UNIVERSIDAD MAYOR MEDICINA VETERINARIA

APUNTES CURSO DE GENTICA DR. CARLOS ALVEAR S. Mdico Veterinario- Dr. Cs. Agr.

IMPORTANCIA DE LA GENTICA ACTUAL EN LAS DIFERENTES APLICACIONES EN MEDICINA VETERINARIA. INTRODUCCIN La gentica es una ciencia muy activa y de gran desarrollo, por ende su estudio requiere actualmente de una alta especializacin. La base de esta ciencia esta determinada por los genes, por lo tanto la gentica puede definirse como el estudio de los genes a travs de su variacin y segn el objetivo de su estudio existen diferentes reas cientficas de anlisis y desarrollo. En 1906 William Batenson defini gentica como la ciencia que se ocupa de la herencia y la variacin, para descubrir las leyes que gobiernan la presentacin de similitudes y diferencias en los individuos con relacin a sus progenitores. Otro gran aporte de la gentica, es la ciencia que ha unificado las ciencias biolgicas. Adems, la variacin gnica contribuye a la variacin natural. Las caractersticas de un ser vivo estn determinadas por la interaccin del conjunto nico de sus genes con su medio ambiente singular. PRINCIPIOS BSICOS DE LA GENTICA En general los estudiantes siempre se preguntan: Por qu estudiar gentica?. Hay dos motivos fundamentales. En primer lugar, la gentica ocupa hoy da una posicin central en todo el tema de la biologa; el conocimiento de la gentica resulta indispensable para cualquier estudioso serio de animales, plantas, o de la vida microbiana. En segundo lugar, la gentica se ha convertido, en mayor grado que ninguna otra ciencia, en referencia bsica para numerosos asuntos humanos. Atae a nuestra sociedad por muy variadas razones. En realidad, nuestra vida se ve afectada casi a diario por temas genticos, y ninguna persona culta puede permitirse ignorar estos descubrimientos. Comencemos echando una mirada panormica a la ciencia de la gentica, mostrando por qu ha llegado a ocupar una posicin tan destacada. Ante todo, debemos definir la gentica. Algunos la definen como el estudio de la herencia, pero los fenmenos hereditarios han interesado a la humanidad desde el nacimiento de la civilizacin. Mucho antes de que la biologa o la gentica existieran como las disciplinas cientficas que hoy conocemos, los pueblos primitivos mejoraban plantas cosechables y domesticaban animales, seleccionando como progenitores a los individuos de caractersticas ms deseables. Tambin debieron sentirse sorprendidos por la herencia de los rasgos humanos y hacerse preguntas tales como por qu los hijos se parecen a sus padres? o por qu determinadas enfermedades afectan ms a algunas familias?. Pero no podemos considerar a esas personas como genetistas. La gentica, como conjunto de principios y mtodos de anlisis, no se inici hasta la dcada de 1860, cuando un monje agustino llamado Gregorio Mendel realiz una serie de experimentos que indicaban la existencia de unos elementos biolgicos llamados

genes. La palabra gentica viene de "genes", y stos son el objeto central del tema. Se realicen estudios a nivel molecular, celular, de organismo, familiar, de poblaciones, o evolutivo, la materia central de los genetistas la constituyen los genes. Dicho simplemente, la gentica se ocupa de cuanto concierne a los genes. La gentica y los asuntos humanos La gentica atae de forma especial a los asuntos humanos. Es importante, no slo en el sentido en que lo son otras disciplinas, sino en cuanto tiene mucho que decir sobre la propia naturaleza humana y, en este sentido, ocupa un lugar especial entre las ciencias biolgicas. La ciencia moderna se sustenta en la gentica. Observe sus ropas. El algodn de su camisa y pantalones procede de plantas diferentes de sus ancestros naturales, porque han pasado en la utilizacin metdica de principios genticos bsicos. Eso mismo puede decirse de las ovejas que producen la lana de su chaleco o su abrigo. Piense ahora en su ltima comida. Puede estar seguro que el arroz, el trigo, el pollo, la carne de bovino, porcino y el resto de los organismos vivos que alimentan al planeta, han sido expresamente manipulados mediante aplicacin de tcnicas genticas bsicas. La llamada Revolucin Verde, que permiti incrementar dramticamente el rendimiento de las cosechas a escala mundial, es la historia del xito gentico en la obtencin de variedades altamente productivas de algunas de las especies de cultivo ms extendido. Para optimizar la produccin de su cosecha, el agricultor debe plantar un rea extensa con el mismo tipo gentico de semillas, prctica conocida como monocultivo. Ya que las cosechas son atacadas por organismos patgenos y depredadores, las variedades a cultivar son protegidas mediante la introduccin de genes que las hacen resistentes. Pero la proteccin es slo temporal. En las poblaciones de patgenos ocurren continuamente cambios genticos que, en ocasiones, acaban dando lugar a propiedades patognicas nuevas. Ello mantiene a los monocultivos en peligro permanente. De ah que los mejoradores deban estar siempre por delante de los patgenos, previniendo la extensin epidmica de enfermedades vegetales, o exterminios masivos, cuyos efectos sobre el suministro de alimentos pueden ser devastadores. Bacterias y hongos han sido tambin mejorados genticamente para servir a ciertas necesidades. Las levaduras constituyen un ejemplo claro; forman la base de compaas multimillonarias de productos de panadera, bebidas alcohlicas, o alcohol para combustin. Los hongos producen el antibitico penicilina, la ciclosporina, droga inmunodepresora que frena el rechazo de rganos trasplantados, y un amplio espectro de otros productos de importancia industrial, como el cido ctrico o la amilasa. Las bacterias proveen a la industria mdica de antibiticos como la estreptomicina. La mayora de las compaias que emplean bacterias y hongos se han beneficiado de la aplicacin de los postulados de la gentica clsica, pero hemos entrado ya en una era nueva, en la que las tcnicas de gentica molecular permiten a los cientficos construir cepas

microbianas completamente nuevas, creadas en tubos de ensayo y diseadas especialmente para satisfacer alguna necesidad humana. Mediante dichos procesos, podemos disponer ahora, por ejemplo de cepas bacterianas que producen sustancias de mamferos, como la insulina para el tratamiento de la diabetes, o la hormona del crecimiento para el tratamiento del enanismo pituitario. La insulina producida por ingeniera gentica es genuinamente humana, a diferencia de los preparados previos obtenidos de vacas y cerdos. Algunas sustancias producidas por ingeniera gentica son extremadamente difciles de obtener de otras fuentes; por ejemplo, obtener la hormona de crecimiento necesaria para el tratamiento de un nio durante un ao, requera anteriormente las glndulas pituitarias de 75 cadveres humanos. Adems, la ingeniera gentica se est utilizando para obtener cepas especiales de bacterias y hongos que producen mayores cantidades de sustancias beneficiosas que ya producan de forma natural. En sus comienzos, la ingeniera gentica molecular se aplicaba slo a microorganismos, pero las mismas tcnicas se aplican ahora a plantas y animales. Obtenindose variedades que no habran podido obtenerse nunca con la gentica clsica. La aplicacin, en sus diversas formas, de la ingeniera gentica recibe el nombre general de biotecnologa. Se estima que la industria biotecnolgica basada en la gentica se convertir en una de las actividades econmicas ms productivas de las prximas dcadas. Sea ello cierto o no, la biotecnologa forma ya parte del cuerno gentico de la abundancia que mantiene a la poblacin humana de este planeta en su alto nmero actual de habitantes y su considerable grado de bienestar social. La gentica resulta esencial para la medicina. Una buena proporcin de los problemas de salud humana tienen una causa gentica. Se estima, por ejemplo, que al menos el 30% de las admisiones hospitalarias peditricas tienen un componente gentico. Se trata seguramente de una estimacin a la baja, ya que investigaciones recientes estn descubriendo ms y ms predisposiciones genticas tanto para enfermedades graves como para otras menos serias. Las alteraciones genticas de la salud pueden dividirse en tres grupos principales. El primer grupo es el de las enfermedades hereditarias, como la fibrosis cstica, la fenilcetonuria, o la distrofia muscular, debidas a genes anormales que se trasmiten de una generacin a la siguiente. El segundo grupo es el de las enfermedades genticas somticas que se deben a la aparicin repentina de una forma anormal de un gen en una parte del cuerpo. El cncer es el ejemplo ms significativo de este tipo de enfermedades. Es poco conocido que el cncer, que de alguna manera afecta todas nuestras vidas, es una enfermedad gentica. Aunque algunos cambios somticos no se trasmiten a la siguiente generacin, varias formas predispocisin al cncer se heredan como los genes anormales. El tercer grupo es el de las aberraciones cromosmicas, tales como el sindrome de Down o el del "grito del gato". Sus causas son anomalas heredadas en la estructura o el nmero de cromosomas.

La raz de un gran nmero de enfermedades est en los genes, pero la gentica puede aliviar en muchos casos su sufrimiento. Ya se utilizan sondas genticas moleculares para detectar la presencia de genes defectuosos en los padres. Adems, los propios genes defectuosos se estn aislando y caracterizando mediante tcnicas de gentica molecular. Recientemente, por ejemplo, se aisl y estudi el DNA del gen que provoca la enfermedad. Una vez conocida la enfermedad, podran concebirse nuevas estrategas teraputicas. En ltima instancia, existe la esperanza de que pueda aplicarse una terapia gentica directa a muchas enfermedades hereditarias. Esta terapia consiste en incorporar una copia del gen normal en las clulas portadoras de la correspondiente copia defectuosa, de manera que el funcionamiento normal del gen incorporado compense el funcionamiento anormal del gen defectuoso. Los gentistas se ocupan tambin de estudiar el virus de la inmunodeficiencia humana (VIH), responsable del sndrome de inmunodeficiencia adquirida (SIDA). Como parte natural de su mecanismo de reproduccin, los virus como el VIH insertan copias de material gentico en los cromosomas de los individuos infectados. Por tanto, sta es tambin, en cierto modo, una enfermedad gentica, y el conocimiento de cmo tales genes virales se integran y se ponen en marcha es un paso importante en la lucha contra las enfermedades causadas por estos virus. Reconociendo la importancia de la gentica humana sus estudios cuentan con importantes apoyos econmicos para la investigacin, como se puede observar que muchos millones de dlares lo invierte la sociedad en un slo proyecto, como lo ha demostrado en el estudio del genoma humano, cuya inversin es de alrededor de tres mil millones de dlares. Obviamente los beneficios para la medicina son inmensos, ya que permite conocer cada una de las regiones del cromosoma. Quizs un buen ejemplo de cmo influye la gentica en nuestra visin del mundo proviene de los trabajos genticos, citogenticos y moleculares que ponen de manifiesto nuestra relacin no slo con los monos y otros mamferos, sino, para mayor sorpresa, con todos los dems seres vivos del planeta, incluidas las plantas, los hongos y las bacterias. Todos los seres vivos comparten el mismo sistema para almacenar y expresar informacin, y muestran homologas en muchas estructuras, incluidos los propios genes. La existencia de un espectro continuo de relaciones dentro del mundo viviente es una nocin intelectual de enorme trascendencia, que nos une indisolublemente a los dems organismos. Esta nocin afecta radicalmente a nuestra concepcin del mundo. Conduce a una visin de la humanidad, no como el pinculo o el centro de la creacin, sino como una forma de vida igual a las dems. Ciertamente, esto nos lleva a los dominios de la filosofa y de la religin pero sta es precisamente la cuestin: la gentica nos obliga a consideraciones que ponen a prueba la visin que tenemos de nosotros mismos. Determinacin gentica

De nuestro breve repaso a la accin gentica, podemos concluir que los seres vivos movilizan los compuestos qumicos del mundo que les rodea y los transforman en su propia materia viva. Una bellota se convierte en una encina, empleando en ello slo agua, oxgeno, dixido de carbono, algunos compuestos inorgnicos del suelo y energa luminosa. Existen especies naturales, principalmente vegetales (tipo de semillas) que producen dos formas heredables, ambas, perfectamente normales. La decisiva influencia de los genes se manifiesta quizs con mayor frecuencia en diferencias en las que una de las formas es normal y la otra anormal. Un ejemplo apropiado es la anemia falciforme, enfermedad hereditaria humana. La causa subyacente de la enfermedad es una alteracin de la hemoglobina, la protena transportadora de oxgeno de los glbulos rojos. Las personas normales poseen un tipo de hemoglobina llamada hemoglobina A, cuya informacin est cifrada en un gen. Un cambio molecular minsculo en el DNA de este gen tiene como consecuencia la aparicin de una hemoglobina ligeramente alterada, llamada hemoglobina S. Para las personas que poseen slo hemoglobina S, el desenlace final de este pequeo cambio es una grave enfermedad y, normalmente, el fallecimiento. El gen produce su impacto en el organismo mediante un complejo efecto cascada, generando: destruccin rpida de glbulos rojos lo que determina anemia, debilidad fsica, deterioro mental, finalmente; adems de problemas circulatorios sumados a la destruccin rpida de glbulos rojos pueden determinar fallo cardaco, adems producir daos cerebrales lo que terminan a veces en parlisis; incluso se describen daos en otros rganos los que terminaran produciendo neumona, reumatismo y fallo heptico. Observaciones como stas nos llevan a un modelo de interaccin entre genes y medio ambiente. En algunos modelos los genes actuan como instrucciones para transformar sustancias ms o menos indiferenciadas del medio ambiente en un organismo especfico, del mismo modo, que un plano determina de que forma ser levantada una casa a partir de materiales bsicos de construccin. Segn cada plano particular, los ladrillos, hormign, madera y clavos servirn para construir una casa de tejado en punta o tejado normal. Tal modelo implica que los elementos decisivos en la determinacin de los organismos son realmente los genes: el medio ambiente aporta simplemente las materias primas. Determinacin por el medio ambiente Si analizamos a dos gemelas monocigticas (idnticas), originadas ambas de un solo vulo fecundado que se dividi y dio lugar a dos individuos completos, con idnticos genes. Suponga que las gemelas nacen en Inglaterra, pero son separadas al nacer y enviadas a pases distintos. Si una es criada en China, por padres adoptivos que hablan chino, hablar chino, mientras que su hermana, criada en Budapest, hablar hngaro. Cada una aprender las costumbres y valores culturales de su medio. Aunque iniciaron su vida con

idnticas propiedades genticas, los distintos ambientes culturales en los que viven generarn diferencias entre las hermanas (y entre ellas y sus padres biolgicos). En este caso, las diferencias se deben obviamente al medio ambiente y los efectos genticos tienen escasa importancia en su determinacin. Por supuesto, en general tratamos con organismos que difieren tanto en sus genes como en su medio ambiente. Si queremos predecir en qu forma se desarrollar un ser vivo, debemos conocer primero la constitucin gentica que hereda de sus padres. Luego, debemos conocer la sucesin histrica de ambientes a los que el organismo en desarrollo ha estado expuesto. Desde que nace hasta que muere, cada ser vivo tiene su propia historia de desarrollo. Que ser de un organismo en el momento siguiente depende crticamente tanto de su condicin actual como del ambiente que encuentre en ese momento siguiente. Por otro lado, mire las gemelas: ningn dato sobre el conjunto de genes que han heredado nos permitir predecir qu idioma y estilo cultural acabarn manifestando. Dos individuos genticamente diferentes se desarrollan de distinta forma en un mismo medio, pero dos individuos genticamente idnticos pueden desarrollarse tambin de distinta forma en ambientes diferentes. Por lo tanto, conforme un organismo va pasando, mediante el desarrollo, de un estado a otro de su vida, sus genes interaccionan con su medio ambiente en cada momento de su historia vital. Es esta interaccin entre genes y medio ambiente la que determinar que son realmente los organismos. Nuestra discusin sobre cmo interaccionan los genes y el medio ambiente nos ha llevado a un punto en el que podemos apreciar la validez de un modelo ms general, segn el cual genes y medio ambiente determinan conjuntamente (a travs de ciertas reglas de desarrollo) las caractersticas reales de los organismos. La expresin gen, deriva del latn generare (procrear) y significa unidad de procreacin, era desconocida incluso por Mendel, ya que recin introducida por Johansen (1909). Qu es un gen? Un gen es un trozo de una molcula en forma de cinta llamada cido desoxirribonucleico, abreviado DNA. El DNA, es el material hereditario que pasa de una generacin a la siguiente, dicta las propiedades inherentes a cada especie. Cada clula de un organismo posee una o dos copias de la dotacin bsica de DNA, llamada genoma. El propio genoma est formado por una o ms molculas extraordinariamente largas de DNA, llamadas cromosomas. Los genes son las partes funcionales del DNA y son, simplemente, tramos activos ordenados a lo largo de los cromosomas. El nmero de cromosomas de los organismos complejos es generalmente del orden de unas decenas, mientras que el nmero de genes alcanza el orden de algunas decenas de millar. Provistos de estas definiciones de gentica y gen, avancemos un paso y veamos cmo el conocimiento sobre estos temas ha llegado a ser de tanta

trascendencia. Los genes son arreglos lineales de secuencias nucleotidicas generando incluso molculas grandes y complejas de DNA, las que dirigen los increbles y complicados procesos de vida de cada organismo. Sin embargo, a pesar de la complejidad, una elegante simplicidad caracteriza a la estructura del DNA, compuesto de 4 unidades de nucletidos en arreglos lineales de gran longitud. Los nucletidos difieren entre si segn la base que ellos contengan: A (adenina), T (timina), G (guanina) o C (citocina). Ellos podran potencialmente formar un sinnmero de combinaciones pero las secuencias no estn compuestas al azar. Las secuencias nucleotidicas son el cdigo de la Gentica. Destacando que inicialmente fue el monje austraco Gregorio Mendel el ao 1866 quin describe claramente, por primera vez, los principios de la Gentica basando su trabajo con arvejas. Generando con ello los principios genticos "mendelianos" que se aplican tanto a la herencia de caractersticas en animales como en plantas. Obviamente, adems determin la importancia fundamental en reconocer la influencia ambiental sobre esas caractersticas. El objetivo, por lo tanto, es entender cmo se heredan las caractersticas y cules son heredadas. Los genes no se pueden ver, ni siquiera con la ayuda de un microscopio, no siendo necesario observar a un gen para predecir el resultado de un determinado cruzamiento. Mendel nunca vio un gen, ni siquiera se lo imagin, sin embargo, l fue capaz de describir los principios bsicos de la Gentica, ya que los genes se reconocen principalmente por sus efectos. Determinndose as que los genes son las unidades de la herencia. En resumen las leyes de Mendel son: 1ra. Ley asociado a segregacin igualitaria, donde los gametos de un individuo provienen de la mitad de un padre y la otra mitad de otro padre, esta observacin la realiz verificando las proporciones matemticas precisas en las generaciones filiales derivadas de dos individuos parentales genticamente diferentes. 2da Ley, durante la formacin de los gametos, la segregacin de los alelos de un gen se produce de forma independiente de la segregacin de los alelos de otro gen, estableci por lo tanto Mendel las reglas bsicas del anlisis gentico, ya que su trabajo permiti inferir la existencia y naturaleza de las unidades hereditarias discretas y de ciertos mecanismos, sin llegar a observar los genes nunca. El anlisis de frecuencias fenotpicas entre los descendientes de cruzamientos controlados forma parte todava del abordaje experimental empleado en gran parte de la gentica moderna. Mendel realiz sus experimentos con leguminosas del gnero Pisum (Pisum sativum = guisantes, arvejas), por poseer las cualidades requeridas: tienen caracteres constantes y fciles de reconocer con seguridad, y la descendencia de sus hbridos es totalmente frtil. Garantizando que no ocurra contaminacin con polen extrao, ya que los rganos fertilizadores se encuentran protejidos y envueltos dentro de la quilla y las anteras estallan dentro del capullo, con lo que el estigma queda cubierto de polen antes que se abra la flor, siendo tambin plantas de fcil cultivo, crecen en el suelo y en vasijas y su perodo de crecimiento es ms o menos corto. La fecundacin artificial realizada por Mendel es un proceso laborioso pero siempre exitoso. Analizando los resultados en generaciones sucesivas en tiempo relativamente corto (anual).

Las caractersticas estudiadas por Mendel fueron principalmente: forma de la semilla (lisas o rugosas), color de la semilla (amarillas o verdes), color de la flor (rojas o blancas), forma de la vaina (hinchadas o rugosas), color de la vaina (verdes o amarillas), posicin de las flores (axiales o terminales) y adems del la longitud del tallo (largos o cortos). Los primeros resultados publicados por Mendel (1ra ley) en la F2, despus de cruzas la descendencia F1 de las lneas puras entre si, es decir cruzar slo hbridos para cada carcter entre si mismos, se entregan en la Tabla 1. TABLA 1. guisantes. CARTER Resultados en la generacin F2 en los experimentos con DOMINANTE 5474 lisas 6022 amarillas 705 rojas 882 hinchadas 428 verdes 651 axiales 787 largos RECESIVO PROPORCIN de DOMINANTES a RECESIVOS 1850 rugosas 2,96:1 2001 verdes 3,01:1 224 blancas 3,15:1 299 rugosas 2,95:1 152 amarillas 2,81:1 207 terminales 3,14:1 277 cortos 2,84:1

Forma de la Semilla Color de la semilla Color de la Flor Forma de la vaina Color de la Vaina Posicin de las Flores Longitud del tallo

Al observar todos los resultados se determin una proporcin promedio de 2,98 a 1, es decir, de 3 a 1, la cruzar los hbridos entre si. Postulando Mendel a la luz de estos experimentos que las distintas caractersticas de las plantas se deban a la existencia de unidades o factores, que ahora se denominan genes. Los genes son traspasados de padres a hijos sin grandes modificaciones a travs de las generaciones, sin embargo, sabemos que los hijos no siempre se parecen a sus padres, ya que en cada generacin se generan nuevas combinaciones de genes que hacen diferente a la descendencia comparada con sus respectivos padres. Muchos productores conociendo el beneficio de determinadas combinaciones ya sea en forma indirecta o formal la utilizan en su rebao, con ello podran obtener como objetivo aumentar las semejanzas genticas en su rebao ya que la generacin de nuevas combinaciones podran significarle no alcanzar sus objetivos productivos y de rentabilidad. Por otra parte si los animales de un productor no cumplen con sus objetivos de productividad, este buscar determinadas combinaciones con individuos que demuestran ser superiores a sus padres.

Estas combinaciones gnicas se explican mediante la estructura fsica del DNA que corresponde a una doble hlice, componente fundamental de la Gentica descrito por primera vez por los autores James Watson y Francis Crick en 1962, por lo cual recibieron el premio Nobel. La doble hlice est compuesta de bandas complementarias donde la Adenina tiene una base complementaria de Timina y por cada Citocina hay una Guanina en la otra hebra. Las estructuras helicoidales permiten fases alternativas de extensin y condensacin del DNA, zonas muy importantes en la actividad gnica y en la divisin celular. El cdigo es traspasado a cada nueva clula a travs de un mecanismo que usa cada banda como un espejo para generar la banda complementaria. De esta manera cuando la clula se divide cada producto recibe una copia exacta del cdigo. Algunos genes son unidades de informacin para produccin de protenas, en este caso el cdigo es ledo solo de una banda de la doble hlice de DNA. Esta orden codifica informacin para unir aminocidos en una protena. Las protenas son sustancias que controlan diferentes etapas del desarrollo, adems las protenas determinan formas, estructuras y proporcionan informacin para mantener las funciones vitales. Sin embargo, pueden ocurrir situaciones extremadamente raras como es un cambio en la secuencia del DNA (mutacin) que puede alterar la estructura de la protena, incluso tambin podra determinar que no se sintetise esa protena, causando muerte embrionario temprana o una enfermedad hereditaria. Cuando estos cambios en el DNA resultan en consecuencias no visibles para el animal, estamos en presencia de mutaciones silentes. Obviamente como ya fue descrito, todas las clulas animales contienen los mismos genes pero hay genes especficos en cada clula que necesitan ser "activados" y otros "desactivados". Es as que, los genes que controlan la produccin sea son desactivados en el hgado, pero son activados en las lminas de crecimiento seo. Menos del 10% del DNA humano est en exones, regiones que codifican para los productos proticos. Una funcin del resto, los instrones, parecen controlar el comportamiento de los genes. En el material gentico existen secuencias repetidas de unidades de nucleotidos, cuya funcin es, hasta el momento, desconocida, se denominan por minisatlites. Los cuales se utilizan en los procesos de identificacin "fingerprints". Simples repeticiones de nucleotidos denominados microsatlites o STRs "short tandem repeats", por ej: CACACACA son claramente diferentes de regiones que codfican para protenas, para las cuales una secuencia larga y nica se encuentra en las bandas de DNA. Con la riqueza de la variacin hereditaria que debe ser estudiada con nuevas tecnologas emergentes de DNA, STRs han demostrado ser armas efectivas para estudios de parentesco y mapeo gnico. Siendo la informacin gentica de los animales muy similar a la del hombre. Los animales se beneficiaran indirectamente del Proyecto Genoma Humano (HUGO), que se propone definir las secuencias de DNA de

aproximadamente 3.000 millones de nucleotidos del genoma humano. Porqu es importante conocer las secuencias gnicas de los animales?. La informacin del genoma puede conducir a nuevas posibilidades para entender, diagnosticar y predecir caractersticas genricas. Herencia cromosmica Los genes ubicados en los cromosomas que forman parte principalmente del ncleo de todas las clulas del organismo. Como se ha explicado anteriormente el DNA se encuentra empaquetado en el nmero de cromosomas de cada especie animal. Sabemos que los cromosomas se pueden ver con la ayuda de un microscopio y colorantes que se unen al DNA. La informacin gentica de todos los animales de una misma especie son muy similares y no es sorprendente que animales de diferentes razas tengan el mismo nmero, tamao y forma de los cromosomas. Las cruzas entre razas muy diferentes en apariencia producen descendencia frtil evidenciando la similitud gentica de las razas. Si se obtienen fotografas de gran tamao de cromosomas teidos de una clula y se reordenan, por forma y pares a esta tecnologa se le conoce con el nombre del cariotipo. En la Tabla 2, se entrega una descripcin de los cariotipos de diferentes especies animales. El nmero diploide de los cromosomas (2n) presenta una gran variabilidad entre las especies de plantas y animales. Encontrndose el nmero mnimo de 2n = 2 (un par de cromosomas) en una especie de gusano plano, parsito de los equidos (Parascaris equorum) y el ms grande 2n = 1270, en una especie de helecho (Orphioglossum reticulatum). En los mamferos no placentados (marsupiales) los nmeros ms frecuentes son 2n = 14 y 2n = 28. En los mamferos placentados, se observa una distribucin tipo curva normal, siendo lo ms frecuente 2n = 38, 42 y 48, los menores 2n = 6 y 7 para hembras y machos de una especie de ciervo enano (Muntiacus muntjiac) y el mayor 2n = 102, encontrado en una especie de roedor sudamericano (Timpanoctomys barrerac). Herencia extracromosmica Hasta el momento, slo se ha tratado la herencia transmitida por los cromosomas. Aunque sta es muy importante, hay evidencia tambin de algunos tipos extracromosmicos de herencia. En un principio, se sospech que muchos caracteres se heredaban de manera extracromosmica, pero despus de estudiarlos se encontr que en muchos casos tenan bases cromosmicas, uno de estos era caracteres ligados al sexo. En algunas ocasiones el comportamiento hereditario aberrante, como el de la direccin de enrrollamiento de los caracoles, es en realidad cromosmico, ya que se debe a que los genes maternos determinan la apariencia del individuo, ms que los de l mismo

TABLA 2. Descripcin resumida de los cariotipos de algunos mamferos y aves. Pares Autosomales Especie N Diploides (2n=) 38 78 38 60 54 60 64 32 66 62 63 74 40 44 64 38 58 82 80 78 32 (16) MetaCnt. Acrocent. o telocent. 2 38 6 29 23 29 18 Cromosomas Sexuales X Y

Felino, Felis catus Canino, Canis familiarus Cerdo, Sus scrofa Caprino, Capra bircus Ovino, Ovis aries Bovino, Bos taurus Equino, Equus caballus Cebra, Equus cebra Caballo Mongol, Equus prezewal Asno, Equus asinus Mula, Equus mulus Alpaca, Lama pacos Ratn, Mus musculus Conejo, Oryctolagus cunicola Coballo, Cavia cobaya Zorro, Vulpus fulva Loro, Melopsittacus u. Pavo, Meleagridis gallo Pato, Anas platy Domesticus Gallina, Gallus gallus Abeja, Apis mellifera M = Metacntrico; A = Acrocntrico

16 0 12 0 3 0 13

M M M A A M M

M A M M M M A

16

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Sin embargo, hay ciertos casos de herencia cromosmica, el ms conocido es el de los plstidos en las plantas, que son corpsculos celulares relacionados con la fotosntesis. El material hereditario cromosmico controla muchas caractersticas de los plstidos; pero en algunos casos, como en las plantas jaspeadas y que tienen hojas con gran variedad de colores, la herencia al parecer se debe a factores transmitidos por el citoplasma materno. Las mitocondrias son otro tipo de organelos citoplsmicos de plantas y animales que llevan a cabo funciones metablicas esenciales para la supervivencia. Tanto los

plstidos como las mitocondrias son partculas autorreplicables y tienen una pequea cantidad de DNA; se tiene la hiptesis de que alguna vez fueron organismos libres que mucho tiempo atrs, durante la historia evolutiva, pasaron a ser endosimbiontes obligados de clulas mayores. Hay informes recientes de evidencia de herencia materna de DNA mitocrondrial (DNAmt) en seres humanos. Con base en el anlisis estadstico de los datos de produccin animal, se sugiere que la herencia gentica materna citoplsmica influye en el crecimiento, produccin y composicin de leche. Antecedentes obtenidos en ganado lechero Holstein publicados por Boettcher et al., (1996) demuestran que la varianza entre linajes maternos (mitocondriales) determinan su responsabilidad en la varianza sobre el porcentaje de grasa en la leche, en la produccin de leche y grasa, en una magnitud de 2,7; 0,38 y 0,71%, respectivamente. Gentica Clsica Durante muchos aos ni Mendel ni sus sucesores entendieron la naturaleza qumica del material hereditario; sus estudios se limitaron a determinar el comportamiento de transmisin de las unidades particulares de la herencia o genes. Con frecuencia se utiliza el trmino gentica clsica para describir los estudios de este tipo. Dentro de todas las especialidades de la gentica es fundamental conocer este mecanismo de transmisin. La gentica clsica sigue la siguiente metodologa: aparear individuos de la misma especie que tienen diferencias aparentes, de manera que pueda definirse el tipo de transmisin. Por medio de observacin y conteo de los individuos con caracteres muy marcados, se instituyeron algunas leyes bsicas. El xito de Mendel estrib en la seleccin del material y el tratamiento matemtico que dio a sus resultados. A partir de sus datos, Mendel postul dos principios o leyes. La primera se relaciona con la segregacin y la recombinacin. Concibi a los genes como unidades separadas, que mantenan su identidad sin mezclarse con otros en el cigoto; estos genes, presentes por duplicado, se separan (segregan) durante la formacin de gametos y se recombinan otra vez como unidades independientes al llevarse a cabo la fecundacin. El segundo es el principio de la distribucin independiente, con respecto al cual estableci: "La relacin de cada par de caracteres diferentes es independiente en las uniones hbridas". Los genes que influan los rasgos en sus experimentos se ordenaban de manera independiente. Ms adelante se ver que este postulado se modific con el descubrimiento del ligamiento gentico. Mendel, aparentemente, no se percat de esto, ya que la idea de que la mayora de los genes estn enlazados en el cromosoma no se public hasta 1903. Herencia de un factor o monofactorial Uno de los rasgos que estudi Mendel fue la altura de las plantas del chcharo. Tena dos variedades, una creca de 180 a 210 cm de altura (alta) y la otra slo 22 a 45 cm (enana). Cuando las cruz, toda la descendencia fue alta; al permitir que estas cruzas se autopolinizaran, el producto fue una proporcin de

tres plantas altas por una enana. Estos resultados seran los esperados si: (1) cada individuo contara con dos factores hereditarios que afectaran su altura, (2) las dos variedades originales, alta y enana, fueran puras para este rasgo respectivamente, (3) los factores hereditarios no se mezclaran sino que retuvieran su identidad, aun cuando el de las altas ocultara o dominara al de las enanas al presentarse ambos en el mismo individuo, (4) la descendencia produjera la misma cantidad de clulas germinales de dos tipos, de las cuales la mitad llevara el factor de "altas" y la otra el de "enanas" y (5) las dos clases de clulas germinales se combinaran aleatoriamente, es decir, que tuvieran la misma probabilidad de combinarse con otra del mismo tipo o con una diferente. Si T representa el factor "alta" y t el de "enana", el cruzamiento con la proporcin resultante 3:1 se puede esquematizar en un cuadro como el siguiente: Progenitores: Fenotipo Alto x Enano Genotipo TT tt Gametos slo T slo t F1 (Descendientes): Fenotipo Genotipo Gametos Alto x Tt T y t Alto Tt T y t Enano tt : 1

F2 (Descendientes de la cruza de F1 x F1): Fenotipos Alto Alto Alto Genotipos TT Tt Tt Proporcin fenotpica: 3

El cruzamiento simple de las variedades alta y enana de chcharos ilustran el comportamiento de los caracteres controlados por un solo par de genes o factores hereditarios. Todos los miembros de la F1 tienen genotipo Tt y fenotipo alto; cada progenitor era genticamente puro u homocigtico, y produjo slo un tipo de gametos para esta caracterstica en particular. Cuando se aparean los miembros de la F1 entre s, para dar lugar a la F2, la situacin se complica; ya que los F1, son genticamente impuros o heterocigticos, producen dos clases de gametos, en nmeros iguales, los cuales se fecundan de manera aleatoria con los gametos del otro progenitor, es decir, un gameto T de un padre tiene la misma probabilidad de unirse con uno T o uno t del otro padre. Las cuatro combinaciones genotpicas posibles de la F2, que se presentan en el diagrama, ocurren con la misma frecuencia. As la generacin F2 se compone de 1/4 de enanas y 3/4 de altas; de estas ltimas, 1/3 ( de toda la descendencia) sern homocigticas como sus padres, y los otros dos tercios sern heterocigticas como la F1. Si se cruzan estas heterocigticas, su comportamiento ser igual que el de la generacin F1.

Se debe hacer notar que las proporciones de la F2 son las esperadas, en promedio, si se produjera una gran descendencia. Cuando hay pocos descendientes, las desviaciones en la proporcin esperada sern considerables. En la mayora de las especies se produce una gran cantidad de gametos masculinos y depende del azar cul de ellos fecundar a los femeninos; esto se rige por las leyes de la probabilidad que se expondrn ms adelante. Para continuar este importante anlisis es necesario establecer y definir varios trminos utilizados para el estudio de la gentica, los que se detallan a continuacin: Hbrido: Descendientes de padres genticamente puros para uno o ms pares de factores hereditarios diferentes. Es importante dejar en claro, que tambin se utiliza el trmino de hbrido para sealar a animales resultantes del cruzamiento compatible entre especies diferentes, cuya descendencia generalmente es infrtil, condicin obviamente no es vlida en nuestros estudios genticos, por ahora, un ejemplo clsico es el resultante de la cruza entre un burro y una yegua que genera mulas, donde sus cariotipos son incongruentes los hbridos resultantes poseen una condicin intermedia: Caballo (2n = 64) X Asno (2n = 62) = Mula (2n = 63) o Burdgano (2n = 63), cuya infertilidad sera determinada por el nmero y estructura de los cromosomas. En este caso, las mulas aparentemente presentan una funcin ovrica normal, al igual que sus cuerpos lteos, pero los oocitos de primer orden son muy escasos y los ovulos mueren durante la meiosis. En los individuos machos existe azooespermia, por muerte de los espermios durante la meiosis espermtica. F1: Hbrido o primera generacin filial de un apareamiento dado. La descendencia de la generacin F1 es la F2, etc. En general, estos trminos tienen un significado ms amplio del que se da aqu y se aplican a los descendientes de apareamientos entre especies, a la progenie de cruces consanguneos dentro de una especie, y en algunos casos, a la descendencia de los cruzamientos entre razas. Fenotipo: Apariencia externa o algunas otras caractersticas observables o mensurables de un individuo. Corresponde slo a la expresin del Genotipo. Genotipo: Constitucin gentica de un individuo en trminos muy generales, pero realmente corresponde al arreglo gnico que posee un individuo para un carcter determinado. En el caso de la altura de los chcaros seran TT, Tt y tt. Tambin, en el caso del color del pelaje en equinos entre el color negro y rojo. Dominante: Miembro de un par de factores hereditarios o genes, cuyo efecto se manifiesta en el fenotipo, total o parcialmente, sin importar que otro miembro del par o serie est presente. En el ejemplo de la talla de los chcharos, T, el factor de "alta", es dominante sobre t, el factor de "enana". Por ende, un gen

es dominante cuando enmascara o evita la manifestacin de su alelo. Del mismo modo, un gen o genes de un par allico pueden ocultar la presencia y manifestaciones de los de otro par. Recesivo: Factor hereditario cuyos efectos no son observables cuando est presente un miembro dominante en el par o serie. En el genotipo Tt, el factor t no se expresa en el fenotipo, por ser recesivo. La diferencia entre negro y rojo, en equinos, es una diferencia allica donde el gen del pigmento negro se simboliza por E, que significa el alelo dominante asignndolo por una letra mayscula y al recesivo una minscula (e). Para describir caractersticas genticas de cualquier animal, el genotipo designa los alelos presentes y el fenotipo la apariencia externa que resulta de la interaccin de pares allicos. Destacndose en el equino, para ese locus los genotipos: EE, Ee y ee, que fenotpicamente representan animales de pelaje Negro, Negro y rojo, respectivamente. Los trminos dominante y recesivo describen la relacin entre alelos de un gen, no las relaciones entre genes diferentes. Cuando padres negros producen un animal rojo los factores del color rojo estn en la constitucin gentica de los padres negros, aunque ellos no se vean al mirar a los padres. Se dice que el alelo rojo es recesivo al negro y que el alelo negro es dominante sobre el rojo. Un alelo dominante se expresa aun cuando est presente solo en uno del par cromosmico. Un alelo recesivo se expresa solo si el altemativo dominante esta ausente. Un carcter recesivo siempre se hereda de manera directa, es decir si se cruza un animal rojo con otro rojo siempre producirn hijos rojos. Un alelo dominante no esta necesariamente asociado con fortaleza, ni un recesivo es signo de debilidad. A veces se escucha la expresin que el recesivo esta escondido, con la connotacin implcita de que el recesivo es defectuoso, pero ciertamente no todos los recesivos son deletreos v los genes deletreos no necesitan ser recesivos. Homocigoto (adj. homocigtico): Individuos genticamente puros para un par o serie de factores hereditarios. Los genotipos TT y tt son homocigticos, as como tambin en el equino los animales EE y ee. Un individuo homocigtico producir gametos de un solo tipo en relacin a este par o serie de factores. Heterocigoto (adj. heterocigtico): Individuo que tiene miembros diferentes en un par dado de factores hereditarios, en el ejemplo el genotipo Tt y en el de los equinos Ee. Los heterocigotos producen, en la misma proporcin, gametos de dos tipos, en relacin a este par o serie. Segregacin: Separacin de los miembros de un par de factores durante la formacin de gametos. Los genes permanecen como entidades constantes a travs de las generaciones; en la formacin de gametos se separan en lugar de combinarse o mezclarse. Este es el primero de los principios de la herencia mendeliana.

