Aminoácidos y Aminoácidos y

Proteínas Proteínas
Aminoácidos y Aminoácidos y
Proteínas Proteínas
Dra. Janeth SaIgado
Bioquímica Medicina
FCM-UNAH
2Aminoácidos y
Proteínas
q-AH|N0A6|008 [aa}: estructura
ur|dad esl(uclu(a| oás|ca de
|as p(oleiras
E| d(upo ar|ro esla ur|do a|
C- q . e| C corl|duo a| d(upo
ca(oox||o.
A| C- q laro|ér esla ur|do ur
l v ura cadera |ale(a| R
3e rar desc(|lo ras de 100 aa
pe(o so|o 20 de e||os pa(l|c|par
er |a sirles|s de
p(oleiras.|eslár cod|l|cados er
|os deres)

3Aminoácidos y
Proteínas
AMINOÁCIDOS: estructura
os aa d|l|e(er erl(e s| po(
e| d(upo R |d(upo
susl|lul|vo).
# adjud|car d|le(erles
p(op|edades a cada uro
de |os aa v dele(r|rar su
lurc|ór o|o|ód|ca.
4Aminoácidos y
Proteínas
AMINOÁCIDOS: estructura
A pH fisiológico el pKa de los grupos amino y carboxilo
de los aa es aproximadamente 2 y 10 respectivamente.
El grupo ÷COOH pierde un protón y el grupo amino
capta u protón para dar la forma itterion.(in vivo)
5Aminoácidos y
Proteínas
structura de Ios aminoácidos
!o( su esl(uclu(a. |os aa se |or|zar er so|uc|ór acuosa de rare(a
cue pueder lurc|ora( coro ác|dos v coro oases |arlo||l|cos).
os aa cue poseer ur d. ar|ro v ur d. ca(oox||o |0|v. eu. l|e) se
corv|e(ler er |ores d|po|a(es |ZW|lle(|ores).
Eslos |ores er s|rs acuosas sor e|écl(|carerle reul(os v ro
er|d(ar r| se soreler a carpos e|écl(|cos.
a |or|zac|or de ur aa deperde de| pl de |a so|uc|ór.
!urlo |so|ecl(|co pl er e| cua| |a ro|écu|a ro l|ere ca(da rela
6Aminoácidos y
Proteínas
stereoquímica de Ios aa
Se presentan en dos formas
isomericas, imágenes
especulares no superponibles.
Los isomeros de la serie L
poseen el grupo alfa amino a la
izquierda.
Los aa que se encuentran en las
proteínas son de la serie L y
tienen mayor participación
metabólica celular.
Los aa de la serie D participan
en las paredes celulares
bacterianas.
Todos los aa excepto la Gly
pueden existir en las formas D y
L.
7Aminoácidos y
Proteínas
Propiedades de Ios aa de Ias proteínas
8Aminoácidos y
Proteínas
NomencIatura de Ios aa
AIanina AIa A
Arginina+ Arg R
Asparragina Asn N
Ac.
Aspartico
Asp D
Cisteina Cys C
GIutamina GIn Q
Ac.
gIutamico
GIu
GIicina GIy G
Histidina + His H
IsoIeucina* IIe I
Leucina * Leu L
Lisina* Lys K
Metionina* Met M
FeniIaIanina* Phe F
ProIina Pro P
Serina Ser S
Treonina* Thr T
Triptofano* Trp W
Tirosina Tyr Y
VaIina* VaI V
+: Lsencial en la niñez
*: Lsencial durante toda la vida
Tres letras
Una letra
9Aminoácidos y
Proteínas
AMINOÁCIDOS
Clasificación Clasificación
Propiedades químicas de
las cadenas laterales
6adenas a||fát|cas
2 6adenas con h|drox||o o azufre
3 Aromát|cos
4 ás|cos
5 Ac|dos y sus am|das
10Aminoácidos y
Proteínas
Aminoácidos con cadenas IateraIes aIifáticos
El grupo R se extiende más y se hace más hidrófobo.
Los aminoácidos hidrófobos se encuentran
normalmente en el interior de las moléculas proteicas.
11Aminoácidos y
Proteínas
Aminoácidos con cadenas IateraIes
hidroxiIo o azufre
Cadenas laterales son débilmente polares
Son en general más hidrófilos que sus análogos
alifáticos
La metionina es bastante hidrófoba
Puede producirse una oxidación entre pares de
cadenas laterales de cisteína para formar un enlace
disulfuro (cistina)
12Aminoácidos y
Proteínas
Aminoácidos básicos
|evar d(upos oás|cos er sus
caderas |ale(a|es.
Ex|sler a va|o(es de pl
p(óx|ros a |a reul(a||dad
a r|sl|d|ra es e| reros oás|co
de |os l(es
3or ruv po|a(es
3ue|er ra||a(se ro(ra|rerle
er |as supe(l|c|es exle(|o(es de
|as p(oleiras
Histidina
Lisina
Arginina
13Aminoácidos y
Proteínas
Am|noác|dos ác|dos y sus am|das
3or |os ur|cos ar|roác|dos cue ||evar ca(das redal|vas a pl Z.
