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1.1
1.2
Base de datos
La base de datos para este ejemplo se encuentra en la pgina:
http://www.udl.es/usuaris/q3695988/WebCursPrimer/
En dicha pgina, seleccionar la opcin Casos Prcticos en la barra izquierda. Una vez
en Casos prcticos, seleccionar la base de datos del ejemplo: Factores implicados en
la evolucin a ciertas intervenciones quirrgicas.
1.3
1.4
1 Hombre, 2 Mujer
Indice de masa corporal
+, ++, +++
1 Programado, 2 Urgencia
+, ++, +++
Objetivos
Realizar una descriptiva completa del conjunto de datos, justificando en cada caso
el mtodo elegido
Estimar el rango de normalidad de los metabolitos incluidos en este estudio en
funcin de la evolucin de los pacientes. Evaluar la posibilidad de utilizar alguno de
estos metabolitos como pronstico de evolucin.
Determinar si la evolucin est relacionada con la gravedad al ingreso. Qu
factores pueden influenciar esta relacin?
Comparar las concentraciones de los metabolitos entre hombres y mujeres.
Estudiar la relacin entre los niveles de los metabolitos y la evolucin
-1-
Anlisis
2.1
2.1.1
-2-
+
GRAVEDAD
+
++
+++
Total
Recuento
% de GRAVEDAD
Recuento
% de GRAVEDAD
Recuento
% de GRAVEDAD
Recuento
% de GRAVEDAD
12
22,6%
12
27,3%
41
51,9%
65
36,9%
EVOLUCIO
++
23
43,4%
25
56,8%
31
39,2%
79
44,9%
+++
Total
18
34,0%
7
15,9%
7
8,9%
32
18,2%
53
100,0%
44
100,0%
79
100,0%
176
100,0%
Los porcentajes parecen indicar que la gravedad al ingreso comporta una peor
evolucin. Para evaluar este punto, podemos calcular los residuales ajustados. En la
opcin Casillas seleccionaos esta opcin:
-3-
+
GRAVEDAD
++
+++
Total
Recuento
% de GRAVEDAD
Residuos corregidos
Recuento
% de GRAVEDAD
Residuos corregidos
Recuento
% de GRAVEDAD
Residuos corregidos
Recuento
% de GRAVEDAD
12
22,6%
-2,6
12
27,3%
-1,5
41
51,9%
3,7
65
36,9%
EVOLUCIO
++
23
43,4%
-,3
25
56,8%
1,8
31
39,2%
-1,4
79
44,9%
+++
Total
18
34,0%
3,6
7
15,9%
-,5
7
8,9%
-2,9
32
18,2%
53
100,0%
44
100,0%
79
100,0%
176
100,0%
-4-
Podemos estimar la probabilidad de que un paciente con una gravedad (+++) al ingreso
tenga una evolucin (+). Para ello, recordad que el intervalo de confianza (95%) para
una probabilidad es:
p0 1.96
p 0 (1 p 0 )
(1)
Utilizando esta expresin podemos calcular, para el grupo de gravedad (+++) al ingreso:
0.52 1.96
0.52 0.48
79
(2)
0.52 0.11
(0.41,0.63)
Este resultado puede compararse con el resultado para los pacientes con gravedad (+)
al ingreso
0.23 1.96
0.23 0.77
53
(3)
0.23 0.11
(0.12,0.34)
Podis comprobar que ambos intervalos no se solapan, indicando que la probabilidad
de evolucionar desfavorablemente es superior en el grupo de mayor gravedad al
ingreso.
Ejercicio: calcular los intervalos de confianza para todas las probabilidades de la tabla
anterior. Discutir los resultados y relacionarlos con la interpretacin de los residuales
ajustados.
Los resultados de una tabla de contingencia pueden representarse mediante una
grfica de barras. Para ello, utilizaremos la opcin Grficos>Barras, seleccionando la
opcin de Agrupado
-5-
50
40
30
Porcentaje
20
GRAVEDAD
+
10
++
0
+++
+
++
+++
EVOLUCIO
Donde se indican los mismos porcentajes de la tabla anterior. Puede apreciarse que el
porcentaje de pacientes con evolucin desfavorable (+) aumenta con la gravedad al
ingreso, mientras que la proporcin de pacientes con buena evolucin (+++) disminuye.
Ejercicio: Copia los resultados de la tabla a un fichero de Excel y calcula los intervalos
de confianza para cada probabilidad. Incluye unas barras de error que complementen la
grfica de barras.
-6-
Hasta este punto, hemos relacionado la evolucin con la gravedad al ingreso. Seria
interesante explorar si esta relacin es similar en hombres y mujeres. Para ello,
podemos repetir la tabla de contingencia incluyendo la variable gnero como una capa.
