You are on page 1of 26

 

2009‐2010 NEUROSCIENCES HANDBOOK   
Table of Contents Page    Departmental Directory                 2‐4    Neurosciences at CWRU                 5‐8    Program Requirements                 8‐10    Courses                     11‐13    Examinations                     14‐15    Change of State Notification                 15    Research Integrity                   15    Guidelines for Thesis Research               15‐18    Master of Neuroscience Degree               18‐19    Postdoctoral Fellows                   19    Neurosciences Facilities                 19‐22    Other Facilities/Services                 22    Useful Websites                   23    Current students                   24    Alumni of the Neurosciences Program             25‐26              *please send any corrections for the handbook to Katie Wervey (kar18@case.edu)* 

1   

PRIMARY FACULTY 
   Heather Broihier (htb)   School of Medicine E714   Office Phone # 368‐4326  Lab Phone # 368‐0657   Rebecca James (rej10)  Nan Liu (nxl23)  Crystal (Kozora) Miller (cxk81)  Inna Nechipurenko (ivn2)  Yi‐Lan Weng (yxw71)     Gemma Casadesus (gxc40)  School of Medicine E729&728  Office Phone # 368‐8503  Lab Phone # 368‐2018  Jaewon Chang (jxc176) 
Denise Hatala (dah13)  Hyunjin Kim (hxk199)  Jennifer Reeves (jer112) 

David Katz (dmk4)  School of Medicine E712    Office Phone # 368‐6116    Lab Phone # 368‐6179    Ian Adams (ita)  Michael Ogier (moo3)  Danielle Schmid (das197)  Talia Sukol 
     (talia.sukol@gmail.com)  Qifang Wang (qxw12)  (E717) 

  Evan Deneris (esd)   School of Medicine E648    Office Phone # 368‐8725    Lab Phone # 368‐8724  Stephanie Fox (srf12)  Chen Liu (cxl115)  Katherine Lobur (kjl16)  Hiroshi Maeno (hxm57)  Steven Wyler (scw58)        David Friel  (ddf2)     School of Medicine E647    Office Phone  # 368‐4930    Lab Phone # 368‐1915    Roberto Galan (rfg8)  School of Medicine E725  Office Phone # 368‐0811  German Cardenas Leroy (gxc128)  Pavel Puzerey (pxp190)  Karl Steinke (gks5)  Yenan Zhu (yxz107)        Alison Hall (axh8)     School of Medicine E709   Office Phone # 368‐6711    Lab Phone  # 368‐6710   Sarah O'Keeffe (seo5) x5655  Jamie Rhodes (jlr124)        Stefan Herlitze (sxh106)   School of Medicine E643   Office Phone # 368‐1804  Davina Gutierrez (dvg1)  Takashi Maejima (txm130)  Eugene Oh (exo16)   

  Diana Kunze   (dkunze@metrohealth.org)   MetroHealth Medical Center   2500 MetroHealth   Cleveland Ohio 44109   Office Phone # 216‐778‐8967    Lynn T. Landmesser (ltl) CHAIR    (E643A) E627‐Lab  School of Medicine E653   Office Phone # 368‐3996   Lab Phone # 368‐4896  Ksenia Kastanenka (kvk3)  Katherine Lobur (kjl16)  Yuka Maeno Hikichi (yxm29)  Sheng Wang (sxw203)     Gary Landreth (gel2)   School of Medicine E649   Office Phone # 368‐6101   Lab Phone # 368‐3435  Brent Cameron (bdc22)  Paige Cramer (pec9)  Colleen Karlo (jck2) E640  Donna Kirsch (djk15)  Chung‐Ying(Daniel) Lee(cxl142)  Shweta Mandrekar (sdm19)  Lauren Ogrich (lmo11)  Daniela Popescu (dcp58)  Joanna Pucilowska (jxp190)  Erin Reed (egr3)  Julie Savage (jcs30)    Wendy Macklin  U of Colorado Denver Health  Sciences Center  Aurora, CO 80045  Office Phone # 303‐724‐3426  Yi Dong (yxd26)   
 

Robert Miller (rhm3)     School of Medicine E721    Office Phone # 368‐6269   Lab Phone  # 368‐6170   Lianhua Bai (lxb65)  Andrew Caprariello(avc9) DPB   Anne DeChant (akd6) x5473  Sharyl Fyffe‐Maricich (slf53)  SaraVandommelen(slv15)x6269  Yan Yang (yxy33)  Anita Zaremba (axz2) 
 

(Wendy.Macklin@ucdenver.edu)     

Jerry Silver (jsx10)   School of Medicine E661   Office Phone # 368‐2150   Lab Phone # 368‐5574(E658)   Warren Alilain (wja4)  Sarah Busch (sab37)  Marc DePaul (mxd359)  Teresa Evans (teresa.evans)  Hongmei Hu (hxh67)  Bradley Lang (btl21)  Angela (Nord) Filous (arn29)    Ben Strowbridge (bxs48)   School of Medicine E659   Office Phone # 368‐6974   Lab Phone # 368‐1041   Yuan Gao (yxg30)  Robert Hyde (rah38)  Loren Schmidt (ljs102)  Ross Anderson (rwa4) DPB  Isaac Youngstrom (iay4)    Bruce Trapp (trappb@ccf.org)   Cleveland Clinic Foundation   Building NC30   9500 Euclid Avenue   Cleveland Ohio 44195   Office Phone # 216‐444‐7177   Lab Phone # 216‐444‐8712   Maria Smith (mcs59)  Elizabeth Young (eay9)    Richard Zigmond (rez)     School of Medicine E701   Office Phone # 368‐4614   Lab Phone # 368‐4615   Alicia Lisowitz (aal39) 

2   

    Chunyang (Brian) Bai (cbb9)  Genetics  BRB 621  Office Phone # 368‐0305    Susann Brady‐Kalnay (smb4)   Molecular & Microbiology   School of Medicine W214b   Office Phone # 368‐0330     Matthias Buck (mxb150)  Physiology & Biophysics  School of Medicine E646  Office Phone # 368‐8651    Hillel Chiel (hjc)   Biology 301   Office Phone # 368‐3846   Lab Phone # 368‐3574     Thomas Dick (ted3)   Pulmonary/Critical Care   BRB 319   Office Phone # 368‐8637  Rishi Dhingra (rxd50)     Dominique Durand (dxd6)   Biomedical Engineering   Wickenden 112   Office Phone # 368‐3974      Paul Ernsberger (pre)   Nutrition    Dental School 201   Office Phone # 368‐4738    Joseph LaManna (jcl4)   Neurology    BRB 525    Office Phone # 368‐1112    Bruce Lamb (btl) (Adjunct)  Genetics  BRB 7th Floor  Office Phone # 368‐2979  Sungho Lee (sxl265)         Shasta Sabo (sls79)  Pharmacology  School of Medicine W305C  Office Phone # 368‐5683    Ruth Siegel (res7)   Pharmacology  School of Medicine W319   Office Telephone # 368‐5554   Lab Phone # 368‐6024    Corey Smith (cbs16)  Physiology & Biophysics  School of Medicine E645  Office Phone # 368‐3487     Richard John Leigh (rjl4)  Neurology  Lakeside 3080  Office Phone l # 216‐844‐3190    Stephen Maricich (smm18)  Pediatrics  School of Medicine E765  Office Phone # 368‐2194  Lab Phone # 368‐0066  Saed Abokor (sxa359)    Brian McDermott.. Jr. Room 452  Office Phone # 216‐844‐6036     Maureen McEnery (mwm4)   General Medical Sciences  School of Medicine W‐G 11   Office Phone # 368‐3377      Irvine McQuarrie (igm)   Neurological Surgery    VA Medical Center    Office Phone # 791‐3800       Elizabeth Pehek (eap6)   Psychiatry  VA Medical Center‐Brecksville  Office Phone # 440‐526‐3030    Robert Petersen (rbp)  Pathology  Institute of Pathology 204  Office Phone # 368‐6709    Sophia Sundararajan (srt2)  Neurology  Lakeside 3080  Office Phone # 216‐844‐8421    Man‐Sun Sy (mxs92)  Pathology  BRB 9th Floor  Office Phone # 368‐1268    Erik van Lunteren (exv4)   Pulmonary/Critical Care   VA Medical Center   Office Phone # 791‐3800    Nicole Ward (nlw4)  Dermatology  BRB 526  Office Phone # 368‐1111    Christopher Wilson (cgw5)  Pediatrics  RB&C  Office Phone # 216‐844‐7356        Roy Ritzmann (rer3)   Biology    Biology Building 207   Office Phone # 368‐3554    Shenandoah Robinson (sxr47)  Neurological Surgery  Office Phone # 216‐844‐4922  Lab: SOM E720  Qing Li (qxl5) x4865  Stephanie Eaton (see14)    Robert Ruff (rlr)  Neurology    Lakeside Hospital 3080   Office Phone # 216‐421‐3040        3    . (bmm30)  Otolaryngology  Wearn Bldg.  SECONDARY FACULTY  Kumar Alagramam (kna3)  Otolaryngology  Lakeside 7123  Office Phone # 216‐844‐7261.

