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10/28/2013

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LAMMPS
インストールメモ
on Mac OS X
LAMMPS
は分子動力学のシミュレータです。手間は掛かりますが、
Mac OS X
にもインストールできます。関連キーワード:
http://www.kanshin.com/keyword/2323948[
関心空間
- hoomd (Highly Optimized Object-oriented Many-particle Dynamics -- Blue Edition)]http://lammps.sandia.gov/[LAMMPS Molecular Dynamics Simulator]lamp: a device that generates light, heat, or therapeutic radiation; something that illumines the mindor soul -- www.dictionary.comThis is the home page for the classical molecular dynamics code LAMMPS, an acronym for Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator. The current version of LAMMPS is 15 Jan2010.###LAMMPS
Mac OS X
でのインストール
(Snow Leopard)##GPU
の組み込みはしません。
##2011-Jan15
版の
lammps
のソースコードを
make
した。
(2011-01-15)(1) OS
OS X 10.6.3, MacBook LATE2009
を使用
(2) Xcode
はバージョン
3.2.5
をインストール
(3) gfortran
hpc.sf.net
から入手
http://hpc.sourceforge.net/
gfortran-snwleo-intel-bin.tar.gz
インストール
(A) gunzip gfortran-snwleo-intel-bin.tar.gz(B) sudo tar -xf gfortran-snwleo-intel-bin.tar -C /(4) git
http://code.google.com/p/git-osx-installer/
から入手してインストール
(5) lammps
を入手適当なディレクトリで
git clone http://git.icms.temple.edu/lammps-ro.git mylammps(http://lammps.sandia.gov/download.html
参照
)mylammps
以下に最新版が展開される。
(6) OpenMPI
をインストール
http://www.open-mpi.org/software/ompi/v1.4/
適当なディレクトリで展開して
./configuremake allmake check sudo make install(7) FFTW
のインストール

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