Wed Feb 4 09:11:31 2009

Solution parameters:
Sequence file: seq.seq
Family matches: yes
MatInspector library: Matrix Family Library Version 8.0 (November 2008)
Selected groups
• Vertebrates (0.75/Optimized)
(core/matrix sim)

Inspecting sequence GXP_1686362 [GXP_1686362] (1 -

765):
[GXL_568596]
Check transcription factor <-> Position Sequence
Core Matrix
matrix family assignment Opt. from - t Str. (red: ci-value > 60
sim. sim.
Family Matrix o capitals: core sequence)
V$PARF V$TEF.01 0.85 1 - 17 (+) 0.818 0.884 tactgtgatATAAttgc
V$DLXF V$DLX3.01 0.91 2 - 20 (+) 1.000 1.000 actgtgataTAATtgcaaa
V$PARF V$TEF_HLF.01 0.78 2 - 18 (-) 0.860 0.801 tgcaaTTATatcacagt
V$HOXF V$HOXD3.01 0.85 3 - 21 (-) 1.000 0.867 ctttgcAATTatatcacag
V$HOMF V$MSX.01 0.97 4 - 22 (+) 1.000 0.973 tgtgataTAATtgcaaagt
V$HBOX V$MEOX1.01 0.84 5 - 23 (+) 1.000 0.856 gtgatatAATTgcaaagta
V$CART V$S8.01 0.97 6 - 26 (+) 1.000 0.994 tgataTAATtgcaaagtaaac
V$NKXH V$NKX25.02 0.88 6 - 24 (+) 1.000 0.882 tgataTAATtgcaaagtaa
V$DLXF V$DLX2.01 0.92 7 - 25 (-) 1.000 0.945 tttactttgcAATTatatc
V$ATBF V$ATBF1.01 0.79 9 - 25 (-) 1.000 0.808 tttactttgcAATTata
V$FKHD V$HNF3.01 0.98 16 - 32 (+) 1.000 0.987 gcaaagtAAACaaatga
V$SORY V$SRY.01 0.93 20 - 36 (+) 1.000 0.939 agtaaACAAatgaattt
V$BRNF V$BRN2.03 0.92 21 - 39 (-) 1.000 0.936 tggaaattcATTTgtttac
V$NFAT V$NFAT5.01 0.83 23 - 41 (-) 1.000 0.862 tatGGAAattcatttgttt
V$BRNF V$BRN2.03 0.92 24 - 42 (+) 1.000 0.921 aacaaatgaATTTccataa
V$NFKB V$NFKAPPAB65.01 0.87 27 - 39 (+) 1.000 0.875 aaatgaatTTCCa
V$OCT1 V$OCT1.06 0.81 27 - 43 (-) 1.000 0.952 tttatggaAATTcattt
V$BRN5 V$BRN5.02 0.77 28 - 50 (+) 0.750 0.773 aatgaatttccATAAagctaatt
V$BCL6 V$BCL6.02 0.77 30 - 46 (-) 0.800 0.778 agctttaTGGAaattca
V$LHXF V$LHX3.02 0.82 33 - 55 (+) 1.000 0.849 atttccataaagcTAATttatct
V$SNAP V$PSE.02 0.73 33 - 51 (+) 0.892 0.794 atttcCATAaagctaattt
V$BRNF V$BRN4.01 0.89 35 - 53 (+) 1.000 0.899 ttccataaagcTAATttat
V$CART V$ALX3.01 0.85 36 - 56 (-) 1.000 0.869 aagataAATTagctttatgga
V$DLXF V$DLX3.02 0.93 37 - 55 (+) 1.000 0.937 ccataaagcTAATttatct
V$LHXF V$LHX2.01 0.85 37 - 59 (+) 1.000 0.855 ccataaagctAATTtatctttat
V$HOXF V$HOXD1.01 0.87 38 - 56 (-) 1.000 0.876 aagataAATTagctttatg
V$LHXF V$LHX4.01 0.83 38 - 60 (-) 1.000 0.845 tataaagataAATTagctttatg
V$HBOX V$EN2.01 0.86 39 - 57 (-) 1.000 0.860 aaagataAATTagctttat
V$HOMF V$MSX2.01 0.95 39 - 57 (+) 1.000 0.956 ataaagCTAAtttatcttt
V$MYT1 V$MYT1.01 0.75 39 - 51 (+) 0.750 0.775 ataAAGCtaattt
V$OCT1 V$OCT1.06 0.81 39 - 55 (+) 1.000 0.811 ataaagctAATTtatct
V$BRNF V$BRN2.04 0.82 40 - 58 (-) 0.759 0.820 taaagatAAATtagcttta
