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05 NOTAS ESTADISTICAS (018-020) 21/1/05 13:27 Página 18

Abraira V. Inferencia estadística bayesiana

notas estadísticas
Inferencia estadística bayesiana
V. Abraira
Unidad de Bioestadística Clínica. Hospital Ramón y Cajal. Madrid. Nodo de la Red MBE.

Una de las objeciones que se hacen contra los contrastes de One of the objections made against the hypothesis tests is
hipótesis es que el valor p es mal interpretado con mucha fre- that the p value is frequently misinterpreted. Bayesian met-
cuencia. Los métodos bayesianos son una alternativa muy hods are a very attractive alternative which offer a very na-
atractiva que permiten presentar los resultados de una forma tural and intuitive result. In addition, results from previous
muy natural e intuitiva, además permiten incluir en el proce- studies can be included in the inferential process by Baye-
so inferencial los resultados provenientes de estudios previos. sian methods.

Palabras clave: inferencia bayesiana, contraste de hipótesis. Key words: bayesian inference, hypothesis tests.

En la nota dedicada a los contrastes de hipótesis1 se seña- la padezca es 0,6. Es decir, el hecho de que ocurra un su-
laba que la interpretación errónea más frecuente que se ceso, en este caso ser un anciano institucionalizado, pue-
hace de ellos, en los artículos publicados en las revistas de cambiar la probabilidad de otro, en el ejemplo, pade-
médicas, consiste en interpretar el valor p como la proba- cer incontinencia fecal. A esta última probabilidad se le
bilidad de que la hipótesis nula sea cierta y que, por lo tan- denomina probabilidad condicionada del segundo suceso
to, un resultado “significativo”, es decir, un resultado para (incontinencia) condicionada a, o dado, el primero (ser
el que el valor p sea pequeño, significa que es muy impro- anciano institucionalizado). El cambio en la probabilidad
bable que la hipótesis nula sea cierta. Seguramente este condicionada, respecto a la probabilidad sin condicionar,
error es tan frecuente porque ésta es la interpretación con es tanto mayor cuanto más relacionados están los sucesos.
la que los investigadores se sienten más cómodos, la que El proceso de realizar la historia clínica, explorar y reali-
resulta más fácil e intuitiva. El problema es que no es co- zar pruebas complementarias para diagnosticar una en-
rrecta: recordemos que el valor p es la probabilidad del re- fermedad es un ejemplo de uso de este principio. Los clí-
sultado obtenido, u otro más alejado de la hipótesis nula, nicos, buscan (anamnesis), o provocan (pruebas
si la hipótesis nula fuera cierta. Es una medida de la dis- diagnósticas) los sucesos que, dado que han ocurrido,
crepancia de los datos con la hipótesis, pero no es la pro- más puedan cambiar la probabilidad de la posible enfer-
babilidad de que la hipótesis sea cierta, ya que se ha cal- medad que están considerando. En general, los médicos
culado aceptando que lo sea. lo hacen de forma intuitiva, pero el cambio de la proba-
Para comprender bien esa diferencia, hay que entender bilidad de un suceso incierto (padecer una determinada
el concepto de probabilidad condicionada que concierne enfermedad), debido a la ocurrencia de otros sucesos re-
a un suceso bajo el supuesto de la verificación de otro2. lacionados (síntomas o resultados de pruebas diagnósti-
Por ejemplo, si la incontinencia anal afecta al 2,2% de la cas) se puede formalizar mediante el teorema de Bayes.
población general, pero al 60% de los ancianos institu- Una de las formas más sencillas de este teorema se vio en
cionalizados3, la probabilidad de que un individuo cual- la nota dedicada a los índices de rendimiento de las prue-
quiera la padezca es 0,022, pero si el individuo es un an- bas diagnósticas4 y es:
ciano internado en una residencia, la probabilidad de que
oddspost = CPR × oddspre

