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Tema 7 Expresin gnica: transcripcin

Dr. Antonio Barbadilla

Objetivos tema 7 Expresin gnica: transcripcin


Debern quedar bien claros los siguientes puntos: El dogma central del flujo de la informacin gentica -> el RNA como intermediario Propiedades del RNA Clases de RNA El mRNA, el mensajero La transcripcin: iniciacin, elongacin y terminacin La transcripcin en eucariotas: modificaciones (procesamiento) transcripcionales, intensificadores Transcripcin inversa y todas las posibles direcciones del transferencia de informacin gentica Actividad enzimtica del RNA RNA de interferencia (RNAi)
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El dogma central del flujo de la informacin gentica

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Propiedades del RNA


Una cadena, no doble hlice. Apareamiento intramolecular -> RNA contorsionista molecular Azcar ribosa (OH en el carbono 2) Esqueleto azcar-fosfato en posiciones 5-3 del azcar como DNA Uracilo en vez de Timina, se empareja con Adenina, y tambin con Guanina cuando se pliega (no en la transcripcin). Catalizador biolgico -> Ribozima
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El emparejamiento intramolecular de nucletidos produce un plegamiento de la molcula de RNA

RNA: contorsionista molecular

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RNA vs DNA

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Tipos de RNA
RNA mensajero (mRNA) RNA funcional
RNA de transferencia (tRNA) RNA ribosmico (rRNA) RNA nuclear pequeo (snRNA) MicroRNA (miRNA) RNA de interferencia pequeo (siRNA)

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TRANSCRIPCIN
Funcin: la formacin del transcrito de RNA mediante la catlisis de la unin de nucletidos libres a la cadena molde del DNA formando una monohebra de RNA.
Propiedades que hacen posible la sntesis del transcrito de RNA 1. COMPLEMENTARIEDAD ENTRE BASES A-U, C-G, G-C, T-A 2. UNIN DE PROTENAS ESPECIFICAS AL DNA (RNA Polimerasa y otras protenas que actan como factores de transcripcin).

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Nomenclatura de las cadenas en relacin a la transcripcin

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Orientacin y nomenclatura de las cadenas en relacin a la transcripcin

(5) CGCTATAGCG (3) cadena codificadora del DNA (3) GCGATATCGC (5) cadena molde del DNA

(5) CGCUAUAGCG (3) transcrito de RNA

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Qu cadena de la doble hlice es la codificadora?


Depende de cada gen, no es un propiedad del cromosoma.
Orientacin de la transcripcin

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Orientacin de la transcripcin

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Orientacin de la transcripcin de los genes del cromosoma 13 humano alrededor del gen BRCA2

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RNA polimerasa
Enzima compleja, no requiere primer (cebador), no funciona la correccin de errores Procariotas: slo un tipo. Con mltiples subunidades. E. Coli :
factor sigma iniciacin + CORE (holoenzima) Eucariotas: 3 tipos I -> rRNA II -> mRNA III -> tRNA, snRNA, rRNA 5S

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RNA polimerasa
PROCARIOTAS En procariotas una sola polimerasa (RNA Polimerasa) se encarga de transcribir el DNA en las diferentes clases de RNA
ESTRUCTURA (E.

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Se compone de 5 subunidades: 2 subunidades idnticas, , , , ms el cofactor . El cofactor tiene la propiedad de disociarse del resto de subunidades durante el proceso dejando el ncleo central de la enzima al descubierto. HOLOENZIMA = 5 subunidades (con cofactor ) ACTIVA APOENZIMA = 4 subunidades ( el cofactor disociado) INACTIVA
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coli)

RNA polimerasa
PROCARIOTAS
2 subunidades = ensamblan el enzima y promueven interacciones = actividad cataltica = se une al DNA = ensamblaje y regulacin expresin = Se une a las regiones promotoras y posicional a la holoenzima en el sitio de inicio

APOENZIMA = 4 subunidades

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RNA polimerasa
Ciclo de la RNA pol bacteriana

