You are on page 1of 31

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.

vn
VIN KHOA HC V CNG NGH VIT NAM
VIN CNG NGH SINH HC
-------------------------

NGHIN CU TO CY C CHUA KHNG BNH XON


VNG L DO VIRUS BNG K THUT CHUYN GEN
Nghin cu sinh:

Nguyn Th Hi Yn

Hng dn khoa hc:

1. GS. TS. L Trn Bnh


2. PGS. TS. Chu Hong Mu

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

NI DUNG BO CO

1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.

M U
TNG QUAN TI LIU
MC TIU NGHIN CU
NI DUNG NGHIN CU
VT LIU V PHNG PHP NGHIN CU
KT QU NGHIN CU
KT LUN V NGH
CC CNG TRNH CNG B LIN QUAN N LUN N

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

I. M U

C chua l loi cy rau qu c gi tr kinh t cao, d trng, vn


chi ph ban u thp.
Bnh virus ang gy thit hi nghim trng trn c chua
(TYLCV: 90 - 100 %).

Nhiu cy trng chuyn gen khng virus bng k thut RNAi


c to ra (Abhary et al., 2006; Asad et al., 2003; Tenllado
et al., 2003; Andika et al., 2005; Phm Th Vn et al., 2008).

Nghin cu to cy c chua khng bnh xon vng l do


virus bng k thut chuyn gen

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

II. TNG QUAN TI LIU

TOMATO YELLOW LEAF CURL VIRUS - TYLCV


Chi Bergomovirus
H Geminiviridae

C1

CP

CP (Coat protein): Sinisterra et al., 1999; Raj et al., 2005


C1 (Rep protein): Brunetti et al., 2001; Yang et al., 2004; Noris et al., 2004; Fuentes et al., 2006

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

II. TNG QUAN TI LIU

CNG NGH RNAi TRONG VIC TO CY TRNG KHNG VIRUS

ihpRNA
Dicer

siRNA
RNA-Induced Silencing
Complex
ds-RNA

RNAi

Virus RNA

Virus RNA target recognition


mRNA degradation
Cleavage

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

III. MC TIU NGHIN CU

1) Thu nhn c trnh t gen CP v trnh t vng


DNA-A ca mt s chng virus gy bnh xon vng
l c chua TYLCV to nguyn liu phc v thit k
vector cu trc RNAi.
2) Thit k c vector mang cu trc ihpRNA - TYLCV
3) To c dng c chua chuyn gen c kh nng
khng vi TYLCV

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

IV. NI DUNG NGHIN CU

1) Kho st, thu thp mu l c chua nhim bnh


2) Tch dng, xc nh trnh t gen TYLCV
3) Thit k vector chuyn gen mang cu trc RNAi - TYLCV

4) To cy c chua chuyn gen mang cc cu trc RNAi


5) Kim tra s c mt ca gen chuyn trong cc dng cy
ti sinh. Phn tch s phn li gen chuyn th h T1
6) nh gi kh nng khng vi TYLCV Vit Nam

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn


V. VT
LIU V PHNG PHP NGHIN CU
1. VT LIU

1.1. Vt liu thc vt


L c chua nghi nhim bnh xon vng l do virus TYLCV c thu
thp t cc a phng khc nhau
Ht ging c chua PT18 do Vin nghin cu rau qu cung cp
1.2. Vector v chng vi khun
Vector tch dng pBT v pENTRTM/D-TOPO
Vector chuyn gen pK7GWIWG2(II)
Cc chng vi khun E. coli DH5; E. coli Top 10 v A. tumefaciens
CV58C1
1.3. Ha cht v thit b my mc
Ti Phng CNTBTV v Phng th nghim trng im Cng ngh gen,
Vin CNSH
Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