V$HBOX V$GSH2.01 0.95 40 - 58 (+) 1.000 0.965 taaagcTAATttatcttta
V$HOMF V$NOBOX.02 0.89 40 - 58 (-) 1.000 0.894 taaagataAATTagcttta
V$CART V$PHOX2.01 0.87 41 - 61 (+) 1.000 0.873 aaagcTAATttatctttatat
V$HOXF V$HOXB4.01 0.84 41 - 59 (+) 1.000 0.840 aaagctAATTtatctttat
V$PAXH V$PAX4.02 0.84 41 - 55 (-) 1.000 0.848 agataAATTagcttt
V$PAXH V$PAX4.02 0.84 42 - 56 (+) 1.000 0.840 aagctAATTtatctt
V$GATA V$GATA1.03 0.95 46 - 58 (-) 1.000 0.958 taaaGATAaatta
V$MYT1 V$MYT1.01 0.75 47 - 59 (-) 0.750 0.775 ataAAGAtaaatt
V$FKHD V$XFD2.01 0.89 48 - 64 (-) 1.000 0.912 aaaataTAAAgataaat
V$NFAT V$NFAT5.01 0.83 51 - 69 (-) 1.000 0.847 tatGGAAaatataaagata
V$IRFF V$IRF4.01 0.94 55 - 75 (-) 1.000 0.948 aataaatatgGAAAatataaa
V$OCT1 V$OCT1.04 0.80 55 - 71 (-) 1.000 0.882 aaTATGgaaaatataaa
V$PDX1 V$PDX1.01 0.74 62 - 80 (+) 0.826 0.754 tttccatatTTATtacttc
V$CDXF V$CDX2.02 0.85 63 - 81 (+) 1.000 0.939 ttccatatTTATtacttca
V$HOXF V$HOXB8.01 0.83 63 - 81 (-) 0.835 0.870 tgaagtaATAAatatggaa
V$SATB V$SATB1.01 0.94 64 - 78 (-) 1.000 0.957 agtAATAaatatgga
V$ABDB V$HOXA10.01 0.87 65 - 81 (-) 1.000 0.915 tgaagtaaTAAAtatgg
V$CART V$RHOX6.01 0.84 66 - 86 (+) 0.783 0.842 catatTTATtacttcaaattc
V$HOXF V$HOXD3.01 0.85 66 - 84 (+) 0.766 0.860 catattTATTacttcaaat
V$CREB V$ATF2.01 0.87 67 - 87 (-) 0.777 0.873 agaattTGAAgtaataaatat
V$PARF V$TEF.01 0.85 70 - 86 (-) 1.000 0.897 gaatttgaaGTAAtaaa
V$CHRF V$CHR.01 0.92 74 - 86 (-) 1.000 0.951 gaatTTGAagtaa
V$FKHD V$FHXB.01 0.83 80 - 96 (-) 0.909 0.837 aatgtaACAAgaatttg
V$HNF1 V$HMBOX.01 0.83 81 - 97 (+) 1.000 0.859 aaattcttGTTAcattt
V$DMRT V$DMRT5.01 0.80 82 - 102 (+) 1.000 0.965 aattcttGTTAcattttcaat
V$PARF V$VBP.01 0.86 86 - 102 (-) 1.000 0.901 attgaaaatGTAAcaag
V$BRNF V$BRN2.01 0.86 87 - 105 (-) 0.933 0.895 acAATTgaaaatgtaacaa
V$PRDF V$BLIMP1.01 0.81 87 - 105 (-) 1.000 0.841 acaattGAAAatgtaacaa
V$SORY V$SOX9.01 0.90 94 - 110 (-) 1.000 0.900 caaacaCAATtgaaaat
104 - 11
V$CHRF V$CHR.01 0.92 (+) 1.000 0.965 gtgtTTGAaatat
6
106 - 12
V$OCT1 V$OCT1.06 0.81 (-) 0.750 0.841 catatgatATTTcaaac
2
V$EVI1 V$EVI1.04 0.73 113 - 12 (-) 1.000 0.754 aaaataccatatGATAt
 9
115 - 12
V$RUSH V$SMARCA3.01 0.96 (-) 1.000 0.997 taCCATatgat
5
117 - 13
V$LHXF V$LHX3.02 0.82 (+) 1.000 0.858 catatggtattttTAATttaaat
9
117 - 13
V$MEF2 V$MEF2.06 0.87 (-) 1.000 0.901 atttaaattaaAAATaccatatg
9
117 - 13
V$OCT1 V$OCT1.06 0.81 (+) 0.750 0.855 catatggtATTTttaat
3
119 - 13
V$HOMF V$HHEX.01 0.95 (+) 1.000 0.966 tatggtattttTAATttaa
7
120 - 14
V$CART V$PROP1.01 0.84 (-) 1.000 0.856 catttaAATTaaaaataccat
0
121 - 12
V$HMTB V$MTBF.01 0.90 (+) 1.000 0.969 tggtATTTt
