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Unidad 1: Paso 2 - Estimar parámetros genéticos

Por
Sebastián Romero Ruíz – Cód.1037642071

Reproducción Avanzada– Código 201503_13

Presentado a
Adriana Galeano Rivera (Tutora)

Universidad Nacional Abierta y a Distancia UNAD
CEAD Medellín
Escuela de Ciencias Agrícolas Pecuarias y del Medio Ambiente ECAPMA
Octubre Del 2018
Objetivos

 Revisar cada dato dado con el fin de desarrollar los parámetros de
heredabilidad
 Organización cada dato de los grupos de hijas según sus padres.
 Evaluar los promedios adquiridos de la muestra
 Realizar la varianza de los resultados obtenidos
 Desarrollar la heredabilidad
MEJORAMIENTO AVANZADO-201503
BASE DE DATOS PASO 2- ESTIMACIÓN DE PARÁMETROS GENÉTICOS

A continuación encontrará la información del promedio de producción de leche
por lactancia (210 días) en caprinos de la raza Sanen, reportados en un
estudio desarrollado por Paz, Togo y López (2007) en Santiago del Estero
(Argentina).

Con base en ésta información, se debe revisar la Guía de actividades y rúbrica
de evaluación- Paso 2- Estimar parámetros genéticos que se encuentra en el
entorno de aprendizaje colaborativo, y realizar los cálculos que allí se solicitan.

Padre Identificación del animal Promedio Leche/Lactancia (kg)
A A1 197
A A2 202
A A3 180
A A4 175
B B1 170
B B2 175
B B3 165
B B4 183
B B5 192
C C1 195
C C2 201
C C3 182
C C4 207
C C5 175
D D1 175
D D2 180
D D3 193
D D4 190
D D5 187
D D6 182
E E1 180
E E2 191
E E3 200
E E4 203
E E5 178
F F1 179
F F2 187
F F3 201
F F4 191
F F5 203
El primer paso se debe organizar toda la información en grupos de lactancia de
las hijas por sus respectivos padres

Padre A Padre B Padre C Padre D Padre E Padre F
197 170 195 175 180 179
202 175 201 180 191 187
180 165 182 193 200 201
175 183 207 190 203 191
192 175 187 178 203
182
El segundo pasó es “Estimación de ANAVA en Excel” que nos ayuda a facilitar y
a tomar todos los datos en orden:

RESUMEN
Grupos Cuenta Suma Promedio Varianza
Padre A 4 754 188,5 169,6666667
Padre B 5 885 177 114,5
Padre C 5 960 192 176
Padre D 6 1107 184,5 45,1
Padre E 5 952 190,4 128,3
Padre F 5 961 192,2 99,2

El cual nos muestra que el padre A posee 4 datos, el padre B tiene 5 datos, así
continuamente con los demás datos. Luego se realiza la suma de los datos
dando los números de hijas de cada padre, el total de leche que dieron cada
grupo de hijas y sus respectivos promedios y varianzas.
Análisis De
Varianza
Origen de las Suma de Grados de Promedio de los Valor crítico
variaciones cuadrados libertad cuadrados F Probabilidad para F
Entre grupos 861,8 5 172,36 1,473949759 0,235119261 2,620654147
Dentro de los
grupos 2806,5 24 116,9375

Total 3668,3 29

Al final nos muestra la variación entre cada grupo, la suma de cuadrados, los
grados de libertad y el promedio de los cuadrados.
Para el desarrollo de los datos se debe tomar el cuadro de los promedios de
lactancia de las hijas de todos los grupos y se realizara la suma de cada grupo
de padres donde se toma la lactancia en kg.