Alelos: Miembros de un par (o serie) de factores hereditarios en un locus o localizacin en un par cromosmico, que se separan en la formacin de gametos. Para explicar con mayor precisin la diferencia entre gen y alelo, se recurrir al ejemplo del color del pelaje en equinos, donde un par de caballos negros pueden producir una hija roja, o bin como se podra pensar uno negro. Numerosos estudios han mostrado que el color rojo del pelaje es heredado como una alternativa al negro. Los estados alternativos de un gen en particular son llamados alelos. Locus: Corresponde al lugar fsico donde se ubican los genes en el cromosoma, por ejemplo la determinacin del pelaje en equino est determinado por un slo locus (E) y manifiesta claramente ese efecto en el fenotipo, en cambio cuando sobre el carcter son varios locus los responsables, se denomina que es un loci el que interviene en ese caso. Los alelos pueden diferir entre si en una sola base nucleotdica de la secuencia de DNA del gen. El cambio puede ser suficiente para alterar la funcin del producto gnetico y crear un nuevo carcter visible. Se han identificado, con exactitud, en plantas, insectos y animales superiores, miles de caracteres que se comportan como pares monofactoriales con dominancia. El primer rasgo de este tipo en ganado, es la presencia o ausencia de cuernos, publicado en 1902. En otros casos monofactoriales, los genes exhiban slo dominancia parcial. Esto se ejemplifica en el siguiente diagrama que muestra el cruzamiento de ganado Shorthorn rojo puro y blanco puro. Progenitores: Fenotipos Genotipos Gametos F1 (Descendientes): Fenotipo Genotipo Gametos Rojo RR slo R Roano Rr R y r x blanco rr slo r Roano Rr R y r blanco rr 1

F2 (Descendientes de la cruza de F1 x F1): Fenotipos Rojo Roano Genotipos RR Rr Rr Proporcin fenotpica: 1 : 2

Se puede observar que el comportamiento de los genes en esta cruza es exactamente igual al de la cruza de chcharos altos y enanos, aunque el heterocigoto tiene un color roano intermedio.

El grado de dominancia vara mucho; en algunos casos es completa o casi completa de manera que no hay evidencia fenotpica en el heterocigoto; en otros casos ste tiene un fenotipo intermedio, sera la situacin de un modelo aditivo o tambin denominado sin dominancia. Herencia de dos factores Un tipo de herencia ms complejo que el monofactorial se presenta cuando dos pares de factores se consideran de manera simultnea, sea que afecten a diferentes caracteres fenotpicos o a uno solo. Esto se puede ejemplificar en ganado Holstein por dos factores separados. La mayor parte de los miembros de esta raza tiene cuernos y es de color blanco y negro, pero algunos individuos no tienen cuernos y otros son de color rojo y blanco. Cuando se aparean un individuo puro sin cuernos (PP) con uno con cuernos ningn miembro de la F1 tendr cuernos (Pp), ya que el gen de ausencia de cuernos domina al de cuernos. Cuando se cruzan entre s los individuos de F1, se espera una proporcin de 3 descendientes sin cuernos por uno con cuernos. Cuando se aparean un individuo puro blanco y negro (BB) con uno rojo y blanco (bb), todos los descendientes sern negros (Bb) ya que el gen para pigmento negro domina al del rojo. Al cruzar a los F1 entre s, se obtiene la proporcin esperada: 3 descendientes negros por 1 rojo. Ahora bien, si se cruzan un Holstein puro negro y blanco con cuernos (Bbpp) con uno rojo y blanco sin cuernos (bbPP), se espera que todos los hijos sean negro y blanco sin cuernos (BbPp). Cuando estos F1 se aparean entre s, se esperan los siguientes resultados en la descendencia: 9/16 blanco y negro sin cuernos; 3/16 rojo y blanco sin cuernos; 3/16 blanco y negro con cuernos y 1/16 rojo y blanco con cuernos. Ligamiento: Como no todos los pares de factores hereditarios se distribuyen de manera independiente, situacin que se verific al observar que dos caracteres no se apegaban a la segunda ley de Mendel. Esto ocurre cuando dos genes que determinan caracteres diferentes tienden a permanecer juntos, as que las combinaciones de F2 fueron diferentes a las esperadas. Sin embargo, los genes ligados pueden separarse unos de otros como parte del proceso normal de recombinacin cromosmica que ocurre durante la meiosis. Muchas especies se han investigado intensamente, como es el ratn (Mus musculus), del que hay mapas cromosmicos ms o menos extensos. Se sabe muy poco sobre los grupos ligados y la localizacin especfica de genes individuales en los animales de granja. El ligamiento es una fuerza moderada en la herencia, no evita la formacin de combinaciones genticas nuevas, slo disminuye su frecuencia. Un buen ejemplo de estos efectos genticos de ligamiento se observan claramente en la herencia de genes recesivos ligados al cromosoma sexual X, provocando enfermedades evidenciables slo en los machos que son hemicigotos, es decir, slo poseen un cromosoma X.

Epistasis: Se le llama epistasis a las interacciones entre genes no allicos. Se conocen varios tipos de epistasis para casos especficos de herencia de dos factores; es probaba que sea un fenmeno frecuente. De hecho, en un sentido amplio la expresin de cualquier gen depende de sus interacciones e interrelaciones con otros. Conociendo lo que significa un gen dominante, adems existen muchas clases de accin episttica gnica y los genes epistticos pueden ser dominantes o recesivos. Si se aparea un ratn negro AABB (gen A para color negro, gen a color claro B para expresin de cualquier color y genes bb enmascaran a todos los colores esto es, que son epistticos para A) con un albino aabb, todos los F1 sern negros AaBb; pero en F2 aparecern 9 negros, 3 color crema y 4 albinos. Esto se debe a que la presencia al menos de un A y un B da por resultado color negro; dos genes dos genes a y por lo menos un B producen color crema; pero cualquiera de las combinaciones de AA, Aa o aa con bb dan albino. Esto es porque los genes b enmascaran la expresin de A o a, es decir, bb es episttico sobre A y a, de modo que las dos ltimas porciones de la proporcin usual 9:3:3:1 tienen el mismo fenotipo. Todas las modificaciones de la proporcin 9:3:3:1 que se encuentran en la F2 indican interacciones en el desarrollo entre genes heredados de manera independiente. Muchas interacciones epistticas se han estudiado desde el punto de vista bioqumico; en particular, varias que controlan el color en flores, piel de mamferos y ojos de los insectos. En todos estos casos se encontr que al parecer los genes estn relacionados con reacciones qumicas especficas, necesarias para la formacin de pigmentos. Hasta el momento se tienen pocos ejemplos bien definidos de epistasis para rasgos productivos en mamferos domsticos, pero es fcil imaginar que debe haber un nmero limitado de posibles reacciones epistticas presentes. La dominancia puede ser un obstculo para la crianza, ya que hace imposible separar durante la inspeccin a los homocigotos de los heterocigotos; la epistasis tambin puede serlo, ya que alguna cualidad deseable del animal se debe a combinaciones epistticas, no pasarn intactas a la descendencia debido a la naturaleza divisoria de la herencia, ya que slo se traspasan a los descendientes los genes de cada uno de los padres. Herencia relacionada con tres o ms pares de genes Se han determinado las proporciones fenotpicas y genotpicas para los casos de herencia relacionada con tres o ms pares de factores que influyen en diversas caractersticas cualitativas. Estos estudios se vuelven tediosos ya que el nmero de posibles gametos, genotipos y fenotipos se incrementa conforme aumenta el nmero de pares de genes. El nmero de individuos que se requieren para llevar a cabo apareamientos controlados, con el fin de establecer las

proporciones, se vuelve astronmico si se incluyen muchos pares de genes. Por ejemplo, si en un locus slo existen dos alelos en una poblacin, los genotipos posibles de encontrar son 3, en cambio si en otro locus cualquiera existen en la poblacin 5 alelos, la cantidad de genotipos aumenta a 15, ahora si existieran 20 alelos diferentes en la poblacin para ese mismo locus, los genotipos diferentes posibles de obtenerse sern igual a 210. La mayora de los rasgos de naturaleza cuantitativa estn influidos por varios pares de factores hereditarios. Sus efectos individuales son pequeos, adems dichos rasgos tambin se ven afectados por factores ambientales. En la mayor parte de los casos, los hechos anteriores, adems del gran nmero de pares de genes, hace imposible identificar genes individuales y determinar proporciones genticas especficas. Sin embargo, los principios de segregacin y recombinacin se aplican del mismo modo que los caracteres cualitativos empleados como ejemplo hasta ahora.

Herencia de genes mltiples A principios de este siglo, con frecuencia se crea que la herencia mendeliana se limitaba a rasgos de tipo cualitativo, como el color o la presencia de cuernos y que los rasgos cuantitativos, como la talla o el rendimiento de leche, produccin de huevos, dependan de algn otro mecanismo; sin embargo, se encontr que caracteres como stos dependen de la accin de muchos pares de genes, cada uno de los cuales se comporta de manera mendeliana. Es usual que no se puedan identificar genes individuales, aunque se ha logrado en algunos casos, relativamente simples. Estos establecen como principio que el mecanismo de la herencia es el mismo, se incluyan pocos o muchos genes. En 1908, surge la hiptesis de los genes mltiples a partir de los trabajos de Nilsson-Ehle sobre el color del trigo y en 1910, de los de East con respecto a la longitud de las mazorcas de maz. El primero cruz varias cepas de trigo rojo y blanco; en general, el color rojo tuvo dominancia parcial sobre el blanco, porque el rojo de la F1 no fue tan oscuro como el del progenitor. En la F 2 hubo tres rojos (un oscuro y dos ms claros) por uno blanco, lo que indicaba una situacin de un par de genes. Otra cruza de trigos rojo y blanco, dio una F 1 similar, pero en F2 fueron 15 rojos (de varios tonos) por un blanco, lo cual indica la participacin de dos pares de genes. Sucesivamente revelaron los cruzamientos que en cada caso se segrebaban uno, dos o ms pares de genes. Por ejemplo, en la cruza de dos pares de genes demostr que un trigo con cuatro genes para el rojo era ms rojo que uno con tres; ste a su vez, ms rojo que uno con dos genes, etc. En estos casos no hay dominancia completa, sino que los genes actan de una manera acumulativa o aditiva.

Se piensa que el tipo de herencia relacionado con varios pares de genes, que tienen efectos acumulativos pero indiferenciables individualmente, opera (adems de la dominancia, la sobredominancia, la epistasis y otros tipos) en la herencia de la mayora de los caracteres animales con importancia econmica. En otras palabras, se puede sustituir el color del trigo por tamao, peso, rendimiento o muchos otros rasgos cuantitativos. Esto explica las dificultades que se encuentran cuando se intenta descifrar la manera exacta en que se heredan muchos caracteres de los animales productivos. Rara vez se identifican los efectos individuales de un gen con respecto a rasgos cuantitativos en animales domsticos; sin embargo, se dispone de mtodos estadsticos para estimar el efecto promedio de los genes. Alelos mltiples En los ejemplos anteriores se consider a los alelos como pares o formas alternativas de un gen que se localizan en un determinado par de cromosomas. Los alelos en un locus dado presentan en series de tres o ms genes que ocupa un cromosoma; a stos se les llama alelos mltiples. Normalmente los individuos no tienen ms de dos miembros de una serie allica mltiple, pero en algunos casos, en los diversos individuos de una poblacin se presentan gran nmero de alelos. Como se mencion antes, los genes estn compuestos por DNA, cuya variedad de combinaciones qumicas es casi infinita. Se presume que los alelos y alelos mltiples son el resultado de diferencias qumicas menores. En el hombre, una de las series allicas mltiples mejor conocida se relaciona con los grupos sanguneos; no se hereda la sangre de los padres (el embrin la produce del mismo modo que el hueso y el msculo), pero s se heredan los genes que controlan el tipo de sta que se tendr. Los cuatro tipos de sangre humana derivan de la interaccin de tres genes allicos; el primer gen es A, el segundo Ab y el tercero a; los genes A y A b son dominantes sobre a, pero entre ellos no hay dominancia, por lo que producen un nuevo tipo, de la misma manera en que ganado Shorthorn R (rojo) y r (blanco) dan el Rr (roano). As, se puede describir la constitucin gentica de los seres humanos para la serie de grupos sanguneos en particular, siendo el primer sistema descrito el sistema ABO, que marco el inicio del concepto de individualidad, definida por los antgenos presentes en la membrana de los eritrocitos humanos. Este sistema se localiza en el cromosoma 9 y se reconocen 4 fenotipos, los que forman, en cambio 6 genotipos diferentes, como sigue: FENOTIPOS GENOTIPOS Tipo A AA o AO Tipo B BB o BO Tipo AB AB Tipo 0 OO

En la Corte, para establecer la posible paternidad en los juicios se utiliza el conocimiento que hay sobre la herencia de estos tipos sanguneos, adems considerndose otros tipos determinados por series gnicas en otros loci. Una condicin que puede ser de inters para ser estudiada es la frecuencia de los diferentes grupos sanguneos (frecuencias genotpicas) de diferentes pases americanos (Tabla 3). El gran nmero de loci en un cromosoma, as como que cada especie tiene varios pares de cromosomas, permite que haya un gran nmero de variaciones genticas en la misma especie, aun cuando slo dos genes pudieran ocupar un locus. Esta gama de variabilidad gentica aumenta ms por la presencia de alelos mltiples. Se conocen varias series allicas muy extensas que afectan caracteres cuantitativos en plantas y animales. Los alelos mltiples pueden ser importantes para los rasgos cuantitativos, pero sera muy difcil identificar series individuales ya que algunos caracteres no se pueden identificar cada uno de los genes que participan, adems de las mltiples interacciones de genes, cuyos componentes no se conocen ni el nmero de loci involucrados, ni tampoco el nmero de alelos de esos loci. En este grupo de condiciones genticas se encuentran la mayora de las caractersticas productivas en animales, plantas, rboles, etc., que necesitan ser medibles y se pueden estudiar a travs de la Gentica cuantitativa.

TABLA 3. Pas

Distribucin de grupo ABO en diferentes pases americanos. Grupo A Grupo B Grupo AB Grupo O (%) (%) (%) (%) Chile 29,50 9,26 1,99 59,22 Venezuela 29,60 10,30 2,10 58,00 Mxico 21,20 7,40 0,92 70,42 Argentina 34,93 8,88 2,91 53,28 EE.UU.:blancos 40,00 11,00 4,00 45,00 EE.UU.:negros 27,00 20,00 4,00 49,00 Cuyos niveles fenotpicos de cada animal para estos caracteres esta determinado por un efecto aditivo de los genes en varios loci y tambin puede estar influenciado por componentes ambientales, de ahi que es muy importante en uso de anlisis matemticos que permitan mediante modelos genticos identificar, con el menor error posible, es decir de la forma ms exacta posible que animal resulta ser genticamente superior para ese carcter, para ello se puede recurrir a la propia informacin productiva, de sus descendientes o de sus parientes. Es fundamental en la investigacin actual la determinacin de marcadores especficos de DNA que presenten niveles altos de correlacin con caracteres productivos. En produccin animal dichos genes ya se han identificado y se denominan los QTL (Quantitative trait loci), Determinacin del sexo Dentro del vasto universo de animales y plantas hay una gran cantidad de mecanismos genticos que determinan el sexo; adems, los factores ambientales tambin afectan la sexualidad. En algunos casos, estos factores determinan el sexo, en otros lo invierten y en muchos ms influyen en el desarrollo sexual normal. En mamferos, aves, muchos insectos, as como en otras formas de vida animal y vegetal los cromosomas son de dos tipos. La mayora de los pares son similares en machos y hembras, y reciben el nombre de autosomas; adems hay un par de cromosomas diferentes conocidos como cromosomas sexuales. En los mamferos, las hembras normales tienen dos cromosomas X, mientras que los machos tienen un par formado por uno X y otro Y; por esto, a las hembras se les llama sexo homogamtico y a los machos heterogamtico. Muchos insectos, entre ellos la mosca de la fruta Drosophila melanogaster que tanto ha contribuido a los estudios de gentica, tiene la misma disposicin XY de los mamferos. En aves, reptiles, diversos insectos y algunos peces y anfibios la situacin ocurre de manera inversa, ya que los machos tienen dos cromosomas X, mientras que las hembras tienen uno X y otro Y, o uno X sin complemento, a esto ltimo se le llama condicin XO. En estas especies el macho es homogamtico y la hembra heterogamtica.

Los cromosomas sexuales se segregan en la meiosis, este mecanismo sirve para mantener la misma proporcin entre ambos sexos. Es ms preciso decir que las condiciones XX y XY se relacionan con la femineidad y masculinidad respectivamente, que decir que estos cromosomas determinan el sexo; lo mismo es vlido para especies en las cuales el macho es XX y las hembras XY o XO. Dependiendo del efecto y aplicacin de los genes la gentica se puede estudiar en diferentes reas, siendo las ms destacadas: La gentica Evolutiva, que se preocupa del estudio de poblaciones, sus comportamientos y parmetros poblacionales del pasado para ayudar a explicar los avances obtenidos en el presente. La gentica del Mejoramiento, es decir, lograr identificar los mejores genes de una poblacin y determinar cual ser su importancia y efecto en el caso de participar, por ejemplo, en la transferencia gnica. Adems verificar si se pueden cambiar las caractersticas productivas en las especies animales, en un tiempo prudente, en base al objetivo de productividad en las poblaciones, que son modificados constantemente por el hombre. La gentica Molecular, cuyos avances actuales deberan tender a utilizar loci identificados que aumenten la produccin y/o producir sustancias necesarias y vitales para las diferentes especies, mediante el conocimiento de los mapas cromosmicos. En especies productivas existe un rea de gran implicancia en el futuro como lo es la Manipulacin gentica, entre otras actividades cientficas realizadas. El rea fundamental para estos estudios corresponde a la Ingeniera gentica. En el rea experimental, determinar el nmero de genes que afectan una caracterstica productiva y la distribucin de la magnitud de sus efectos sigue siendo una alternativa importante de evaluar. Ms recientemente se discute el uso de la gentica molecular y sus aplicaciones en el mejoramiento productivo, es decir, cada rea del desarrollo gentico interactua en forma activa y directa con las dems. El identificar genes: sigue en algunas especies an muy limitado y tiene un rol marginal en la gentica de produccin animal, por ejemplo: el color y otros caracteres de herencia simple, los que fueron usados como marcadores simples en la formacin de muchas razas. Tambin sirvieron como marcadores para mantener razas puras y as guardar los stock genticamente aislados. Ms recientemente los grupos sanguneos y protenas polimrficas se han usado para chequear sus parientes (padres) y permitir a travs del ADN eliminar el error de los matrimonios o cruzamientos. Un uso importante es lo analizado en poblaciones de

salmones del pacfico versus del atlntico y/o entre los del atlntico ver sus otros de origen diferente. El otro uso importante dice relacin con la posibilidad de comprender y controlar la herencia simple de desordenes genticos. Tambin algunos mediante el polimorfismo se puede determinar las distancias genticas entre razas, y as orientar el origen histrico de la poblacin para planificar la conservacin de razas y/o genes, adems hacer posible la prediccin de heterosis como producto de los cruzamientos. Buenos ejemplos del us prctico de genes individuales son los utilizados en aves comerciales: como los genes que determinan un emplume rpido o tardo, ligados al sexo en algunos stock de aves (lneas sintticas), el color de la cscara del huevo, caractersticas que presentan una gran repercusin econmica en el mercado. Tambin, estos genes marcados en subgrupos de peces para identificar si el grupo es puro o mezclado. Genes Mayores: Gran efecto sobre caractersticas individuales. Muchos se hayan descubierto en lneas desarrolladas por los productores. La incorporacin de estos genes en los sistemas productivos no es inmediata, directa ni masiva. Necesariamente se debe evaluar la importancia econmica en va de asegurar al productor un beneficio o rentabilidad econmica en su sistema productivo. A menudo los genes mayores han tenido efectos deletreos tal como "Dificultad al parto" en animales doble msculo (Hanset y Michaux, 1985). Algunos genes que presentan un efecto productivo importante en diferentes especies se entregan en la Tabla 4. Consideraciones Generales Resistencia gentica a enfermedades: los grmenes varian su patogenecidad en forma espontnea y con regularidad variada. Existe diferencia entre animales normales y homocigotos para doble msculo que incluso alcanzan a alejarse en 6 desviaciones estandares de la media. En cambio, la situacin del gen Booroola en los animales homocigotos presentan 3 desviaciones estndar lejos de la media. Otros marcadores asistidos para seleccin RFLP (Fragmento restringido de polimorfismo largo) minisatlites. Marcadores polimrficos se usan en mejoramiento productivo como marcadores que ayudan a la seleccin. Se podra estimar una respuesta extra en bovinos de leche de 25 a 50%.

TABLA 4. Algunos ejemplos importantes de genes mayores en diferentes especies productivas. ESPECIE Broiler GEN Lig. al sexo: enanismo (dw) VENTAJAS Menor consumo de madres broiler. Resistencia Enfermedad Marek. Mayor rendimiento carne magra. Resistencia E. coli. Alta tasa de ovulacin DESVENTAJAS Menor tasa de crecimiento (leve). ---------------Mortalidad por Estress, menor calidad carne. Incierto. Mayor tamao de camada al nacimiento. Deficiencia al parto. Incierto.

Ponedoras Cerdos

B21 (Grupo sanguneo) Gen Halotano K28

Ovinos

Gen Booroola (+ otros)

Bovinos

Gen Doble msculo Genes protena en leche (Alfa, Beta, Caseina, etc).

Mayor Produccin de carne magra. Mayor Produccin de queso.

Transgenes: DNA genes promotores y promueve codificar la secuencia deseada (previamente encontrada). Por ejemplo, en ovejas que con la sangre humana clotting factor IX producen insulina, cada animal transgnico es nico en el lugar y nmero de copias por lo tanto este efecto deber ser debidamente evaluado individualmente. Rol importante en el futuro son aquellas caractersticas productivas (muchos loci) que deben ser estudiadas y mejoradas en poblaciones productivas. Por lo tanto no muy importante en el mejoramiento productivo pero podra iniciarse su uso y aplicacin a partir de hoy. La metodologa para la creacin de animales transgnicos, el establecimiento de lneas transgnicas, la expresin de constructos gnicos transferidos y las posibilidades que ofrecen los animales transgnicos para la investigacin bsica y aplicada.

Los ratones con hormona del crecimiento (HG) transgnica fueron producidos por primera vez en 1982 (Palmiter et al., 1982). Estos ratones presentaban un incremento muy pronunciado del crecimiento cuadruplicando los ritmos de crecimiento y con una duplicacin del peso corporal final. Tambin se han utilizado los genes de la hormona del crecimiento de otras especies y otros genes de la cascada de la HG tales como GHRH y el IGF-I tambin han sido utilizados para producir ratones transgnicos. Muchos artculos se han publicado acerca de animales transgnicos de importancia econmica que portan y expresan genes de la familia de la HG. En contraste con los resultados obtenidos con los ratones transgnicos para la HG y la administracin de la HG en animales de importancia econmica, los correspondientes animales transgnicos para la HG no mostraron los mismos efectos biolgicos. Los cerdos y los conejos transgnicos que expresan el gen de la HG no presentan en el grado de crecimiento (Hammer et al., 1985). Los cerdos transgnicos criados con una racin alimenticia normal, conteniendo 16% de protena cruda, incluso parecan crecer menos que los cerdos controles, sin embargo los experimentos de inyeccin realizados simultneamente, revelaron que un incremento del peso requiere de una dieta rica en protena (18%) suplementada con lisina (0.25%), minerales y vitaminas. Cuando, como consecuencia, la descendencia transgnica de los cerdos transgnicos de la HG recibi dieta modificada, el grado de crecimiento diario se increment en un 15% y la utilizacin de la dieta tambin se increment. Durante miles de aos la alteracin gentica de los animales por el hombre ha sido la fuerza conductora que se hallaba tras la domesticacin de los animales salvajes. Inicialmente, las intervenciones fueron llevadas a cabo con base emprica. Debera mencionarse que el espectro de alteraciones genticas introducidas durante el proceso de domesticacin es, con mucho, ms dramtico que todas las otras alteraciones introducidas desde entonces por la crianza dirigida y selectiva. A un nivel creciente, la gran cantidad de programas de crianza animal llevados a cabo desde el pasado siglo, han estado cada vez ms enfocados a la persecucin de la alteracin selectiva, perceptible y con objetivos predefinidos sobre caracteres individuales. Los realmente destacables resultados obtenidos hasta el momento son asimismo una razn para la evaluacin muy favorable otorgada a estos logros. El extremo desarrollo de ciertos caracteres es el resultado de la formulacin de distintos objetivos en la crianza. La mejora de la produccin de leche en las vacas podra servir como un ejemplo: mientras que la produccin anual de leche por vaca era de aproximadamente 1.000 Kg a mediados del siglo XIX, alcanz ms de 7.000 Kg en algunas poblaciones de animales de la dcada de los 80, con medias por rebao por encima de los 10.000 Kg. Las acciones genticas responsables de estos logros son, con mucho, menos dramticas y menos complejas que aquellas que acompaaron a la domesticacin del ganado salvaje. El mayor problema en la crianza de animales es que los genotipos (a menudo complejos) responsables del desarrollo de los caracteres fenotpicos deseados no pueden ser reconocidos per se. Frecuentemente, la informacin acerca de las causas genticas de ciertos caracteres fenotpicos slo

puede ser obtenida analizando una extensa cantidad de datos obtenidos de animales relacionados (anlisis del pedigree y estimacin de los valores genticos aditivos). Este problema no es nuevo y tambin afecta a los genetistas involucrados en investigacin bsica. La cuestin ms importante acerca de los caracteres determinados poligenticamente es la distincin entre influencias genticas y ambientales para la evaluar las relaciones causa-efecto entre genotipos y fenotipos. El anlisis de los defectos genticos y sus consecuencias, as como la prediccin de los resultados de las modificaciones genticas son de la mayor importancia en caracteres determinados tanto mono- como poligognicamente. Los avances en biologa molecular han evolucionado nuestro conocimiento de la gentica y han aportado algunas respuestas concluyentes y competentes a por lo menos algunas de estas cuestiones. Los pasados aos han visto el desarrollo de mtodos que, a diferencia de las tcnicas convencionales de crianza, permiten modificar directamente y de manera selectiva la composicin gentica de los organismos, en lugar de indirectamente por la estimacin de los valores genticos aditivos en base a fenotipos, con el fin de establecer un orden de prioridad para la seleccin. En principio, estas nuevas tcnicas de manipulacin gentica pueden ser divididas en aquella categora que trata el genoma entero como una unidad compacta (manipulacin genmica; por ejemplo, la transferencia nuclear) y aquella otra en la que son manipulados los genes individuales (manipulacin gnica; por ejemplo, la transferencia gnica). Adems, estas tcnicas pueden ser diferenciadas en aquellas que permiten la manipulacin de clulas somticas (por ejemplo, la terapia gnica somtica) y en aquellas dirigidas a alterar la lnea germinal de los animales. Las ltimas tcnicas dan lugar a lneas transgnicas de animales caracterizadas por la transmisin estable de la modificacin gentica. La aplicacin de las tcnicas de transferencia gnica nos ha dotado de nuevas perspectivas en la biologa del desarrollo y de los principios que subyacen a la expresin especfica de tejido. Tambin ha provisto a los onclogos, inmunlogos, mdicos genetistas con una amplia base de informacin importante y detallada. Adems, la transferencia gnica tambin permite el desarrollo de nuevos sistemas de produccin de protenas farmacolgicamente importantes (granjas de drogas). En lo que concierne a la produccin animal, la transferencia gnica parece ser una tcnica prometedora para mejorar la resistencia a enfermedades y el comportamiento y la calidad de los productos animales modificando, por ejemplo, rutas metablicas y hormonales.

CONCEPTOS BSICOS DE ESTADSTICA Como ya fue establecido que en general los genes no pueden ser vistos con mucha facilidad, y slo en nuestras poblaciones (animales, vegetales y humana) se observan sus efectos. Las diferencias entre los individuos y el estudio de cuales son las causas de estas diferencias, requieren de una herramienta cientfica de mucho apoyo, como es la Estadstica, ciencia exacta que permite estudiar la variabilidad observada en una serie de datos. Generalmente necesitamos describir exactamente a un individuo, es as, que de un determinado animal podemos conocerlo, a travs de las mediciones de su estado y nivel productivo (peso corporal, produccin de lana, produccin de huevos, etc.). Cada una de estas caractersticas son medidas y que en la poblacin presentan variacin se denominan variables. Por lo tanto, dependiendo del tipo de variable es recomendable definir a la poblacin para su estudio y anlisis adecuado. Una condicin que define su estudio, corresponde a la distribucin de probabilidades que se puede generar con muchos individuos medidos para un determinado carcter. Es importante definir el trmino de variable: corresponde a un atributo que puede adquirir distintos valores, es decir, que se le puede asignar un nmero que se relaciona con el grado en que el atributo est presente. Por ende, una variable continua, se denomina a aquella variable que puede tomar tericamente un nmero infinito de valores de un conjunto determinado de ellos. En cambio se llama variable discreta, a una variable que puede tomar slo un nmero finito de valores de un conjunto determinado de ellos. Como consecuencia se define una variable aleatoria, segn Sokal y Rohlf (1981) como la propiedad respecto a la cual, los individuos de una muestra difieren de una manera aleatoria entre si. Si esta propiedad, no cambia dentro de una muestra dada o al menos entre muestras estudiadas, es una constante entre ellos. DISTRIBUCIONES En todas las poblaciones, definida como "un grupo de individuos que puede reproducirse y dejar descendencia frtil", se pueden medir caractersticas que se distribuyen de diferentes formas, ya sea en una distribucin Binomial, de Posson, Normal, etc. Distribucin de probabilidad: Son distribuciones tericas, construidas sobre bases de un nmero infinito de casos. Son fenmenos ideales y a partir de ellos se deduce la probabilidad a priori.

Momentos de una Distribucin Primer Momento: ESPERANZA a) Definicin: Es el valor promedio que se espera obtener de una muestra poblacional. Se simboliza con la letra E (x). b) Frmula E (x) = Xi P(Xi,); donde Xi, son las observaciones y es la probabilidad de que ocurra cada observacin. c) Propiedades: Asumiendo c una constante y X e Y variables aletorias. 1) E(c) = c 2) E(cX) = c E(X) 3) E(X Y) = E(X) E(Y) 4) E(X*Y) = E(X) * E(Y); slo si X e Y son independientes. 5) E(X*Y) = E(X) * E(Y) - 2Cov; s X e Y no son independientes. Por ej.: S se desea conocer el valor promedio de los resultados obtenidos al lanzar un dado n veces (Esperanza), debemos definir el espacio muestral (que corresponde a todos, los posibles resultados de la experiencia) que para esta situacin ser de S = (1,2,3,4,5,6) con una probabilidad de ocurrir cada una igual a P(X) = 1/6. Por lo tanto aplicando la formula se obtiene: E(X) = 1*1/6 + 2*1/6 + 3*1/6 + 4*1/6 + 5*1/6 + 6*1/6 = 3.5 Segundo Momento: VARIANZA a) Definicin: Cuanto se alejan los valores de las observaciones del valor central. Se simboliza con la letra V(X). b) Frmula: V(X) = E (X - E(X))2; donde E = sumar y multiplicar por la frecuencia y E(X) = Esperanza. c) Propiedades: 1) V(c) = 0 2) V(cX) = c2 V(X) 3) V(X Y) = V(X) V(Y); si las variables X e Y son independientes. 4) V(X Y) = V(X) V(Y) - 2Cov; si son X e Y dependientes. Por ej.: Con los datos del ejemplo anterior se puede obtener la varanza de esta experiencia, ocupando la formula: V(X) = 1/6 * (l2 + 22 + 32 + 42 + 52 + 62) - (3.5)2 = 2.916 Desviacin estndar = Es la raz de la varianza. Siendo su frmula : = V(X)

COVARIANZA: Determine la existencia de asociacin entre 2 variables diferentes. a) Definicin:: Es la suma de los productos entre las variables X e Y. b) Frmula: Cov (X,Y) = E(XY) - E(X) * E(Y). c) Propiedades: 1) Cov (c,Y) = 0. 2) Cov (X,Y) = XY ; si ambas variables son aleatorias. Sin embargo, la Covarianza de una variable con si misma es la Varianza: Cov (X,X) = V(X). 3) Cov (X,Y) = 0; si X e Y son independientes; pero s la Cov (X,Y) = 0, no signifca que X e Y sean independientes. 4) Cov (c1X, c2Y) = c1 c2 Cov (X,Y). 5) Cov (X, +y1 + y2 + y3 ) = Cov (X, y1) + Cov (X, y2) + Cov (X, y3). La covarianza puede tomar cualquier valor, para poder saber si es muy grande o pequea se estabiliza con respecto a la varianza, lo que permite saber si es mayor o menor que la.varanza de las variables en estudio. Para esto se construye un ndice llamado Coeficiente de correlacin (r) entre X e Y que oxcila entre 1 y -1. Este adems nos permite comparar varianzas de distintas variables o de iguales variables medidas en diferentes oportunidades. Cov (X,Y) r = V(X) * V(Y) Si CovXY es distinto de 0, las variables (X,Y) estn correlacionadas (asociadas). Si CovXY es igual a 0, las variables (X,Y) no estn correlacionadas, esto no implica que sean independientes, lo que se ve en esta correlacin es la asociacin lneal entre las variables, por lo tanto si la correlacin es igual a 0 las variables pueden estar relacionadas en una forma no lneal, ej: logartmica. Adems, cuando una variable Y pueda depender de otra X, se puede obtener el Coeficiente de Regresin: que permite predecir cuanto cambia la variable Y por cada unidad de cambio en X, esta regresin se define por b; siendo esta asociacin entre ambas variables estandarizada por la variable independiente como denominador: Cov (X,Y) Cov (X,Y) b = = V(X)*V(X) 2X

Los usos en produccin animal de la regresin son para predecir el valor de una variable conociendo el valor de otra. Por ejemplo: Cuanto producir un animal en su segunda esquila de lana si slo conozco su produccin (actual) en su primera esquila; o cuanto pesara un animal al destete si conozco su peso al nacimiento. Las unidades de medicin de Y fueran en cm y las de X fueran en Kg, entonces el coeficiente de regresin est en trminos de Kg por cm, sealando el cambio esperado del carcter Y en cm, por el cambio en un Kg del carcter X, La regresin puede ser tambin negativa, cero o positiva, dependiendo de la Covarianza entre X e Y. La ecuacin de regresin puede ser definida por: i = Y + bY.X ( Xi - X) ; lo que permite ser usada para predecir Y cuando X es conocida, Xi - X representa para un animal en particular el desvio de la variable Xi del valor estimado de i . Si bY.X es el cambio esperado en la variable Y por una unidad de cambio en X, bY.X ( Xi - X) representa la diferencia esperada en Y para un X valor en particular. Si Xi = X, es decir Xi - = 0, el valor predicho de Y es Y. Por lo tanto, la ecuacin para predecir i puede escribirse como: i = (Y - bY.X X) + bY.X Xi i = + bY.X Xi donde: representa el intercepto estimado de Y, osea el valor de Y cuando Xi es cero. Por lo tanto, en una curva lneal, b corresponde a la pendiente de la curva. TIPOS DE DISTRIBUCION A continuacin se describiran brevemente las distribuciones de frecuencias ms usadas en gentica aplicada al mejoramiento gentico. Distribucin Binomial: Se usa para fenmenos dicotmicos, por ej.: el suceso que una cra sea macho o hembra. Un suceso binomial tiene dos resultados posibles, presencia (A) o ausencia (A') de un determinado atributo. El modelo lneal exige que la probabilidad que ocurra un determinado suceso sea constante, adems los sucesos deben ser mutuamente excluyentes. Un fenmeno o experimento se repite n veces independientes.

