METABOLISME Tema 8

Cicle dels cids tricarboxlics

Bioqumica

1. 2. 3. 4. 5. 6.

Introducci Acetil CoA Piruvat deshidrogenasa Reaccions del cicle Energtica i regulaci Carcter amfiblic

Bioqumica

1. Introducci

Cicle del cids tricarboxlics (TCA) Cicle de lcid ctric (CAC) Cicle de Krebs

Hans KrebsNobel 1953

The Central Relationship of the Citric Acid Cycle to Catabolism

2. Acetil CoA

Bioqumica

(CoA-SH)

- El CoA (coenzim acil) s un dinucleotid i incorpora una vitamina hidrosoluble (lcid pantotnic) i una -mercaptoetilamina reactiva, pel grup tiol, en la seva estructura - A diferncia de lNAD+ i del FAD, el coenzim A no s un portador delectrons sin un portador de grups acil (els transporta com esters tiol)
Lacil suneix al CoA per un enlla tioester ric en energia (G dhidrlisi elevada i negativa)

Oxidaci de biomolcules glicogen glicogenlisi glucosa gliclisi piruvat descarboxilaci oxidativa cossos cetnics cids grassos CO2 Lacetil-CoA s un intermediari crulla del metabolisme i del cicle de lcid ctric triacilglicerols liplisi cids grassos protenes protelisi aminocids

-oxidaci
desaminaci i oxidaci

acetil CoA cicle de lcid ctric

colesterol

Acetil CoA El piruvat, un cop transportat dins la mitocondria, per un transportador piruvat/H+, s convertit en acetil-CoA per la piruvat deshidrogenasa - un complex multienzimtic

glicogen glicogenlisi glucosa gliclisi piruvat descarboxilaci oxidativa cossos cetnics cids grassos

triacilglicerols liplisi cids grassos B-oxidaci

protenes protelisi aminocids

desaminaci i oxidaci

acetil CoA cicle de lcid ctric

colesterol

CO2

3. Piruvat Deshidrogenasa

- Complex multienzimtic en la matriu mitocondrial - consisteix de 3 enzims diferents - piruvat deshidrogenasa (E1) - dihidrolipoamida transacetilasa (E2) - dihidrolipoamida deshidrogenasa (E3)

- Requereix 5 coenzims Pirofosfat de tiamina (TPP), flavin adenin dinucleotid (FAD), nicotinamida adenina dinucleotid (NAD+), coenzim A (CoA), i lipoat - Catalitza la descarboxilaci oxidativa irreversible del piruvat per produir acetil CoA amb un Go = -33.4 kJ/mol

pyruvate + CoASH + NAD+ acetyl-CoA + CO2 + NADH + H+

Bioqumica

Piruvat Deshidrogenasa

Pyruvate Dehydrogenase Complex is 50 nm, MW = 7,000,000, present in mitochondrial matrix

Piruvat Deshidrogenasa

- La piruvat deshidrogenasa de cor de bou t: 30 dE1, 60 dE2 i 6 dE3

Piruvat Deshidrogenasa

Coenzims
- Pirofosfat de tiamina (TPP) - flavin adenin dinucleotid (FAD) - nicotinamida adenina dinucleotid (NAD+), - coenzim A (CoA) - lipoat calen 4 vitamines diferents en la nutrici humana que sn components vitals per a aquest complex: - tiamina (vitamina B1) per a TPP - riboflavina per a FAD - niacina per a NAD - pantotenat per a CoA

Piruvat Deshidrogenasa

Coenzims: TPP
Decarboxylation of pyruvate in pyruvate dehydrogenase H3C C R S N+ R
H Enyz

pyruvate
O CH3 R S N+ R C OH COO-

S N+ R

COO-

Thiamine pyrophosphate (B1)

electron sink

Piruvat Deshidrogenasa

Coenzims: TPP

(Descarboxilaci no oxidativa)

Piruvat Deshidrogenasa

Coenzims: Lipoamida

La part aldehid activa es transfereix del TPP la lipoamida alhora que soxida generant-se un grup acil (mentres que la lipoamida es redueix)

Piruvat Deshidrogenasa

Coenzims: Coenzim A (CoA-SH)

-mercaptoetilamina cid pantotnic Adenosina 3-fosfat 5-difosfat

Grup funcional

Piruvat Deshidrogenasa

Coenzims: de flavina -FAD i FMN -Deriven de la vitamina B2 o riboflavina -Participen en reaccions doxido-reducci -Els enzims amb un coenzim de flavina sanomenen flavoprotenes