Padre A Padre B Padre C Padre D Padre E Padre F
197 170 195 175 180 179
202 175 201 180 191 187
180 165 182 193 200 201
175 183 207 190 203 191
754 192 175 187 178 203
885 960 182 952 961
1107

1. Estimar los Grados de Libertad:

 Grados de libertad entre padres (EP): 𝐺𝐿𝐸𝑃
= 𝑁𝑢𝑚𝑒𝑟𝑜𝑑𝑒𝑔𝑟𝑢𝑝𝑜𝑠(𝑝𝑎𝑑𝑟𝑒𝑠) − 1 𝐺𝐿𝐸𝑃

= 6 − 1 = 5

Tenemos 6 padres y el grado de libertad es 5

 Grados de libertad totales (T) 𝐺𝐿
𝑇 = 𝑁𝑢𝑚𝑒𝑟𝑜𝑡𝑜𝑡𝑎𝑙𝑑𝑒𝑖𝑛𝑑𝑖𝑣𝑖𝑑𝑢𝑜𝑠 − 1 𝐺𝐿
𝑇 = 30 − 1 = 29

El número de hijas en las que se plasmó el análisis es de 30 individuos lo que
nos da un grado de libertad total de individuos de 29

 Grados de Libertad Dentro de Padres (DP): 𝐺𝐿𝐷𝑃
= 𝐺𝐿 𝑇 − 𝐺𝐿𝐸𝑃 𝐺𝐿𝐷𝑃
= 29 − 5 = 24

2. Estimar las sumas de cuadrados:
 Suma de Cuadrados Total (SCT):
2
(∑𝑖𝑗 𝑦𝑖𝑗 )
2 𝑆𝐶𝑇
= ∑ 𝑦𝑖𝑗 −
𝑖𝑗 𝑛𝑖𝑗

(197 + 202 + 180 … + 201 + 191 + 203)2 𝑆𝐶𝑇
= (197)2 + (202)2 + (180)2 … + (201)2 +(191)2 + (203)2 −
(4 + 5 + 5 + 6 + 5 + 5)

(5619)2 𝑆𝐶𝑇
= 1056107 −
(30) 𝑆𝐶𝑇

= 1056107 − 1052438,7 𝑆𝐶𝑇

= 3668,3

Revisando cada cálculo de la suma de cuadrados totales da el mismo
resultado que los obtenidos con el análisis de Estimación de ANAVA en
Excel.
 Suma de Cuadrados Entre Padres (SCEP):
2
𝑦𝑖.2 (∑𝑖𝑗 𝑦𝑖𝑗 ) 𝑆𝐶𝐸𝑃
=∑ −
𝑖 𝑛𝑖 𝑛𝑖𝑗

Donde 𝑌𝑖 = total de cada grupo
(754)2 (885)2 (960)2 (1107)2 (952)2 (961)2 (5619)2 𝑆𝐶𝐸𝑃
= [ + + + + + ]−
4 5 5 6 5 5 (30)

568516 (783225) 921600 1225449 906304 923521 31573161 𝑆𝐶𝐸𝑃
= [ + + + + + ]−
4 5 5 6 5 5 30 𝑆𝐶𝐸𝑃

= [142129 + 156645 + 184320 + 204241,5 + 181260,8 + 184704,2] − 1052438,7 𝑆𝐶𝐸𝑃

= [1053300,5] − 1052438,7 𝑆𝐶𝐸𝑃

= 861,8

La suma de cuadrados entre cada grupo de padres nos da un total de
861,8 con esto se valida el resultado obtenido en el análisis de varianza.

 Suma de Cuadrados Dentro de Padres (SCDP): 𝑆𝐶𝐷𝑃

= 𝑆𝐶𝑇 − 𝑆𝐶𝐸𝑃 𝑆𝐶𝐷𝑃

= 3668,3 − 861,8 𝑆𝐶𝐷𝑃

= 2806,5
3. Estimar los Cuadrados Medios:
 Cuadrado Medio Entre Padres (CMEP): 𝐶𝑀𝐸𝑃
= 𝑆𝐶𝐸𝑃 /𝐺𝐿𝐸𝑃 𝐶𝑀𝐸𝑃

= 861,8/5 𝐶𝑀𝐸𝑃

= 172,36

Este valor es similar al promedio de los cuadrados entre grupos

 Cuadrado Medio Dentro de Padres (CMDP): 𝐶𝑀𝐷𝑃
= 𝑆𝐶𝐷𝑃 /𝐺𝐿𝐷𝑃 𝐶𝑀𝐷𝑃

= 2806,5/24 𝐶𝑀𝐷𝑃

= 116,9375

Tabla de análisis de varianza

Fuente de Grados de Suma de Cuadrado
variación libertad cuadrados Medio
Entre padres 5 861,8 172,36
Dentro de padres 24 2806,5 116,9375
Total 29 3668,3