Eslár acorparados po( sus ar|das. |a asparag|na v |a g|utam|na.
- T|erer caderas |ale(a|es s|r ca(da. aurcue sor c|a(arerle po|a(es.
laro|ér sor r|d(ól||os v l|erder a ercorl(a(se er |a supe(l|c|e de |as
ro|écu|as de p(oleira. er corlaclo cor e| adua.
14Aminoácidos y
Proteínas
Aminoácidos aromáticos
Presentan cadenas laterales aromáticas.
La feniIaIanina junto con los aa alifáticos (val, leu, ile),
es uno de los aa más hidrófobos.
La tirosina y eI triptófano también presentan un
carácter ligeramente hidrófobo
15Aminoácidos y
Proteínas
Aminoácidos modificados
A|duros aa sor rod|l|cados |caderas |ale(a|es) posl(arsc(|pc|ór.
!o( ejerp|o
- Foslose(|ra |sirles|s de se(|ra a pa(l|( de 3-loslod||ce(alo)
- 1-r|d(ox|p(o||ra co|ádero
- õ-l|d(ox|||s|ra co|ádero
- Ac|do v-ca(oox|d|ulár|co esl(uclu(a de |a osleoca|c|ra |10-25º p(ol
ro co|ádera de| rueso ) deperd|erle de \|l K
16Aminoácidos y
Proteínas
0#HA6|0N 0E PEPT|008 Y
P0L|PEPT|008
os aa se urer o po||re(|zar po( red|o de er|aces
peplid|cos |a ur|ór cuir|ca erl(e e| d(upo q-ca(oox|| de ur
aa cor e| d(upo q-ar|ro de ol(o aa. cor |a ||oe(ac|ór de
ura ro|écu|a de adua.
a (x ÷ |rpo(larle de |os aa es |a lo(rac|ór de ur er|ace
peplid|co va cue esle er|ace ca(ece de ca(da a cua|cu|e(
pl de |rle(és l|s|o|ód|co.
Es ur er|ace cova|erle po( lo(rac|ór de ur er|ace ar|da
17Aminoácidos y
Proteínas
En|ace pept|d|co y formac|ón de pépt|dos
DIPPTIDO
18Aminoácidos y
Proteínas
PEPT|008 Y P0L|PEPT|008
as caderas cue corl|erer uros pocos (es|duos de aa se
deror|rar o||gopépt|dos
- 2 aa d|pépl|do
- 3 aa l(|pepl|do.
3| |a cadera es ruv |a(da se ||ara po||pépt|do.
0(upo ar|ro cue ro ra (eacc|orado er ur exl(ero |ar|ro
le(r|ra| o N-le(r|ra|)
0(upo ca(oox||o s|r (eacc|ora( er e| ol(o exl(ero
|ca(oox||o le(r|ra| o C-le(r|ra|)
19Aminoácidos y
Proteínas
En|ace pept|d|co y formac|ón de pépt|dos
Cada vez que se añade un aa a la cadena, debe eliminarse una molécula de
agua.
TTRAPPTIDO
20Aminoácidos y
Proteínas
Estab|||dad y formac|ón de| en|ace pept|d|co
Er ur erlo(ro acuoso esle p(oceso ro esla lavo(ec|do
le(rod|rár|carerle.
E| er|ace peplid|co es relaeslao|e.
as p(oleiras se r|d(o||zar er d|so|uc|ór acuosa cuardo
esla p(eserle ur cala||zado(
a lo(rac|ór de| er|ace peplid|co p(ec|sa e| acop|ar|erlo
de |a (eacc|ór de sirles|s cor |a r|d(ó||s|s de corpueslos
de loslalo de ere(dia e|evada |AT!). |acl|vac|ór de |os aa)
21Aminoácidos y
Proteínas
Actividad bioIógica:
Péptidos
1. Péptidos vasoactivos: angiotensina ÌÌ,
bradicinina, calidina
2. Hormonas: oxitocina, vasopresina,
somatostatina, TRH, GRH, ACTH, insulina,
glucagón, gastrina, secretina, colecistoquinina,
VÌP (péptido intestinal vasoactivo)
3. Neurotransmisores: encefalinas, sustancia P
22Aminoácidos y
Proteínas
P#0TE|NA8: po||pépt|dos de secuenc|a def|n|da
Cada p(oleiras l|ere ur o(der del|r|do de (es|duos de aa.
3or po||pépl|dos |a(dos Vo rurara l|ere 153 aa.
lav p(oleiras cue sor s|r||a(es pe(o N0 |dérl|cas
as p(oleiras evo|uc|orar. |o racer red|arle caro|os
corse(vado(es v ro corse(vado(es
- Corse(vado(es corse(var |a ralu(a|eza de |a cadera
|ale(a|. !o( ejer Asp po( 0|u
- No corse(vado(es pueder lere( corsecuerc|as d(aves.
