Horton • Moran • Scrimgeour • Perry • Rawn

Principles of Biochemistry Fourth Edition

Chapter 9
Lipids and Membranes

陳 玉 婷

Copyright © 2006 Pearson Prentice Hall, Inc.

Lipids
Storage energy: triacylglycerol (fat, oil)
Cell membrane: glycerophospholipids, sphingolipids, sterols
Protective surface: wax (in cell wall, exoskeleton, skin)
Enzyme cofactor:
Electron carrier: cytochrome P450
Light­absorbing pigments: chlorophyll
Hydrphobic anchors
Emulsifying agents
Hormones: testosterone, estradiol
Interacellular messengers: sialic acid

Structural relationships of the major classes of lipids

p. 254

Fatty acid .

Saturated fatty acid Unsaturated fatty acid IUPC: International Union of Pure and Applied Chemistry p. 255 .

 ionized at physiological  pH As a detergent. e.g.15 -6.0.Structure and nomenclature of fatty acids Fatty acid:  Fuel: ~37 kJ/g fatty acid ~16 kJ/g protein or cabohydrate pKa 4. e.12 -9. farthest from the carboxyl carbon -3. 18:1 9 p.g.5~5. 256 . 18:2 9. e. 18:3 9.g.12. with polar head and  hydrophobic tail Low concentration in membrane Joined to other molecular with ester  linkage : tail.

257 .Chemical structures of three C18 fatty acids p.

Triacylglycerol .

Most abundant lipid in animal. Not found in cell membrane. Pancreatic lipases hydrolyse the  ester (at C1 and C3) of  gtracylglycerol. Most diet lipids: tricaylglycerols.Structure of glycerol and triacylglycerol Pancreatic  lipases Fat (solid) and oil (liquid) are  mixture of tricaylglycerols. p. 258 .

Glycerolphospholipids .

260 . C2 Phosphate at C3 Named: Phosphatidyl­X p.Glycerolphospholipids Most abundant in cell  membrane Contain: Glycerol backboned 2 acyl groups at C1.

p. 261 .

 bee. Present in pancreatic juice.  snake. and wasp venom. 261 . p.Action of four phospholipases Disrupt cell membrane.

Structure of an ethanolamine plasmalogen Ethanolamine Ethanolamine and coline are the  commonly esterified to  plasmalogen. About 23% of the glycerophospho­ lipid in the human central nerve  system. 262 . p. also found in the membrane  of peripheral nerve and muscle.

Sphingolipids .

and sphingomyelin. ceramide. 262 .Structures of sphingosine. p.

p.Structure of a galactocerebroside Galactocerebrosides are abundant in nerve tissue. 263 . about 15% lipid of myelin sheaths.

263 . Now >60 gangliosides. Gangliosides: ceramide + C1 Glc + Gla Present on cell surface p.Ganglioside GM2 GM2 is the 2nd monosialo ganglioside  caracterized.

Inherited human diseases  resulting from abnormal  accumulation of  membrane lipids. globoside and  sphigomyelin. GM2 → Lysosomes swell → nerve cells enlargement → nerve cells die → blindness. death Lehninger. Pathway for the breakdown  of GM1. mental  retardation. p 356 .

249 . Single deletion at N-terminal: non-functional O allele A enzyme: N-acetylaminogalactosyltrnasferase B enzyme: galactosyltrnasferase p.ABO Blood Group Lehninger. p 354 ABO blood group is determined by a single gene on chromosome 9.

Steroids .

264 .Steroids. lipid Vitamins and terpenes are classified as isopropenoids.3­butadiene) Carbon backbone Isoprene unit p. Chemical structure Isoprene (2­methyl­1.

Structures of several steroids Based on 5C isopropene 3 X 6C ring + 1 X 5C ring Cholesterol: OH at C3 Cardiovascular disease Mammalian Hormones Bile slat Plant sterols Cell membrane component  p. 265 .

267 .  Since insoluble in water.Cholesteryl ester Cholesterol is converted to cholesteryl esters for storage in cells or for  transport through the bloodstream. p. cholesterol and its esters must be complexed with  phospholipids and amphipathic proteins in lipoproteins for transport.

 wax) secreted by cells lining the auditory canal contains squalene. myricyl palmitate. cerumen (from the Latin word cera. triacylglycerols and waxes (about 10% of the weight). p. ester of palmitate (16:0) and the 30­C myricyl alcohol  Ear wax. a wax Waxes nonpolar esters of long­chain fatty acids and long­chain monohydroxylic alcohols protective waterproof coatings  Beeswax. 267 .Myricyl palmitate.