 368‐5473. (mxp19)  Lynn Landmesser. Director. Core Technician (jennifer. (gxc40)  Jennifer Reeves.edu/med/CTN/index. (bxs48)  Maryanne Pendergast.reeves@case. (ltl)    IT Specialist  Harry Menegay (hxm8)    4    . 368‐5473.edu)     NEUROSCIENCES IMAGING CENTER  http://neurosciences. Administrator for the Center.html  School of Medicine E722  Robert Miller. 368‐3996. 368‐6974. Director. 368‐2575 or cell: 216‐224‐8649. (rhm3)  Anne DeChant.case. 368‐8503.edu/crbc/home   School of Medicine E729   Gemma Casadesus. Garvin Professor and Chair. (akd6)    CWRU RODENT BEHAVIOR CORE  http://neurosciences. Core Director.  ADMINISTRATIVE OFFICE   School of Medicine E653      Narlene Brown (nrb)   Administrative Manager  Office Phone # 368‐6253      Pam McGregor (pam7)   Grants Management Specialist  Office Phone # 368‐6251      Katie Wervey (kar18)   Graduate Student Coordinator/Assistant to Chair  Office Phone # 368‐6252         CENTER FOR TRANSLATIONAL NEUROSCIENCES  http://www. Training and Facility Manager. Neurosciences.case.case.edu/imaging/index  School of Medicine E632  Ben Strowbridge.

 with close interactions  with faculty advisors leading to an understanding of problem‐solving. including practice and advice in the  analysis of contemporary literature. The Doctor of Philosophy degree is designed to prepare a  student to become a scholar. journal clubs. J. grantsmanship. Our  Neuroscience students can expect training in 1) scientific excellence. and intellectual property.. synaptic  physiology and plasticity. and invites  talented undergraduates to participate in research over the summer.D. Training is provided through a combination of research. Thesis research  opportunities are available with more than 20 faculty members working in areas such as  development of motor and sensory systems.  5    . to  make complex decisions on authorship. and oral presentations and 3) Ethics.  characterized by extensive collaborations among laboratories and with other investigators... that is. integrate and apply knowledge. course work and  seminars.D.D.Neurosciences at CWRU    The Department of Neurosciences.edu/    Training Philosophy    Graduate education in Neurosciences at CWRU addresses many aspects of the science  profession. critical analysis of data  and modern technical approaches. to discover..  our department has consistently ranked in the top fifteen percent of Neuroscience programs  nationwide in NIH funding (2005 Case ranked 14th in NIH funding).  neurogenetics.    Neurosciences Department Office SOM E653  Phone 216‐368‐6253 FAX 216‐368‐4650  Web site: http://neurosciences. regeneration. neuron‐glial interactions. deserving  dedicated guidance from the scientific community. It is a research degree and is to be distinguished from other doctorates such as the  M. ion channel biophysics and information processing."  ‐Council of Graduate Studies    Neuroscientists today require many skills to succeed in a competitive environment. data handling. degrees. and involves both formal coursework and informal interactions. or Ed. pathfinding by axons.    "The Doctor of Philosophy degree is the highest academic degree granted by North American  universities. In the last decade. which are designed for professional training or which focus on  applied rather than basic research... regulation of neurotransmitter expression.case. as well as  communicate and disseminate it. Both faculty and  students prosper when students are considered as promising junior colleagues. located in the East Wing of the CWRU Medical School. One feature of the  Department that makes it particularly attractive is the highly interactive atmosphere.The program emphasizes the development of the student's  capacity to make significant original contribution to knowledge in a context of freedom of  inquiry and expression. offers  graduate education and postdoctoral training in a wide range of disciplines in modern  neuroscience. a social hour. 2) communication skills. The department hosts weekly seminars.

 contact the student lunch coordinators. introduce the speaker at the seminar. Students create the schedule for the  speaker.    Neuroscience textbook and computer. students and postdoctoral fellows should make formal  presentations to the Neuroscience community at least once a year.case. All students. A student or postdoc  should expect to meet with at least 4 speakers a year. Students are strongly encouraged to actively participate by asking questions at  seminars and journal clubs.  Student Activities. The graduate students in the biomedical sciences organize a  symposium once a year that includes student posters and a keynote speaker invited by  6    . Graduate students are expected to initiate and participate in a variety of  activities having to do with professional growth:    Departmental Representatives to Case programs. One speaker a year is selected and sponsored by  the graduate students in the Department.    Student‐sponsored departmental speaker. Dr. If a student subsequently changes programs. Postdoctoral fellows and experienced students usually present their research  work with relevant background and significance.    Journal Clubs and Seminars. are responsible for transit to and from  the airport and hotel reservations. Richard Zigmond (rez) organizes the seminar schedule and Dr. Visiting faculty are honored by this distinction and  are very accessible to students during the visit. Faculty input about candidates is encouraged to  ensure that "student‐friendly" speakers are selected. Journal clubs and seminars offer an opportunity to learn about  broad areas of Neuroscience.  postdoctoral fellows and faculty are expected to attend both the Journal Club Mondays at noon  (SOM E646) and the Neurosciences Seminar Thursdays at noon (BRB105 unless otherwise  specified). but may opt to do a journal club. Similarly.  create a department‐wide dinner with the speaker. his/her institution and to discuss scientific strategies or collaborations. Students committed to the Neuroscience Program for  their thesis work are provided a copy of Kandel. a laptop computer will be provided for  use in completing studies. To  meet with a speaker. Principles of Neural  Science. Schwartz and Jessell.edu/) that discusses issues that affect graduate  students. Ross Anderson (rwa4) or Loren  Schmidt (ljs102) (for 2009‐10 academic year) to reserve a free lunch. after practice with their  faculty advisors.  Gary Landreth (gel2) organizes the journal club calendar. Students and postdoctoral fellows are encouraged to  meet with visiting speakers at lunch following the noon seminar.    Meeting outside speakers for lunch. once students commit to a laboratory. Further. All departments contribute to the CWRU  Graduate Student Senate (http://gss. it offers a means to get to  know the speaker. Students in the first 3 years may elect to present a current research article  from a prominent journal. arrange lunch with students and postdocs. and form an important part of graduate training.    To gain oral presentation skills. interesting way. Faculty offer constructive criticism to the student directly following  the presentation. the textbook and  laptop must be returned for future use.    Graduate Student Symposium. Teresa Evans and Angela (Nord) Filous are current Neuroscience representatives to  GSS. This is a good opportunity to  practice talking about science in a concise.

 Students are encouraged to present their work at national  meetings once a year. NIH  individual research grants.org/presenter. It is highly  advantageous for students to successfully compete for individual grant support from  extramural sources. Information can  be obtained from each municipality. The Department pays for student health services. The stipend level is currently $25.I. and that viewpoint is very valuable to prospective students. Support for additional years may be provided but  requires an individual petition. Often the most candid view of our program  comes from current students.I. A copy  of the CWRU Medical Plan for Students can be obtained at the University Health Services. Neuroscience  students have been successful in obtaining National Research Scholar Fellowships from the NIH  (please see http://grants.nih.case. Stipend support may derive from NIH training grants. 2145  Adelbert Road.edu/gradprog/grantsources.    Recruitment of prospective graduate students. the Dean of Graduate  Studies informed students that "… income tax will be withheld only on the stipend portion of  compensation (stipend plus tuition) charged to federal research grants.html) and the  American Heart Association (please see  http://www. MSTP students often can get partial reimbursement for  meeting costs if they present a poster or talk at a scientific meeting. and  chair of department stating that tuition and stipend will be guaranteed for at least five years.I.org/). and the department strongly encourages such applications.  University Health Service 216‐368‐2450  7    . Tuition  is generally paid by the training faculty member’s primary department. federal  and private research grants and university resources.  This letter must be received by the Department of Neurosciences before a student begins  training with the chosen P.nagps. and serve as ambassadors of the institution and program.000 for twelve months for the 2009‐2010 academic  school year.  Stipends are funded by NIH training grants. In August.    Graduate Stipend and Benefits  Full time registered Neuroscience students are eligible for tuition and stipend support (see  above). The most appropriate meetings may be the Society for Neurosciences  Annual Meeting or a Gordon Conference. graduate students who train with  Neurosciences Department P.s outside the Department  of Neurosciences should note that tuition and stipend support will be the responsibility of the  training P. A letter of support is required from the training P. Note that several  agencies require applications early in graduate training.html.  Students host prospective students from other institutions during the Spring recruitment  weekend.students.I. Many student issues are  represented by the National Association of Graduate and Professional Students  (http://www." Note that students  may also be required to pay local taxes if they live outside the city of Cleveland. NIH individual research grants. federal and private research grants and university resources.    Attending national meetings.jhtml?identifier=2457#Predoc).americanheart. Students who choose to train with P. 2000.    Individual Predoctoral Support. and his/her department. The faculty advisor for this program is David MacDonald.I. Once accepted. Students should compete for individual travel grants  as well as funds from training grants.s are guaranteed stipend support by the Department for five  years if they remain in good standing.gov/grants/guide/notice‐files/NOT‐OD‐07‐052. The Office of Graduate Education  maintains a list of graduate funding opportunities  http://casemed.