Recuérdese que se denomina odds al cociente entre la
probabilidad de que un evento (en este caso “estar en-
Correspondencia: V. Abraira. fermo”) ocurra y la probabilidad de que no ocurra. Los
Unidad de Bioestadística Clínica. subíndices post y pre indican posprueba, o condiciona-
Hospital Ramón y Cajal.
Ctra. Colmenar km 9,100. 28034 Madrid. do al resultado de la prueba, y preprueba, respectiva-
Correo electrónico: victor.abraira@hrc.es mente y CPR es el cociente de probabilidad del resultado

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que resume la información contenida en los datos. la probabilidad de que el pacien. dada la hipótesis alternativa) los datos y que puede usarse tanto en la inferencia como en la toma de decisiones. sis. este resultado se puede interpretar de tres ma- cierta dados los datos observados. ción de Internet: http://dxsp. rior para obtener la probabilidad condicionada a este re. después del experimento. partida entre 0 y 1. para que. bajo la hipótesis nula que bajo la alternativa. en un ensayo Nótese que con esta forma de hacer la inferencia. La cómo los datos observados en el estudio cambian la pro. Los defensores del méto. repre- evaluación. siempre subjetivo. de fuerza que la alternativa.sergas.es/. se prohíbe la transmisión de este documento por cualquier medio o formato.9 que presumiblemente aumentará un método que lo permite formalmente y que. con este formalismo. que es la forma más na.31(1):18-20 19 . puede descargarse desde la direc- caprichoso y argumentan que es inevitable que los inves. aun. Inferencia estadística bayesiana de la prueba. vistas médicas es muy minoritario. La fórmula anterior se suele representar co. ya incorpora su grado de convicción. probabilidad. esta in- para interpretar. incorporar al proceso infe. ahora. clínico que compara dos tratamientos. como una puerta abierta a la hacer los cálculos necesarios. sino un cociente de probabilidades. Se pue- de decir que el FB es el índice a través del cual “hablan” los datos y está separado de la parte subjetiva de la ecuación. sin embargo. es decir: estudio de evaluación de pruebas diagnósticas se comuni- can los CP. Sin embargo. Esta interpreta- Otra ventaja importante del método bayesiano es que ción es la que permite cuantificar la probabilidad de la hi- permite. Hay también una tigadores tengan sus convicciones sobre las hipótesis que tendencia emergente entre los editores de revistas médicas evalúan y que. en lu. que lo hagan explícitamente. dicho de manera muy poco rigurosa. esta incorporación se ha señalado también como menos en parte. Si se tienen dificultades con la incorporación de la proba- gar del CP. por ello. La forma habitual de usar este método consiste5 en ex- sultado. es decir el exa. Podríamos pensar. se expresa tam- babilidad. es ésta la primera ventaja del método hipótesis alternativa con el doble de fuerza que la nula. no de estar enfermo. por lo tanto. si se tiene una va- rencial los resultados procedentes de estudios previos. o no informativo6 y que consiste en asignar a los posibles resultados de la prueba. por ejemplo. dores que lo usan optan por usar el denominado prece- te tenga la enfermedad y se deberían conocer los CP de dente plano. tende modestamente contribuir a su difusión. la cantidad de artículos que lo hagan. Como se vio entonces con un ejemplo4. lo que obligará a los hace posible un “análisis de sensibilidad”. ya que los paquetes estadís- subjetividad del investigador. dan provocar en el resultado final6. es la interpretación que los investigadores tienden a 1) Los resultados observados son la mitad de probables dar erróneamente al valor p de los contrastes de hipóte. sino de la hipótesis en bién como una distribución. una vez la hipótesis una probabilidad previa uniformemente re- conocido el resultado. A partir del odds se puede fácilmente sis nula es que no hay diferencia entre ellos. pótesis nula después del experimento. otra apro- mo: ximación al método7 que resalta el hecho de que el teorema de Bayes tiene dos componentes. yen. o equivalentemente. que com- FB = para dos hipótesis respecto a su capacidad para predecir Prob (datos. loración previa. donde los odds son. en el que la hipóte- sultado es el odds. el FB. dada la hipótesis nula) babilidad. los de la hipótesis nula y. Recuérdese que la imposibilidad de hacerlo es una de las Hasta ahora el uso de los métodos bayesianos en las re- críticas más importantes al método convencional1. dificultad del método. en español y que contiene una do bayesiano recuerdan que subjetivo no es sinónimo de ayuda muy didáctica.elsevier. empieza a haber programas fáciles de usar que los inclu- ca de la hipótesis en evaluación. se encuentra calcular la probabilidad4 de que la hipótesis nula sea que FB=1/2.Documento descargado de http://www. se debería estimar. el denominado factor de Bayes (FB) que. el resultado de corporación del conocimiento previo sí parece ser una una prueba diagnóstica. se pueda aplicar la fórmula ante. no es una pro- Prob (datos. EPIDAT. de un modo u otro. acer. con de las investigaciones8. Sin em. 05 NOTAS ESTADISTICAS (018-020) 21/1/05 13:27 Página 19 Abraira V. El FB. neras: tes. a diferencia del valor p. también interesa ver mo un rango de valores posibles en el intervalo (0-1). presar la probabilidad a priori como una distribución de De modo similar se puede aplicar este formalismo al probabilidad o. Esta nota pre- men de las modificaciones que distintas convicciones pue. ya que la mayoría de los investiga- tomatología e historia. Si. puesto que el investigador ticos más difundidos no las incorporan. Uno de ellos. bilidad a priori. sentadas de forma gráfica. a través del oddspre. Existe. del mismo modo que en un forma. que como se dijo an. la mitad respecto al odds previo al ensayo. se puede comunicar como resultado de la que en este contexto cambia de nombre. 2) Los resultados avalan la hipótesis nula con la mitad tural e intuitiva de expresar los resultados de la inferen. Copia para uso personal. médicos a familiarizarse con estos métodos. al bargo. Seguramente debido. por lo tanto. generalmente. basado en el teorema de Bayes con respecto al método 3) Los resultados reducen el odds de la hipótesis nula a convencional. 39 SEMERGEN 2005. En este caso. En todo caso.es el 25/05/2016. a la falta de herramientas adecuadas para una debilidad del método. a fomentar interpretaciones bayesianas de los resultados Más vale. por ello. el re. siempre las incorporan. tiene la misma inferencia simplemente el FB. Ambas. co- contraste de hipótesis. uno que incor- oddspost = FB × oddspre pora la apreciación de conocimientos previos y otro. avalan la cia y. por su sin.