V. VT LIU V PHNG PHP NGHIN CU


2. PHNG PHP NGHIN CU
PCR
THU THP MU L
C CHUA

K Thut
GATEWAY

MU C CHUA
NHIM BNH
PHN LP GEN
CA TYLCV
THIT K VECTOR
CU TRC RNAi

Thng qua
A. tumefaciens

BIN NP VO C
CHUA PT18
Phn tch PCR
nh gi kh
nng khng
TYLCV
Cy chuyn gen

Phn tch phn


li gen chuyn

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

Ti LIU
liu chia
s ti:
wWw.SinhHoc.edu.vn
V. VT
V
PHNG
PHP NGHIN CU
2. PHNG PHP NGHIN CU

2.1. Cc phng php s dng phn lp gen ca TYLCV


Thu thp mu bnh cn c vo mc biu hin bnh (Lapidot &
Friedmann, 2002)
Tch chit DNA tng s t mu l thc vt (Collins & Symons ,1992)
PCR nhn gen ca TYLCV
Tch dng gen v xc nh trnh t nucleotide
2.2. Phng php thit k vector chuyn gen cu trc RNAi
Phn tch trnh t v thit k mi nhn gen
PCR nhn gen v ghp ni cc on gen thit k
Thit k vector pENTRTM/D-TOPO mang CPi; C1.2+CP2
Thit k vector chuyn gen pK7GWIWG2(II) mang cu trc RNAiTYLCV
Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

V. VT LIU V PHNG PHP NGHIN CU


2. PHNG PHP NGHIN CU
2.3. Phng php chuyn gen vo c chua thng qua A. tumefaciens
Bin np pK7GWIWG2(II)-TYLCV vo t bo A. tumefaciens
CV58C1 bng xung in
Bin np cc cu trc RNAi - TYLCV vo c chua thng qua vi
khun A. tumefaciens
2.4. Phng php phn tch cc dng c chua chuyn gen
Kim tra s c mt ca gen chuyn bng k thut PCR
Phn tch kh nng khng virus ca cy chuyn gen thng qua ly
nhim b phn v ghp p vi cy bnh
Phn tch s phn li gen chuyn th h T1 bng ch th khng
khng sinh Km

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

Ti liuVI.
chia
s ti:
wWw.SinhHoc.edu.vn
KT
QU
NGHIN CU
1. PHN LP GEN VIRUS TYLCV
1.1. Kho st v thu thp mu l c chua b bnh xon vng l

X ng t, Ph Lng

DDd

C chua di

Mc
nhim bnh
1

Bn Nguyn, i t

Td

C chua di

Huyn nh Ha

iHd

C chua di

P. ng Quang, TPTN

Qd

C chua di

Tuyn Quang

TQd

C chua di

Bc Kn

BKd

C chua di

Quyt Thng, Thi Nguyn

QTd

C chua di

Huyn V Nhai

VNt

C chua lai

P. Trng Vng, TPTN

TVd

C chua di

10

u, Ph Lng

PLt

C chua lai

11

Tch Lng, TPTN

TLt

C chua lai

12

P. Thnh n, TPTN

Td

C chua di

13

P. Tn Long, TN

TaLt

C chua lai

14

Sc Sn, H Ni

SSt

C chua lai

15

Huyn ng H

Ht

C chua lai

Stt a im thu mu

K hiu

Loi c chua

Ti
liu
chia
sgiti:
Ch thch: mc nhim
bnh
c
nh
theowWw.SinhHoc.edu.vn
tiu chun Lapidot, Friedmann, 2002

Ti liuVI.
chia
s ti:
wWw.SinhHoc.edu.vn
KT
QU
NGHIN CU
1. PHN LP GEN VIRUS TYLCV
1. 2. Nhn dng gen, xc nh v phn tch trnh t nucleotide gen CP

DNA tng s ca cc mu l c chua


nhim bnh

in di sn phm PCR khuch i gen CP

in di sn phm colony-PCR vi cp mi pUC18F1/pUC18R1

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

Ti liuVI.
chia
s ti:
wWw.SinhHoc.edu.vn
KT
QU
NGHIN CU
1. PHN LP GEN VIRUS TYLCV

QT
PL
QT
PL
QT
PL
QT
PL
QT
PL
QT
PL
QT
PL

10
TGTACAAAAG
..........
90
CATGTAGGGA
..........
170
TAAGTCAGTT
..........
250
TTTTAGTACG
..........
330
ACAGCCACGG
..........
410
TGCAAGCAAG
..........
490
AGTATGATAA
..........

