CLASE 5 BIOLOGIA (PARTE1

)

Anteriormente se dijo que existian en la replicacion unas secuencias que se llamaban origenes de
replicacion, origen donde una hebra se separaba de la otra y participan todas las proteinas como
toposomerasa, ADN primasa, etc. En la transcripcion, es sintesis de ARN mensajero, la que trabaja
es la ARN polimerasa.

Si para replicar necesito ubicar el origen de la transcripcion, para transcribir necesito encontrar
una secuencia que me dice “ soy un gen” y esa secuencia se denomina promotor, marca donde
esta el gen y le dice al arn polimerasa que en unos pasos mas alla (hacia la derecha)debe comenzar
a transcribir. La caja TATA es una secuencia que esta en el promotor (en bacterias y eucariontes).

Una vez que el mensajero esta sintetisado, es utilizado para hacer la sintesis de proteinas. Existen
3 tipos de ARN:

-ARN mensajero= Codifica proteinas

-ARN ribosomal= forman parte del ribosoma y de la sintesis de proteinas

- ARN transferencia=Son los que traducen las proteinas.

- ARN pequeños = son una nueva forma de plantear ARN que tienen que ver con procesos como el
esplaisis , que estan en relacionados con los intrones( que no se encuentran los los arn maduros).
Por lo tanto , estos ARN tienen que ver con la sacada de cada uno de los intrones desde un
precursor de mensajero eucarionte.

TRANSCRIPCION

La enzima que trabaja aqui y hace todo el trabajo es el ARN polimerasa, enrollo, desenrolla,
sintetisa el partidor, evita que las hebras se peguen,etc. Tiene dominio de topoisomerasa es decir
la capacidad de tomar el ADN, separar una hebra de la otra he ir desenrollando, y a medida que se
va moviendo detras de ella va a ir reenrollando el ADN. Por esa razon no hay helicasa, ni
toposomerasa ni primasa. La primasa no sirve aqui porque sintetisa arn usando como molde adn.
Por lo tanto un ADN polimerasa si requiere una primasa en cambio el ARN polimerasa no la
necesita porque ella hacn el trabajo completo.

Se va a reconocer una region del ARN que se llama promotor, la misma actividad helicasa que
tiene el arn polimera permite que el ADN se separe y la hebra que tiene la señal es la conocida
para usarla como molde por ejemplo si la hebra de arriba tiene puras AAA la hebra
complementaria tendria puras TTT, en cambio el ARN que se va a sintetisar tendra puras UUU
porque toma la primera hebra para transcribir.

Al oprimir, como en replicacion, se separan las hebras, la tomoisomerasa se mueve hacia la
derecha, la helicasa la sigue y la hebra lider se sintetisa en el mismo sentido, ARN polimerasa se

