http://kph12.myweb.uga.edu/cellcommuncation.

html Cell Communication: Chapter 11

From Biology (Fifth Edition) by Campbell, Reece, and Mitchell

Overview
Why do cells need to communicate? To coordinate the processes of life. Multicellular organisms have billions of cells that must communicate to develop and survive. Unicellular organisms must also communicate in order to locate nutrients and in some cases identify mating partners. Example: Saccharomyces cerevisiaethe fungus that humans have used for centuries to make bread, wine, and beer. Use of chemical signal to find potential mates. Alpha and a cells:

The cells that are communicating might be close together or far apart. Local regulator-Hormone-Neurotransmission-*Cells can also communicate through direct contact, through a cell junction that allows cytoplasmic continuity*

How do chemical messengers cause changes in the receiving cell? Three stages of cell signaling: Reception, Transduction, Response. Reception-Transduction-Response-*Rutherlands research at Vanderbuilt University for which he won the Nobel Prize in 1971 shows how signal transduction works*

A. Signal Reception and Initiation of Transduction

1) Binding of messenger-- Chemical messenger binds to receptor protein, and the protein changes shape (conformational change.) The messenger fits into the receptor like a key in a lockit behaves as a ligand. 2) Receptors-- Most receptors are plasma membrane proteins. We can divide the types of receptors in to a few major categories based on their structure and how they work: G-protein linked receptors, tyrosine-kinase receptors, and ion-channel receptors.

a. G-protein-linked receptors:

b. Tyrosine-kinase receptors:

c. Ion-Channel receptors:

B. Signal Transduction Pathways

Transduction has many steps and can result in amplification of signal. (Small signal produces big response) 1) Transduction pathways relay information. The ligand binds to a receptor on the plasma membrane, causing a conformational change in the receptor, which triggers a cascade of events. The activated receptor protein activates a series of other proteins that relay the information. 2) Protein phosphorylation is major mechanism of signal transduction in cells. Protein kinase-Protein phosphotase--

3) Second messengers play a role in signal transduction pathways. Small, water-soluble, and nonprotein, they can spread throughout cell by diffusion. Two most common cyclic AMP and Ca++. a. Cyclic AMP

b. Calcium ions / Inositol Triphosphate:

Cellular Responses to Signals

A cell may regulate activities in cytoplasm or transcription in the nucleus. Examples of activities regulated in cytoplasm: Genetic regulation:

Why are there so many little steps in the pathway?

Specificity of Response: Why do certain cells respond differently to the same signal?

How can pathways interact to form single reponses?

Ion Channels

Ion channels have to be able to admit one ion type selectively, but not another, and to open and shut and sometimes to conduct ions in one direction only. But until recently, it was not known how this molecular machinery really worked. From U. of Miami - Ion channels: During the 1970s it was shown that the ion channels were able to admit only certain ions because they were equipped with some kind of "ion filter". Of particular interest was the finding of channels that admit potassium ions but not sodium ions even though the sodium ion is smaller than the potassium ion. It was suspected that oxygen atoms in the transport protein played an important role as "substitutes" for the water molecules with which the potassium ion surrounds itself in a solution of water and from which it must free itself during entry to the channel. Only the Ion can pass, not it hydrated counterpart. In 1998 Roderick MacKinnon determined the first high-resolution structure of an ion channel and revealed for the first time how an ion channel functions at atomic level... it uses an ion filter, which admits potassium ions and stops sodium ions. His ability with X-ray crystallography made it possible to unravel how the ions passed through the channel. The ions could also be visualized in the crystal structure surrounded by water molecules just before they enter the ion filter; right in the filter, and when they meet the water on the other side of the filter.

OUTSIDE THE ION FILTER (upper fig.) Outside the cell membrane the ions are bound to water molecules with certain distances to the oxygen atoms of the water. INSIDE THE ION FILTER (lower fig.) For the potassium ions the distance to the oxygen atoms in the ion filter is the same as in water. The ion channel is able to strip the potassium ion of its water and allow it to pass at no cost in energy. The sodium ions, which are smaller, do not fit in between the oxygen atoms in the filter. This prevents them from entering the channel.

