You are on page 1of 7

Base excision repair Basis tumpang tindih perbaikan eksisi dengan perbaikan langsung, dan merupakan multiple step

sistem yang melibatkan beberapa peserta. Ini target Adduct dasar "nonbulky", seperti yang dihasilkan oleh metilasi, oksidasi, reduksi, atau fragmentasi dari basa oleh radiasi pengion atau kerusakan oksidatif. Pelepasan bebas dari dikatalisis basa DNA oleh DNA glycosylases adalah fitur utama perbaikan eksisi basa. Setelah penghapusan yang dimodifikasi, rusak, atau terfragmentasi dasar oleh DNA glycosylase, sepasang menoreh APE yang 3 '(AP liase) dan 5' (AP hidrolase) ke situs apurinic. DNA polimerase mengisi dimulai pada kesenjangan 3'OH terbuka, dan DNA ligase segel nickname.

Ada lima baik ditandai glycosylases DNA manusia dengan substrat yang berbeda tapi kadang-kadang tumpang tindih spesifisitas (lihat Tabel II). Semua glycosylases relatif kecil, monomer protein yang tidak memerlukan kofaktor baik untuk pengakuan lesi DNA atau mereka enzim kegiatan. Karena sifat ukuran dan kimia dasar kerusakan beragam, adalah wajar untuk menganggap bahwa mungkin ada DNA tambahan akan glycosylases belum diidentifikasi.
ekspresi dari beberapa glycosylases adalah sel siklus-tergantung atau perkembangan diatur [Dehazya dan Sirover, 1986; Dingin dan Sirover, 1990; Meyer-Siegler et al, 1992;. Mansur et al, 1993.]. Ada sedikit bukti yang menunjukkan bahwa mereka adalah disebabkan oleh penghinaan genotoksik yang relevan. Oleh karena itu, mungkin bahwa glycosylases tersedia dalam inti sebelum kerusakan DNA terjadi, dan bertindak dengan cara pencegahan. Hal ini juga menunjukkan bahwa mungkin glycosylases inisiasi faktor-faktor di jalur BER. Pengetahuan tentang transkripsi mengatur faktor gen ini masih kurang. Ada sedikit informasi pada hubungan antara DNA glycosylase kekurangan dan penyakit manusia. awal informasi tentang enzim manusia diperoleh dari perbandingan klon cDNA yang homolog manusia terhadap dikenal enzim bakteri atau ragi, bukan dari manusia memperbaiki kekurangan sindrom. Telah diusulkan bahwa genom manusia menopang ribuan "hits" per hari, perbaikan yang melibatkan glycosylases DNA. Kegagalan BER jalur secara dramatis meningkatkan mutasi pada E. coli [Duncan dan Weiss, 1982], ragi [Impellizzeri et al., 1991],

