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Reacciones Bioqumicas Tpicas

Electronegatividad
La electronegatividad es una medida de la fuerza de atraccin que ejerce un tomo sobre los electrones de otro en un enlace covalente. Los diferentes valores de electronegatividad se clasifican segn diferentes escalas, entre ellas la escala de Pauling y la escala de Mulliken. En general, los diferentes valores de electronegatividad de los tomos determinan el tipo de enlace que se formar en la molcula que los combina. As, segn la diferencia entre las electronegatividades de stos se puede determinar (convencionalmente) si el enlace ser, segn la escala de Pauling: Inico (diferencia superior o igual a 2) Covalente (diferencia entre 2 y 0.4) Cuando mas pequeo es el radio atmico mayor es la energa de ionizacin y mayor la electronegatividad.

- Electronegatividad
Grupo Perodo 1 H 2.1 Li 1.0 Be 1. 5 M g 1. 2 Ca 1. 0 Sr 1. 0 Ba 0. 9 Sc 1. 3 Y 1. 2 Lu Ti 1. 5 Zr 1. 4 Hf 1. 3 Rf 1 2 3 4

aumenta ->
5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18

He

B 2.0

C 2.5

N 3.0

O 3.5

F 4.0

Ne

Na 0.9

Al 1.5 M n 1. 5 Tc 1. 9 Re 1. 9 Bh

Si 1.8

P 2.1

S 2.5

Cl 3.0

Ar

K 0.8

V 1. 6 Nb 1. 6 Ta 1. 5 Db

Cr 1.6

Fe 1. 8 Ru 2. 2 Os 2. 2 Hs

Co 1. 9 Rh 2. 2 Ir 2. 2 Mt

Ni 1. 8 Pd 2. 2 Pt 2. 2 Ds

Cu 1.9

Zn 1.6

Ga 1.6

Ge 1.8

As 2.0

Se 2.4

Br 2.8

Kr

Rb 0.8 Cs 0.7 Fr 0.7

Mo 1.8 W 1.7 Sg

Ag 1.9 Au 2.4 Uuu

Cd 1.7 Hg 1.9 Uub

In 1.7 Tl 1.8 Uut

Sn 1.8 Pb 1.9 Uuq

Sb 1.9 Bi 1.9 Uup

Te 2.1 Po 2.0 Uuh

I 2.5 At 2.2 Uus

Xe

Rn

Ra 0. 9

Lr

Uuo

LA FUERZA DE UN ENLACE ESTA RELACIONADA A LAS PROPIEDADES DE LOS ATOMOS UNIDOS

La fuerza de un enlace qumico depende de:


-las electronegatividades relativas las afinidades por los electrones- de los elementos enlazantes. -la distancia de los electrones enlazantes de cada ncleo

Enlace covalente
A diferencia del enlace inico, en el que se produce la transferencia de electrones de un tomo a otro, en el enlace qumico covalente, los electrones de enlace son compartidos por ambos tomos.

LA FUERZA DE UN ENLACE ESTA RELACIONADA A LAS PROPIEDADES DE LOS ATOMOS UNIDOS

El nmero de electrones compartidos tambin influencia la fuerza del enlace. Los enlaces dobles son ms fuertes que los enlaces simples y ms an los enlaces triples

5 ESTADOS DE OXIDACIN DEL CARBONO EN LAS BIOMOLECULAS DEPENDIENDO DE LOS ELEMENTOS CON QUIEN COMPARTE LOS ELECTRONES

Cada compuesto es formado por la oxidacin del carbono en rojo en el compuesto listado. El dixido de carbono es la forma de carbono ms altamente oxidada que se encuentra en los sistemas vivientes

EN LAS CLULAS OCURREN CINCO TIPOS GENERALES DE TRANSFORMACIONES QUMICAS

- OXIDACIN-REDUCCIN - RUPTURA Y FORMACION DE ENLACES CARBONO- CARBONO - REARREGLOS INTERNOS - TRANSFERENCIA DE GRUPOS - REACCIONES DE CONDENSACIN en las cuales se unen subunidades monomricas con la eliminacin de una molcula de agua

REACCION DE OXIDACION-REDUCCION
La prdida de electrones de un tomo o molcula es llamada oxidacin y la ganancia de electrones por un tomo o molcula es llamada reduccin.

Debido a que los tomos no son creados ni destruidos en una reaccin qumica, si un tomo es oxidado otro debe de ser reducido.

Muchas reacciones de oxidacin-reduccin de importancia biolgica involucran la remocin o adicin de tomos de hidrgeno (protones ms electrones) en vez de solo electrones.
La oxidacin de una molcula orgnica se puede describir como un proceso de "sustraccin" de electrones a partir de la misma, y se logra mediante diversas estrategias. La reduccin es el proceso de "adicin" de electrones a un sustrato. Las enzimas encargadas de estos procesos se conocen con el nombre genrico de xido-reductasas" y por lo general trabajan en compaa de coenzimas que actan como los agentes oxidantes o reductores directos sobre el sustrato. Las coenzimas NAD+ , NADP+ y FAD son los agentes oxidantes ms utilizados por la clula para los procesos descritos.

