Pico

Universal Genotyping for Tuberculosis Prevention Programs: a

5-Year Comparison with On-Request Genotyping

Problem :

Calon universal genotyping dari tuberkulosis (TB) isolat adalah digunakan oleh banyak
laboratorium untuk mendeteksi kelompok kasus dan menginformasikan penyelidikan kontak.
Sebelum genotyping universal, sebagian besar program pencegahan TB genotyped isolat pada
permintaan saja, mengandalkan permintaan dari profesional kesehatan masyarakat yang
pengetahuannya tentang klinis pasien, demografi, dan karakteristik epidemiologi menyarankan
transmisi potensial.

Intervention :

Kami membandingkan pola pengelompokan yang terungkap oleh retropektif 24-lokus

mikobakteri diselingi unit repetitif-variabel-number tan-dem pengulangan genotipe dari semua
isolat kultur-positif selama periode 5 tahun ke pola yang sebelumnya ditetapkan oleh
genotyping-on-request kami program dalam pengaturan insiden rendah British Columbia,
Kanada. Kami menemukan bahwa 23,8% dari isolat diminta selama masa studi, dan ketika
diminta isolat mengalami peningkatan kemungkinan milik kelompok genotipe (rasio odds yang
disesuaikan, 2,3; 95% confidence inter val, 1,5-3,3), hanya 54,6% bergerombol. dengan strain
pembanding yang diminta. Universal genotyping mengungkapkan 94 kelompok mulai dari 2
hingga 53 isolat (rata-rata 5) dan melibatkan 432 individu. Berdasarkan permintaan genotyping
tidak terjawab 54 (57,4%) dari kelompok ini dan 130 (30,1%) individu berkerumun.
Comparison :
Meskipun demikian dan tingkat kasus insiden rendah insiden lainnya, negara-negara
tuberkulosis (1). Di sini, (TB) yang tetap substansial kesehatan proporsi publik diagnosis
masalah TB di Kanada terjadi pada orang yang lahir di luar negeri dan merupakan pengaktifan
kembali infeksi TB laten (1, 2). Namun, wabah dan galur yang bersirkulasi secara endemik juga
berkontribusi terhadap tingkat insiden (3-5). Gangguan rantai transmisi ini membutuhkan
pemahaman epidemiologi regional. Teknik-teknik seperti 24-lokus mycobacterial interspersed
repetitive unit-variable-number tandem repeat (MIRU-VNTR) genotyping dapat memberikan
wawasan berharga ke dalam jangkauan potensial dari penularan TB lokal dengan menggunakan
clustering sebagai proxy; dengan demikian, banyak pengaturan insiden rendah telah
memasukkan genotyping MIRU-VNTR ke dalam praktek standar (6-9).

Outcome : Hasil kami menggarisbawahi bahwa jaringan pasien TB adalah kompleks, dengan
hubungan yang tidak dikenali antara pasien, dan program genotyping universal yang luas di
seluruh provinsi menyediakan alat yang informatif, bebas bias untuk mengeksplorasi transmisi
ke tingkat yang tidak mungkin dengan genotip permintaan.