La P(A) = p (probabilidad a priori que ocurra A, suceso favorable), P(A') = q (probabilidad a priori que ocurra A'), por lo tanto, no hay que olvidar que q = (1- p). Espacio muestral: son las valores obtenidos despus de extraer n observaciones de una poblacin. S = (A, A'). Suceso favorable = X = (A) Por lo tanto la probabilidad que ocurra A (suceso favorable) es: P(X) = Cn pX q n - X; = P(X) = 1 ; donde: n es la posibilidad de que los sucesos sean tomados de n en n, siendo X el suceso del cual se desea conocer la probabildad de ocurrir. E(X) = n p; V(X) = n p q

Por ej.: La caracterstica ausencia de cacho en bovinos esta dada por, el gen C (dominante) y la presencia de cachos por el gen c (recesivo). La frecuencia de C (p) en la poblacin es de frecuencia de c = (1 - p) en la poblacin es de 0.5 = q. 0.5, por ende la

Al cruzar 2 individuos hetrocigotos. Cual es la Probabilidad de que de la cruza nazca un individuo con cachos (cc), osea un animal homocigoto recesivo ?. Si p = C = 0,5 y q = c = 0,5; y el espacio muestral para los dos genes que formen un genotipo (hijo) es: S = (CC, cC , Cc, cc ) X = 2 , 1 , 1, 0 La presencia de cuernos esta dado por el genotipo cc (x) = 0 (es decir no se presenten en el genotipo genes C). P (0) = C2 p0 q2 = 1x2 x 0.50 x 0.52 0! x (1 x 2)!

P (0) = 1 x 1 x 0.52 = 0.25 Distribucin de Poisson: Cuando en variables binomiales nuestro n tiende a infinito y p es muy pequeo la distribucin binomial pasa a ser Distribucin de Poisson. Siendo ahora np = m. Por lo tanto, p = m/n, reemplazando en la formula de probablidad Binomial: n| P(X) = X * (m/n) X * (l - m/n) n - X ; donde con una, serie de remplazos se llega a la formula general para esta distribucin:

P(X) = ( e-m mX) / X! Esta distribucin es tambin conocida como probabilidad de sucesos raros, como por ej., en el caso de enfermedades contagiosas en que el n es muy grande y el p es muy pequeo, especialmente sirve para explicar la ocurrencia de mutaciones en las poblaciones. Su E(X) = m y su V(X) es tambin = m VARIABLES CONTINUAS Son variables que pueden tomar todo las valores de una recta con cierta probabilidad. Distribuciones Continuas: 1) Distribucin Uniforme: Una variable continua tiene igual probabilidad de ocurrir en un intervalo conocido (a,b). a b La funcin de densidad es: (X) = 1/ (b - a) Por ej.: Un metal x se fusiona a 300C sus parmetros sern: a + b E(X) = ; V(X) = 1/ 12 x (b - a)2 2
2)

Distrbucin Normal: Muchas variables continuas se distribuyen en una forma normal, cuya E(X) = , donde es cualquier valor de + a -, y su V(X) = 2, donde 2 > 0. Si graficamos una poblacin de bovinos de leche evaluados para diferentes caractersticas productivas con respecto a su frecuencia relativa (Figura 1).

Se puede observar que: 1.Es poco probable encontrar pesos muy bajos y muy altos. 2.Es muy probable encontrar pesos intermedios. Si se aumenta el tamao de la muestra (n) y se aumenta el nmero de intervalos siendo estos cada vez ms pqueos se llegara a obtener una curva lisa y no angulosa: CURVA NORMAL (Figura 2):

Figura 1: Distribuciones de frecuencias para el permetro torxico, el peso corporal, produccin de leche en 250 das y el porcentaje de la grasa en la leche de 2047 vacas, que muestran tendencias hacia la curva normal.

Figura 2. Curva de distribucin normal.

1 La funcin de densidad de esta curva es: Z(X) = e - ((X - )/ )2 2

Propiedades de la curva Normal: 1) 2) 3) 4) 5) 6) 7) Es simtrica respecto a . Su mximo valor se encuentra en . Su punto de inflexin se encuentra en . E(X) = V(X) = 2 Si 2 es pequea la curva es alta. Si 2 es grande la curva es baja.

Existen infinitas curvas normales con diferentes y 2, por lo tanto se busca la ms sencilla de todas las curvas, donde = 0 y 2 = 1.0, que ocurre cuando la variable continua X es expresada en trminos de desvios relativos (Z) = Distribucin Normal estndarizada, mediante: X - Z = ; siendo, por lo tanto, la variable X sustituida por Z. El rea bajo la curva corresponde a la probabilidad de Z, P(Z), sta se encuentra tabulada para cualquier valor de Z. La curva normal estandarzada tiene su mximo en la abcisa Z = 0, donde coincide , la media y la moda. Otra caracterstica es:

1. 1 = 0,6827 o sea en este intervalo se encuentra el 68,27% de las observaciones, o dicho de otra forma exista probabilidad de 0,6827 de que una observacin cualquiera al azar este entre - y + (Figura 2). Aumentando esta probabilidad si aumenta: 2. 2 = 0,9545 3. 3 = 0,9973 Por ej.: Supngase que se tiene 1000 pesos corporales de cerdas de 5 a 6 meses de edad cuyo = 82 Kg y = 9 Kg. Entonces en el rea 1 que va desde (82 - 9 a 82 + 9) = determinando un rango entre 73 a 91 Kg, es decir corresponder al 68,27% de los animales. Para calcular cual es la probabilidad que tiene una cerda de pesar entre 72 y 82 Kg, dado los parmetros de = 80 Kg y = 12 Kg, se utiliza la siguiente forma: X1 = 72; Z1 = (72 - 80)/12 = -0,67 X2 = 82; Z2 = (82 - 80)/12 = 0,17

Se buscan estos valores de Z en la tabla, considerando que si Z1 y Z2 tienen igual signo se deben restar las reas, si tienen signo diferentes Z1 y Z2, sus reas deben sumarse. Para nuestro ejemplo el rea para Z 1 = 0,2486 y para Z2 = 0,0675, como eran de signo diferente se suman dando 0,2486 + 0,0675 = 0,3161 o sea existe la probabilidad de aproximadamente 0,32 que una cerda en esta muestra tenga un peso corporal entre 72 y 82 Kg. Distribucin de X2: Esta distribucin toma solo valores positivos e incluye el 0; adopta diferentes formas segn su grado de libertad, por lo tanto a medida que aumenta el nmero de grado de libertad se hace ms simtrica. . Su E(X) = n y su V(X) = 2n. La formula de X2 es: (Oj observado y Ej es el valor esperado. Ei)2 / Ei ; donde Oj es el valor

Distribucin de F (Fisher): Una segunda distribucin importante derivada de la distribucin Normal es la distribucin de F que es la distribucin de la relacin entre dos variables independiente al cuadrado. Por ejemplo si existe una variable X de la cual se puede obtener el cuadrado de ella (X 2) con n grados de libertad y una variable Y con el cuadrado de ella (Y2) con m grados de libertad. Siendo ambas independientes, entonces la relacin F = (X/n) / (Y/m) es distribuido en F con n y m grados de libertad F (m,n), para ello es necesario construir la tabla del anlisis de varianza (ANDEVA), que consiste en la divisin de la variacin total de observaciones en una serie de datos en que su suma de cuadrados (SC) son independientes.

SC de tratamientos SC de error Cuando se divide cada suma de cuadrado por su grado de libertad se obtiene los cuadrados medios (CM) y la relacin de estos cuadrados medos puede estar distribuido en F y pueden ser comparadas con valores tabulados de la distribucin de F para chequear ciertas hipotesis. SC de tratamientos / n CM tratamiento F = ------- = SC de error / m CM error METODOS PARA ENCONTRAR ESTIMADORES 1. 2. Mtodo de los MOMENTOS. Mtodo de MAXIMA VEROSIMILITUD (ML).

Es un mtodo complicado pero poderoso. Para obtener un estimador ML se debe: 1) Especificar la frecuencia o probabilidad de distribucin del cual la muestra es extraida. 2) Usar una distribucin para escribir la probabilidad de obtener de la muestra un valor actual (esta probabilidad es conocida como la funcin de Verosimilitud de la muestra). 3) Hacer que se mximize la funcin de verosimilitud de la muestra P (X / ) mx. En la prctica es ms usual mximizar el Logaritmo de la funcin de verosimilitud e igualar a cero, esto se logra derivando con respecto al parmetro. Por ejemplo: encontrar un estimador ML de la media de una poblacin binomial de una muestra de n = 10 observaciones, donde 4 de las cuales fueron = 1 y 6 iguales a cero. La distribucin de probabilidades para las 10 muestras es: 10 P (X) = 4 pr (1- p) 10 - r ; La probabilidad de obtener el valor actual de la muestra 4 es: 10 P (4) = 4 p4 (1 - p) 6 = L (Func. verosim.) Entonces el Log de L es: 10

Log L = 4 + 4 Logh p + 6 Log (1 - p) y la derivada de este con respecto a p es: L / p = 0 + 4/p + 6/ (1 - p); haciendo esta ecuacin igual a cero (0) y se resuelve as p. p = 4/10 = 0.4; que es la media de la muestra obtenida. Propiedades del mtodo ML: Pueden ser sesgados, son consistentes y adems son invariantes. 3. Mtodo de los MINIMOS CUADRADOS (LS). Este mtodo no requiere especificar la frecuencia de la poblacin o su distribucin de probabilidades. En gentica cuantitativa los LS son estimadores suficientes ya que a menudo poseen estimadores insesgados con mminas varianzas. Los pasos a seguir para obtener un estimador de LS en un caso simple son: 1) Escribir el modelo general que describa a cada variable del estudio. Para simplificar este mtodo utilizaremos un modelo de regresin lneal: y = X b + e (notacin matricial) valor observado y = 0 + 1 Xi + i valor estimado = b0 + b1 Xi 2) Escribir la Suma de Cuadrados (SC) de la discrepancia entre y e y estimado: 2i = ( yi - )2 = 3) Minimizar esta diferencia, es decir, minimizar = ( yi - )2 (b0 , b1 ) = ( yi - b0 - b1 Xi )2 ; para minimizar se debe igualar a cero y despus calcular la primera derivada de cada ecuacin: / b0 = 2 ( yi - b0 - b1 X ) (-1) = 0 / b1 = 2 ( yi - b0 - b1 X ) (-X) = 0 ; resultando entonces: y xy Mnimos cuadrados: y xy se obtiene: y = b0 n/n + b1; simplificndose en b0 = y - b1 y ; = b0 n + b1 X = 0 = b0 X + b1 X2 = 0 = b0 - b1 X = 0 = b0 X - b1 X2 = 0

Resultando con estas las ecuaciones Normales de

Despejando b0 en la primera ecuacin dividiendo por n,

reemplazando b0 ahora en la segunda ecuacin, tendremos: xy = ( y - b1 _) X + b1 X2 xy xy b1 = (x y ) / n - b1 ( X)2/n + b1 X2 = (x y ) / n + b1 ( X2 - ( X)2/n ) xy - (x y ) / n = X2 - ( X)2 / n = Cov (X,Y) Var (X)

Siendo para este caso b1 el coeficiente de regresin. Calcular el estimador LS de la media de una poblacin binomial (10 observaciones de la muestra), donde 4 fueron 1 y 6 fueron = 0: Modelo Xi = p + i ; donde p es la media deseada.
10

SC de la diferencia:

2i =
i=1

( Xi - p )2 = SCE
i=1

Derivar con respecto al parmetro p: SCE / p = -2 ( Xi - p ) = -2 ( 4 - 10p) = 0 ; entonces p = 4/10 = 0,4 Nota: En la prctica se utiliza en mayor magnitud los estimadores de LS y slo ML en ocasiones muy determinadas. EJERCICIOS PARA RESOLVER 1. Calcule la probabilidad de obtener dos ases al tirar dos dados simultneamente seis veces. 2. Dada una muestra de cerdo de 5 meses de edad, de una poblacin con un valor para = 83 Kg y = 10 Kg. Cual es la probabilidad de que un cerdo de esta muestra pese 73 Kg. 3. Obtenga los mejores estimadores por el mtodo de mnimos cuadrados, utilizando matrices, de la siguiente, informacin entre dos variables productivas, donde la respuesta alcanzada en peso de embrin (y) depende del da de la gestacin en gatos (x): Y 52 40 33 20 10 X 60 50 28 16 12

REFERENCIAS BIBLIOGRAFICAS: BARRIA, N.; A. JARA; MARTINEZ, V. 2000. Gentica Cuantitativa Aplicada a Mejoramiento Animal. Apuntes Dpto. Fomento de la Produccin Animal. Facultad Cs. Veter. y Pecuarias. U de Chile. SOKAL, R.R. and F.J. ROHLF. 1981. Biometry. W.H. Freeman and Co. New York. USA. WHITE, T.L. and G.R. HODGE. 1989. Predicting Breeding Values with Applications in Forest Improvement. Kluwer Academic Publishers. The Netherlands.

GENETICA DE POBLACIONES Definicin: Una poblacin se define desde el punto de vista gentico para un carcter determinado como un grupo o conjunto de individuos de una misma especie que tienen la capacidad de reproducirse y dejar descendencia frtil, siendo fundamental el flujo o intercambio gnico entre ambas generaciones, lo que significa una mantencin del material gentico a travs de las generaciones mediante los gametos. El flujo gnico se genera desde los padres a los gametos posteriormente al cigoto y nuevamente a los padres, sucesivamente. Caracterizar una poblacin desde el punta de vista gentico es necesario reconocer si el carcter en estudio esta determinado por un locus con pocos genes o simplemente multignico, es decir, iniciar el estudio de un locus simple o del carcter determinado por un loci. Esta diferenciacin simplificada permite diferenciar el estudio ya sea por la Gentica cualitativa y/o cuantitativa, respectivamente. Obviamente, existen caracteres que no son muy fciles de enmarcar en una u otra gentica para su estudio, un ejemplo de ello corresponden al estudio de genes mayores en ciertas especies animales y en muchas enfermedades de origen gentico. Estructura gentica de una poblacin Para un carcter simple, donde el Genotipo de un individuo determina directamente el fenotipo, es decir, la ecuacin P (fenotipo) = G (genotipo) es la responsable del carcter, por ende no existen otros factores que puedan modificar la expresin del genotipo. Caracteres semejantes a lo establecido en los estudios realizados por Mendel. Genticamente significa un carcter simple determinado por un solo locus y por otro lado de manera muy simple que existen pocos genes en la poblacin para ese locus. Algunos de los caracteres que se encuentran en esta situacin, es decir, determinados por un nico gen, incluyendo los antgenos de clulas sanguneas y una extensa variedad de enfermedades. Esto significa que los individuos de una poblacin pueden diferenciarse visualmente (fcilmente) entre si generando varias clases fenotipcas, generando

cierta variabilidad entre los individuos, siendo estas diferencias determinadas por diferencias genticas entre los individuos, o sea entre los genotipos. Una condicin que responde a esta situacin corresponde al color de la capa en mamferos, que se debe a la presencia en el pelo y en la lana de grnulos pigmentados formados por melanina en un entramado proteco. Las melaninas se forman a partir de una serie de rutas metablicas que convierten el aminocido tirosina en eumelaninas (color oscuro) o feomelaninas (color claro). Las eumelaninas se describen a menudo como de color negro, aunque incluyen marrn. Las feomelaninas contienen azufre. Se describen a menudo como amarillas pero presentan un rango que va desde el amarillo claro hasta el rojo. Sin embargo, se reconoce que falta mucho por descubrir acerca del control gentico de la formacin de pigmentos, se acepta en general que al menos seis loci autosmicos, cada uno con mltiples alelos, controlan la produccin y distribucin del pigmento. El aspecto ms interesante de estos seis loci es que parecen existir en todos los mamferos. Aunque no todas las especies de mamferos presentan todos los alelos conocidos en cada locus, existen suficientes ejemplos de coloracin similar de capa y/o patrones de herencia similares en varias especies diferentes para presentar un cuadro convincente de homologa de los alelos para el color y el patrn de la capa entre especies. Un resumen de los seis loci se presenta en la Tabla 5. TABLA 5. Caractersticas de los seis principales loci que determinan el color de la capa en los mamferos. Todos los loci son autosmicos. Locus Smbolo Principales Efectos y modo de accin Alelos Controla la distribucin regional de Agut A Ay, Aw, A, at, a, ae
eumelanina y feomelanina en el cuerpo y en los pelos individuales. Afecta a la concentracin de eumelaninas. Este locus codifica una protena relacionada con la tirosina. Reduce la intensidad de la pigmentacin, primero la feomelanina y luego la eumelanina hasta que no queda nada en el homocigoto cc (albino). Este locus codifica la enzima tirosina. Diluye tanto la feomelanina como la eumelanina por aglutinacin de los grnulos de pigmento. Extiende la eumelanina o la feomelanina en la totalidad del cuerpo; el alelo e produce un jaspeado negro/amarillo. Este locus codifica el
hr

Marrn Albino

B C

Btr, B, b, b1 C, cch, ch, cs, ca,c

Dilucin Extensin

D E

D, d, dt Ed, E, ehr, e

receptor de la hormona estimulante de los melanocitos.

Dilucin de ojos de rosa

P, p, px

Afecta principalmente a los eumelanosomas, diluyendo los colores oscuros mucho ms que los ms claros. Este locus codifica una protena de transporte de membrana.

Se sabe que tambin otros loci son importantes en la determinacin del color y el patrn de la capa en ciertas especies. Por ejemplo, en gatos el locus autosmico Tabby (atigrado) tiene tres alelos, dando lugar a atigrados abisinios (Ta), atigrados rayados (T), y atigrados manchados (tb). Otro locus fcil de reconocer en gatos es el locus orange (naranja) ligado al cromosoma X, el cual da lugar al conocido color de capa carey (concha de tortuga). El alelo naranja, O, impide la expresin de aumelaninas de la misma manera que el alelo amarillo, A y, lo hace en el locus autosmico Agut. El alelo no naranja, o, permite la expresin normal de aumelaninas. Una situacin muy interesante ocurri en la raza de oveja Romney en nueva Zelanda, respecto a genes responsables de la calidad de la lana en estos animales. El velln tpico de Romney consiste en fibras de lana en su mayora no pigmentadas, que son slidas, y una minora de pelos, que presentan un centro hueco (llamado mdula) recorriendo el centro de la fibra. Tradicionalmente, ha habido una fuerte seleccin en contra de las fibras pilosas con mdula en la raza Romney de Nueva Zelanda. En 1931, en el fundo del Sr. Nielson, naci un carnero de pura raza Romney con un velln excepcionalmente piloso, animal cedido al profesor Dry, de la ahora Universidad Massey, quin demostr que la extrema pilosidad se deba a un alelo autosmico con dominancia completa actualmente designado como Nd (N de Nielson y d de Dry), que debe ser el resultado de una mutacin del alelo normal, no piloso, n. Los vellones de ovejas homocigotas para Nd presentan aproximadamente el 65% en peso de fibra con mdula, lo que es ideal para la manufactura de alfombras. Los heterocigotos (Ndn) presentan un nivel de pelos con mdula intermedia entre los dos homocigotos. Al no presentar pigmentacin y tener buenas propiedades de hilatura, la lana obtenida del alelo N d pronto alcanz popularidad en la manufactura de alfombras. El nmero de ovejas NdNd y Ndn fue incrementndose tan rpidamente como fue posible, dando lugar a una nueva raza llamada Drysdale, la cual es en la actualidad la base de una industria de lana de alfombras firmemente establecida. Otros genes de la lana de alfombras han aparecido de vez en cuando. Por ejemplo, el gen Nt, que es completamente dominante sobre n, ha dado lugar a otra raza de ovejas de lana de alfombras, la Tukidale. Y una mutacin en un locus

distinto en las ovejas Romney de Tasmania a dado lugar a la raza Elliottdale de ovejas de la lana de alfombras. Otro locus importante en ovejas es que corresponde al gen Booroola para la fecundidad, Fec (B), que es la causa principal de la prolificidad observada en la estirpe Booroola de las oveja Merino australiana. Este gen fue muy publicitado en 1993, cuando, despus de realizar anlisis de ligamiento que incluyeron ms de 100 marcadores microsatlite, se identificaron dos marcadores ligados a este gen. Anlisis posteriores, haciendo uso de las fuertes homologas cromosmicas que existen entre la oveja, el ganado vacuno, y los humanos, mostraron que el gen est localizado en el cromosoma 6. Tambin se ha descrito otro gen relacionado con la prolificidad en ovejas de Nueva Zelanda. Mientrs que el gen Booroola es autosmico, este nuevo gen, FecX(i) esta ligado al cromosoma sexual X (llamado gen de la fecundidad Inverdal). Lamentablemente, los homocigotos para FecX(i) presentan ovarios rayados no funcionales. Adems, la presencia o ausencia de cuernos puede ser atribuida a la accin de dos alelos en un locus autosmico, siendo la ausencia de cuernos (C) dominante sobre la presencia de cuernos (c). Muchas razas de animales domsticos presentan cuernos y son por lo tanto homocigotos recesivos (cc). Debido a ciertos problemas en la canal y dificultad en el manejo de animales con cuernos, los productores prefieren en general actualmente animales sin cuernos, presentando dificultades propias al seleccionar un gen dominante en la poblacin, siendo muy difcil obtener la homocigosis completa, porque el alelo recesivo (presencia de cuernos) permanece oculto (enmascarado) en los heterocigotos. Recin en 1993, se ha logrado la identificacin mediante cartografa de dos marcadores microsatlites ligados al gen en el ganado vacuno, localizndose en gen en el cromosoma 1. Un problema bastante inusual se presenta con el alelo para la ausencia de cuernos en cabras. En circunstancias normales en otras especies de mamferos, los individuos que presentan dos cromosomas X se desarrollan como hembras normales. Y tambin en cabras, los individuos XX que presentan cuernos (pp) o que son heterocigotas para la ausencia de cuernos (Pp) son hembras normales. Pero todas las cabras XX que son homocigotas para el alelo de ausencia de cuernos son intersexos. Adems, una proporcin de las cabras XY homocigotas para el alelo de ausencia de cuernos son cabras estriles. Este es un buen ejemplo de pleiotropa. Frecuencias genotpicas: Existiendo muchos otros locus autosmicos que en poblaciones animales poseen solo dos o tres genes, es muy fcil obtener una primera caracterizacin gentica de ese locus, mediante fenotipos diferenciables a consecuencia de estos genes y alelos diferentes. Un ejemplo simple, es lo observado en un rebao bovino de la raza Shorthorn, donde existen 3 clases fcilmente diferenciables de color del pelaje: animales rojos, roano y blancos. Este carcter se reconoce que

esta determinado por un locus autosmico, cuya expresin gnica no presenta interaccin (sin dominancia o aditivo) lo que esa diferenciacin fenotpica permite concluir que los animales rojos son homocigotos para el alelo R, es decir genticamente RR, los animales heterocigotos corresponden entonces al grupo roano (Rr; mezcla de pelo color rojo y blanco) y finalmente los animales blancos al grupo genticamente reconocido como homocigoto recesivo (rr). Si Ud. posee estos antecedentes y observa a 1300 animales en una poblacin de bovinos Shorthorn y las clases fenotipcas en la siguiente cantidad: 286 animales rojos; 650 animales roanos y en cambio existen 364 animales blancos. Con esta informacin ya podemos obtener el primer parmetro gentico para esa poblacin, es decir, las frecuencias genotpicas, siendo: RR = 286/1300 = 0,22; de los genotipos heterocigotos la frecuencia sera igual a 650/1300 = 0,50 (Rr) y la frecuencia del genotipo blanco (rr) igual a 364/1300 = 0,28. Estas sern denominadas por letras maysculas, inicindose por P siempre para los homocigotos dominantes (RR), Q para los homocigotos recesivos (rr) y siempre a los heterocigotos se les denomina por la letra mayscula H (Rr), obviamente la suma de estas frecuencias genotpicas siempre debe ser igual 1 (P + H + Q = 1). Frecuencias gnicas Corresponde al porcentaje o frecuencia de cada gen existente en ese locus en la poblacin respecto del total de genes de la poblacin, y siempre se denominan solo por letras minsculas arbitrariamente inicindose siempre por p, para el alelo dominante en ese locus, en cambio para el resto de los genes son designados por las letras minsculas siguientes. Su determinancin es fundamental de obtenerla en la poblacin, por que este parmetro gentico poblacional, es el ms importante, ya que se refiere a la frecuencia de cada uno de los genes que posee la poblacin de animales en ese locus y adems es lo que se transfiere de padres a hijos. Ya con la informacin del locus del color del pelaje de los bovinos Shorthorn, es decir, con las frecuencias geniotpicas se puede obtener las frecuencias de ambos genes en ese locus autosomal. Siendo p la frecuencia del gen dominante R, designada por p y calculada en trminos simples con el total de genes R que existen en la poblacin para ese locus, estos estn en un 100% en los animales homocigotos dominantes y siempre en un 50% en cada tipo de heterocigoto que exista en la poblacin con ese gen. Una forma simple de calcular dicha frecuencia gnica del gen R (rojo), designada por p, sera reconocer que los animales rojos (RR) cada uno tiene 2 genes R en ese locus (uno paterno y otro materno) por ende el total de genes aportados por estos homocigotos dominantes es de 286x2 = 572 genes rojos, adems es evidente que los animales heterocigotos, solo lleva cada uno en su genotipo un gen R y otro r (blanco), por ende su contribucin respecto del total de genes rojos de la poblacin es de 650 genes rojos y tambin 650 genes blancos.

Por lo tanto, reconociendo que en esa poblacin de 1300 animales existen en ese locus 2600 genes, la frecuencia del gen rojo R (p) se podra obtener de los siguientes aportes: 572 genes desde los homocigotos dominantes adems de los 650 genes rojos aportados por los animales heterocigotos, osea en esa poblacin existen 1222 genes rojos de un total de 2600, equivale entonces a una frecuencia de p = 0,47. Como en ese locus solo existen dos genes diferentes (R y r) la frecuencia del otro gen (recesivo r) se designa por q y se puede obtener directamente por (1 p), es decir, q = 0,53. Equivale a reconocer que los animales homocigotos recesivos aportan 728 genes blancos (364x2) ms los 650 genes blancos de los animales heterocigotos, osea, significa que la frecuencia del gen recesivo q ser igual a 1378/2600 = 0,53. Es claro reconocer como siempre que la suma de las frecuencias siempre debe ser igual a 1, en este caso tambin p + q = 1,0. Reconociendo que esta situacin es general para cada locus a estudiar en una poblacin, las frecuencias gnicas se pueden calcular fcilmente con solo conocer las frecuencias genotpicas de P, H y Q. Simplificando que la frecuencia del gen dominante R (p) es aportada siempre por un 100% de los animales homocigotos dominantes (P) + el 50% de los animales heterocigotos que portan ese mismo gen (1/2 H), por lo tanto, p = P + H, es decir, 0,22 + 0,50 = 0,47. Por ende, tambin la frecuencia gnica del alelo recesivo blanco r, ser igual a q = Q + H, es decir, 0,28 + 0,50 = 0,53. Lo que equivale a que en esa poblacin el 53% de los genes son blancos y el 47% son genes rojos (R) en ese locus. Ambos parmetros son fundamentales para caracterizar, para ese locus en particular, la poblacin a estudiar desde el punto de vista gentico, siendo la frecuencia gnica el parmetro determinante de la diferencia gentica entre poblaciones, en un mismo locus. La estimacin de estos parmetros genticos de una poblacin se extienden para cada locus donde pueden existir ms genes en la poblacin, es decir, si en un locus (A) para un carcter determinado son 3 alelos (A1, A2, A3) diferentes, la frecuencia genotpica de cada genotipo ser designada por: P para los genotipos (animales) A1A1; Q para los A2A2 y R para los A3A3; en cambio para los heterocigotos existentes son H1 para los animales A1A2; H2 para el genotipo A1A3 y finalmente H3 para los animales con genotipo A2A3. Es decir en la poblacin deben existir 6 genotipos diferentes si en un locus son tres alelos que determinan el carcter. Por ende, se podra conocer si en un locus existiesen 12 alelos diferentes cuantos genotipos distintos deben existir mediante el uso de la siguiente sucesin: (n (n+1))/2, donde n corresponde al nmero de alelos en un locus, en este caso deben existir en la poblacin 78 genotipos diferentes en la poblacin para ese locus. Obviamente, la suma de las frecuencias genotpicas es igual a 1 (P + Q + R + H1 + H2 + H3) y las frecuencias gnicas se designaran, por lo tanto, p para el

alelo A1; q para el A2 y r para el alelo A3, sumando 1 (p + q + r). Aplicando los conceptos para calcular la frecuencia gnica de un alelo se necesita solo conocer las frecuencias genotpicas, es decir, p podra obtenerse mediante la expresin: p = P + H1 + H2. Poblacin en Equilibrio de Hardy-Weinberg Toda poblacin evaluada para un locus simple si se cruzan al azar una poblacin infinita de animales, se debe mantener las frecuencias genotpicas y gnicas a travs de las generaciones, siendo las frecuencias genotpicas por ejemplo, para un locus (A) con solo dos alelos (A y a) dependientes de las frecuencias gnicas (gametos) en p2 los genotipos homocigotos descendientes AA; 2pq para los descendientes heterocigotos Aa y q2 para los descendientes homocigotos recesivos aa. Esta condicin fue establecida por el matemtico ingls Hardy y el mdico alemn Weinberg, el ao 1908, adems la idea fundamental es que la distribucin gnica en grandes poblaciones y sin seleccin, la frecuencia relativa para cada alelo en la poblacin tiende a permanecer constante de generacin en generacin, cuando los apareamientos son aleatorios, adems esta condicin tambin asume, que los factores que producen cambios de las frecuencias gnicas, por su accin, propiamente tal no intervengan en forma muy determinante, tales como: mutacin, migracin y la seleccin natural. Obviamente el equilibrio de Hardy-Weinberg, postula entonces que las poblaciones se mantienen sin mayores cambios, despus de los apareamientos aleatorios, en la mayora de los genes. Para satisfacer esta ley de Hardy-Weinberg, la proporcin de los distintos tipos de gametos producidos en ella es proporcional de manera directa con sus frecuencias gnicas respectivas; as en el ejemplo de la poblacin de bovinos de la raza Shorthorn, donde p fue = 0,47 y q = 0,53, la frecuencia gamtica en esa poblacin sera la misma, es decir, para el gen R = 0,47 y para el gen r = 0,53. Si esta poblacin grande se cruzase al azar, sin seleccin, mutacin y migracin, la frecuencia de cada alelo tiende a permanecer constante; y la frecuencia de los descendientes (cigotos) en proporcin a las frecuencias gnicas al cuadrado de esas frecuencias gnicas, osea, como el binomio al cuadrado (p + q) 2 = RR en p2 + Rr en 2pq + rr en q2. Con este ejemplo deberamos esperar que la frecuencia genotpica de los animales rojos fuera de 0,472 = 0,2209 o un 22,09% de los 1300 animales ser rojos (287 aproximadamente), los heterocigotos roanos en una frecuencia de 2x0,47x0,53, es decir, 0,4982 o un 49,82% de los animales roanos (647 animales aproximadamente) y en cambio los animales blancos (homocigotos recesivos) en 0,532 que equivale a 0,2809 o un 28,09% de los animales blancos. Esta ley permite proyectarla a ms alelos en cada locus, es decir, si existiesen 3 alelos en un locus, el equilibrio de Hardy-Weinberg consiste que las frecuencias gnicas seran p, q y r, para los alelos A1, A2 y A3, respectivamente. As si se cruza la poblacin grande aleatoriamente los descendientes deberan

alcanzar las siguientes frecuencias genotpicas (p + q + r)2: en p2 los descendientes A1A1; en q2.los A2A2 y en r2 los A3A3; en cambio los heterocigotos en 2pq los descendientes A1A2; en 2pr los descendientes A1A3 y finalmente en 2qr los descendientesA2A3. Este caso de alelos mltiples, ocurre en el caballo, donde existen tres formas distintas de la enzima glucosa 6-fosfato deshidrogenasa (G6PD), que corresponden a los tres alelos D, F y S del locus G6PD. Naturalmente, un caballo dado puede tener como mximo solamente dos alelos diferentes. Pero en una muestra grande de caballos se encontraran probablemente los tres alelos y se puede estimar la frecuencia de cada uno de ellos, mediante el equilibrio de Hardy-Weinberg. El apareamiento aleatorio, tambin se denomina como panmixia en poblaciones grandes. Sin embargo, la ley de Hardy-Weinberg tiene los siguientes supuestos: 1) las tasas reproductivas y de supervivencia son iguales para todos los individuos de la poblacin con los respectivos genotipos; 2) el apareamiento es aleatorio; 3) la mutacin es poco frecuente y 4) la poblacin debe ser lo suficientemente grande para que los errores de muestreo resulten insignificantes. Todos estos supuestos garantizan que las frecuencias gnicas no cambien a travs de las generaciones.

Aplicaciones del equilibrio de Hardy-Weinberg Se pueden resumir que el equilibrio de Hardy-Weinberg tiene 3 grandes aplicaciones, para genes autosomales: 1) Permite conocer la frecuencia gnica de un gen recesivo, cuando existe dominancia completa de un gen sobre otro, lo que determina que no se puede diferenciar en forma evidente a los individuos heterocigotos de la poblacin, en cambio con esta propiedad, se conoce que los homocigotos recesivos deben estar en una frecuencia genotpica de q2, el desear conocer la frecuencia del gen recesivo permite asumir que q2 = Q, por ende q = Q, en equilibrio de Hardy-Weinberg. Una buena aplicacin sera el reconocer la frecuencia gnica de un recesivo responsable por ejemplo de una enfermedad gentica, como la atresia anal en cerdos, falta de orificio anal al nacer (determinada por un locus con solo dos alelos), donde los animales enfermos son fcil de identificar y se encuentran en muy baja frecuencia, osea si 12 animales nacidos de 4800 en un plantel, indica que los homocigotos recesivos tienen una frecuencia genotipca de 12/4800 = 0,0025, lo que asegurara si la poblacin para ese locus se cruza aleatoriamente la frecuencia gnica del gen recesivo no deseable sera igual a 0,0025, es decir, 0,05; lo que significa que el 5% de los genes en esa poblacin son recesivos.

2)

Adems, el equilibrio permite estimar la frecuencia de individuos portadores (heterocigotos) en caso de tratarse de una interaccin de dominancia completa de un gen sobre otro, lo que no permite diferenciar a los portadores de genes recesivos, por no presentar el problema gentico, en cambio, si la poblacin para ese locus simple estuviera en equilibrio de Hardy-Weinberg, los heterocigotos deberan encontrarse en una frecuencia genotpica igual a 2pq (un locus con solo dos alelos), lo que permite, aplicando la aplicacuin anterior para conocer la frecuencia gnica del gen recesivo, los heterocigotos podran ser obtenidos mediante la ecuacin: 2 (1 q) q, es decir, 2 x (1 0,05) x 0,05 = 0,095, lo que significara en el ejemplo de la atresia anal en cerdos 456 animales portadores de ese gen recesivo no deseable. Obviamente, una aplicacin fundamental es poder asegurar si una poblacin cualquiera se encuentra ya en equilibrio de HardyWeinberg o no, para ello se usa la prueba de Ji-cuadrado (X 2), que permite comparar clases genotpicas observadas versus las clases genotpicas esperadas. La base de la prueba de hiptesis se refiere a: H0 (nula): Oi = Ei (clases genotpicas), considerando que las clases esperadas deben ser las frecuencias genotpicas esperadas de equilibrio de cada clase determinada; versus la Ha (alternativa): Oi Ei, en caso de aceptar esta hiptesis indicara que las frecuencias genotpicas de todas las clases genotpicas no corresponden a las esperadas en equilibrio de Hardy-Weinberg. Una aplicacin sera, el ejemplo del color de la capa en ganado bovino Shorthorn, donde se encontraron de un total de 1300 animales, 286 animales rojos, 650 animales roanos y a 364 animales blancos: Las frecuencias genotpicas observadas en la poblacin son: RR = 0,22; Rr = 0,50 y rr = 0,28; lo que determin que las frecuencias gnicas del alelo R fuera 0,47 y del alelo r = 0,53. La frecuencia genotpica esperada en equilibrio de Hardy-Weinberg para cada una de las clases genotpicas sern: RR = 0,472 = 0,2209; Rr = 2x0,47x0,53 = 0,4982 y rr = 0,532 = 0,2809. Con estas frecuencias esperadas se debe construir la prueba de X2, para as generar el nmero de animales esperados de cada clase genotpica, para compararlas con el nmero de animales observados, para ello es necesario multiplicar la frecuencia genotpica esperada en equilibrio x el total de animales de la poblacin. La tabla 6 entrega los clculos de la prueba de Ji-cuadrado. TABLA 6. Resultados de la prueba de Ji-cuadrado.

