Para eliminar dicha partición, ante la imposibilidad de hacerlo desde el

propio Administrador de discos de Windows Vista, podemos usar la utilidad de

línea de comandos diskpart, así que manos a la obra:

1. Iniciamos la consola Símbolo del sistema y ejecutamos el

comando diskpart, lo que abrirá una nueva ventana del símbolo del sistema
en modo elevado, de ello avisa UAC.
2. List disk
Muestra el listado de los discos físicos de nuestro equipo
3. select disk=2
Seleccionamos así el disco externo que contiene la particion a borrar
4. list partition
Visualiza las particiones del disco seleccionado
5. select partition=1
Seleccionamos la particion GPT, supongo siempre será la 1
6. delete partition override
El atributo override fuerza la eliminación de dicha particion GPT.
7. exit