20
CCCTGACGTT
......T...
100
AGGTAATTTG
..........
180
TATGTTTTGG
..........
260
TGATAGAAGA
..........
340
TGAAGAACGA
..........
420
GAGCAGGCAA
..........
500
CCACACAGAG
..........

30
CCACGAGGAT
..........
110
TGTGTCGGAT
..........
190
GTAAGATCTG
..........
270
CCTTTTGGAA
..........
350
TAACAGAGAT
..........
430
TAGTTAGGAA
..........
510
AATGCTTTGT
..........

40
GTGAAGGGCC
.......C..
120
GTTACACGTG
..........
200
GATGGATGAG
..........
280
CTCCCCAAGA
..........
360
CGTTTTCAAG
..........
440
GTTTATGAAG
..........
520
TATTGTATAT
..........

50
ATGTAAAGTC
..........
130
GTAACGGATT
..........
210
AACATTAAGA
..........
290
TTTTGGTCAG
..........
370
TTCTTCGTCG
..........
450
GTGAACAACC
..........
530
GGCATGTACA
.........T

60
CAGTCTTATG
..........
140
GACTCATCGT
..........
220
CGAAGAATCA
..........
300
GTGTTTAACA
..........
380
ATTTCAGGCT
..........
460
ATGTGACGTA
..........
540
CATGCTTCTA
.....C..C.

70
AACAGCGTCA
..........
150
GTTGGGAAGA
..........
230
TACTAATACG
..........
310
TGTATGATAA
..........
390
ACTGTTACTG
..........
470
TAATCATCAA
..........

80
TGATGTAGCC
..........
160
GGTTCTGTAT
..........
240
GTCATGTTCT
..........
320
CGAGCCAAGT
..........
400
GTGGTCAGTA
..........
480
GAGGCTGCGA
..........

ATCC
.C..

Nhm ph bin
ca Vit Nam

Hnh
Biuloi
hnh
phncy
loida
hnh
cy
[da
vo trnh
t ca
vng
gen CP
ca
TYLCV
Biu3.5.
phn
vo
trnh
t vng
gen CP
TYLCV
phn
lp
trn cphn
chua lp
di
trn
c
chua
di
ti
QT
v
DD,
Thi
Nguyn
vi
cc
trnh
t
khc
phn
lp
c
ti
Vit
ti QT v DD, Thi Nguyn vi cc trnh t khc phn lp c ti Vit Nam v cc trnh t
Nam v cc trnh t gen V1 ca TYLCV ng k trn GenBank (bng 3.2)]. Nhng gi tr
gen CP ca TYLCV ng k trn GenBank
bootstrap ln hn 70% mi c bin din.

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

Ti liuVI.
chia
s ti:
wWw.SinhHoc.edu.vn
KT
QU
NGHIN CU
1. PHN LP GEN VIRUS TYLCV
1.3. Gii trnh t vong gen DNA-A ca TYLCV

STT gene
1
2
3
4
5
6
7

DNA-A
Pre-CP
CP
C3
C2
C1
C4

Kch thc
(v tr nucleotide)
2744
351 (131-481)
774 (291-1064)
405 (1060-1464)
408 (1205-1612)
1089 (1512-2600)
294 (2150-2443)

NA
69.6

90.7

AY602166.1.seq
GU723713.1.seq
DQ641695.1.seq
AF414287.seq
FN434083.1.seq
FN297834.1.seq
TYLCV-QT.seq
DQ641705.seq
AF264063.seq
GQ338767.seq
AJ704603.1.seq
EF165536.1.seq

68.3
99.5
100.0

80.7
99.5
100.0
77.6

20.2
20

15

10
Nucleotide Substitutions (x100)
Bootstrap Trials = 1000, seed = 111

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

Ti liu VI.
chiaKT
s ti:QU
wWw.SinhHoc.edu.vn
NGHIN CU
2. THIT K VECTOR CU TRC RNAi MANG GEN TYLCV