9
121 - 14
V$LHXF V$LMX1B.02 0.83 (+) 1.000 0.864 tggtatttttAATTtaaatgtac
3
122 - 14
V$HOXF V$HOXC4.01 0.84 (-) 1.000 0.856 catttaAATTaaaaatacc
0
122 - 14
V$LHXF V$LMX1A.01 0.83 (-) 1.000 0.868 agtacatttaAATTaaaaatacc
4
123 - 14
V$BRNF V$BRN2.03 0.92 (+) 1.000 0.944 gtatttttaATTTaaatgt
1
123 - 14
V$HOMF V$MSX.01 0.97 (+) 1.000 0.989 gtattttTAATttaaatgt
1
125 - 14
V$CART V$PROP1.01 0.84 (+) 1.000 0.856 atttttAATTtaaatgtacta
5
125 - 14
V$HBOX V$EN1.01 0.77 (+) 1.000 0.918 atttttaaTTTAaatgtac
3
125 - 14
V$HOXF V$HOXC4.01 0.84 (+) 1.000 0.856 atttttAATTtaaatgtac
3
125 - 13
V$NKX6 V$NKX61.01 0.91 (+) 1.000 0.920 atttTTAAtttaaat
9
126 - 14
V$OCT1 V$OCT1.05 0.89 (-) 0.900 0.931 taCATTtaaattaaaaa
2
126 - 13
V$RBIT V$BRIGHT.01 0.92 (-) 1.000 0.950 tttaaATTAaaaa
8
128 - 14
V$HBOX V$EN1.01 0.77 (-) 1.000 0.787 ttagtacaTTTAaattaaa
6
131 - 15
V$DMRT V$DMRT4.01 0.79 (-) 1.000 0.818 aataattagTACAtttaaatt
1
132 - 14
V$IRXF V$IRX6.01 0.85 (-) 0.750 0.861 agtaCATTtaaat
4
V$IRXF V$IRX6.01 0.85 133 - 14 (+) 0.750 0.851 tttaAATGtacta
 5
134 - 15
V$CART V$S8.01 0.97 (-) 1.000 0.997 aaaaaTAATtagtacatttaa
4
135 - 15
V$ATBF V$ATBF1.01 0.79 (+) 1.000 0.813 taaatgtactAATTatt
1
135 - 15
V$BRN5 V$BRN5.04 0.83 (+) 1.000 0.909 taaatgtactaATTAttttttag
7
135 - 15
V$DLXF V$DLX2.01 0.92 (+) 1.000 0.992 taaatgtactAATTatttt
3
135 - 15
V$LHXF V$LHX2.01 0.85 (+) 1.000 0.935 taaatgtactAATTattttttag
7
135 - 15
V$PDX1 V$IPF1.01 0.84 (+) 1.000 0.939 taaatgtacTAATtatttt
3
136 - 15
V$HOXF V$HOXA3.01 0.86 (-) 1.000 0.962 aaaaaTAATtagtacattt
4
136 - 15
V$LHXF V$LHX6.01 0.84 (-) 1.000 0.929 actaaaaaaTAATtagtacattt
8
137 - 15
V$BRNF V$BRN3.02 0.89 (+) 1.000 0.923 aatgtacTAATtatttttt
5
137 - 15
V$HBOX V$EN1.02 0.86 (-) 1.000 0.970 aaaaaatAATTagtacatt
5
137 - 15
V$HOMF V$MSX1.01 0.89 (+) 1.000 0.990 aatgtactAATTatttttt
5
138 - 15
V$BRNF V$BRN2.04 0.82 (-) 1.000 0.943 taaaaaaTAATtagtacat
6
138 - 15
V$HBOX V$HLXB9.01 0.83 (+) 1.000 0.963 atgtactAATTatttttta
6
138 - 15
V$HOMF V$BARX1.01 0.91 (-) 1.000 0.981 taaaaaatAATTagtacat
6
138 - 15
V$NKX1 V$NKX12.01 0.87 (-) 1.000 0.958 aaaaatAATTagtacat
4
138 - 15
V$OCT1 V$OCT1.03 0.85 (+) 1.000 0.934 atgtactaATTAttttt
4
139 - 15
V$CART V$S8.01 0.97 (+) 1.000 0.992 tgtacTAATtattttttagtc
9
139 - 15
V$HOXF V$HOXA3.01 0.86 (+) 1.000 0.976 tgtacTAATtattttttag
7
139 - 15
V$NKX1 V$NKX12.01 0.87 (+) 1.000 0.922 tgtactAATTatttttt
5
139 - 15
V$NKX6 V$NKX63.01 0.85 (+) 1.000 0.899 tgtacTAATtatttt
3
139 - 15
V$OCT1 V$OCT1.03 0.85 (-) 1.000 0.955 aaaaaataATTAgtaca
5
V$PAXH V$PAX4.02 0.84 139 - 15 (-) 1.000 0.936 aaaatAATTagtaca