     Most students arrive July 1 and immediately begin a lab rotation. http://www.      All students must submit a Planned Program of Study (PPOS) by the end of their 2nd semester  through the Student Information System (SIS) by using the "Course Planner" and "My Program"  tabs (the basic curriculum will be given to new students at their initial meeting with the GPA  when they first arrive to the department.case.  Questions about the PPOS can be directed to the Graduate  Studies Office at gradadmit@case.  The GPA also  coordinates student activities and serves as a student advocate should difficulties arise.D. (216) 368‐4390.       Students are required by the University to take 36 semester hours of graduate courses before  advancing to candidacy.  Credit hours should never exceed 9 hours in any  semester since aid is not available for anything above 9 credit hours).edu. gel2@case. The  GPA is available to discuss progress and provide advice on course selection.      The Neurosciences Graduate Program Advisor (GPA) is   Dr. a registration hold will be placed on the  student's account.edu/bulletin/) as well as  the specific rules which apply for the course of study in Neuroscience (this document).Appointments:  General Clinic 216‐368‐4539  Women’s Clinic 216‐368‐2453  Mental Health 216‐368‐2510  University Counseling Service 216‐368‐2510      Neurosciences Program Requirements  It is the responsibility of the student to become familiar with the general rules and regulations  of the University (available in the General Bulletin. students generally enroll in the correlated curriculum in cell biology (CBIO453) and  molecular biology (CBIO455) and pursue lab rotations. In  the Fall.     Neurosciences Ph. this includes required courses. often this rotation is an excellent laboratory experience. Gary Landreth   E649 (SOM)  368‐6101. Because the summer session  is not encumbered by coursework.   At least 24 hours must be graded.  If a student fails to  submit a PPOS during the required time frame.edu       The Graduate Program Advisor oversees graduate training in the Neurosciences Program.    Registration for classes is also done on‐line in SIS. advanced electives and 601 research.  A revised program of study must also be submitted via the SIS when any  change in the original plan occurs. Program Requirements:  CBIO 453 Cell Biology I  CBIO 455 Molecular Biology I  IBMS 500 Being a Professional Scientist (Ethical issues in science research seminar)  NEUR 402 Principles of Neural Sciences    8    .

 to be taken in May)    Summer Complete preliminary exam by July 31  Begin thesis research    Year 2 Fall  Elective courses (6 credits)  NEUR 601 Research in Neuroscience (3 credits)    Year 2 Spring  Elective Courses (6 credits)  NEUR 601 Research in Neuroscience (3 credits)    Complete Qualifier Exam by July 31  Form thesis committee  Research  Prepare individual fellowship application    Year 3 Fall  NEUR 701 Research in Neuroscience (9 credits)  Thesis Committee Meetings every 6 months    Year 3 Spring  NEUR 540 Advanced Topics in Neuroscience Ethics (0 credits)  (All students matriculating in 2004 and later must take this course)  NEUR 701 Research in Neuroscience (9 credits)   Thesis Committee Meetings every 6 months    Year 4+  NEUR 701 Research in Neuroscience (1 credit each Fall and Spring Semester until graduation)  9    .D. Study  Year 1 Fall  CBIO 453 Cell Biology 1 (4 credits)  CBIO 455 Molecular Biology 1 (4 credits)  NEUR 601 Research in Neuroscience (1 credit)    Year 1 Spring  NEUR 402 Principles of Neuroscience (3 credits)  Elective graduate course (2‐3 credits)  NEUR 415 Neuroscience Seminars (1 credit)  NEUR 601 Research in Neuroscience (2‐3 credits)  IBMS 500 On being a professional scientist (0 credits.NEUR 415 Neurosciences Seminar Series  NEUR 540 Advanced Topics in Neuroscience Ethics ‐ (Students who matriculated before 2004  are exempt from taking this course)  Elective graduate courses  Neurosciences Journal Club   A minimum of 18 hours of NEUR 701 thesis research    Suggested Course of Ph.

 and should be  completed in the first summer following identification of a laboratory and mentor. students complete a minimum of three rotations of  approximately 4‐6 weeks duration during the first semester.    By the end of the first semester. Students are encouraged to  take Neuroscience graduate courses during the first two years of medical school. In particular. In general.Thesis committee meetings every 6 months    Summer Sessions: Students must register for (0) credit hours of RSCH 750 (Summer Research)  every summer using Denise Douglas as the instructor. The date of this commitment is generally around December 15.  Any faculty  advisor who agrees to take a rotation student must do so only with confirmed financial support  should the student decide to work in that laboratory. it is advised that MSTP students complete NEUR  402 during year 1 of medical school. please see Katie. The general guidelines and performance  expectations for MSTP students in the neuroscience program are identical to those for graduate  students.    Medical Science Training Program (MSTP)  MSTP students in the neuroscience program are expected to complete the requirements for  MSTP students as outlined in the MSTP guidelines. the Neurosciences Office (give to Katie).  10    . Copies of the rotation report and signed evaluation form are submitted to the  graduate program advisor. students commit to a specific laboratory and faculty advisor for  doctoral studies.D. Students are encouraged to start  rotations July 1 to allow for three extended rotations by December. To  obtain experience in different laboratories. and the BSTP Office (for  BSTP students). students are encouraged to take a graduate  school elective course in year 2 of medical school. in this case. and 3  other elective courses. on the thesis committee. This is the student's responsibility. In keeping  with MSTP program. MSTP students are required to take NEUR 402 Principles of Neuroscience.    Laboratory Rotations and Selection  One of the most important decisions a student makes is the choice of a faculty advisor. After the form is completed.  in light of medical school curriculum changes. A 3 page rotation report  describing the project and a rotation evaluation form must be prepared at the conclusion of  each rotation. The MSTP steering committee member for  Neurosciences is Dr. A student should realize that 20‐25 hours  per week of laboratory work are expected during the semester. while also preparing for the USMLE step 1. thesis. each student must have a member of the MSTP steering committee and  one MD or MD/PhD. The  qualifying exam should be completed at the conclusion of required course work. Jerry Silver (jxs10). These rotations give  students a diverse introduction to approaches for studying neural function and serve as the  basis for choosing a laboratory for the Ph. at least one of which is in Neurosciences.    Preliminary exams have the same format as that for other graduate students. the student and faculty advisor meet to discuss  comments. and must be  completed in the second summer following admission into the graduate program. unless you are going to defend in the  summer.

 fall semester (last offered in fall 2006).    NEUR 405: CELL & MOLECULAR NEUROBIOLOGY Credit Hours: 3. This is a partial list of available courses:    NEUR 402: PRINCIPLES OF NEURAL SCIENCE Credit Hours: 3. function. The course will expose students to the current  understanding of various types of stem cells.  Description: This course is intended to teach current understanding of stem cells as it relates to their  characterization. This course will prepare students for upper level Neuroscience courses and is also suitable for  students in other programs who desire an understanding of neurosciences. fall semester (beginning fall 2008). E. relationships between center and periphery  in development and the role of activity. H.  11    .  techniques for their isolation and study.  Description: Cell biology of nerve cells.  ZIGMOND.0  Offered every fall semester. regulation of proliferation and differentiation. Prereq: NEUR 402  or NEUR 405. multiple sclerosis. The  application of molecular biological tools to questions of synaptic function will be addressed. Pharmacology  or other departments. Duchenne's muscular dystrophy. Cross‐listed as PATH 425.  BROIHIER. The general format will include clinical descriptions of patient presentation.0  Every fall and spring semesters. Cleveland Clinic Foundation and  the partnering biomedical companies.  Description: Lecture/discussion course covering concepts in cell and molecular neuroscience. and fundamentals of the development of the  nervous system.  Only register for this one time.  Description: Designed to show how basic research in neuroscience has contributed to the management of clinical  problems in human neurology and to discuss some of the further challenges posed by human disease for research  in neurobiology. No credit is given for less than 75% attendance.    NEUR 427 : NEURAL DEVELOPMENT Credit Hours: 3. principles of systems  neuroscience as demonstrated in the somatosensory system.0  Offered alternating years. dementia (including Alzheimer's  disease). pathfinding by the outgrowing nerve fiber.    NEUR 411 : NEUROBIOLOGY OF DISEASE Credit Hours: 3. From this series. discussion of the  disease mechanisms and an analysis of contributions of cellular and systems neuroscience to understanding of the  human disorder.0  Offered every spring semester. Genetics. K.0  Offered every spring semester. The course will be taught by the faculty of the "Center for Stem Cell and Regenerative Medicine"  who are affiliated with multiple departments of Case Western Reserve University. cell death and trophic  factors.  MILLER .  Courses  Potential elective courses may be listed in Neuroscience.  BUNTING. D.  Description: Current topics of interest in neurosciences. seizures and strokes. synapse formation. Experimental models and potential biomedical therapeutic applications  will be discussed. Specific topics to be discussed include myasthenia gravis. and physiologic and pathological states.  DENERIS. Prereq: BIOL 473.  Description: Topics include cell commitment. Cross‐listed as BIOL 427. R. poliomyelitis. including aspects of synaptic structure physiology and chemistry.    NEUR 415 : NEUROSCIENCE SEMINARS Credit Hours: 1.0  Offered alternating years. and FRIEL. Cell Biology.    NEUR 425 : STEM CELL BIOLOGY & THERAPEUTICS Credit Hours: 3. Students attend weekly seminars. Prereq: CBIO 453. Cross‐listed as BIOL  402.  students prepare critiques. including embryonic and adult stem cells of various tissues. R.