Xanthoudakis et al. Basis eksisi menghasilkan kesenjangan 3-4 urutan nukleotida atau "Patch. Seperti banyak enzim perbaikan DNA lainnya. 1994]. 1995]. seperti 8-oxoguanine DNA glycosylase dan thymine glikol DNA glycosylase. antara mutasi dan Penyakit tidak jelas [Olkowski.].]. 1996. telah diteliti dengan baik [Demple dan Harrison. Pol ß adalah multifungsi. Kelas I enzim membelah ikatan 3 'pada gula abasic sementara kelas II enzim membelah 5 'obligasi. Manusia APE memiliki sebuah novel N-terminus yang dapat dan dengan demikian mengurangi mengaktifkan faktor transkripsi Fos dan Jun [Walker et al. hanya satu kelas II AP endonuklease. coli . 1994. Lesi ini biasanya dihapus oleh dua kelas endonuklease.. 1996] dan diferensiasi sel [Shadan dan Villarreal. Hal ini juga terlibat di dalam sel siklus penangkapan [Shadan dan Villarreal.. jika ada. Tumor mempromosikan efek dari mutasi pol ß [Dobashi et al. 1988. Pada manusia. Enzim Perbaikan eksisi Basis Manusia enzim Ukuran & gen lokasi E. 1996]. coli exonuclease III. 1998]. sebuah homolog struktural dan fungsional dari E.dan hewan pengerat [Klungland et al. Matsuzaki et al." Kerusakan-inducible DNA polimerase ß (Pol ß) secara optimal cocok untuk mengisi sedemikian "sangat singkat" patch [Randahl et al. saat ini pengetahuan tentang enzim ini masih terbatas pada biokimia studi. Mutasi APE manusia telah diidentifikasi dalam pasien yang menderita amyotrophic lateral sclerosis. 1994. Semua kelas tahu aku enzim glycosylase / AP lyases. Namun. mutasi penyaringan gen pada pasien sehat dan kanker populasi adalah pendekatan logis untuk menguji hipotesis ini Para apurinic / apyrimidinic situs yang dihasilkan dari DNA glycosylase kegiatan adalah lesi DNA noninformative mirip dengan AP situs yang dibentuk oleh depurination spontan atau depyrimidination DNA.] Mungkin mencerminkan keterlibatan dalam lainnya TABEL II. Hal ini wajar untuk berhipotesis bahwa DNA kekurangan glycosylase mungkin predisposisi faktor untuk penyakit manusia. Meningkatkan aktivitas pengikatan dimer DNA. 1993. 1995.. termasuk kanker. tetapi hubungan kausal.

dan tidak aktif terhadap 8-oxodG dipasangkan dengan dA Kanker paru-paru.1 Urasil DNA glycosylase Urasil DNA glycosylase Urasil DNA glycosylase Mengikat urasil membalik keluar dari dupleks DNA. cere.3 Endonuklease III Timin redoxyendonuclease glikol DNA glycosylase UV endonuklease I dan II Siaran timin glikol dari DNA yang rusak melalui N-glycosylase aktivitas dan dikaitkan dengan endonuklease kegiatan yang menengahi fosfodiester obligasi pembelahan di situs timin glikol dan apurinic situs [2] Urasil DNA glycosylase 33. hilangnya satu alel mengarah ke mengurangi BER. Lebih aktif pada 8-oxodG dipasangkan dengan dC dT atau dibandingkan dengan dG.8kDa 12q23-q24.2-.homolog S.8-25. [1] Timin glikol DNA glycosylase 60kDa 16p13. homolog Rodent Fungsi homolog Associated Referensi penyakit hOgg1 (8-oxoguanine DNA glycosylase) 39KDa 3p25/26 FPG (fungsional analog) MutY yOgg1 mOgg1 Cukai 8-oxoguanine dari DNA. beta-liase kegiatan yang nick 39 lesi. rilis bebas urasil dari DNA dan eksisi inisiat dasar .

siklik ethenoadducts dari adenin. HAP1. yang mengikat tetraphosphate diadenosine (Ap4A) dan mengatur sel pertumbuhan Bloom sindrom [3] Hydroxymethyluracil DNA glycosylase Tidak Hydroxymethyluracil Tidak ada DNA glycosylase Menghilangkan hydroxymethyluracil. Bentuk UDG / GAPDH (gliseraldehida-3fosfat dehidrogenase). coli) Perbaikan kerusakan alkilasi APE.) exonuclease III (E.perbaikan. guanin dan sitosin dan 8-oxoguanine dari DNA [5] APE (apurinic endonuklease. sebuah thyminederived utama Lesi DNA yang dihasilkan oleh radiasi pengion dan oksidatif kerusakan Aktivitas berkurang Werner sindrom [4] MPG (Nmethylpurine DNA glycosylase) 33kDa 16p13.3 Tagi dan TagII (Fungsional analog) MPG MPG beberapa Menghapus N-alkylpurine adduct. membuat tunggal-untai istirahat di apurinic situs dalam DNA Amyotrophic lateral sclerosis? [6] XRCC1 (X-ray perbaikan salib melengkapi. REF1) 36kDa 14q11.2-14q12 ExoA (S. APEX. hipoksantin.pneu. .