268 .Some isoprenoids Lemon flavor Archaebacteria  cell membrane Development regulation  in insect  p.

269 .Flowchart of lipid extraction and purification p.

Biological membrane •Lipid bilayers and proteins  •External boundaries of cells •Separate compartments within cells •Selective pumps: transport of ions and small molecules •Generating and maintaining the proton concentration  gradients for ATP production •Recognize extracellular signals and communicate them  to the cell interior. .

Membrane lipid and bilayer An amphipathic membrane lipid Cross-section of a lipid bilayer 5 to 6 nm thick. flexible. or monolayers (leaflets) polar head groups: contact with the aqueous medium nonpolar hydrocarbon tails: toward the interior of the bilayer lipid bilayers is driven by the hydrophobic interactions p. self­seal  two sheets. 270 .

  Red blood cells: rich in proteins Brain cells: rich in phosphotidylserines E. coli: inner­70% phosphatidylethanolamines outer­lipopolysaccharides Mammalian: outer surface­90% sphingomylin .Typical biological membrane 6­10 nm Lipids: 25%~50% Proteins: 50%~75% Carbohydrate: 10% Cholesterol and some other liplds: ~30% of total lipid Components of inner and outer membranes are different.

 Nicolson  membrane is a dynamic structure  proteins and lipids can rapidly and randomly diffuse laterally or rotate p. Jonathan Singer and Garth L.Structure of a typical eukaryotic plasma membrane fluid mosaic model: 1972 S. 271 .

272 .Diffusion of lipids within a bilayer  flip­flop 2 μm/sec 2×10­6 μm/sec flippases and floppases: membrane­bound enzymes generated and maintained lipid asymmetry  ATP­dependant move specific phospholipids from one monolayer to the other p.

 Edidin:   proteins diffuse within the lipid bilayer. D. or domains. Frye and Michael A. restricting the  movement of other proteins. 273 .  areas of membrane. p.  produces protein patches. Majority of membrane proteins diffuse  ~100 to 500 times slowly than lipids. Immobile membrane proteins:  act as fences or cages.Diffusion of membrane proteins 1970  L.

Freeze fracturing a biological membrane p. 274 .

Phase transitions in biological membranes can be localized. p. Thickness 15% In the ordered gel state. 274 . rotation around C—C bonds  disorders the chains in the liquid crystalline phase. Above the phase­transition temperature. the hydrocarbon chains are extended.Phase transition of a lipid bilayer. so fluid­ and gel­ phase regions can coexist at certain temperatures.

Cholesterol accounts for 20% to 25% of the mass of lipids in  a typical mammalian plasma membrane and significantly  affects membrane fluidity. 274 . lipid rafts: Cholestreol and sphingolipid Maintained by membrane proteins p.Fluidity and phasetransition temperature The structure of a phospholipid: incorporating an  unsaturated fatty acyl group into a phospholipid lowers the  phase­transition temperature.

or liposome p. 275 .Schematic cross-section of a lipid vesicle.

Membrane proteins Integral membrane proteins Peripheral membrane proteins Lipid­anchored membrane proteins p. 271 .

p. 276 .Bacteriorhodopsin from Halobacterium salinarum Harness light energy for ATP synthesis ­helix ~20 aa light­harvesting  prosthetic group  (in yellow) loops Integral membrane proteins (transmembrane proteins) Hydrophobic core (transmembrane region) + exposed proteins on the surface.

 The channel is formed from 22 antiparallel  strands p. 276 . This porin forms a channel for the passage of protein­ bound iron into  the bacterium.Ribbon structure of the transmembrane portion of porin FhuA from Escherichia coli.

Peripheral membrane proteins  Associated with one face of the membrane through  charge–charge interactions and hydrogen bonding with  integral membrane proteins or with the polar head groups  of membrane lipids. .   A change in pH or ionic strength is often sufficient to  remove these proteins from the membrane.

