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TRABAJO FINAL DE SEGUNDO BIMESTRE

BIOINFORMATICA
MAY PLATT

ALERGIAS AYER Y HOY

INTRODUCCIN

Existe evidencia de que las alegras estn aumentando a nivel mundial. Segn Bergmann & Ring, en su libro
Historia de la Alergia, aproximadamente un tercio de la poblacin general de los pases Occidentales sufre de
alegras. Y de estos casos, alrededor de dos tercios pertenecen a reacciones de rinitis y asma (causados por el polvo,
pelusas, etc.), junto con dermatitis atpica y alergias a alimentos, afectando principalmente a los nios.

En un artculo sobre el origen de respuestas alrgicas de la revista cientfica Nature, Medzhitov y sus colegas
debatieron la idea convencional de que una alergia es provocada cuando se sale de control nuestro sistema inmune,
si no que por el contrario, es una respuesta exagerada para protegernos de las toxinas o contaminantes ambientales.
Pero, porque han ido estas en aumento?

Inicialmente se cuestionaban la causa de muchas reacciones alrgicas, como el asma por ejemplo, y se sugiri la
presencia de mltiples alrgenos en el polvo de casa. Fue despus varios estudios que pudieron comprobar esa
teora, y determinar que el principal alrgeno presente en el polvo de casa eran los caros y protenas especificas en
ellas que estimulaban nuestro sistema y produca la respuesta alergnica.

Los caros y los humanos estn ntimamente ligados y que su historia evolutiva corre en paralelo (Fernndez, 2016),
y gracias a esta relacin y al descubrimiento de los caros como alrgenos principales, la humanidad se ha adaptado
y buscado formas de combatiendo este problema, y lo ha logrado.

El crecimiento de desrdenes alrgicos sugiere la influencia de factores ambientales ms que la exposicin a alrgenos.
Las observaciones de que las alergias prevalecen ms en ambientes en los que infecciones parasticas entre otras han
sido erradicadas o reducidas dramticamente condujeron a una hiptesis, la cual considera que tomando en cuenta
nuestra historia evolutiva la creacin de ambientes ms estriles para vivir, ha alterado nuestra competencia inmune
de manera que aumenta el riesgo de alergias y autoinmunidad. Esta hiptesis se conoce como la Hiptesis de la
higiene.

Una de las formas en las que han conceptualizado la susceptibilidad alrgica es como una habilidad robusta de
responder a parsitos, pero que en su ausencia, puede ser estimulada por estructuras moleculares inocuas quizs por
alguna homologa con antgenos parasticos.

Lo que se desea demostrar en este trabajo es exactamente eso, que a pesar de que las alergias eran inicialmente
causadas por caros, gracias a la resistencia que hemos formado ya no tenemos esa respuesta, pero que las protenas
alergnicas presentes en ellos tienen cierta homologa con otros precursores de alergias ms actuales, como los
alimentos.

METODOLOGIA

Para determinar alguna protena proveniente de acaro, pero presente en otros organismos, se busc en la base de datos
SDAP (Structural Database of Allergenic Proteins) y se ingres la secuencia proteica del acaro portador del alrgeno
en la pgina del NCBI para realizarle una prueba Blast en la que aparecen los homlogos ms cercanos. Ahora, con
el fin de verificar la homologa, se seleccion aquellos ortlogos que encontramos en la alimentacin. Una vez
separadas las especies y sus secuencias, se realiz un alineamiento mltiple de todos estos comparados con la protena
precursora, con ClustalW para crear un rbol filogentico y analizar su resultado.

RESULTADOS

Obtuve dos secuencias proteicas alergenicas de los acaros: Blo t 1.0101 y Der p 1.0118, y de ellas un total de
ocho homlogos en alimentos (Tabla 1 de Anexos), y su rbol filogentico resulto como se observa en la
Fig.1, que representa el alineamiento de las secuencias tomadas. Aunque estn separados ambos
organismos caros, estn en la misma lnea de tiempo Solanum penelli (tomatillo) y comparte el mismo
precursor directo, que a la vez se ramifica para las dems especies.

Figura 1. rbol filogentico enraizado con longitud de ramas de las especies seleccionadas y sus caros
homlogos.

CONCLUSIONES

Podemos concluir con esto que la idea de que las nuevas alergias que se presentan actualmente por diversos
alimentos no son tan independientes de las alergias causadas por los caros, como se podra pensar debido a que
para empezar unos son vegetales y los segundos son invertebrados, sino que sus protenas alergnicas provienen del
mismo ancestro, solamente que antes nicamente provocaba respuesta en nuestra inmunologa los alrgenos de
caros, pero que conforme nuestro organismo creo resistencia, y aparte eliminaba este tipo de parasito, nuestro
sistema inmune ha buscado otros organismos con protenas alrgenos similares ante los cuales reaccionar.