S m t cc bc thit k vector mang cu trc RNAi bng k thut Gateway


(Karimi et al., 2002)
Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

Ti liu chia
ti: wWw.SinhHoc.edu.vn
VI.sKT
QU NGHIN CU
3. BIN NP CU TRC RNAi MANG GEN TYLCV VO C CHUA
Hnh nh chuyn gen vo c chua

CPi: 24/26

C1.2+CP2: 21/23

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

Ti liu chia
ti: wWw.SinhHoc.edu.vn
VI.sKT
QU NGHIN CU
3. BIN NP CU TRC RNAi MANG GEN TYLCV VO C CHUA
Bin np cu trc RNAi/TYLCV-CPi v RNAi/TYLCV-C1.2+CP2 vo c chua PT18
Cu trc
RNAi

RNAi/TYLCV
-CPi

RNAi/TYLCV
-C1.2+CP2

L th
nghim

S mnh l
bin np

S cm
chi hnh
thnh/ C+
Km

134

186

35

420

370

104

11

220

212

37

Tng s

774

768

176

26

104

83

27

142

87

48

300

270

93

14

Tng s

546

440

168

23

30

30

54*

77*

20*

S chi
sng st
/C+Km

S cy ra
r /B + Km

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

Ti liu chia VI.


s ti:
wWw.SinhHoc.edu.vn
KT
QU NGHIN CU
4. NH GI KH NNG KHNG TYLCV CA CC DNG C CHUA CHUYN GEN

4.1. nh gi kh nng khng vi TYLCV Vit Nam bng ly nhim b phn

Ngun b phn trong vn th nghim v kt


qu in di sn phm PCR kim tra s c mt
ca TYLCV c chua v b phn

Ti liu chia s ti:

Mc biu hin kh nng khng ca dng


LCP1-4 i chng sau 20 ngy v sau 60 ngy
ly nhim b phn
wWw.SinhHoc.edu.vn

Ti liu chia VI.


s ti:
wWw.SinhHoc.edu.vn
KT
QU NGHIN CU
4. NH GI KH NNG KHNG TYLCV CA CC DNG C CHUA CHUYN GEN

nh gi kh nng khng TYLCV ca cc dng LCP0 bng phng php ly


nhim b phn mang virus
Dng
LCP0-1
LCP0-2
LCP0-3
LCP0-4
LCP0-5
LCP0-6
LCP0-7
LCP0-8
LCP0-9
LCP0-10
LCP0-11
LCP0-12
LCP0-13
LCP0-14
LCP0-15
LCP0-16
LCP0-17
LCP0-18
LCP0-19
LCP0-20
LCP0-21
LCP0-22
LCP0-23
LCP0-24
C

10
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0,3

15
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
1

Mc biu hin bnh sau ly nhim TYLCV


(Ngy theo di)
20
25
30
35
40
45
0,4
0,4
1,2
1,6
1,6
1,6
0
0,6
1,8
1,6
2
2,4
0
0
0,6
0,6
0,6
0,6
0,6
0,6
1,4
1,4
1,4
1,4
0,4
0,4
1,2
1,6
1,6
1,8
0,6
1
1,6
1,6
1,6
1,6
0,6
0,8
1,4
1,8
1.8
1,8
0
0,4
1,2
1,6
1,8
1,8
0,4
0,4
1,6
2,6
2,6
3
0
0,4
0,4
0,6
1
1
0,6
1
2,4
2,8
2,8
3
0
0,6
1,6
2
1,8
2
0
0,4
1,4
1,4
1,6
2,2
0
0
0,6
0,6
0,6
0,6
0,8
1,4
1,6
1,8
1,8
2
0
0,4
1
1,4
1,4
1,8
0,6
0,6
1,6
1,4
1,4
1,6
0
0
0,8
1
1,4
1,4
0,2
0,2
0,8
1,2
1,4
1,4
0
0
0,6
0,6
0,6
0,6
0
0,2
0,4
1,6
1,6
1,8
0,4
0,8
1,6
1,8
1,8
2
0,4
0,8
1,8
1,6
1,6
1,8
0
0,4
0,4
0.6
1
1,2
1,8
2
2,6
3
4
4