 3
140 - 15
V$DLXF V$DLX1.02 0.88 (-) 1.000 0.988 actaaaaaatAATTagtac
8
140 - 16
V$LHXF V$LMX1B.01 0.91 (-) 1.000 0.980 acagactaaaaaaTAATtagtac
2
140 - 15
V$NKX6 V$NKX63.01 0.85 (-) 1.000 0.934 aaaaaTAATtagtac
4
140 - 15
V$PAXH V$PAX4.02 0.84 (+) 1.000 0.918 gtactAATTattttt
4
140 - 15
V$PDX1 V$IPF1.01 0.84 (-) 1.000 0.971 actaaaaaaTAATtagtac
8
141 - 15
V$BRNF V$BRN4.02 0.80 (+) 0.771 0.810 tactaaTTATtttttagtc
9
141 - 15
V$PIT1 V$PIT1.02 0.81 (-) 0.766 0.839 aaaaaATAAttagta
5
142 - 15
V$PIT1 V$PIT1.02 0.81 (+) 0.766 0.810 actaaTTATttttta
6
143 - 16
V$BRN5 V$BRN5.03 0.76 (+) 1.000 0.782 cTAATtattttttagtctgtggg
5
145 - 16
V$HNF1 V$HNF1.01 0.80 (+) 0.790 0.800 aATTAttttttagtctg
1
161 - 18
V$IRFF V$IRF4.01 0.94 (+) 1.000 0.950 gtgggtaagaGAAAttaaaaa
1
164 - 18
V$HOXF V$HOXC8.01 0.85 (-) 0.761 0.850 atttttaATTTctcttacc
2
164 - 18
V$LHXF V$LHX1.01 0.82 (-) 1.000 0.820 tcaaatttttAATTtctcttacc
6
165 - 18
V$PRDF V$PRDM1.01 0.81 (+) 1.000 0.834 gtaagaGAAAttaaaaatt
3
166 - 18
V$BRNF V$BRN3.02 0.89 (-) 1.000 0.903 aaattttTAATttctctta
4
166 - 18
V$HOMF V$MSX.01 0.97 (-) 1.000 0.989 aaattttTAATttctctta
4
167 - 18
V$ABDB V$HOXC9.01 0.83 (+) 1.000 0.832 aagagaaaTTAAaaatt
3
167 - 18
V$HOXF V$HOXB8.01 0.83 (+) 1.000 0.898 aagagaaATTAaaaatttg
5
167 - 18
V$IRFF V$IRF7.01 0.86 (+) 1.000 0.888 aagaGAAAttaaaaatttgaa
7
168 - 18
V$DLXF V$DLX3.01 0.91 (-) 1.000 0.924 tcaaattttTAATttctct
6
168 - 19
V$LHXF V$LHX3.02 0.82 (-) 1.000 0.838 ttgttcaaattttTAATttctct
0
V$NKX6 V$NKX61.01 0.91 168 - 18 (-) 1.000 0.960 atttTTAAtttctct
 2
169 - 18
V$RBIT V$BRIGHT.01 0.92 (+) 1.000 0.942 gagaaATTAaaaa
1
170 - 18
V$ATBF V$ATBF1.01 0.79 (-) 1.000 0.800 tcaaatttttAATTtct
6
170 - 18
V$HOMF V$HHEX.01 0.95 (-) 1.000 0.979 gttcaaattttTAATttct
8
179 - 19
V$CART V$ALX3.01 0.85 (-) 1.000 0.881 tgaattAATTtgttcaaattt
9
179 - 19
V$CHRF V$CHR.01 0.92 (+) 1.000 0.935 aaatTTGAacaaa
1
180 - 20
V$LHXF V$ISL2.01 0.87 (+) 1.000 0.914 aatttgaacaaATTAattcagtt
2
181 - 19
V$HOXF V$HOXD3.01 0.85 (-) 1.000 0.868 tgaattAATTtgttcaaat
9
181 - 20
V$LHXF V$LHX3.01 0.81 (-) 1.000 0.914 aaactgaaTTAAtttgttcaaat
3
182 - 20
V$BRNF V$BRN4.01 0.89 (+) 1.000 0.910 tttgaacaaatTAATtcag
0
182 - 20
V$HBOX V$GSH2.01 0.95 (-) 1.000 0.963 ctgaatTAATttgttcaaa
0
182 - 20
V$HOMF V$MSX1.01 0.89 (+) 1.000 0.916 tttgaacaAATTaattcag
0
183 - 20
V$BRNF V$TST1.01 0.90 (-) 1.000 0.927 actgaATTAatttgttcaa
1
183 - 20
V$CART V$SHOX2.01 0.85 (-) 1.000 0.872 aaactgAATTaatttgttcaa
3
183 - 20
V$HBOX V$GSH1.01 0.85 (+) 1.000 0.919 ttgaacaaatTAATtcagt
1
183 - 20
V$HOMF V$MSX.01 0.97 (-) 1.000 0.977 actgaatTAATttgttcaa