ANEXOS

Proteina Especie Secuencia


IPANFDWRQKTHVNPIRNQGGCGSCWAFAASSVAETLYAIHRHQNIILSE
Blomia QELLDCTYHLYDPTYKCHGCQSGMSPEAFKYMKQKGLLEESHYPYKMKLN
Blo t
tropicalis( QCQANARGTRYHVSSYNSLRYRAGDQEIQAAIMNHGPVVIYIHGTEAHFR
1.0101 NLRKGILRGAGYNDAQIDHAVVLVGWGTQNGIDYWIVRTSWGTQWGDAGY
acaro)
GFVERHHNSLGINNYPIYASL
germination- KEALPETVDWRQKGAVNAIKNQGTCGSCWAFSTAAVVEGINKIVTGELISLSEQELVDCDKSYNQGCNGGLM
Raphanus
specific DYAFQFIMKNGGLNTEQDYPYRGSDGKCNSLLKNSKVVTIDGYEDVPTNDETALKRAVSYQPVSVAIDAGGR
ativus
cysteine VFQHYQSGIFTGECGTKMDHAVVAVGYGSENGVDYWIVRNSWGQKWGEDGYIRIERNLASSKSGKCGIAIEA
protease 1 (rabano) SYPVKYSPNPIRGNTISSV
MVLIFKKSGFMMIIIVVVITICASHVQVAVSRSMNEAASISIAEKHEKWMAEHGRSYKDELEKDMRFKIFKQ
xylem
Citrus NLEYIDKVNNNNNSNEGINRTYQLGTNQFSDLTNAEFRASYAGNSMAITSQHSSFKYQNLTQVPTSMDWREK
cysteine
sinensis GAVTSIKNQGGCAACWAFSAVAAVEGITQISSGNLIRLSEQQLLDCSSNGNSGCVAGKSDIAFKYIIKNQGI
proteinase ATEADYPYHQVQGSCGREHAAAAKISSYEVLPSGDEQALLKAVSMQPVSINIEGTGQDFKNYKGGIFNGVCG
(naranja)
1-like TQLDHAVTIIGFGTTEDGTKYWLIKNSWGDTWGEAGYMRIQRDEGLCGIGTQAAYPIT
MASSTKLISLLLLYVVISLASGDESTTINNHLDLPSDGSWRTDEEVRSIYLQWCAEHGKTSNNNGIINQQDE
cysteine KFNIFKDNLRFIDLHNENNKNATYKLGLTIFSDLTNDEYRRLYLGARTESVRRITKAKNVNMKYSAAVNDVE
Brassica
proteinase VPETVDWRRKGAVNAIKNQGTCGSCWAFSTAAAVEGINKIVTGELISLSEQELVDCDRSYNQGCNGGLMDYA
oleracea
COT44-like (Col) FQFIMKNGGLNTEQDYPYRGSNGKCNSLLRNSRVVTIDGYEDVPTEDETALKRAVSYQPVSVAIEAGGRVFQ
HYQSGIFTGKCGTNLDHAVVAVGYGSENGIDYWIVRNSWGTRWGEDGYIRMERNLARSKSGKCGIAVEASYP
VKYSPNPVRGTSSV
MSIVVITTSLLIFFAYLTNANDMFYNNNNNNNIDEEVKGIYEIWLVEHGKIYNGLGEKGKRFEIF
cysteine KDNLRFIEEHNNLKNQTYVLGLNRFADLTNEEYRTMFLGTRSDARRRLVKSKNASHRYVFRASDH
Solanum
proteinase VPESVDWRKKGAVAPIKDQGSCGSCWAFSTVAAVEGINQISTGEMITLSEQELVDCDTMYNDGCN
tuberosum
COT44-
(papa) GGLMDYAFQFIISNGGIDTESHYPYKGIDHKCDLVRKNAKVVSIDDYEDVPANENALEKAVAHQP
like ISVAIEASGRVFQLYSSGIFTGKCGTQLDHGVVVVGYGTENGVDYWIVRNSWGTNWGEDGYIKME
KNIEATNSGKCGIAMMASYPIKNAINKITMGEDGIIRST
MNKLSALRNACTTTSTTATTTTTTFVLLCILFLCPSASFGEGRKLYDRGPVFKRYEEWLKKYGRTYANGD
EWEMRFGIYQSNVQYIDYINSRNLSYQLTDNQYADMTNEEFISTYLGYKTRSLQRDGQNFTSDPVKLPAT
Proteina Coffea
VDWRKQGAVTPVKDQGACGSCWAFSAIAAVEGINKIKTGKLVSLSEQELVDCDYNRNNEGCNGGFMDKAF
no canephora