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Etapas de la transcripcin
Iniciacin: Secuencias promotoras (se une la RNA polimerasa) Procariotas: Secuencias consenso Pribnow (-10 pb aguas arriba) y regin -35 pb

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Etapas de la transcripcin
Iniciacin: Secuencias promotoras (se une la RNA polimerasa) Procariotas: Secuencias consenso Pribnow (-10 pb aguas arriba) y regin -35 pb

Eucariotas: Caja TATA (-25 pb) y CAAT (-70 pb)


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Etapas de la transcripcin
Iniciacin: Secuencias promotoras (se une la RNA polimerasa) Procariotas: Secuencias consenso Pribnow (-10 pb) y regin -35 pb Eucariotas: Caja TATA (-25 pb) y CAAT (-70 pb)
Elongacin: 5->3 Enrollamiento aguas arriba (5) y desenrollamiento aguas abajo (3) del DNA

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Terminacin: Dependiente del factor Rho Independiente de Rho


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Etapas de la transcripcin
Iniciacin: Secuencias promotoras (se une la RNA polimerasa) Procariotas: Secuencias consenso Pribnow (-10 pb) y regin -35 pb Eucariotas: Caja TATA (-25 pb) y CAAT (-70 pb)
Elongacin: 5->3 Enrollamiento aguas arriba (5) y desenrollamiento aguas abajo (3) del DNA

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Terminacin: Dependiente del factor Rho Independiente de Rho


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Terminacin: DNA Palndrome estructura secundaria

Palndrome:
dabale arroz a la zorra el abad

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mecanismo intrnseco -> DNA Palndrome, estructura tallo-bucle

Terminacin:

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Regin 3 no traducida de ~ 40 bases (3UTR)

Estructura del gen y el mensajero procariota

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RNAs Polimerasa en Eucariotas


1- Existen tres tipos de RNA polimerasa La I, la II y la III
RNA polimerasa I, 13 subunidades. Se localiza en el ncleo y en el nucleolo. -> Sntesis de rARN 45S. RNA polimerasa II, 12 subunidades. Se localiza en el nucleoplasma. -> Sntesis de los hnRNA (transcrito primario), los precursores de los mRNA. RNA polimerasa III, 17 subunidades. Se localiza en el nucleoplasma. -> Sntesis rRNA 5S y tRNA.

Transcripcin Eucariotas

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Transcripcin Eucariotas

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Transcripcin Eucariotas

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Transcripcin Eucariotas

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Transcripcin Eucariotas

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Transcripcin Eucariotas

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Eliminacin de intrones por corte y empalme (splicing)

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Reaccin transesterificacin
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Regla GU-AG

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Empalmosoma (Spliceosome)

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Autosplicing en Tetrahymena (Tom Cech 1981)

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RIBOZIMA

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Estructura mensajero eucariota

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Flujo de la informacin en eucariotas

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Diferencias eucariotas - procariotas

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Diferencias eucariotas - procariotas


Caracterstica
Promotor Cistrn RNA polimerasa

Procariota
Cajas y zona operadora Solo cajas

Eucariota

Policistrones una sola, con 5 subunidades distintas El RNA recin transcrito, no tiene.

Monocistrones

3 RNA polimerasas.

Estabilizacin

Contiene, al comienzo de la cadena, 7-metilguanosina o CAP, y al final de la cadena, una secuencia poli A.

Comienzo

RNA pol, se autoacopla al promotor

RNA pol, necesita la presencia de protenas de iniciacin, que se unan antes que ella al ADN. Tiene y se eliminan mediante splicing (corte y empalme). En el citoplasma.

Intrones
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No tiene Inmediatamente, al ser creado

Lugar de accin
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Transcripcin inversa

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El dogma central revisado

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RNA World

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RNA de interferencia

RNA interference

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MicroRNAs

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Links de inters

DNA, RNA, protein Image Library of Biological Macromolecules - DNA DNA berkeley DNA Learning Center Beginner's guide to Molecular Biology Glosario de Gentica molecular Central Dogma Animacin de la transcripicin Animacin del splicing Animacin del RNA de interferencia

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