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

Mc bnh TB
50
1,6
2,4
0,6
1,4
1,8
1,6
1,8
1,8
3
1
3
2
2,2
0,6
2
1,8
1,8
1,4
1,4
0,6
2
2
1,8
1,2
4

2
2
1
1
2
2
2
2
3
1
3
2
2
1
2
2
2
1
1
1
2
2
2
1
4

Ti liu chia VI.


s ti:
wWw.SinhHoc.edu.vn
KT
QU NGHIN CU
4. NH GI KH NNG KHNG TYLCV CA CC DNG C CHUA CHUYN GEN

nh gi kh nng khng TYLCV ca cc dng LCP1 bng phng php ly nhim


b phn mang virus
Dng
LCP1-1
LCP1-2
LCP1-3
LCP1-4
LCP1-5
LCP1-6
LCP1-7
LCP1-8
LCP1-9
LCP1-10
LCP1-11
LCP1-12
LCP1-13
LCP1-14
LCP1-15
LCP1-16
LCP1-17
LCP1-18
LCP1-19
LCP1-20
LCP1-21
C

10
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0,3

15
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
1

Mc biu hin bnh sau ly nhim TYLCV


(Ngy theo di)
20
25
30
35
40
0,2
0,4
1,2
1,4
1,4
0
0
0
0
0
0,4
0,4
1,4
1,6
1,6
0
0
0
0
0
0,6
0,4
0,4
1,4
1,4
0,6
1
1,6
2,2
2,8
0,2
0,6
1,6
1,8
2,6
0
0
0,4
0,2
0
0,6
0,4
1
1,6
1,6
0,2
0,4
1,2
1,4
1,4
0,6
0,4
1
1,6
1,8
0
0,4
0,4
0,4
0,4
0
1
1
1,4
2,6
0
0,8
1,6
1,4
1,6
0
0
0,4
0,6
0,6
0
0
0
0
0
0,6
0,6
0,8
1
1,4
0
0
0,4
0,4
0,4
0
0,4
0,4
0,4
0,4
0
0,2
0,4
1,2
1,6
0
0,2
0,6
1,6
1,8
1,8
2
2,7
3
4

Mc bnh TB
45
1,6
0
1,6
0
1,8
2,8
2,6
0
1,8
1,4
1,6
1
2,6
1,8
0,6
0
1,4
0,6
1
1,6
1,8
4

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

50
1,8
0
1,6
0
1,8
2,8
2,6
0
2
1,4
1,6
1
3
1,8
0,6
0
1,4
0,6
1
1,6
1,8
4

2
0
2
0
2
3
3
0
2
1
2
1
3
2
1
0
2
1
1
2
2
4

Ti liu chia VI.


s ti:
wWw.SinhHoc.edu.vn
KT
QU NGHIN CU
4. NH GI KH NNG KHNG TYLCV CA CC DNG C CHUA CHUYN GEN

Tng hp kt qu nh gi kh nng khng TYLCV ca cc dng c chua chuyn gen


Dng
phn tch

LCP0

LCP1

T l cy khng sau ly nhim TYLCV (%)

Mc
nhim
bnh

10
ngy

20
ngy

30
ngy

40 ngy

50 ngy

T l khng
sau phn
tch (%)

100

75

12,5

25

50

37,5

33,3

33,3

33,3

54,2

58,4

58,4

4,2

8,3

8,3

8,3

100

76,2

47,6

38,1

19

19

523,8

38,1

19

23,8

23,8

14,3

28,6

42,9

42,9

14,3

14,3

14,3

20

80

10

50

40

10

90

100

100

100

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

Ti liu chia VI.


s ti:
wWw.SinhHoc.edu.vn
KT
QU NGHIN CU
4. NH GI KH NNG KHNG TYLCV CA CC DNG C CHUA CHUYN GEN

4.2. nh gi kh nng khng vi TYLCV Vit Nam bng ghp p

Cy C biu hin bnh mc 2 sau 18


ngy ghp vi cy nhim TYLCV

Dng LCP1-8 biu hin kh nng khng


TYLCV sau 30 ngy ghp

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

Ti liu chia VI.