3)

GENOTIPOS

OBSERVADO

ESPERADO (Oi Ei)

(Oi Ei)2/Ei

RR (rojo) Rr (roano) Rr (blanco) TOTAL

286 650 364 1300

287,17 647,66 365,17 1300,00

-1,17 2,34 -1,17

0,0047686 0,0084544 0,0047686 = 0,01799

El resultado de X2 calculado expresa la suma de 0,01799, debe ser comparado con el X2 tabular, con grados de libertad que deben ser calculados de la siguiente forma: gl = K - p 1, donde K es el nmero de clases que se comparan; p es el nmero de parmetros que se calculan con los datos para realizar las comparaciones y 1 es una condicin constante. En este ejemplo los grados de libertad son 1 (3 1 1), al obtenerlo de la tabla de X2 es igual a 3,84 con un nivel de confianza de 95% ( = 0,05). En este caso 3,84 es mayor a 0,01799, es decir, se acepta H0: Oi son iguales a las clases Ei, lo que significa que la poblacin se encuentra en equilibrio de Hardy-Weinberg. Como una posibilidad de compresin y aplicacin de esta matera se exige al alumno a caracterizar esta situacin en el caso de genes ligados al sexo, quiere decir, que el alumno debe desarrollar lo que ocurre cuando el gen se encuentra en un cromosoma sexual (X). Recuerde que para estos genes debe reconocer que los genes son aportados en forma muy diferente segn el sexo del animal. En mamferos los machos (Xy) solo pueden llevar un solo gen en ese locus y por ende no existen genotipos homocigotos ni heterocigotos, sino que ahora se denominan hemicigotos, ya que los machos sern para ese locus (Ay o ay, en el caso del locus A con solo dos alelos A y a), esta situacin se invierte ya que los machos en aves y reptiles son XX. CAMBIOS DE LA FRECUENCIA GNICA EN UNA POBLACIN Una poblacin para un locus determinado podra producir cambios y por ende producir efectos genticos importantes en los parmetros genticos de la poblacin, osea, cambios en la frecuencia gnica; las fuerzas que influyen sobre la frecuencia gnica, a menudo se encuentran en perfecto balance. La frecuencia gnica es el resultado del equilibrio entre seleccin, mutcin, migracin y azar. Wright resume el efecto de estas fuerzas sobre el cambio evolutivo y brinda la base para interpretar sus efectos en las frecuencias gnicas de las poblaciones de ganado (ver Legates y Warwick, cpitulo 6). Cada una de estas fuerzas se describirn su importancia sobre el cambio de la frecuencia gnica de una generacin a otra, mediante el denominado delta q (/\q = q1 q0) Mutacin La mutacin es la nica fuerza que genera variabilidad gentica en las poblaciones, por la creacin de genes mutantes nuevos sin necesariamente conocer su efecto en un individuo ni en la poblacin, siendo las que determinan el proceso evolutivo de las especies. Su permanencia o eliminacin est estrechamente asociada a la seleccin.

La mutacin gnica se define como cualquier cambio sbito en la estructura de un gen que determine un efecto gentico, es decir, incluso el cambio de una base en la secuencia de aminocidos podra determinar un nuevo efecto sobre la funcin definida para ese gen, ser una mutacin. Adems un a mutacin siempre es aleatoria (sbita) en su efecto, es decir, las mutaciones no se pueden asegurar previamente si sern positiva, negativa o neutra, slo una vez que ocurren deben sufrir un proceso de adaptacin a largo plazo para definitivamente permanecer y llegar a producir un cambio significativo de la frecuencia gnica en la poblacin. En general las tasas de mutacin son muy bajas y fluctan entre 10 -4 y 10-8, siendo levemente ms alta desde un gen silvestre a uno mutante (u), que de uno mutante al gen silvestre (v), pero son todas muy escazas y adems, algo especficas de cada locus, dentro del cromosoma. Para que exista una mutacin debe ocurrir este cambio en la lnea gametognica, ya que estos son heredables, no aquellos que pueden ocurrir en clulas somticas indiferenciadas o diferenciadas. Estos factores (aleatorias, baja frecuencia, especficas, etc), son los que determinan que en general la mutacin no es responsable en gran medida de la variabilidad a corto plazo en las poblaciones, es decir, se producen de una generacin a otra un cambio muy pequeo o poco importante en las poblaciones. Las mutaciones en ambos sentidos o retromutacin son las determinantes, en general explican que la magnitud del cambio por generacin de la mutacin es siempre poco significativo, ya que adems debe el nuevo gen verse favorecido para permanecer a la seleccin. Una demostracin que el /\q es generalmente muy pequeo se puede definir por la siguiente expresin: /\q = up qv ; el equilibrio entre las dos tasas de mutacin, en ausencia de otros factores que causen cambios, ocasiona que la frecuencia de los genes en la poblacin disminuya, o aumente o permanezca estable. En situaciones donde se permite a las tasas de mutacin buscar su propio equilibrio, el /\q = 0, en ese punto el q del equilibrio sera igual a u / (u+v), quiere decir que slo depende de las tasas de mutacin. Por lo tanto, la mutacin tiene una parte importante en la formacin de nuevas variaciones a largo plazo, lo que permite que la poblacin se adapte a los cambios ambientales. La mayor parte de las mutaciones tienen una tasa muy baja y lo ms destacable es cuando son de efecto dainos (negativa), no se considera que tengan mucha potencia, como fuerza para cambiar las frecuencias gnicas de las especies importantes en la econmia. Es difcil aumentar su frecuencia en selecciones iniciales por su naturaleza recesiva en general. Sin embargo, algunas mutaciones en nuestras especies productivas han sido detectadas y de inters para el hombre y la seleccin a permitido aumentar la frecuencia de esos genes, eliminando a veces genes que posteriormente podran haber sido de mayor importancia.

Otra importancia de las mutaciones son en el sentido mdico, ya que determinan predisposicin gentica a ciertas enfermedades, enfermedades hereditarias propiamente tales, como defectos bioqumicos y malformaciones, y cuando afectan a clulas somticas, pueden determinar enfermedades auto-agresivas, como por ejemplo el lupus eritematoso y por supuesto tambin el cncer. Migracin La introduccin de nuevos genes en una poblacin hace posible cambios en la frecuencia gnica, pero la condicin determinante es que estos nuevos individuos que llegan a la poblacin deben participar activamente en la reproduccin, es decir, integrar y mezclar sus genes con los de la poblacin nativa. En el mejoramiento de las cosechas se utilizan introducciones extensivas, pero en poblaciones de ganado puro la prctica no es importante. En la mayora de las razas puras, los registros cerrados imponen la barrera del pedigree, lo limita la entrada de nuevos genes, aunque en los ltimos aos hubo un poco menos de restriccin. Cualquier cambio que produzca la migracin depende de la frecuencia gnica del gen en la poblacin inmigrante y de que tanto se les permita propagarse, es decir, que proporcin (%) de gametos pueden aportar los inmigrantes. En general entonces, el cambio de la frecuencia gnica (/\q) depende de cuan grande es la diferencia de la frecuencia gnica para el mismo gen entre la poblacin inmigrante y la nativa, adems de que porcentaje de inmigrantes participen activamente en el intercambio de gametos (/\q = M (qM qN) ), siendo M el porcentaje de inmigrantes a la poblacin nativa, qM la frecuencia gnica del alelo recesivo de los inmigrantes y qN la frecuencia gnica del mismo gen en la poblacin nativa, o igual a q0. Hay varios ejemplos de importacin de animales para introducir genes que determinan rasgos especficos. A principios del siglo 20, se introdujo ganado ceb en las poblaciones de ganado de carne en Texas y otros estados del Golfo de Mxico, por su resistencia a las altas temperaturas y a la fiebre de garrapatas, as como su capacidad para aumentar de peso a pesar de la mala calidad del forraje nativo. Muchas razas nuevas son combinaciones de razas europeas y ceb, por ejemplo, Santa Gertrudis, Brangus, Charbray y Beefmaster. Otro ejemplo interesante es la introduccin de cardos Landrace daneses, en el decenio de 1930, para aportar genes que mejoraran la calidad del tocino y el tamao de las camadas en las razas norteamricanas de cerdos. En un sentido ms estricto, algunos rebaos de raza pura sirven como fuentes de genes. Se debe considerar la compra de estos animales para usarlos en rebaos comerciales, como la seleccin de toda la raza. Sin embargo, en rebaos individuales, es comparable a la migracin, ya que hace posible la introduccin de nuevos genes a partir de pios de animales en pie.

Seleccin Natural La seleccin es uno de los factores cuyo efecto principal es reducir la variabilidad gentica y se caracteriza por tener siempre una direccin previamente establecida, es decir, siempre opera a favor de un determinado gen, genotipo o fenotipo a travs de las generaciones. Por lo tanto, la seleccin sera la fuerza directriz a favor o en contra de ciertos genes, genotipos o fenotipos. Definicin: la seleccin corresponde a un diferencial reproductivo entre los individuos de una poblacin, si este diferencial reproductivo lo determina el hombre, estamos frente la a seleccin artificial, en caso contrario se atribuye ese diferencial a la seleccin natural. En ambos casos los efectos de la seleccin son semejantes. La seleccin puede operar sobre el fenotipo, o genotipo y tambin sobre los genes. Si la seleccin opera inicialmente sobre el fenotipo de los animales, es interesante establecer los cambios producidos en los genotipos y a travs de ellos sobre la frecuencia gnica. La seleccin natural principalmente actua ya sea generando diferencia en fertilidad de los padres y/o por producir diferencia entre la viabilidad de los descendentes producidos. Lo que genera obviamente en cada individuo de la poblacin individuos que comparativamente a otros sern los de mayor adaptabilidad, es decir, cuantificar estas diferencias en fertilidad y/o en viabilidad se puede cuantificar mediante el denominado valor adaptativo de cada fenotipo, o genotipo o gen de la poblacin, lo que genera este diferencial de adaptabilidad. El valor adaptativo o fitness (Wi) de cada fenotipo, genotipo o gen, permite cuantificar de una generacin a otra el cambio principalmente de la frecuencia gnica. Se determina como valor adaptativo relativo de cada genotipo, donde inicialmente debe idntificarse al ms adaptado de la poblacin designndole el W mximo (1 o 100%) y al resto de los genotipos designarle una Wi en relacin al de mayor adaptabilidad. El cambio de la frecuencia gnica (/\q) por seleccin natural depende de tres factores: 1) frecuencia gnica inicial de la poblacin 2) valor adaptativo de cada individuo (genotipo o gen), y 3) del grado de dominancia o modelo de interaccin gnica dentro del locus. Para demostrar la importancia de la seleccin en el cambio de la frecuencia gnica, es conveniente definir el trmino de coeficiente de seleccin, que corresponde a la seleccin en contra de cada fenotipo (genotipo o gen) y se designa por s y no es ms que el valor reciproco del valor adaptativo, es decir, si = (1 Wi).

Para establecer la magnitud del /\q por seleccin natural es necesario definir los diferentes grados de dominancia existentes en un locus, asumiendo un locus (A) con dos alelos (A y a), los ms clsicos son: Escala de valores adaptativos cada Genotipo (Wi) 1) Aditivo o Sin Dominancia. Valor adaptativo (Wi) AA Aa aa 1 1s 1s

2)

Dominancia completa del gen A sobre a. Valor adaptativo (Wi)

Aa AA aa 1 Aa AA aa 1s

3)

Sobredominancia o Seleccin a favor de Heterocigotos. Valor adaptativo (Wi)

(1 s1) (1 s2)

4)

Seleccin contra un Dominante. Valor adaptativo (Wi)

Aa AA aa (1 s) 1

Para comprender cmo acta la seleccin en la prctica, empezaremos por considerar a la poblacin de perros Labrador, donde los criadores tienden a favorecer perros con capa de color amarillo o dorado. Esta situacin inicial correspondera a un ejemplo tpico de seleccin artificial y equivaldra a una seleccin contra el fenotipo dominante (modelo 4). La representacin de esta situacin determina que el genotipo de mayor adaptabilidad seran los animales homocigotos recesivos (ee), correspondindole W = 1, es decir una presin de seleccin en contra igual a 0, en cambio, los genotipos que sern afectados en contra por la seleccin sern asignados con un valor adaptativo igual a (1 s), siendo s el porcentaje de presin en contra. La representacin esquemtica favorece la explicacin de cmo obtener p1, osea, la frecuencia gnica del gen dominante despus de una generacin de

seleccin, para posteriormente determinar la magnitud del cambio de la frecuencia gnica (/\p). Seleccin contra gen dominante GENOTIPO TOTAL EE Ee ee Frec. Genotpica Antes de seleccin: p2 2pq q2 = 1 Dominante Valor adaptativo (Wi): (1 s) (1 s) 1 Proporcin despus la seleccin: p2(1 s) 2pq(1 s) q2 = 1sp(2-p) Si desea determinar cual es la frecuencia del alelo dominante despus de la seleccin, puede aplicar los conocimientos previos para ello, donde la frecuencia gnica de p = P + H, pero, en este caso, dividido por el nuevo total, siendo: p1 = (p2(1 s) + pq(1 s)) / 1sp(2 - p); Con esta expresin de la nueva frecuencia gnica (p1) podemos calcular el cambio de la frecuencia gnica (/\p) debido a la seleccin, es decir: (p 0 p1). Esta nueva expresin se simplifica en /\p = -sp (1 p2)/ (1 sp(2 p)). La expresin del /\p nos muestra que el cambio de la frecuencia gnica causada por la seleccin contra un fenotipo dominante depende tan slo de dos factores: la intensidad o coeficiente de seleccin (s) y de la frecuencia gnica previa a la seleccin. Introduciendo valores de estos dos parmetros en la ecuacin, puede verse que la seleccin en contra un fenotipo dominante puede llevar a disminuciones considerables de la frecuencia del alelo dominante, es decir, este /\p negativo, nos indica la direccin del cambio. Si la seleccin fuese muy intensa, el alelo dominante sera eliminado con rapidez de la poblacin. En un caso extremo en que la seleccin fuese completa, es decir, cuando los animales EE o Ee no contribuyan a la siguiente generacin, osea, s = 1, entonces la expresin anterior se reduce a /\p = -p, lo que significa que la frecuencia gnica ser cero despus de una sola generacin de seleccin, lo que es por supuesto lo que se espera ya que en esta situacin extrema ninguno de los alelos E pasa a la siguiente generacin. En esta extrema situacin se demuestra que a futuro el p del equilibrio sera igual a cero, osea, que el q de equilibrio sera = 1, ya que la poblacin a partir de ese momento no cambiar la frecuencia gnica. Siguiendo esta demostracin se puede generalizar que los /\q para cada una de las situaciones, asumiendo que la seleccin se inicia en una poblacin en equilibrio de Hardy-Weinberg, se resumen en la Tabla 7. TABLA 7. /\q para diferentes modelos de dominancia MODELO DE DOMINANCIA /\q despus de la seleccin

Sin dominancia o Aditivo

- sq (1 q) 1 - sq - sq2 (1 q) ( 1 sq2) - pq (s1 p s2 q) 1 s 1 p s2 q

Dominancia completa (A sobre a)

Sobredominancia

Seleccin a favor de los heterocigitos Una condicin muy importante se destaca en el caso de seleccin a favor de heterocigotos (modelo de sobredominancia), donde el fenotipo (genotipo) de mayor adaptabilidad es el heterocigoto y ambos homocigotos (dominantes y recesivos) son afectados por la seleccin en contra, pero generalmente en proporciones muy diferentes, es decir, s1 s2, siendo s1 la seleccin en contra de los homocigotos dominantes y s2 en contra de los homocigotos recesivos. Esta condicin determina en su efecto una condicin de equilibrio de las frecuencias gnicas muy especial. Por ejemplo en un caso extremo, donde ambos homocigotos no pasen sus genes a la siguiente generacin (letalidad completa ambos homocigotos), es decir, solo se reproduciran los heterocigotos entre s, generando una frecuencia gnica, para *el alelo recesivo en equilibrio de 0,5 (tambin para p, alelo dominante). Adems en caso menos extremo, en que ambos homocigotos presenten una adaptabilidad parcialmente reducida en la misma magnitud, la frecuencia gnica de equilibrio, tambin sera 0,5 para ambos alelos. Sin embargo, si un homocigoto tiene una adpatabilidad menor que el otro, entonces la seleccin ser menos intensa contra el gen cuyo homocigoto tiene una mayor adaptabilidad, en este caso la frecuencia gnica de q en equilibrio ser obtenida con la siguiente expresin: qe = s1 / (s1 + s2). Por ejemplo si un homocigoto es slo un 10% menos adpatable que el heterocigoto (s1 = 0,10), mientrs que el otro es letal (s2 = 1,0) la frecuencia gnica de equilibrio del gen letal ser = 0,09 (0,10 / 1,10).

Tamao finito (pequeo) de la poblacin

Una factor que juega un rol muy determinante en producir grandes cambios de las frecuencias gnicas de una generacin a otra, se refiere al caso de poblaciones de tamao muy pequeo o finitas, especialmente esta condicin se establece en muchas poblaciones naturales, cuyo tamao natural est muy limitado, como as tambin en especies en vas de extincin y lo ms dramtico ocurre en el manejo indebido que realiza el hombre en preservas ciertas cualidades a una especie y/o raza para fijar esta condicin desde el punto de vista gentico, un ejemplo evidente de esta manipulacin (seleccin) son a veces los productores de muchas razas exgenas que son incorporadas como mascota por su belleza fenotpica y/o por su extravagancia en algunos caracteres como el color, tamao, tipo de pelaje, etc. Los efectos genticos en el caso de poblaciones finitas sern analizados por su gran impacto en producir cambios de las frecuencias gnicas, es decir, dentro de todos los factores en alterar el equilibrio de Hardy-Weinberg, este es uno de los de mayor impacto en el cambio, que como se describir no siempre es en beneficio de la especie, raza, lnea y/ o subpoblacin. Recordemos que los individuos de una generacin particular, son formados a partir de 2N gametos de la generacin precedente (padres). Solamente cuando el N es infinito podemos estar seguros que los gametos representan perfectamente el pool de genes parentales. En cambio, en poblaciones de N finito los gametos que se llevan (portan) son una muestra al azar de los genes del pool parental, por ende estan sujetos a Error de muestreo. De ah que las frecuencias gnicas, en las poblaciones pequeas, sufren lo que se denomina, el proceso dispersivo que es predecible solo en magnitud y no en direccin. La frecuencia gnica del alelo recesivo (q), por ejemplo puede cambiar n cada generacin sucesiva por azar, aumentando o disminuyendo dependiendo del valor dado por la generacin previa de manera aleatoria debido a Muestreo gamtico, y este cambio aleatorio determina una proceso dispersivo de las frecuencias gnicas. Las consecuencias del proceso dispersivo se pueden agrupar de 4 maneras: 1) Deriva gnica: cambio aleatorio de las frecuencias gnicas de generacin en generacin. 2) Diferenciacin entre subpoblaciones: en la naturaleza raramente existen poblaciones grandes, donde se parean entre todos aleatoriamente, ya que frecuentemente se presentan subdivididas en subpoblaciones, debido a que sus apareamientos se hacen con mayor

frecuencia entre individuos que se encuentran en la misma rea (vecinos), estos grupos locales o subpoblaciones comienzan a diferenciarse ya que al encontrarse aisladas sufren el proceso dipersivo, lo que determina que las diferencias en las frecuencias gnicas aumenta. 3) Uniformidad dentro de subpoblaciones: la variabilidad gentica se disminuye a medida que transcurren las generaciones, siendo as los individuos cada vez ms semejantes, desde el punto de vista genotpico, es decir, de generacin en generacin, se va perdiendo informacin gentica. 4) Aumenta la homocigosis: los individuos homocigotos aumentan a expensas de los heterocigotos. Este proceso dispersivo se puede analizar de 2 formas y derivar as sus consecuencias: a) b) Proceso Muestreo aleatorio: describir sus cambios en trminos de la varianza muestreal. Proceso Endogmico (Consangunidad): describir sus cambios genotpicos resultantes de apareamientos entre individuos emparentados.

a) Proceso Muestro Aleatorio El muestreo aleatorio de genes opera tanto a nivel de gametos como a nivel de cigotos. Para un anlisis simplificado, es necesario definir a una poblacin ideal en un inicio del proceso, por lo tanto, la poblacin base debe ser grande, que se pueda subdividir en varias subpoblaciones y/o lneas, y/o familias, sujetas al proceso dispersivo. Se analizar el comportamiento de un locus a travs de diferentes lneas (o varios loci en una misma lnea), ya que al mantener las siguientes condiciones su efecto es semejante en la poblacin. Las condiciones que simplifican a una poblacin ideal que ser subdividida en varias lneas: 1) Apareamiento aleatorio solo entre individuos de una misma lnea (no habr migracin). 2) No habr sobreposicin de generaciones. 3) Nmero de individuos a aparearse por lnea es igual en cada lnea y en cada generacin en todas las lneas. 4) Apareamiento aleatorio (incluido autofertilizacin) dentro de cada lnea. 5) No hay efecto importante de la seleccin. 6) No habr mutacin que pudiera producir cambios de las frecuencia gnicas.

Dentro de cada lnea el nmero de gametos que se produce es potencialmente muy grande y se aparean al azar para formar un nmero determinado (restringido) de individuos, para originar una generacin; pero el nmero de individuos por generacin es limitado y el nmero de individuos que alcanza a reproducirse ser uno por cada padre o 2 progenies por pareja (Nmero de individuos se mantendr constante). Por lo tanto, debe cumplirse adems que la frecuencia gnica de la poblacin es igual al promedio de la frecuencia gnica de todas las lneas. Siendo el muestreo aleatorio de genes y/o cigotos, es fundamental evaluar a este proceso mediante la varianza de la frecuencia gnica. Varianza de la frecuencia gnica Solo se puede predecir la magnitud del cambio y no su direccin y esto se hace mediante la varianza del cambio de la frecuencia gnica, debido a que este cambio es aleatorio. Varias lneas extraidas al azar de la poblacin base y cada uno con N individuos, donde cada individuo posee 2 alelos en cada locus. Por lo tanto, cada lnea representa una muestra 2N de genes elegidos al azar de la poblacin base, lo que determina que la frecuencia de todas las lneas tendr un promedio igual a la frecuencia gnica de la poblacin base, condicin que no cambiar a travs de las generaciones en este proceso ( ). La distribucin de las frecuencias gnicas alrededor de la media es igual a una varianza p0 q0 / 2N (entre lneas), que es semejante la varianza del cambio de /\q (q1 q0); es decir la varianza del cambio de la frecuencia gnica despus de una generacin de muestreo ser (dentro de la lnea): = p0 q0 / 2N; indicara la magnitud del cambio de la frecuencia gnica como efecto del proceso dispersivo. expresa el cambio esperado en cualquier lnea o la varianza de las frecuencias gnicas que se encontraran entre muchas lneas despus de una generacin (de panmixia) entre muchas poblaciones de igual tamao y con semejantes frecuencias gnicas iniciales. * El efecto es en definitiva la dispersin de las frecuencias gnicas entre las lneas, es decir, las lneas llegan a diferenciarse en frecuencias gnicas aunque la media de la poblacin total se mantiene constante.

2/\q

2/\q

Por lo tanto, en cada generacin una nueva dispersin, nuevo q 1 y por ende un nuevo /\q; aumentando la diferenciacin entre las lneas, lo que significa mayor varianza de las frecuencias gnicas entre ellas. Este cambio de las frecuencias gnicas por efecto de muestreo de denomina deriva gnica. Sin embargo, en una determinada generacin para cada lnea la varianza de la frecuencia gnica (valor al cuadrado), permite predecir con un 68% de confianza cual podra ser la frecuencia gnica de una subpoblacin (lnea cualquiera) mediante la siguiente expresin, sea, q1 = q0 /\q, es decir, si en una poblacin se obtiene una muestra aleatoria de 50 individuos, cuya frecuencia gnica inicial fuera para el alelo recesivo 0,5 (q), la frecuencia gnica entre estos 50 individuos puede variar alrededor de la media (q = 0,5) con una desviacin estndar de 0,05, sea la nueva frecuencia gnica de la lnea podra resultar entre 0,45 a 0,55, o que el 68% de los descendientes tendrn la frecuencia gnica entre estos valores. Esquema simplificado de las probabilidades para los distintos valores que puede tomar la nueva frecuencia gnica de la muestra, asumiendo distribucin normal, con N = 50 y donde la poblacin base tiene una frecuencia inicial de q = 0,5:
q1 < 0,35 0,35-0,40 0,40-0,45 probabil. 0,002 0,021 0,136 0,45-0,50 0,50-0,55 0,55-0,60 0,60-0,65 > 0,65 0,341 0,341 0,136 0,021 0,002

Ahora la varianza de las frecuencias gnicas entre muchas subpoblaciones (lneas), donde cada subpoblacin nos dar una nueva frecuencia gnica (q1) en la prxima generacin y este nuevo valor tiende a diferir como, produciendo la dispersin de las frecuencias gnicas entre las poblaciones. Si este proceso de dispersin continua la 2q. Entre lneas aumenta y por ende en la t-sima generacin sera de esta forma:

2q =

= p0 q0 ( 1 ( 1 1 / 2N)t ),

Cuando la 2q entre las lneas ser mxima? Se alcanza en ese momento la Fijacin o lmite del cambio, sea q = 1 o q = 0. Fijados los genotipos de una poblacin, ser la base de la uniformidad genotpica (sea lneas altamente endogmicas). Ahora, si todas las lneas alcanzan la fijacin, obviamente para diferentes alelos en cada lnea, la proporcin de lneas que se fijan para el alelo recesivo (a) es igual a q 0 y para el alelo dominante (A) ser igual a p0. Frecuencias Genotpicas

Los cambios en la frecuencia gnica determinan cambios en las frecuencias genotpicas dentro de cada lnea donde estas frecuencias genotpicas cumplen las propiedades de una poblacin en equilibrio de Hardy-Weinberg, ya que despus del muestreo los individuos sern cruzados al azar. A medida que las lneas se diferencian en sus frecuencias gnicas, tambin se diferencian las frecuencias genotpicas observndose que el cambio es en direccin a la homocigosis, disminuyendo los genotipos heterocigotos, ya que las frecuencias gnicas cambian de valores intermedios a valores extremos. Los heterocigotos son ms frecuentes cuando las frecuencias son intermedias. Por lo tanto a mayor proporcin de individuos con iguales genotipos (valores extremos de la frecuencia gnica) aumenta la uniformidad gentica dentro de cada lnea. Las frecuencias genotpicas de la poblacin total se deducen si se conoce la varianza del q (sea de las frecuencias gnicas). Si quisieramos estimar en todas las lneas que porcentaje de la poblacin sern homocigotos recesivos (aa) se puede deducir mediante la frecuencia gnica de la poblacin base + la varianza del q: = q02 + 2q Por lo tanto, en la poblacin total, la frecuencia de los homocigotos aumenta para un alelo en particular, en una cantidad semejante a la frecuencia gnica entre lneas. En resumen entonces las frecuencias genotpicas, para un locus con dos alelos sern: Genotipo Frecuencia Genotpica en la poblac. total AA p02 + 2q Aa aa 2p0q0 - 22q q02 + 2q

Por lo tanto, la ley de equilibrio de Hardy-Weinberg se mantiene dentro de cada lnea, pero no en la poblacin como un todo. b) Proceso Endogmico (Consangunidad o Inbreeding) Endogama es el apareamiento entre individuos que son parientes (hermanos, primos). El grado de parentesco entre individuos depende del tamao de la poblacin. En una poblacin bisexual cada individuo tiene 2 padres, 4 abuelos, 8 bisabuelos, etc. En la generacin t un individuo X tendr 2t

ancestros. Como consecuencia de un reducido nmero de individuos (poblacin pequea), el parentesco es mucho ms estrecho que en una poblacin grande. La consecuencia principal del parentesco es que los 2 individuos parientes pueden llevar genes que son rplicas del antecesor en comn, que al aparearse esas rplicas pueden pasar a sus descendientes, es decir progenies obtenidas a partir de padres que son parientes pueden llevaren un locus genes que son replicas de un gen en generaciones previas, obteniendo la homocigosis en ese locus. La homocigosis observada en un individuo, puede tener 2 orgenes: 1) 2) Dos genes originados por replicaciones de un gen en generaciones previas, son genes idnticos por descendencia (idnticos) y por ende originan el denominado homocigoto idntico (autocigoto). Genes que no son idnticos, es decir, independientes en la descendencia y tambin originan homocigotos (cigotos) que no son idnticos, se les denomina individuos homocigotos por estado (alocigotos).

Una medida del proceso dispersivo se basa en los homocigotos idnticos originados producto del apareamiento entre parientes, se le conoce como: coeficiente de Endogama o de consanguinidad, definido por una F (Malcot, 1948 y Crow, 1954), siendo F la probabilidad de que dos genes en un locus de un individuo sean idnticos por descendencia. La consanguinidad es un atributo de un individuo y expresa el gardo de parentesco entre los padres. Si en una generacin los individuos se cruzan al azar, el F de la generacin siguiente corresponder a la probabilidad de que 2 gametos tomados al azar de la generacin paterna sean genes idnticos. Individuos pertenecientes a diferentes familias (lneas) podran tener F diferentes, puesto que los padres podran diferir en sus parentescos. Con el fin de hacer comparaciones, se fija una generacin relativamente lejana, asumindose que F = 0, como puede ser la poblacin base, en que todos los genes son independientes en su origen. Calculo de la consanguinidad en una poblacin ideal Para simplificar la explicacin se considerar a un organismo marino y hermafrodita, es decir, capaz de autofertilizarse, el cual coloca espermios y vulos en el mar, si hubiese N de estos organismos colocando gametos en igual cantidad y que se unan al azar habra 2N tipos de gametos con relacin a los alelos de un locus, si se supone que para ese locus A, todos los alelos son independientes (A 1,

A2, A3, etc.). Si esta fuese la situacin inicial, en la progenie, originada en esta generacin inicial, la probabilidad de encontrar genes idnticos sera de 1/ 2N, puesto que en la generacin inicial todos los genes son independientes, pero un mismo individuo replica el mismo gen para un locus particular, de all que un gameto portando el gen A1, se una con uno portador de un gen idntico es 1/2N y ese sera el coeficiente de consanguinidad de la progenie (generacin 1). Ahora en la 2da generacin, hay 2 formas por las cuales se obtiene consanguinidad: 1) nueva replicacin de genes, semejante a la situacin anterior (1 / 2N). 2) los cigotos restantes ( 1 1/ 2N), son independientes en su origen de la generacin 1, pero podran ser idnticos en su origen de la generacin 0. Por lo tanto: F2 = 1 / 2N + ( 1 1/ 2N) F1;

Por ende a la generacin t-sima la expresin general, ser: Ft = 1 / 2N + ( 1 1/ 2N) Ft-1; Donde: la primera expresin corresponde al incremento por la endogama nueva, en cambio el segundo trmino corresponde a la endogamia previa o remanente. Por lo tanto, al incremento de la consanguinidad se le denomina: /\F, es decir, 1 /2N, quedando entonces la frmula anterior: Ft = /\F + ( 1 /\F) Ft-1; despejando /\F, entonces: /\F = Ft Ft-1 1 Ft-1

ecuacin que mide el incremento (/\F) de manera proporcional, porque mide el incremento en una generacin con relacin a la distancia (1 F t-1), para lograr la consanguinidad completa. Por ejemplo, si la poblacin tuviese en la generacin t una consanguinidad de 0,8 y en la generacin previa alcanzaba una consanguinidad de 0,4, el incremento ser de un 66%. Varianza de las frecuencias gnicas, tambin se puede expresar en trminos del coeficiente de consanguinidad, como:

2/\q

= p0 q0 / 2N = = p0 q0 /\F;

as tambin la varianza de las frecuencias gnicas entre las lneas en la t-sima generacin ser:

2q

= p0 q0 Ft = p0 q0 ( 1 ( 1- /\F)t )

as /\F expresa la tasa de dispersin y F el efecto acumulado de la deriva gentica. Frecuencias Genotpicas Si se considera que: el promedio de los genotipos (aa) en la poblacin total puede estimarse por: q02 + 2q; y a su vez la varianza de las frecuencias gnicas entre las lneas como: 2q = p0 q0 Ft.. Se puede resumir en trminos de consanguinidad el promedio de los genotipos recesivos como: q02 + p0 q0 Ft Estas expresiones permiten demostrar como sucede el aum,ento de la consanguinidad y a partir de que individuos y en que porcentaje se forma, obviamente en un proceso de dispersin a largo plazo dentro de cada lnea donde aumenta la homocigosis, estos homocigotos no todos son consanguneos, como se resume a continuacin:

Genotipo AA Aa aa

Frecuencias Originales p02 2p0q0 q02

Cambio debido a la endogamia + p0 q0 F - 2 p0 q0 F + p0 q0 F

Origen independiente idntico p02 (1 F) + p0 F 2 p0 q0(1 F) q02 (1 F) + q0 F

demostrndose que los homocigotos aumentan a expensas de los heterocigotos, adems se distinguen 2 tipos de homocigotos: idnticos e independientes, para los genotipos AA (dominante) y aa (recesivos). La frecuencia de los homocigotos idnticos es el coeficiente de consanguinidad (F), es decir, p0 F es la frecuencia de homocigotos idnticos AA y de los aa es igual a q0 F, el restante de los genotipos, tanto homocigotos como los heterocigotos llevan genes que son independientes en su origen. Coeficiente de consanguinidad individual y coeficiente de parentesco Tanto el coeficiente de consanguinidad y el parentesco tienen importantes aplicaciones prcticas, en la cra de animales de compaa, el control de enfermedades hereditarias, el manejo de poblaciones en los Zoolgicos y de las especies en peligro y en la estimacin de parmetros genticos necesarios para los programas de seleccin artificial. Desde el punto de vista gentico dos individuos son parientes cuando comparten al menos un antecesor en comn o cuando un es antecesor del otro. De ah que, el cruzamiento entre individuos que posean un mayor grado de parentesco que el promedio de la poblacin a la que pertecen, generar descendientes consanguneos. Por ende, el concepto fundamental de consanguinidad, surge del hecho que individuos resultantes de la cruza entre parientes, tendrn mayor probabilidad de recibir de sus padres rplicas de genes provenientes de antecesores comunes, que si sus padres fuesen tomados al azar de la poblacin. Por lo tanto, para que un individuo sea consanguneo, sus padres tienen que ser parientes, y mientrs mayor sea el grado de ese parentesco mayor ser la consanguinidad del individuo hijo de esa cruza. As entonces, es determinante que la consanguinidad de un individuo est directamente dependiendo del gardo de parentesco que tengan sus padres. La definicin de consanguinidad individual fue entregada por Malcot ya en 1948, donde el coeficiente de consanguinidad (F) ser la probabilidad que tiene un individuo, en cualquier locus, de tener genes idnticos por descendencia. Por lo tanto, un individuo consanguneo. Por lo tanto, un individuo consanguneo es aquel que tiene cierta probabilidad de ser homocigoto idntico por descendencia para un locus en particular, siendo estos genes rplicas de genes provenientes de un antecesor comn, es decir, que estos genes, adems de producir el mismo

efecto, cumplen con provenir de una rplica de un mismo gen de algn antecesor en comn. Clculo del Coeficiente de consanguinidad individual a travs de Pedigree. Para calcular el coeficiente de consanguinidad individual, es necesario construir el pedigree lo ms completo posible del individuo. La demostracin de este clculo se realizar por etapas hasta cumplir con un pedigree mucho ms completo o complejo de un individuo. Se demostrar el clculo mediante un esquema o pedigree inicial y muy simple: A B F X Por lo tanto, saber cuanto es la consanguinidad del individuo x (FX): a) Supuesto inicial ser que el individuo A no sea consanguneo (F A = 0), es decir, se asume, que tiene un genotipo hereterocigoto en un locus (A1A2): Se reconoce que X debe ser consanguneo ya que sus padres F y H son parientes, es decir, ambos son hijos de 2 medios hermanos, ya que B y C son hijos de A, sea, en el individuo X existe la probabilidad de ser homocigoto idntico por descendencia por recibir ya sea el gen A1 por ambas vias (paterna y materna) o por otro lado lo mismo podra ocurrir al recibir el otro gen (A2). El clculo comprendera seguir a un gen de A hasta la probabilidad de ser entregado al individuo X, por supuesto el mismo gen o rplica de A, ya sea por el padre y tambin por su madre. Por ejemplo, cual es la probabilidad que el gen A1 llegue a X por ambas vias y se produzca un homocigoto idntico por descendencia (A1A1). Primero veamos la probabilidad que este gen A1 llegue a X por F (padre de X): estando este gen en el antecesor comn A, existe de probabilidad que se entrege a su hijo(a) B, estando ahora este gen en B, tiene la probabilidad de entregarselo a F, asu vez estando ahora en F exciste de probabilidad de entregarselo a X, es decir, que finalmente el gen A1 llegue a X ser: x x = (1/2)3. C H

Considerando al mismo gen A1, pero que ahora llegue a X por la va C-G-X, sera en total nuevamente x x = (1/2)3. Por lo tanto, la probabilidad que X tenga el genotipo para ese locus A1A1, ser (1/2)6 .= 1/64. No olvidemos que X tambin podra recibir el gen A2 de sus padres y obtener un genotipo A2A2 Finalmente entonces Fx ser igual a 2x(1/2)6 = (1/2)5 = 1/32, siempre que el antecesor comn A no sea a su vez consanguneo. La frmula resumida bajo este primer supuesto ser: Fx = (1/2)n1+n2+1 donde: n1 = nmero de segregaciones desde el padre de X hasta el antecesor en comn, n2 = nmero de segregaciones desde la madre de X hasta el mismo antecesor en comn, 1 = sera la probabilidad de estando el gen en el padre y en la madre, debe pasar a un hijo entre ellos. Simplificando este clculo con la siguiente expresin, siendo conveniente determinar la lnea de parentesco entre el padre y la madre de X, y contar as solo las segregaciones desde F hasta H, es decir, representadas por las rallitas. siendo: F - B - A - C - H, Por lo tanto, son 2 las segregaciones desde F hasta A (n1), por otro lado tambin 2 desde H hasta A (n2), lo que dara 4, en este momento se debe sumar entonces 1, lo que determina, que la consanguinidad de X ser () 2+2+1 = ()5. : b) Si el antecesor comn fuese a su vez consanguneo, obviamente X aumentar su consanguinidad,, es decir, se asume que A tiene un genotipo homocigoto idntico por descendencia, tanto para gen A1, como para el gen A2, as la probabilidad total de identidad ser igual a: Fx = 1/32 + 1/32 FA = 1/32 ( 1 + FA) La frmula se debe completar con el siguiente trmino, siendo hasta ahora: Fx = (1/2)n1+n2+1 (1 + FA), c) Ahora si en el pedigree se identifica, por otro lado, que existen otras lneas de parentescos que determinan que X sea mucho ms

consanguneo, es decir, exista otro antecesor comn o que el mismo anterior entrege sus genes por otras vas diferentes a los padres de X, por lo que cada una de estas vias agregar una probabilidad independiente de identidad por descendencia a los loci del individuo X. Con lo que se obtiene la expresin definitiva de la consanguinidad individual de X: Fx = (1/2)n1+n2+1 (1 + FA), donde: la se refiere a cada antecesor comn y/o cada va de conexin (parentesco) entre los padres y el antecesor comn de X. Clculo del Coeficiente de Parentesco Definicin: el coeficiente de parentesco es la probabilidad que dos individuos en el mismo locus posean genes idnticos por descendencia, sea, ambos genes deben ser una rplica del mismo gen proveniente al menos de un antecesor en comn, entre ambos individuos. Obviamente la relacin estrecha entre el grado de consanguinidad de un individuo con el grado de parentesco que poseen sus padres, esta tambin establecido en la frmula general de clculo, que cuantifica cuan semejante resultan ser dos individuos emparentados en trminos probabilisticos. La frmula general es: PXY (1/2)n1+n2 (1 + FA) = (1 + FX) (1 + FY)

donde: el numerador solo se diferencia en que el exponente no debe considerar la ltima segregacin en cada lnea de parentesco establecida entre X e Y, y el denominador es un factor de correccin en el caso que cualquier de los dos individuos fuese ya consanguneo. Concepto: el parentesco entre dos individuos siempre es el doble de la consanguinidad de un hijo entre ambos, solo s, ambos individuos no son consanguneos. Demuestre esta propiedad en el clculo del parentesco entre F y H, del esquema anterior.