2. 1. Abraira V. Córdoba Díaz de Laspra E. Benavides A. Davidoff F. 20 SEMERGEN 2005.15:341-6. SEMERGEN 2002. 3. Bayes Factor. Bayarri MJ. Abraira Santos V. Toward Evidence-Based Medical Statistics. Índices de rendimiento de las pruebas diagnósticas. Muñoz A. 2002.28:193-4.es el 25/05/2016. Copia para uso personal. sianos. Arri. Abraira V. Inferencia estadística bayesiana BIBLIOGRAFÍA 5. 6.30:218-22. Arribas del Amo D. Debate sobre métodos frecuentistas vs baye- 28:374-5. 9. Madrid: Centro 7.elsevier.14:482-94.119:252-3. Goodman SN. Cobo E. Ann Intern Med 1999. 2: The de Estudios Ramón Areces.Documento descargado de http://www. Silva LC. Gac Sanit 2001. SEMERGEN 2004. Latorre Sahún A. Standing statistics right side up. El enfoque bayesiano: otra manera de inferir. 4. 8. Una oportunidad para Bayes. bas del Amo R. Pérez de Vargas A. Bioestadística. Silva LC. 05 NOTAS ESTADISTICAS (018-020) 21/1/05 13:27 Página 20 Abraira V. Gac Sanit 2000. 130:1019-21. Med Clin (Barc) SEMERGEN 2002. Ann Intern Med 1999.130:1005-13.31(1):18-20 40 . Incontinencia anal. 1996. se prohíbe la transmisión de este documento por cualquier medio o formato. Contrastes de hipótesis: el valor p.