(Cafe) EFIKTNGGITTESDYPYKGKKDKCNRAKEKDHAVTITGYGKIPKSNELALQTAAAKQPVSVAIDASGFNF
nombrada
QLYSKGVYSGYCDKNLNHGVAVIGYGEEGGKKYWLVKNSWGTKWGEAGYIKMERGTKDKDGLCGINLEAS
YPVKQS
MSTSMTLTLFTLLFLSFTLSHASALRTDAEVRELYQNWLVKHQKVYNGIGEEETRFQIFKDNLKFVDEHN
AENRSYKVGMNAFADLTNQEYRARFLGTRPDPKRRVMKAKNPSLRYVVLPDDKLPESVDWRALGAVNPIK
Cysteine Fragaria
NQGSCGSCWAFSTVAAVEGINKIATGELVSLSEQELVDCDRKYNAGCNGGLMDYAFEFIIKNGGMDTESD
proteinase vesca
YPYKAVNQQCDASLENNKVVSIDGYEDVPAFNEEALKKAVAHQPVSVAIEAGGVALQLYDSGVFTGECGS
COT44 (Fresa) ALDHGVVAVGYGTENGVDYWLVRNSWGTNWGEGGYFKIERNVKSTYTGKCGIAMEASYPTKDSAQNPIQM
VTSM
Dermato- TNACSINGNAPAEIDLRQIRTVTPIRMQGGCGSCWAFSGVAATESAYLAY
phagoides RNQSLDLAEQELVDCASQHGCHGDTIPRGIEYIQHNGVVQESYYRYVARE
Der p pteronyssi QSCRRPNAQRFGISNYCQIYPPNANKIREALAQTHSAIAVIIGIKDLDAF
1.0118 -nus RHYDGRTIIQRDNGYQPNYHAVNIVGYSNAQGVDYWIVRNSWDTNWGDNG
(acaro) YGYFAANIDLMMIEEYPYVVIL
MSRSSVLLVLIAGLFSATIAGAATFADENPIRQVIVSEEVEIGILQVIGESDDALSFARFVNKYGKKYDS
Cysteine Solanum VEETKLRFEIFVENLKMIRSHNNKRSVVSYKLGVNKFTDLSWDEFRRVKLQGTPQNCSATTKTNLNFTNG
proteinase pennellii LLPEKKDWRETGIVSPVKAQGDCGACWTFSTTGALEAAYAQAFGKGISLSEQQLVDCAGAFDNHGCNGGL
3-like (tomatillo) PSHAFEYIKYNGGLETEESYPYTAKDGICKFKPQNVGVKVIDSVNITEGAEDELKIAVALIRPVSVAFEV
IDGFKQYESGVYTSTACGNTSMDVNHAVLAVGYGVENGVPYWLIKNSWGEDWGDNGYFKMEMGKNMCGVA
TCASYPIVA
Solanum MALVLEWKTQFTLLFMIVGMYASQVTCSQDSTSMVEKHESWMARHGRTYKNDIEKAKRLNIFTKNVKFIE
Zingipain-
2-like lycopersic SFNNNDSKSYKLGINKFTDLTSEEFMRYYTTNHGLNSKFSSIKSQKLSPTTISSFKYENISDVPSEMDWR
um KSGVVTSIKDQGQCGCCWAFSAVAALEGANKLSTGKLISLSEQQLLDCSTENNGCNGGLITMAYDYIVKN
(tomate NGIAEESSYPYEENQDSCKIQDSIVKMSSYETLPPSNEPMLLTAVARQPISVGIAVNEEFKLYKSGVYDG
mediano) NCGDEVNHAVTIIGYGTSNENGTKYWLIKNSWGSSWGENGYMKIARDIGNNDGLCRIATMASYPIV

Tabla 1. Protenas homologas con su respectiva secuencia.


BIBLIOGRAFIA

Bergmann, K.-C. (2014) History of Allery. Chemical Immunology and Allergy. Karger Medical and
Scientific Publishers, Germany.
Daruna, J. (1983) Introduction to Psychoneuroimmunology. 2 nd Edition, Ed. Academic Press.
Fernandez, I. (2016). La historia de las migraciones humanas. PNAS
Scientific American Editors (2014) Allergies, Asthma and the Common Cold. Ed. Macmillan, New York.