GENETICA CUANTITATIVA La gentica cuantitativa es la ciencia que se preocupa, en forma prioritaria, de la herencia de las diferencias observables para un carcter entre individuos que pertenecen a una poblacin. Este conocimiento es fundamental para comprender los procesos evolutivos y el mejoramiento gentico animal, vegetal y forestal. Estas caractersticas presentan en general una distribucin de frecuencias con sus valores fenotpicos de los individuos presentando una gradiente continua, por ejemplo, el peso corporal en aves de postura a las 20 semanas de edad. Estas diferencias fenotpicas observadas entre individuos son determinadas por efectos genticos y ambientales. En general, las diferencias atribuibles a la variabilidad gentica son causadas por la accin simultnea de varios loci, cada uno de los cuales tiene un efecto pequeo sobre el carcter productivo, por lo que no es posible diferenciarlo en forma fenotpica, porque adems esa expresin fenotpica puede ser modificada por el ambiente. En la gentica Mendeliana (cualitatativa), en cambio, estas diferencias son causadas por uno o dos loci, lo que permite identificar el o los loci que estn actuando. Las proporciones mendelianas no son observables en caracteres cuantitativos, por ende, los mtodos de anlisis son muy diferentes. Sin embargo, los genes involucrados en la expresin de un carcter cuantitativo siguen las mismas leyes que aquellos que determinan la expresin de caracteres mendelianos. Definicin: la gentica cuantitativa tiene por objeto estudiar poblaciones, es decir, grupos de individuos, cuyas mediciones para un carcter son obtenidas de estos mismos individuos. Las bases tericas fueron establecidas por Fisher (1918), Wright (1921) y Haldane (1932). Por lo tanto, dado que la variacin cuantitativa es un concepto estadstico, debemos utilizar por ende mtodos estadsticos para investigarla. Si comenzamos por un carcter productivo como la produccin de leche en vacas de la raza Holstein Friesian de primer parto, corregidas por la edad de madurez sexual y a 305 das de lactancia, los valores de produccin de unas 2500 vacas, con una alta probabilidad tendrn una distribucin normal. Por lo tanto, los dos principales parmetros estadsticos a calcular sern: la media y la varianza. Esta distribucin normal, con seguridad ser la ms frecuente distribucin para la mayora de los caracteres productivos en las diferentes especies (no siempre), ya que describe bastante bien a los datos. Esto coincide con que en gentica cuantitativa, la mayora de los datos presentan distribucin normal, es as como: la produccin de huevos, peso corporal, etc. Para los caracteres que no se distribuyan normalmente, por ejemplo, el recuento de huevos en la lombriz en las heces, es normalmente posible encontrar una transformacin simple, tales como la raz cuadrada o logaritmo, que permite explotar las tiles propiedades de la distribucin

normal, ms an no olvide que en gentica cuantitativa, es fundamental estudiar las causas de la diferencia entre los individuos, mediante entonces de la varianza y su anlisis (ANDEVA) de los componentes observacionales y principalmente los responsables y/o causales, son fundamentales de identificar y cuantificar. Por ende para realizar un ANDEVA, requiere como uno de los supuestos fundamentales que la variable posea una distribucin normal, de all transformar las variables antes de evaluar y estudiarlas genticamente son determinantes. Asumiendo en un principio que la produccin de leche estuviese determinada en un locus con solo dos alelos diferentes en la poblacin, determinbamos solo a tres genotipos diferentes, los cuales contribuyen a la produccin de leche en: AA = 2 lts; Aa = 1 lt. y aa = 0 lt. (locus A), si la frecuencia del gen dominante fuese 0,5, la distribucin de las tres clase es muy definida, diferenciable y simtrica. Si ahora agregamos un segundo locus (B) con la misma situacin solo dos alelos diferentes con tres genotipos (BB, Bb y bb), contribuyendo de la misma forma (2 lts para BB; 1 lt. para Bb y 0 litro para bb), obviamente que aumentan el nmero de clases segn los genotipos posibles en la poblacin, alcanzando ya en este ejemplo simple, ahoa a cinso clases diferentes. Por ende al aumentar el numero de loci aumentamos el nmero de clases diferentes. Condicin que permite explicar con mayor presicin lo que realmente ocurre ucon un loci o varios loci que sern los responsable del carcter. Adems ahora existen muchos otros factores no genticos (ambientales) que son muy determinante en modificar el efecto de esos genes y sus interacciones, afectando la produccin de leche, generando por ende, que los lmites entre las diferentes clases sean ahora indistinguibles, sea, las diferencias entre las clases son imperceptibles. Si el efecto de un determinado alelo es muy grande en relacin a la variacin total, las clases discretas sern todava evidentes incluso en presencia de factores ambientales. Sin embargo, la mayora de alelos que afectan a los caracteres cuantitativos tienen un efecto que es suficientemente pequeo como para ser detectable. Lo que nos permite concluir que los caracteres cuantitativos estn determinados por la accin combinada de alelos en muchos loci, la mayora de los cuales tienen un efecto relativamente pequeo sobre el carcter, adems existen factores no genticos (ambientales) que afectan la produccin de los individuos. Produccin de un individuo La produccin de un individuo para un carcter, por ejemplo, peso corporal en broiler, presenta un valor que debe ser medido en unidades, en este caso, Kg, esta medicin en particular se denomina valor fenotpico (Pi) para el i-simo individuo. Este fenotipo est determinado por dos factores conjuntamente: valor genotpico (Gi) la desviacin ambiental (Ei). El valor genotpico de un animal se define como el efecto combinado de todos los genes del animal en todos los loci que afectan el carcter, teniendo en cuenta el modo en que estos genes se unen dentro del genotipo. Sin embargo, en trminos estadsticos, el valor genotpico ser: el efecto del arreglo gnico que tiene un individuo en un genotipo responsable de un carcter determinado. En cambio la desviacin ambiental

representa el efecto combinado de todos los factores no genticos que han influido sobre el valor fenotpico, sea, tambin se puede definir como todos los factores no genticos que modifican la expresin del genotipo. El genotipo de un individuo viene ya determinado desde la fertilizacin, mientrs que E representa el efecto combinado de todos los factores que han influido en ese animal entre la fertilizacin y el momento en que se mide el P. Por lo tanto, la ecuacin que representa al valor fenotpico ser inicialmente: P = G + E donde: E puede ser tanto positivo como negativo, dependiendo del efecto combinado de todos los factores no genticos que han influido sobre el carcter en ese animal. Sin embargo, el valor genotpico de un animal, est determinado por tres componentes: el valor Aditivo (A), el desvio de dominancia (D) y el desvio de epistacis o interaccin (I). Esto puede expresarse simblicamente como: G = A + D + I; Los genotipos se forman en cada generacin, a partir de los genes que los padres traspasan a sus hijos, es decir, los genotipos no se traspasan, ni menos sus caractersticas. Por eso es muy importante conocer el valor del gen o de los genes que los padres transmiten a los descendientes, esto se define a partir de ahora, como el valor aditivo (A) de cada individuo para ese carcter especfico. El valor aditivo se define en trminos tericos como: la suma de los efectos promedios de cada gen que posee un individuo en su genotipo para un carcter, y posteriormente lo definiremos en trminos prcticos, explicado con un ejemplo. El desvio de dominancia, corresponde a la interaccin intralocus de ambos genes, es decir, la interaccin dentro de un mismo locus de ambos genes (uno paterno y el otro materno). Finalmente, la epistacis corresponde a la interaccin entre loci (I). El componente de mayor importancia en conocer es el valor aditivo de cada individuo para un carcter, ya que lo nico que se traspasa de los padres a los hijos son los genes responsables para ese carcter, la dominancia y la epistacis se generan posterior a la unin en cigoto de los genes paternos y maternos para ese carcter, ambas reciben el nombre de desviaciones genticas no aditivas (D y I). Si la accin de los genes fuese completamente aditiva dentro de cada locus y entre loci, entonces D = I = 0, y G sera igial A. Por lo tanto, es fundamental buscar como estimar el valor de cada gen para un carcter, denominado el efecto promedio del gen.

Media genotpica o media poblacional

Las propiedades genticas de una poblacin se pueden expresar en trminos de frecuencias gnicas y genotpicas, sin embargo, para comprender la coneccin entre estas y los caracteres mtricos debemos introducir el concepto de valor (medicin) expresable en unidades mtricas, en las que el carcter es medido: Kg, cm, mm, litros, etc. Siendo la media, el primer parmetro fundamental para un carcter cuantitativo, demostraremos que depende principalmente de la frecuencia gnica, sea, si dos poblaciones evaluadas para el mismo carcter productivo y se compararn los promedio fenotpicos y resultan ser muy diferentes, esto estara determinado por las frecuencias gnicas diferentes entre ambas poblaciones. En trminos tericos, la media genotpica solo representa el promedio de los genotipos que existen en la poblacin para ese carcter, ya que el promedio de los desvios ambientales, siempre es igual a cero, en poblaciones grandes, es decir, conociendo la propiedad de que estadsticamente, se sabe que la suma de desvios, siempre es igual cero ( = 0), lo que significa: P = G. Se considerar un ejemplo en una poblacin de drosophilas melanogaster, cuya variable ser el nmero de celdas abdominales, si este carcter estuviese inicialmente determinado por un locus (F) con solo dos alelos diferentes en la poblacin, donde en nemero de celdas abdominales de los 3 genotipos diferentes de la poblacin, son: las homocigotas dominantes tienen 35 celdas (FF), las heterocigotas 32 celdas (Ff) y las homocigotas recesivas 25 celdas (ff). Estos valores sern simblicamente asignados por a (homocigotos dominantes), -a (homocigotas recesivas) y por d a las de genotipo heterocigoto, representados en la siguiente escala nueva de valores: Genotipos Valor fenotpico Valor Genotpico FF Ff ff 35 32 25 c. abdom. a d -a

En trminos numricos, es necesario obtener un Punto Medio (PM) cuyo valor ser igual a cero, en la escala de valores, es decir, entre ambos homocigotos, (35 + 25)/2 = 30 en trminos absolutos, con ello se obtiene que +a, d y a, respecto al PM sern: 5, 2 y 5, respectivamente. Donde el valor genotpico de d, corresponde al grado de dominancia en ese locus y por lo tanto depende del tipo de interaccin gnica intralocus, es decir, podra tener los siguientes valores: Si no hay dominancia en ese locus: d = 0. Si hay dominancia parcial de F sobre f: d ser positivo (sea entre 0 y +a). Si hay dominancia completa (F sobre f): d ser = +a o a.

Si hay sobredominancia: d > +a o d < -a. El ejemplo de las moscas, demuestra existir dominancia incompleta del gen A sobre el gen recesivo a. Para calcular la media, se podra utilizar el concepto de la sumatoria del producto entre los valores genotpicos por las frecuencias de los respectivos genotipos. El clculo de la media poblacional asumiendo que la poblacin esta en equilibrio de Hardy-Weinberg, se resume en la Tabla 8. TABLA 8. Media poblacional bajo equilibrio de Hardy-Weinberg.

Genotipo FF Ff Ff

Frecuencia Genotpica p2 2pq q2

Valor (desvio PM) +a d -a Suma =

Frec. x Valor p2 a 2pqd q2 a(p q) + 2dpq

La media genotpica poblacional (M) ser: M = a (p q) + 2dpq, Nmericamente, asumiendo si en la poblacin el gen recesivo en la poblacin fuera 0,1 (q = 0,1), la media de la poblacin ser: M = 5 (0,9 0,1) + 2 x 2 x 0,9 x 0,1 = 4,36; Sin embargo, este valor representa la media genotpica expresada como desvio desde el Punto Medio (30 celdas abdominales), por lo tanto, la media poblacional en trminos absolutos es igual a 34,36 celdas abdominales (30 + 4,36). Esto tambin representa a la media fenotpica, recuerde que el efecto ambiental promedio es cero. Se puede deducir entonces que la media poblacional depende principalmente de la frecuencia gnica y obviamente de los valores genotpicos, pero la contribucin de cualquier locus a la media poblacional con respecto a un carcter, tiene dos componentes: 1) a (p q) representa la contribucin de los homocigotos a la media. 2) 2dpq es la contribucin de los heterocigotos a la media. Lo que podra adems simplificar a la media, cuando:

No exista dominancia (d = 0), en ese caso la media simplificada ser: M = a (1 2q). En caso de dominancia completa (d = a), la media es proporcional al cuadrado de la frecuencia gnica: M = a (1 2q2). Si la poblacin estuviese fijada para el alelo dominante (p = 1): M = +a. Si la poblacin estuviese fijada para el alelo recesivo (q = 1): M = -a. Si existe sobredominancia, la media podra ser: >+a o <-a, sea se saldra del rango entre +a y a. Como estamos analizando un carcter determinado al menos por un loci, una representacin sera que el carcter estara influenciado por la accin aditiva de varios loci que actan en forma conjunta, la media poblacional ser igual a la suma de cada locus por separado: M = a (p q) + 2 dpq Valor Aditivo (A)

Siendo el valor aditivo igual a la suma de los efectos promedios de los genes que porta un individuo para un carcter determinado, sin embargo para obtener una estimacin del valor aditivo (A), es asumir al individuo como un futuro reproductor que aportar sus genes a la poblacin con la que se cruzar, por ende, se puede obtener si este candidato a reproductor se cruza al azar con hembras de la poblacin, determinar que el A ser igual a dos veces el desvio promedio de su progenie con relacin a la media de la poblacin. Es el doble ya que cada gameto del reproductor porta una muestra aleatoria de la mitad de los genes del reproductor y, como el otro aporte corresponde a las madres tomadas al azar, estas representan por lo tanto que su efecto sea igual al promedio de la poblacin (sea en trminos de desvio = 0). Pero, tericamente es estrictamente necesario para obtener una estimacin del valor aditivivo de cada genotipo de la poblacin, es estrictamente necesario contar (estimar), por lo tanto, con el valor de cada gen de ese reproductor, sea estimar el efecto promedio de un gen en la poblacin determinada. Efecto promedio de un gen El valor que tiene un gen no es posible conocerlo directamente en el gameto donde est contenido, sino cuando se une este gen con otro gen para formar recin el genotipo del individuo. Para el ejemplo del locus en las drosophilas melanogaster, respecto a nmero de celdas abdominales, donde existen dos genes diferentes en la poblacin (F y f). entonces para conocer el efecto del gen dominante (F), este gen puede estar presente en un sexo y generar genotipos FF y Ff, dependiendo de la frecuencia gnica con la que estos genes F y f se encuentren en la poblacin gamtica del otro sexo. Una condicin

fundamental es que el alelo u otro gen debe ser tomado al azar de la poblacin gamtica del otro sexo. Por lo tanto, para conocer el efecto del gen F (dominante en ese locus) se necesita desviar, la media poblacional con respecto al valor genotpico de todos los genotipos posibles formados al azar, posterior a la unin, ponderados por su frecuencia gnica (p y q), respectivamente. Similar condicin debe ocurrir con el otro gen recesivo (f). Una forma ms simple de entender el efecto promedio de un gen sera asumiendo que existe una poblacin en equilibrio de Hardy-Weinberg, cuya frecuencia del gen dominante fuese p = 1, es decir, existan solo individuos con genotipos dominantes en un 100%, por ende, la media genotpica (fenotpica) sera = +a. Si un candidato a reproductor tambin fuera homocigoto dominante para el mismo gen (aporta solo genes dominantes que sern introducidos a la poblacin) y se cruzar al azar con las hembras de la poblacin, los descendientes (genotipos producidos) de esos cruzamientos sern en 100% homocigotos dominantes y su produccin en promedio ser +a, sea la diferencia entre ambos promedios (media de los descendientes producidos media de la poblacin) es igual a cero, lo que significa que el efecto promedio del dominante introducido a esa poblacin en igual a cero. Por lo tanto el efecto promedio del gen (i) corresponde al promedio de los genotipos producidos por ese gen desviados de la media poblacional. Tambin se puede analizar en funcin a los hijos que portan genes de un padre, que al promediar sus valores genotpicos y desviarlos de la media poblacional, ser una estimacin de los efectos promedio de los genes que porta ese padre. En la Tabla 9, se muestra simblicamente el clculo del efecto promedio del gen.
TABLA 9. Clculo del efecto promedio del gen (dominante y recesivo). Valores y Frecuencias De Genotipos Producidos FF Ff ff +a d -a p q p q Promedio de Los Genotipos Producidos pa + qd -qa + pd

Tipo de Gameto F f

Restar la media Poblacional (M) -(a(p-q) + 2dpq)) -(a(p-q) + 2dpq))

Efecto promedio Del Gen q(a + d(q-p)) -p(a + d(q-p))

corresponde al denominado efecto de sustitucin de un gen, que representa el

cambio promedio que ocurre an la poblacin al reemplazar un alelo por otro y se estima por la expresin: = a + d(q - p), lo que podra simplificar la expresin del

efecto promedio de cada gen mediante: para el gen dominante (F) ser 1 y para el gen receisvo (f) ser 2 quedando determinado entonces:

1 = q

2 = -p

Respecto a la poblacin de drosophilas, nmericamente el efecto de sustitucin del gen ( ) y los efectos promedio del gen dominante ( 1) y del gen recesivo (2) son los siguientes: = 5 + 2 (0,1 0,9) = 5 + 2 x -0,8 = 3,4 1 = 0,1 x 3,4 = 0,34 2 = -0,9 x 3,4 = -3,06 Los resultados son interpretados de la siguiente manera: El efecto de sustitucin significa que al reemplazar el alelo dominante (F) en cualquiera de los genotipos que portan el gen recesivo (f), es decir los genotipos ff cambiaran a Ff y los genotipos Ff cambiaran a FF, este cambio promedio sera igual a 3,4 celdas abdominales. Por lo tanto si un gen se encuentra en baja frecuencia en la poblacin y es reemplazo por otro de alta frecuencia, el efecto sobre el promedio poblacional en pequeo, mientrs que si el reeplazo es entre genes de frecuencia intermedia, el efecto sobre la media poblacional es alto. El efecto promedio del gen dominante es de 0,34 y del gen recesivo de 0,36 celdas abdominales. Se puede demostrar, que el efecto promedio del gen depende de la frecuencia gnicas, de los valores genotpicos a y d y de la media poblacional. Por lo tanto, queda evidente que el efecto promedio de un gen es una propiedad del gen y de la poblacin donde se analice su efecto. No olvidar entonces que un mismo gen tendr un efecto promedio muy diferente dependiendo de la poblacin donde definitivamente se introduzca y se desee evaluar, adems el efecto promedio del gen es una estimacin. El efecto promedio de cada gen era fundamental para estimar finalmente el valor aditivo (A) de cada genotipo de la poblacin, lo que para el locus E de las moscas, podra obtenerse como la suma del efecto promedio de cada gen que tiene un determinado genotipo de la poblacin. Existiendo tres genotipos diferentes para este locus en la poblacin, los valores aditivos se expresan simblicamente por: Genotipo FF Ff ff Valor Aditivo 2 1 = 2 q 1 + 2 = (q p) 2 2 = -2 p

Rercordemos, que el valor aditivo (Ai) de un individuo depende estrechamente de la media poblacional donde se pueda estimar (evaluar), lo que significa que un mismo individuo (genotipo) para un carcter determinado tendr valores aditivos muy diferentes si se evalua en pases, regiones, etc muy diferentes genticamente, es decir, cuyas medias genotpicas (fenotpicas) con frecuencias gnicas muy diferentes. En una misma poblacin, si se asume en equilibrio de Hardy-Weinberg se satsface el supuesto que el promedio de los valores aditivos en la poblacin es cero, recuerde que los valores aditivos son estimaciones desviadas de la media poblacin (suma de desvios = 0), esto se demuestra mediante: = (p2 x 2q ) + (2pq x (q p) ) + (q2 x 2p ) = 2 pq ( p + q p -q ) = 0 El valor aditivo de cualquier individuo es el promedio de los valores aditivos de sus respectivos padres y, si los valores aditivos son expresados en trminos absolutos, tambin es el valor fenotpico esperado para el individuo. Sin embargo, diferentes hijos de los mismos padres (varios hermanos completos) pueden diferir en relacina sus valores aditivosya que reciben cada uno una muestra aleatoria de la mitad de los genes que porta cada padre. Entonces, la transmicin desde los padres a la descendencia se representa por: Ai = (As + Ad) + Wi donde: Ai = As = Ad = Wi = valor aditivo del i-simo hijo. valor aditivo del padre (sire). valor aditivo de la madre (dam). efecto del muestreo mendeliano.

Los valores aditivos para el ejemplo de las drosophilas seran los siguientes, en trminos de desvios respecto a la media poblacional, en trminos absolutos, adems del valor genotpico, son: Genotipo FF Ff ff Valor Aditivo (desvio M) 0,68 -2,72 -6,12 Valor Aditivo (absoluto) 35,04 31,64 28,24 Valor Genotpico (absoluto) 35,00 32,00 25,00

Obtenindose con los valores genotpicos y Aditivos (trminos absolutos) una diferencia en cada genotipo, esta diferencia se debe a la interaccin dentro

del locus, reconociendo que existe dominancia incompleta de F sobre f, sea, d es positivo y es menor a +a. Esta diferencia por lo tanto, se debe al desvio de dominancia de cada genotipo, es decir Di = Gi - Ai, ya que el valor genotpico para un locus solamente corresponde a la expresin de G = A + D. El valor aditivo (A) se peude tambin explicar en trminos practicos, ya que bajo en concepto de que un reproductor se cruza al azar con hembras de la poblacin, se puede obtener el valor aditivo de ese candidato a ser reproductor, multiplicando por 2 el desvio promedio de sus hijos respecto a la media de la poblacin, ya que todos los hijos solo reciben de su padre la mitad de sus genes, y la otra mitad proviene de las madres, cuyo aporte promedio debe ser igual a cer, ya son igual al promedio gentico de la poblacin. Numericamente podra explicarse con 2 toros lecheros (A y B), si ambos se cruzaran al azar con vacas de la poblacin, el promedio de la produccin de leche de las hijas del toro A fuese 6800 Kg y del toro B fuese 5500 Kg de leche, si la poblacin total tiene un promedio genotpico (fenotpico) de todas las vacas igual a 6000 Kg. Esto permite determinar quelas hijas del toro A tienen un desvio con respecto a la media poblacional de +800 Kg, esto se debe solo a la mitad de los genes del toro A, sea, sera el efecto promedio de los genes de ese toro. Por lo tanto, ese toro tendr un valor aditivo de 1600 Kg (800x2) ya que los genes de las madres en promedio son iguales a la media gentica de la poblacin (promedio A = 0). El efecto promedio del toro B sera 500 Kg y as el valor aditivo del toro B sera igual a 1000 Kg. Desvios de dominancia El desvio de dominancia se presenta solo cuando existe alguna interaccin gnica dentro del mismo locus y se podra obtener por la diferencia entre el valor genotpico y el valor aditivo de cada clase genotpica (Di = Gi Ai). Al igual que los valores aditivos se pueden expresar como desvio de la media poblacional, los desvios de dominancia de cada genotipo simblicamente y sus respectivos valores del ejemplo en las drosophilas (locus F) son: Genotipo FF Ff ff Desvio dominancia (desvio) 2 - 2q d = -0,04 2pq d = 0,36 - 2p2 d = 3,24 Desvio dominancia (absoluto) 35,00 35,04 = -0,04 32,00 - 31,64 = 0,36 25,00 - 28,64 = -3,64

Quedando en evidencia si no existe dominancia en ese locus (d = 0) el valor genotpico ser igual al valor aditivo de cada genotipo (Gi = Ai) Los desvios de dominancia representan el efecto solo al aparearse los genes para formar un genotipo. Por ende, es imposible considerar este efecto a cada gen por separado, ya la la dominancia se establece al unirse un gen con otro en ese locus. Tambin los desvios de dominancia de cada genotipo, al igual que el

valor aditivo y el efecto promedio de cada gen, dependen de la frecuencia gnica de los genes en la poblacin, por eso son propiedades particulares de cada poblacin. Tambin, si la poblacin estuviese en equilibrio de Hardy-Weinberg, el promedio de los desvios de dominancia en la poblacin es igual a cero (suma de frecuencia x valor de cada genotipo), es decir, si se suma el producto de la frecuencia genotpica por el respectivo desvio de dominancia es: = -2 p2 q2 d + 4 p2 q2 d - 2 p2 q2 d = 0. Otra conclusin fundamental correspone a la regresin de los aditivos sobre los valores genotpicos de cada genotipo, en la poblacin, la pendiente corresponde al efecto de sustitucin del gen () y la lnea de mejor ajuste de esta regresin representa a los valores aditivos de cada genotipo (Ai). Adems los valores aditivos y desvios de dominancia de cada genotipo son independientes, sea la Cov A,D = 0. Grfique esta condicin con el ejemplo del locus F en drosophila y discutalo con sus compaeros de estudio y por supuesto con el profesor. Tambin analice que significa la diferencia entre Gi y Ai de cada genotipo, asociado a los valores absolutos. Demuestre, nmericamente con los datos de las drosophilas, que la Cov A,D = 0. Epistacis Ya observamos que al estudiar los efectos en solo solo el valor genotpico est constituido solo por el valor aditivo ms el desvio de dominancia. Sin embargo cuando el carcter est determinado por varios locus, el valor genotpico puede adiconalmente originar una combinacin no aditiva entre los loci involucrados, sea interaccin entre locus. Si dos locus vecinos sus respectivos genes interactuan entre si, generando una desviacin por interaccin o entre ellos muestran epistacis. La desviacin por epistacis se denomina desviacin episttica (I). Al interactuar los genes en diferente nmeros de loci (pares, tres locus vecinos, etc.), esta interaccin en general es muy diferente. Pero la naturaleza compleja de las interacciones epistticas no son importante, tratndose estas interacciones como una desviacin simple (I), teniendo en definitiva, que el valor genotpico se explica por: G = A + D + I. VARIANZA FENOTPICA

El parmetro que puede medirla magnitud en que los individuos difieren entre ellos es la varianza, este grado de diferenciacin se mide con la varianza fenotpica (VP), clculo que ya fue definido con los valores fenotpicos de manera muy simple, sea, por definicin no es ms que la suma de cuadrados dividido por los grados de libertad, o tambin como la suma de desvios al cuadrado. Los caracteres cuantitativos estan sujetos a fuentes de origen gentico y no gentico (ambientales) de variacin, generando una variacin continua y por ende una distribucin de frecuencias (clases fenotpicas) que generalmente se ajustan a una curva normal. Siendo fundamental el estudio de las propiedades observacionales y causales en la poblacin de esta variacin para un carcter determinado, por lo tanto, es necesario comprender y recordar el concepto de variacin y adems del conocimiento de parmetros fenotpicos y genticos mediante el uso de tcnicas estadsticas, ya discutidas previamente. La varianza de los valores fenotpicos observables permiten estudiar a los caracteres cuantitativos desde el punto de vista gentico. En general la VP debe ser estudiada segn aquellas fuentes de variacin que son necesariamente idntificadas por el productor o genetista, mediante un modelo estadstico, para as conocer la magnitud de cada una de estas fuentes en relacin a la varianza fenotpica, es decir, definir para cada variable la magnitud relativa de estas fuentes causales en relacin a la variabilidad total, lo que permite as conocer las propiedades genticas de una poblacin, en particular, el grado de semejanza entre parientes, predecir respuestas esperadas por seleccin y determinar la metodologa ms acertada para mximizar el mejoramiento gentico. Esta condicin de explicar la variabibilidad observada por las diferentes factores que la determinan, depende del carcter, de la informacin disponible y la capacidad y conocimiento del investigador para identificar cada una de estas causas. En general esto se realiza agrupando las observaciones en torno a promedios, por ejemplo: raza, sexo, tipo de manejo, etc. De ah surge el conocimiento en la construccin de modelos estadsticosmatmaticos que expliquen y describan de la mejor forma los procesos biolgicos insertos en el carcter y as cuantificar los factores que afectan al carcter en estudio. Es decir, el modelo debe aproximarse a la realidad biolgica y explicarla lo ms completa posible. Modelos estadsticos Los modelos lneales y probabilisticos, en general se pueden clasificar segn los factores que se idntifiquen afectando a la variable en estudio y son de tres tipos: I. Modelos de efectos fijos.

II. III.

Modelos de efectos aleatorios. Modelos Mixtos (efectos fijos y aleatorios)

Para definir un modelo en forma resumida debe cumplirse con las siguientes condiciones: 1) Construccin de la ecuacin, sea identificar todos los factores, ya sea, fijos o aleatorios que afecten a la variable en estudio. 2) Definir: esperanza, varianza y covarianza, de cada uno de los factores del modelo, principalmente de los componentes aleatorios del modelo. 3) Definir los supuestos y restricciones que estan presentes en el modelo. Una descripcin breve y resumida ayudar a comprender esta metodologa de trabajo y as el estudiante podr comprender en definitiva el objetivo del uso de los modelos lneales en gentica. Un ejemplo de un modelo mixto, donde se cuenta con datos de animales criados en 2 ambientes y los animales pertenecen a tres familias de propios hermanos. 1) donde: La ecuacin debe ser: yijk = + Ai + fj + ijk,

yijk = caracterstica de inters (por ej.: ganancia de peso, respuesta inmune, etc.) Ai = es el efecto fijo del i-simo ambiente (i = 1, 2). fj = es el efecto aleatorio de la j-sima famila (j = 1, 2 y 3). ijk = efecto residual (o variacin no explicada).
2) Por definicin en nuestros modelos que siempre deben ser probabilisticos, las variables aleatorias del modelo deben ser: yijk e

ijk., adems en los modelos mixtos se deben considerar todos los

efectos aleatorios incorporados, en este ejemplo, el efecto familia (fi). Las esperanzas son: E (ijk ) = 0 y E (yijk ) = E ( + Ai + fj + ijk) =

+ Ai

Las varianzas y covarianzas son:

Var (y) = Var (f) + Var (); ya que los nicos efectos responsables de generar variabilidad al carcter son slo los efectos aleatorios del modelo. Una vez estimados es fundamental calcular la importancia relativa de varianzas, es decir, Var(f) / Var(y) que indicara que porcentaje de la variabilidad del carcter est explicada por la varianza entre las familias, o en que proporcin las familias son responsables de la variabilidad del carcter, componente fundamental para ser usado en gentica, ya que permite explicar las causas de la variabilidad del carcter, respecto a su origen. Todos las E (ijk) son ceros, para todo i,j y k. En cambio las covarianzas son: E (ijk, i j k) para varias combinaciones de i, j, k e i, j y k, eso significa que las covarianzas entre los errores deben ser siempre 0 (independientes). En general los investigadores idealmente asumen estas covarianzas como cero, en caso de existir algunas covarianzas deben ser calculadas y conocidas para explicar mucho mejor la diferencia entre una medicin y otra. 4) Supuestos y restricciones: Para este ejemplo simple se debe asumir: a) Todos los animales son del mismo sexo, edad, en caso contrario estos efectos deberan ser incluidos en el modelo. b) Todos los animales fueron medidos en el mismo tiempo, por ejemplo: la misma semana, mes, etc; de otra manera el efecto tiempo debera ser incluido en la ecuacin del modelo. c) Todos los tratamientos generales (manejo) de los animales dentro del ambiente fueron asumidos idnticos, por ej.: alimentacin, administracin de vacunas, etc.