Con ello, se realizar una tabla independiente para hombres y mujeres:
GENERO
Hombre
+
GRAVEDAD
++
+++
Total
Mujer
GRAVEDAD
++
+++
Total
Recuento
% de GRAVEDAD
Residuos corregidos
Recuento
% de GRAVEDAD
Residuos corregidos
Recuento
% de GRAVEDAD
Residuos corregidos
Recuento
% de GRAVEDAD
Recuento
% de GRAVEDAD
Residuos corregidos
Recuento
% de GRAVEDAD
Residuos corregidos
Recuento
% de GRAVEDAD
Residuos corregidos
Recuento
% de GRAVEDAD
6
26,1%
-1,4
4
23,5%
-1,4
22
50,0%
2,4
32
38,1%
6
20,0%
-2,2
8
29,6%
-,8
19
54,3%
2,9
33
35,9%
EVOLUCIO
++
9
39,1%
-,4
7
41,2%
-,2
20
45,5%
,5
36
42,9%
14
46,7%
,0
18
66,7%
2,5
11
31,4%
-2,3
43
46,7%
+++
Total
8
34,8%
2,3
6
35,3%
1,9
2
4,5%
-3,6
16
19,0%
10
33,3%
2,8
1
3,7%
-2,2
5
14,3%
-,6
16
17,4%
23
100,0%
17
100,0%
44
100,0%
84
100,0%
30
100,0%
27
100,0%
35
100,0%
92
100,0%
-7-
+
INGRESO
Programado
Urgencias
Total
Recuento
% de INGRESO
Residuos corregidos
Recuento
% de INGRESO
Residuos corregidos
Recuento
% de INGRESO
24
29,3%
-2,0
41
43,6%
2,0
65
36,9%
EVOLUCIO
++
39
47,6%
,7
40
42,6%
-,7
79
44,9%
+++
Total
19
23,2%
1,6
13
13,8%
-1,6
32
18,2%
82
100,0%
94
100,0%
176
100,0%
De estos resultados, podemos indicar que los pacientes de urgencias presentan una
proporcin superior de evolucin desfavorable, si bien los resultados no son muy
significativos. En este caso, seria conveniente considerar la gravedad al ingreso:
Tabla de contingencia INGRESO * EVOLUCIO * GRAVEDAD
GRAVEDAD
+
+
INGRESO
Programado
Urgencias
Total
++
INGRESO
Programado
Urgencias
Total
+++
INGRESO
Programado
Urgencias
Total
Recuento
% de INGRESO
Residuos corregidos
Recuento
% de INGRESO
Residuos corregidos
Recuento
% de INGRESO
Recuento
% de INGRESO
Residuos corregidos
Recuento
% de INGRESO
Residuos corregidos
Recuento
% de INGRESO
Recuento
% de INGRESO
Residuos corregidos
Recuento
% de INGRESO
Residuos corregidos
Recuento
% de INGRESO
5
15,6%
-1,5
7
33,3%
1,5
12
22,6%
3
17,6%
-1,1
9
33,3%
1,1
12
27,3%
16
48,5%
-,5
25
54,3%
,5
41
51,9%
EVOLUCIO
++
14
43,8%
,1
9
42,9%
-,1
23
43,4%
11
64,7%
,8
14
51,9%
-,8
25
56,8%
14
42,4%
,5
17
37,0%
-,5
31
39,2%
+++
Total
13
40,6%
1,3
5
23,8%
-1,3
18
34,0%
3
17,6%
,3
4
14,8%
-,3
7
15,9%
3
9,1%
,1
4
8,7%
-,1
7
8,9%
32
100,0%
21
100,0%
53
100,0%
17
100,0%
27
100,0%
44
100,0%
33
100,0%
46
100,0%
79
100,0%
-8-
Variables cuantitativas
Al realizar una descriptiva de la variables cuantitativas, es conveniente, en primer lugar,
comprobar si se comportan como una normal. Para ello, podemos utilizar grficas P-P.
El procedimiento es: Grficos>P-P:
,8
2.1.2
,5
,3
0,0
0,0
,3
,5
,8
1,0
-9-
,02
Desviacin de Normal
,01
0,00
-,01
-,02
-,2
0,0
,2
,4
,6
,8
1,0
1,2
- 10 -
40
30
20
10
Desv. tp. = 4,48
Media = 42,8
N = 176,00
0
32,6
41,8
37,2
51,0
46,4
CONC3
- 11 -
Obtenemos:
60
118
50
40
39
CONC3
30
20
N=
53
44
79
++
+++
GRAVEDAD
- 12 -
60
68
50
40
39
CONC3
30
INGRESO
Programado
Urgencias
20
N=
32
21
17
27
++
33
46
+++
GRAVEDAD
Podemos observar que no se producen variaciones apreciables.
