Structura chimic a acizilor nucleici

AND acid dezoxiribonucleic ARN acid ribonucleic

Acizii nucleici sunt substane macromoleculare alctuite din uniti structurale care se repet nucleotide

baze purinice baz azotat Nucleotida baze pirimidinice

zahr (pentoz)

riboza n ARN dezoxiriboza n ADN

radical fosforic

Baze purinice derivai de la purin

NH2 N N
N N
Purina

N N H

N N H

Adenina (A) (6 aminopurina)

OH N H2 N N N N H

Guanina (G) (hidroxiaminopurina)

Baze pirimidinice derivai de la pirimidin

NH2 N
N HO N OH CH3

N N Pirimidina

HO N Citozin (C)

Timin (T)

OH N HO N Uracil (U)

Zaharul
HO CH2 C H H C OH OH C H

O H C OH

HO CH2 C H H C OH

O H C H

OH C H

Riboza

Dezoxiriboza

Tautomeria este capacitatea unor substane de a se afla n forme diferite (izomeri de poziie) datorit legturilor chimice conjugate pe care le conin.
NH2 N N N N H HN N NH N N H

OH N H2N N N N H HN HN

O N N H N H

Nucleotida

PO4

Baza azotat

Zahr

OH OH P OH HO CH2 C H H C OH O O

NH2 N N H OH H C C H H N N
OH

OH P O CH2 C H H C OH O O

NH2 N N H C C H H N N

2H 2O

NH OH OH P OH HO CH2 C H H C OH O O N H OH H C C H OH NH O
2 H2O

OH OH P O CH2 C H H C OH O O

NH NH N H C C H OH O

Nucleotidele se leag ntre ele prin intermediul radicalului fosforic formnd catene

Nucleotidele se leag ntre ele prin intermediul radicalului fosforic formnd catene
O OH P O O CH2 C H H C O OH P O O O N H C C H H NH NH O

O OH P O O CH2 C H H C O OH P O O CH2 C H H C O O O

NH NH N H C C H H N N H C C H H N NH NH O

Structura primar a acizilor nucleici

Este o structur monocatenar rezultat n urma polimerizrii nucleotidelor; Caracteristica unei structuri primare este dat de ordinea nucleotidelor

H HO P O O CH2 O N N

N A N

H N

3'
O HO P O O CH2 O N N O G N NH N H H N C O N H N H O H

O HO P O O CH2

O HO P O H 3C

O T O N N H O

5'

O CH2

Structura secundar a ADN

A fost stabilit n 1953 de J.D. Watson, F.H.C. Crick i M.H.F. Wilkins (premiul Nobel pentru medicin i fiziologie n 1962) molecula de ADN este format din dou catene, complementare, antiparalele, care formeaz un dublu helix (spiral dubl)

H N N

H N H O
T

O N N CH3

H O N N N N H N H
G C

N N

O H

Tipuri de ADN

Tipul A este ntlnit n cazul unor concentraii saline mari i n cazul unor deshidratri pariale; este prezent la hibrizii ADN-ARN precum i n poriunile bicatenare ale ARN. Tipul B reprezint structura general a macromoleculei de ADN n regiunile active metabolic (tipul clasic). Tipul Z este singurul tip cu rsucire spre stnga, ntlnit in vitro.

Denaturarea ADN

Prin nclzire sau prin meninerea la o concentraie ridicat de sruri, legturile de hidrogen dintre cele dou catene se desfac. Procesul se numete denaturare, rezultnd ADN denaturat (monocatenar). Dac soluia este rcit brusc, cele dou catene nu se mai reunesc (nu se mai refac punile de hidrogen). Dac soluia se rcete lent, punile de hidrogen se refac i catenele se reasociaz, rezultnd ADN renaturat. Se pot obine hibrizi ADN-ARN sau ADN-ADN cu catene provenind de la specii diferite.

Tipuri de ARN

ARN viral (ARN-v) este material genetic (genom viral) la ribovirusuri: VMT, virusul gripal etc. ARN nuclear mic(ARN-nm sau ARN-sn) formeaz ribonucleoproteine, avnd rol n iniierea sintezei proteice i n maturarea ARN-m

ARN mesager (ARN-m) copiaz informaia genetic a unei catene de ADN i o transfer n citoplasm, unde se desfoar sinteza proteinelor. Este sintetizat n procesul de transcripie, cu ajutorul enzimei ARN polimeraza, proces care reprezint prima etap a sintezei proteice. ARN de transport sau ARN solubil (ARN-t, ARN-s) are rolul de a transporta aminoacizii la locul sintezei proteice (pe ribozomi), n procesul de translaie a informaiei genetice, cea de-a doua etap a sintezei proteice.

locul de ataare al aminoacidului

puni de hidrogen bucla D bucla TC

anticodon A U U A A U codon

ARN-m

ARN ribozomal (ARN-r) intr n alctuirea ribozomilor, unde este asociat cu proteinele. Ribozomii sunt particule ribonucleoproteice de form relativ sferic, prezente la procariote i eucariote. Se gsesc i n mitocondrii i cloroplaste, organite celulare de origine endosimbiont. Unitatea ribozomal prezint trei locusuri (regiuni): A,P i Ex.

