UNIDAD NÚMERO 3

ENZIMAS: BASES TERMODINÁMICAS DE SU MECANISMO DE ACCIÓN

Dr. Valmore Bermúdez Pirela

ENZIMAS: CLASIFICACIÓN Y MECANISMOS DE ACCIÓN

¿ Qué es una enzima?

Las enzimas son compuestos químicos orgánicos de naturaleza proteica que aceleran la velocidad de una reacción química termodinámicamente posible.

Dr. Valmore Bermúdez Pirela

La catálisis es el proceso mediante el cual se acelera la velocidad de una reacción química. Dr. Cuando se hace referencia a que la reacción debe ser termodinámicamente posible.ENZIMAS: CLASIFICACIÓN Y MECANISMOS DE ACCIÓN ¿Qué significa este concepto? Las enzimas aceleran la velocidad de una reacción química por que se comportan como catalizadores orgánicos (biocatalizadores). se destaca el hecho que en el sistema donde ocurre la reacción química existe suficiente energía útil (energía de activación) para realizar el trabajo que implica convertir el sustrato en producto. Valmore Bermúdez Pirela .

La termodinámica nació como consecuencia del estudio de las máquinas de vapor. Valmore Bermúdez Pirela . Dr. pero durante el siglo 20 se observó que podía aplicarse a los sistemas orgánicos.ENZIMAS: CLASIFICACIÓN Y MECANISMOS DE ACCIÓN ¿Qué es la termodinámica? La termodinámica es la rama de la física que estudia los fenómenos energéticos y los intercambios de energía entre la materia.

La energía útil en este sistema está representada por la energía gravitatoria que ejerce una atracción de la bola hacia abajo.ENZIMAS: CLASIFICACIÓN Y MECANISMOS DE ACCIÓN ¿Qué significa energía útil suficiente dentro del sistema para realizar un trabajo? S Estado inicial P Estado final Si dejamos caer una bola. El trabajo en este sistema. evidentemente irá hacia abajo sin ninguna ayuda. Nótese que en éste sistema hay suficiente energía útil que permite la caida de la bola. está representado por el movimiento que hace la bola desde el estado inicial (S) hasta el estado final (P). Valmore Bermúdez Pirela . hace falta cierta cantidad de energía útil dentro del sistema. Dr. Para realizar este trabajo.

No existe suficiente energía útil en el sistema en forma de energía gravitatoria para realizar el trabajo. que la bola caiga hacia la tierra (la bola esta fuera del campo gravitarorio de la tierra). Dr. Valmore Bermúdez Pirela .ENZIMAS: CLASIFICACIÓN Y MECANISMOS DE ACCIÓN ¿Qué pasaría si saliéramos al espacio. es decir. fuera de la atracción gravitatoria de la tierra? S Estado inicial P Estado final Evidentemente. la bola no caería…….

energía en el S Estado inicial Se dice que la reacción acontecerá de forma espontánea…….ENZIMAS: CLASIFICACIÓN Y MECANISMOS DE ACCIÓN Si hay suficiente sistema…. que S se convertirá en P sin ninguna otra ayuda que la energía útil del sistema. Valmore Bermúdez Pirela . Caida espontánea P Estado final Dr. Es decir.

ENZIMAS: CLASIFICACIÓN Y MECANISMOS DE ACCIÓN Consideremos ahora el caso inverso S Estado final ¿Habrá energía suficiente en el sistema Para que se realice el trabajo que se plantea en la gráfica? Es decir. que esta reacción en este sistema. NO No hay energía libre suficiente. Valmore Bermúdez Pirela . ¿que la bola suba espontáneamente hacia la mano? P Estado inicial Evidentemente. Esto quiere decir. en forma de energía ANTI-gravitatoria para hacer que la bola suba hasta la mano espontáneamente. es una reacción irreversible. Dr.

es decir. que el producto puede volverse a convertir en sustrato.ENZIMAS: CLASIFICACIÓN Y MECANISMOS DE ACCIÓN En conclusión: Una reacción es termodinámicamente posible cuando hay suficiente energía libre (ó útil) para realizarla. Cuando la reacción es termodinámicamente posible. S P Dr. Valmore Bermúdez Pirela . Si en el sistema no hay suficiente energía útil después de la conversión del sustrato a producto. S P Si en el sistema hay suficiente energía útil. la reacción puede ser reversible. está implícito el hecho que esta reacción será espontánea. la reacción será irreversible.