. Muller dan Caradonna.2 XRCC1 Single-untai memecah protein yang mengikat. 1989. Impellizzeri et al. Demple dan Harrison. menunjukkan peran untuk ini isoform dalam rekombinasi meiosis DNA ligase IV 96kDa 13q33-34 Tidak jelas. 1993. Laval... Protein dimurnikan bergabung tunggal-untai istirahat dalam polydeoxynucleotide ganda terdampar di reaksi ATP-dependent 1] Bessho dkk. .kelompok 1) 70kDa 19q13. Dinginkan dan Sirover. Tchou et al. Bloom syndrome. Mitra dan Kaina. 1986. Mitra dan Kaina.. 1993.. 1987. 1990. berinteraksi dengan DNA ligase III [7] Pol b (DNA poloymerase b) 39kDa 8p11-12 PolB kesenjangan DNA-enzim mengisi [8] DNA ligase Saya 102kDa 19q13. Roldan-Arjona et al. 1992. 1993. 1989. Hilbert et al. 1993. Bessho et al. hanya dinyatakan dalam laki-laki kuman sel meiosis.. 1992. Engelward et al. [2] Lee et al. 1991.... Rosenquist et al. Cool dan Sirover. Mansur et al. [4] Boorstein et al. 1987. 1997. . 1994. Kim dan Linn. 1994. Duncan dan Weiss. 1997. Ganguly dan Duker. [3] Stich. 1990. 1997. [5] Dehazya dan Sirover. Anemia Fanconi [9] DNA ligase II Berasal dari DNA ligase III oleh proteolitik yang mekanisme DNA ligase III a / b 103kDa (a) 96kDa (b) 17q11-12 DNA ligase III bentuk-bentuk kompleks dengan istirahat tunggal untai DNA perbaikan protein XRCC1 b tidak berinteraksi dengan XRCC1. Vollberg et al. 1993. 1997.. 1982. Demple dan Harrison.. Meyer-Siegler et al. 1994.3 DNA ligase DNA ligase CDC9 Saya Berpartisipasi dalam perbaikan eksisi basa DNA dan DNA replikasi T-sel leukemia akut. 1991. 1996. 1997.. Radicella et al.. Nash et al. 1975. 1993.. 1997.