Ejercicio: Determina si la gravedad al ingreso y el gnero determinan alguna variacin
importante en la distribucin de imc, y de las concentraciones.
- 13 -
El anlisis exploratorio de estos datos nos indica que existen algunas diferencias
importantes en funcin de la edad:
130
120
75
37
110
100
CONC2
90
80
N=
84
92
Hombre
Mujer
GENERO
Informe
CONC1
GENERO
Hombre
Mujer
Total
Media
51,670
51,748
51,711
Desv. tp.
2,3444
2,6864
2,5221
N
84
92
176
- 14 -
GENERO
Hombre
Mujer
Total
GRAVEDAD
+
++
+++
Total
+
++
+++
Total
+
++
+++
Total
Media
52,9
54,2
50,7
52,1
53,6
51,1
51,3
52,3
53,3
52,2
51,0
52,2
Programado
Desv. tp.
3,0
2,6
2,1
2,8
2,7
3,4
2,7
3,0
2,8
3,4
2,4
2,9
N
12
6
17
35
20
11
16
47
32
17
33
82
Media
52,1
51,8
50,9
51,4
52,3
51,4
50,5
51,2
52,2
51,6
50,7
51,3
INGRESO
Urgencias
Desv. tp.
1,9
1,9
1,9
1,9
2,8
1,5
2,1
2,2
2,3
1,6
2,0
2,0
N
11
11
27
49
10
16
19
45
21
27
46
94
Media
52,5
52,7
50,8
51,7
53,2
51,3
50,9
51,7
52,9
51,8
50,8
51,7
Total
Desv. tp.
2,5
2,4
1,9
2,3
2,7
2,4
2,4
2,7
2,6
2,5
2,1
2,5
Obtenemos:
- 15 -
N
23
17
44
84
30
27
35
92
53
44
79
176
120
110
100
CONC2
90
80
44
46
48
50
52
54
56
58
60
CONC1
Puede observarse que no existe una tendencia evidente entre los valores de ambas
variables.
Ejercicio: Utilizando los procedimientos anteriores, realiza una descriptiva completa de
los datos. En funcin de los resultados, indica una interpretacin global de los mismos
en funcin de los objetivos que se han planteado.
- 16 -
2.2
X 1.96 s
(4)
Para ello, debemos calcular las medias y desviaciones tpicas correspondientes a los
casos de inters. Vamos a calcular dichas medias para hombres y mujeres:
Informe
EDAD
IMC
CONC1
CONC2
CONC3
Media
Desv. tp.
Error tp. de la media
N
Media
Desv. tp.
Error tp. de la media
N
Media
Desv. tp.
Error tp. de la media
N
Media
Desv. tp.
Error tp. de la media
N
Media
Desv. tp.
Error tp. de la media
N
Hombre
53,64
4,949
,540
84
22,51
,951
,104
84
51,670
2,3444
,2558
84
104,370
6,0601
,6612
84
45,000
4,2134
,4597
84
GENERO
Mujer
60,89
4,488
,468
92
20,50
,955
,100
92
51,748
2,6864
,2801
92
93,932
6,2720
,6539
92
40,880
3,7652
,3925
92
Total
57,43
5,939
,448
176
21,46
1,385
,104
176
51,711
2,5221
,1901
176
98,914
8,0756
,6087
176
42,847
4,4777
,3375
176
En funcin de estos resultados, los valores normales (que expresan entre que valores
esperamos el 95% de los resultados individuales) para conc2 serian, para los hombres:
(5)
104.37 11.88
(92.49,116.25)
Para las mujeres serian:
(6)
93.93 15.82
(78.11,109.75)
Puede verse que los resultados esperados se sitan ligeramente por debajo en
hombres que en mujeres.
- 17 -
60
60
157
122
CONC1
50
22
40
N=
65
79
32
++
+++
EVOLUCIO
Puede observarse que existe una relacin entre la evolucin y la conc1. Esta variable
podra utilizarse como indicativo de evolucin en el diseo de un criterio diagnstico.
Para explorar esta posibilidad, podemos calcular una curva ROC. El procedimiento
indica si la variable en cuestin puede discriminar un determinado grupo de pacientes.
