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Revista Mexicana de Biodiversidad


Revista Mexicana de Biodiversidad 88 (2017) 485486
www.ib.unam.mx/revista/

Resena

M. Kry y J. A. Royle. 2016. Applied hierarchical modeling y Gardner, 2014). La importancia y belleza de los modelos
in ecology: analysis of distribution, abundance and species jerrquicos consiste en que permiten modelar simultneamente
richness in R and BUGS. Vol. 1 Prelude and static models. el proceso de estado o ecolgico (abundancia, distribucin y/o
Academic Press, London, UK. 783 Pp. [ISBN: 978-0-12- riqueza) y el proceso observacional (probabilidad de deteccin).
801378-6] Este aspecto es central y muchas veces obviado cuando se estima
el tamano poblacional sin considerar a la vez la probabilidad de
El ttulo de este libro consta de 4 partes y quiero empezar deteccin la cual habitualmente es menor a 1 (Thompson, 2004).
por la segunda: Analysis of distribution, abundance and spe- El enfoque jerrquico es una manera natural de abordar este pro-
cies richness. Se han escrito libros con ttulos similares: The blema de las estimaciones diferenciando la aportacin que tiene
distribution and abundance of animals (Andrewartha y Birch, el proceso de estado y las que tiene el proceso observacional;
1964), Ecology: the experimental analysis of distribution and adems de que incorpora covariables que pueden estar asocia-
abundance (Krebs, 1978) y otros que en su contenido abordan das a uno u otro proceso. Esto se hace a travs del empleo de
este tema. De hecho, una definicin de ecologa es el estudio los modelos lineales generalizados con distribuciones de erro-
de los factores que determinan la distribucin y abundancia de res tipo Poisson, binomial y Bernoulli al tratarse de datos de
las especies. Es decir, la ecologa tiene que ver con el nmero conteos y/o presencia/ausencia. Adems, en estos modelos se
de individuos o especies en una poblacin o de una comunidad, estima la probabilidad de deteccin condicional al modelo que
respectivamente. Estos 3 parmetros, la abundancia, ocupacin estima la abundancia y/o ocupacin. Para algunos esto podra
(distribucin) y riqueza, frecuentemente son el tema central resultar desconocido y es lo que hace novedoso este libro.
de muchos trabajos de tesis, investigaciones cientficas y con La tercera parte del ttulo: in R and BUGS enfatiza las
aplicacin directa en la conservacin y manejo de la vida sil- herramientas analticas empleadas para la solucin numrica de
vestre. Adems, se han escrito libros dedicados exclusivamente los modelos jerrquicos: el enfoque frecuentista o de verosimi-
a la estimacin de estos parmetros, por citar algunos: Dis- litud, y el enfoque bayesiano actualmente en auge en el trabajo
tance sampling: estimating abundance of biological populations ecolgico. Para el primer caso emplea como herramienta de
(Buckland, Anderson, Burnham y Laake, 1993), Occupancy clculo el paquete R unmarked (Fiske y Chandler, 2011),
estimation and modeling: inferring patterns and dynamics of mientras que para el segundo enfoque emplea el lenguaje de
species occurrence (MacKenzie et al., 2006) y EstimateS: sta- programacin Bayesian Using Gibbs Sampling (BUGS) en las
tistical estimation of species richness and shared species from 2 plataformas WinBUGS y OpenBUGS, y tambin Just Anot-
samples (Colwell, 2013). her Gibbs Sampling (JAGS) (Lunn, Jackson, Best, Thomas
Entonces qu tan novedoso es el libro de Kry y Royle? y Spiegelhalter, 2013). Particularmente, el libro de Kry y
La respuesta tiene que ver con la primera parte del ttulo: Royle aqu resenado es prcticamente un tratado del paquete
Applied hierarchical modeling in ecology. En este libro se unmarked para abordar modelos de ocupacin, N-mixtos y
analizan muchos y variados modelos jerrquicos acerca de las 3 de muestreo de distancia empleando modelos de mxima vero-
variables de estado para describir las poblaciones y comunida- similitud. Otra caracterstica que resulta muy atractiva es que
des: abundancia, ocupacin (distribucin) y riqueza de especies. en todo el libro se encuentran cdigos o rutinas R para analizar
Este enfoque de modelos jerrquicos es un tema relativamente muy variados modelos jerrquicos con enfoque bayesiano en
reciente y se ha abordado en diferentes libros de los mismos auto- BUGS. En mi opinin esto hace que el libro no solo profundice
res tales como: Hierarchical modeling and inference in ecology: en los aspectos conceptuales sino que adems lo convierte en
the analysis of data from populations, metapopulations and com- un manual prctico donde uno puede ir siguiendo paso a paso
munities (Royle y Dorazio, 2008), Bayesian population analysis los diferentes procedimientos. Esto enriquece enormemente al
using WinBUGS: a hierarchical perspective (Kry y Schaub, lector y favorece el entendimiento y la adopcin de los modelos
2012) y Spatial capture-recapture (Royle, Chandler, Sollmann jerrquicos para aplicarlos no solo en esta rea de la ecologa de