delta y elthon. el primer nucleotido que llega tiene su 5 prima K libre y su 3 prima OH libre. agarro el ADN de doble hebra. todo esto no lo tiene las bacterias porque las bacterias no tienen membrana nuclear. cola poli A y que tengas unica y exclusivamente exones.mueve de 5 a 3 prima polimerisando pero desplazandose al reves que la hebra molde y la diferencia es que ire poniendo ribonucleotidos ( si hay una A pongo una U. tecnicamente le pusieron +1 o el inicio de la transcripcion. Y el tercer nucleotido va a quedar 3 nucleotidos con un 5 prima k y un 3 prima OH y siempre se iran agregando nucleotidos al 3 prima. solo se van a transportar mensajeros que tengan 5 prima K. Por eso se debe conservar la ubicacion de la caja TATA. si hay una G pongo una C). las bacterias tienen una sola ARN polimerasa formanda por . gama. Si el ARN mensajero esta maduro se quedara en el nucleo y no va hacer traducido. La cola poli A y el esplaisi. El molde depende si estoy haciendo transcripcion o traduccion. II Y III. ese sitio que es donde empieza la polimerasa a transcribir. Copia de 5 a 3 prima porque cuando se transcribe se debe seguir la regla que es copio al hongo primeriso porque cuando se enloga lo que llega es un nucleotido trifosfato. La caja tata se encuentra 10 nucleotidos antes de que la arn polimerasa se ponga a transcribir. los separo. ESTRUCTURAS DE PROMOTORES DE PROCARIONTES El 5 prima k . eso significa que el - 35. el -1000 va a terminar de ser negativo cuando termine el gen. en bascterias y en eucariontes. va a quedar dos nucleotidos con un 5 prima K y un 3 prima OH. Desenrolla donde va partiendo y enrolla donde va termiando. Cuando el ARN polimerasa esta terminando de copiar en algun momento al separar las dos hebras de ADN se genera una estructura secuendaria como una especie de laso y eso significa que la ttranscripcion termino. Los genes descubrieron los arn polimerasas pero les pusieron los nombres alreves es decir. Todo lo que se encuentra antes de la transcripcion tiene un valor negatico y todo lo que se encuentra durante la transcripcion tiene un valor positivo por nomenclatura. encambio los eucariontes tienen una cariteca que diferencia lo que vamos a traducir con lo que no se debe traducir. ARN POLIMERASAS DE EUCARIONTES Las bacterias tienen 3 ADN polimerasas denominadas I. Nosotros tenemos ADN polimerasas alfa. beta. copio el molde y una vez que lo copie lo vuelvo a enrollar detras. El ARN polimerasa SIEMPRE reconoce a la marca(tata) y no a la complementaria de la marca. Por esto no necesita ni a la helicasa ni a la topoisomerasa porque el ARN polimerasa hace todo. La ARN polimerasa necesita encontrar dos marcas para funcionar una de ellas es la caja TATA y la secuencia menos 35. la cosa es que la caja tata esta en una sola hebra. el segundo nucleotido va a formar el enlace fosfodiester entre el fosfato del segundo y el3 prima OH del primero.

dos. Como la bacteria tiene el genoma mas pequeño junta todo y hace que el sistema sea mas eficiente. para que este maduro debe tener SPLICING. -La II sintetisa ARN mensajeros -La III sintetisa ARN mas pequeños . por favor ponte a traducir” y el SPLICING saca todas las regiones que no codifican que no tienen codones ni los tripletes para formar aminoacidos. 1 es a 1. .II Y III al igual que las ADN polimerasas de las bacterias. Ademas nuestros genes se encuentran todos independientemente funcionando. La adecion del 5 prima cap es un proceso cotranscripcional es decir mientras la ARN polimerasa II esta sintetisando el mensajero inmediatamente se le pone la marca del 5´ cap. tienen la capacidad de generar mensajeros grandes que pueden tener la informacion para generar muchas copias de una. y su sintesis es diferente. es otra señal que le dice al sistema. todos se hacen y se procesan al tiro porque no hay membrana nuclear que separe una estructura de otra. Cada polimerasa eucarionte va a reconocer promotores diferentes. La ARN polimerasa I usa unas señales distintas. Las bacterias que se definen como organismos policistronicos. va a tomar una secuencia y va a pegarle al extremo 3´ 20. MADURACION DEL ARN EN EUCARIONTES El 5prima cap es el sombrero que el mensajero debe usar. COMPARACION DE ARNM DE PROCARIONTES Y EUCARIONTES El concepto monocistronico tiene que ver que necesita sintetisar una proteina . “ soy un mensajero propio. En cambio en la bacteria. va a decir lo que va a ser esa proteina. Cada ARN ribosomal. Debo unir todos los exones para poder mandar afuera del nucleo. 30 hasta 100 (o mas) AAA y marcara la cabeza con el 5´cap y la cola con la cola poli A de ese precursor del mensajero porque aun no esta maduro. La cola poli A en el extremo de la 3 prima . todos los ARN de transferencia y el 5s de los ribosomas.una subunidades que se parecen mucho a las ADN polimerasas eucariontes y nosotros tenemos 3 ARN polimerasas que se llaman I. en comparacion al genoma de las bacterias. el arn polimerasa II sintetisa. tres hasta cinco proteinas diferentes porque nosotros tenemos un genoma mas grande por lo que se debe organizar muchos aminoacidos. la ARN polimerasa III usa otras señales diferentes a las dos anteriores. de un mensajero se puede sintetisar miles de copias para UNA SOLA proteina. -La I sintetisa ARN grandes 28 y 18 veces que son los ribosomas. la caja tata sirve para los mensajeros. Sigue sintetisando y en algun momento pasara por una señal de polimerizacion una poli A polimerasa. transferencia y mensajeros sufren procesos distintos y por eso sus marcas y su maduracion. si no usa ese sombrero no puede salir del nucleo hacia el citoplasma y no puede ser traducido en el porque sera conocido como un ARN FORANIUM y sera degradado. debe sintetisar (previamente) un ARN mensajero.