Ejr Asp po( A|a
23Aminoácidos y
Proteínas
P#0TE|NA8
Respuesta
Ìnmunitaria
Coagulación
sanguínea
FUNCIONS
24Aminoácidos y
Proteínas
6|as|f|cac|ón de |as prote|nas
esde ur punto de v|sta qu|m|co. ex|sler dos d(ardes d(upos de
p(oleiras
Prote|nas s|mp|es lo(radas exc|us|varerle po( a-ar|roác|dos.
coro es e| caso de |a ub|qu|t|na. ura p(oleasa |rl(ace|u|a( lo(rada
po( 53 AA.
2 Prote|nas conjugadas cue corl|erer aderás de |a cadera
po||peplid|ca ur corporerle ro ar|roacid|co ||arado grupo
prostét|co. cue puede se( ur azuca(. ur |ip|do. ur ác|do ruc|e|co o
s|rp|ererle ur |ór |ro(dár|co.
a p(oleira er auserc|a de su d(upo p(oslél|co ro es lurc|ora|. v se
||ara apoprote|na.
a p(oleira ur|da a su d(upo p(oslél|co es lurc|ora|. v se ||ara
ho|oprote|na |ro|op(oleira = apop(oleira ÷ d(upo p(oslél|co).
3or p(oleiras corjudadas |a hemog|ob|na. |a m|og|ob|na. |os
c|tocromos. elc.
25Aminoácidos y
Proteínas
6|as|f|cac|ón
Er cuarlo a su forma ro|ecu|a(. poderos d|sl|rdu|(
Prote|nas g|obu|ares |a cadera po||peplid|ca apa(ece er(o||ada
soo(e si r|sra dardo |uda( a ura esl(uclu(a rás o reros
eslé(|ca v corpacla. Ejr V|od|oo|ra v lerod|oo|ra
2 Prote|nas f|brosas l|erer lurc|ores esl(uclu(a|es.
!(oleiras de |a p|e|. lej|do corjurl|vo v e| pe|o. |a seda.
3or s|erp(e a|a(dadas
3or reros aourdarles cue |as d|oou|a(es
Ejr cue(al|ra. co|ádero. e|asl|ra. l|o(o|ra
26Aminoácidos y
Proteínas
N|ve|es de organ|zac|ón estructura| de |as
prote|nas
structura 1`
(secuencia de aa)
structura 2`
Plegado de la
cadena polipéptica
(local)
structura 4
Asociación de
varias cadenas
polipeptídicas
structura 3`
Nivel de plegado superior
(global)
27Aminoácidos y
Proteínas
structura primaria
Acorodar|erlo de |as caderas de aa |o(der secuerc|a| de aa).
eslao|||zado po( er|aces peplid|cos. puerles d|su|lu(os |c|sleira). A|
a|le(a( esle o(der laro|ér se a|le(a e| l|po. |as p(op|edades de |a
p(oleira.
Esla dele(r|rada po( ur der corc(elo.
Ejr lrsu||ra. vasop(es|ra. co|ec|slocu|r|ra. dasl(|ra. sec(el|ra |lr
de| s|slera d|desl|vo)
28Aminoácidos y
Proteínas
structura secundaria
Se encuentran con > frecuencia
son Ia héIice Ia Iamina ß y Ia
héIice 3
10
29Aminoácidos y
Proteínas
Estructuru Z"
3or (ea((ed|os espec|a|es o(|d|rados po( e|
eslao|ec|r|erlo de puerles de l erl(e |os
d(upos c corlo(rar |os er|aces peplid|cos de
|os aa ce(caros.
a|fa hé||ce es ur o(derar|erlo re||co|da| er e|
cue e| d. R de |os aa se o(|erla rac|a e| exle(|o(
de |a ré||ce.
- 3e eslao|||za po( |a lo(rac|ór de puerles de l
erl(e |os corporerles de| er|ace peplid|co de
aa ce(caros er |a esl(ucl 1 de |a p(oleira.
- Ejr p(oleiras l|o(osas co|ádero. a|la cue(al|ra.
Ø |am|nar
- E| escue|elo se o(dera er lo(ra de z|dzad.
- os d(upos R de aa se o(|erlar er d|(ecc|ores
opueslas cor ur pal(ór a|le(rarle v rac|a alue(a
- se eslao|||za po( puerles de l.
- os aa ro l|erer cue esla( p(óx|ros er |a
esl(uclu(a 1
- Tip|ca de p(oleiras l|o(osas l|o(o|ra |seda)
30Aminoácidos y
Proteínas
STRUCTURA TRCIARIA
as p(oleiras d|oou|a(es ro so|o
poseer esl(uclu(as 2` s|ro cue.
aderás. laro|ér se p||edar
lo(rardo esl(uclu(as le(c|a(|as
corpaclas.
Es ura rod|l|cac|ór er e| espac|o.
Es e| p|edar|erlo l(|d|rers|ora|
lola| de |a cadera de ura p(oleira.