 Quantal analysis and silent  synapses will be discussed in the context of the present‐day controversies regarding long‐term potentiation at  central synapses.  Students will be graded on their  performance in journal club presentations (40%). Cross‐listed as BIOL 474. Occasional faculty lectures will complement student  presentations on primary research articles. and retina.    NEUR 440 : SYNAPTIC TRANSMISSION Credit Hours: 3. We will then explore pre‐ and post‐synaptic processes such as receptor saturation and vesicle  dynamics that govern the amplitude and time course of postsynaptic potentials.  Park. lens.  Vision disorders discussed include  age‐related macular degeneration. spring semester. based on student interest.    NEUR 435 : VISION:MOLECULES TO PERCEPTION Credit Hours: 3. We will then read classic papers by Katz and  colleagues that defined the mechanisms controlling transmitter release at the neuromuscular junction. and on critical analysis of the contemporary technical literature in  the neurosciences.      12    . Classic papers and current literature form the basic course  material.    NEUR 473 : INTRODUCTION TO NEUROBIOLOGY Credit Hours: 3. structural biology.  CHIEL.0  Offered every fall semester. and class participation (20%). H.  Description: Vision research is an exciting and multidisciplinary area that draws on the disciplines of biochemistry. class participation. Prereq: Consent of department.  RITZMANN. B. Two lectures per week. biochemical. spring semester (last offered in spring 2010).  Topics will be covered by traditional lectures. and pathology. molecular biology. Prereq: Permission of the course director. Assessment is based on student presentations. and diabetic retinopathy. Cross‐ listed as PATH 432 and PHRM 432.   Regions of the eye that will be discussed include the cornea.0  Offered every fall semester.  STROWBRIDGE. physiology.0  Offered spring semester. The course will begin with a brief review of cellular  neurophysiology and the techniques used to study synaptic potentials.  (See BIOL 374). neuroscience.  This graduate level course will  provide the student with broad exposure to the most recent and relevant research currently being conducted in  the field. their organization into circuitry. Prereq: NEUR 402  or consent of department. Students will read and present a mixture of historical and modern papers that established the  fundamental principles of synaptic transmission and plasticity.  NEUR 432: CURRENT TOPICS IN VISION RESEARCH Credit Hours: 3. Student grades will be based on two short (5 page) essays and class  participation.  Instructors in the course are  experts in their field and are members of the multidisciplinary visual sciences research community here at Case  Western Reserve University. and molecular biological properties  of nerve cells. research proposal (40%).  genetics. and their function within networks. Next we  will consider the role of calcium in regulating the release of neurotransmitters and in short‐term modulation of  synaptic potentials.  The visual pathway from retina to LGN and visual cortex is described with an emphasis on circuits that produce  successively more complex receptive field properties. Biophysical. Term paper required.  Topics will cover a variety of diseases and fundamental biological processes occurring in the eye. and a term paper.  demonstrations in the laboratory and the clinic. Emphasis on quantitative  methods for modeling neurons and networks. and journal club presentations. R.  Description: How nervous systems control behavior. P. retinal ciliopathies.0  Offered alternating years.  STAFF  Description: The organization. We will also consider the relationship between short‐ and long‐term synaptic plasticity and  behavioral functions such as learning and memory. and function of the vertebrate visual system are considered in detail. Cross‐listed as  BIOL 473    NEUR 474 : NEUROBIOLOGY OF BEHAVIOR Credit Hours: 3.  Description: This course will explore the basic mechanisms of synaptic transmission that operate at central and  peripheral synapses.  Students will be exposed to the experimental approaches and instrumentation  currently being used in the laboratory and in clinical settings.0  Offered alternating years.

    NEUR 482: DRUGS. All Neurosciences graduate students  matriculating in 2004 and later must complete this course (typically during their 3rd or 4th year in the program. Maximum of 15 students with  preference given to graduate students in the Neurosciences program.  (See MBIO 518).  WOOD.    NEUR 518 : SIGNALING VIA CELL ADHESION Credit Hours: 3. Students are taught a range of models for neurons and neural circuits. candidates only. All students are required to complete the course. Cross‐listed as BIOL 476. Credit Hours: 1. The course introduces students to dynamical  systems theory for the analysis of neurons and neural circuits.0 ‐ 18. Cross‐ listed with EECS 478 & BIOL 478.    NEUR 540: ADVANCED TOPICS IN NEUROSCIENCE ETHICS Credit hours: 0.    NEUR 701: DISSERTATION PH.  and other current topics. and Zigmond. models of plasticity and learning.)    NEUR 601: RESEARCH IN NEUROSCIENCE Credit Hours: 1.    NEUR 479: SEM:COMPUTATIONAL NEUROSCIENCE Credit Hours: 3.  Strowbridge. H.  Description: Readings and discussion in the recent literature on computational neuroscience.0  Offered alternating years. Credit Hours: 1.S. D. S. Cross‐listed as BIOL 482. spring semester (last offered in spring 2005)  BEER. Cross‐listed as MBIO 518.0    NEUR 651: THESIS M. spring semester (last offered in spring 2006).S. postdocs and faculty are  13    . Six 2‐hr meetings per semester. Term project required. on‐line  course material and small group discussions.  WOOD. Cross‐listed as BIOL 479.  Description: This course offers continuing education in responsible conduct of research for advanced graduate  students. D.D.0  Offered alternating years. B.0  Offered alternating years. and the computational properties of nervous  systems. Two lectures per week.0  Offered every spring semester. AND BEHAVIOR Credit Hours: 3. as well as to cable theory.0  Offered every fall semester.0  (Credit as arranged).  Offered every other spring semester (beginning 2008) – Students who matriculated before 2004 are exempt from  taking this course). NEUR 540: ADVANCED TOPICS IN  NEUROSCIENCE ETHICS will be completed in the third or fourth year of graduate study (spring  semesters) and engages more detailed discussion. Prereq: M.0 ‐ 18. This  course that outlines fundamental information and some case studies is generally presented in  one week in May.W.  BRADY‐KALNAY. R. Students. A second responsible conduct course.NEUR 476 : NEUROBIOLOGY LABORATORY Credit Hours: 3. R.  IBMS 500: ON BEING A PROFESSIONAL SCIENTIST at the end of the first year of study.  (See BIOL 476).0    Responsible Conduct in Research.E. models of brain  systems. and are asked to implement and  explore the computational and dynamic properties of these models. and CHIEL. adaptive behavior. BRAIN. numerical integration methods. and their relationship to artificial neural networks.  (See BIOL 482). spring semester (last offered in spring 2006)  THOMAS. Peter (MATHEMATICS)  Description: Computer simulation of neurons and neural circuits.    NEUR 478: COMPUTATIONAL NEUROSCIENCE Credit Hours: 3. The course will cover the nine defined areas of research ethics through a combination of lectures. passive and active  compartmental modeling.0 ‐ 6.

 The advisor and two additional Neuroscience training faculty who are  selected by rotation from a list of all training faculty (see Narlene Brown to determine the  composition of your committee) form an examination committee.cfm). University regulations regarding quality point average and academic  probation form the minimum expectations of our students. A topic for a mini‐grant proposal. one must be a member of the Graduate Education Committee. The exam committee chair will  submit a written report within one week to the Graduate Program Advisor. One week after submitting the proposal the student will give an oral  presentation to the committee and defend the proposal. out of which. workshop calendar at  http://ora.    Preliminary Exam‐‐end of first year. Three weeks later (4 weeks total). A four member committee will be determined by the faculty advisor and  student and must include at least two Neurosciences training faculty. 3 pages introduction. background &  significance and 7 pages specific aims and experimental design). A  personalized course of study may be recommended if necessary.    One week after receiving the topic. The proposal should describe  1‐3 experiments that are feasible within a 3 year time interval.    Examinations  Progress toward the PhD is marked by grades in coursework. Any student with a quality point  average below 3. If the student fails. Questions about the topic  should be directed to members of the student's examination committee and not to other  faculty or students. The student is given a primary research article selected by  the faculty advisor. Copies of the documents that  supported successful exams are available for students to view (see Katie). One week later the  student makes a 30 min presentation including relevant background. The student is not required  to discuss all facets of the paper but should emphasize its important aspects. the committee must be constituted of at least 3 primary  faculty members. the student will submit  to the committee a 10 page research proposal (Approx. The goal of this exam is to identify students who exhibit  significant gaps in basic knowledge. clearly distinct from the student's  and sponsoring lab's research project will be selected by the faculty committee and given to the  student. This exam constitutes a critical milestone in graduate  training. The qualifying exam committee is responsible for insuring that the exam topic is  appropriately distinct from the student’s thesis work.cwru.0 at the end of 2nd or 4th semesters of graduate study may be separated from  the University by a majority vote of the primary faculty in the Department of Neurosciences.5 hours. The chair of the exam committee must be a primary faculty member in the  Neurosciences Department.    Qualifying Exam‐‐end of second year. and the student will be broadly  questioned in an exam that typically takes 1.ra.encouraged to participate in monthly workshops presented by the Office of Research  Compliance (http://ora.edu/research/orc/education/onlinecalendar.edu/research/orc/rcr/index. and a critique of the results and discussion. It tests the ability of a student to identify an important problem and propose creative  and feasible solutions. The exam must be  completed by July 31 of the first year of study. If the advisor is not a  primary Neuroscience faculty member.cwru. the student will submit specific aims for the proposal that  must be approved by the committee.cfm.  and the advisor. laboratory research and successful  completion of exams. The chair of the committee  must be a primary faculty member in the Neurosciences Department. description of the  experiments.ra. Students should practice their  presentations to ensure that the presentation time limit is followed.  14    . Successful  completion of the exam is required for progression to the second year of graduate school.