ADICION DE LA COLA DE POLI A Normalmente son unas centenas de amiocinas que se estan pegando en el extremo 3. Si paso el poro nuclear el sistema piensa que es maduro y puede ser traducido y transcribido. el codon esta en el mensajero y el anticodon esta en el ARN de transferencia. termina de marcar el fin de ese precursos de mensajero en eucarionte. del tamaño que queda no es igual al tamaño que se expresa en la proteina ( se va achicando el tamaño). te debo poner una mochila de prolimero. lo que reconoce la unidad de transferencia se llama codon. EXTRUCTURA DE GENES PROCARIONTES Y EUCARIONTES Un gen eucarionte con axones e intrones y un gen bacteriano que solo tien un gen codificante. SPLICING DE TRANSCRITOS PRIMARIOS Cada 3 nucleiotidos tengo un aminoacido por eso cundo sancan intrones y quedan los exones. Los intrones normalmente son mayor en tamaño que los exones.Todos los mensajeros eucariontes deben tener 5´cap para salir a traves del complejo polo nuclear al citoplasma. las bacterias no tien ni 5´cap ni cola poli A. El Splicing lo hace un cuerpo que se llama spliceosoma significa que en ese splicing habra proteinas y arn cataliticos que van hacer capaces de reconocer secuencias en los intrones y van hacer que cada intron por si solo haga una especie de laso y salga. No tengo separacion fisica en los procesos de maduracion de las bacterias como si lo tengo en el caso de u eucarionte porque todo lo que pasa adentro del nucleo esta pensado en separar el formato de ua proteina dentro del nucleo del formato de una molecula madura fuera del citoplasma. Mientras mas evolucionado este un individuo como organismo . mas intrones tiene . si no lo tiene no puede salir. cuando sale se hace un enlace covalente entre el intron I y el intron II y asi consecutivamente hasta formar un ARN mensajero maduro que solamente tiene exones. . Diferencia entre nosotrso con el chimapanse. TRADUCCION Para la sintesis de proteinas debe estar el mensajero. ARN de transferencia solo reconoce algo en el mensajero y si lo reconoce se saca la carga y la pone para que se genere la sintesis de proteinas . ARN de transferencia para armarlo y necesitan la proteina que le entregue la “ mochila “ (la informacion) a cada ARN de transferencia. aminoacil ARNT que le mira el codigo a la ARN de transferencia y dice tienes AGC . pero si cae en los exones si afecta a la proteina. mas secuencia intergenicas tiene. guardamos intrones porque cumplen una funcion biologica que es proteger de las mutaciones que no afectan a las proteinas. tienes ATC te debo poner una mochila de alanina. transferencia y las unidades mayor y menor de los ribosomas.