Locusul A (aminoacil) este locul unde se ataeaz iniial molecula de aminoacid. Locusul P (polipetid) este locul unde are loc formarea unei legturi dipeptidice ntre doi aminoacizi alturai. Locusul Ex (exit) este locul unde catena polipeptidic sintetizat se desprinde de ribozom.

Funcia autocatalitic a ADN

Const n procesul de replicare a materialului genetic (biosinteza); Are loc n faza S a ciclului celular; n prima faz are loc sinteza nucleotidelor, urmat de polimerizarea acestora; Replicarea ADN se realizeaz dup modelul semiconservativ; Conform acestui model, iniial are loc ruperea punilor de hidrogen, rezultnd ADN monocatenar; Ulterior fiecare caten veche servete drept model pentru sinteza unei catene noi; Vor rezulta dou molecule de ADN, fiecare avnd o caten veche i o caten nou sintetizat;

Funcia heterocatalitic a ADN

ADN

ARN

Proteine

Funcia heterocatalitic a materialului genetic arat circuitul informaiei genetice n celul.

ADN

ARN-m

Informaia genetic

Informaia genetic

Proteine

Prima etap transcripia are loc n nucleu. Informaia genetic din ADN este transcris ntr-o secven complementar de ARN-m. A doua etap translaia are loc n citoplasm. Informaia genetic din ARN este utilizat pentru sinteza unei catene proteice. Excepie retrovirusurile care au material genetic ARN pe care l convertesc n ADN cu ajutorul enzimei revers-transcriptaza, care transcrie informaia genetic invers, de la ARN-v la ADN. Ex. HIV

ADN din nucleu conine gene ce codific proteine specifice Prin transcripie informaia genetic din aceste gene este copiat n ARN-m

Gena Transcripia ARN-m ARN-m precursor Maturare ARN-m matur ADN ADN

Se sintetizeaz o molecul de ARN-m precursor ARN-m precursor sufer un proces de maturare i ARN-m matur este transferat n citoplasm La nivelul ribozomilor are loc decodificarea informaiei genetice din ARN-m i se sintetizeaz o caten proteic

Translaia

ARN-m ribizom proteine

Codul genetic - legtura care se stabilete ntre acizii nucleici i proteine.

Este alctuit din uniti de codificare numite codoni. Codonul este o secven de 3 nucleotide din molecula de ARN-m care determin introducerea unui aminoacid n catena proteic. Codul genetic este alctuit din 64 codoni, reprezentnd combinaii de cte 3 ale celor 4 tipuri de nucleotide.

A treia nucleotid

A doua nucleotid

Prima nucleotid

Caracteristicile codului genetic

Colinearitatea reprezint corespondena dintre secvena nucleotidelor din molecula de ADN sau ARN-m i secvena aminoacizilor din catena proteic. Codul genetic este nesuprapus ntre doi codoni vecini nu sunt nucleotide comune. Codul genetic este fr virgule ntre doi codoni vecini nu sunt nucleotide libere. Codul genetic este degenerat adic un aminoacid poate fi codificat de doi sau mai muli codoni.

Codul genetic este universal i are origine foarte veche aceiai codoni determin introducerea aceluiai aminoacid la organisme diferite, cu vechime filogenetic diferit. Codul genetic a evoluat n timp, dovad fiind unele excepii de la codul genetic ntlnite la organisme foarte vechi sau la codul genetic de la mitocondrii. Aceste excepii se refer la codonii stop, care iniial au avut rol n determinismul unor aminoacizi.