 the thesis research should utilize more than one technical approach. the Office of Research Integrity considers plagiarism to include both  the theft or misappropriation of intellectual property and the substantial unattributed textual  copying of another’s work. Substantial  unattributed textual copying of another’s work means the unattributed verbatim or nearly  verbatim copying of sentences and paragraphs which materially mislead the ordinary reader  regarding the contributions of the author.D. thesis seminar.” For more information on this issue.  By the time of the thesis examination. In the thesis  document. Students should email Katie Wervey  (kar18) to let her know these advancements have been achieved.  The first draft of all manuscripts should be written by the student. the student should have submitted for publication at  least one peer reviewed experimentally based manuscript on which he/she is the first  author and have completed a body of work that the student's committee judges will  lead to a second manuscript.D.dhhs. see  http://ori.  During the course of study.  Goals for Graduate Students:    Students must strive to develop with the advisor a research project that yields a coherent and  original body of work. and a draft of the second manuscript should be completed. This exam should be completed by  July 31 of the second year of study. in accordance with University guidelines. The chair will submit a  report to the Graduate Program Advisor within one week. the student should demonstrate that  he/she has become an expert in the field of research. The draft  submitted to the Thesis Committee should be a polished document developed in  consultation with the mentor. collaborative research projects and/or journal clubs.  The first draft of the thesis must be the original and individual effort of the student.    B. Goals for the Training Faculty:    Training faculty of Ph.    Research Integrity.the committee may give the student a second attempt to pass the exam. at least one national meeting. It does not include authorship or credit disputes.shtml    GUIDELINES FOR THESIS RESEARCH    A.  The thesis must be written in a scholarly manner with a detailed historical introduction and a  critical discussion. ORI generally does not pursue the limited use of  identical or nearly identical phrases which describe a commonly used methodology or previous  research because ORI does not consider such use as substantially misleading to the reader or of  great significance. “As a  general working definition. Satisfactory performance on this exam will admit the  student to Candidacy for the Ph. The graduate school requires written notification of every  advancement in a graduate student's progress to mark each of the following events 1) selection  of research advisor 2) selection of thesis committee members 3) successful completion of  qualifying exam 4) successful completion of Ph. Students should carefully attribute material generated by others. students must be active participants in the Neurosciences Program  and contribute to courses. program.    Change of State Notification.gov/policies/plagiarism. The  15    . students should present their data at.D. and thesis defense.  In general.

 in conjunction with the Thesis Committee. the purpose of the  committee takes on the additional role of ensuring the completion of a scholarly thesis. member). The first  meeting need accomplish no more than a discussion of the general topics for thesis research. The  16    . each student will notify the Graduate  Student Coordinator (Katie Wervey) so the Advancement to Candidacy form can be filled out   and sent to Graduate Studies.  The thesis advisor is responsible for providing physical. and the University requires that one member has a primary  appointment outside this department. and help the student develop into an  authority in his/her field. including the elaboration of an  independent research project.    The thesis committee shall have a minimum of three members (the thesis advisor serves as a  fourth. evaluate data from the student’s own  research and that of others.  The thesis advisor must provide the student with intensive training in the scientific method. and discuss the broad context and significance of the  student’s work. the trainer must bring the student file and rotation reports. financial.  The thesis advisor should encourage the student to think broadly about the research project  and not necessarily be limited to approaches/techniques currently used in the advisor’s  laboratory. and intellectual resources  necessary for accomplishing the research plan. and is  recommended if the direction of work shifts substantially.  and preliminary exam and qualifying exam reports should be reviewed at this time. ex officio. A primary appointee in the Department of  Neurosciences chairs the meetings. in both speaking and writing. who will be the  chair of the committee.program periodically reviews faculty for training status.    The Thesis Committee    Graduate training has as its goal the extension of knowledge and the development of  scholarship. The presence of one half plus one of the members of the committee constitutes a  quorum. This requires input from faculty advisors who work together with the student and  faculty advisor to guide the scope of the research. When the committee agrees that the  body of work accomplished is adequate to earn a doctoral degree. and faculty who have been  inactive will be declined. The student should feel free to consult individual members at  any time. The membership of the thesis committee can change during the course of work. develop feasible research  approaches to answering such questions.  including the ability formulate clear research questions.  The thesis advisor should work regularly with the student to develop good communication  skills. Thesis committee members should have expertise that corresponds  with the proposed work and an acknowledged interest in contributing constructively to the  student's progress.  The thesis advisor.    Upon successful completion of the qualifying exam.    At the first committee meeting. Students have 6 months from their qualifier to form their thesis  committees and must notify Katie with the names of the committee members. The committee is to serve as the student's advocate in  advancing toward the doctorate. and when the first meeting will take place. is responsible for developing and  implementing a training plan with the student. A  frank discussion of the strengths and weaknesses of the work should be encouraged.

 or the Chair of the  Department.meeting should end with the development of a consensus plan for the next 6 months. a brief written summary of the student's progress  since the last meeting should be given to each committee member.    The Committee is responsible for seeing that the standards and the requirements of the  program are fulfilled.    The Thesis Committee evaluates the strengths and deficiencies in the training plan or in its  implementation and discusses these with the mentor and student. a date for the next meeting will be set for 6 months later (unless directed  by the committee to meet sooner). The report must contain a clear assessment of whether or not  “satisfactory progress” is being made towards a Ph. It is ultimately the responsibility of the Chair of the Committee to bring  any unresolved problems to the attention of the Director of Graduate Studies and/or the  Departmental Graduate Education Committee. The Committee should serve  as a sounding board if the student encounters problems in the graduate program and should  create a relationship with the student where it is clear that such interchanges are encouraged.    Progress Reports must be completed within one week of the committee meeting and sent to  the members of the committee and to the Departmental Assistant for placement in the  student’s confidential folder. It is very important that students and their committees meet every 6  months. The committee chair must send a short synopsis of the  meeting to the Graduate Program Advisor and Neuroscience Departmental Assistant within one  week. so that the student and committee members can enter it  into their calendars.    The Thesis Committee must meet at least once a semester to monitor student progress. If the student receives two unsatisfactory grades in  NEUR 701.  they should bring their differences to the Departmental Graduate Education Committee (* see  under “Student Advocates” – next section). even if the student does not feel he or she has enough data to report. degree. It is the responsibility of  committee members to read the report prior to the committee meeting. This assessment is one of the key  responsibilities of the Advisory Committee.    The Thesis Committee is responsible for approving the shift in the student’s priorities from  doing experiments to writing the thesis. the Graduate Program Advisor.    After every meeting. It is the  responsibility of both the Chair of the Committee and the student that these meetings take  place. the student is separated from the University. and outline  advances and proposed areas for work.D.      17    . Before doing this. so that the  committee can be kept up‐to‐date on his or her progress and can advise the student. the student must present to the  Committee a brief outline of the proposed written thesis.  Subsequent meetings should put new work in the context of the entire project. mentor and committee cannot come to an agreement about the training plan. Students will not be allowed to register for a semester if there has not been a Committee  meeting during the previous half‐year period.    At least two weekdays prior to each meeting.    If the student.