1
183 - 19
V$NKX1 V$NKX12.01 0.87 (-) 1.000 0.905 tgaattAATTtgttcaa
9
184 - 20
V$CART V$PHOX2A.01 0.84 (+) 1.000 0.885 tgaacaAATTaattcagtttt
4
184 - 20
V$HOXF V$HOXD3.01 0.85 (+) 1.000 0.861 tgaacaAATTaattcagtt
2
184 - 20
V$LHXF V$LHX3.01 0.81 (+) 1.000 0.928 tgaacaaaTTAAttcagttttta
6
184 - 20
V$NKX1 V$NKX12.01 0.87 (+) 1.000 0.905 tgaacaAATTaattcag
0
184 - 19
V$PAXH V$PAX6_HD.01 0.86 (-) 1.000 0.869 gaattAATTtgttca
8
V$HBOX V$EN1.01 0.77 185 - 20 (-) 0.826 0.773 aaactgaaTTAAtttgttc
 3
185 - 20
V$HOXF V$HOXB4.01 0.84 (-) 1.000 0.870 aaactgAATTaatttgttc
3
185 - 20
V$LHXF V$LHX3.02 0.82 (-) 1.000 0.910 ataaaaactgaatTAATttgttc
7
185 - 19
V$NKX6 V$NKX61.01 0.91 (-) 1.000 0.920 tgaaTTAAtttgttc
9
185 - 19
V$PAXH V$PAX6_HD.01 0.86 (+) 1.000 0.877 gaacaAATTaattca
9
185 - 20
V$PDX1 V$IPF1.01 0.84 (-) 1.000 0.846 aaactgaatTAATttgttc
3
186 - 20
V$BRNF V$TST1.02 0.79 (+) 1.000 0.900 aacaaaTTAAttcagtttt
4
186 - 20
V$HOMF V$BARX2.01 0.95 (+) 1.000 0.959 aacaaatTAATtcagtttt
4
186 - 20
V$PIT1 V$PIT1.02 0.81 (-) 1.000 0.892 ctgaaTTAAtttgtt
0
186 - 19
V$RBIT V$BRIGHT.01 0.92 (+) 1.000 0.943 aacaaATTAattc
8
187 - 20
V$BRNF V$BRN2.04 0.82 (-) 0.756 0.834 aaaaactGAATtaatttgt
5
187 - 20
V$HOMF V$LBX2.01 0.89 (-) 1.000 0.907 aaaaactgAATTaatttgt
5
187 - 20
V$PIT1 V$PIT1.02 0.81 (+) 1.000 0.894 acaaaTTAAttcagt
1
188 - 20
V$CART V$PROP1.01 0.84 (+) 1.000 0.871 caaattAATTcagtttttatg
8
188 - 20
V$HOXF V$HOXC4.01 0.84 (+) 1.000 0.871 caaattAATTcagttttta
6
188 - 20
V$NKX6 V$NKX61.01 0.91 (+) 1.000 0.913 caaaTTAAttcagtt
2
188 - 20
V$OCT1 V$OCT1.03 0.85 (-) 1.000 0.850 aaaactgaATTAatttg
4
189 - 20
V$RBIT V$BRIGHT.01 0.92 (-) 1.000 0.955 actgaATTAattt
1
193 - 20
V$MYBL V$VMYB.01 0.88 (-) 0.865 0.901 aaaAACTgaatta
5
196 - 21
V$CDXF V$CDX2.02 0.85 (+) 1.000 0.872 ttcagtttTTATgtcagtt
4
197 - 21
V$CREB V$CREB2.01 0.85 (-) 1.000 0.915 gagaacTGACataaaaactga
7
197 - 21
V$FKHD V$FHXB.01 0.83 (-) 1.000 0.835 actgacATAAaaactga
3
V$ABDB V$HOXA9.02 0.85 198 - 21 (-) 1.000 0.899 aactgacaTAAAaactg
 4
199 - 21
V$PARF V$TEF.01 0.85 (+) 0.818 0.887 agtttttatGTCAgttc
5
200 - 21
V$TALE V$TGIF.01 1.00 (+) 1.000 1.000 gtttttatGTCAgttct
6
216 - 22
V$CHRF V$CHR.01 0.92 (+) 1.000 0.929 tcatTTGAaggtc
8
225 - 23
V$IKRS V$IK1.01 0.92 (-) 1.000 0.946 tactGGGAagacc
7
225 - 24
V$STAT V$STAT6.01 0.84 (+) 1.000 0.852 ggtcTTCCcagtaacctac
3
234 - 25
V$P53F V$P53.03 0.92 (+) 0.921 0.922 agtaacctaccaaaaCAAGtctc
6
246 - 26
V$IRFF V$ISRE.01 0.81 (-) 0.750 0.819 aaaaaaaagaGAGActtgttt
6
283 - 29
V$BCDF V$CRX.01 0.94 (+) 1.000 0.984 gattcTAATcttcactc
9
283 - 29