Cells must also be able to control the opening and closing of ion channels. MacKinnon has shown that this is achieved by a gate at the bottom of the channel which opened and closed a molecular sensor. This sensor is situated close to the gate. Certain sensors react to certain signals, e.g. an increase in the concentration of calcium ions [Ligand Gated Channel], an electric voltage over the cell membrane, [Voltage Gated Channel], or binding of a signal molecule of some kind [Stress Activated Gated Channel]. By evolving different molecular sensors to ion channels, nature has created ion channels that respond to a large number of different environmental signals. Passive Ion Carriers From NIH - Molecular Biology of the Cell: Many carrier proteins allow solutes to cross the membrane only passively ("downhill"), a process called passive transport, or facilitated diffusion. In the case of transport of a single uncharged molecule, it is simply the difference in its concentration on the two sides of the membrane (its concentration gradient) that drives passive transport and determines its direction. Ionophores are small hydrophobic molecules that dissolve in lipid bilayers and increase their permeability to specific inorganic ions. ... [They] operate by shielding the charge of the transported ion so that it can penetrate the hydrophobic interior of the lipid bilayer. Since ionophores are not coupled to energy sources, they permit the net movement of ions only down their electrochemical gradients. Valinomycin is an example of a mobile ion carrier. It is a ring-shaped polymer that transports K+ down its electrochemical gradient by picking up K+ on one side of the membrane, diffusing across the bilayer, and releasing K+ on the other side.

Similarly, FCCP, a mobile ion carrier that makes membranes selectively leaky to H+, is often used to dissipate the H+ electrochemical gradient across the mitochondrial inner membrane, thereby blocking mitochondrial ATP production. A23187 is yet another example of a mobile ion carrier, only it transports divalent cations such as Ca2+ and Mg2+. When cells are exposed to A23187, Ca2+ enters the cytosol from the extracellular fluid down a steep electrochemical gradient. Accordingly, this ionophore is widely used to increase the concentration of free Ca2+ in the cytosol, thereby mimicking certain cell-signaling mechanisms. (more...) Ion Pumps

From NobelPrize.org - The first Ion pump discovered (1997 Nobel Prize):Ion composition outside the cell differs from that inside. When e.g. a nerve is stimulated Na+ flows into the cell. The electrical potential arising across the membrane causes the nerve impulse to propagate itself along the nerve. The normal state is restored when Na+ has been pumped out and K+ pumped in. Jens Skou discovered Na+, K+-ATPase - an enzyme that maintains the balance of sodium (Na+) and potassium (K+) ions in cells. Within cells, the concentration of Na+ ions is lower, and that of K+ ions higher, than in the surrounding fluid. Na+, K+-ATPase and other ion pumps must work all the time in our body. If they were to stop, our cells would swell up, and might even burst, and we would rapidly lose consciousness. A great deal of energy is needed to drive ion pumps - in humans, about 1/3 of the ATP that the body produces.

When a signaling molecule binds to an ion channel on the outside of the cell, this triggers the change of the 3D conformation of the protein and the channel opens, allowing the ions to move in or out of the cell following their electrical gradients and thus altering the polarization of the cell membrane. Some ion channels respond to non-chemical stimuli in the same way, including changes in electrical charge or mechanical disturbance of the membrane.

G protein-linked receptors are seven-pass transmembrane proteins. This means that the polypeptide chain traverses the membrane seven times. When a chemical a hormone or a pharmaceutical agent binds to the receptor on the outside of the cell, this triggers a series of chemical reactions, including the movement and binding of the G-protein, transformation of GTP into GDP and activation of second messengers. Second messengers (e.g., cyclic AMP) start a cascade of enzymatic reactions leading to the cellular response. This signaling method is quite fast and, more importantly, it amplifies the signal. Binding of a single hormone molecule quickly results in thousands of molecules of second messengers acting on even more molecules of enzymes and so on. Thus, the response to a small stimulus can be very large. We will go into details of G-protein-mediated signaling when we tackle the endocrine and the sensory systems.

Fungsi Gerbang Ion Tunggal (Single Ion Channel) Dalam Sel

Setiap sel yang hidup akan dikelilingi oleh membran yang memisahkan dunia dalam sel dari dunia di luarnya. Pada membran ini, ada channel (gerbang) dimana sel saling berkomunikasi dengan sekitarnya. Channel ini terdiri dari satu molekul sederhana atau gabungan molekulmolekul kompleks dan channel ini memiliki kemampuan untuk membolehkan lewatnya atomatom yang memiliki muatan atau disebut juga dengan ion. Regulasi ion channel dipengaruhi oleh kehidupan dalam sel dan fungsinya dalam keadaan normal dan patologik. Nobel Prize di bidang Physiology atau Medicine tahun 1991 dianugerahkan kepada penemuan dari fungsi ion channel. 2 orang physiologist asal Jerman, Erwin Neher dan Bert Sakmann mengembangkan teknik yang memungkinkan kita mengetahui arus elektrik ion channel yang sangat kecil (sekitar satu picoampere - 10-12A) yang melewati satu ion channel. Teknik ini sangat unik dimana kita dapat memonitor bagaimana satu molekul ion channel merubah bentuknya dan bagaimana ion channel dapat mengontrol aliran arus dalam durasi sepersekian detik. Neher dan Sakmann secara detail mestabilkan teknik mereka dan menjelaskan bahwa ion channel itu ada dan mereka berfungsi. Mereka mendemonstrasikan apa yang terjadi selama pembukaan dan penutupan satu ion channel dengan diameter sekecil satu ion natrium atau ion klorida. Beberapa ion channel diregulasi oleh reseptor yang terlokalisasi pada satu bagian molekul channel yang selama aktivasi akan merubah bentuknya. Neher dan Sakmann menunjukkan bagian mana dari molekul yang menjadi sensor dan bagian dinding dalam channel. Mereka juga menunjukkan bagaimana channel meregulasi aliran ion positif dan negative. Pengetahuan yang baru ini dan cara analisis baru mereka tlah merevolusi biologi modern, memfasilitasi riset dan berkontribusi terhadap pemahaman mekanisme seluler yang menyebabkan penyakit seperti diabetes dan cystic fibrosis selama 10 tahun belakangan ini. Apa yang terjadi di dalam sel? Di dalam membran sel ada lingkungan yang sangat terorganisir, dimana banyak proses