s ti:
wWw.SinhHoc.edu.vn
KT
QU NGHIN CU
4. NH GI KH NNG KHNG TYLCV CA CC DNG C CHUA CHUYN GEN

nh gi kh nng khng TYLCV ca cc dng LCP1 bng phng php ghp p


Mc biu hin bnh sau ly nhim TYLCV
Mc bnh
(Ngy theo di)
Dng
TB
10
15
20
25
30
35
40
45
50
LCP1-1
0
0
0
0
0,3
0,3
1
1
1
1
LCP1-2
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
LCP1-3
0
0
0
0
0
0,3
0,7
1,3
1,3
1
LCP1-4
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
LCP1-5
0
0
0
0
0,7
0,7
0,7
1
1
1
LCP1-6
0
0
0
0
0,7
0,7
1
1,3
1,7
2
LCP1-7
0
0
0
0
0,3
1
0,7
1,3
2
2
LCP1-8
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
LCP1-9
0
0
0
0
0,3
0,7
0,7
1
1,3
1
LCP1-10
0
0
0
0
0
0,3
0,7
1,3
1,3
1
LCP1-11
0
0
0
0
0,7
1,3
1,3
1,7
1,7
2
LCP1-12
0
0
0
0
0,3
0,3
1
1
3S1
1
LCP1-13
0
0
0
0
0,7
0,7
1
1,3
1,3
1
LCP1-14
0
0
0
0
0,7
1,3
1,3
1,7
1,7
2
LCP1-15
0
0
0
0
0
0,3
1
1
1,3
1
LCP1-16
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
LCP1-17
0
0
0
0
0,3
0,7
1,3
1,7
1,7
2
LCP1-18
0
0
0
0
0
0,3
0,7
1
1
1
LCP1-19
0
0
0
0
0,3
0,3
0,7
1
1
1
LCP1-20
0
0
0
0
0
0,3
0,7
1,3
1,3
0
LCP1-21
0
0
0
0
0,3
1,3
1,3
1,3
1,3
2
C
0
0
0,6
1
1
1,4
1,4
2,2
2,6
3
Ghi ch: Mi dng chuyn gen tin hnh ghp 3 cy, i chng ghp 5 cy. Biu hin bnh c nh gi theo mc
t 0 n 4. Kt qu ly gi tr trung bnh ca cc ln theo di.

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

Ti liu chiaVI.
s ti:
KTwWw.SinhHoc.edu.vn
QU NGHIN CU
5. PHN TCH PHN LI GEN CHUYN V NH GI KH NNG KHNG TYLCV TH H T1

5.1.Phn tch phn li gen chuyn bng ch th khng khng sinh Km

Kh nng khng Km
Tng s
ht gieo

S cy
khng Km

LCP1-4

142

102

S cy
khng
khng
Km
36

LCP1-8

54

54

LCP1-16

89

66

23

Dng

T l

2,83 : 1 0.087
-

2,87 : 1 0.034

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

VI.sKT
QU NGHIN CU
Ti liu chia
ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

5. PHN TCH PHN LI GEN CHUYN V NH GI KH NNG KHNG


TYLCV TH H T1

5.2. nh gi kh nng khng TYLCV mt s dong LCP1 th h T1

T l cy khng sau ly nhim TYLCV (%) sau 50 ngy


Dng

LCP1-4

S cy
phn tch

Mc 0

Mc 1

Mc 2

Mc 3

Mc 4

43

39,6

27,9

20,9

11,6

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

VII. KT LUN

1. Xc nh c 13/15 mu c chua nhim bnh thu Thi Nguyn v


vng ln cn dng tnh vi TYLCV. Gen CP ca hai dng TYLCVDDd v TYLCV-QTd c gii trnh t v ng k trn GenBank
(FN826907 v FN826908). Vng DNA-A ca TYLCV-QTd phn lp
c c chiu di 2744 nucleotide gm c 2 gen xui chiu (Pre-CP,
CP) v 4 gen theo chiu b sung (C1, C2, C3, C4). Trnh t nucleotide
cho thy hai chng virus phn lp c u thuc nhm gy bnh ph
bin Vit Nam.
2. Thit k thnh cng 2 vector chuyn gen mang cu trc RNAi
(K7WG/TYLCV-CPi v pK7WG/TYLCV-C1.2+CP2) vi on trnh t
gen thit k lp li o chiu c ngn cch vi nhau bng on
trnh t intron. Cc vector c bin np vo A. tumefaciens chng
CV58C1 chuyn gen.