 thesis advisor.The Dissertation  All candidates for the PhD degree must submit a written dissertation as evidence of their ability  to conduct independent research at an advanced level. Detailed regulations concerning  format. In the event that difficulties arise during graduate training. degree. quality.  At  least 18 hours of course work must be at the 400 level or higher. a student must maintain continuity  of registration and a minimum cumulative grade point average of 2. a student is  advised to seek advice from one or more sources including the student's faculty advisor.  Members of the University community who believe they have been sexually harassed are  entitled to an investigation. David Katz. To  complete the requirements for a Master of Neuroscience. The student must successfully pass the preliminary exam as well as a special  Masters qualifying exam. A  graduate student. the MSTP director. The Graduate Education Committee within the Dept of  Neurosciences will meet on an ad hoc basis to discuss policy issues in Graduate Education. At least six  months before the student anticipates PhD completion. Alison Hall. students may express a grievance against  actions of students or faculty and staff through procedures handled by Graduate Studies (for  academic problems) or the University Office of Student Affairs (for non‐academic problems). but is arrived at by the student and thesis committee.    Master of Neuroscience Degree.S. officials in the Provost's Office.  Stefan Herlitze. The dissertation must represent a  significant and original contribution to existing knowledge in the student's field. an  individual may leave the Doctoral program after completing a significant body of course work  and independent research. placed in context with a general Introduction.    Student Advocates. Office of Student Affairs and/or the  Office of Affirmative Action/Equal Employment Opportunity will provide options for resolution. and a  Discussion that considers the relevance of the studies. and instructions are available from the Office of Graduate Studies. Committee member. the departmental chairperson  or if relevant. Under these conditions. On rare occasions. Richard Zigmond. Students are also  encouraged to seek advice from the Director of Graduate Education. Alison Hall. and under no circumstances will a  Masters degree be awarded as part of a Doctoral curriculum. pg.  who will work to effect resolution. or Graduate Program Advisor can bring  to the Committee at any time cases where serious breakdowns in communication have  occurred with respect to the students’ graduate studies and ask the Committee to intervene. If necessary. the thesis  often reflects that work as chapters. and Ben Strowbridge (Committee Chair). the Graduate Education Committee. No student will be admitted to  the Program for the sole purpose of earning a M. other  concerns arise. a thesis committee meeting should be  held to discuss whether the student's progress toward the degree is sufficient. the  graduate program advisor.  Members of the Graduate Education Committee include Drs. because once a postdoctoral position is begun. in TG‐1. Examples of  Neuroscience graduate theses are in the Neuroscience library. Any requirements not  specifically addressed below such as those pertaining to grade point average. 17). The Neuroscience program is a Doctoral degree granting  program and does not offer a Master’s of Science curriculum. however. a Master of Neuroscience degree (Type B)  may be awarded under the recommendation of the student's thesis or qualifying committee.75 (see Graduate Student  Handbook. time of submission and oral defense are established by the Dean of Graduate  Studies and Research. Dr. The form of the thesis is not proscribed  by the department. Because many students have published manuscripts on their studies. and have completed a total of 27 semester hours of course work. It is in a student's interest to submit any  manuscripts before leaving the University. residency and  fees conform to the regulations for the Master’s degree specified in the general University  18    . The committee  should agree at that time to the format of the thesis.

 Manager (mxp19. it has always operated as a completely open core facility (anyone in the  community can use these instruments at the same hourly rate). office: 368‐2575 or cell: 216‐224‐8649)  Ben Strowbridge. and to begin to supervise personnel in the laboratory as appropriate. and who have pursued a research program. Forms are available from the Office of Research Grants. Director (bxs48)  http://neurosciences. The Neuroscience qualifier examination consists of an “NIH  style” research proposal that has both written and oral components. these students will earn a Master of Science in  Neurosciences. Postdoctoral fellows are encouraged to  present their work at national meetings. the  19    . a major source for postdoctoral funding is the National Institutes of  Health National Research Scholar Award (NRSA). This program is aimed at students who have taken most or all of the courses required  for the Ph.  these proposals are developed by the fellow. To earn this Master’s degree one of  two examinations must be passed: Passage of the Neuroscience qualifier exam or successful  oral defense of a research report. molecular and physiological analyses of  neural function.    Foreign students. and  often read by other investigators with the intention of demonstrating good grant skills during  this enterprise. contact Graduate Studies. The research report is  based on the student’s original research and will be tested in an oral examination by the  student’s advisory committee.    Postdoctoral Fellows are advised to begin to establish independent scientific identities. Jane Coffin Childs. etc. In general.case.    Postdoctoral fellows may wish to contact the  CWRU Postdoctoral Researchers Association at  http://www.html    Postdoctoral fellows are strongly encouraged to obtain their own outside financial support. Office of Foreign Faculty and Scholars  (x4289. The NIC houses some of the  most sophisticated microscopes available today. For more  information about postdoctoral policy. Additional specialized facilities are available:    NEUROSCIENCES IMAGING CENTER (E632)  Maryanne Pendergast.D. The University Attorney’s office. in  order to develop grant skills and achieve the distinction of independent support. Upon successfully passing one of the two examinations and  fulfilling the above requirements. Currently. including the Zeiss LSM 510META confocal.edu/provost/gradstudies/pra.edu/imaging/index    The Neurosciences Imaging Center (NIC) has been in existence since 1994 and is the oldest  optical imaging facility on campus.    NEUROSCIENCE FACILITIES    Laboratories are fully equipped for advances in cellular. FAX x1881) is a resource for foreign students. Multiple Sclerosis Foundation. Additional agencies that support particular  research areas include American Heart Association. Although the center is located within the Department of  Neurosciences. read and constructively edited by the PI.Bulletin. to provide topical lectures in relevant graduate  courses.case. This  may be achieved by the pursuit of a clearly defined and unique project within the lab  increasingly directed by the postdoctoral fellow. Paralyzed  Veterans.

  thereby avoiding the need to resection tissue for confocal microscopy.  543nm. This system is mounted on a Zeiss Axiovert 200M microscope and  includes a 100mW multi‐line (458nm.    The Zeiss LSM 510META is the primary confocal microscope the NIC.  The system offers eight excitation wavelengths (405nm. Both the Leica  TCS SP2 MP and the BioRad 2100MP can perform 2‐photon imaging.    A Zeiss LSM 410 confocal microscope. the system offers six visible light wavelengths (458nm.    Another Zeiss inverted microscope stand is equipped for TIRF (Total Internal Reflection  Fluorescence) imaging. is also available for use  at a reduced hourly rate.  488nm. 514nm.Leica TCS SP2 MP confocal/multiphoton and the BioRad Radiance 2100 multiphoton laser  scanning system. 488nm. three  separate PMTs. and 514nm) Lassos 77 laser and a high NA (1.  this system remains in excellent condition.45)  100x α plan‐FLUAR objective. Instead of traditional dichroic filter sets. resulting in a very flexible and efficient  detection system. The evanescent field formed by this system can vary between 60  330nm and is able to excite dyes in an aqueous environment at or near the cover glass/ cell  20    . The BioRad system also is equipped  for patch clamp electrical recordings and can be used for brain slice experiments. To facilitate live cell imaging. A lambda stack  collected from individual reference dyes can be used to generate an emission fingerprint that  can subsequently be used for spectral un‐mixing of closely related dyes and is often used to  separate different GFP variants. is easy to use. It can be mounted on  either a motorized inverted stand (Axiovert 200M) or a manual upright stand (AxioImager Z1). Since the Leica system is  based on an inverted microscope. and 633nm) plus a tunable (720nm‐950nm) IR light source (Choherent  Chameleon XR MP laser) for 2‐photon excitation. The Neurosciences department has one of the largest concentrations of 2‐  photon microscopes in the country (the BioRad 2100MP and Leica TSC SP2MP in the NIC and  two custom systems in the Strowbridge laboratory). 477nm. While this system has many advanced  features. 458nm. and is often available when the  LSM510 is fully booked. 488nm. FRET and FRAP) are available for on‐line imaging. 514nm. Despite its age. It is located in  its own room (E639).    The Leica TCS SP2 MP confocal/multiphoton microscope combines spectrophotometric  detection with confocal and 2‐photon microscopy. 2‐photon imaging also is  well suited to image living specimens since it generates much less phototoxicity. the predecessor to the LSM510. a  Bioptics Delta T4 heating stage and objective heater can be used with both the wide‐field and  confocal systems within the facility.  Physiology. each with its own adjustable pinhole and emission filter wheel. a  prism is used to separate the emitted fluorescence. 543nm. it still can be used as a general‐purpose inverted confocal microscope. 476nm. each with  its own adjustable pinhole and emission filter wheel. For excitation. it is easier to use for live culture cells while the BioRad  system is more convenient for intact or semi‐intact tissue. The LSM 510META scan head can acquire  lambda stacks in 10 nm increments over a broad spectral range (411‐753nm). The LSM410 is located in its own room (E638). 594nm and 633nm) and for detection. 2‐photon microscopy ideal for imaging through live or fixed brain tissue. The system consists of an LSM 410 scan head mounted on an inverted  Axiovert 100 microscope stand and offers five excitation wavelengths and for detection.    The Bio‐Rad Radiance 2100MP is a dedicated 2‐photon laser scanning system attached to an  upright microscope. Four commonly used software modules (Multi‐time. three separate reflected light PMTs.

