METALLOENZIM

ENZIM KARBOKSIPEPTIDASE

Disusun Oleh: PUTRI INTAN PRATIWI 24030112130068 RIYADINI UTARI 24030112130041 .

• Enzim ini menghidrolisis peptida pertama atau ikatan amida pada karboksil atau C-terminal akhir pada protein dan peptida. .Pengertian dan Fungsi Karboksipeptidase • Karboksipeptidase adalah enzim yang disintesis di pankreas dan disekresi ke dalam usus halus.

Klasifikasi Enzim Karboksipeptidase • Enzim yang menggunakan logam sebagai sisi aktifnya "metallocarboxypeptidases • Karboksipeptidase lain yang mengguanak an residu serin pada sisi aktifnya "serine carboxypeptidases" • Enzim yang menggunakan sistein sebagai sisi aktifnya "cysteine carboxypeptidase" Berdasarkan mekanisme sisi aktif Berdasarkan substrat • Karboksipeptidase yang memiliki preferensi kuat terhadap asam amino yang mengandung rantai hidrokarbon aromatik atau bercabang disebut Carboxypeptidase A (A untuk aromatik / alifatik) • Karboksipeptidase yang membelah asam amino bermuatan positif (arginin. lisin) disebut Carboxypeptidase B (B untuk Basic ) .

melalui N dari Histidin 196. dan melalui Oksigen dari asam glutamat-72.Logam Zn dalam Karboksipeptidase Enzim karboksipeptidase mengandung Zn (II) sebagai kofaktor ion logam yang merupakan inti dari sisi aktif enzim. • Ion seng dikoordinasikan dalam geometri tetrahedral dengan tiga rantai samping asam amino pada sisi aktif: melalui Nitrogen dari histidin-69.  Posisi ikatan keempat adalah salah satu molekul air atau oksigen dari karbonil dari glisin-1 seperti yang ditunjukkan pada gambar berikut. .

Posisi logam dalam Karboksipeptidase Keterangan • Red = O • Blue = N • Cyan = Zn • Gray = C • Magenta = Substrate-peptide backbone .

 Zn+…0ᵟ- - Cᵟ+. . hal ini bertujuan untuk membuat atom karbon dari gugus karbonil ini lebih rentan terhadap serangan nukleofilik.Logam Zn dalam Karboksipeptidase • Karboksipeptidase diisolasi dari pankreas.  • Atom Zn memainkan peran integral dalam pembelahan substrat • Zn mempolarisasi gugus karbonil dari-substrat. Secara alami enzim ini mengandung satu atom Zn per molekul protein.

Mekanisme ini melibatkan serangan molekul air pada ikatan peptida substrat.Mekanisme Reaksi pada Sisi Aktif Enzim Karboksipeptidase dengan Substrat • Ada dua mekanisme yang diusulkan untuk fungsi katalitik Enzim Carboxypeptidase • Yang pertama adalah jalur nukleofilik yang melibatkan enzim asil kovalen intermediet yang mengandung sisi aktif basa Glu270. • Mekanisme kedua yang diusulkan adalah jalur air yang dipromosikan. Proses ini dipromosikan oleh ion seng dan dibantu oleh residu Glu-270. .

dimana tyr adalah di ujung C-terminal.Mekanisme Reaksi pada Sisi Aktif Enzim Karboksipeptidase dengan Substrat • Fungsi dari enzim Karboksipeptidase adalah untuk menghidrolisis ikatan  peptida  pada amida pada ujung C-terminal. Ikatan amida adalah antara Gly dan tyr tersebut. Struktur Gly-Tyr . • Dalam contoh dipeptida adalah Gly-tyr.

 Hal oleh ini air yang kemudian diaktifkan diusulkan untuk bagaimana ikatan menyebabkan penambahan-OH dari glutathione-270.Mekanisme lain yang diusulkan yaitu arg-127 berinteraksi dengan  karbonil. pada karbon karbonil yang mengakibatkan pemutusan ikatan amida. peptida ini putus seperti yang air ke karbonil untuk ditunjukkan oleh menghasilkan asam dan  putusnyaa garis bergerigi merah  kemudian hidroksida menyerang iikatan CN. Mekanisme Reaksi pada Sisi Aktif Enzim Karboksipeptidase dengan Substrat . Ion seng masih Ikatan karbonil diaktifkan oleh mempertahankan ikatan dengan Berbagai mekanisme telah interaksi dengan ion Zn.

Hal ini akan menghasilkan bilangan koordinasi enam untuk seng pada kompleks Carboxypeptidase dipeptida A. setelah substrat mengikat di situs aktif Carboxypeptidase . Kedekatan dua residu ini . bilangan koordinasi seng adalah lima. dan molekul air untuk membentuk tetrahedral terdistorsi.glycyl-L-tirosin. nitrogen amino dari dipeptida dan oksigen karbonil menggantikan ligan air. Namun. •Peta kerapatan elektron memberikan bukti bahwa nitrogen amino menempati posisi kedua di dekat glutamat-270. bilangan koordinasi ini dapat bervariasi 5-6. dua oksigen karboksilat dari glutamat-72.Mekanisme Reaksi pada Sisi Aktif Enzim Karboksipeptidase dengan Substrat •Dalam enzim bebas. •Ketika terikat dipeptida glycyl-L-tirosin. pusat logam dikoordinasikan dengan dua nitrogen imidazol Nδ1.

Intermediate distabilkan oleh interaksi dengan Zn2 + dan molekul Carboxypeptidase. •Tiga ikatan hidrogen dan interaksi elektrostatik sangat penting bagi enzim untuk mengenali asam amino terminal dalam rantai peptida. Protein bereaksi dengan molekul air untuk menghasilkan asam amino dan protein baru yang lebih kecil. •Hidrolisis ikatan peptida kemungkinan besar terjadi jika terminal memiliki rantai samping hidrokarbon besar atau aromatik. Sebuah ion Zn 2+ yang terikat erat di dekat sisi aktif membantu dalam katalisis.Mekanisme Reaksi pada Sisi Aktif Enzim Karboksipeptidase dengan Substrat •Untuk memecah protein menjadi asam amino penyusunnya. . Enzim Carboxypeptidase A disekresikan oleh pankreas dan digunakan untuk mempercepat reaksi hidrolisis ini. •Langkah terakhir adalah transfer proton dan pembelahan ikatan peptida. sel menggunakan reaksi hidrolisis.

Terima Kasih .