biokimia kompleks terjadi. Interior sel berbeda dengan lingkungan luar sel dalam beberapa aspek penting. Contohnya, jumlah ion positif natrium dan potassium serta jumlah ion negative ion klorida sangat berbeda. Hal ini menyebabkan perbedaan potensial elektik membrane sel, menjadi sekitar 0.03 sampai 0.1 Volt. Hal ini biasa dikenal dengan nama membran potensial. Sel menggunakan membrane potensial dalam beberapa cara. Pembukaan channel ion natrium secara cepat, membrane potensial akan berubah drastic dalam 1/1000 detik. Sel dalam system saraf pusat akan berkomunikasi satu dengan yang lainnya menggunakan sinyal elektrik sekitar 1/10 volt yang akan menjalar dengan cepat selama proses penghantaran saraf. Ketika penjalaran mencapai titik kontak antar sinaps (kontak antara 2 sel), akan menyebabkan dilepaskannya substansi neurotransmitter. Substansi ini akan mempengaruhi reseptor dalam sel target, dengan dibukanya ion channel. Membran potensial kemudian dipengaruhi sehingga sel akan mengalami stimulasi atau inhibisi. Sistem saraf pusat terdiri dari sebuah rangkaian network yang masing-masing sel saraf akan terkoneksi oleh sinaps dengan fungsi yang berbeda. Penelusuran memori yang baru dalam otak adalah sebuah contoh dari perubahan jumlah ion channel yang ada dalam sinaps di sebuah network. Semua sel berfungsi dalam mekanisme yang sama. Faktanya, kehidupan itu sendiri dimulai dari adanya muatan di membrane potensial. Ketika sperma melebur dengan sel telur pada saat yang sama ion channel akan teraktivasi. Perubahan rata-rata membran potensial akan mencegah akses masuknya sperma yang lain ke dalam sel telur. Semua sel entah itu sel saraf, sel kelenjar, sel darah dan sel-sel yang lainnya memiliki satu karakteristik yang menyebabkan sel tersebut memiliki satu fungsi spesifik. Ion channel terdiri dari molekul tunggal atau kompleks yang membentuk dinding channel (berupa pori) yang membolehkan komunikasi antara interior dan eksterior sel. (gambar 1B dan 1D). Diameter pori sangat kecil sehingga sensitive terhadap satu ion (ukuran sekitar 0.5-0.6 milyar/milimeter). Perubahan yang cepat dalam bentuk molekul menyebabkan pembukaan atau penutupan ion channel. Ini terjadi selama aktivasi reseptor (gambar 1D) oleh sebuah sinyal spesifik dari substrat molekul tunggal. Sehingga satu bagian spesifik dari molekul yang membuat perubahan membrane potesial dapat membuka atau menutup ion channel.

Gambar 1. Pengamatan aliran arus melalui ion channel tunggal menggunakan teknik recording oleh Neher dan Sakmann. A Skema yang menunjukkan bagaimana sebuah gelas mikropipet didekatkan dengan sel. B, menggunakan magnifikasi lensa yang tinggi, bagian dari membran sel dengan ion channel didekatkan dengan ujung pipet. Bagian dalam pipet akan terkoneksi pada pengukur arus elektronik C menunjukkan sebuah channel dalam magnifikasi yang besar dengan reseptor akan berhadapan dengan bagian luar sel dan saringan ion D menunjukkan