3. Thng qua ng nui cy vi mnh m l mm c chua, hai cu trc


RNAi c chuyn vo cy c chua ging PT18. Phn tch PCR
kim tra s c mt ca gen chuyn trong cc dng c chua cho kt
qu l 24/26 dng
LCP0
dng LCP1 dng tnh.
Ti liu
chiav
s 21/23
ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

VII. KT LUN

4. Kt qu nh gi kh nng khng TYLCV ca cc dng chuyn gen


th h T0 bng phng php ly nhim virus thng qua b phn v
ghp p cho thy cc dng cy chuyn a gen biu hin tnh khng tt
hn cc dng chuyn n gen, trong 4 dng LCP1-2 ; LCP1-4 ;
LCP1-8 v LCP1-16 c kh nng khng hon ton vi TYLCV.
5. Kt qu phn tch di truyn thu c hai dng LCP1-4 v LCP1-16
mang 01 bn gen chuyn vi t l phn li gen l 3:1 theo quy lut di
truyn n gen ca Mendel.
6. nh gi kh nng khng virus ca dng LCP1-4 th h T1 thu c
t l khng hon ton vi TYLCV t 39,6%; Sau 60 ngy ly nhim
b phn, khng c cy biu hin bnh mc 4 v t l cy b nhim
bnh mc 3 ch chim 11,6%.

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

VIII. NGH

1. Tip tc phn tch tnh khng virus TYLCV ca cc dng c chua


cc th h tip theo v phn tch tnh khng bnh vi mt s chng
TYLCV khc ang c mt ti Vit Nam la chn nhng dng c
trin vng phc v cng tc chn ging.
2. Thit k cu trc vector RNAi c kh nng bt hot ng thi nhiu
gen virus TYLCV tng cng hiu qu khng vi TYLCV

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

IX. CC CNG TRNH CNG B LIN QUAN N LUN N


1) Nguyn Th Hi Yn, Phm Th Vn, Chu Hong H, Chu Hong Mu, L
Trn Bnh (2008). Phn lp gen m ha protein v ca virus gy bnh xon
vng l c chua thu thp trn cy c chua di ti Thi Nguyn. Tp ch Cng
ngh Sinh hc Tp 5 (2): 467 - 474.
2) Nguyn Th Hi Yn, Phm Th Vn, Chu Hong H, Chu Hong Mu, L
Trn Bnh (2009). Thit k vector chuyn gen mang cu trc RNAi c kh
nng khng virus gy bnh xon l c chua. Bo co hi ngh Cng ngh Sinh
hc Ton quc: 473 477.
3) Nguyn Th Hi Yn, Phm Th Vn, Chu Hong H, Chu Hong Mu, L
Trn Bnh (2011). To dng c chua PT18 khng bnh xon vng l do virus
bng k thut RNAi. Tp ch Cng ngh Sinh hc. Tp 9 (3): 333 340
4) Nguyn Th Hi Yn, Phm Th Vn, Chu Hong H, Chu Hong Mu, L
Trn Bnh (2011). So snh tnh khng bnh xon vng l ca cc dng c
chua chuyn genmang cu trc RNAi n gen v ng thi hai gen ca
Tomato yellow leaf curl Vietnam virus. Hi tho quc gia Bnh hi thc vt Vit
Nam: 290 299.
5) Trnh t gen ng k trn ngn hng GenBank: 02 trnh t gen CP ca TYLCV
vi m s: FN826907 v FN826908

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

Ti liu chia s ti: wWw.SinhHoc.edu.vn

You might also like