VRSTE I FUNKCIJE RNK

iRNK - informacija za sintezu proteina rRNK - strukturne i funkcionalne komponente ribozoma tRNK prevodioci u procesu translacije (adapteri) adapteri)

ema prenosa informacije sa DNK na RNK i protein

Struktura iRNK prokariota i eukariota

PROKARIOTE (policistronske i monocistronske iRNK) iRNK)
ajn-Dalgarnov niz ajn-Dalgarnov niz ajn-Dalgarnov niz

5eoni niz
START

- 3
Kodirajui niz eoni niz
STOP START

Kodirajui niz

eoni niz
STOP START

EUKARIOTE (monocistronske iRNK) iRNK) 5eoni niz 5 kapa

START

EUKARIOTE
Kodirajui niz
STOP

- 3
poli-A rep

Struktura iRNK prokariota i eukariota

Transportne RNK (tRNK)

Primarna struktura tRNK: 70 - 90 nukleotida (prose (proseno 80) Promenljivi, polupromenljivi i nepromenljivi regioni Modifikovane baze (" ("neobi neobine baze" baze")

Sekundarna struktura tRNK

Tercijerna struktura tRNK

D krak

T krak

AKTIVACIJA AMINO KISELINA

AK dobija energiju za formiranje peptidne veze

tRNK zaduena za mesto amino kiseline u proteinu Ribozom ne uestvuje u prepoznavanju

Biohemijski dokaz: modifikacija CysCys-tRNKCys tRNKCys AlaAla-tRNKCys ugrauje se Ala na kodon za Cys Geneti Genetiki dokaz: tRNK sa mutacijom u antikodonu ugrauje AK na pogre pogrean kodon

Jedna aminoacilaminoacil-tRNK sintetaza: prepoznaje jednu amino kiselinu i sve izoakceptorske tRNK
Mesta specifi specifinog prepoznavanja:

Akceptorski krak

Akceptorski krak Dr Drka D kraka

D drka

Antikodonska dr drka

Proofreading mehanizam
Antikodonski krak

Interakcija kodonkodon-antikodon

- Zasniva se na sparivanju komplementarnih baza -tRNKPhe kvasca sa antikodonom GmAA prepoznaje kodone UUC i UUU - tRNKAla kvasca sa antikodonom IGC prepoznaje kodone GCU, GCC i GCA

Interakcije Interakcije kodonkodon-antikodon

Krikova hipoteza o kolebljivosti interakcije kodon-antikodon

IZROENOST

Interakcija kodonkodon-antikodon
Kolebanje prve baze antikodona

Prvi nukleotid antikodona C A U G I

Trei nukleotid kodona G U A ili G C ili U U, C ili A

(35)

GRAA RIBOZOMA PROKARIOTA

(21)

GRAA RIBOZOMA EUKARIOTA

(49) 60S

(33) 40S

80S

SEKUNDARNA STRUKTURA 16S rRNK

II

III

I
IV

SEKUNDARNA STRUKTURA 5S rRNK

PROTEINI RIBOZOMA

Ulaze u sastav ribozoma

1. STRUKTURNI PROTEINI RIBOZOMA 2. SLABO VEZANI PROTEINI RIBOZOMA 3. USLOVNO RIBOZOMSKI PROTEINI

GRAA GRAA RIBOZOMA

REKONSTRUKCIJA REKONSTRUKCIJA RIBOZOMA IN VITRO 50S

CsCI

30S

- subjedinice 70S prokariotskog ribozoma

CsCI

42S jezgro + proteini

23S jezgro + proteini

Jezgro: rRNK i strukturni proteini

Funkcije ribozomalnih proteina

ARHITEKTURA RIBOZOMA
Oblik, veliina i topografija pojedinanih komponenti (EM, difrakcijom X-zraka)

Lokalizacija funkcionalnih centara ribozoma (vezivanje iRNK, tRNK, tRNK, faktora translacije, peptidil transferaze)

BIOSINTEZA RIBOZOMA

16S rRNK promotor

tRNK

23S rRNK

5S rRNK

tRNK

RASPORED GENA ZA rRNK U BAKTERIJSKOM GENOMU

Primarni transkript 30S iseca ribonukleaza III na pojedina pojedinane rRNK za koje se vezuju rr-proteini

RASPORED GENA ZA rRNK U EUKARIOTSKOM GENOMU

18S rRNK

5.8S rRNK

28S rRNK spolja poljanji grani graninik

18S rRNK

spolja poljanji grani graninik

unutra unutranji grani graninici

Primarni transkript 45S vezivanje rr-proteina prekursor 80S endonukleaze isecaju na 65S i 55S prek prekursore subjedinica koji sadr sadre prekursorske rRNK 20S (18S rRNK) i 32S (28S i 5.8S rRNK)

Sinteza rRNK eukariota

BIOSINTEZA RIBOZOMA EUKARIOTA