Ahora se calcula el número ponderado de observaciones por
agrupamiento con la formula:
1 ∑𝑖𝑛2
𝑖 𝑁𝑝
= ∗ (∑ 𝑛𝑖 − )
𝑔−1 ∑𝑖𝑛𝑖
𝑖

1 42 + 52 + 52 + 62 + 52 + 52 𝑁𝑝
= ∗ (30 − )
5 30

1 152 𝑁𝑝
= ∗ (30 − )
5 30
1 𝑁𝑝
= ∗ (30 − 5,06)
5

1 𝑁𝑝
= ∗ (24,94)
5 𝑁𝑝

= 4,988
2 𝛿𝐸𝐺
= Componente de varianza genético (entre grupos)
2 𝛿𝐷𝐺
= Componente de varianza de entorno (dentro de grupos)

Tabla de análisis de varianza

Fuente de Grados de Suma de Cuadrado Cuadrado medio
variación libertad cuadrados medio esperado
Entre padres 5 861,8 172,36 116,9375+ 4,988 * 𝛿2 EP
Dentro de 24 2806,5 116,9375 𝛿2DP
padres
Total 29 3668,3

Con los Cuadrados Medios (calculados y esperados) se pueden apreciar
los componentes de varianza:
2 2
172,36 = 𝛿𝐷𝑃 + 4,988 ∗ 𝛿𝐸𝑃
Ya conocemos el valor del promedio de cuadrados dentro de grupos
reemplazamos este valor por 𝛿𝐸𝐺
2
= componente de varianza genético
(entre grupos) seria 116,9375 y al reemplazarlo la formula quedaría
2
116,9375 = 𝛿𝐷𝑃
2 172,36−116,9375 𝛿𝐸𝑃
= 4,988
2 𝛿𝐸𝑃
= 11,1111

Heredabilidad
Y = Valor fenotípico
G = Efecto de la genética
E = Efecto del entorno
A = Efectos genéticos aditivos
NA = Efectos genéticos no aditivos
Desde el punto de vista de variación
VF = Varianzas fenotípicas
VA = Varianzas aditivas
VNA = Varianzas no aditivas
VE = Varianzas de entorno
1
𝑉𝐴 𝑉
2 𝑟 𝐴
ℎ = =
𝑉𝐹 𝑉𝐴 + 𝑉𝑁𝐴 + 𝑉𝐸

Valores de Heredabilidad entre 0 y 1
1= alta influencia en la expresión de la característica
0 = baja influencia en la expresión de la característica
0 a 0.25 baja
0.25 a 0.50 media o moderada
0.50 a 1 alta
Rango de Heredabilidad en razas de leche para promedios de producción
de leche se encuentran entre 0.30 y 0.40
La fórmula para calcular la Heredabilidad por el agrupamiento de medios
hermanos es:
1 2
𝑉𝐴 𝑉 4δ𝑀𝐻
2 𝑟 𝐴
ℎ = = = 2 2
𝑉𝐹 𝑉𝐹 δ𝑀𝐻 + δ𝑅

4(11,1111)
ℎ2 =
11,1111+116,9375
44,4444)
ℎ2 =
128,0486

ℎ2 = 0,3470
Esto nos indica que la característica heredable se manifiesta en un
34,7% influencia en la expresión de la característica media o moderada,
lo que indicaría además que el 65,3% restante se le atribuye al
ambiente por lo que es posible mejorar sus condiciones ambientales
para que cada animal pueda llegar a expresar de la mejor manera su
potencial genético.
Bibliografía

Galeano Rivera, A. (2016). Análisis de varianza. Colombia: Recuperado
de http://hdl.handle.net/10596/9706

Galeano Rivera, A. (05, 12, 2016). Estimación de ANAVA en Excel.
[Archivo de video]. Recuperado de http://hdl.handle.net/10596/9403

Galeano Rivera, A. (2016). Heredabilidad. Colombia: Recuperado
de http://hdl.handle.net/10596/9705