V$EVI1 V$EVI1.01 0.72 (-) 1.000 0.726 gagtgAAGAttagaatc
9
304 - 32
V$CP2F V$CP2.02 0.84 (+) 0.750 0.841 aACTTctcaactctggcta
2
313 - 33
V$NF1F V$NF1.01 0.82 (+) 0.763 0.869 actCTGGctattttccaatta
3
313 - 33
V$NF1F V$NF1.01 0.82 (-) 1.000 0.855 taaTTGGaaaatagccagagt
3
318 - 33
V$CART V$S8.01 0.97 (-) 1.000 0.999 gagtaTAATtggaaaatagcc
8
318 - 32
V$HMTB V$MTBF.01 0.90 (+) 1.000 0.901 ggctATTTt
6
319 - 33
V$ATBF V$ATBF1.01 0.79 (+) 1.000 0.807 gctattttccAATTata
5
319 - 33
V$DLXF V$DLX2.01 0.92 (+) 1.000 0.945 gctattttccAATTatact
7
320 - 33
V$NKXH V$NKX25.02 0.88 (-) 1.000 0.882 gagtaTAATtggaaaatag
8
321 - 33
V$HBOX V$GSH2.01 0.95 (-) 1.000 0.961 ggagtaTAATtggaaaata
9
322 - 34
V$CLOX V$CDP.02 0.94 (+) 1.000 0.950 attttcCAATtatactcca
0
322 - 34
V$HOMF V$MSX.01 0.97 (-) 1.000 0.978 tggagtaTAATtggaaaat
0
323 - 34
V$CART V$ISX.01 0.85 (+) 1.000 0.870 ttttccAATTatactccaacc
3
V$DLXF V$DLX3.01 0.91 324 - 34 (-) 1.000 0.964 gttggagtaTAATtggaaa
 2
345 - 36
V$PARF V$VBP.01 0.86 (+) 1.000 0.885 ctaagccatGTAActct
1
359 - 37
V$SF1F V$FTF.01 0.94 (+) 1.000 0.941 tcttCAAGgtttt
1
367 - 38
V$FKHD V$HFH3.01 0.97 (-) 1.000 0.977 taaaaacAAACaaaaac
3
371 - 38
V$CABL V$CABL.01 0.97 (-) 1.000 0.973 aaAACAaacaa
1
373 - 38
V$FKHD V$FREAC2.01 0.84 (-) 1.000 0.843 cagttgTAAAaacaaac
9
375 - 39
V$ABDB V$HOXD12.01 0.80 (-) 1.000 0.860 agcagttgTAAAaacaa
1
375 - 39
V$BRN5 V$BRN5.03 0.76 (-) 1.000 0.820 tTAATgagcagttgtaaaaacaa
7
382 - 40
V$BRN5 V$BRN5.04 0.83 (+) 1.000 0.955 tacaactgctcATTAagacatcc
4
382 - 40
V$LHXF V$LHX6.01 0.84 (+) 0.776 0.848 tacaactgcTCATtaagacatcc
4
382 - 39
V$MYBL V$CMYB.01 0.90 (+) 1.000 0.916 taCAACtgctcat
4
383 - 40
V$HOXF V$HOXB3.01 0.84 (-) 1.000 0.881 tgtctTAATgagcagttgt
1
385 - 40
V$BRNF V$BRN3.03 0.83 (-) 1.000 0.857 gatgtctTAATgagcagtt
3
385 - 40
V$HBOX V$VAX2.01 0.85 (+) 1.000 0.874 aactgctcATTAagacatc
3
386 - 40
V$ABDB V$HOXC9.01 0.83 (+) 1.000 0.881 actgctcaTTAAgacat
2
386 - 40
V$HOXF V$HOXD3.01 0.85 (+) 0.799 0.856 actgctCATTaagacatcc
4
387 - 40
V$NKX6 V$NKX63.01 0.85 (-) 1.000 0.857 tgtctTAATgagcag
1
405 - 42
V$SNAP V$PSE.02 0.73 (+) 0.857 0.742 tacacCTTAgcaaaaagat
3
406 - 42
V$PERO V$PPARA.01 0.70 (+) 1.000 0.714 acaccttagcaaAAAGatcacac
8
417 - 42
V$GATA V$GATA3.02 0.91 (+) 1.000 0.944 aaaAGATcacaca
9
419 - 43
V$BRAC V$TBOX.01 0.93 (-) 1.000 0.933 tgaagaaatatGTGTgatctt
9
440 - 45
V$E2FF V$E2F.02 0.84 (-) 1.000 0.849 ctgtggctcCAAAgcat
6
V$PAX5 V$PAX5.03 0.80 446 - 47 (+) 0.894 0.835 tggagCCACagtcatgtactcaaaattta
 4
453 - 47
V$NKXH V$NKX29.01 0.81 (+) 1.000 0.825 acagtcatGTACtcaaaat
1
454 - 47
V$NKXH V$NKX29.01 0.81 (-) 1.000 0.831 aattttgaGTACatgactg