ENZIMAS: CLASIFICACIÓN Y MECANISMOS DE ACCIÓN Volvamos a la termodinámica: Las leyes…. Primera ley de la termodinámica o ley de la conservación de la energía: “La energía no se crea ni se destruye solo se transforma (de una forma de energía a otra)” Dr. Valmore Bermúdez Pirela .

Dr.000 de años. algunas aumentarán. esto es. lo que será compensado con la disminución de otras formas de energía.000. que el contenido energético del universo no ha cambiado desde que fue creado (desde el Big Bang) hasta nuestros días. Esto quiere decir.000. A pesar que el contenido energético del universo es constante. Valmore Bermúdez Pirela .ENZIMAS: CLASIFICACIÓN Y MECANISMOS DE ACCIÓN Primera ley de la termodinámica o ley de la conservación de la energía: “La energía no se crea ni se destruye solo se transforma (de una forma de energía a otra)” Esta ley presenta de forma implícita dos ideas: 1. 2. es de prever que durante las transformaciones de una forma a otra de energía. desde hace unos 15. entre un momento y otro acontecen transformaciones de una forma de energía a otra. se deduce que la cantidad de energía total del universo es constante. Para mantener estable la energía total. Si la energía nunca se creó y no puede ni destruirse ni acabarse.

000 de años Contenido energético total del universo en el momento de su creación Contenido energético total del universo en la actualidad Dr.000.000.ENZIMAS: CLASIFICACIÓN Y MECANISMOS DE ACCIÓN “La energía no se crea ni se destruye…(siempre ha sido y será la misma cantidad) Esquemáticamente este proceso puede representarse de la siguiente manera: Obsérvese que la cantidad de energía total en el universo antes y después de mucho tiempo. Valmore Bermúdez Pirela . es la misma 15.

todo era luz y calor. Esquemáticamente este proceso puede representarse de la siguiente manera: Obsérvese que la cantidad de energía total en el universo antes y después de mucho tiempo.en otras formas energéticas manteniendo el contenido total inalterable….000. es la misma 25 % potencial 50 % lumínica 25 % cinética 15.000 de años 20 % lumínica 50 % calórica 20 % otras 20 % calórica Durante los primeros instantes del universo.ENZIMAS: CLASIFICACIÓN Y MECANISMOS DE ACCIÓN “Solo se transforma”…..000. en esencia.. Valmore Bermúdez Pirela . solo energía calórica y lumínica En la actualidad la distribución y tipos de energía son diferentes ( y más diversos) a las observadas al inicio de la creación del universo Dr.

ENZIMAS: CLASIFICACIÓN Y MECANISMOS DE ACCIÓN Segunda ley de la termodinámica. e incluso. La entropía de todos los procesos del universo (y del universo mismo) tiende siempre a incrementarse hasta alcanzar el equilibrio. Valmore Bermúdez Pirela .. Esto quiere decir que cualquier sistema dentro del universo. El desorden se va incrementando en la medida que la energía útil (que se encarga de mantener organizado un sistema) va disminuyendo. Por lo tanto.Cuando el desorden sea máximo se habrá establecido el equlibrio. la disminución de ésta ocasionará desorden…. Si consideramos que el sistema usa la energía útil para mantenerse organizado. tal como lo expresa la primera ley de termodinámica es seguida por el incremento de otras formas energéticas que no son útiles para realizar un trabajo determinado en el sistema. los sistemas orgánicos están adaptados para mantener la energía útil en niveles óptimos para mantenerse ORGANIZADOS Dr. La caída de la energía útil. el cual representa el estado de máximo desorden. todo el universo tiende a desordenarse espontáneamente. buscando así el equilibrio.