3e lo(ra ura p(oleira l(|d|rers|ora|
Esla corlo(rac|ór lac|||la |a
so|uo|||dad er adua v asi (ea||za(
lurc|ores de l(arspo(le. erz|rál|cas.
ro(rora|es. elc. Ejr r|od|oo|ra
STRUCTURA TRCIARIA
32Aminoácidos y
Proteínas
STRUCTURA TRCIARIA
Esla corlo(rac|ór se rarl|ere eslao|e d(ac|as a |a
ex|slerc|a de er|aces erl(e |os rad|ca|es # de |os
ar|roác|dos. Apa(ecer va(|os l|pos de er|aces
os puentes de h|drógeno
|nteracc|ones de Van der waa|s
os puentes e|éctr|cos erl(e aa de ca(da d|le(erle
||arados laro|ér 'al(acc|ores e|ecl(oslál|cas¨
as |nteracc|ones h|drófobas lo(rac|ór de ur ruc|eo
r|d(oloo|co o |rle(lace r|d(oloo|co
E| puente d|su|furo
33Aminoácidos y
Proteínas
structuras de Ias proteínas gIobuIares
La mayoría de las proteínas
están formadas por mas de
un dominio;
Dominio: región compacta,
plegada localmente, de la
estructura 3`.
Los principales patrones de
plegado:
1. Los producidos alrededor de
un empaquetamiento de
hélices alfa
2. Los construidos sobre un
entramado de estructuras
laminas beta
34Aminoácidos y
Proteínas
Estructuru 4"
Es e| r|ve| ras corp|ejo de
o(dar|zac|ór.
3e (el|e(e a |rle(acc|ores ro
cova|erles cue urer va(|as
caderas po||pepl|d|cas er ura so|a
ro|écu|a. Ejr |a rerod|oo|ra c
l|ere 1 caderas.
Cada ura de eslas caderas
po||peplid|cas (ec|oe e| roro(e de
suour|dades.
E| rure(o de suour|dades
|caderas) va(ia desde dos coro
er |a rexocu|rasa. cual(o coro er
|a rerod|oo|ra. o rucros coro |a
cáps|da de| v|(us de |a po||or|e||l|s.
cue corsla de ê0 ur|dades
p(ole|cas.
35Aminoácidos y
Proteínas
NiveIes de estructura proteica
Estructura cuaternaria
Homotípicas: asociación
de cadenas
polipeptídicas idénticas o
casi idénticas
Heterotipicas:
interacciones entre
subunidades con
estructuras muy distintas
36Aminoácidos y
Proteínas
Propiedades
3e ||ara desnatura||zac|ón de |as p(oleiras a |a pérd|da de |as estructuras de
orden super|or |securda(|a. le(c|a(|a v cuale(ra(|a). cuedardo |a cadera
po||peplid|ca (educ|da a ur po|ire(o esladisl|co s|r r|rdura esl(uclu(a
l(|d|rers|ora| l|ja
a desralu(a||zac|ór p(ovoca d|ve(sos efectos er |a p(oleira
6amb|os en |as prop|edades h|drod|nám|cas de |a p(oleira aurerla |a
v|scos|dad v d|sr|ruve e| coel|c|erle de d|lus|ór
2. ura d(ásl|ca d|sm|nuc|ón de su so|ub|||dad. va cue |os (es|duos r|d(olóo|cos
de| |rle(|o( apa(ecer er |a supe(l|c|e
3 Pérd|da de |as prop|edades b|o|óg|cas
LS1ADO NA1IVO LS1ADO
DLSNA1URALIZADO
37Aminoácidos y
Proteínas
0E8NATU#AL|ZA6|0N
os aderles cue p(ovocar |a desralu(a||zac|ór de ura p(oleira se
||arar agentes desnatura||zantes. 3e d|sl|rduer aderles f|s|cos
|ca|o() v qu|m|cos |dele(derles. d|so|verles o(dár|cos. pl. lue(za
|ór|ca).
Coro er a|duros casos e| lerórero de |a desralu(a||zac|ór es
(eve(s|o|e. es pos|o|e p(ec|p|la( p(oleiras de rare(a se|ecl|va
red|arle caro|os er
|1) |a po|a(|dad de| d|so|verle
|2) |a lue(za |ór|ca
|3) e| pl
|1) |a lerpe(alu(a
NIMAS: cataIizadores
bioIógicos
NIMAS: cataIizadores
bioIógicos
CATÁLISIS Y CONTROL D LAS
RACCIONS BIOQUIMICAS
39Aminoácidos y
Proteínas
NIMAS
1. Corceplos dere(a|es
2. C|as|l|cac|ór
3. C|rél|ca erz|rál|ca
1. lrr|o|c|ór erz|rál|ca
5. Erz|ras a|oslé(|cas
ê. Calá||s|s erz|rál|ca
Z. Eleclos de |a lerpe(alu(a. pl. colaclo(es
8. Redu|ac|ór erz|rál|ca
40Aminoácidos y
Proteínas
Conceptos generaIes
3or cala||zado(es lip|cos ace|e(a( |a ve|oc|dad de ura (x s|r se(
corsur|das er e| p(oceso
3or esl(uclu(a|rerle (ec|c|ao|es
lrc(ererlar |as ve|oc|dades de (x er ur o(der de 10
8
a 10
11
veces.
