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ARCHAE

Haloquadratum walsbyi

Biol MSc Adriana Janneth Espinosa Ramrez


UPTC
Microbiologia Ambiental UPTC
Billones de aos

Microbiologia Ambiental UPTC


DESCUBRIDOR DEL TERCER
DOMINIO !!
Dr. Carl Woese
( Matemtico y
fsico
norteamericano,
PhD Biofisica
Universidad de Yale,
adscrito a la
Universidad de
Illinois)

Final de 1977,
discrimin relaciones filogenticas diferenciales entre seres vivos y
cre el rbol de la vida, descubri las ARCHAES

http://mmbr.asm.org/content/51/2/221.short
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Arbol filogentico a partir de ARN ribosomal 16s y 18s que comparten todos los
seres vivos del planeta y que apenas ha sufrido cambios desde la aparicin en la
Tierra de las primeras formas de vida microbiolgicas.

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Cavalier-Smith
Por qu estudiar Dominio Archaea ?

1. Son uno de los linajes ms antiguos de los seres vivos son


un puente de la evolucin de la diversidad incluyen el
origen de la clula eucariota

2. Son componentes de los ciclos biogeoqumicos de la


Tierra y tienen alto uso en procesos de tratamiento
biolgico de tipo anaerbio.

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The hot springs of Yellowstone National Park, USA, were among the first places
Archaea were discovered. At left is Octopus Spring, and at right is Obsidian Pool. Each
pool has slightly different mineral content, temperature, salinity, etc., so different pools
may contain different communities of archaeans and other microbes.

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Grupo 32: Arqueas Sulfato Reductoras ARCHAEAS
Archaeglobus
Manual de Sistemtica Bacteriolgica de
Grupo 33: Arqueas Halfilas Extremas Bergeys
Halobacterium
Haloarcula
Haloferax
Halococcus Grupo 31: Metanognica
Natronobacterium Methanobacterium
Natronococcus Methanobrevibacter
Methanosphaera
Grupo 34: Arqueas sin Pared Celular Methanothermus
Thermoplasma Methanococcus
Methanospirillum
Grupo 35: Termfilas Extremas e Methanohalophilus
Hipertermfilas que metabolizan el Azufre Methanosarcina
Acidianus
Sulfolobus
Thermofilum
Desulforococcus
Staphylothermus
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Dominio Archaea
Se consideraban slamente como
organismos extremfilos que vivan en
ambientes severos, como aguas termales
(termfilas) y lagos salados (halfilas),

pero se les ha observado en una gran


variedad de hbitats, como suelos, ocanos y
humedales.

Estos organismos comparten algunas


caractersticas con los procariotas y otras con
eucariotas.
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Fsiles vivientes por que viven en hbitats semejantes a
las condiciones de la Tierra primitiva.
Ambientes termales con temperaturas > a 100 C, medios
halfilos (muy salados)

Tiene las mismas estructuras que el resto de las bacterias procariotas


pero estn constituidas por compuestos qumicos diferentes.
Las diferencias a nivel molecular entre arqueas y el resto de los
procariotas son tan fundamentales que se las clasifica en grupos
distintos.
Debido a estas diferencias exhiben una ALTA RESISTENCIA a
diversos agentes fsicos y qumicos.
Actualmente se las considera ms cercanas a los eucariotas

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Tamao y forma
Dimetros 0,1 m y ms de 15 m

Diversas formas, esferas, barras,


espirales, placas, finos filamentos,
cuadradas y planas

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MEMBRANA QUIMICAMENTE DIFERENTE!!

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Archael Histones and Nucleosomes

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Estructura de Membranas de Archaea

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SALINAS DE MANAURE COLOMBIA

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Halococcus salifodinae

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Uso de Archaea en tecnologa e industria

Por ser extremfilas, en particular las resistentes a las ALTAS TEMPERATURAS


o a los EXTREMOS DE ACIDEZ O ALCALINIDAD, son una importante fuente de
ENZIMAS capaces de funcionar bajo estas duras condiciones

En la industria, las AMILASAS, GALACTOSIDASAS realizan su funcin a ms de


100 C, lo que permite la elaboracin de alimentos a altas temperaturas, tales
como leche baja en lactosa y suero de leche.

Las enzimas de estas arqueas termfilas tambin son muy estables en


solventes orgnicos, por lo que pueden utilizarse en una amplia gama de
procesos relacionados a la SNTESIS DE COMPUESTOS ORGNICOS.

Son una parte vital del tratamiento de aguas residuales, realizando la digestin
anaerbica de los RESIDUOS

Prometedores en minera paraMicrobiologia


la extraccin de metales tales
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como ORO, COBALTO Y COBRE
Arbol filogentico de Archaea basado en rRNA 16S

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Lago Hillier o Lago Rosa, Australia

Este lago localizado en la Middle Island al oeste de Australia

bacterias halfilas rojasMicrobiologia


en la corteza de la sal.
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Euryarchaeota

Altamente diverso fisiolgicamente.