Narayan dkk.. 1991. Grombacher et al... 1996.. 1995. 1982. seperti MNNG. Kami menduga bahwa cacat dari komponen intermediate antara kerusakan alkilasi dan induksi pol ß harus memiliki dampak yang sama pada sel-sel dalam hal kepekaan terhadap alkilasi kerusakan dan kerentanan kanker. yang ligases dikodekan oleh gen yang berbeda [Tomkinson dan Mackey. Dosanjh et al.]. 1994. Penyanyi dan Hang. Shadan dan Villarreal. Mereka menampilkan urutan dilestarikan di situs aktif. Sel mamalia mengandung beberapa ligases DNA (DNA ligase I. menginduksi ekspresi ß pol. Wajib. Saparbaev dan Laval. 1998.. Dobashi et al. Xanthoudakis et al. 1997. 1989. 1997. DNA ligase III dan IV yang terlibat dalam perbaikan DNA untai istirahat oleh bergaul dengan XRCC1 dan XRCC4. 1996. 1997.. 1992.. selular proses (misalnya. Engelward et al.. 1996. Upregulation ini memerlukan fosforilasi dari cAMP respon elemen (CRE) di promotor pol ß [Englander dan Wilson. investigasi dalam jalur yang diatur akan sangat informatif. 1996. Namun. Tomkinson et al. . 1997. Alkylating agen. 1998]. 1994. yang sangat langka genetik penyakit yang ditemukan pada pasien tunggal .. Englander dan Wilson. [8] Randahl et al. Grombacher et al... 1994. 1994. Lasko et al. Critchlow et al. 1997... adalah umum untuk kedua dasar dan perbaikan eksisi nukleotida (APM). 1996. Barnes et al. 1993. Rusquet et al. Teo dan Jackson. Olkowski. Tomkinson dan Mackey. karenanya. 1998.. masing-masing.. 1994. mereka memiliki spesifisitas substrat yang berbeda dan fungsi dalam keadaan yang berbeda (Tabel II). 1994. 1994. 1988. meningkatkan transkripsi pol ß.. [7] Cappelli dkk. 1992. Bentley et al. III. yang memiliki residu lisin yang luar biasa reaktif penting untuk fungsi enzim. 1996. 1988. Vilpo dan Vilpo. Klungland et al. Wang et al... Narayan et al. 1991. Kecuali untuk DNA ligase II. Langkah terakhir dari BER... 1990 ... Mezzina et al. menyegel oleh DNA ligase nick. II. Cappelli et al. 1996.1993.. 1990. menunjukkan evolusi yang umum asal [Tomkinson et al. 1994. 1994. [6] Walker et al. Demple dan Harrison. dan IV). Hal ini tidak jelas apakah itu adalah agen alkilasi itu sendiri atau peristiwa lain dalam jalur perbaikan yang memicu fosforilasi CRE oleh protein kinase dan.. [9] Schwaiger dkk. 1998. 1997. Wang et al. Matsuzaki et al. 1995.. 1995. 1989. 1996]. 1996]. yang berasal dari DNA ligase III dengan mekanisme proteolitik.. Tomkinson dan Mackey. Chan et al. Gu et al. diferensiasi sel) di samping Perbaikan DNA [Shadan dan Villarreal. 1987. Wei et al.

1982. 1990]. Agah et al. cacat pada komponen langkah-langkah terakhir dari BER.]. 1997]. Vilpo dan Vilpo. Ada indikasi bahwa beberapa glycosylases tumpang tindih kekhususan tidak penting untuk perkembangan normal [Engelward et al. DNA ligase adalah juga kekurangan [Schwaiger et al.. 1997. kemungkinan akan informatif. 1987] dan / atau urasil-DNA glycosylase aktivitas. seperti Pol ß [Gu et al. Sel baris dari Pasien sindrom Bloom dilaporkan telah mengurangi DNA ligase Aku aktivitas [Chan et al. 1989.. 1988. 1996. Hewan model BERexploiting KO lengkap gen yang terakhir adalah tidak mungkin layak. yang berkorelasi dengan kehadiran istirahat DNA dalam leukemia sel.]. 1996]. Mutasi pada gen DNA ligase tidak konsisten terdeteksi dalam penyakit ini. 1994. . Lasko et al. Pada anemia Fanconi (FA)..]. Sebaliknya.. Sebagai contoh. tetapi eksperimen lainnya telah menghasilkan hasil yang bertentangan [Mezzina et al..yang disajikan dengan gejala hypogemmaglobulinaemia memberikan bukti langsung untuk hubungan antara poli (ADP-ribosa) polimerase dan DNA ligase saya [Wajib... tidak kompatibel dengan perkembangan yang normal pada tikus. tapi spesifik jaringan KO menggunakan rekombinase sistem [Gu et al. 1994] dan ligase [Bentley et al. menunjukkan mungkin peran regulasi epigenetik kegiatan ligase. akut lymphoblastic leukemia (ALL) sel menunjukkan yang luar biasa pengurangan aktivitas DNA ligase [Rusquet et al. DNA ligase kelainan telah dikaitkan dengan luas berbagai gangguan manusia. 1994] dan mengungkapkan keterlibatan enzim ini di eksisi DNA perbaikan. 1989.