3or cala||zado(es o|o|ód|cos
A|duras (ecu|e(er colaclo(es o d(upos p(oslél|cos
a acl|v|dad erz|rál|ca es (edu|ao|e
Cor excepc|ór de ur pecuero d(upo de ro|écu|as de ARN. lodas
|as erz|ras sor p(oleiras.
41Aminoácidos y
Proteínas
Conceptos generaIes
A|duras poseer |soerz|ras. erz|ras cue cala||zar |a r|sra
(eacc|ór pe(o p(eserlar d|le(erc|as er 1 o rás ar|roác|dos
de su esl(uclu(a p(|ra(|a.
Er ura (eacc|ór cala||zada po( ur erz|ra
a suslarc|a soo(e |a cue aclua e| erz|ra se ||ara sustrato.
E| susl(alo se ure a ura (ed|ór corc(ela de| erz|ra. ||arada
centro act|vo.
ura vez lo(rados |os productos |a erz|ra puede corerza(
ur ruevo c|c|o de (eacc|ór
42Aminoácidos y
Proteínas
SPCIFICIDAD D LAS
NIMAS
Especificidad optica acluar soo(e ur dele(r|rado
|sóre(o. Ejer se(|e |aa) o se(|e |Cl)
Especificidad de grupo a|duras acluar soo(e ur d(upo
dele(r|rado de ro|écu|as. Ejer erz|ras cue d|d|e(er |as
p(oleiras.
43Aminoácidos y
Proteínas
CIasificación
En función de su acción catalítica específica, los enzimas
se clasifican en 6 grandes grupos o clases:
Clase 1: OXÌDORREDUCTASAS
Clase 2: TRANSFERASAS
Clase 3: HÌDROLASAS
Clase 4: LÌASAS
Clase 5: ÌSOMERASAS
Clase 6: LÌGASAS
44Aminoácidos y
Proteínas
Clase 1: OXÌDORREDUCTASAS
Reacc|ores de ox|dac|ór- (educc|ór . Ejr ox|dasas.
desr|d(oderasas. (educlasas. pe(ox|dasas
45Aminoácidos y
Proteínas
Clase 2: TRANSFERASAS
Cala||zar |a l(arsle(erc|a de ur d(upo cuir|co |d|sl|rlo de|
r|d(ódero) de ur susl(alo a ol(o. Ejr l(arsca(oox||asas.
l(arsrel||asas. l(arsar||asas
46Aminoácidos y
Proteínas
Clase 3: HÌDROLASAS
Catalizan las reacciones de hidrólisis: (rupturas
hidroliticas. Ejm peptidasas, fosfatasas,
estearasas.
lactosa + agua ÷ glucosa + galactosa
47Aminoácidos y
Proteínas
Clase 4: LÌASAS
Fo(rac|ór de doo|es er|aces po( e||r|rac|ór de ur d(upo
cc o ad|c|ór de d(upos a doo|es er|aces. Ejer a|der|do
||asas. desca(oox||asas. desr|d(alasas. desar|rasas.
s|rlasas
FR1
Slide 47
FR1
Francis Rodriguez, 2/1S/2008
48Aminoácidos y
Proteínas
Clase 5: ÌSOMERASAS
Cala||zar |a |rle(corve(s|ór de |sóre(os (ea((ed|os de
áloros derl(o de ura ro|écu|a. 3or ejerp|os |a
loslol(|osa |sore(asa. loslod|ucosa |sore(asa.
ep|re(asas. rulasas
49Aminoácidos y
Proteínas
Clase 6: LÌGASAS
Reacciones en las que se unen dos moléculas
Formación de enlaces qq, utilizando ATP u
otros nucleótidos como fuente de energía. Ejem:
polimerasas, sintetasas
50Aminoácidos y
Proteínas
NOMNCLATURA
51Aminoácidos y
Proteínas
Sitio o centro activo de una
enzima
Lugar de la estructura proteica donde se da la
interacción con el sustrato (3 lugares).
Es una estructura dinámica y transitoria.
Hay dos modelos sobre la forma en que el
sustrato se une al centro activo de la enzima:
1. Modelo llave ÷ cerradura
2. Modelo del ajuste inducido
52Aminoácidos y
Proteínas
ModeIo IIave cerradura
!(opueslo po( e| o|occ a|erár E.
F|sre( 1881
!|arlea ura |rle(acc|ór (e|al|varerle
(id|da erl(e |os 2 corporerles.
a erz|ra pe(rarece s|r
l(arslo(rac|ores esl(uclu(a|es r|
lurc|ora|es
3upore cue |a esl(uclu(a de| susl(alo
v |a de| s|l|o acl|vo sor
corp|ererla(|as
53Aminoácidos y
Proteínas
ModeIo deI ajuste inducido
!(opueslo po( . Koscr|ard er 1958
a erz|ra sul(e ur caro|o corlo(rac|ora|
|a| |rle(aclua( cor e| 3) cue pe(r|le ura
(e|ac|ór ras esl(ecra erl(e aroos
Es e| ras aceplado aclua|rerle
Cuardo se |od(a |a |rle(acc|ór E-3 er po( |o
reros 3 purlos se ve lavo(ec|da |a (x
a E v e| 3 sul(er caro|os corlo(rac|ora|es
A| l|ra| de |a (x |a E (ecupe(a su esl(uclu(a
o(|d|ra|
54Aminoácidos y
Proteínas
H000 0E A66|0N 0E LA8 ENZ|HA8: conceptos
|mportantes
Ere(dia ||o(e de 0|oos |L0) carl|dad de ere(d|a capaz de (ea||za(
ur l(aoajo du(arle ura (eacc|or a T` v !` cle.
Ere(dia de acl|vac|ór |E
a
) oa((e(a ere(dél|ca po( erc|ra de |a cua|
ura ro|écu|a de ur p(oduclo |rle(red|o deoe pasa( pa(a cue se
||eve a caoo ura (eacc|ór.
Eslado de l(ars|c|ór es ur eslado cue posee ravo( carl|dad de E
||o(e cue |os (eaclarles v cue |os p(oduclos.
55Aminoácidos y
Proteínas
PerfiI energético de una reacción espontánea PerfiI energético de una reacción cataIizada
a acc|ór de |os cala||zado(es cors|sle er d|sr|ru|( |a Ea
as erz|ras d|sr|ruver |a Ea aur ras cue |os cala||zado(es
|ro(dar|cos.
a acluac|ór de |a erz|ra pe(r|le
1. 0ue |os susl(alos se urar a su cerl(o acl|vo cor ura o(|erlac|ór
ópl|ra pa(a cue |a (eacc|ór se p(oduzca.
2. Vod|l|ca |as p(op|edades cuir|cas de| susl(alo ur|do a su cerl(o acl|vo.
deo|||lardo |os er|aces ex|slerles v lac|||lardo |a lo(rac|ór de ol(os
ruevos
CINTICA
NIMATICA
CINTICA
NIMATICA
57Aminoácidos y
Proteínas
CINTICA NIMATICA
Eslud|o cuarl|lal|vo de |a calá||s|s erz|rál|ca
\e|oc|dad de (eacc|ór caro|o er |a corcerl(ac|ór de
susl(alos o p(oduclos po( ur|dad de l|erpo.
as erz|ras sor cala||zado(es o|o|ód|cos
58Aminoácidos y
Proteínas
Cinética enzimática: orden de Ia reacción
os p(|rc|p|os dere(a|es de |as (eacc|ores cuir|cas se ap||car laro|ér a |as
(eacc|ores erz|rál|cas
Er ura (eacc|ór de pr|mer orden |a ve|oc|dad de lo(rac|ór de |os p(oduclos es
d|(eclarerle p(opo(c|ora| a |a corcerl(ac|ór de| susl(alo.
ura (eacc|ór de segundo orden es acue||a er |a cue |a ve|oc|dad de lo(rac|ór
de| p(oduclo deperde
1. de |a corcerl(ac|ór de dos susl(alos |coro er ura (eacc|ór de cordersac|ór)
2. de| cuad(ado de |a corcerl(ac|ór de ur ur|co susl(alo |(eacc|ór de d|re(|zac|ór)
Er ura (eacc|ór de orden cero. |a ve|oc|dad de lo(rac|ór de| p(oduclo es
|rdeperd|erle de |a corcerl(ac|ór de susl(alo.
59Aminoácidos y
Proteínas
Cinética enzimática
Teoría generaI de Ia acción enzimática: la E
se combina con su S para formar el complejo E-
S (unión reversible) luego este se rompe: por un
lado se libera la E y por el otro se origina el
Producto
Factor limitante
60Aminoácidos y
Proteínas
Cinética de MichaeIis - Menten
El efecto de la [S] en la velocidad de reacción se rige
por la siguiente ecuación matemática:
V: vel inicial de la reacción
V
max
: vel máxima que puede alcanzar la rx
K
m
: cte de Michaelis
[S]: concentración de sustrato
61Aminoácidos y
Proteínas
cuación de MichaeIis Menten
\
rax
purlo er cue ro |rpo(la |a
carl|dad de 3. |a ve|oc|dad de (x
ro aurerla ras.
!urlo de salu(ac|ór de |a E
co((esporde a |a carl|dad de 3
dorde se a|carzo |a \
rax
K
r
[3ì a |a cua| se a|carza |a
r|lad de |a \
rax
K
r
es ur pa(árel(o de |a al|r|dad
de |a erz|ra po( su susl(alo.
62Aminoácidos y
Proteínas
INHIBICIÓN NIMATICA
Medio importante para regular las rutas
metabólicas
Tx clínicos se fundamentan en la inhibición
enzimática
Permite diseñar técnicas bioquímicas
63Aminoácidos y
Proteínas
CIases de inhibidores
Ìnhibición reversible:
1. Competitivos
2. Acompetitivos
3. No competitivos
Ìnhibición Ìrreversible: venenos enzimáticos
64Aminoácidos y
Proteínas
Inhibidores competitivos
3e urer de lo(ra (eve(s|o|e a |a erz|ra ||o(e pa(a lo(ra( corp|ejo El
E| 3 v e| l corp|ler po( e| r|sro |uda( er |a erz|ra
a acl|v|dad de |a erz|ra |
E| eleclo puede |rve(l|(se | |a [ 3 ì
Reducer |a al|r|dad de |a erz|ra po( e| 3
T|erer ura esl(uclu(a serejarle a| 3
65Aminoácidos y
Proteínas
Inhibidores competitivo
Succinato deshidrogenasa
66Aminoácidos y
Proteínas
Inhibidores acompetitivos
3e urer a| corp|ejo E3
a ad|c|ór de ras 3 a |a (x= | a |a ve|oc|dad de (x
3e oose(va er |as (xs er |as cue se urer ras de ur susl(alo
67Aminoácidos y
Proteínas
68Aminoácidos y
Proteínas
Inhibidores No competitivos
3e urer larlo a |a E coro a| corp|ejo E3
3e urer a ur s|l|o d|le(erle de| |uda( acl|vo de |a E
Vod|l|cac|ór de |a corlo(rac|ór de |a E ||rp|de |a
lo(rac|ór de| p(oduclo)
No aleclar a |a ur|ór de| susl(alo
3e |rv|e(le pa(c|a|rerle= | |a [ 3 ì
69Aminoácidos y
Proteínas
Inhibición no competitiva
70Aminoácidos y
Proteínas
Inhibición irreversibIe
3e urer cova|erlererle a |a
erz|ra
lrr|o|c|ór cor rela|es
pesados coro ld v !o
Arer|a po( ervererar|erlo
po( !o ur|ór de| !o a |os
d(upos -3l de |a
le((ocue|alasa ||rse(c|ór de
Fe
÷2
er e| rero)
71Aminoácidos y
Proteínas
Inhibición irreversibIe
72Aminoácidos y
Proteínas
nzimas aIostéricas
3or p(oleiras cor va(|as suour|dades
3u acl|v|dad es aleclada po( ro|écu|as eleclo(as cue se urer a
ol(os |uda(es a|oslé(|cos o (edu|ado(es
Cala||zar pasos (edu|ado(es c|aves de |as (ulas o|ocuir|cas
Rep(eserlac|ór de |a ve|oc|dad de (x sor s|dro|deas
73Aminoácidos y
Proteínas
CatáIisis
Efectos de proximidad y tensión
Efectos electrostáticos
Catálisis acidobásica
Catálisis covalente
74Aminoácidos y
Proteínas
La act|v|dad opt|ma de |a enz|ma
depende de:
Temperatura
pH
Presencia de cofactores
[ S ]
[ E ]
75Aminoácidos y
Proteínas
fecto de Ios cofactores
Cas| ur le(c|o de |os erz|ras coroc|dos (ecu|e(er colaclo(es pa(a su lurc|ór.
os colaclo(es pueder se( |ores |ro(dár|cos coro e| Fe÷÷. Vd÷÷. Vr÷÷. Zr÷÷ elc.
Cuardo e| colaclo( es ura ro|écu|a o(dár|ca se ||ara coenz|ma.
Vucros de eslos coerz|ras se s|rlel|zar a pa(l|( de v|lar|ras
76Aminoácidos y
Proteínas
Función de Ios Cofactores
Alterar la estructura tridimensional de la enzima
Ìntervenir como otro sustrato
77Aminoácidos y
Proteínas
78Aminoácidos y
Proteínas
79Aminoácidos y
Proteínas
fecto de Ia Tº
os aurerlos de lerpe(alu(a
ace|e(ar |as (eacc|ores
cuir|cas
a lerpe(alu(a a |a cua| |a
acl|v|dad cala|il|ca es ráx|ra
se ||ara temperatura ópt|ma
80Aminoácidos y
Proteínas
fecto deI pH
3edur e| pl de| red|o. |os d(upos R de
|as erz pueder lere( ca(da e|écl(|ca
pos|l|va. redal|va o reul(a.
lav ur pl er e| cua| |a corlo(rac|ór
se(á |a rás adecuada pa(a |a acl|v|dad
cala|il|ca. Esle es e| ||arado ph ópt|mo.
a ravo(ia de |os erz|ras sor ruv
sers|o|es a |os caro|os de pl.
|aro(l|duado(es l|s|o|ód|cos)
81Aminoácidos y
Proteínas
Modificación de Ia [S]
Es la menos compleja.
Ocurre al | o | la [S]
Bajas [S] es indicador de
disminución de la actividad
enzimática
Fig sup: velocidad de rx
enzimatica a 6 diferentes [S]
82Aminoácidos y
Proteínas
Modificación de Ia []
Es mas compleja: requiere la síntesis de novo de enzimas
(inducción enzimática)
La síntesis proteica requiere tiempo y mucha energía
Cuando la [S] aumenta por encima de ciertos valores y si aparecen
nuevos sustratos (antes ausentes) se deben sintetizar nuevas
enzimas.
La inducción enzimática es estimulada por hormonas (larga
duración)
Represión enzimática: disminución de la síntesis de enzimas
** de acuerdo a las necesidades celulares
83Aminoácidos y
Proteínas
ReguIación enzimática
Mantenimiento de un estado ordenado
Conservación de energía
Respuesta a las variaciones ambientales
84Aminoácidos y
Proteínas
I controI se reaIiza por:
1. Control genético
2. Modificación covalente
3. Regulación alostérica
4. Activación de zimógenos
85Aminoácidos y
Proteínas
ControI genético
Ìnducción enzimática
Represión enzimática
86Aminoácidos y
Proteínas
Modificación covaIente
La actividad enz puede | o | por a adición covalente de un grupo químico
a la enzima
Es transitoria y reversible
Con mayor frecuencia: g. fosfatos, g. metilo y la adenosina
Adición o remoción de g. qq funcionan como mxs de control
Iementos de Ia
reacción
nzima no fosforiIada es
inactiva
nzima fosforiIada es
activa
87Aminoácidos y
Proteínas
Modificación covaIente
88Aminoácidos y
Proteínas
Activación de zimógenos
as erz sor s|rlel|zadas coro ro|écu|as |racl|vas ||aradas z|róderos o
p(oerz|ras.
!a(a acl|va(se. |os z|róderos sul(er ur alacue r|d(o|il|co cue o(|d|ra |a ||oe(ac|ór
de uro o va(|os pépl|dos
3| eslas erz|ras se s|rlel|zaser d|(eclarerle er lo(ra acl|va desl(u|(iar |a p(op|a
cé|u|a cue |as p(oduce
89Aminoácidos y
Proteínas
ReguIación aIostérica
Las enz reguladas por
alosterismo existen en dos
estados:
1. T o tenso
2. L o laxo
Hay 2 tipos de reguladores
alostericos:
1. Efectores o activadores
alostericos
2. Ìnhibidores alostericos
Ciertas sust se unen en sitios
diferentes del sitio activo
(sitio alosterico)
Ejm: ATP, NADH, citrato, etc.

 
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43/7444.:170 742E9.48 ./086:J2./03.8/0 ./488:8./03.8 234E..48 E8.1E9.8.8 ..8 .8./48 !7490J3.81.O3 !7450/.2/.8./03.08      ..8.  $ ...907.

20390030390747/0.234E..43./48/7O14-488003.:0397./48.08./48 !7490J3.02E8/7O14-4   48./03.1E9.8   234E.3 3472.824F.907.857490.48  7:54#800903/02E880.8 .8.234E...:.

../48.89.8.08/0.1472.780:3.8.2E8/7O1486:08:8.4/.1E9.893.390/7O14-.5.209433.  !:0/0574/:.  234E.48  .8 .8.7:303./03.890J3.708  $43030307.:170  .234E.O3039705. 08-..907.708/0 ./03.08 /7444./03.0 /8:1:74 .3E448 .907.907./48 !7490J3.43.08843/F-2039054..7.

48038:8 ../48 !7490J3.708  $:003..20390 03..857490J3.. 83./.0809074708/0 ./48-E8.8.. 234E.08020348-E8.89/3.88:5071.7803472.37:548-E8.907../  .8 89/3./03.08   8903. 733.30:97.4 /0489708  $432:54.48  0.4708/05 57O248.8 .234E.

2-F3843/7O148903/03.:...708  9. %0303./488:8./485478:8.8 .78003..830.430.0/0.439.3.5  89E3.2039054.234E.7.8/057490J3.:9.3../48 !7490J3.7.7./03.85.234E.8 24F.2/.8./486:00.94..N..425.7...03.8:5071./48E.8 .23.9. 03. 234E.907.:.8.8  $43483.0883.4397. ...2/.:36:0843.48.

..3:3 .08./48../48 !7490J3./03..8   . 0: 0  08:34/048.2E8/7O14-48   .103.90707.97483. :394.8.4348.742E9....09759O1.234E.1E9.48 .33.742E9.7E.20390/7O14-4 234E..8 .907.48  !708039.3.2-F35708039.34 9.

907./03./4824/1... 8J39088/08073./48 .08 54897.84324/1..38.07.5..797/0 14814.234E.94  /745743..8.O3 !4700254 48148073.75..4E034 ./48  :348.

9:7..7-4:9E2./48 !7490J3../0:084 /0503/0390/0'9 234E./0.8 .4E03.  5749 34./4Ø .48904..3..40897:. /7483.4E034 .

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