Biosinteza proteinelor

Transcripia informaiei genetice const n transferul informaiei genetice din secvena de nucleotide a unei catene de ADN (3'-5') ntr-o molecul de ARN-m. Se realizeaz cu ajutorul enzimei ARN-polimeraza. Unitatea de transcripie este o poriune din molecula de acid nucleic care conine informaia genetic pentru sinteza unei molecule de ARN-m, fiind diferit la eucariote i procariote

La procariote o unitate de transcripie conine mai multe gene, (operon), fiind implicat n sinteza mai multor catene polipeptidice. La eucariote o unitate de transcripie conine informaia genetic a unei singure gene, fiind implicat n sinteza unei singure catene polipeptidice. Gena la eucariote conine secvene informaionale numite exoni i secvene noninformaionale numite introni.

n urma procesului de transcripie la eucariote se formeaz ARN-m precursor, care conine att introni ct i exoni. Procesul de maturare a ARN-m se realizeaz n nucleu i const n eliminarea intronilor i asamblarea exonilor cu ajutorul unor enzime (endonucleaze i ligaze)

Translaia informaiei genetice const n transferul informaiei genetice din secvena de nucleotide a ARN-m n secvena de aminoacizi din catena polipeptidic. Mesajul genetic este tradus dintr-o secven de nucleotide ntr-o secven de aminoacizi. Translaia se desfoar n citoplasm, la nivelul ribozomilor;

ADN din nucleu conine gene ce codific proteine specifice Prin transcripie informaia genetic din aceste gene este copiat n ARN-m

Gena Transcripia ARN-m ARN-m precursor Maturare ARN-m matur ADN ADN

Se sintetizeaz o molecul de ARN-m precursor ARN-m precursor sufer un proces de maturare i ARN-m matur este transferat n citoplasm La nivelul ribozomilor are loc decodificarea informaiei genetice din ARN-m i se sintetizeaz o caten proteic

Translaia

ARN-m ribozom proteine

Subunitate mic Locusul de ataare al ARN-m

Subunitate mic

ARN-m

P
Subunitate mare Locusul P leag ARN-t care transport catena polipeptidic

A
Subunitate mare

Locusul A leag ARN-t care transport urmtorul aminoacid

Iniierea
5' ARN-m Ribozomul recunoate secvena 3' codon start anticodon 5' Locusul P 3' Locusul A

Subunitatea mic a ribozomului recunoate codonul start (AUG) din secvena de ARN-m iar ARN-t care transport aminoacidul metionin se altur cu anticodonul, completnd complexul de iniiere.

Subunitatea mare a ribozomului se altur complexului de iniiere, ARN-t care transport aminoacidul metionin ocupnd locusul P.

Elongarea

Locusul P

Locusul A

Anticodon

ARN-t

Se formeaz legatura peptidic: Pro se leag de Met

Se formeaz o nou legtur peptidic: Tyr se leag de Pro i alungete catena peptidic.

Recunoaterea codonului

Elongare

Recunoaterea codonului

Elongare

ntrerupere
5'
ARN-t

subunitatea mic

subunitatea mic

3'

5'

3'
ARN-m

ARN-t

Factorul de eliberare se altur complexului cnd codonul stop ajunge n locusul A

polipeptid

subunitatea mare

Factorul de eliberare desprinde catena polipeptidic de ARN-t din locusul Exit

Componentele rmase se separ

http://www.youtube.com/watch?v=D5vH4Q_tAkY&feature=related

Modificri post-translaionale

n urma sintezei proteice rezult o caten polipeptidic, n care aminoacizii se afl ntr-o succesiune caracteristic ce formeaz structura primar, de obicei inactiv. Catenele polipeptidice se pot rsuci sau plia formnd structura secundar; Forma tridimensional a polipeptidelor rsucite sau pliate constituie structura teriar; Relaiile structurale dintre catenele polipeptidice componente ale unei proteine formeaz structura cuaternar;

Pentru a deveni activ catena polipeptidic poate fi modificat astfel: Fosforilarea enzimatic implic adugarea uneia sau mai multor grupri fosfat; Glicozilarea enzimatic adugarea uneia sau mai multor grupri carbohidrat; Digestia parial sub aciunea unor peptidaze

Ex. n celulele ale pancreasului endocrin, n urma sintezei proteice rezult pre-proinsulina. Conversia acesteia n insulin activ se realizeaz n dou etape: n prima etap are loc eliminarea secvenei semnal, situat la captul catenei B, rezultnd proinsulina alctuit din trei catene polipeptidice (A,B i C); n a doua etap are loc eliminarea peptidei C i formarea a dou legturi disulfurice intercatenare, rezultnd insulina activ, alctuit din 51 aminoacizi.

secvena semnal

preprosinsulina

secvena semnal

proinsulina

peptida

insulina

ADN

nucleu
ARNm precursor

controlul transcripiei

ARNm matur

controlul maturrii ARNm

citoplasma

ARNm matur controlul stabilitii ARNm controlul translaiei

controlul transportului ARNm

ARNm inactiv

ribozom

controlul modificrilor posttranslaionale proteina activ