Nos alimentamos para extraer de los alimentos la energía potencial presente en los enlaces químicos y guiarla hacia los enlaces de alta energía del ATP. como la energía útil tiende a disminuir cuando se realiza el trabajo llamado “organizarnos” debemos producir todos los días más energía útil para reponer la invertida. la vida de cualquier ser vivo transcurre en una lucha contra la segunda ley de termodinámica…. Luego. La lucha del orden contra el desorden……(donde inevitablemente siempre gana el desorden) El orden. Dr. De esta forma.ENZIMAS: CLASIFICACIÓN Y MECANISMOS DE ACCIÓN Segunda ley de la termodinámica. representado por las innumerables reacciones químicas que requieren esa energía para poder llevarse a cabo. implica alto grado de energía útil……pero esta energía se utiliza para mantenernos organizados. al hidrolizar los enlaces de alta energía del ATP se liberan cantidades inmensas de energía libre que pueden utilizarse para realizar un trabajo. Valmore Bermúdez Pirela . Y así..

las proteínas se hidrolizan a sus aminoácidos y los carbohidratos se oxidan…. pues lo que abunda dentro de la célula usualmente es escaso en el medio ambiente. todos los seres vivos experimentan la llamada “muerte”. Valmore Bermúdez Pirela .se establece un equlibrio entre el interior de la célula y su exterior. Todas las células se desorganizan: las membranas se rompen. que en nosotros recibe el nombre de muerte) Lamentablemente. La salud implica alto grado de orden y un gran desequilibrio con el medio externo. La lucha del orden contra el desorden……(donde inevitablemente siempre gana el desorden. las mitocondrias y otros organelos se disgregan y todo el contenido celular se combina con el entorno………Los lípidos se peroxidan. después de algún tiempo de luchar contra la segunda ley.ENZIMAS: CLASIFICACIÓN Y MECANISMOS DE ACCIÓN Segunda ley de la termodinámica. Este hecho es extremadamente anómalo. Dr. La muerte implica un alto grado de desorden y un equilibrio perfecto con el medio. Ya no existe suficiente energía libre para mantener un alto grado de organización.

La muerte implica el desorden máximo. Esta energía útil debe mantenerse estable en el tiempo. De esta forma estamos adaptados para tener un Metabolismo que genere altas cantidades de energía útil en forma de ATP.40 años 60 años 70 – 80 años Muerte Alto grado de energía útil La vida. Valmore Bermúdez Pirela .ENZIMAS: CLASIFICACIÓN Y MECANISMOS DE ACCIÓN “La vida y la muerte”…. implica un alto grado de orden que solo puede lograrse con altas dosis de energía útil.Según la termodinámica Este proceso puede representarse esquemáticamente de la siguiente manera: Bajo grado de energía no utilizable Niñez alto grado de energía no utilizable 30 . Dr. así que progresivamente acumula menos energía útil hasta un punto en el que no puede mantenerse ordenado.. El individuo no puede transformar de forma eficiente la energía que le ofrece Su entorno.

tiene un solo sentido…Esto es. que la reacción es irreversible. El compuesto B no puede tranformarse en el compuesto A porque hay muy poca energía libre para realizar este trabajo. Valmore Bermúdez Pirela . que indica el sentido de la reacción. Dr. Obsérvese como la flecha.ENZIMAS: CLASIFICACIÓN Y MECANISMOS DE ACCIÓN Bases termodinámicas del mecanismo de acción de las enzimas Para que un sustrato A se transforme en el producto B debe existir cierta cantidad de energía libre (útil) en el sistema que se pueda realizar este trabajo químico: A Alta cantidad de energía libre B Baja cantidad de energía libre y todos los procesos químicos transcurren desde un punto de alta energía libre hasta uno de baja energía libre.

Al final puede apreciarse una caída en la energía libre. En los seres vivos es importante que muchas reacciones ocurran adecuadamente…. ni ninguna otra forma de energía…… Pero el hecho de que ocurra la reacción. es obvio que se ha transformado en otras formas energéticas.pero también es importante que ocurran rápidamente. Dr.ENZIMAS: CLASIFICACIÓN Y MECANISMOS DE ACCIÓN Bases termodinámicas del mecanismo de acción de las enzimas Nótese también que la conversión de A en B es un proceso espontáneo. quizá potencial dentro de la molécula B A A B 0 100 Alta cantidad de energía libre Baja cantidad de energía libre No hace falta añadir calor al sistema. debido a que la cantidad de energía libre es suficiente para realizar los cambios químicos que caracterizan la reacción. Como la energía libre no se pierde. Valmore Bermúdez Pirela .. no nos da información alguna de la velocidad con la que ésta acontece…….