(c) Proteins anchored by glycosylphosphatidylinositol. 277 .Lipid-anchored membrane proteins attached to the plasma membrane (a) A fatty acyl-anchored proteins. Outer leaflet only. (b) A prenyl-anchored membrane proteins (prenylated proteins). and found in lipid (cholesterol-spingolipid) rafts. p.

  Hydrophobic molecules) p.Membrane Transport (Non­polar gases. 278 .

Thermodynamics of Membrane Transport Aout  → A in  at 25°C. [Ain]=1mM. [Aout]=100mM .

Thermodynamics of Membrane Transport Charge compounds : membrane potential (in volts) F : Faradays’s constant (96.485 kJV­1 mol­1) z: charge on the molecule being transported .

In nerve tissue: gated potassium  channel rapid outward transport  of K+ 10. 280 .000 times faster than  transport of  Na+. Some open or close response to  signal.Membrane transport through a pore or channel pore: for bacteria channel: for animals No energy needed Not substrate saturable Rate id diffusion­controlled Some always open. p.

Types of passive and active transport. 281 . Uniport Symport Antiport p.

Michaelis–Menten equation V0: initial rate of inward  [S]out: external concentration  Vmax: maximum rate of transport of the substrate Ktr: constant analogous to the Michaelis constant Km p.Kinetics of passive transport. 281 .

282 .Passive and active transport protein function. protein binds its specific substrate conformational change  allow the molecule or ion to be released on  the other side of the membrane p.

Primary active transport
powered by a direct source of energy/ATP or light.

light­harvesting 
prosthetic group 
(in yellow)

Bacteriorhodopsin: 

uses light energy to generate a transmembrane proton 
concentration gradient that can be used for ATP formation. 
p. 276

Secondary active transport in Escherichia coli
driven by an ion concentration gradient

The oxidation of reduced 
substrates (Sred) generates a 
transmembrane proton 
concentration gradient. 
The energy released by 
protons moving down their 
concentration gradient drives 
the transport of lactose into 
the cell by lactose permease.

p. 282

Secondary-active transport in animals

p. 283

 releasing the vesicle  contents into the extracellular space. such as proteins. fusing with  endosome then with lysosome. 283 .  Exocytosis: materials for secretion are enclosed in vesicles by the Golgi  apparatus.Endocytosis and Exocytosis Movement for large molecule. p. then fuse with the plasma membrane. Receptor­mediated endocytosis: binding of macromolecules to specific  receptor proteins in the plasma membrane of the cell.

Transduction of Extracellular Signals Signals: chemotaxis hormones neurotransmitters growth factors .

The Hot Spice of Chili Peppers Vanilloid (capsacin) receptor (inactive) Opiod  ( 內生型鴉片 ) Vanilloid receptor (active) Na+ and K+ flow into nerve cell Pain. temperature increasing .

General mechanism of signal transduction across the plasma membrane of a cell. 285 . G proteins are signal transducers Cascade: series amplification events p.

Summary of the adenylyl cyclase signaling pathway p. 288 .

Hydrolysis of GTP to GDP and Pi G proteins have  GTPase activity p. 286 .

wikimedia.org p. 286 .G-protein cycle : fatty­acyl anchored protein : prenyl­anchored protein http://upload.

5’­cyclic  adenosine monophosphate (cAMP) and  its guanine analog cGMP are second  messengers that help transmit signals  from external sources to intracellular  enzymes.Production and inactivation of cAMP The cyclic nucleotides 3’. p. Methylated purines caffeine and  theophylline inhibit cAMP  phosphodiesterase. 287 .

Activation pf protein kinase A The assembled complex is  inactive.  When four molecules of cAMP  bind to the regulatory subunit  (R) dimer. p. 288 . the catalytic subunits  (C) are released.

Activation of receptor tyrosine kinases Insulin receptor p. 291 .

4. 292 .Insulin-stimulated formation of phosphatidylinositol 3.5-trisphosphate PIP3 insulin­receptor substrates p.

PIP2 produces two 2nd messengers. releasing  stored Ca2+. where it— along with Ca2+— activates the enzyme  protein kinase C (PKC). p.  Diacylglycerol remains  in the plasma  membrane. IP3 and diacylglycerol.  where it binds to and  opens a Ca2+ channel in  the membrane. 289 . IP3 diffuses to the  endoplasmic reticulum.

290 . p.Inositol–phospholipid signaling pathway.