2
460 - 48
V$BRN5 V$BRN5.01 0.74 (+) 0.750 0.811 tgtactCAAAatttattttatct
2
465 - 47
V$MYT1 V$MYT1.01 0.75 (+) 0.750 0.800 tcaAAATttattt
7
467 - 48
V$EVI1 V$EVI1.03 0.79 (-) 0.750 0.897 gagatAAAAtaaatttt
3
471 - 48
V$ABDB V$HOXA9.02 0.85 (-) 1.000 0.858 agtagagaTAAAataaa
7
472 - 48
V$EVI1 V$EVI1.01 0.72 (-) 0.764 0.750 gagtaGAGAtaaaataa
8
473 - 48
V$GATA V$GATA3.01 0.91 (-) 1.000 0.991 tagaGATAaaata
5
480 - 49
V$EGRF V$WT1.01 0.92 (-) 1.000 0.932 aagggTGGGagtagaga
6
482 - 49
V$EGRF V$NGFIC.01 0.80 (-) 0.754 0.812 ggaaGGGTgggagtaga
8
482 - 50
V$ZBPF V$ZNF202.01 0.73 (+) 1.000 0.765 tctactCCCAcccttcctccacc
4
486 - 50
V$ETSF V$PEA3.01 0.94 (-) 1.000 0.955 tgggtggAGGAagggtgggag
6
499 - 51
V$NKXH V$NKX31.01 0.84 (-) 1.000 0.841 aaggatAAGTttgggtgga
7
502 - 51
V$MYT1 V$MYT1.02 0.88 (-) 1.000 0.887 gatAAGTttgggt
4
506 - 51
V$GATA V$GATA.01 0.93 (-) 1.000 0.935 caagGATAagttt
8
518 - 53
V$CART V$PHOX2.01 0.87 (-) 1.000 0.893 agcacTAATcagtgaaaaccc
8
519 - 54
V$BRN5 V$BRN5.04 0.83 (+) 1.000 0.848 ggttttcactgATTAgtgctttc
1
519 - 54
V$LHXF V$LHX6.01 0.84 (+) 0.817 0.892 ggttttcacTGATtagtgctttc
1
519 - 53
V$PDX1 V$IPF1.01 0.84 (+) 0.764 0.843 ggttttcacTGATtagtgc
7
520 - 53
V$HOXF V$HOXB3.01 0.84 (-) 1.000 0.877 agcacTAATcagtgaaaac
8
520 - 54
V$LHXF V$LHX6.01 0.84 (-) 1.000 0.899 tgaaagcacTAATcagtgaaaac
2
V$HBOX V$GSH2.01 0.95 521 - 53 (-) 1.000 0.950 aagcacTAATcagtgaaaa
 9
521 - 53
V$PAX6 V$PAX6.04 0.83 (+) 0.833 0.893 tttTCACtgattagtgctt
9
522 - 53
V$BCDF V$CRX.01 0.94 (-) 1.000 0.940 agcacTAATcagtgaaa
8
522 - 54
V$HBOX V$EVX1.01 0.84 (+) 1.000 0.884 tttcactgATTAgtgcttt
0
523 - 54
V$CART V$RHOX6.01 0.84 (+) 0.768 0.862 ttcacTGATtagtgctttcaa
3
523 - 54
V$HOXF V$HOXB3.01 0.84 (+) 0.794 0.857 ttcacTGATtagtgctttc
1
537 - 55
V$PAX6 V$PAX6.01 0.75 (+) 0.773 0.782 ctttcAAGCctgcctgcct
5
537 - 54
V$PAX8 V$PAX8.01 0.88 (+) 1.000 0.964 cttTCAAgcctgc
9
538 - 55
V$PAX6 V$PAX4_PD.01 0.91 (-) 0.965 0.911 aagGCAGgcaggcttgaaa
6
557 - 57
V$CREB V$TAXCREB.02 0.71 (+) 0.750 0.718 agttcaTGAAgctcctcctct
7
578 - 58
V$RU49 V$RU49.01 0.98 (-) 1.000 0.994 cAGTAcc
4
581 - 59
V$HOMF V$HMX2.02 0.82 (+) 1.000 0.838 actgggatAAACatttgta
9
582 - 59
V$FKHD V$FREAC7.01 0.96 (+) 1.000 0.960 ctgggaTAAAcatttgt
8
586 - 60
V$HOMF V$HMX2.02 0.82 (-) 0.750 0.846 agtaatacAAATgtttatc
4
587 - 60
V$OCT1 V$OCT2.01 0.80 (-) 0.757 0.826 gtaATACaaatgtttat
3
588 - 60
V$RP58 V$RP58.01 0.84 (+) 0.752 0.846 taaaCATTtgtat
0
590 - 60
V$SATB V$SATB1.01 0.94 (-) 1.000 0.941 agtAATAcaaatgtt
4
594 - 61
V$BRNF V$TST1.01 0.90 (+) 1.000 0.902 tttgtATTActattttaaa
2
596 - 61