Varios extremfilos ( bajos pH, altas salinidad, altas temperaturas)
1. Metangenos - anaerobios estrictos, producen metano
2. Halobacterias - aerobias mayormente.
3. Hipertermfilos - Thermococcus, Pyrococcus
4. Acidfilos
Thermoplasma: sin pared celular.

Halfilo extremo: requiere altas concentraciones de sal para vivir (>1.5M NaCl, 9%,25-35%).

Habitat: salinas (agua de mar estancada 2,5%), lagos salados naturales, alimentos en
salazn
.
Quimioorgantrofos aerobios (mayora) o anaerobios (fermentadores o resp anaerobia)

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ACIDOFILOS

Rio Tinto Huelva


Espaa pH 2

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Euryarchaeota
Incluye los metangenos, halfilos extremos, , arqueas sin
pared como Thermoplasma,, sulfato reductoras y hetertrofos
hipertermfilos.

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Taxonoma de Halfilos Extremos
14 gneros
Divisin por fisin binaria, no esporulan
Generalmente inmviles.
Algunas con plsmidos gigantes
Pared celular: glicoprotena estabilizada por iones Na+

Balance osmtico mantenido por:

- acumulacion de solutos intracelular


- sintesis de solutos.
- bombeo de iones Na+ y K+.

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Halobacterium salinarum
Euryarchaeota: Halfilos extremos
Ante la baja tensin de oxgeno:

Algunas son capaces de sintetizar ATP mediada por luz, en anaerobiosis.


Bacteriorrodopsina y retinal (carotenoide) en la membrana: absorben luz y
catalizan la gnesis de fuerza motriz de protones.
Crecimiento lento en anaerobiosis.

Poseen grandes cantidades de


carotenoides en anaerobiosis.

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Composition Inica de algunos ambientes altamente salinos

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Micrographs Halophile Halobacterium salinarum

Dividing cell

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Glycoprotein subunit structure on the cell wall


Euryarchaeota: Metangenos
Productoras de metano (CH4) por metanognesis.
El metano es gas combustible. Methanobacterium
Quimioorgantrofos Methanococcus
Anaerobios estrictos, mesfilos (en gral.) Methanosarcina
Respiracin anaerobia: dador H2 y CO2 aceptor (en gral.)

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Habitats of Methanogens

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Micrographs of Cells of Methanogenic Archaea

Methanobrevibacter Methanobrevibacter
ruminantium arboriphilus

Methanospirillum
hungatei Microbiologia Ambiental UPTC
Diversidad de Metangenos

Diversas paredes qumicamente diferentes


Pseudomureina ( Methanobacterium,
Methanobrevibacter)

Metanocondroitina (Methanosarcina)
- (N-acetilgalactosamina + cido glucuronico)n

Proteinas o glicoproteinas (Methanocaldococcus)

Capa S ( Methanospirillium)

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Micrographs of Thin Sections of Methanogenic Archaea

Methanobrevibacter ruminantium

Methanosarcina barkeri

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Hyperthermophilic and Thermophilic Methanogens

Methanocaldococcus jannaschii

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Sustratos Convertidos a Metano por Metangenos

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Fig. 1. Interacciones microbianas en el proceso de degradacin anaerobia

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Tabla 2. Productos Metablicos liberados durante la fermentacin
anaerobia de diferentes polisacridos por cepas
puras de bacterias anaerobias

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Algunas de las especies de bacterias
homoacetognicas que han sido
mayormente estudiadas son:

- Clostridium thermoaceticum
- Acetobacterium woodii
- Clostridium formicoaceticum
- Peptostreptococcus productos
- Eubacterium limosum
- Clostridium thermoautotrophicum
- Acetogenium kivui

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Fig. 3. Rutas metablicas de la
metanognesis: hidrogenotrficas
(flechas de lneas dobles),
acetoclsticos (flechas
slidas) y metilotrficos (flechas
de lneas quebradas grises).

La ruta hidrogenotrfica puede


operar de formato o
H2/CO2, obtenindose un
potencial reducido de formato o
de H2, respectivamente.

La ruta acetoclstica obtiene


electrones de la oxidacin de CO
producido por la divisin del
acetato. La ruta metalotrfica
puede operar en dos
vas: (1) los compuestos
metilados C-1 son fuente del
grupo metil as como de
electrones (una molcula oxida a
CO2 y provee de electrones por
cada tres molculas que se
reducen a metano, flechas verdes
punteadas). Y (2), los
compuestos metilados C-1 se
reducen a metano usando
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electrones del H2.
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Caractersticas de Archaea metanognicas

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Caractersticas de Archaea metanognicas

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Euryarchaeota: Thermoplasmatales
Termfilos y acidfilos extremos
Thermoplasma
Thermoplasma:

Quimioorgantrofo
Crecimiento ptimo: 550C y pH 2
Aerobios facultativos (respiracin aerbica o
anaerbica con S)

Sin pared celular

Inmviles o flageladas

Habitat: sulfataras volcnicas o pilas de carbn.

Pila de carbn, pirita, etcMicrobiologia Ambiental UPTC


Euryarchaeota: Thermoplasmatales

Thermoplasma

Membrana celular nica: con lipoglucano y glucoproteinas.


