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LOS ACIDOS NUCLEICOS

ESTRUCTURA DE UN NUCLEOTIDO

NUCLEOSIDO= RIBOSA + BASE NITROGENADA

NUCLEOTIDO = FOSFATO + NUCLEOSIDO

En una base nitrogenada el C1 de la β-D-ribosa se une al N1 de las


pirimidinas y al N9 de las purinas. Los carbonos y nitrógenos de las
bases se identifican con un número y los carbonos de la ribosa con
un número prima.
LAS BASES NITROGENADAS

unión glicosídica
NOMENCLATURA DE NUCLEOTIDOS
NOMENCLATURA DE NUCLEOTIDOS
LOS 4 DESOXINUCLEOTIDOS
LOS 4 RIBONUCLEOTIDOS
NUCLEOTIDOS MODIFICADOS

Tanto en el DNA como RNA algunos nucleótidos pueden presentar modificaciones


en las bases nitrogenadas. Las modificación más común es la metilación de la
adenosina, guanosina y citidina. En algunos virus en su genoma pueden presentar
bases hidroximetiladas y los tRNAs presentan varias otras modificaciones
(pseudouridina, dihidrouridina, isopenteniladenosina, etc.).
LA UNION FOSFODIESTER

El DNA como en el RNA, los


nucleótidos se unen mediante un
enlace fosfodiester entre el 3´ OH
de la ribosa de un nucleótido con el
5´ fosfato del nucleótido siguiente.

La unión entre dos nucleótidos es


posible cuando reaccionan dos
nucleótidos trifosfato y la enzima
que realiza la polimerización (DNA
polimerasa o RNA polimerasa) une
dos nucleótidos y libera pirofosfato
(P-P).

Los polímeros de nucleótidos que


contiene menos que 50 residuos se
denominan oligonucleótidos.
EL RNA ES HIDROLIZADO POR ALCALI
ESTRUCTURAS TAUTOMERICAS DE LOS
NUCLEOTIDOS

Tautómeros del uracilo

Las bases nitogenadas son levemente básicas, tiene un estructura planar y varios
doble enlaces conjugados. A pH 7.0 exiten varias formas de una base que están en
equilibrios y se denominan tautómeros.
ABSORBANCIA A 260 NM

La presencia de doble enlaces conjugados en las bases nitrogenadas determina que


ellas absorban luz ultravioleta por lo que los ácidos nucleicos (DNA y RNA) presentan
una fuerte absorbancia a 260 nm. La absorbancia es proporcional a la concentración de
ellos (Ley de Lambert-Baer)
PUENTES HIDROGENO ENTRE BASES NITROGENADAS
LA DOBLE HELICE DEL DNA

Para que las bases nitogenadas


puedan ubicarse frente a frente y
ser complementarias la primera
hebra deben ubicarse en sentido 5´-
3´y la segunda de manera
antiparalela 3´- 5´

La doble hebra tiende en solución


acuosa a girar hacia la derecha para
que las bases nitrogenadas se
apilen como monedas y disminuyan
su interacción con el agua y las
ribosas y fosfatos se ubiquen hacia
fuera de la doble hebra (modelo de
Watson y Crick)

En la doble hélice la distancia entre


las bases es de 3.4 A, la longitud de
cada giro es 36 A y el ancho de la
doble hélice es 20 A. Además cada
giro comprende 10. 5 bases. El giro
FORMA B DE LA DOBLE HELICE
del de la doble hélice define un
zurco mayor y un zurco menor.
ESTRUCTURAS TRIDIMENSIONALES DEL DNA

El enlace N-glicosídico de bases nitrogenadas


con la ribosa puede rotar lo que origina las formas
syn y anti de los nucleótidos. La forma B de la
doble hebra es la más común en solución acuosa
pero en solventes más apolares el DNA adopta la
forma A. En este caso la doble hélice gira hacia la
derecha pero es más apretada presentando 11
nucleótidos por giro. Además, existe la forma Z en
que la doble hélice gira hacia la izquierda, hay 12
nucleótidos por giro y algunas bases están en la
forma syn. La forma B y Z existen en el DNA de
procariontes y eucariontes (rol regulatorio en la
expresión de algunos genes).
DENATURACION Y RENATURACION DEL DNA

La doble hebra de DNA puede desnaturarse por


aumento de la temperatura o disminución del pH ya
que se rompen los puentes hidrógenos que aparean
las bases nitogenadas. Si la temparatura baja o el
pH se hace neutro las hebras vuelven a aparearse,
es decir, se renatura la doble hebra de DNA. La Tm
de una doble hebra con una determinada secuencia
es la temperatura a la cual el 50% de las moléculas
están desnaturadas. Esto depende principalmente
de la cantidad de G+C de la secuencia.
NUCLEOSOMA
ESTRUCTURA DEL RNA

El RNA de simple hebra (como los RNAm de la transcripción de los


genes) tienden a formar una hélice simple que gira hacia la derecha
al igual que la doble hebra de DNA porque las bases minimizan la
interacción del cuerpo apolar de las bases nitrogendas. Sin
embargo, el RNA de simple hebra tiende a formar estructuras
secundarias por apareamiento de secuencias internas
ESTRUCTURAS SECUNDARIAS Y
TRIDIMENSIONALES DE RNAs

RNA correspondiente a un tRNA-phe de


levadura. Los tRNAs adoptan una estructura
secundaria constituída por varias horquillas
así como una estructura tridimensional que le
permite cargar un aminoácido específico y
presentarlo en el ribosoma para la síntesis
de proteínas
RNA correspondiente a una RNAsa tipo P
que presenta actividad catalítica que elimina
el extremo 3´de secuencias leader de tRNAs
SECUENCIACION DE DNA