    The Neurolucida 3D reconstruction and stereology system is based on a Zeiss Axioplan upright  microscope with a high resolution motorized stage and is designed to facilitate three  dimensional tracings and reconstructions of neurons filled with fluorescent or opaque dyes. It includes Macintosh and PC workstations loaded with software for data analysis. morphometric analysis. A point light source enlarger. In  addition the system offers a separate stereology package that allows the user to estimate cell  number and morphological properties of 3D structures from 2D data. calcium ratio  imaging.            21    .interface. and time lapse experiments.5 is available on the PC computer.  Located in the Zigmond Lab. TLC plates  and microplates.    We also operate a general‐purpose Inverted Wide‐Field Microscope that integrates a Zeiss  Axiovert 405 microscope with software. computers and cameras. For  information or training contact Maryanne Pendergast (mxp19 x2575). An off line version of the LSM 510 software. and a 350. For information or training contact  Richard Zigmond (rez x4614). blots. room  E632b. an Epson Stylus Photo 2200 printer. rapid  processors and a high quality copy stand are provided in the E630 darkroom suite. chemifluorescent. 3D reconstruction.    The Bio‐Rad model 3000 Versadoc Gel Imaging System is designed to capture and analyze  digital images from a wide range of samples. On‐line display allows visual  confirmation of the PCR amplification in progress.  Release 3. For additional information. and fluorescent  samples. office: 368‐2575 or cell: 216‐224‐8649).000 pixel CCD detector makes  possible the simultaneous detection of up to 96 samples. To facilitate live cell imaging. The software (Metamorph  and Metafluor) is designed to support image acquisition. and also  the multiplexing of up to four (4) different reporter fluorophors. including gels.    PHOTOGRAPHY SUITE.    The department’s Computer Lab is also located in the Neuroscience Imaging Center. please contact  Maryanne Pendergast (mxp19. and image processing. Peripheral equipment includes Polaroid 5000 and  6000 slide makers. and a Microtek scanner capable of  scanning both reflective and transparent images. This system is designed to image fluorescence labels in or very near (within a few  hundred nm) the plasma membrane in cultured cells. A broad‐spectrum tungsten light source and  multiple filters permit a wide range of excitation and emission between 400‐700nm. autoradiograms. a  Bioptics M‐type stage heater and adjustable objective heater are available for use with this  system. The system is able to detect and quantify standard nucleic acid and protein  specific stains as well as chemiluminescent. a diffuse light source enlarger.    ICYCLER.  manuscript preparation. room E734a  The Bio‐Rad iCycler iQ PCR detection system allows the user to both monitor and quantify a  Polymerase Chain Reaction (PCR) in real time. colorimetric.

  http://neurosciences.  William M.edu/ora/iacuc/. and BRB).  Director: Dr. Tower. The Core laboratory is temporally located in  the Wolstein Building but will expand to its main location in the newly renovated Animal  Resource Center (ARC) in November 2007. East.  contact Midori Hitomi.htm.case.edu/crbc/index  The goal of the Rodent Behavior Core in the School of Medicine is to conduct state of the art  rodent behavioral testing for investigators at Case and other nearby institutions.  Core Director: Gemma Casadesus (gxc40 x8503). Selected vendors have commonly used items and special orders at facilities on  campus. retrofitting. administered by departments:  Gibco/BRL/Invitrogen. Manager (wmf3 x3225). Biochemistry W450  Fisher.case.    OTHER FACILITIES/SERVICES    ELECTRON MICROSCOPY FACILITY. The Core can  assist in all aspects of rodent behavioral testing including design and execution of behavioral  tasks as well as data analysis and interpretation.    BASIC SCIENCE INSTRUMENTATION REPAIR FACILITY. All individuals involved in research using vertebrate animals are required to  be trained and to be listed on an approved animal protocol. a sectioning room.CASE RODENT BEHAVIOR CORE. place/fear conditioning. The core  facility is equipped to perform a comprehensive battery of behavioral tests to thoroughly  phenotype overall motor and sensory function of rats and mice as well as phenotype specific  behaviors that are of interest to the investigators (learning and memory. fabrications.  equipment design and modification. For information. a fully  equipped sample processing laboratory.  http://casemed. Hisashi Fujioka (hxf3 x2490)  Training and Facility Manager: Midori Hitomi (mxh67 x3454)  Institute of Pathology (IP Room 116)  The electron microscopy facility includes JEOL 1200 EX transmission electron microscope. and a dark room. and anxiety‐related behaviors).  Mechanical and electrical diagnosis and repair of general and specialized laboratory equipment.edu/sirc/default. These individuals must read and  sign the protocol. reconditioning of older  equipment. motor function and  gaiting.    VENDORS.  (SOM. BRB 547            22    . Information about animal research at CWRU is available at  http://casemed. B‐05 at the basement intersection of Wood. pain/analgesia.    ANIMAL FACILITY.case. Frank. Pharmacology W361  Boehringer Biochemistry W450  New England Biolabs.

os.dhhs.nsf.nagps.org/uk    Society for Neurosciences  http://www.andp.org    Association for Neuroscience Departments and Programs  www.jhu.med.sfn.faseb.Useful Websites:  The National Association of Graduate‐Professional Students  http://www.edu/jhpda    Science next wave  http://nextwave.org    American Society for Cell Biology  http://www.org    National Science Foundation (NSF)  http://www.org/    Johns Hopkins Postdoctoral Association  http://www.gov/    Department of Health and Human Services  http://www.gov/    23    .sciencemag.org/    FASEB  http://www.ascb.

Current Students in the Neurosciences Graduate Program (2010)    Name          Brent Cameron      German Cardenas Leroy   Paige Cramer       Marc DePaul       Rishi Dhingra       Yi Dong       Teresa Evans       Angela (Nord) Filous     Stephanie Fox       Davina Gutierrez     Robert Hyde       Rebecca James      Ksenia Kastanenka     Hyunjin Kim       Bradley Lang       Chung‐Ying Lee      Sungho Lee       Chen Liu       Shweta Mandrekar     Crystal (Kozora) Miller     Inna Nechipurenko     Eugene Oh       Joanna Pucilowska     Pavel Puzerey      Julie Savage       Loren Schmidt       Maria Smith       Yi‐Lan Weng       Steven Wyler       Elizabeth Young     Isaac Youngstrom     Year entered into program                                                                2008  2009  2007  2009  2008  2006  2009  2008  2004  2003  2008  2008  2006  2008  2009  2006  2009  2003  2005  2005  2005  2005  2007  2009  2008  2008  2005  2006  2009  2005  2009    24    .

 U of Michigan  Brian Block. KY  Ling Cheng.D. Columbia University  Allison Limpert.  Kristen Boeshore. PhD. Medicine. 1999 Deceased  Brian Halabisky. Prof. U. PhD 2005 Resident.D.. Ph. Denver  Carol Haney. University of Miami.. Martin Goulding Lab  Libin Ho.D. Pain Med. UCSF  Alison Hall. Univ.D.D.. Ph. MSTP.  David Dewitt. 2000 Asst. Ph. and Educ. MA  Stephen Davies. University Hospitals Health Systems  Dmitry Fyodorov. MSTP. PhD 2004 Analyst. PhD 2004 Postdoctoral Fellow. PhD 2002 Research Fellow. Vanderbilt University. Molecular Neuroscience. University Hospitals Health Systems  Laura Gault. Specialists (Private Practice). Ph.D. Asst. Biology. PhD 2007 Postdoctoral Associate. Res. Meador  Woodruff La. Molecular and Human Genetics. School of Medicine. PhD 2005 Postdoctoral Fellow. Neurology. PhD 2008 Postdoctoral Fellow. M.. Associate Professor. Dept. Inst. Li Gan Lab.. Director. Vance Lemmon Lab  Xiang Li. of Colorado Health Science Center. of Colorado Health Science Ctr. Johns Hopkins U. Cleveland Clinic  Bethany Cruise. MSTP. Baptist Med. 1996 Instructor in Pediatrics. Jacksonville  Sonya Ensslen. WFU Core Teaching Faculty.D. of Oregon Health Sciences Ctr. Ph. MSTP. Univ. 1996 Dir. PhD 2006 Visiting Asst. Science Teacher. (NCIRE) ‐ Dr.D. KY  Christopher B. Eckman.S. PA  Theresa Ann Brosenitsch. Tufts University School of Medicine  Guoping Fan. PhD 1997 Internal Medicine Pediatrics and Adolescent Medicine. Lebanon Valley College. David Geffen School of Medicine at UCLA  Michael Fitch.. Instructor in Medicine. Dr. Phillip Popovich lab  Jeannette Hayes (Davies) Ph. Prof. Mental Hlth.D. Washington University Medical School  Katherine Krueger. FL. MSTP. Gladstone Institute of Neurological Disease. Neurosciences. HMS  Paul Kammermeier. Ph. Ph. Denver  Alicia Hawthorne. Zhogbi Lab. PhD 2005 Assistant Director for Development.. PhD 2007 Resident. of Cell Biology. Physiology. 1999 Unknown  Tim Hendricks. Johns Hopkins University  David Canning. 2009 – Medical School ‐ The Ohio State University  Qingguang Jiang. PhD 2001 Faculty.. PhD 1999 Instructor in Pediatrics.D. Madison. WI  Kevin Horn. PhD 2009 Postdoctoral Fellow. Univ.D. CWRU Neurosciences. E. PhD 1999 Asst.D. Professor. MSTP. CWRU Neurosciences. Primary Care Physician. Prof.  Johns Hopkins Univ. PhD 2004 UC San Francisco. ED Simulation Prog. North Dakota  Andrew Cordle. Molecular & Behavioral Neurosciences Inst. CWRU  Jing Han. Orthopedic Surgery. PI: G.D. Harvard University  Molly Fuller. Mayo Clinic. PhD 2007 Postdoctoral Research Fellow. Ph. 1997 Asst. University of Pennsylvania  Karen Baracskay. U. Lilly Bourguignon lab  at the San Francisco VA Medical Center  rd Phillip Larimer. 2001 Staff Scientist.  2009 Postdoctoral Fellow. Silver Lab  Christy (Gray) Butler. for Res. Wake Forest Univ. Director. Murray State University. of Medicine. MSTP. Davis  Elizabeth Chiang.. Dean Health System. Emergency Med. CWRU.. Ph.D. Cambridge Health Alliance. Baylor College of Medicine  Martin Gartz Hanson.. Ophthalmology. Albert Einstein College of Medicine  Limin Gao. MSTP. 1996 Instructor. Case Western Reserve University. PhD 2007 MD Intern. CWRU. Prof. Asst. PhD 2008 Postdoc.D. PhD 2008 Postdoctoral Fellow. for Creation Studies. Ph. Neuroscience Program Faculty  Nicole Francis.. Ctr. Prof. Ph. Ph. Boston University Medical Campus  Meredith Albrecht. Massachusetts General Hospital  Katherine Alex. Oberlin College  Agnieszka Balkoweic. Daniel Jay Lab.D. of Colorado Health Sciences Ctr. Erin Lavik Lab  Jessica Koenigsknecht‐Talboo.. Anesthesiology & Critical Care.D. of Molecular & Cellular Biology. Assoc. David Ginty Lab  Kristin Long Kaelber. Harvard  Nadine Goodman.D. PhD 2006 Homemaker  Yuan Gao. Partner. Office of Graduate Education. 2001 Unknown  Colin Combs. 1999 Asst. Ctr. Ph. Ph. PhD. Salk Institute. of Pittsburgh  Sue Burden‐Gully. Ph. Ph. Associate Professor. Clonetech  Amber Kerstetter. PhD 2000 Professor.  Ramani Balu.  Member. Human Genetics. Molecular Biology & Microbiology  Sarah Busch. M. PhD 2006 Resident. PhD 2007 CWRU Medical School  Stephen Colgrove. PhD 2009 Postdoctoral Fellow. Carter Lab  25    . PhD 2009 Research Associate. Anesthesiology. Ph. Pharmacology & Physiology. PhD 2009 CWRU 3  year Medical School  Timothy Lehman. Kandel Lab.  Alumni of the Neurosciences Program  Name Present Position  Xingbin Ai. Neurosurgery. CWRU. Strowbridge Lab  Andrew Garner MD‐Ph. Univ. Decision Resources. Prof. MSTP. Prof. Asst. The Ohio State University.. Liberty University. Boston. PhD 2004 Postdoctoral Fellow. Prof. Rochester School of Medicine and Dentistry  Shi‐Chu Kao. Assoc. Univ. 1999 Assistant Professor. MD‐Ph. Yale School of Medicine  Edward Gilmore. Pediatrics Children’s Hospital. Scientist. PhD 1997 Assoc.S.D. Prof. Gilmour Academy  Guy Guidry. PhD 2003 Postdoctoral Fellow. MSTP. MSTP. Ph.. Child Study Ctr. Northern California Inst. 1999 Assistant Professor. Pfizer Pharmaceuticals  Jessica Lerch‐Haner. PhD 2003 Postdoctoral Fellow. Research Assoc. Prof.D.. PhD 1999 Staff Anesthesiologist.D. Res. Dept..

