateurs de second ordre ……………………………………..……..3
4 Quelques techniques de lissage………………………………………...4
4.1 Filtre Gaussien …………………………………………...…...4
4.2 Filtre moyenne mobile…………………………………...…....6
4.3 Opérateur Nagdif …………………………………………..…6
4.4 Filtre gradient inverse ……………………………………..….7
5 Approches par modèle surfacique …………………………….….…...7
5.1 Huertas et Medioni …………………………………………...7
5.2 Haralick …………………………………………………...….8
6 Approche par optimisation ……………………………….…………....9
6.1 Hueckel………………………………………………..……....9
6.2 Canny………………………………………………….…..…10
6.3 Deriche ……………………………………………….…...…12
6.4 Shen et Castan …………………………………....……….....12
7 Extraction des maximums locaux …………………………………….13
8 Conclusion…………………………………………………………….13

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