Piruvat Deshidrogenasa: reaccions

Pyruvate decarboxylation
Carbanion of thiamine pyrophosphate (TPP) attacks carbonyl carbon, resulting in decarboxylation catalyzed by pyruvate DHase component E1

Piruvat Deshidrogenasa

Oxidation Step
Hydroxyethyl group oxidized, lipoamide reduced by pyruvate DHase component E1 Dihydrolipoyl transacetylase (E2) transfers acetyl group to coenzyme A Dihydrolipoyl DHase (E3) oxidizes dihydrolipoamide, & reduces FAD, which reduces NAD+

Piruvat Deshidrogenasa

Seqncia de reaccions de la piruvat deshidrogenasa

http://www.wiley.com/legacy/college/boyer/0470003790/animations/animations.htm

Piruvat Deshidrogenasa

Reacci global de la piruvat deshidrogenasa

4. Reaccions del cicle (CAC)

- Via final comuna per a loxidaci de molcules aminocids, cids grassos, carbohidrats - T lloc en la matriu mitocondrial - Opera noms en condicions aerbiques - Important per produir energia - Important per subministrar intermediaris per a biosntesi

Bioqumica

CAC: etapes enzimtiques

Reacci 1 del CAC

Reacci molt exergnica i punt de regulaci de la ruta

CAC: etapes enzimtiques

Reacci 2 del CAC

El citrat es transforma en un isomer ms fcil doxidar (isomeritzaci reversible)

Reacci estereoespecfica

CAC: etapes enzimtiques

Reacci 2 del CAC

Molcula proquiral: molcula simtrica que es fa assimtrica desprs dunir-se a la superficie assimtrica dun enzim

Citrat

Alexander Ogston va indicar que si lenzim sunia al sustrat en 3 punts o ms, el lloc de fixaci era assimtric i noms podia unir el sustrat en una sola direcci

CAC: etapes enzimtiques

Reacci 2 del CAC

CAC: etapes enzimtiques

Reacci 3 del CAC

descarboxilaci oxidativa

CAC: etapes enzimtiques

Reacci 4 del CAC

descarboxilaci oxidativa
En aquest punt han entrat 2C com Acil CoA i nhan sortit 2 com CO2 La resta del cicle ser per regenerar el substrat encebador

CAC: etapes enzimtiques

Reacci 5 del CAC

CAC: etapes enzimtiques

Reacci 6 del CAC

CAC: etapes enzimtiques

Reacci 7 del CAC

CAC: etapes enzimtiques

Reacci 7 del CAC

CAC: etapes enzimtiques

Reacci 8 del CAC

5.Energtica i regulaci

Bioqumica

CAC

N de C de les diferents molcules del CAC

Lessncia del CAC s la uni dels dos carbonis activats de lacetil CoA a un substrat de 4 C (OAA) per formar una molcula de 6C (citrat). Les reaccions posteriors oxiden 2C a CO2 i regeneren el substrat del cicle

El dest del C en el cicle de lcid ctric

CAC

Productes del cicle de lcid ctric

Estequiometria global:
3NAD + 1FAD + GDP + acetil- CoA + Pi ____ 3NADH +FADH2 +GTP + CoA + 2CO2

Oxidation of Pyruvate Forms CO2 and ATP

Enzims del cicle de lcid ctric

Energia lliure (kJ/mol) Enzim 1 citrat sintasa irreversible Go -32.2 +13.3 G -53.9 +0.8

aconitasa 2 a,b de citrat a isocitrat 3 4 isocitrat deshidrogenasa complex-cetoglutarat deshidrogenasa irreversible succinil CoA sintetasa succinat deshidrogenasa fumarasa malat deshidrogenasa

-20,9

-17.5 -43.9

-33.5

5 6 7 8

-2.9 +0.4 -3.8 +29.7

0 0 0 0

Regulaci del CAC

-Sensible a la disponibilitat de substrats i als nivells relatius dels productes: [NAD+]/[NADH] i crrega energtica cellular -Modulat per efectors allostrics i processos de modificaci covalent reversible dels enzims

Regulaci del CAC

Control de la oxidaci del piruvat

Regulaci segons la crrega energtica (ATP i AMP, efectors allostrics); segons [NAD+]/[NADH] i relaci CoA lliure o acetilat. Regulaci mitjanant modificaci covalent (E1)

Reflexa la relaci [ATP]/[ADP]

Carcter amfiblic del CAC

Rutes anaplertiques

CAC: carcter amfiblic

Summary of Anabolism in the Citric Acid Cycle