Adems pueden existir otros puntos, dependiendo de la situacin, que puede tener conexin sobre el modelo y la interpretacin de resultados. Conclusin: Un modelo no est completo al menos que todas las tres partes hayan sido debidamente especficadas. Por este hecho, el investigador debe conocer exactamente las limitaciones de un u otro modelo o del experimento. El modelo puede ser siempre mejorado, pero el experimento puede ser altamente costoso para hacer los cambios o repeticiones. Por ello, el modelo siempre debe ser definido antes del experimento. Esto puede mejorar el diseo experimental y debe garantizar que Ud. pueda hacer las pruebas de hiptesis que son de inters. Finalmente una vez conocida los componentes responsables (causales los cuales se designan por la letra V) de la varianza fenotpica (Var(y)) que inicialmente reconocemos a dos: VP = VG + VE + 2 Cov G,E

Donde, es muy importante para un carcter determinar la importancia relativa entre ambos componentes de la caracterstica estudiada, siendo esta proporcin propia del carcter y de la poblacin en la que se obtuvo. Se podra establecer VG / VP, que entrega un nuevo parmetro de importancia gentica denominado heredabilidad en sentido muy amplio, sin embargo, orienta y determina para un carcter en que magnitud la variabilidad gentica explica la variabilidad del carcter, es decir, que porcentaje de la varianza fenotpica est explicada por las diferencias entre los genotipos para ese carcter. Ambos parmetros son propiedades de la poblacin y del carcter evaluado. Sin embargo, est relacin en produccin animal no juega un rol determinante y disgno de estimar para aplicarlo en mejoramiento gentico, ya que el genotipo no se transmite a la descendencia, por ende esas diferencias genotpicas son solo determinadas en esa poblacin y no se garantiza que eso permanezca en las generaciones futuras. La Cov G,E representa si existe o no asociacin entre los desvios genticos y ambientales. Este componente explica parte de la varicin observada, en forma muy especfica si ciertos genotipos estuviesen o no asociados a ciertas condiciones ambientales. El ejemplo ms evidente ocurre en el sector lechero bovino, donde es habitual que los productores realizan un manejo preferencial a las vacas que son hijas de ciertos toros (los ms caros, los comprados recientemente, los de mayores valores aditivos, etc), lo que significa que estas vacas en promedio estn siempre expuestas al mejor microambiente, que determina por supuesto mayor produccin de leche o mejor calidad, extablecindose una asociacin entre el genotipo y el ambiente. Obviamente esta situacin es para los genetistas no deseable, para poder con seguridad comparar toros y seleccionarlos por sus valores genticos aditivos, como animales superiores, lo que significa que en la evaluacin o comparacin de toros, este efecto o covarianza debe ser introducida adecuadamente en el anlisis gentico, ya que este componente puede sobreestimar o subestimar los parmetros genticos en especial la varianza gentica. Sin embargo, en poblaciones experimentales esta fuente de sesgo puede ser fcilmente eliminada distribuyendo aleatoriamente los genotipos en los distintos ambientes productivos. Interaccin Genotipo-Ambiente Otra consideracin importante a tener en cuenta es la situacin que se puede presentar en algunas caractersticas, donde los genotipos son replicados en distintos ambientes o rebaos. Un ejemplo podra ser al evaluar 2 razas de bovinos, respecto a la tasa de crecimiento anual, donde los mismos animales sufren durante un ao de condiciones ambientales muy diferentes, en el verano extrema falta en calidad (ambiente negativo) y cantidad de alimento y en primavera estas condiciones muy favorables (ambiente favorable). Estas condiciones deben ser incluidas en un modelo de la siguiente manera: VP = VG + VE + I G,E

Donde la I G,E representa la varianza de interaccin, ya que genera otra fuente de variacin y este componente se debe a diferencias ambientales entre los individuos por ende explica parte de la varianza ambiental. Estadsticamente este componente puede ser incluido en el modelo bajo un diseo factorial, ya que los distintos genotipos son replicados en los distintos macroambientes disponibles. Tambin podra estimarse este efecto mediante la correlacin de genotipos similares medidos en los dfos ambientes diferentes, si esta correlacin fuera igual a 1 o crcano a 1, esto significara que la interaccin genetico-ambiental es poco relevante, es decir, la produccin de los mejores animales se mantiene independiente del ambiente. En cambio una correlacin muy baja (0 o crcana a 0), significa que los diferentes ambientes producen cambios en los niveles de produccin, sea, cambio en el ranking de los animales segn el macroambiente y podran obligar a considerarse como caractersticas incluso diferentes. Componentes causales de la Varianza Gentica Obviamente el estudio de las causas de las diferencias genticas determinadas por diferentes factores de origen gentico, estos son explicados por los componentes que determinan el genotipo, descritos previamente, por ende, la varianza genotpica esta determinada por diferentes componentes causales, estos son: VG = VA + VD + VI + 2 CovA,D + 2 CovA,I + 2 CovD,I Entre todos estos componentes causales de la varianza genotpica el de mayor importancia, sobretodo en mejoramiento gentico animal, vegetal y tambin forestal, es la varianza de los valores aditivos (VA), ya que permite conocer el grado de semejanza observada entre parientes, la que es una de las propiedades ms importantes genticas de la poblacin. La proporcin (VA/ VP) explica cuanto de la variabilidad total est determinada por la diferencias entre los valores genticos aditivos entre los individuos de la poblacin, para ese carcter, tambin es fundamental esta magnitud para determinar que tipo de mejoramiento gentico es el ms conveniente de realizar para ese carcter y por otro lado determina el gardo de respuesta esperable frente a la seleccin. Este parmetro relevante se denomina heredabilidad y por ser una importancia relativa de varianzas de designa por h2. Los componentes de la varianza gentica aditiva, por definicin es la suma de los desvios aditivos al cuadrado, por lo tanto, tambien depende de la frecuencia gnica. La demostracin se resume en la Tabla 10, considerando un locus con dos alelos. TABLA 10. Valores aditivos y desvios de dominancia para los genotipos de una poblacin (1 locus con 2 alelos).

Frecuencias genotpicas Valores aditivos Desvios de dominancia

FF p2 2q -2q2 d

GENOTIPOS Ff 2pq (q p) 2 pqd

ff q -2p -2p2 d
2

Tanto los valores aditivos y los desvios de dominancia extn expresados como desvios de la media poblacional, cuyos promedios deben sumar cero. Ahora las varianzas son las siguientes: VA = p2 (2q )2 + 2 pq ( (q p) )2 + q2 (-2p )2 = 2pq 2 q2 (-2p d2) = (2pq d)2

VD = p2 (-2q2 d2) + 2 pq (2pqd)2 +

siendo, por lo tanto, para un locus con dos alelos VG = VA + VD. Adems como nuevamente la varianza de dominancia depende de los valores de d, en caso de dominancia completa en ese locus VG = VA , ya que VD = 0, sin embargo, la VA puede simplicarse a la siguiente expresin VA = 2pqa2. Bajo otras condiciones especiales, las varianzas pueden expresarse en los siguientes trminos: Modelo dominancia completa (d = a): VA = 8 pq3 a2 ; VD = (2pqa)2,

Si las frecuencias gnicas fuesen iguales a 0,5 (p=q): VA = a2 ; VD = d2, Los trminos CovA,D; CovA,I y CovD,I son cada uno iguales a cero, ya que los valores aditivos, desvios de dominancia y desvios de interaccin no estan asociados. Para evaluar el efecto de las frecuencis gnicas sobre los componentes de varianza genotpica, es importante observar sus comportamientos a bajo el modelo de dominancia completa y diferentes frecuencias gnicas de un alelo, en el grfico siguiente:

Del grfico se puede inferir que la varianza gentica aditiva, se alcanza en este modelo a frecuencias gnica del alelo recesivo, crcana a 0,7 (intermedia), en cambio, la varianza de dominancia su mayor magnitud es alrededor de 0,5 para q. Adems, la varianza genotpica esta explicada muy fuertemente por la varianza gentica aditiva (q = 0,7). En general, se puede concluir que a frecuencias gnicas extremas (muy alta o muy baja) explican muy poci de la variabilidad del carcter. Como ejercicio se suguiere construir los grficos de estas 3 varianzas bajo un modelo sin dominancia y sobredominancia. Utilize para esos clculos, los valores de a y d de la poblacin de drosophilas. Adems, complete la Tabla 11, donde se resumen, con la informacin de la poblacin de moscas, todos los parmetros genticos: media poblacional, efecto de sustitucin y promedio de un gen, para los genotipos sus valores aditivos, desvios de dominancia, valores genticos y las varianzas respectivas, si el gen recesivo ahora aumentase su frecuencia gnica a 0,4, generando la poblacin B. Varianza Citoplsmatica (VC) No debemos olvidar a otros genes que determinan la expresin de un carcter, pero pertenecientes al ncleo (cromosomales), sino genes extracromosomales ubicados en rganelos citoplsmaticos (mitocondras y cloroplastos), que son transferidos principalmente desde la madre a los hijos, ya que estos genes estn en el citoplasma del ovocito. En mamferos existe evidencia que demuestra que la mitocondra es transferida por la madre y que no resenta o es muy escasa la capacidad de recombinacin. Por lo tanto, tambin algunas caractersticas son responsables de la variacin observada, determinado como diferentes linejes de rganelos o maternos, generando una varianza de origen citoplsmatico (VC). Existiendo entonces algunos efectos citoplsmaticos, la nueva particin de la varianza gentica, considerada en un locus con dos alelos, ser: VG = VA + VD + VC + V IA,C + V IC,D donde: C representa el efectos aditivo del genoma citoplsmatico, IA,C y IC,D, la interaccin entre efectos citiplsmaticos y nucleres aditivos y de dominancia, respectivamente. En ganado lechero Holstein Boettcher et al. (1966) demostraron la importancia de este efecto citoplsmatico, determinando que la varianza entre linajes maternos (mitocondriales) es responsable de: 2,7; 0,38 y 0,71% de la varianza para porcentaje de grasa en la leche, produccin de leche y grasa, respectivamente.

TABLA 11. Parmetros genticos en poblaciones con diferente frecuencia gnica del alelo recesivo (1 locus con 2 alelos). Parmetros Genticos Poblacin A Poblacin B (valores a = 5 y d = 2) (q = 0,1) (q = 0,4) Media genotpica real Media genotpica desviada (PM) Efecto sustitucin del gen () Efecto promedio del gen: Dominante (F): 1 Recesivo (f): 2 Valores Genotpicos: Reales (absolutos) Desviados de Media Valores Aditivos: Reales (absolutos) Desviados de Media Desvios de Dominancia: Varianzas: Genotpica Aditiva Dominancia 34,36 4,36 3,40 0,34 -3,06 FF Ff 35,0 32,0 0,64 -2,36 35,04 0,68 -0,04 31,64 -2,72 0,36 ff 25,0 -9,36 28,24 -6,12 -3,64

4,6296 celdas2 4,50 celdas2 0,1296 celdas2

Varianza ambiental (VE) La varianza ambiental involucra toda la variacin de origen no gentico, por ende, depende de una gran variedad de causas, entre ellas: factores nutricionales, climticos, efectos maternos, errores en la medicin, etc. Un ejemplo ms claro sera al considerar los diferentes factores que determinan el peso al nacimiento en mamferos: de origen gentico seran lo gentico aditivo (genes), lo gentico no aditivo (dominancia y epistacis) y el sexo de la cra; en cambio los de origen ambiental seran, genotipo de la madre, ambiente materno pre y postparto (general y especial), edad de la madre, nmero de parto y lo no idntificable. COEFICIENTE DE REPETIBILIDAD O CONFIABILIDAD

Adems, existen caractersticas adems que se miden varias veces en la vida del mismo animal (temporal): peso corporal, peso velln, produccin de leche, tamao de camada, etc. y tambin, a mismo animal se podra medirle el mismo carcter en diferentes zonas del cuerpo (espacial): celdas abdominales lado izquierdo y derecho, masa muscular miembros anteriores, etc. Esta situacin, obliga a descomponer el efecto ambiental en dos nuevos componentes: ambiente permanente (Ep) y ambiente temporal o transitorio (Et). Lo que significa que la variabilidad ambiental dependiendo de cmo se expresen las caratersticas debe estimarse de distintas formas, por ejemplo caracteres que el animal lo expresa varias veces en su vida, los niveles de produccin en cada animal alcanzan valores diferentes, debido a que estos efectos ambientales Ep y Et, para el mismo animal van actuando de diferente manera a lo largo de su vida. Los factores ambientales que varian en su efecto pueden ser: edad, estacin del ao, estado de preez, ao calendario, etc. Desde el punto de vista estadstico, al medir varias veces al mismo individuo y realizarlo para un carcter en la poblacin, la varianza fenotpica se divide en los componentes: dentro de individuos (entre las mediciones del mismo individuo) y entre individuos (entre las diferentes mediciones). Esa descomposicin de varianza con lleva a una importancia relativa de varianzas, varianza entre individuos dividida por la varianza fenotpica del carcter, se denomina repetibilidad o tambin definida como coeficiente de correlacin intraclase (t = B / P). La repetibilidad tiene entre otro 3 aplicaciones fundamentales en produccin animal: Cuanto podra ganarse al medir repetidas veces el carcter; corresponde al valor mximo de la heredabilidad y podra predecir la produccin futura de un animal, con la medicin temprana. Este parmetro es principalmente un estimador ambiental y no gentico del carcter, ya que se basa en descomponer el componente ambiental. Sin embargo, es de mucha utilidad para los productores ya que permite ayudar con cierta seguridad a tomar decisiones lo ms tempranamente posible en elegir a un buen animal y que esa productividad en el futuro pueda estar debidamente garantizada, sea podra ser buen apoyo en seleccionar animales lo ms temprano posible, no siendo el criterio definitivo para seleccionar. Una representacin simple de medir a un mismo animal diferentes veces para el mismo carcter (tamao de camada en cerdas), el valor fenotpico estara determinado en general por 3 componentes: G + Ep + Et, estos componentes tienen una importancia relativa para cada animal a travs del tiempo y que generalmente sufren cambios en importancia. Los efectos de ambiente permanente son todos aquellos factores ambientales que permanecen junto al animal durante toda su vida, por ejemplo, si un animal sufre de desnutricin severa al inicio de su vida, esta condicin le afectar durante toda su vida, en cambio, los efectos de ambiente transtorio o temporal son aquellos que afectan solo a cada

medicin, por ejemplo, una mastitis de la madre al segundo parto afecta slo el crecimiento de su camada a ese parto o una mastitis afecta la produccin de leche en esa lactancia no en cualquier otra. Una representacin esqemtica de la importancia relativa de cada uno de estos componentes se entrega en la Figura 3.

Figura 3. Importancia relativa de cada componentes responsable de la produccin fenotpica durante varias mediciones Medicin 1ra G Ep G Ep G 2da G Ep G Ep G 3ra G Ep G Ep G Ep Et Et Et Ep Et Et Et Ep Et Et Et animal 1 animal 2 ...... animal n

Esto demuestra que a travs del tiempo las mediciones de un mismo animal no se ven modificadas en cuanto a genotipo ni al ambiente permanente, en cambio, es muy frecuente observar que la importancia relativa de los efectos ambientales transtorios comienzan a disminuir en el mismo animal, es decir, son cada vez de menor importancia sobre la produccin. Esto se explica en general a medida que los animales son ms adultos, son menos suceptibles a manifestar problemas por efectos ambientales. Un ejemplo de un modelo mixto, donde se cuenta con varios animales elegidos al azar, medidos 3 veces seguidos para el mismo carcter, por ejemplo, 100 cerdas elegidas al azar, fueron medida a cada una el tamao de camada de sus 3 primeros partos, el modelo estadstico ms adecuado, sera:

yijk = + Pi + aj + ijk,
donde:

yijk = tamao de camada. Pi = es el efecto fijo del i-simo parto (i = 1, 2 y 3). aj = es el efecto aleatorio de la j-sima cerda (j = 1, 2,.... , 100).

ijk = efecto residual (o variacin no explicada).

Las esperanzas son: E (ijk ) = 0 y E (yijk ) = + Pi Var (y) = Var(a) + Var(); sea, la varianza fenotpica observacional estara determinada por la a entre animales ms la e o dentro de animales. Los componentes causales en cada caso son: a = VG + VEP y e = VEt

La importancia relativa de la varianza entre animales respecto de la variabilidad del carcter representa el coeficiente de repetibilidad. Obviamente al ser una importancia relativa de varianza (x100) su valor siempre es positivo (las varianzas son siempre PPD = positivas por definicin) y fluctua entre 1 a 0 (100 a 0%). La repetibilidad por definicin es una correlacin intraclase (t), osea es una correlacin entre las distintas mediciones en un mismo animal. Por lo tanto, mide el grado de asociacin entre las mediciones de un mismo animal. La coneccin entre una correlacin intraclase (t) con una impoprtancia relativa de varianzas, para obtener una estimacin del coeficiente de repetibilidad, podra demostrarse mediante las siguientes ecuaciones. Si se describe la ecuacin que determina la produccin de un animal en tiempos distintos, podramos obtener: P = + G + donde: Ep + Et + I G,Ep + I G,Et

G Ep Et I G,Ep

= media poblacional. = efectos genticos. = efectos ambientales permanentes.

= efectos ambientales temporales, pueden cambiar de una medicin a la siguiente. y I G,Et = interacciones gentico-ambientales.

Recordemos que todos los efectos del modelo estn expresados como desvio del promedio y son entre si independientes (supuestos del ANDEVA), exepto P.

Para simplificar se agruparan los efectos permanentes en B (entre = between), y los efectos temporales o transitorios en W (dentro = within), con las siguientes expresiones: B = .G + Ep + I G,Ep y W = Et + I G,Et

De tal forma que:

P = + B + W,

Entonces la medicin en poca j-sima en el animal i-simo, estara representado por la siguiente ecuacin simplificada: Pij = + Bi + Wij, Si construimos la covarianza de un registro Pij (animal i-simo en el tiempo j) con el reguistro siguiente, Pij (el mismo i-simo animal en el tiempo j), del mismo animal, escribira de la siguiente manera: Cov (Pij, Pij) = Cov (Bi + Wij , Bi + Wij) Las sumas de productos, determinan que las Cov (Wij, Wij) = 0; Cov (Bi, Wij) = 0 y Cov (Bi, Wij) = 0, lo que significa que entre estos factores son independientes (Cov = 0), quedando solamente que la asociacin est determinada solo por: Cov (Bi , Bi ) = B Es decir, la Cov (Bi, Bi) = a la varianza entre animales a Por definicin la correlacin intraclase (t), se define por:

Cov (Pij, Pij) 2B t = = ; V(Pij)*V(Pij) 2P donde la V(Pij)*V(Pij) es igual a la varianza fenotpica del carcter (Var(y)), ya que es la misma variable medida en tiempos diferentes, por definicin un carcter tiene siempre la misma variabilidad en la poblacin. La interpretacin del trmino repetible no indica que el nivel productivo sea semejante de una medicin a la siguiente, para el mismo animal, sino que este animal mantendr su orden productivo, no importando el cambio productivo, es

decir, si el carcter es altamente repetible, sea presenta un alto nivel de confianza o repetibilidad, indica que animales de altos niveles en sus primeras mediciones mantendrn su alto nivel productivo en las futuras mediciones y por ende los animales de bajos niveles productivos seguirn siendo siempre los de menor produccin. Alta repetibilidad, est asociado a una correlacin lneal alta, sea, al menos de 0,8 hasta crcano a 1. En general un carcter de baja repetibilidad indica que la superioridad (inferioridad) de algunos animales al inicio de su vida, no ocurrir lo mismo en el futuro, sea se tiene poca confianza que esta superioridad (o inferioridad) se mantenga en el futuro. Por lo tanto, este parmetro entrega la importancia relativa de las diferencias temporales y permanentes en la poblacin animal, para un carcter es decir, la nica causa de que un carcter presente alta repetibilidad, se debe a que la varianza o efectos ambientales transitorios o temporales sea poco relevante en la diferencia dentro de cada individuo, o viceversa. La prediccin de aumentos futuros de la produccin se puede realizar mediante la regresin de la produccin futura sobre la produccin actual. La repetibilidad es por definicin una correlacin (intraclase) y para predecir es necesario conocer la regresin, es decir, se podr transformar una correlacin en regresin?. Para demostrar este aplicacin resuelva los ejercicios presentes en la Gua Prctica de Gentica. Semejanza entre Parientes (Covarianzas) Otro parmetro importante en caracterizar genticamente a una poblacin para un carcter mtrico (cuantitativo) es tambin la Covarianza, que mide en general si existe asociacin o no entre las variables, adems indica si este asociacin es positiva o negativa. El parecido entre parientes es uno de los fenmenos genticos bsicos observables en los caracteres cuantitativos y por ende es una propiedad de cada carcter medido en una poblacin. La Covarianza en gentica sirve para cuantificar el semejanza fenotpica entre parientes, es decir, los parientes se parecen entre si y en que medida, para posteriormente determinar las causas de ese parecido. Las causas del parecido entre parientes se puede conocer mediante la Covarianza fenotpica entre miembros de una misma familia (CovP), que es resultado del parecido de origen gentico (CovG) y por otro lado del parecido por origen ambiental (CovE), es decir, que el parecido fenotpico entre individuos emparentados sera: CovP = CovG + CovE

La covarianza es simplemente una porcin de la varianza total o fenotpica, tanto por componentes genticos como ambientales. Antes de demostrar la magnitud y causas del parecido entre grupos o familias emparentadas, debemos recordar que frente a un mismo grupo de parientes, por ejemplo, familias de propios hermanos, existen mayor o menor parecido dependiendo a su vez del carcter, es decir, dos propios hermanos se pueden parecer ms o menos, segn el carcter (o loci) que se evalue en la comparacin. Los grupos familiares ms frecuentes usados en produccin animal, vegetal y forestal, son de a) propios hermanos; b) medios hermanos; c) un padre y el promedio de sus hijos y d) promedio de ambos padres con el promedio de sus hijos. Dependiendo del grupo o familia existen causas genticas y/o ambientales que determinan el parecido, condicin que se demostrar mediante las causas de la Covarianza entre el grupo familiar. Inicialmente revisaremos la CovG como responsable del parecido y posteriormente la CovE. Es importante recordar que, una covarianza se define como la suma de productos o suma de productos desviados y generalmente se obtiene evaluando al mismo animal para dos caractersticas diferentes, en este caso se est considerando a un grupo familiar, pero medido para el mismo carcter, por ejemplo, medir al padre para el carcter X y tambin medir a los hijos para el mismo X carcter, sea, en dos generaciones diferentes.

Covarianza Gentica (CovG) Se describa la causa del parecido gentico para los distintos grupos familiares: 1) Covarianza Gentica entre un padre y el promedio de sus hijos (CovOP): La covarianza gentica entre los hijos (O) y uno de sus padres, corresponde a la covarianza entre los valores genticos de individuos con el promedio de los valores genticos de sus hijos, asumiendo que los cruzamientos son aleatorios en la poblacin. Al expresarse los valores genticos como desvios de la media poblacional, entonces el promedio de los hijos de un padre corresponde a la mitad del valor aditivo del padre. Quedando la siguiente expresin: ( A, (A + D + I) ) = A2 + (A,D) + 1/2 (A,I); Al dividir esta suma de productos por el nmero de padres, se obtiene la CovOP: CovOP = VA + CovA,D + CovA,I CovA,D y CovA,I = 0, sea son
como ya demostramos anteriormente que las

independientes, por lo tanto:

CovOP =

VA

Tericamente, se puede demostrar resovieldo el ejmplo, con un locus con dos alelos, que obviamente sus conclusiones son vlidas tanto para un locus, como un loci. Las frecuencias genotpicas (p2: 2pq : q2), los valores genotpicos (2q (qd); (q p) + 2dpq y 2p(pd) ) y la de los valores aditivos de los tres genotipos (desviados de la media) sern: (q ; (q p) y -p ). Si se suman todos los productos desviados, se obtiene: 2 2 CovOP = pq (p2 + 2pq + q2) + 2p2q2 (-q +q p +p) = pq CovOP = VA

Como debemos recordar la covarianza solo mide si existe o no asociacin y si est es positiva o negativa, y si la estandarizamos por la varianza del carcter, sea, se divide est covarianza por la varianza fenotpica del carcter, en la poblacin, obtenemos una regresin de los hijos sobre un padre (bOP). bOP = VA / VP. 2. Covarianza Gentica entre el promedio de ambos padres y el promedio de sus hijos (CovOP): Asumiendo que por (P + considerar que productos ser: OP = los padres en promedio podran ser representados P). Simplicicando esta demostracin, podramos la suma de productos desviados, la suma de ( OP + OP);

siendo la covarianza: CovOP = ( CovOP + CovOP ), Ahora, sabemos que P y P tienen la misma varianza, CovOP = CovOP, lo que resulta finalmente que: CovOP = CovOP = VA

Sin embargo, siendo la covarianza gentica de los hijos sobre el promedio de ambos, igual a la covarianza gentica de los hijos sobre un padre, el grado de parentesco, no es el mismo. La dependencia de los hijos sobre la produccin del promedio de ambos padres, quedara representado por la siguiente regresin:

bOP = VA / VP = VA / VP ; es decir, es dos veces el coeficiente de regresin de los hijos sobre un padre. 3. Medios Hermanos (HS) Los medios hermanos (HS) son aquellos individuos que tienen solo un progenitor en comn. El valor gentico de la descendencia es por definicin la mitad del valor aditivo del padre en comn. Por lo tanto, la covarianza entre miembros de una familia de medios hermanos, es la varianza de los promedios de los grupos de medios hermanos, es decir, ser igual a la varianza de la mitad de los valores aditivos de los progenitores: COVHS = V ( 1/2 A ) = VA La demostracin terica, para un locus con dos alelos, indicara: COVHS = p2(q ) + 2pq ( (q p) ) + q (-p ) = pq COVHS = VA Sin embargo, el grado de semejanza entre medios hermanos se expresa como la correlacin intraclase, que representa la relacin entre la varianza entre grupos (Covarianza) y la Varianza total del carcter. 2A t = 2P
1/4
2 2 2 2 2

4.

Propios Hermanos (FS)

Los propios hermanos o hermanos completos (FS) son individuos que tienen ambos padres en comn, por ende, el promedio de los valores genticos es igual al promediode los valores aditivos de ambos padres, sea, ( A + A), si la varianza de ambos sexos fuese semejante, la covarianza ser: COVFS = V ( (A + A)) = ( VA + VA) = VA Adems, el parecido gentico entre propios hermanos aumenta por la probabilidad de dos hermanos recibir algn grado de dominancia semejante, lo que aumenta el hecho que propios hermanos se parecen por efectos genticos no

aditivos en comn entre ellos, sea, esto demuestra tambin porque dos propios hermanos a veces no son muy parecido dentro de un familia. Se podr demostrar con un ejemplo simple, en un solo locus (A), donde ambos padres puedan tener genotipos diferentes (heterocigotos cada uno), por lo tanto sus genotipos podran estar representados por: Padre A1A x Madre A3A4: los genotipos en la descendencia sern de cuatro tipos diferentes: A1A3 ; A1A4 ; A2A3 o A2A4, es decir cada tipo de hijo tendr una probabilidad de ocurrencia de . Si el primer hermano en la camada tiene algunos de estos genotipos, la probabilidad que el segundo hermano presente el mismo genotipo es . Por lo tanto, de todos los pares de hermanos completos tendrn el mismo genotipo y en consecuencia el mismo desvio de dominancia en ese locus (D), lo que determina que estos hermanos aumentan su semejanza o parecido gentico, por causas genticas no aditivas, sea, 2 interaccin dentro del locus. De ah que, la suma de productos, ser D , los productos medios igual a VD, sea es la covarianza debido a efectos de dominancia. Finalmente, la covarianza entre hermanos completos ser: COVFS = VA + VD. En este caso, la correlacin intraclase ser: 2A + 2D t = 2P
1/2

Covarianza Ambiental (CovE) Hasta ahora slo se ha considerado el aporte del parecido gentico entre pariente por causas genticas, sin embargo, tambin existen causas ambientales que aumentan el parecido entre parientes, sea, segn el grado de parentesco puede aumentar este parecido por efectos no genticos, que puede ser cuantificado como la CovE. Una condicin evidente en aumentar el parecido por condiciones ambientales, ocurre en una familia de propios hermanos, es decir, una camada de cerdos, que comparten condiciones ambientales comunes, tanto pre como portparto, situacin que genera diferentrecias mayores entre familias. Estos efectos generalmente estan asociados a efectos maternos, siendo estimada por

una CovE o mediante la varianza denominada de ambiente comn (VEC) y resulta solo en familias de propios hermanos fundamental en aumentar el parecido. Covarianza Fenotpica (CovP) Siendo por lo tanto, la covarianza fenotpica el resultado de sumar las CovG + CovE. Esta informacin desde el punto de vista gentico y estadstico puede ser resumida en la siguiente Tabla 12. TABLA 12. Resumen de las covarianzas y estimadores segn grado de parentesco. Parientes Covarianza Estimador (t o b)

OP OP HS FS

VA VA VA VA + VD + VEC

b = VA / V P b = VA / V P t = VA / V P t = ( VA + VD + VEC)/ VP

HEREDABILIDAD, METODOS DE ESTIMACIN Y APLICACIONES. HEREDABILIDAD (h2: "Heritability") Es un parmetro muy usado en mejoramiento animal para describir que fraccin de las diferencias fenotpicas observadas en un carcter, como produccin de leche o velocidad de crecimiento, etc., se deben a diferencias genticas entre los individuos. Frecuentemente, se habla de caracteres que son "heredables" a "altamente heredables" para enfatizar que una proporcin importante de las diferencias que se observan entre individuos, para una caracterstica, son causadas por la diferencias en los genes que aportan esos individuos y solamente una proporcin poco importante de esas diferencias son causadas por el ambiente en el que ellos se encuentran produciendo. Cuando las diferencias en un carcter son causadas principalmente por el ambiente y en escasa proporcin por el componente gentico, se podra hablar de caractersticas "menos heredables". Las diferencias en color rojo y negro en vacunos y el grado de engrasamiento son, respectivamente, ejemplos de la primera y de la segunda situacin. Si se dispone de suficiente informacin, se puede conocer, con bastante exactitud, la importancia del componente gentico y del ambiental para un carcter en particular en una poblacin determinada. Del conocimiento de esta proporcin surge la posibilidad de conocer el cambio que puede esperarse en una caracterstica de una generacin a la siguiente. Este es el rol predictivo de este parmetro. La heredabilidad se define como la proporcin de la varianza aditiva sobre la varianza fenotpica: h2 = VA / VP. Una forma semejante de expresar h2 es mediante la regresin de los valores aditivos (suma de efectos promedios) sobre los valores fenotpicos: h2 = b AP. Por lo tanto, una esperanza del valor aditivo de un animal podra ser bien estimada por A = h2 P. La heredabilidad es una propiedad del carcter, de la poblacin y del ambiente donde son medidos los individuos, por lo que la h2 depende de los componentes de varianza fenotpica y por tanto, cambios en esos componentes originar tambin cambio en el valor de h2 .

No es pues de extraar, que las estimaciones varien para el mismo carcter en diferentes poblaciones o en las mismas poblaciones a travs del tiempo. La VA podra tender a disminuir por seleccin, mientras que VP podra alterarse por modificaciones ambientales. Al observar los valores de h2 en diferentes caracteres para distintas especies animales, se observa, en general, que las heredabilidades son bajas en caracteres relacionadas con adaptacin. Una causa que podra explicar esos valores sera que dichos caracteres han sido sometidos por varias generaciones a mayor presin de seleccin que caracteres menos asociados con la adaptacin. Mtodos de estimacin de h2 1.
2

Regresin de la descendencia sobre un padre (bOP):

En este caso, h2 se estima multiplicando por 2 el coeficiente de regresin: h = 2 b. - Un supuesto de este mtodo es qu los fenotipos de padres e hijos no estn correlacionados, lo que es difcil de sostener en ganado lechero donde madres e hijas estn produciendo en el mismo establo. - Si existe covarianza ambiental entre padres e hijos, seria conveniente estimar b mediante una suma de productos originados por el desvo de un padre con el desvo promedo de su progenie. 2. Regresin de la descendencia sobre el promedio de ambos padres (bOP). Estima directamente la heredabilidad: bOP = h2
2

Esta regresin asume que las varianzas entre ambas sexos son iguales ( = 2).

3.

Covarianza de medios hermanos (CovHS) 4 S h = S +

2

a)

Este mtodo supone que las madres con las que se cruza un padre son una muestra aleatoria de la poblacin y que los grupos de medias hermanas son cradas bajo condiciones semejantes. Ambos supuestos impiden que se origine covarianza entre padres y efectos aleatarios.

b) Este mtodo supone que la covarianza ambiental entre individuos del mismo grupo es cero. c) El grupo de padres considerados sea una muestra aleatoria de la poblacin y suficientemente numeroso para que sea una estimacin consistente. 4. Covarianza de propios hermanos (CovFS) 2 FS h2 = FS +

Este mtodo incluye varianza de dominancia y de ambiente materno en su numerador.

MERITOS DE LAS DlSTlNTAS CLASES DE PARENTESCO EN LA ESTIMACION DE LA VARIANZA ADITIVA A PARTIR DE LA COVARIANZA GENETICA Y SOBRE LA ESTIMACION DE LA HEREDABILIDAD POR REGRESION o CORRELACION. GRADO PARENTESCO PROGENIE Y UN PADRE PROGENIE Y PROMEDIO DE PADRES MEDIOS HERMANOS PROPIOS HERMANOS COVARIANZA* VA VA VA VA + VD + VEC REGRESIN (b) O CORRELACIN (t) b = h2 b = h2

t = h2 t > h2

* El aporte de las interacciones epistticas son ignoradas. EI mejor mtodo para estimar h2 depende del tipo de parentesco, por ende la eleccin del tipo de parentesco a establecer en la poblacin est dependiendo adems de muchas otras condiciones. Condiciones para un buen estimador Obviamente que la situacin prctica del carcter, especie, etc. es muy determinante en facilitar la decisin de que tipo de parentesco se deba utilizar y con ello la obtencin de informacin en el rebao. Adems existen 2 aspectos importantes que se deben conocer: a) Precisin en la estimacin (s.e.) b) Posible sesgo en la estimacin (CovE)

101

a) En general la exactitud o precisin en la estimacin (error estndar) de h2 es tanto mayor mientras ms; cercano es el parentesco. La causa esta determinada por el factor (1/r: 1, o ) que debe multiplicar al parmetro estimado y tambin su error estndar. Tambin la precisin depende mucho del dseo experimental, ya que mediante un buen diseo se disminuye el error estndar de la estimacin. El nmero mnimo de individuos por cada familia necesarios para obtener buena estimacin juega tambin un rol fundamental. Naturalmente que tiene implicancia directa en los costos y sobre la capacidad fsica de instalacin. b) El sesgo en la estimacin de la h2 es ms importante que la precisin en la estimacin, ya que al introducir sesgo al parmetro principalmente por los componentes ambientales de Covarianza (COVE) es muy difcil de eliminar a pesar de tener un buen diseo experimental (estadstico). En base al conocimiento de la biologa del carcter y del diseo experimental se puede decidir cual Covarianza es la menos suceptible de aumentar a causa de un componente ambiental. Desde este punto de vista las ms confiables estimaciones de h2 son mediante, la correlacin de medios hermanos y la regresin de la descendencia sobre el padre. Pero la regresin de la descendencia sobre las madres segn el carcter, est sujeta a sobreestimacin por presentar efectos maternos (peso corporal en la mayora de los mamferos). El nico parentesco que presenta componentes ambientales de covarianza es la correlacin entre propios hermanos, por ende tambin sobreestima al parmetro (VEC), este componente de ambiente comn es muy difcil de eliminar por un diseo experimental y/o estadstico adecuado y adems est an ms sobreestimado por la presencia de componentes de dominancia (VD). Por lo tanto, tFS sobreestima h2, sealando casi siempre un valor mximo de la h2, para un carcter y esta estimacin es la ms insegura de todas (> Sesgo). Una complicacin, en la utilizacin para estimar la h2 a travs del uso de la regresin de la descendencia sobre los padres, se presenta cuando las varianzas de ambos sexos son diferentes. Anteriormente vimos que la Covarianza entre los descendientes y el promedio de padres es igual a V A, slo bajo el supuesto que las varianzas fenotpicas en ambos sexos sean iguales. En caso de que las varianzas sean distintas para ambos sexos, entonces no deber usarse bOP para estimar h2, sino que, la h2 debe estimarse separadamente por sexos. Por ejemplo la regresin para machos se podr hacer de los hijos sobre el padre o de las hijas sobre el padre. Considerando que la regresin de las hijas sobre el padre debe corregirse por la diferencia entre las varianzas de ambos sexos, mediante la multiplicacin de la relacin entre las desviaciones estndares / siendo, por ejemplo, la regresin de
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las hijas sobre el padre corregida (b') de la siguiente manera: b' = b / . De manera semejante se debe corregir para el caso de la regresin de los hijos sobre la madre (b' = b / ). Ejemplo: se estim h2, para el peso corporal a las 6 semanas de edad en ratones mediante la bOP (Falconer, 1973). Determinndose diferentes valores para las varianzas de ambos sexos, las que fueron: = 3.786; = 2.675; / = 1.415; / = 0.707. Las diferentes regresiones estimadas sus errores estndares corregidas por la diferencia entre las varianzas segn sexo fueron (Tabla 13).
TABLA 13. COEFICIENTE DE REGRESION (bOP) FACTORES DE CORRECCION. MACHOS ERRORES STANDARES Y LOS PADRES DESCENDIENTES HIJOS HIJAS HEMBRAS (0,324 0,064) x 0,707 0,229 0,045 0,237 0,043

0,119 0,040 (0,111 0,029) x 1.415 0,157 0,041

Como las regresiones son bOP, deben multiplicarse por 2 tanto el parmetro como su respectivo error estndar, por lo tanto finalmente se obtienen los siguientes valores de h2 s.e. (Tabla 14).
TABLA 14. HEREDABILIDADES ERRORES STANDARES PARA PESO CORPORAL EN RATONES. PADRES DESCENDIENTES HIJOS HIJAS COMBINACIN MACHOS HEMBRAS

0,238 0,080 0,314 0,080 0,270 0,060

0,458 0,090 0,474 0,090 0,470 0,060

Los valores de h2 para diferentes sexos de los descendientes dentro del mismo padre no se diferencian estadsticamente, en cambio las diferencias fueron significativas al considerar los valores estimados entre diferentes padres (machos versus hembras). Se observaron mayores valores en las hembras por sesgo producido mediante la presencia de los efectos maternos.