Estable a condiciones cidas, altas temperaturas.

Genoma pequeo.

DNA asociado a estructuras


esfricas (~histonas)
Monocapa lipdica: tetrater de lipoglucano

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Euryarchaeota: Thermoplasmatales

Ferroplasma

Quimiolittrofo: oxida ion ferroso a frrico (Fe2+ ---> Fe3+)


Acidfilo, pero no termfilo
Crece en minas de pirita (FeS)

Picrophilus
Acidfilo extremo: pH ptimo 0.7
Posee pared celular (capa S)
Quimioorgantrofos

http://microbewiki.kenyon.edu/index.php/Acid_mine_drainage

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DRENAJE ACIDO MINERIA CARBON SAMACA BOYACA

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Arbol filogentico de Archaea basado en rRNA 16S

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Crenarchaeota
Mayora de las especies cultivadas son extremfilas
Especies termfilas y algunas psicrfilas.
Especies marinas mesfilas.
Muchas quimiolitoauttrofos.

Hipertermfilos son anaerobios estrictos:


Quimioorgantrofos (fermentacin raramente) o quimiolittrofos.

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Crenarchaeota hipertermofilos
aerobios y
anaerobios.

Aerobios son ms
acidfilos

anaerobios son
frecuentemente
neutrofilos.

Iitotrofa del azfre

Pyrodictium abyssi. Optimo temperatura 97-105 C. Un auttrofo facultativo


usa H2 o compuestos orgnicos como
Microbiologia donador
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Ultraestructura de Pyrodictium abyssi : En caldo celulas son
delgadas esferas (A), compuestas de una red 3-
D de clulas y tbulos (B). Morfologa tpica de archaea con un bucle
flagelar y capa S (C). Clulas en forma discal (D).

A B C

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Crenarchaeota No cultivadas Aislados del suelo y
del mar

En suelo representan
el 1 % de los
procariotas,

en algunas aguas
marinas por encima
del 30 %.

Mesofilica y psicrfilas

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Crenarchaeota: Hipertermfilos en habitat terrestre volcnico

Sulfolobales:

Crece en manantiales calientes (hasta 900C) ricos en S y pH 1-5.


Quimiolittrofo aerbico (oxida H2S o S0), auttrofo (o mixtrofo).
Ej. Sulfolobus

Thermoproteales:

Manantiales calientes pH 6-7


Ej. Thermoproteus, Thermophilum: Anaerobios estrictos,
quimioorgantrofos: resp anaerobia basada en S.
Pyrobaculum: aerobio facultativo: resp aerobia o anaerobia.

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TIPOS NUTRICIONALES archae hipertermofilas

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Virus de Sulfolobus (extremfila termofilas acidfila)
A. SIFV, un virus flexible con ADN lineal. B. SIRV2. C. SSV1, virin
en forma de huso con un genoma de ADN circular, D. SNDV, un virus
en forma de gota con una larga "barba". Las barras de escala = 0.2
m

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Fuentes hidrotermales submarinas

Grandes cantidades de material inorgnico reducido.


Productores primarios: quimiolitoauttrofos.
CO2 abundante en forma de CO3= y HCO3-
Quimiolittrofos oxidadores de S: Thiobacillus, Thiomicrospira, Beggiatoa
Algunos viven en asociacin con animales: gusanos tubcolas.

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Crenarchaeota: Habitat volcnicos submarinos
Arqueas ms hipertermfilos: crecimiento ptimo >1000C.
Paredes celulares formadas por glicoprotenas.

Pyrodictium: anaerobio estricto, quimiolittrofo (dador H2, aceptor S0) o


quimioorgantrofo.
Pyrolobus: crece entre 90 y 1130C. Quimiolittrofo (dador H2, aceptores S0, nitrato),
auttrofo, anaerobio.

Pyrolobus
Pyrodictium

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Crenarchaeota: No termoflicos

Ambientes marinos y terrestres,


en todo el mundo.
Reconocidos en muestreo
ambiental
Planctnicos y muy numerosos
(40% de la microbiota submarina)
Quimiolittrofo aerbico
(amonaco a nitrito), auttrofos.
Rol importante en el ciclo del
nitrgeno y Carbono en el mar.

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'Nanoarchaeum equitans-Ignicoccus
sp. coculture.

a, Freeze-etched cell of Ignicoccus and


four attached cells of 'Nanoarchaeum',
showing their crystalline S-layer with
sixfold symmetry.

b, Ultrathin section of two cells of


'Nanoarchaeum' attached to the outer
membrane of Ignicoccus.

c, Cell of Ignicoccus, with several cells


of 'Nanoarchaeum' attached on the left
side; platinum-shadowed.

d, Confocal laser scanning micrograph


after hybridization with the CY3-
labelled probe 515mcR
('Nanoarchaeum') and rhodamine-
green-labelled probe CREN499R
(Ignicoccus). A-D, Scale bar, 1.0 m.
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TALLER
Favor revisar y entender el artculo sobre el Mar Muerto

Reconocer principales condiciones Fisicoqumicas de este ambiente

Grupos de arqueas y eucariotes presentes

Utilidad de la Metagenmica

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