V$MEF2 V$SL1.01 0.84 (+) 1.000 0.859 tgtattaCTATtttaaaggctat
8
602 - 62
V$BRN5 V$BRN5.03 0.76 (-) 1.000 0.766 gTAATgatagcctttaaaatagt
4
602 - 62
V$BRNF V$BRN2.01 0.86 (+) 0.966 0.890 acTATTttaaaggctatca
0
603 - 62
V$KLFS V$GKLF.02 0.96 (+) 1.000 0.969 ctattttAAAGgctatcat
1
V$MEF2 V$SL1.01 0.84 608 - 63 (+) 1.000 0.865 ttaaaggCTATcattactcttta
 0
609 - 62
V$PDX1 V$PDX1.01 0.74 (+) 0.782 0.822 taaaggctaTCATtactct
7
609 - 62
V$SIXF V$SIX1.01 0.84 (+) 1.000 0.903 taaaggcTATCatta
3
613 - 63
V$HOXF V$HOXC8.01 0.85 (+) 1.000 0.855 ggctatcATTActctttat
1
615 - 63
V$HBOX V$GSH1.01 0.85 (-) 1.000 0.857 agataaagagTAATgatag
3
624 - 63
V$GATA V$GATA.01 0.93 (-) 1.000 0.981 cacaGATAaagag
6
629 - 64
V$PAX6 V$PAX6.03 0.76 (-) 0.838 0.767 gttctACTCttcacagata
7
631 - 64
V$DICE V$DICE.01 0.80 (-) 1.000 0.835 tctaCTCTtcacaga
5
632 - 64
V$EVI1 V$EVI1.01 0.72 (+) 1.000 0.720 ctgtgAAGAgtagaaca
8
632 - 64
V$PAX8 V$PAX8.01 0.88 (+) 0.900 0.883 ctgTGAAgagtag
4
641 - 65
V$GREF V$ARE.02 0.89 (-) 1.000 0.955 agatttcttcatGTTCtac
9
645 - 65
V$CEBP V$CEBPB.01 0.94 (+) 1.000 0.945 aacatgaaGAAAtct
9
654 - 66
V$MYT1 V$MYT1.01 0.75 (-) 1.000 0.756 ataAAGTagattt
6
657 - 67
V$OCT1 V$POU3F3.01 0.81 (-) 0.783 0.811 tatctGAATaaagtaga
3
680 - 69
V$BCL6 V$BCL6.01 0.76 (+) 1.000 0.800 ataTTCCtaaagattag
6
680 - 70
V$CART V$PHOX2.01 0.87 (-) 1.000 0.876 atctcTAATctttaggaatat
0
682 - 70
V$RXRF V$RXR_RXR.01 0.78 (+) 0.888 0.795 attcctaaagattagaGATCatttc
6
684 - 70
V$BCDF V$CRX.01 0.94 (-) 1.000 0.945 atctcTAATctttagga
0
687 - 69
V$GATA V$GATA3.02 0.91 (+) 1.000 0.927 taaAGATtagaga
9
696 - 71
V$IRFF V$IRF7.01 0.86 (-) 0.936 0.886 agaaGAATgagaaatgatctc
6
703 - 71
V$SORY V$HBP1.01 0.86 (-) 1.000 0.899 cctagaagAATGagaaa
9
708 - 72
V$BCL6 V$BCL6.02 0.77 (-) 1.000 0.793 gtactccTAGAagaatg
4
V$NKXH V$NKX31.02 0.81 713 - 73 (+) 1.000 0.849 ttctaggaGTACttacttc
 1
714 - 73
V$NKXH V$NKX31.01 0.84 (-) 1.000 0.892 tgaagtAAGTactcctaga
2
718 - 73
V$CREB V$E4BP4.01 0.80 (-) 1.000 0.817 gcttcctgaaGTAAgtactcc
8
720 - 72
V$RU49 V$RU49.01 0.98 (-) 1.000 0.988 aAGTAct
6
721 - 74
V$HEAT V$HSF1.01 0.84 (+) 0.952 0.869 gtacttacttcaGGAAgcatccaga
5
721 - 73
V$PARF V$VBP.01 0.86 (-) 1.000 0.866 cttcctgaaGTAAgtac
7
725 - 74
V$ETSF V$ELF2.01 0.90 (+) 1.000 0.942 ttacttcaGGAAgcatccaga
5
728 - 74
V$CP2F V$TCFCP2L1.01 0.87 (-) 1.000 0.881 atCTGGatgcttcctgaag
6
736 - 75
V$PERO V$PPAR_RXR.01 0.76 (+) 1.000 0.793 agcatccagataaaAGGTaaggc
8
737 - 76
V$NR2F V$TR4.01 0.72 (+) 1.000 0.763 gcatccagataaaAGGTaaggcaca
1
740 - 75
V$GATA V$GATA.01 0.93 (+) 1.000 0.981 tccaGATAaaagg
2
294 matches found in this sequence.