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Estimacin de heredabilidad utilizando el parentesco entre hermanos Los datos frecuentemente vienen estructurados de la forma siguiente: muchos padres se han cruzado con varias hembras y los hijos de cada madre son los que proporcionan la informacin (en ellos se realizan mediciones). PADRE-1 2 3 x x x x x x x x PADRE-2 4 5 6 x x x x x x x x x x x x PADRE-3 7 8 9 10 x x x x x x x x x x x x x x x PADRE-4 11 12 14 15 x x x x x x x x x x x x x x x

1 x x x

De este esquema se puede observar que la poblacin esta compuesta de grupos de medios y propios hermanos. La Varianza Fenotpica desde el punto de vista observacional se puede partir en los siguientes componentes: 1.Entre padres (s), explicado por las diferencias entre progenie de los diferentes padres (s = nmero de padres). 2.Entre madres (d), explicado por las diferencias entre las progenies de las madres que se cruzan con un mismo padre (d = nmero de madres por cada padre). 3.Dentro de Progenie ( e), originado por las diferencias entre hijos de una misma madre (n = nmero de hijos por madre).
TABLA DE ANDEVA (Componentes observacionales): FUENTE DE VARIACIN Entre padres Entre madres (dentro de padres) G.L. s 1 s(d-1) sd(n-1) C.M. CMs ESPERANZA C.M.

e + n d + n d s e + n d e

CMd CMe

Dentro de progenie

Este modelo asume que los componentes padres, madres y progenie (error) son aleatorios. Adems, se asume que el nmero de hijos por padre es igual para todas las madres y que el nmero de madres es igual en todos los padres. Esta evaluacin se debe realizar por el siguiente Modelo matemticoestadstico: yijk = + si + dij + ijk donde: i = 1, ...., s; j = 1, ....., d; k = 1, ....., n si = ~ N (0, s) ; dj = ~ N (0, d) ; ijk = ~ N (0, e) .

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Siendo por ende la varianza fenotpica total igual a la suma de todos los componentes aleatorios del modelo, que en este caso ser igual a la suma de la varianza entre padres, la varianza entre madres y la varianza dentro de progenie: y = s + d + e , que no necesariamente coincide con la varianza fenotpica de la suma de cuadrados totales dividida por los grados de libertad correspondiente (total = sdn - 1).
COMPONENTES OBSERVACIONALES Y COMPONENTES CAUSALES EN UN ANALISIS DE HERMANOS. COMPONENTE OBSERVACIONAL Padres Madres Progenies COVARIANZA COVHS COMPONENTE CAUSAL

s d e

= = = VP

= VA

COVFS - COVHS = VA + VD + VEC VP - COVFS = VA + VD + VC + VEW = VA + VD + VC + VEW + VEC

TOTAL s + d + e =

Para mayor claridad en la comprensin en la estimacin de este parmetro gentico, desarrolle los ejercicios presentes el la Gua de Pasos Prcticos. Comente con sus compaeros la interpretacin de dichos resultados.

105

CARACTERES CORRELACIONADOS Antes de confeccionar un programa de mejoramiento gentico en nuestras especies pecuarias, es fundamental conocer el carcter, la poblacin mediante la estimacin de todos los parmetros fenotpicos, genticos y ambientales, que ayudan a mejorar la eficiencia de cualquier mtodo que puediese aplicarse a esa poblacin. Conociendo lo complejo de la metodologa, tambin es importante reconocer que las caractersticas productivas no son independientes entre si, ya que muchas de estas estan asociadas, a veces, en una gran magnitud. El grado de esas asociaciones se obtiene con la estimacin de la correlacin entre las diferentes variables productivas, si existe correlacin entre dos caractersticas, al variar una de ellas, tambin sufrir variaciones de manera conjunta la otra caracterstica. Existen muchos ejemplos en produccin animal, tales como, saber biologicamente que el tamao del huevo en aves esta correlacionado negativamente con la produccin de huevos y tambin correlacionada positivamente con el peso del ave. Siendo estas variables productivas fundamentales para un sistema productivo, ya que entre otros efectos fundamentales, el peso del huevo tiene un inters econmico directo en el sistema intenso de produccin de huevos. La correlacin fcil de estimar, entre las varibles productiva, es la correlacin fenotpica, sin embargo, la asociacin fenotpica es el resultado de un componente gentico ms otro ambiental, es decir, esta asociacin se puede estimar mediante las covarianzas genticas aditiva ms ambiental (CovP(x,y) = CovA(x,y) + CovE(x,y)), entre ambas variables productivas. Lo que permite estimar posteriormente, las correlaciones fenotpicas, genticas o aditivas y ambiental, que se definen como rPxy, rAxy y rExy, respectivamente. Pero la correlacin fenotpica no es igual a suma de las correlaciones genticas aditivas y ambientales, como se describir posteriormente. Correlacin Fenotpica (rPxy) La correlacin fenotpica, corresponde a la asociacin entre los valores fenotpicos de los individuos para dos caractersticas productivas. Su estimacin generalmente no ofrece mayores dificultades. Estas correlaciones son propieadades de la poblacin donde se estiman sus magnitudes. La frmula de la correlacin fenotpica es: CovPxy CovPxy Px Py

rPxy

= = VPx*VPy

Conociendo que la CovPxy es la suma de las covarianzas aditiva y ambiental, por lo tanto, la correlacin fenotpica se puede expresar:

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CovPxy

CovA(x,y) + CovE(x,y) Px Py
2 e 2

rPxy

= = ; Px Py

si, h2 =

/ P; h = A / P ; e2 =

/ P; e = e / P,

lo que determina que la desviacin estndar fenotpica es: P = A/ h + e/ e Por lo tanto, la correlacin fenotpica puede definirse como: CovAxy CovE(x,y) (ex/ex) (ey/ey)

rPxy

= + (Ax/hx) (Ay/hy)

CovAxy

CovE(x,y) + eX eY ex ey

rPxy

= hX hY Ax Ay

rPxy

hX hY rAxy

eX eY rExy

resultando, por lo tanto, esta derivacin nos demuestra que no se puede conocer la correlacin fenotpica solo conocinedo la correlacin aditiva y ambiental, sino que tambin se necesita conocer las heredabilidades y ambientalidades de ambas caractersticas productivas. Lo que obliga realizar estadsticamente un Anlisis de Covarianza (ANCOVA), y dos Anlisis de Varianza (ANDEVAs), para obtener todos los parmetros necesarios. Algunos valores de correlaciones se entregan en la Tabla N XX. La relacin que existe entre estos parmetros nos asegura a observar que si llos dos caracteres tienen bajas heredabilidades, la correlacin fenotpica deber estar principalmente determinada por la correlacin ambiental, en cambio si ambas poseen altas heredabilidades, la correlacin gentica aditiva ser la ms importante. Lo que permite inferir que la magnitud ni el signo de la correlacin gentica pueden ser obtenerse de la correlacin fenotpica. Finalmente, para obtener las estimaciones de las correlaciones genticas, es necesario recurrir a los mismos mtodos apoyados en la semejanza entre parientes, pro ejemplo, el mtodo de mayor uso es el parentesco entre medios hermanos.

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Correlacin Gentica (rAxy) La correlacin gentica (aditiva) corresponde al grado de asociacin entre los valores aditivos (efectos promedios de los genes) de un carcter con respectoa otro, siendo muy importante de estimar en una poblacin, ya que esto significa reconocer la existencia de alguna de las dos causas genticas: pleiotropa y ligamiento, condiciones necesarias en un mismo cromosoma. Pleiotropa: es la propiedad de un gen en particular de afectar dos o ms caractersticas, causando variacin simultnea en las carctersticas afectadas. Ligamiento: es generalmente una causa de correlacingentica transitoria y se debe a la cercana fsica de dos genes en un cromosoma y que puede llegar a romperse por crossing-over y seleccin. Correlacin Ambiental (rExy) La correlacin ambiental se refiere a la asociacin por causas ambientales y efectos genticos no aditivos (dominancia, interaccin). TABLA 15. Correlaciones fenotpicas, ambientales, en diferentes especies. genticas aditivas y

rPxy
Hombre: Nivel Inmunologulinas sricas IgG:IgM Bovinos: Produc.leche: % grasa (1ra lactancia) Produccin leche 1ra:2da lactancia Cerdos: Ganancia de peso:espesor grasa dorsal Ganancia de peso:Eficiencia Alimenticia Ovinos: Peso corporal: Peso velln limpio Peso velln limpio: Dimetro fibra Aves: Peso corporal: Peso huevo Peso corporal: Produccin huevos Peso huevo: Eficiencia Alimenticia 0,20 -0,26 0,40 0,00 0,66 0,45 0,40 0,30 0,01 -0,05

rAxy
0,07 -0,38 0,75 0,13 0,69 0,22 0,39 0,42 -0,17 -0,31

rExy
0,31 -0,18 0,26 -0,18 0,64 0,55 0,41 0,23 0,08 0,02

108

MEJORAMIENTO GENTICO El mejoramiento gentico consiste en producir cambios de la frecuencia gnica en la poblacin por el productor, genetista o investigador. Ese objetivo se puede realizar por dos diferentes vias: 1) Eleccin de animales de mayor inters productivo (gentico) de la poblacin: Seleccin. 2) Dependiendo de las formas como se realicen los apariamentos: Cruzamientos que pueden ser nediante: a) Endocruza (Inbreeding) o b) Exocruza (Crossbreeding). Seleccin Artificial La seleccin artificial consiste en cambiar las frecuencias gnicas de las poblaciones por el criador, permitiendo que solo ciertos animales de la poblacin participen en la reproduccin dejando descendencia y los otros sencillamente sean eliminados de la reproduccin, por ende no aportarn descendientes en el futuro. Los cambios observados en la produccin se deben por un lado a la seleccin que realizan los productores y por otro lado al mayor conocimiento de los mecanismos fisiolgicos y productivos en que esa poblacin produce, por ejmeplo, factores ambientales, etc. Adems las diferencias gnicas presentes en una poblacin son causas importantes de la variacin observada. Es importante sealar que por seleccin se entiende adems la reproduccin de los mejores animales, para ser eficiente en el cambio que se pretende efectuar en la poblacin, sin embargo, cal ser el criterio de considerar a un animal mejor que otro?. En gentica cuantitativa el mejor animal, debe cumplir con muchas condiciones, que se podran resumir que este animal debe ser el de mayor productividad, esto implica obviamente compararlo con el resto de los animales, no solo productivamente sino que tambin evaluando la importancia y rendimiento econmico que determina al productor. Por lo tanto, la dificultad radica en el criterio a utilizar para seleccionar a un individuo. El anlisis de la seleccin artificial desde el punto de vista gentico cuantitativo puede estudiarse tericamente de dos maneras: 1. Poder predecir el resultado de la seleccin de la mejor manera es decir, lo ms preciso posible, para garantizar una alta eficiencia. 2. Eleccin de los mejores animales en base a sus mejores valores aditivos (Ai). Seleccin fenotpica Se determinar la respuesta a la seleccin, realizada como consecuencia de seleccionar individuos solo por su nivel productivo (valores fenotpicos). En la prctica para un carcter cuantitativo, es imposible conocer las frecuencia gnicas de los individuos involucrados, para el carcter que se

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desa seleccionar, es por eso que se recurre a las propiedades observacionales de la poblacin, sea definir el carcter en esa poblacinmediante sus parmetros: media, varianzas y covarianzas, siempre asumiendo que estos parmetros reflejan los cambios de la frecuencias gnicas del ganado sometido a seleccin. Respuesta a la seleccin Naturalmente que eleccin de los mejores animales se basa en los mejores valores fenotpicos, determinndose as cuanto ser el cambio (/\ o R y sus costos, apar as procurar la mejor relacin beneficio-costo. Los cambios por seleccin se describen comparando 2 generaciones sucesivas de seleccin a edades semejantes, es decir, a iguales puntos del ciclo de vida de los animales al ser medidos. Los cambios de las frecuencias gnicas tienen 3 origenes principales: 1) Los padres seleccionados difieren en frecuencia gnica comparado con el resto de la poblacin de la cual provienen (pS p0). Si no existe diferencia en fertilidad de los padres y diferencia en viabilidad de los descendientes, la poblacin resultante de los descendientes tendr la misma frecuencia gnica de los padres Diferencias naturales en fertilidad del grupo de padres selecionados, modifican la frecuencia gnica esperada. Diferencias en la sobrevivencia de los descendientes o hijos de los padres seleccionados.

2)

3)

Los puntos 2) y 3) demuestran que la seleccin natural siempre opera en todas las poblaciones, generando obviamente cambios de la frecuencia gnica, pero siempre se reconocen en general que son de baja magnitud. El cambio de la frecuencia gnica de F 0 a F1 se mide en los cambios de la media poblacional de una generacin a otra, este cambio se denomina Respuesta a la seleccin (R) y se mide como la diferencia entre el promedio de la poblacin resultante en la progenie de los individuos seleccionados y la media de la poblacin original o total (incluyendo a los padres seleccionados). Se debe definir el Diferencial de Seleccion (S) que corresponde a la diferencia entre dos promedio: promedio del grupo de padres seleccinados menos la media poblacional (X - ) y la Respuesta se mide en la F1 y depende de los valores fenotpicos de los apdres y se puede cuantificar. Si se grfica la produccin de pares padre-descendientes en un eje de coordenadas siendo X la poblacin F0 (S) y el eje Y la produccin de los hijos o F1. Con esta informacin se puede predecir cuanto cambiar R por cada unidad de cambio en S, sea bOP = R/S, lo que permite obtener R conociendo la bOP y S (diferencial de seleccin), al parecer en esta expresin no existe ningn componente gentico, lo que obviamente no es as, ya que recuerde
110

que la bOP es la heredabilidad del carcter, Por lo tanto con informacin solo de F0 se puede obtener la prediccin a la respuesta a la seleccin: R = bOP x S = h x S La respuesta ser cada vez ms valida mientrs ms confiable sea la 2 estimacin de la heredabilidad del carcter. Si la h = 0, no habr respuesta a la seleccin (R = 0). No debemos olvidar que la VA cambia por efecto de la seleccin (cambia 2 la frecuencia gnica), por lo tanto se debe estimar la h en cada generacin para predecir con mayor exactitud la Respuesta. En la prctica los cambios de R son pequeos en una generacin (carcter determinado por muchos loci). En 2 general la h , se mantiene relativamente constante entre 5 a 10 generaciones, dependiendo de la poblacin y del carcter. Diferencial de seleccin (S) Este S es un parmetro fenotpico y depende de dos factores: porcentaje de animales seleccionados (%p) y de la variabilidad del carcter (P ). Es necesario hacer 2 supuestos para explicar la importancia de S y los factores que la afectan: 1)
2)
2

Los valores fenotpicos deben tener una distribucin normal = N (0,1) y Seleccin solo aplicada por la produccin de los animales, sea, seleccin por truncacin. Es decir, se determina un nivel mnimo de produccin para que los animales queden seleccionados y el animal que no cumple esa condicin es eliminado de la poblacin.

Finalmente, el S depende solo del porcentaje de animales seleccionados y de la desviacin estndar del carcter fenotpico (P ). Si se desea expresar R y S de manera general, debemos estandarizar dividiendolas por P. As es muy til para comparar R de un carcter en diferentes poblaciones y en diferentes caracteres en una misma poblacin. La expresin queda de la siguiente forma: R = ( h x S x P) / P
2

Si el diferencial de seleccin estndarizado (S/P) se define como la intensidad de seleccin (i), entonces: R = h i P
2

111

Al estndarizar la poblacin la i depende exclusivamente del % de animales seleccionados y as se puede obtener directamente i conociendo solo %p, es decir, a cuantas desviaciones estndar queda la media de los padres seleccionados, sea, cuanto ms lejos de la media poblacional i es cada vez mayor. Por lo tanto, la relacin inversa entre %p de seleccionados y la intensidad de seleccin, definida estadsticamente, i = Z/p (en la curva normal), donde Z es la altura en el punto de truncacin y p el % de seleccionados. De esta forma, la intensidad de seleccin puede ser fcilmente calculada a travs del conocimiento del porcentaje de animales usados como padres de la siguiente generacin utilizando tablas de ordenadas y reas de la curva normal. La tabla de intensidad de seleccin se encuentra en la Gua de Pasos Prcticos de Gentica. El S supone una sobrevivencia promedio de todos los animales semejantes, en esta expresin, condicin que no es verdica en la prctica, adems los machos y hembras en la poblacin se seleccionan con diferente intensidad, es decir, en produccin animal es claro que se necesitan mucho menos machos que hembras en la reproduccin. Tambin recuerde que existen caracterstcas que se puede medir en un solo sexo, lo que obliga cada vez a calcular S e i como el promedio ponderado de ambos sexos, es decir: S = (S + S) ; i = (i + i) En caso de solo seleccionar fenotpicamente las hembras, por ejemplo en carcter que solo ellas producen, peso del huevo en aves, produccin de leche en bovinos, etc., la expresiones sern: S = S , es decir entonces: R = h S Es importante considerar que el cambio en el promedio fenotpico corresponder a la respuesta esperada por seleccin, solo cuando no exista endogamia, deriva gnica y cuando los efectos ambientales sobre las generaciones de padres y progenie sean idnticos, es decir, representa cambio gentico solo el cambio ambiental es cero. En situaciones experimentales, los efectos ambientales se pueden estimar mediante lineas control. Otra consideracin impportante para mejorar la prediccin de la respuesta a la seleccin fenotpica, es reconocer que el Diferencial de seleccin (S), no tiene implicito el efecto de la seleccin natural, que generalmente opera en contra de la selccin natural, es decir, impide o retrae el avance gentico, por lo tanto, es importante calcular otro parmetro que corriga este efecto, este parmetro se denomina Diferencial de Seleccin Realizado (SR), que mediante la expresin SR / SI determina la direccin de la respuesta y tambin cuantifica el efecto de la seleccin natural. Comente como podra aumentar al mximo la Respuesta a la seleccin, objetivo que siempre el productor le exigir, en caso de que Ud. sea el profesional responsable del mejoramiento gentico en una poblacin animal. Resuelva los ejercicios de la Gua Prctica de Gentica.
2

112

Cambio gentico por unidad de tiempo y Lapso intergeneracional El verdadero obejtivo de un productor en trminos prcticos es cuanto avanzar o ganar en una unidad de tiempo conocida y no el cambio obtenido por generacin, como es la magnitud entregara con R. El progreso de mayor importancia es por unidad de tiempo ms que el progreso por generacin. Recuerde que no es lo mismo trabajr con bovinos de leche que con cerdos, donde una generacin es muy diferente entre ambos. Por ende es necesario definir el lapso entre generaciones (IEG = L), como la edad promedios de los padres cuando sus hijos sern los padres en la prxima generacin, es decir, la edad de los padres cuando sus hijos son seleccionados para el carcter. Sion embargo, es importante recordar que el IEG depende es una propiedad: de la especie, sexo y carcter a seleccionar. Por lo tanto, es importante predecir la Respuesta a la seleccin por unidad de tiempo (aos), con la siguiente expresin: /\GANUAL = R / L El L aumenta si se espera por un mayor nmero de descendientes, lo que determinar que la R por unidad de tiempo (anual) sea menor, pero ka intensidad de seleccinaumenta al disponer de maypr nmero de individuos a medir, entonces como se logra mximizar la respuesta, eso es en definitiva un conflicto, ya que al aumentar L exclusivamente resulta poco interesante por presentar R escaza al ao, ya que al productor de leche lo que ms le interesa, es cuanta leche aumentar anualmente, este conflicto esta determinado por la relacin entre i/L, donde: 2 h i P /\GANUAL = ; L Por lo tanto, para mximizar la respuesta anual se debe encontrar el mejor compromiso entre i e L, adems recordemos que tambin en seleccin la cantidad de machos es generalmente menor o diferente a las hembras necesarias para seleccionar, lo que determina que el L debe ser tambin la suma de los L en ambos sexos: L = L + L, entonces para mximizar la R la relacin que debe ser mxima i/L, es: Mximizar R se logra mximizando (i + i) / (L + L). Ya Rendel y Roberton (1950), al inicio en USA de la inseminacin artificial (IA) desarrollaron un modelo de respuesta a la seleccin en ganado lechero, que cuenta simultneamente de 4 vas que participan en el mejoramiento gentico y la importancia relativa, se resume el la Tabla 16.

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TABLA 16. Estimacin de la ganancia gentica anual para el ganado lechero en 1950. Padres Seleccionados para padres Superioridad Gentica Padres Potenciales potenciales Machos Toros que generan toros (TT) 39% Machos iTT Toros que generan vacas (TV) 32% Hembras iTV Hembras Vacas que generan toros (VT) 27% Machos iVT Vacas que generan vacas (VV) 2% Hembras iVV

Por lo tanto, la ganancia gentica, debe ser mxima cuando la relacin se considere y se maximize:

iTT + iTV + iVT + iVV LTT + LTV + LVT + LVV

Para demostrar que la tecnologa gentica actual determina un mayor avance gentico, le sugiero que resuelva un ejercicio al respecto de la Gua de Pasos Prcticos, donde se comparan las ganancias genticas cuando se aplica adems de IA, transferencia de embriones y sexado de embriones, en el ganado bovino de leche.

Eleccin de los mejores animales segn su valor gentico Aditivo (Ai) Predecir el valor aditivo de un individuo se puede efectuar en forma 2 terica como ya fue propuesto anteriormente (estimacin de la h ) mediante la aproximacin de la ecuacin: Ai = h x Pi, sin embargo, se han desarrollado muchos metodologas ya que el valor aditivo nunca se podra conocer, sino que solo buscar vas adecuadas para estimarlo. Actualmente, su estimacin se basa en el principio que el valor Aditivo es una variable aleatoria de la poblacin, que deber ser predecible de la forma lo ms exacta posible para garantizar as el menor error en la eleccin de un animal genticamente superior a otro, para ser utilizado definitivamente como futuro padre. Es importante describir la diferencia entre estimacin y prediccin de una variable aleatoria, para ello, podramos considerar por ejemplo, si existe un reproductor, el lograr su evaluacin de su valor aditivo corresponder a un problema de estimacin. En cambio, si deseamos evaluar el valor aditivo potencial de un cruzamiento entre dos progenitores, este ser un problema de prediccin. Es decir si estamos interesados en registros futuros, el problema claramente corresponde a una prediccin. La variable aleatoria se define en general por letra minuscula u, ya que los efectos fijos siempre por letras maysculas.
2

114

Mtodos para obtener el mejor predictor se han propuesto en base a sus propiedades, tales como: 1) Mejor Predictor (Best Predictor, BP)

Cuyo principio bsico es predecir una variable aleatoria u, mediante una funcin de los datos y, tal que = f(y). La derivacin del mejor predictor se basa en encontrar una funcin de y, f(y), tal que minimize el error 2 de prediccin E( u) = mnimo, definida como una funcin condicional: F(y) = E ( u / y); lo que requiere el conocimiento de la distribucin de y y u, f(y, u). Propiedades del BP: 1) E (i) = E(ui), es decir, se cumple con ser insesgado. 2) Var (i ui) = Var (u / y), promediada sobre la distribucin de y.
3)

Maximiza r, u para todas las funciones de y.

Mejor Predictor Lineal (Best Linear Predictor, BLP) Normalmente se conoce la distribucin de y, y tambin de u, se puede considerar que la prediccin lineal minimiza el cuadrado de los errores de prediccin. Significa que se est interesado en encontrar una funcin lineal de los datos, tal que: = a y + d, tal que E( u) = mnimo. donde a es un vector y d un escalar. En contraste al BP, el BLP no requiere el conocimiento de la forma de la distribucin de (y, u). La E(u) = 0; E(y) = Xb; Cov (y,u) = C y Vy = V. E( u) = E(ay + d - u) = a V a 2 aC + a Xb (Xb) a + d , Derivando con respecto a a y d, se obtiene matricialmente la ecuacin: V + Xb(Xb) Xb
-1 2 2 2 2

Xb 1

a = d

C 0
-1

Cuyas soluciones son: a = V C y d = -(Xb) V C; * De esta forma, los BLP de son: -1 = C V (y Xb)

115

el cual es igual a E( u y) cuando y e u tienen una distribucin conjunta normal. El ponderador de la informacin fenotpica corregida popr los efectos ambientales (conocidos), (y Xb), es igual a un coeficiente de regresin de la -1 variable aleatoria u sobre y. C V Propiedades del BLP 1) E (i ) = E(ui) , es decir es insesgado. 2) Var (i ui) = Var(u) - Var ().
3)

Maximiza r, u para todas las funciones de y.

Fue en 1941 cuando Lush, Hazel desarrolla el indice de seleccin para un tipo de seleccinmultivariada y el mismo en 1947 propuso los indices de seleccin utilizando informacin combinada de parientes. Evaluacin gentica mediante BLP (Indice de Seleccin) La exactitud de las evaluaciones genticas garantiza a los productores un mayor avance gentico en el menor tiempo posible, siendo la exactitud en la prediccin de los valores aditivos evaluacin el factor determinante de este progreso. Con esta evaluacin el productor puede ordenar a los animales (ranking) y eleguir a los mejores y por lo tanto eliminar aquellos de bajos valores. El ndice de seleccin es un mtodo que maximiza la exactitud en la prediccin de los Ai, por ende, maximiza el avance gentico por generacin producto de la seleccin. Recordemos que las caractersticas cuantitativas, de mayor importancia econmica para los productores, estn determinadas por muchos genes cuyos fectos son muy pequeos sobre el carcter. El objetivo fundamental de la seleccin es identificar aquellos padres que produzcan descendencia superior para ese carcter, y como es el componente aditivo del genotipo es el nico que se traspasa de padres a hijos, en cambio la dominancia e interaccin se producen en la descendencia producto de la combinacin de los genes paternos y materno en cada uno de los loci, producto de la segregacin independiente de estos genes. La mejor evaluacin entonces del valor aditivo de un individuo para un carcter deber involucrar desde el registro propio del individuo (cuando pueda ser medido) y sus parientes, debidamente ponderado. Los registros de parientes mas cercanos con el individuo recibirn una ponderacin ms alta que aquellos registros de individuos ms distantes, esta ponderacin corresponde a la cantidad de genes y efectos gnicos que comparten con el individuo. Obviamente, que los registros antes de que sean ponderados por la cantidad de informacin gentica que ellos contribuyen, deben ser ajustados (correguidos) por todos aquellos efectos ambientales de manejo u otros no

116

genticos identificables que afectan al fenotipo. El modelo simple que explica un valor fenotpico, es: Pi = + Gi + Ei donde: representa el mayor de los efectos ambientales no aleatorios (fijo) identificables tales como el nivel de manejo del predio, la estacin del ao, etc. Por ende, puede ser diferente para cada animal y cada registro de cada animal. Un ejemplo de un modelo ms complicado puede ser: Pi = Efecto de manejo + efecto sexo del animal + Efecto de la edad de la madre + efecto del ao + Gi + Ei + * donde: * ahora representa el promedio gentico de los animales ms el promedio de aquellos efectos ambientales no identificados en la poblacin. El ajuste de tales factores se realiza desviando los registros desde los no genticos efectos identificables. El modelo simple para un registro ajustado sera: Xi = Pi - = Gi + Ei, En cambio el modelo ms complicado el registro ajustado sera: Xi = Pi - Efecto de manejo - efecto sexo del animal - Efecto de la edad de la madre - efecto del ao - * = Gi + Ei Teora del Indice de Seleccin Univariado El ndice de seleccin es el mtodo para encontrar los apropiados ponderados para los registros del animal y de sus parientes. El trmino de ndice se refiere a un valor para cada animal o puntaje que permite ranquear (indexar) a los animales en relacin a otros. La ecuacin para predecir los valores aditivos de cada animal (Ai) ser definida por: i = b1X1 + b2X2 + ......... + bNXN

117

donde: b1 es el ponderados para X1 o el registro correguido del pariente 1; b2 es el ponderador de X2 que es el registro del pariente 2 y bN es el ponderador de XN que es el registro del N-simo pariente. Los valores de X, pueden representar promedios de registros de cualquier pariente o promedios de registros del mismo tipo de parientes, es decir, medios hermanos paternos. En este caso nos refirimos al IS univariado, ya que slo entregar los puntajes de cada animal, de un solo carcter productivo inicialmente . Propiedades del Indice de Seleccin (IS) El objetivo del ndice de seleccin es que el valor del ndice debe ser lo ms semejante al valor aditivo verdadero de cada animal, condicin que nunca es posible, sino que con este mtodo se garantiza que el valor i predictivo resultante es definitivamente lo ms cercano al valor real. Con estos valores obtenidos del ndice los animales pueden ser ranqueados de la mejor manera (exacto ranking) por los valores aditivos desconocidos. Con ello se garantiza, que el grupo de padres seleccionados por este ndice (puntaje) obtendr un promedio de los valores aditivos lo ms alejado de la media gentica de la poblacin, por que este grupo en promedio quedar formado por los mayores valores aditivos. Las propiedades del IS podran resumirse en:

118

El IS maximiza la correlacin entre los valores aditivos verdaderos y los predichos. De esta forma, no existe otro procedimiento que tenga una correlacin ms alta (ri,Ai), esta correlacin se denomina exactitud de la evaluacin (accuracy). La exactitud de la evaluacin permite determinar el intervalo de confianza utilizando las propiedades de la distribucin normal. El IS minimiza el promedio de los errores de prediccin al cuadrado, lo que 2 significa que minimiza el promedio de(Ai - i) . Esta diferencia (Ai i) es el error de prediccin. La superioridad del grupo de padres seleccionados es mxima. Lo que garantiza que la ganancia gentica es la ms rpida al utilizar el IS, que utilizando cualquier otra metodologa. Sin embargo, para que esto ocurra todos los animales deben tener la misma exactitud en sus evaluaciones, es decir, que todos los animales tengan el mismo tipo de registros incluidos en la prediccin. La probabilidad de un correcto ordenamiento de un par de animales por su valor aditivo veradadero es mximo. Los predictores obtenidos mediante el IS son insesgados, sea, la esperanza de (Ai - i) para todos los animales es cero. Es decir, el promedio de los valores aditivos para todos los posibles animales con el mismo valor aditivo predicho es igual al valor predicho. Prediccin de valores aditivos para un solo carcter. a) Informacin del propio individuo

Si un individuo posee un nico registro Xi, donde Xi es el desvio del valor fenotpico Pi, correguidos por los efectos fijos denotados por , es decir (Pi ), entonces: i = h (Pi ) = h Xi Ya que: C V ser: Cov (Xi, Ii) = Cov (Xi, Ai)
-1 2 2

b 2P = ai,i 2A
donde ai,i representa el parentesco aditivo del animal mismo, que obviamente ser siempre = 1, en este caso. Por lo tanto, la expresin anterior resulta ser la heredabilidad del carcter. Tambin puede ser visto el ponderador en trminos del coeficiente de regresin del valor aditivo sobre el valor fenotpico: b = Cov (Ai, Xi) / V(Xi) (Cov(Ai,Ai) + Cov(Ai,Ei)) / V(Xi)

119

2 A

= h .
2

donde la exactitud der la evaluacin es igual a: ri,Ai = h = h. Informacin del promedio de n resgistros del mismo individuo. La informacin del promedio de n registros ajustados del mismo individuo, el ponderador es algo ms pomplicado, resultando: b = Cov (Ai, promedio de n registros) / Var (promedio de n registros) 2 = n h / 1 + (n 1 ) r ; resultando en tonces en: i = b Xi,n En este caso el ponderador b depende de la heredabilidad del carcter y del coeficiente de repeticin (r) del mismo carcter. Informacin de la progenie del individuo Esta condicin es muy importante en produccin animal, especialmente para aquellas caractersticas que solo son producidas por un sexo, por ende la evalucin gentica de individuos del otro sexo debe basarse en registros de antecesores o desde sus progenies. Clsico ejemplo de sta situacin ocurre en el ganado bovino de leche, donde el carcter solo lo producen las hembras y se desea evaluar a los toros. Evaluar a un reproductor con la informacin de una sola hija ser: Ii = i = b Xi El ponderador ser estimado por:

b 2P = ai,p 2A
donde

ai,p, es el parentesco gentico aditivo, entre el padre y su hija, que en

este caso es , por lo tanto la expresin anterior ser: b = h
2 2

y la exactitud de la evaluacin ser h . En cambio evaluar a un reproductor con la informacin de ms de una hija, este ponderador es la covarianza entre el valor gentico aditivo del padre y el promedio de los valores genticos aditivos de su progenie, dividida por la

120

varianza del promedio de su progenie. Siendo Xi,P el promedio de los registros de la p-sima hija del padre i: Ii = i = b Xi,P donde: b = 2 p h / 4 + (p 1 ) h = b = 2p 2p = 2 2 p + (4 h )/h p +
2 2 2 2

siendo landa una constante de la forma: = (4 h )/h y la exactitud en la evaluacin como la b. El coeficiente 4 probiene del parentesco entre las hijas de un mismo padre, sea medias hermanas paternas (). En caso de las hijas ser hermanas completas el coeficiente ser 2 (), etc. Por lo tanto tanto el ponderador como la exactitud de la evaluacin dependen de la heredabilidad del carcter y de la cantidad de hijos que cada reproductor posea. Cuando el nmero de hijos tiende a infinito el ponderador tiende a 2 y la exactitud se aproxima a la unidad. Finalmente, el IS maximiza la probabilidad del correcto ordenamiento de animales con diferentes tipos de evaluacin, es decir, un animal ranqueado utilizando informacin de sus padres puede ser comparado con un animal ranqueado utilizando su propia informacin, o tambin puede ser comparado con un animal ranqueado utilizando informacin de su progenie. Por lo tanto, el IS se peude desarrollar utilizando informacin de todos los parientes del animal, lo cual mejora sustancialmente la exatitud de las evaluaciones genticas. La representacin de la ecuacin del IS univariado quedara de la siguiente forma:

Ii =

i =

b Xi +

b Xi,n +

b Xi,P.

121

Mejoramiento Gentico de varias Caractersticas Simultneamente Indice de Seleccin Multivariado (ISM) En general, el mejoramiento gentico no se basa en una sola caracterstica productiva, ya que son muchas las caractersticas que determinan la rentabilidad de un sistema pecuario, principalmente determinado por la distinta importancia econmica-gentica de cada uno de los caracteres a mejorar en la poblacin. Por lo tanto es fundamental para los productores obtener un valor gentico-econmico total de un animal, considerando todas las caractersticas de importancia al sistema productivo simultneamente. Este mtodo permite alcanzar el mejoramiento gentico como la suma de la ganancia gentica de las diferentes caractersticas de inters econmico. Por lo tanto, se deber ponderar esta ganancia gentica para cada caracterstica (Gi) por el valor econmico (ai) de cada caracterstica. As se obtendr la mxima superioridad gentica del grupo seleccionado desde la poblacin. A este nuevo valor se le denomina Valor gentico-econmico de un animal (Hi), que se expresa de la siguiente manera lneal: Hi = a1 G1 + a2 G2 + ........ + an Gn El valor o ponderacin econmica de cada caracterstcia depende de la cantidad de incremento esperada en la ganacia por cada unidad de avance gentico en el carcter. Estimaciones confiables se pueden obtener utilizando promedios histricos de precios y costos de produccin, sin embargo, debido a los grandes cambios, a veces del mercado e insumos del sistema es muy conveniente obtener estos ponderados regularmente en cada ocasin de construir este ISM. Siempre los ponderadores econmicos dependen de la especie, raza, regin, mercado, etc. Una metodologa para derivar los valores econmicos se denomina flujo descontado de genes (discounted gene flow) propuesta por McClintock y Cunnigham (1974). Este valor gentico-econmico (Hi) en todos los animales a evaluar en la poblacin dificulta identificar aquellos animales de valores ms altos con cierta exactitud. Por eso la seleccin por el mrito gentico.-econmico debe ser practicada en forma indirecta mediante una nueva variable correlacionada (I) basada sobre los registros fenotpicos de cada animal para los caracteres involucrados. As la ecuacin lneal mltiple del ISM, se define como: I = b1 X1 + b2 X2 + ........ + bn Xn donde: ahora los Xi representan los registros fenotpicos correguidos o ajustados de la i-sima caracterstica y los bs representan los coeficientes de regresin mltiple estimados de tal forma que determinen las mismas propiedades que el IS univariado.