bahwa arus melewati ion channel ketika ia terbuka. Neher dan Sakmann merekam arus elektrik yang melewati ion channel tunggal Telah diketahui sejak lama adanya pertukaran ion yang cepat melalui membrane sel, tetapi Neher dan Sakmann adalah orang pertama yang menunjukkan bahwa ion channel spesifik faktanya eksis. Untuk mengelusidasi bagaimana ion channel beroperasi, sangat penting untuk merekam bagaimana aktivitas pembukaan channel saat membuka dan menutup. Hal ini sangat sulit karena arus ion melalui ion channel tunggal sangat-sangat kecil. Tambahan lagi, molekul ion channel yang sangat kecil ini berjejer di membrane sel. Neher dan Sakmann sukses dalam mengatasi kesulitan ini. Mereka mengembangkan sebuah mikropipet gelas (berdiameter 1/1000 mm) sebagai recording electrode. Ketika electrode tersebut kontak dengan membrane sel, ia akan membentuk segel yang kuat mengunci perifer mulut pipet (gambar 1A, B). Sebagai konsekuensinya, pertukaran ion antara pipet bagian dalam dengan bagian luar dapat terjadi hanya melalui ion channel di membran yang tersegel (gambar 1B). Ketika ion channel tunggal membuka, ion akan bergerak melalui channel sebagai arus elektrik. Dengan peralatan elektronik dan kondisi eksperimen yang ada, mereka sukses mengukur arus mikroskopik ini. (gambar 1C). Bagaimana ion channel beroperasi? Ion channel memiliki tipe-tipe yang berbeda. Beberapa hanya membolehkan arus yang bermuatan positif seperti natrium, sodium atau ion kalsium. Ion channel yang lain hanya membolehkan arus yang bermuatan negative seperti ion klorida. Neher dan Sakmann menemukan bagaimana spesifikasi ini. Satu sebab perbedaan ini ialah diameter ion channel yang akan menyaring diameter ion yang tertentu. Dalam satu kelompok ion channel, ada juga 2 cincin asam amino yang bermuatan positif dan negatif. Mereka membentuk saringan ionik (gambar 1D), yang hanya membolehkan ion dengan muatan berbeda yang dapat melewati saringan. Sakmann & Neher mengelusidasi bagaimana perbedaan bagian molekul ion channel beroperasi. Penemuan ini telah secara radikal merubah visi kita dalam fungsi sebuah sel sampai ke buku text pelajaran sel biologi. Metode ini digunakan oleh ribuan peneliti di seluruh dunia saat ini. Regulasi fungsi Ion Channel Neher dan Sakmann juga menggunakan pipet electrode untuk menginjeksi substrat yang berbeda ke dalam sel, dan mereka kemudian dapat mengivestigasi perbedaan langkah dalam proses pelepasan substrat dalam sel itu sendiri. Dengan cara ini, sejumlah mekanisme pelepasan seluler telah diklarifikasi seperti organisasi cyclic AMP (lihat Nobel Prize to Sutherland 1971) atau ion kalsium. Sebagai contoh, sekarang kita mendapatkan pemahaman yang berbeda tentang bagaimana level hormone dalam darah di regulasi pada level tertentu. Mekanisme basal yang melandasi sekresi insulin telah teridentifikasi. Kadar glukosa darah normal akan mengontrol kadar glukosa dengan sel yang membentuk insulin, sehingga akan meregulasi kadar energi yang kaya akan ATP. ATP beraksi secara langsung dalam tipe tertentu dari ion channel yang akan mengontrol membran potensial elektrik dalam sel. Perubahan membran potential kemudian secara tidak langsung akan mempengaruhi ion channel yang lainnya sehingga akan membolehkan aliran ion melewati sel. Ion kalsium akan merangsang sekresi insulin. Pada diabetes, sekresi insulin terbatas atau tidak ada sama sekali. Obat tertentu

yang digunakan untuk menstimulasi sekresi insulin dalam diabetes akan secara langsung mengontrol ATP yang mengontrol ion channel. Penyakit lainnya tergantung seluruhnya atau sebagian pada regulasi defek dari ion channel dan jumlah obat yang beraksi langsung pada ion channel. Banyak mekanisme patologis yang telah diklarifikasi seperti misalnya cystic fibrosis (ion channels klorida), epilepsy (ion channels natrium dan potasium), beberapa penyakit kardiovaskuler (ion channel kalsium), dan penyakitpenyakit neuromuscular seperti Lambert-Eatons (ion channel kalsium). Dengan bantuan teknik Neher dan Sakmann dimungkinkan untuk merancang obat yang dapat mencapai efek optimal pada ion channel tertentu yang memberikan efek penting pada penyakit tertentu. Obat yang melawan keresahan (anti anxiety) bekerja pada inhibitory ionic channel pada otak. Alkohol, nikotin dan racun lainnya juga demikian.