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Química del RNA

Harry Alices-Villanueva, Ph.D.
RNA tiene cuatro bases

• Adenina
• Guanina
• Citosina
• Uracilo
Adenina
Guanina
Citosina
Uracilo
Las cuatro bases en el RNA
Timina vs. Uracilo
¿Por qué uracilo?
• Es energeticamente más barato de
producir
• Degenera facílmente a citosina
• Es más apropiado para RNA donde
cantidad es más importante que largo
de vida.
• Timina es más apropiado para DNA
Comparación con DNA
• Distinción principal es la presencia del
grupo –OH en el carbono #2 de la ribosa.
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Comparación con DNA
• La presencia de ese grupo –OH le
confiere al RNA versatilidad catalítica y le
permite llevar a cabo reacciones que el
DNA es incapaz de ejecutar.
• Ese –OH extra en la ribosa impide la
formación de doble hélices estables.
• A la misma vez, el RNA es más sensitivo
a hidrólisis alcalina (rompimiento del
enlace fosfodiester) mientras el DNA no.
RNA
Comparación con DNA
• El RNA existe casi exclusivamente en
forma de una sola hebra, siendo la
excepción el material genético en algnos
viruses.
• El RNA se dobla en estructuras más
complejas mediante secuencias
complementarias internas.
Comparación con DNA
Hairpin loop
Hairpin loop
Hairpin loop
Tipos de RNA
• hnRNA: heteronuclear
• mRNA: mensajero
• rRNA: ribosomal
• tRNA: transferencia
• snRNA: small nuclear
• Ribozimas (catalytic RNA)
• dsRNA: double stranded
• miRNA: micro-RNA
hnRNA
• Es el producto inmediato de la
transcripción.
• Se procesa para convertirse en mRNA
• Vida muy corta
mRNA
• Es el producto del proceso de splicing del
hnRNA
• Splicing: remover los introns
• El mRNA lleva el mensaje del núcleo al
ribosoma.
rRNA
• Compone 50% del ribosoma donde ocurre
el proceso de traducción.
• 80% de las moléculas de RNA en una
célula eucariótica.
• Son los genes que más se han
conservado a traves de la evolución.
• Son el blanco de varios antibioticos
(cloramfenicol, eritromicina,
streptomicina).
rRNA
• 18 s, 5.8 s, 28 s, y 5 s.
• Se combinan con proteínas ribosomales en el
nucleolo para formar las unidades mayor (60 s)
y menor (40 s) de los ribosomas.
• 28 s tiene un rol catalítico con la unidad 60 s.
• 18 s juega un papel en posicional el mRNA y el
tRNA.
• rRNA tiene un papel estructural.
tRNA
• Está envuelto en síntesis de proteínas y
es el encargado de llevar el aminoácido
correcto al ribosoma.
• Un tRNA especifico forma un enlace
covalente con un aminoácido específico.
• En una célula eucariótica existen 31 tRNA
difernetes.
tRNA
snRNA
• Pequeñas moléculas de RNA en el
núcleo.
• Intervienen en RNA splicing (hnRNA  mRNA).
• Mantenimiento de telómeros (extremos de
los cromosomas).
• Asociados con proteínas específicas
• SNRNP
Ribozimas
• Catalizan la hidrólisis de sus propios
enlaces fosfodiester o el de otras
moléculas de RNA.
• Cataliza la actividad aminotransferasa del
ribosoma.
• Fósiles vivientes
• Fueron descubiertas en 1981 por Cech
(Cell 26: 487 – 496)
dsRNA
• Es el material genético de algunos
viruses.
• Se usa en experimentos de interferencia
del RNA (RNAi).
• microRNA: pequeñas moléculas de RNA
(20-35 nd) que se creen reguladores de la
expresión génica.
• Es complementario a pequeñas
secuencias en el RNA ( dsRNA)
Enzimas que catalizan
procesos en el RNA
• RNA POL I
– La única enzima que transcribe RNA
ribosomal (excepto el 5 S)
– rRNA constituye el 50% del RNA total en una
célula eucariótica.
Enzimas que catalizan
procesos en el RNA
• RNA POL II
– Cataliza la transcripcion de DNA a mRNA y a
snRNA y microRNA
Enzimas que catalizanprocesos en
el RNA
• RNA POL III
– Transcribe DNA para sintetizar rRNA 5 S,
tRNA y otras moléculas pequeñas de RNA
Mundo RNA
• Teoría inspirada en los retroviruses.
– Catalizan fomración de enlaces péptidos en el
ribosoma por una ribozima derivada de su
RNA.
• Propone que el ancestro universal para
todo tipo de vida usaba RNA para:
– Transferir información genética
– Catalizar reacciones bioquímicas
Mundo RNA
• Los retroviruses y las ribozimas son
remanentes fósiles del mundo RNA.
• Uso reducido del RNA en las células y
mayor uso de DNA y proteínas.