122

Construccin de las ecuaciones del ISM Las ecuaciones del ISM es necesario observarlas para cada individuo a evaluar, resumindose de la siguiente manera: Gi = Hi; sea cada animal deber estar representado por su propia ecuacin, donde nuevamente es fcil identificar las incognitas asociadas a los bs o coeficientes de regresin mltiples. a1 A11 + a2 A12 + ...... + an A1n = b1 X11 + b2 X12 + ..... + bn Xn1 a1 A21 + a2 A22 + ...... + an A2n = b1 X21 + b2 X22 + ..... + bn X2n

a1 An1 + a2 An2 + ...... + an Ann = b1 Xn1 + b2 Xn2 + ..... + bn Xnn donde: ai son los ponderadores econmicos de cada caracterstca incluida en el ISM, Aij son los valores genticos aditivos del animal i-simo para la caracterstica j-sima, bi los coeficientes de regresin y los Xij son los valores fenotpicos (debidamente ajustados) del animal i-simo para la caracterstica jsima. Matricialmente se simplifica por la siguiente expresin: Ga = Pb Donde: a sera el vector de dimensin nx1, siendo n la cantidad de caractersticas incluidas y medidas en el ISM; G una matriz nxn de varianzas y covarianzas genticas aditivas entre las caractersticas; P una matriz nxn de varianzas y covarianzas fenotpicas entre las caractersticas y b el vector (nx1) de los coeficientes de regresin o incognitas del sistema de ecuaciones matriciales. La resolucin de estas ecuaciones permiten obtener los ponderadores bs, resolviendo: b = P Ga Cuando las caractersticas medibles en cada uno de los animales son incluidas en el ISM, las matrices G y P cumplen con las siguientes propiedades: simtricas, cuadradas y positivas por definicin (PPD). Recordemos que una matriz se define por un arreglo de elementos ordenados estrictamente en filas y columnas, para que la matriz sea simtrica, los elementso ij-simos son semejantes a los ji-simos, es decir, sobre y bajo de la diagonal cada elemento es su reflejo exacto. Se define PPD, por que en este caso los elementos de la diagonal son las varianzas (por definicin positivas) y sobre y bajo la diagonal son covarianzas.
-1

123

La construccin de estas ecuaciones matriciales se desarrollan en la Gua de Pasos Prcticos 2002. Respuesta a la seleccin por el Indice de Seleccin Multivariado Como ya vimos anteriormente, la respuesta a la seleccin depende de la 2 regresin del valor aditivo sobre el valor fenotpico (h ) y del diferencial de seleccin (S): R = bA,P S sea el cambio esperado por seleccin mediante el ISM determinar un cambio en el mrito gentico-econmico: RH = bH,I SI Por lo tanto el coeficiente de la regresin del mrito gentico-econmico para el IS es: bH,I = CovH,I / VI ; donde la Cov H,I matricialmente es igual a: b Ga y a su vez la varianza del ndice es = bP b, lo que finalmente resulta que: bH,I = b Ga / b Pb teniendo la igualdad del IS donde PB = Ga, entonces bH,I por definicin es igual a la unidad (h I = 1) y por ende la respuesta a la seleccin mediante el IS es solo igual al diferencial de seleccin del ndice (SI = I x i). Respuesta a la seleccin para cada una de las caractersticas seleccionadas por el ISM Obviamente para el productor es una necesidad imperiosa determinar que ganancia gentica-econmica se obtendra en cada una de las caractersticas incluidas en el ISM, ya que la respuesta del IS solo entrega el cambio en la media de los puntajes de una generacin a otra, mediante la ecuacin anterior, sea, RI = SI . Por lo tanto, la ecuacin que permite obtener cuanto cambiar por efecto de seleccionar por el ISM en cada una de las caratersticas incluidas en el ISM, est dependiendo de la regresin del valor aditivo sobre el ndice de seleccin, bAi,I y del diferencial de seleccin: Ri/Xi = bAi,I SI donde el coeficiente de regresin del valor aditivo sobre el ndice de seleccin es igual a: bAi,I = CovAi,I / VI
2

124

sea matricialmente ser la CovAi,I = bG, lo que permite finalmente obtener que la respuesta a la seleccin en cada i-sima caracterstica incluida matricialmente, ser: Ri/Xi = bG (i/ I) Hasta ahora, pareciera que ISM solo pudiera generar cambios en caractersticas que se pueden mediar en cada uno de los animales, es decir, si se desea mejorar genticamente a 10 variables productivas, estas 10 deben ser necesariamente medibles fenotpicamente en cada uno de los animales a evaluar. Sin embargo, el ISM es mucho ms poderoso y aplicable en la mayora de las especies productivas, donde muchas variables productivas y a veces las de mayor importancia gentica-econmica para los productores, por ejemplo: la eficiencia de conversin alimenticia, etc. son caracteres que no se pueden medir en cada uno de los animales, ya sea por impracticables (crianza en cerdos, se realiza en corrales con numerosos animales) o por el alto costo de su medicin individual, es decir, estas caractersticas son generalmente denominadas como objetivos de seleccin. En cambio, el ISM, permite medir caractersticas productivas, asociadas pricipalmente de manera gentica, a una no medible, sea, estas variables productivas se denominan criterios de seleccin. En estos casos, las ecuaciones matriciales del ISM sufren algunas modificaciones en su construccin y por ende en la dimensin, al ser conjuntamente incluidas variables medibles o criterios de seleccin, por las que se debe obtener los coeficientes de seleccin o ponderadores en el vector b, que ser de la misma dimensin nx1, donde n corresponde al nmero de caractersticas criterios de seleccin y la matriz P por ende de dimensin nxn. En cambio, la matriz que incorpora las variables objetivos y/o tambin las de criterios de seleccin, es la matriz G (varianzas y covarianzas genticas aditivas), cuya dimensin sufre cambios fundamentales, ya que puede cambiar las propiedades anteriormente descritas, para la matriz, ya que ahora podr ser: no siempre cuadrada, no siempre simtrica y no siempre PPD. La construccin de estas ecuaciones del ISM con variables medibles y no medibles en cada animal, se entregan para resolver en la Gua de Pasos Prcticos.

125

EVALUACIN GENTICA CON MTODOS ACTUALES y EFICIENTES. Soluciones de Ecuaciones de Modelos Mixtos (MME) Hasta ahora los ndices de seleccin (BLP), asumen que los valores fenotpicos estn previamente ajustados por todos los efectos no genticos de variacin que producen diferencias sistemticas entre los individuos. Recordemos que el ndice de seleccin, para predecir el valor gentico aditivo de un individuo, debe ser corregir la informacin fenotpica, es decir, corregir por los efectos fijos. Sin embargo, en muchas ocasiones no es posible corregir previamente los datos. Especialmente, en condiciones como el efecto ao, donde muchos animales junto con sus mediciones, no se puede conocer la importancia del ao en cuestin por que an es un factor que no trmina en su efecto, sea, se genera junto con la medicin. Siendo, por otra parte muy importante de estimar la magnitud de este efecto fijo (ao), simultneamente con obtener los efectos aleatorios. El mtodo que permite predecir las variables aleatorias conjuntamente con la estimacin de los efectos fijos, es mediante el procedimiento estadstico-matemtico conocido como BLUP, que posee las mismas propiedades de los ndices de seleccin (BLP) y fue propuesto y desarrollado por Henderson a partir de los aos 40s. Sin embargo, la metodologa propuesta permite obtener simultneamente los efectos fijos, denominados BLUE (Mejor estimador lineal insesgado) y los efectos aleatorios BLUP, es decir, esta metodologa obedece mejor a una solucin de Modelos Mixtos. Debido a que la derivacin de los modelos mixtos (BLUE-BLUP) requiere de recordar los supuestos y restricciones de un modelo mixto (previamente descrito) se sugiere revisar esos antecedentes ya que la solucin se plantear matricialmente para mejor comprensin y aplicacin: Matricialmente un modelo mixto se puede definir por: y = Xb + Zu + e donde: y es el vector de las observaciones, b es el vector incognita de los efectos fijos (BLUE), u es el vector incognita de los efectos aleatorios (BLUP), e es el vector de errores, X es la matriz de diseo de los efectos fijos y Z es la matiz de diseo de los efectos aleatorios Adems los supuestos mas simples son: E(y) = Xb; V(y) = ZGZ + R = V; V(u) = G y V(e) = R Las ecuaciones de los modelos mixtos, propuestas por primera vez por Henderson (1949), que permiten obtener las soluciones de b y , son:

126

 -1 X R X Z R X
-1

XR Z ZR Z + G
-1 -1

-1

b =

-1 XR y ZR y
-1

Pero recin en 1963 el profesor S. R. Searle, le ayudo a probar que b era un estimador BLUE y entonces es BLUP de u Propiedades del BLUP 1) 2) 3) 4) 5) Insesgamiento: el IS (BLP) por asumir los efectos fijos conocidos es insesgado. BLUP asume efectos fijos desconocidos, sin embargo stos son estimados insesgadamente (BLUE). Mnima varianza de los errores de prediccin: es la base para construir BLUP e ndices de seleccin (BLP). Mxima correlacin entre el predictor y el valor parametral. Mxima probabilidad de un correcto ordenamiento para el predictor y el valor verdadero: se cumple, cuando el predictor y el valor parametral tienen distribucin normal multivariada. Las predicciones BLUP son similares a las del Indice de Seleccin (BLP): la diferencia rdica en que los BLUP, las soluciones BLUE de los efectos fijos son utilizadas para corregir los registros. Es decir, obtener los mejores efectos de cada nivel (fijo) los BLUP intervienen en los BLUE.

Evaluacin Gentica de Reproductores mediante BLUP Existen muchos modelos que utilizan la metodologa de los modelos mixtos, siendo en gentica muy importante obtener los valores aditivos predichos, tambin es fundamental conocer la magnitud de mucho de los efectos fijos que estan afectando la produccin de los animales, especialmente son muy necesarios de conocer para los productores que participan con sus animales en la evaluacin gentica a travs de las generaciones, por ejmplo en bovinos de lechera, el efecto predio (fijo) es fundamental conocer su importancia y magnitud, para que cada productor pueda reconocer el nivel productivo de su propio rebao y el promedio de otros rebaos vecinos, de la regin, etc. Sin embargo, es digno de destacar priorizando el objetivo gentico en la evaluacin, sea, obtener los BLUP, que representan, segn el modelo establecido, los valores genticos aditivos. En produccin animal, estos modelos dependen de la informacin utilizada, siempre definidos lo ms completos posibles. Se describirn los modelos que mayor utilizacin tienen actualmente en produccin animal. El desarrollo de estos modelos ha sido del sector lechero bovino, donde existen, enorme cantidad de efectos fijos que afectan la produccin de leche en vacas, que necesariamente son estimados cada uno por esta metodologa y asu vez
127

predecir los valores genticos aditivos de los toros que se usan en el sistema lechero, cuyo objetivo es obtener un ranking con el fin de seleccionar aquellos de mayores valores aditivos y utilizarlos como reproductores mejoradores genticamente. Los modelos clsicos son: Modelo padre Aditivo o tambin denominado como prueba de comparacin de toros, que utiliza la produccin fenotpica de las hijas y permite obtener los predictores de la mitad de los valores aditivos de los toros evaluados y el Modelo animal aditivo que utiliza la informacin del propio animal y de sus parientes para obtener en este caso los predictores que representan directamente los valores aditivos de los animales evaluados. Modelo Padre Aditivo El modelo padre permite obtener los BLUP que representan solo la de los valores aditivos de cada toro o denominados los PTA (Predicted Transmiting Abilities), el modelo estadstico-matemtico lineal sera:

yij = + HYSi + sj + eijk

donde: yijk = produccin de leche de k-sima vaca, hija del j-simo toro, que esta produciendo en el i-simo rebao-ao-estacin. = media poblacional.

HYSi = el efecto fijo del i-simo rebao-ao-estacin. sj = el efecto aleatorio comn a todas las hijas del j-simo toro (
del valor aditivo del j-simo toro).

eijk

= son los efectos residuales.

En cambio, el modelo en notacin matricial es: y = Xb + Zs + e donde: y es el vector de las observaciones, de dimensin nx1 b es el vector incognita de los efectos fijos, de dimensin bx1 o nmero de niveles de los efectos fijos (BLUE), u es el vector incognita de los efectos aleatorios, de dimensin sx1 o nmeros de toros evaluados (BLUP), e es el vector de errores, de dimensin nx1 X es la matriz de diseo de los efectos fijos, de dimensin nxb y Z es la matiz de diseo de los efectos aleatorios, de dimensin nxs. Adems los supuestos mas simples son: E(y) = Xb , E(s) = 0 y E(e) = 0. V(y) = ZGZ + R = V; V(s) = ZGZ y V(e) = R donde: ZGZ es la matriz de Var-Covarianzas entre padres evaluados, R es la matriz de Var-Covarianzas para los efectos residuales. Si el modelo asume,
128

que los toros no estan emparentados entre s y existe homogeneidad de varianzas genticas y ambientales, las matrices pueden ser definidas de la siguiente manera: V(y) = I
2 s

+ I e; V(s)

V(e)

I
-1

La solucin de este modelo padre aditivo bajo el supuesto anterior simplica bastante las ecuaciones a resolver ya que R y G seran representadas por una matriz diagonal muy fcil de invertir, ya que si el sistema se dividiera en ambos lados por R , la solucin simplificada quedara: X X Z X XZ -1 ZZ + xA b = X y Z y
2 2 -1

-1

siendo, en este modelo padre la constante (landa) = (4 h )/h , como ya fue definido previamente, ya que correponde al aprentesco entre las hijas de cada toro, sea, este landa depende del parentesco entre los datos (y). En cambio, -1 A es la matriz de coeficientes de parentesco entre los toros evaluados. La solucin de este modelo padre nmericamente se entrega en la Gua de Pasos Prcticos 2002 y junto a ello sus importantes aplicaciones en la prctica ganadera. El modelo padre ha sido muy utilizado en la avaluacin actual gentica de los animales, sin embargo supone algunas condiciones que generalmente no se cumplen en las poblaciones ganaderas. Los supuestos son: 1) 2) Toros no emparentados. Pero tambin permite incluir parentesco entre toros ( ) con ello mejora la exactitud de la evaluacin gentica. Toros provienen de una poblacin esttica. Condicin que las poblaciones ganaderas no cumplen, ya que las poblaciones son muy dinmicas, es decir, los promedios y varianzas cambian precisamente por efecto de la seleccin, la deriva gnica y obviamente por el Inbreeding. Cambios producidos especialmente por los cambios en las frecuencias gnicas y la existencia de covarianzas entre los valores genotpicos en diferentes loci, conocido este efecto como desequilibrio por ligamiento. Cruzamientos aleatorios. Imposible ya que los mejores toros no se cruzan al azar con las hembras de la poblacin, sino que se cruzan con las mejores del rebao, lo que genera a travs de las generaciones estructuras genticas cada vez ms complejas, cuyas relaciones de parentescos entre los animales no solo pueden ser explicadas entre padres e hijas. Vacas madres no son parientes. No existe consanguinidad ni seleccin en la poblacin.

3)

4) 5)

129

Adems, actualmente existe una alta importacin de semen de toros provenientes de diferentes pases, por ende, se generan diferentes grupos genticos, lo que determina que la E(s) ya no es = a cero y tambin se genera heterogeneidad de var-covarianzas genticas a travs delos grupos genticos. Por ende, es necesario reconocer la existen de estos grupos genticos, permite agrupar estos toros por ao de nacimiento de los padres o por origen de los padres, permitiendo as corregir por el efecto de la seleccin, sea, reconocer la existencia de una tendencia gentica a travs de las generaciones, es decir, mediante los promedios diferentes de los grupos genticos. Modelo Animal Aditivo El modelo animal permite obtener los BLUP que representan directamente los valores aditivos de cada animal evaluado, el modelo estadstico-matemtico lineal sera en forma muy simplificada, ya que a la gran mayora de los efectos fijos del modelo, se consideraran incluidas para esta demostracin, todos ellos, en :

yij = + ai + eij
y la notacin matricial ser: y = Xb + Za + e donde: la diferencia radica en el efecto aleatorio a, que representa el efecto aleatorio del mismo animal evaluado, E(y) = Xb , E(a) = 0 y E(e) = 0. V(y) = ZGZ + R = V; V(a) = ZGZ y V(e) = R Si se asume homogeneidad de varianza genticas y ambientales, estas matrices pueden ser definidas: V(y) = ZAZ
2 A

+ I e;

V(a) = ZAZ

y V(e) = I

Donde la matriz A es la matriz de parentesco aditiva (no de coeficientes de parentesco), formada por los numeradores de los coeficientes de parentesco de Wright (1921) entre el i-simo y k-simo animal que se ubican fuera de la diagonal y los elementos igual a 1 + Fii en la diagonal, donde Fii es el coeficiente de consanguinidad del mismo i-simo animal. En este modelo entonces la simplicacin permite utilizar landa pero bajo la siguiente expresin: 2 2 (landa) = (1 h )/h Estos modelos mixtos pueden incluir obviamente mucha informacin diferente, es decir, otro efectos aleatorios, tales como ambiente permanente (cuando existen mediciones repetidas de un mismo animal para el mismo carcter), efectos maternos aditivos (cuando el carcter est influenciado por

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efectos maternos), etc. mejorando la exactitud y presicin de las evaluaciones genticas especialmente. El principio tambin obtiene los BLUE cada vez mejores (medias de mnimos cuadrados de cada nivel de los efectos fijos del modelo). Estos modelos actualmente tambin permiten, sobre todo, el modelo animal, obtener las tendencias genticas por generacin. Evaluaciones nmericas y sus respectivas aplicaciones se realizan en los ejercicios de la Gua de Pasos Prcticos, al igual las propiedades para construir una matriz de parentesco aditiva.

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MEJORAMIENTO GENTICO A TRAVS DE CRUZAMIENTOS Anteriormente definimos que existe adems de la seleccin de animales, la posibilidad de mejorar genticamente la poblacin para un carcter productivo a travs de cruzamientos: Endocruza (Inbreeding) y Exocruza (Heterosis). Endogamia o Inbreeding (Endocruza) Ya determinamos los efectos que produce al apariamiento entre parientes (consaguinidad) que determina una disminucin del rendimiento, denominada depresin endogmica, especialmente en caracteres asociados con la viabilidad y/o capacidad reproductiva; a medida que aumenta la consanguinidad, lo hace tambin aumentando la incidencia de mortalidad embrionaria (abortos espontneos) y perinatal, y adems aumenta la aparicin de enfermedades recesivas determinadas por un solo gen. Como la consanguinidad aumenta la homocigosidad, da lugar a una disminucin de la variabilidad gentica, lo que a u vez, reduce el potencial para mejorar una poblacin por seleccin. Depresin endogmica Entonces la depresin endogmica se define a nivel poblacional como la reduccin del valor fenotpico promedio, asociado a caracteres como la capacidad reproductiva o como la eficiencia fisiolgica. Algunos caracteres son ms sensibles a este efecto depresivo que otros y en general se podra decir que la endogamia tiende a reducir la aptitud (fitness). A contuinuacin se resumen algunos caracteres que pueden ser afectados por inbreeding y que forman un componenete importante de la aptitud:
Fertilidad Fitness Calidad de la progenie destetada Viabilidad Exito de cruzamiento Tamao de camada Resistencia de enfermedades Habilidad para no ser predado Tasa de ovulacin Sobrevivencia embrionaria

Produccin lechera (tamao glndula mamaria) Habilidad materna

Los cambios en el rendimiernto productivo promedio de la poblacin pueden ser atribuidos a los cambios en frecuencias genotpicas y no a las frecuencias gnicas, puesto que las frecuencias gnicas en la poblacin total no cambian. Como ya se conoce que el aumento de la consanguinidad es en base al aumento de los homocigotos a expensas de los heterocigotos. Por ende, estos cambios estn asociados con diferencias en los valores de heterocigotos y homocigotos.

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A continuacin se determina los componentes responsables de la depresin endogmica en una poblacin, tericamente se analizar la situacin para un carcter en un solo locus con dos alelos diferentes: La media de una poblacin grande con cruzamiento aleatorio sera: M0 = a(p q) + 2 d pq, En cambio bajo inbreeding, la media para el mismo carcter ser: MF = a(p q) + 2 d pq - 2dpqF La demostracin se entrega en la Tabla 17. TABLA 17. Frecuencias genotpicas bajo inbreeding (1 locus con 2 alelos). GENOTIPOS FF Ff ff 2 2 Frecuencias genotpicas 2pq (1 F) p + pqF q + pqF Valores genotpicos d a -a

Si M0 fuera la media de la poblacin antes de la endogamia y MF la media de una poblacin sometida a inbreeding, el cambio que se atribuye al efecto de endogamia es 2dpqF. Esto permite explicar si en el locus no existe dominancia el cambio por consanguinidad sera = 0. Por lo tanto, es el valor de d (dominancia) el determinante en producir efecto sobre la media del carcter (+d o d), el cambio sera en sentido contrario al valor de d, en ese locus. Esta condicin es semejante y vlida para caractersticas influenciadas por muchos loci. Conclusiones: 1) El cambio de la media poblacional por endogamia es consecuancia fundamental de la dominancia en los loci involucrados en el carcter (cualquier grado de dominancia). 2) La direccin del cambio, es en general hacia el valor de los alelos recesivos. 3) La dominancia puede ser parcial o completa, o incluso sobredominancia. Ya que solo es necesario que el heterocigoto no se ubique exactamente entre ambos homocigotos. 4) El coeficiente de consanguinidad poblacional, juega un rol, pero secundario en la depresin endogmica. 5) Las frecuencias gnicas intermedias producirn un cambio mayor que las frecuencia gnicas extremas. Al considerar el efecto combinado aditivo de muchos loci que afecten el carcter, es decir, que no exista interaccin interloci, la media poblacional depende de la suma de las contribuciones individuales de cada loci, determinndose:

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MF = a(p q) + 2 d pq - 2F dpq = M0 - 2F dpq generndose el cambio debido a endogamia como - 2F dpq. Es decir, las circuntancias en que un carcter mtrico mustre un cambio en la media poblacional, esta relacionada con la presencia de dominancia direccional, es decir, si existe dominancia de los genes reelacionados con el carcter preferentemente en una direccin, por ejemplo, si genes que incrementan el carcter fuesen dominantes sobre los alelos que lo reducen, entonces la endogamia determinar una disminucin de la media poblacional, sea, la direccin del cambio es hacia los alelos recesivos. Tambin, en la contribucin de cada locus, depende de la frecuencia gnica, determinndose que frecuencias intermedias tendrn un efecto mximo en el cambio de la media. En algn captulo anterior, tambin se demostr que cuanto ms pequea sea la poblacin, ms probable es que las frecuencias gnicas cambien al azar (deriva gnica) ms que como a causa de la seleccin. Siempre, tanto la consanguinidad y la deriva gentica son muy importantes en los programas de mejoramiento gentico, ya que existe una gran tendencia a concentrar este avance gentico, en pocos animales con valores genticos aditivos muy altos. Cuanto menos reproductores existen en un programa de seleccin, mayor es la tasa de consanguinidad y mayor la probabilidad de que la deriva gentica cause prdida de alelos favorables (lo que determina una reduccin de la mejora que podra consaguirse). Adems, mayor es la probabilidad de que la deriva gentica impida el progreso del programa de mejoramiento o incluso que lo haga retroceder. Tamao Efectivo de la Poblacin En produccin animal, la consanguinidad y deriva gnetica puede cuantificarse en trminos de un parmetro llamado tamao efectivo de la poblacin (NE), que se puede obtener mediante la expresin: NE = (4 Nm Nh) / (Nm + Nh) Donde, Nm es el nmero de machos de la poblacin y Nh, es el nmero de hembras de la poblacin. Estimacin de la Consanguinidad poblacional La consanguinidad en trminos poblacionales, se puede explicar bajo las siguientes consideraciones: formacin de subpoblaciones o lneas, a partir de una poblacin grande (poblacin base) cuya consanguinidad es igual a cero. Cada lnea se forma de una muestra de N individuos provenientes de esta poblacin, por lo tanto, cada lnea tiene en el locus considerado genes distintos (F = 0, en la poblacin base). El aumento de la consanguinidad se puede explicar mediante la formacin de un pool de gametos formados por aportes semejantes de los
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diferentes individuos dentro de cada subpoblacin. La probabilidad de identidad en la progenie, se puede explicar como producto de uniones de gametos idnticos de ese pool, y esta dada por una probabilidad condicional. Dado que se tom al azar un gameto que posea un gen cualquiera. Cal es la probabilidad de que al tomar al azar un segundo gameto posea ese mismo gen?. Esta probabilidad corresponde al coeficiente de Inbreeding o consanguinidad poblacional en la generacin 1. Dentro de cada lnea existen N individuos, cada uno arrojando igual nmero de gametos que se unen al azar. Por lo tanto, existen 2N genes distintos en los gametos formados, es decir, en el locus A, podran ser: A1, A2, A3,...., An, hasta 2N. Cualquier gameto tiene la probabilidad igual de N de unirse con otro de la misma clase, de esta manera 1/2N es la probabilidad de que gametos que se unen lleven genes idnticos y constituye, de esta forma, el coeficiente de endogamia en la progenie. Al considerar la segunda generacin, existen dos formas por las cuales se pueden producir homocigotos idnticos, una derivada de la replica nueva de genes y la otra derivada de la replica previa. La probabilidad de origen idntico es la generacin 0 es la que ya hemos deducido como el coeficiente de endogamia de la generacin 1. Por lo tanto, la probabilidad total de homocigotos idnticos en la generacin 2, ser: F2 = N + (1 - N) F1 donde F1 y F2, son los coeficientes de endogamia de las generaciones 1 y 2, respectivamente. De la misma manera se aplica a las generaciones subsiguientes, as el coeficiente de endogamia de los individuos, en la generacion t-sima, ser: Ft = N + (1 - N) Ft-1 Conclusin: la endocruza no es un mtodo por si solo de mejoramiento gentico en poblaciones animales, pero el generar lneas altamente consanguneas a tenido un uso en puntuales poblaciones productivas y bajo ciertas condiciones. Exocruza (Heterosis) Corresponde a los cruzamiento entre poblaciones, lneas o razas diferentes y estos permiten tambin explotar la variacin gentica generada. En general, an se piensa en los cruzamientos en trminos de cruces entre lneas consanguneas, en parte debido al considerable xito conseguido mediante este mtodo de mejora en plantas, especialmente el maz. Sin embargo, la obtencin de lneas consanguneas en animales es una tarea ardua y de muy alto costo, que actualmente se usa en muy raras ocasiones, excepto por una o dos empresas de mejoarmaiento avcola. En cambio, los

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cruzamientos en animales se realizan con poblaciones en las que no se ha llevado a cabo deliberadamente consanguinidadm, sino que han permanecido aisladas unas de otras durante perodos ms o menos largos de tiempo. Es importante destacar que existen mtodos para realizar cruzamientos que se realizan en la prctica y por otro lado discutir las implicancias de cada mtodo. Cruzamiento entre razas El objetivo de cruzar razas, es generalmente, maximizar los efectos de las razas y de la heterosis, a partir de efectos conocidos o estimados de las razas o especficos de la heterosis. Las desviaciones genticas predichas para efectos directos y maternos pueden sumarse para predecir el rendimiento directo y maternal de cruzamientos especficos. Heterosis La heterosis se origina de la cruza entre razas o lneas consanguneas y se mide mediante la diferencia en el rendimiento de la cruza y el promediode ambas razas paternas. La heterosis puede ser positiva, negativa o nula, o tambin considerarse individual, materna, o paterna, segn el componente que la determine. La heterosis se explica genticamente, porque depende de la dominancia, ya que se maximiza especialmente cuando esta dominancia se manifiesta al cruzarse dos lneas en que sus genes diferentes se hayan fijado en cada lnea o raza diferente. El trmino de fijacin se refiere a que en alguna ubicacin cromosmica todos los genes sean idnticos. La heterosis se manifiesta cuando exista dominancia ya sea en un locus o en el caso de un carcter cuantitativo en un loci. La garantia de obtener una mxima heterosis es: 1) en caracteres asociados con la capacidad de supervivencia y reproductiva, en general que presenten algn grado de dominancia, y 2) cuanto mayor sea la diferenciacin gentica entre las poblaciones de animales domsticos. A la Heterosis tambin se conoce por su efecto vigor hbrido, por que, recupera en parte lo deprimido en caracteres asociados a la reproduccin, por efecto de la consanguinidad. Un ejemplo simple de heterosis, si en todos los loci existe dominancia completa, y se cruzan dos razas fijadas: raza A, cuyos genes para los loci A, B, C y D, y existen los siguientes genotipos: AA, BB, cc y DD. En cambil en la raza B, para los mismos loci existen los genotipos aa, bb, CC y DD, es decir, dos razas genticamente diferentes, para ese loci. Ambas razas cumplen con la condicin de fijacin, al ser homocigotas en todos los loci. Si asumimos que los genes deseables para elproductor fuesen los genes dominantes, entonces la Raza A, tiene genes favorables A y D, en cambio la raza B, los genes C y D. Adems si asumimos que el efecto del gen deseable (dominante = mayscula)

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fuera de +4 en cada locus y del gen recesivo (minsculas) fuera igual a 0, tendremos: Ubicacin cromosmica A B C D AA BB cc DD Aa bb CC DD Aa Bb Cc DD Valor de los genes A B C D 4 4 0 4 0 0 4 4 4 4 4 4 Suma 12 8 16

RAZA A B CRUZA (AxB)

La heterosis se estima como la superioridad de la cruza (descendientes) respecto al promedio de ambos padres: Cruza Promedio (razas A y B) = 16 10 = 6, lo que significa que la heterosis es de un 60% = (6/10)*100. En este ejemplo, el loci D no contribuye a la heterosis porque ambas razas el gen D se encuentra fijado (DD). Complementariedad Otra componente fundamental en el cruzamiento entre razas es la complementaridad, que se refiere al beneficio adicional que se obtiene al cruzar dos poblaciones y que resulta no de la heterosis sino de la forma en que dos o ms caracteres se complementan entre s. Por ejemplo, si dos poblaciones de cerdos: una con un alto ndice de conversin alimenticia y con un tam,ao de camada pequeo (A) y otra con un ndice de conversin bajo, pero con un tamao de camada grande (B). Supongamos que los verracos A se cruzan sistematicamente con hembras de la poblacin B, para producir un cerdito hbrido comercial, que se cra exclusivamente para produccin de carne. An cuando no haya heterosis para la conversin alimenticia, es decir, el rendimiento de los cerdos hbridos es exactamente intermedio entre ambas poblaciones parentales. Si el tamao de camada de las hembras B fuera el mismo tanto al cruzarse con A o con B, el beneficio global de estos cruzamientos ser probablemente mucho mayor que el beneficio de criar solamente las poblaciones A o B, ya que el nmero igual de lechones se producir con la ms prolifica de las poblaciones, B, mientrs que el ndice de conversin ser superior en los hibridos que en el apariamiento BxB. Otro forma de evidenciar complementacines el trmino que debilidades de una raza son mejoradas con la fortaleza de las otras razas, es decir, heterosis econmica.

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Tipos de cruzamientos Cruzamientos de dos vas: animales de una poblacin A se cruzan regularmente con animales de una poblacin B: AxB (AB) En este esquema ambos progenitores son considerados puros o sin mezcla y (AB) representa la descendencia mastiza (hbrida) o tambin denominada como descendencia del primer cruzamiento. Si el progenitor macho es siempre el mismo, al igual que la progeniitora hembra se mantiene, se habla entonces de lneas paterna y materna, respectivamente. Obviamente, para mantener cada lnea pura hay que cruzar machos con hembras de la misma lnea, dentro de lnea. Este cruzamiento produce descendientes (AB) que son 100 heterocigotos, en el sentido en que en cada locus tienen un gen de cada poblacin parental, en consecuencia muestran un 100% de heterosis individual. Sin embargo, los cruzamientos de dos vas no proporcionan ninguna oportunidad de que el productor se beneficie de la heterosis paterna o materna, ya que los padres no son nunca cruzados entre ellos mismos, son siempre puros o sin mezcla. Para explotar la heterosis materna y/o paterna, se deben utilizar otros tipos de cruzamientos. Retrocruza (Backcross): Retrocruzamiento consiste en aparear individuos hbridos procedentes de un cruzamiento de dos vas con una de las razas: (AB) X A (AB) A o (AB) x B (AB)B

En los retrocruzamientos, el progenitor cruzado es 100% heterocigoto, de aqu que muestre un 100% de heterosis parental. Sin embargo, los descendientes son ahora el resultado de la fusin de un gameto cuyos genes son enteramente, es decir, A (raza parental) y un gameto que contiene el promedio de genes A y de genes B (procedente del progenitor hbrido). Esto quiere decir que los descendientes del retrocruzamiento tendrn como promedio dos genes A, es dexcir, sern homocigotos para genes procedentes de la poblacin A, en la mitad de sus loci y un gen A y un gen B, es decir, sern heterocigotos, en la otra mitad de los loci. En otras palabras, los descendientes de los retrocruzamientos son como promedio un 50% menos heterocigotos que los descendientes del primer cruzamiento, AB. En consecuencia, muestran solamente como promedio el 50% de la heterosis individual.

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Cruzamiento de tres vas: este tipo de cruzamiento permite explotar de mejor forma la heterosis, ya que un animal del primer cruzamiento (AB), es apareado con un animal de una tercera raza o poblacin (C). Una vez ms, como lo que a menudo se desa aumentar la capacidad reproductiva del progenitor hembra, un cruzamiento de tres vas tiene la siguiente forma: (AB) X A (AB) C Este cruzamiento permite una utilizacin de la heterosis materna ya que la madre es 100% heterocigtica. Permite adems una utilizacin total de la heterosis individual ya que los descendientes son tambin 100% heterocigotos, siendo como promedio AC en la mitad de sus loci y BC en la otra mitad. Es importante destacar que el cruzamiento de dos vas y este de tres vas, ambos muestran una utilizacin total de la heterosis individual en un 100%, pero pueden no mostrar el mismo grado de heterosis. Este cruzamiento de tres vas ha sido usado ampliamente en el mundo, debido al xuito en la explotacuin de la heterosis en el progenitor hembra y en los animales comerciales, adems, ya que permite hacer uso de la complementaridad. Cruzamiento de cuatro vas: consiste en aparear descendientes cruzados de dos vas distintos para producir la descendencia comercial, ejemplo clsico del broiler actual, que se representa: A x B (AB) CxD (CD)

x (AB)(CD)

Este cruzamiento permite una explotacin total de la heterosis materna, como la heterosis paterna as como tambin de la heterosis individual. Una vez ms debemos observar que el grado real de heterosis individual en la descendencia comercial puede no ser el mismo que el observado en la descendencia de, cualquiera de los dos tipos de primer cruzamiento. Cruzamientos rotatorios o cclicos: consiste en utilizasr en forma secuencial machos de dos o tres poblacionesdistintas. Condicinque se plantea, si un productor solo desea producir descendencia comercial final deber obtener todos los reproductores de reemplazo, tanto machos como hembras, de otra fuente. Si los cruzamientos rotatorios se continuan en un rebao o poblacin comercial durante varios aos y si todas las hembras de reemplazo proceden del propio rebao o poblacin implicado, todas las hembras sern pronto hbridas y contendrn proporciones variables de genes de las dos o tres poblaciones de las que se obtuvieron los machos.

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Una desventaja de los cruzamientos rotatorios es que no permite ninguna explotacin de la complementaridad ya que las poblaciones implicadas en los cruzamientos no pueden usarse solamente con un nixco proposito, tal y como se hace en los otros cruzamientos. Comparacin de distintos tipos de cruzamientos En la Tabla 18, se resumen la fraccin de heterosis, segn la heterosis promedio esperada en los diferentes tipos de cruzamientos. Tabla 18. Fraccin de heterosis esperada en diferentes tipos de cruzamientos. Tipo cruzamiento Fraccin de heterosis Individual Materna Paterna Raza pura 0 0 0 Cruzamiento de dos razas: AxB Retrocruzamiento: AB x (A o B ) (A o B ) x AB Cruzamiento de tres razas: AB x C C o AB Cruzamiento de cuatro vas: AB x CD Cruzamiento rotatorio: 2 razas paternas 3 razas paternas 1 0 0

1 1 1 2/3 6/7

1 0 1 0 1 2/3 6/7

0 1 0 1 1 0 0

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BIBLIGRAFIA RECOMENDADA

Aguirre, R.; Armanet, Leonor, Castillo, Silvia, Cifuentes, Luca, CruzCoke, R.; Etcheberry, A. y Llop, Elena. Identificacin gentica y pruebas de paternidad. Vicerrectora Acadmica y Estudiantil. Universidad de Chile. Editorial Universitaria. 1996. Griffiths, A.; Miller J.; Suzuki, D.; Lewontin, R. ; Gelbart, W. Gentica. McGraw Hill-Interamericana. Quinta Edicin. 2000. Griffiths, A.; Gelbart, W.; Miller J.; Lewontin, R. Gentica Moderna. McGraw Hill-Interamericana. 2000. Legates, J.E. and Warwick, J.E. Cra y Mejora del Ganado. Interamericana. Mc Graw-Hill. 1992 Nicholas, F. W. Introduccin a la Gentica Veterinaria. Editorial Acribia, S.A. Zaragoza (Espaa). 1996. Nicholas, F. W. Veterinary Genetics. Oxford Science Publications. 1987. Phler, Alfred. Ingeniera Gentica de Animales. Editorial Acribia, S.A. 1993. Salamanca, F. Gregor Mendel, El olvidado Monje del huerto. Editorial Andrs Bello. 2000

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