se arma el cadete y comienza la traduccion. La subunidad menor se encarga de reclutar ella sola al ARN de transferencia que reconoce el AUG y ella lo lleva reconociendo el 5´cap . el sistema ni siquiera se arma. la subunidad menor del ribosoma reconozca algo en esa molecula si es un mensajero eucarionte lo que reconocera es el sombrero del mensajero. Cuando el ribosoma esta formado quedan disponibles unos sitios que se llaman A. los cloroplastos y las mitocondrias tiene su propio codigo genetico por lo tanto el codigo genetico que se define como universal esta pensado en lo que nuestros genes nucleares tienen y se codifican a un aminoacido. . despues de que reconozca eso . Si cuando pasa la subunidad del ribosoma pasa por el AUG no existe coexistencia con metionina. Cada codon o cada triplete estara asociado por un unico y exclusivo aminoacido. P Y E. Cuando aparece el segundo ARN de transferencia. va a entregar cada aminoacido a cada codon que reconoce en el mensajero. Comienza a formar hasta que encuentra el codon de termino y el sistema termina. Las dos primeras letras son las que definen el nombre del aminoacido. es decir el 5´CAP. El A donde llega el aminoacido con el ARN de transferencia. INICIACION DE LA TRADUCCION EN PROCARIONTES Las bacterias no tienen 5´cap y deben conocer a sus mensajeros como propios.CODIGO GENETICO No es universal . es una secuencia propia de todo mensajero bacteriano que tiene complementariedad de bases que termianan UAAGGAGG y se unen por puente de hidrogenos con AUUCCUCC. hace un escaneo y suelta el mensajero. la subunidad del 5´cap debe comenzar a caminar desde el 5´cap hasta encontrar el codon de idinio (AUG).caminando hasta encontrar el AUG y cuando comienza a formar le manda una señal a la subunidad mayor y se ponen hacer la traduccion. Si en ese codon de inicio esta ubicado el ARN de transferencia que reconoce el AUG y que viene con la metionina. TRADUCCION El ARN de transferencia porta el aminoacido y porta el anticodon. El codigo genetico no es ambiguo es decir un triplete (tres letras) solo codifican para un solo y unico aminoacido pero el codigo genetico es degenerado porque por ejemplo la prolina. el P donde se forma el enlace peptidico y el E sale el ARN de transferencia que ya entrego su aminoacido. llega al citio A. El remplazo del 5´cap en la abcteria se llama SHINE-DALGARNO . proceso conocido como traduccion. la leucina puede ser codificada por 5 o 6 combinaciones de letras diferentes. lo que debe pasar es que le ribosoma. la subunidad mayor se mueve y hace que en el sitio P se forme el primer enlace peptidico y el ARN de transferencia que tenia quedo en el cito E por lo tanto se va a descanzar y una vez que esto paso la subunidad menor se pone a la par y de nuevo el sito A queda completo. cuando comienza a sintetisarce la proteina .

Cada mensajero debe ser utilizado por el tiempo en que se encuentra en el citoplasmas haciendo muchas proteinas identicas en el menor tiempo posible. ni cola polia A ni SPLICING. a penas el arn polimerasa esta sintetisando el 5´ de ese mensajero inmediatamente hay ribosomas que dicen le encontramos el shine-dalgarno tiene AUG me pongo a traducir. LA TRANSCRICION Y LA TRADUCCION ESTAN ACOPLADAS EN PROCARIONTES En lasbacterias. los codones de termino no existe en ningun arn de transferencia por lo que debe llegar una proteina llamada factor de liberacion disfrazada de arn de transferencia se pone justo en el sito A para formar enlace peptidico y como en el arn de transferencia del termino no tiene nada. el ARN de transferencia con metionina y al igaul que en eucarionte comienza la traduccion. el aminoacido se suelta y por eso se genera el termino. En ingles los codones de terminos no se llamaban codones de terminos sino que conodes sin sentidos . Se debe cambiar la funcion del 5´CAP para que comience. Lo que ocurre es que se debe ir moviendo hasta AUG . esperar a que llegue el codon de inicio. . lo que ocurre que cuando el sistema reconoce los codone. se transcribe el mensajero e inmediatamente yo estoy traduciendo por eso no hay 5´cap.La subunidad menor del ribosoma bacteriano tiene internamente una secuencia que se forman puente de hidrogeno con SHINE-DALGARNO y de esa manera la subunidad menor reconoce si ese mensajero es de el. POLIRRIBOSOMA Los mensajeros bacterianos tienen una vida super reducida y se debe trabajar mucho con el antes de perderlo y el ribosoma es el que lo traduce.