http://dx.doi.org/10.1016/j.rmb.2017.03.028
1870-3453/ 2017 Universidad Nacional Autnoma de Mxico, Instituto de Biologa. Este es un artculo Open Access bajo la licencia CC BY-NC-ND
(http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/).
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la estimacin de la abundancia, distribucin y riqueza, sino en oportuno y prctico que todo eclogo debera conocer. Para
otras reas no abordadas en el libro. finalizar, dentro de muy poco tiempo estos mismos autores
La cuarta parte del ttulo Vol. 1 Prelude and static models publicarn el segundo volumen titulado: Applied hierarchical
tiene que ver con las 2 secciones en que se divide el libro el modeling in ecology: dynamic and advanced models. . .!
cual est integrado por un total de 11 captulos. En el cap-
tulo 1 se introducen los conceptos de distribucin, abundancia Referencias
y riqueza de especies en ecologa pero desde un enfoque del
llamado proceso de puntos. El captulo 2 describe qu son los Andrewartha, H. G. y Birch, L. C. (1964). The distribution and abundance of
modelos jerrquicos y cmo se analizan. En el captulo 3 se animals. Chicago: University of Chicago Press.
Buckland, S. T., Anderson, D. R., Burnham, K. P. y Laake, J. L. (1993). Dis-
hace una introduccin, general pero muy ilustrativa y prctica, tance sampling: estimating abundance of biological populations. London:
de los modelos lineales generalizados, con efectos aleatorios y de Chapman and Hall.
los modelos jerrquicos. El captulo 4 introduce funciones para Colwell, R. K. (2013). EstimateS: statistical estimation of species richness
simular datos como una herramienta poderosa que se emplea and shared species from samples. Version 9. Users Guide and application.
constantemente en este libro como procedimiento para evaluar Recuperado de: http://purl.oclc.org/estimates
Fiske, I. y Chandler, R. (2011). Unmarked: an R package for fitting hierar-
el desempeno de los modelos, previos a su empleo con datos chical models of wildlife occurrence and abundance. Journal of Statistical
reales o tomados en campo. El captulo 5 introduce a diversas Software, 43, 123.
tcnicas para el ajuste de modelos empleando modelos bayesia- Kry, M. y Schaub, M. (2012). Bayesian population analysis using WinBUGS:
nos con los programas BUGS y JAGS. La segunda parte del libro a hierarchical perspective. Waltham, MA: Elsevier Academic Press.
Krebs, C. J. (1978). Ecology: the experimental analysis of distribution and
est constituida por 6 captulos. En el captulo 6 se introduce
abundance. New York: Harper and Row.
el modelo de la abundancia a partir del conteo de individuos Lunn, D., Jackson, C., Best, N., Thomas, A. y Spiegelhalter, D. (2013). The
no marcados en poblaciones cerradas, los llamados modelos BUGS book: a practical introduction to Bayesian analysis. Boca Raton:
N-mixtos o bien modelos N-mixtos tipo Binomial-Poisson. El CRC Press, Taylor & Francis Group.
captulo 7 profundiza en estos modelos empleando los llamados MacKenzie, D. I., Nichols, J. D., Royle, J. A., Pollock, H. H., Bailey, L. L.
y Hines, J. E. (2006). Occupancy estimation and modeling: inferring pat-
modelos multinominales N-mixtos donde se tienen historias de
terns and dynamics of species occurrence. Waltham, MA: Elsevier Academic
captura-recaptura de individuos. Para aquellos que alguna vez Press.
empleamos el paquete DISTANCE para estimar el tamano Royle, J. A., Chandler, R. B., Sollmann, R. y Gardner, B. (2014). Spatial capture-
poblacional a partir de datos de distancia (Buckland et al., 1993), recapture. Waltham, MA: Elsevier Academic Press.
el captulo 8 es toda una revelacin porque introduce el empleo Royle, J. A. y Dorazio, R. M. (2008). Hierarchical modeling and inference
in ecology: the analysis of data from populations, metapopulations and
de modelos jerrquicos empleando muestreos de distancia. En
communities. London: Academic Press.
el captulo 9 se profundiza analizando modelos ms avanzados Thompson, E. L. (2004). Sampling rare or elusive species: concepts, designs and
basados tambin en datos de distancia. El captulo 10 aborda uno techniques for estimating population parameters. Washington, D.C: Island
de los temas ms frecuentes y de moda en estos das, la mode- Press.
lacin de la ocupacin o distribucin de especies empleando
modelos de ocupacin de sitios, pero incorporando la probabi- Salvador Mandujano
lidad de deteccin como en los dems modelos jerrquicos de Red Biologa y Conservacin de Vertebrados, Instituto
los captulos previos. Finalmente, en el captulo 11 se introdu- de Ecologa A.C., Km 2.5 Carretera Antigua Coatepec
cen los modelos jerrquicos aplicados para estimar la riqueza de Nm. 351, Congregacin del Haya, 91070 Xalapa,
especies en las comunidades. Veracruz, Mxico
Considerando que la estimacin de la abundancia, ocupacin Correo electrnico: salvador.mandujano@inecol.mx
(distribucin) y riqueza de especies son temas constantes
en los trabajos de investigacin cientfica con implicaciones Recibido el 24 de octubre de 2016;
importantes para la conservacin y manejo de las poblaciones aceptado 9 de febrero de 2017
y especies, en mi opinin este es un libro muy interesante, Disponible en Internet el 11 de mayo de 2017