REACCION DE OXIDACION-REDUCCION

En esta deshidrogenacin son removidos 2 electrones y 2 iones hidrogeno del carbono 2 del lactato. Los electrones son transferidos al NAD. La reaccin es completamente reversible. El piruvato puede ser reducido por el cofactor.

REACCION DE OXIDACION-REDUCCION

El proceso es de oxidacin si: 1. El producto oxidado contiene ms tomos de oxgeno que el sustrato 2. El producto oxidado contiene menos tomos de hidrgeno que el sustrato 3. El producto oxidado posee ms dobles enlaces (insaturaciones) que el sustrato 4. Si el sustrato es un "in", el producto tiene una "carga elctrica" mayor que el sustrato 5. si en la reaccin entra NAD+ y sale NADH + H+ 6. si en la reaccin entra NADP+ y sale NADPH + H+ 7. si en la reaccin entra FAD y sale FADH2 8. Se fragmenta la molcula del sustrato y se adiciona oxgeno 9. Las oxidaciones fuertes producen CO2 y H2O Ejemplo reaccin de oxidacin:

REACCION DE OXIDACION-REDUCCION

El proceso es de reduccin si: 1. El producto reducido contiene menos tomos de oxgeno que el sustrato 2. El producto reducido contiene ms tomos de hidrgeno que el sustrato 3. El producto reducido posee menos dobles enlaces (insaturaciones) que el sustrato 4. Si l sustrato es un "in", el producto tiene una "carga elctrica" menor que el sustrato 5. si en la reaccin entra NADH + H+ y sale NAD+ 6. si en la reaccin entra NADPH + H+ y sale NADP+ 7. si en la reaccin entra FADH2 y sale FAD Ejemplo reaccin de reduccin:

LOS ENLACES C-C SON ROTOS Y FORMADOS POR REACCIONES DE SUSTITUCION NUCLEOFILICA

La ruptura de un enlace covalente puede ocurrir de dos maneras fundamentalmente diferentes, dependiendo de lo que suceda con los dos electrones que forman el par enlazante: En la ruptura homoltica, cada tomo deja el enlace como un radical, llevando uno de los 2 electrones (ahora desapareado) En la ruptura heteroltica, uno de los tomos mantiene ambos electrones de enlace(formando un anin) y dejando al otro sin un electrn (un catin).

NUCLEOFILOS.Grupos funcionales ricos en electrones y capaces de donarlos ELECTROFILOS.Grupos funcionales deficientes en electrones que buscan electrones Los nuclefilos se combinan con los electrfilos y les proporcionan electrones

REACCION DE SUSTITUCION NUCLEOFILICA

Un nuclefilo rico en electrones (Z) ataca un centro pobre en electrones (tomo de carbono) y desplaza un grupo nucleoflico (W) el cual es llamado grupo abandonador

LA TRANSFERENCIA DE ELECTRONES DENTRO DE UNA MOLECULA PRODUCE REARREGLOS INTERNOS

REACCION DE ISOMERIZACIN.- La conversin de glucosa 6-fosfato, una reaccin del metabolismo de los carbohidratos catalizada por la fosfohexosa isomerasa

LAS REACCIONES DE TRANSFERENCIA DE GRUPOS ACTIVAN INTERMEDIARIOS METABOLICOS

Cuando un ncleofilo Z (en este caso, el OH en el C6 de la glucosa) ataca al ATP, ste desplaza ADP (W)

LOS BIOPOLIMEROS CONDENSACIONES

SON

FORMADOS

POR

CONDENSACIONES E HIDRLISIS. Se muestra la formacin e hidrlisis de un enlace peptdico

LOS BIOPOLIMEROS SON FORMADOS POR CONDENSACIONES

CONDENSACIONES E HIDRLISIS. La remocin de los elementos del agua de 2 molculas del aminocido glicina produce un enlace peptdico, pero debido a que el OH no es un buen grupo abandonador, esta reaccion es desfavorable

LOS BIOPOLIMEROS SON FORMADOS POR CONDENSACIONES

CONDENSACIONES E HIDRLISIS. En las clulas, los aminocidos son activados antes de la polimerizacin por la unin de un buen grupo abandonador, mejor que el OH, un ARNt, que forma un ester oxigeno con el grupo alfa-carboxilo

HIDROLISIS

CONDENSACIONES E HIDRLISIS. El agua realiza un ataque nucleoflico al carbono del grupo carbonilo, desplazando el nitrgeno del grupo alfaamino

HIDROLISIS

Esta es una reaccin catablica y se refiere a la ruptura de un enlace del sustrato para producir dos molculas ms pequeas. Las enzimas que catalizan estos procesos utilizan el agua como un agente de transformacin. En este proceso, la molcula de agua tambin se fragmenta para adicionarse a los productos. La porcin (OH) del agua se une al primer residuo, mientras que el Hidrgeno (H) se une al restante.
Ejemplo reaccin de hidrlisis: