核磁 共振原 理及 其在

生物学中 的应 用
核磁共 振在
生物学中 的应用
NMR 在生物大分子上的应用

• 蛋白 质三维 结构 测定 , 原子
分辨 率下的 结构 与功能 研
究
• 分子 柔性与 运动 性
• 复合 物结构 测定 , 分子识 别
• 膜蛋 白
核磁共振基本原理 - 引言
吴季辉

核磁共 振在 生物科 学
中的 主要应 用
•测定生 物大分 子空 间结构
•研究生 物大分 子与 配基的 相互 作用
•测定生 物大分 子的 动力学 性质
•跟踪蛋 白质的 折叠 过程 , 捕获折 叠过程 中瞬
态中间 物
•测定可 滴定基 团的 解离常 数
•测量溶 液中分 子的 扩散系 数
•研究酶 反应机 理
•跟踪活 细胞的 代谢 过程
•用于医 学成像 以及 神经科 学中 的脑功 能成 像
蛋白 质三维 结构 测定 , 原子
分辨率下 的结 构与功 能研究

复合物 结构 测定 , 分子识别
TROSY-based
NMR study of
the interface
of the 64 kDa
complex
formed by the
B domain of
protein A (FB)
and an Fc
fragment of
immunoglobul
in
Current
Opinion in
G (Fc).
Structural
Biology 2003,
13:570–580
www.current-
 NMR analysis of a 900K
GroEL GroES complex.

• Nature. 2002 Jul 11;418(6894):207-11

• Fiaux J, Bertelsen EB, Horwich AL,
Wuthrich K.
two-dimensional [15N,1H]-
CRIPT-TROSY2
 膜蛋 白
• 受体，离子通道 药物 作用靶点
• PDB 数据库 中 < 30 个膜蛋 白 ,
• ~160 00 水溶性蛋
白
•人 ~360 00 个基因
• ~10 万个蛋 白质
• 真核细胞中 ~3 0% 膜蛋白
• < 0. 2% 膜蛋白结
 膜蛋白 结构
• 蛋白质晶体学 , 电镜三维重构
• NMR 小肽 <50 残基 , 蛋白质
• 在去垢剂形成的微胶囊 (micelles) 中 , 液
体 NMR
• 在去垢剂或脂形成的双层微胶囊
(bicelles) 中 , 液体 NMR
• 在脂形成的脂双层 (bilayers),
• 固体 NMR
2H,13C,
15N-
labeled
integral
membra
ne
protein
OmpX in
DHPC
micelles
, a 60
kDa
complex
that is
shown
schemat
ically in
 蛋白质动 力学
• 蛋白质 运动性和功 能有密切关 系
• 酶的柔性运动性 与酶反应机 理
•
• NM R 弛豫时间
• 1
H/ 2 D 交换速率
 药物设计 和筛 选

• 高通量筛 选
Chemical-shift mapping. a | Conventionalchemical-
shift mapping of part of the [13C,1H]-correlation
spectrum of the enzyme dihydrodipicolinate
reductase (DHPR) , which is a 120-kDa
homotetrameric protein. On binding of
the(NOESY)6 represents the substrate analogue
 药物设计 和筛 选

•设计， 筛选结合

•SAR － By-NMR
药物筛选
NATURE REVIEWS | DRUG
DISCOVERY VOLUME 1 | MARCH
2002 | 211
SHAPES
蛋白质 折叠 –去折 叠研究
核磁共振基本原理 - 引言
吴季辉

• Schematic diagram summarizing the roles of unfolded, partially

folded proteins, and misfolded proteins in biology.
核磁共振基本原理 - 引言
吴季辉

捕获折 叠过程中瞬 态中间物

 用 NMR 连续监 测蛋白质复 性过
核磁共振基本原理 - 引言
吴季辉

• Stopped-flow 19F NMR spectra of the refolding of 6-19F-tryptophan

labeled Escherichia coli dihydrofolate reductase following dilution from
5.5 to 2.75 M urea at 5 °C in the presence of 3.8 mM NADP+
核磁共振基本原理 - 引言
吴季辉

平衡常数 测量
A + B ←
k ,k
→ AB
1 −1
 围棋高级认知功能的 fMRI 研究

1. 围棋 - 高级智能 中华 文化 瑰宝 2. 专业棋 手 - 高级智

能学习
3. 围棋 - 象棋比 较 : 为人工 智能提 供启示
国际象 棋：计 算 机 - 战胜 - 世界 冠军
围　　 棋：业 余棋 手 - 战胜 - 计 算 机

反射
镜

BLANK 30sec RANDOM 30sec GAME 30sec

 BOLD signal time course in left and right BA7 Left
Right
6

BOLD signal change (%)

4
2
0
-2
-4
0 30 60 90 120 150 180 210 240 270 300 330 360
Time (s)

A. ( 上 ) 围棋 B. （下） 国际 象棋的 fMRI 结果

围棋 与国际 象棋 的区别 ：较 强的激 活 围 棋 - 右侧， 国际 象棋 - 左侧。
有证 据表明 : 右半球 参与整 体水 平加 工 . 本结果 提示 ：
围棋 -- 更依赖于 - 整体 水平 加工， 国 际象 棋 -- 更注 重于 - 局部计 算。
 Genome, Proteome,
Metabolomics, Systems Biology
构建数 学模 型
 METAFoR (metabolic flux
ratio)
analysis
the active central carbon pathways
and the ratios of their fluxes
can be directly determined from
two-dimensional (2D) nuclear
magnetic
resonance (NMR) analysis of
hydrolyzed cell protein
各种片断的相对丰度