 1999 Assistant Professor.D. Boston.D.  Melissa Shirley. Associate Director. 2007 Research Asst. University Hospitals Health Systems. MSTP. Cell & Dev. M. California. MD.D. Cleveland Clinic Foundation  Eric Wong.. 1997 Cardiologist  Xiu Yang. Ph. PhD 2006 Postdoctoral Res. 1998 Research Fellow in Medicine Harvard Univ. Chapel Hill. Forscher Lab. NC  Diane Snow. PhD 2005 Postdoctoral Fellow. MO  Todd Pressler. U.D. Ph. Seattle. & Medicine  Ken Swanson. Germany. Neurology. San Francisco  Maryanne Usiak. OH  Theresa Zwingman. PhD 2007 Resident.D. PhD. Designated Federal Official. OH  Sarah Shoemaker. Emory University  Esther Stoeckli. Radiologist. PhD 1999 Resident. Aetna.D. Ph.D.S. CCF  Robert Mohney. M. Cleveland.1997 Asst.D. MI  Catherine Rottkamp. Gabriel Corfas Lab. PhD 2008 CWRU Medical School  Mike Myers. PhD 2004 Postdoctoral Researcher. Louis University. Univ. Radiology. Harvard Medical School – Assistant in  Medicine: Children’s Hospital. Ph. Research Associate. Assoc. Allergy & Immunology. Programs. 2001 Unknown  Louise Milner. Columbia.S. Neurosciences.  Alumni of the Neurosciences Program (continued)  Name Present Position  Stephen Maricich.D. Ph. Harvard Medical School  Mian Xie. Ph. 1997 Sr. 1997 High school teacher. Office of Science and Health Coordination. Allen Institute. Merck Pharmaceuticals  Karen Rollins.D. John Houle  Lab. Washington University  Yuefang Zhou. Ph.D. 1995 Pediatrician. Univ.  Trieste. 2000 Staff Scientist. M. UT Southwestern  Annette Shadiack. University of Louisville  Christi Wylie. Cleveland Clinic Foundation  Fred Moeslein. National Institute of Environmental Health  Sciences  Shibani Mukerji. MO  Lixin Zhou. International Ctr. 1997 Sr. Ph. Ph. Snider Lab. Res. 1996 Group Leader. PhD 2010 Postdoctoral Fellow Case Western Reserve University. UCSD.D. Ophthalmology. for Genetic Engineering and Biotechnology (ICGEB). PhD 2008 Guest Scientist at the Hertie Institute for Clinical Brain Research. PhD 2008 Postdoctoral Fellow. Elmquist Lab. Shah Lab. PhD Asst. 2000 Analy/Programmer III. PhD 2006 Residency. Neurology. MSTP. Ph.D. Ph. Assoc. PhD 2002 Postdoctoral Fellow. Amy Pasquenelli Lab  Stacey Memberg MD‐Ph.S. Protein Networks. Ph. PhD 1999 Assistant Professor Pediatrics. anatomy Control. Boston. Stephen Maricich lab  Anna Rivkin. WA  26    . of Tubingen. of Missouri. Ctr.: Beth Israel Deaconess Med. Oak Clinic  Robert McKeon. Assistant Professor. Neurosciences. CWRU. Ph. Department of Neurology and Psychiatry. Boston  Jennifer McDonough. Dr. Alan Faden Lab. PhD 2006 Postdoc. PhD 2007 CWRU Medical School  Dolly Padovani‐Claudio.. Kent State Univ. PhD 2008 Postdoc Dr. Vice President. Elan Pharmaceuticals  Xiaoying Tang. Louis. St. Advisor:  Mathias Jucker  Daniel Vogt. Ctr. Neurosciences. Preclinical R&D. Olengtangy.D. Ph.D. Urbana Champaign  Vic Rafuse. San Francisco  Zongqi Xia. PhD 2007 Postdoctoral Fellow. Inc. David Rowitch Lab. PhD 2002 Clinical Trials Coordinator. Emory University  Katya Melnik‐Martinez. Assistant Professor. Univ. of Illinois. Ph. Medina. Office of the Commissioner. Pediatrics.D. Department of Neurobiology and Anatomy. Assistant Professor. PhD 2008 Resident. M.D. for Stem Cell Biol. Scientist. Biology.D..D. Department of Spinal Cord and Brain Injury Research. North Carolina. ‐ Hematology/Oncology  Lori Taylor. Staff Researcher. Dalhousie University  Erin Reed‐Geaghan.. MSTP. Ph. Medical Pharmacology & Physiology. Drexel University College of Medicine. Ph. Biological Sciences. Children’s Hospital. Molecular & Integrative Physiology & Neuroscience ‐ Univ. PAC. Children’s Hospital. J.S. MSTP. Yale University  Michael Scott. Lab of Signal Transduction. 2000 Homemaker  Nicholas Varvel. Ph. FDA  Luis Polo‐Parada. Neuroscience Center. Italy  Nenad Ilic.. Ph. MSTP. Cleveland Clinic Foundation  Veronica Tom. Palatin Technologies. Prof. Ph. Private Practice. University of Michigan  Carlos Pena. Wade Regehr Lab. PhD 2007 Postdoctoral Fellow. Assistant Professor. and Dept of Ophthalmic Research ‐ Cole Eye Inst. Associate Professor. M. PhD 2006 Postdoc. OH  Harry Menegay. Academic Dir. Neal Peachey Lab Cleveland VA Med. Ph. II. N. 1998 Postdoctoral Fellow. University of Zurich  Yi Sun. UCSF  Xiang‐Dong Yang. 2005 Unknown  Diana Orentas. Georgetown University  Pin Xu. Paul. Executive Director.D.D. MSTP.D. Prof. Ph. 1997 Regional Scientific Associate Director. Mol. St. Ph. Lexington  Stacey Stephans. for Memory & Aging. PhD 2010 Postdoctoral Fellow.D.D. Assistant Professor.D. UCLA Inst.  Cleveland Clinic Foundation  Andrew Schaefer. Assoc. Ph.1997 Assistant Professor.S. CNS (Pharmaceuticals)  Stephen Ostrowski. University Hospitals Health Systems/CWRU  Doug McDonald MSTP. Biol. University of Kentucky. Pimplikar Lab. Associate Professor. MA  Xiaohong Xu.D. Ctr. PhD 2007 Postdoctoral Fellow. MA  Ivy Samuels. PA  Hui‐Hsin Tsai. UH  Catherine Meyer. Ph. UCLA. School of Biomedical Sciences. Harvard University  Lori Raetzmann. 2003 Fellow.