Valmore Bermúdez Pirela . hecho que incrementa la pendiente entre el estado inicial y el final…. A 500 Incremento en la cantidad de energía libre A B Mayor velocidad por incremento de la pendiente (véase la pendiente en la diapositiva anterior) Baja cantidad de energía libre 0 Dr. Esto puede hacerse con calor.ENZIMAS: CLASIFICACIÓN Y MECANISMOS DE ACCIÓN ¿Cómo podemos aumentar la velocidad de una reacción química? En líneas generales se puede aumentar la velocidad de la reacción de dos maneras: 1. Incrementando la cantidad de energía libre para realizar el trabajo.

la única manera de aumentar la velocidad de la reacción es utilizando de forma más eficiente la energía útil del sistema.ENZIMAS: CLASIFICACIÓN Y MECANISMOS DE ACCIÓN ¿Cómo podemos aumentar la velocidad de una reacción química? En líneas generales se puede aumentar la velocidad de la reacción de dos maneras: 2. Manteniendo la cantidad de energía útil constante. Valmore Bermúdez Pirela . Esto puede hacerse gracias al uso de una ENZIMA A 100 A B Baja cantidad de energía libre 0 ENZIMA Alta cantidad de energía libre Dr.

. Valmore Bermúdez Pirela ..ENZIMAS: CLASIFICACIÓN Y MECANISMOS DE ACCIÓN ¿Cómo una enzima puede optimizar el uso de la energía libre en el sistema para así aumentar la velocidad de una reacción?.. Considere estos dos sistemas Cantidad de Energía útil: 100 Kcal Cantidad de Energía útil: 100 Kcal A Sistema 1 A Sistema 2 B B Dr.

Cantidad de Energía útil: 100 Kcal Energía utilizada para realizar el trabajo: sólo 10 Kcal. la cantidad de energía útil para realizar el trabajo es la misma. Cantidad de Energía útil: 100 Kcal Energía utilizada para realizar el trabajo: 100 Kcal A Sistema 1 A Sistema 2 B B Dr. es obvio que el individuo del sistema 1 empleará menos energía que el individuo del sistema 2 para realizar el trabajo.ENZIMAS: CLASIFICACIÓN Y MECANISMOS DE ACCIÓN En ambos sistemas. Valmore Bermúdez Pirela . Sin embargo.

es obvio que el individuo del sistema 1 empleará menos energía que el individuo del sistema 2 para realizar el trabajo. Energía útil: 100 Kcal Energía utilizada: 100 Kcal Total 100 100 0 Cantidad de Energía útil: 100 Kcal Energía utilizada para realizar el trabajo: 100 Kcal A Sistema 2 Conclusión: solo se puede Tirar una piedra con la cantidad de energía disponible B Dr. Valmore Bermúdez Pirela . Sin embargo.ENZIMAS: CLASIFICACIÓN Y MECANISMOS DE ACCIÓN En ambos sistemas. la cantidad de energía útil para realizar el trabajo es la misma.

Cantidad de Energía útil: 100 Kcal Energía utilizada para realizar el trabajo: 10 Kcal Energía útil: 100 Kcal Energía utilizada: 10 Kcal Total A La palanca en este sistema es equivalente a la enzima en un sistema químico. Valmore Bermúdez Pirela . la cantidad de energía útil para realizar el trabajo es la misma. Sin embargo.ENZIMAS: CLASIFICACIÓN Y MECANISMOS DE ACCIÓN En ambos sistemas. es obvio que el individuo del sistema 1 empleará menos energía que el individuo del sistema 2 para realizar el trabajo. Un elemento que permite el ahorro energético y el uso del excedente para realizar Más trabajo 100 10 90 Conclusión: se pueden tirar nueve piedras más con la cantidad de energía sobrante Sistema 1 B B B B B B B B B Dr.

Son reciclables.. por lo que…. Su actividad. Son compuestos termolábiles. es decir.ENZIMAS: CLASIFICACIÓN Y MECANISMOS DE ACCIÓN ¿Cuales son las principales características de una enzima? 1. 3. Dr. la velocidad de la catálisis puede regularse. 4. Se necesitan en baja cantidad. 2. Valmore Bermúdez Pirela .

Tienen una gran especificidad por un solo sustrato o por un grupo de sustratos emparentados estructuralmente. Dr.ENZIMAS: CLASIFICACIÓN Y MECANISMOS DE ACCIÓN ¿Cuales son las principales características de una enzima? 5. Tienen una gran afinidad por un solo sustrato o por un grupo de sustratos emparentados estructuralmente. 6. Valmore Bermúdez Pirela .