En este caso, tomaremos como grupo de inters al grupo (+++). El procedimiento es:
Grficos>Curva COR
- 18 -
Curva COR
1,0
,8
Sensibilidad
,5
,3
0,0
0,0
,3
,5
,8
1,0
1 - Especificidad
Los segmentos diagonales son producidos por los empates
Podemos apreciar que esta variable discrimina bien entre el grupo de buena evolucin
(+++) y el resto de grupos. Podemos incluir a las otras variables en la misma grfica:
Curva COR
1,0
,8
Procedencia de la cu
Sensibilidad
,5
CONC3
,3
CONC2
CONC1
0,0
0,0
,3
,5
,8
1,0
1 - Especificidad
- 19 -
2.3
12
22,6%
-2,6
12
27,3%
-1,5
41
51,9%
3,7
65
36,9%
EVOLUCIO
++
23
43,4%
-,3
25
56,8%
1,8
31
39,2%
-1,4
79
44,9%
4
4
Sig. asinttica
(bilateral)
,000
,000
,000
+
GRAVEDAD
++
+++
Total
Recuento
% de GRAVEDAD
Residuos corregidos
Recuento
% de GRAVEDAD
Residuos corregidos
Recuento
% de GRAVEDAD
Residuos corregidos
Recuento
% de GRAVEDAD
+++
18
34,0%
3,6
7
15,9%
-,5
7
8,9%
-2,9
32
18,2%
Total
53
100,0%
44
100,0%
79
100,0%
176
100,0%
Pruebas de chi-cuadrado
Chi-cuadrado de Pearson
Razn de verosimilitud
Asociacin lineal por
lineal
N de casos vlidos
Valor
21,976a
21,339
18,551
gl
176
- 20 -
GENERO
Hombre
+
GRAVEDAD
++
+++
Total
Mujer
GRAVEDAD
++
+++
Total
Recuento
% de GRAVEDAD
Residuos corregidos
Recuento
% de GRAVEDAD
Residuos corregidos
Recuento
% de GRAVEDAD
Residuos corregidos
Recuento
% de GRAVEDAD
Recuento
% de GRAVEDAD
Residuos corregidos
Recuento
% de GRAVEDAD
Residuos corregidos
Recuento
% de GRAVEDAD
Residuos corregidos
Recuento
% de GRAVEDAD
6
26,1%
-1,4
4
23,5%
-1,4
22
50,0%
2,4
32
38,1%
6
20,0%
-2,2
8
29,6%
-,8
19
54,3%
2,9
33
35,9%
EVOLUCIO
++
9
39,1%
-,4
7
41,2%
-,2
20
45,5%
,5
36
42,9%
14
46,7%
,0
18
66,7%
2,5
11
31,4%
-2,3
43
46,7%
+++
8
34,8%
2,3
6
35,3%
1,9
2
4,5%
-3,6
16
19,0%
10
33,3%
2,8
1
3,7%
-2,2
5
14,3%
-,6
16
17,4%
Total
23
100,0%
17
100,0%
44
100,0%
84
100,0%
30
100,0%
27
100,0%
35
100,0%
92
100,0%
Tabla de contingencia
INGRESO
Programado
+
GRAVEDAD
++
+++
Total
Urgencias
GRAVEDAD
++
+++
Total
Recuento
% de GRAVEDAD
Residuos corregidos
Recuento
% de GRAVEDAD
Residuos corregidos
Recuento
% de GRAVEDAD
Residuos corregidos
Recuento
% de GRAVEDAD
Recuento
% de GRAVEDAD
Residuos corregidos
Recuento
% de GRAVEDAD
Residuos corregidos
Recuento
% de GRAVEDAD
Residuos corregidos
Recuento
% de GRAVEDAD
5
15,6%
-2,2
3
17,6%
-1,2
16
48,5%
3,1
24
29,3%
7
33,3%
-1,1
9
33,3%
-1,3
25
54,3%
2,1
41
43,6%
EVOLUCIO
++
14
43,8%
-,6
11
64,7%
1,6
14
42,4%
-,8
39
47,6%
9
42,9%
,0
14
51,9%
1,2
17
37,0%
-1,1
40
42,6%
+++
13
40,6%
3,0
3
17,6%
-,6
3
9,1%
-2,5
19
23,2%
5
23,8%
1,5
4
14,8%
,2
4
8,7%
-1,4
13
13,8%
Total
32
100,0%
17
100,0%
33
100,0%
82
100,0%
21
100,0%
27
100,0%
46
100,0%
94
100,0%
- 21 -
INGRESO
Programado
+
GRAVEDAD
++
+++
Total
Urgencias
GRAVEDAD
++
+++
Total
Recuento
% de GRAVEDAD
Residuos corregidos
Recuento
% de GRAVEDAD
Residuos corregidos
Recuento
% de GRAVEDAD
Residuos corregidos
Recuento
% de GRAVEDAD
Recuento
% de GRAVEDAD
Residuos corregidos
Recuento
% de GRAVEDAD
Residuos corregidos
Recuento
% de GRAVEDAD
Residuos corregidos
Recuento
% de GRAVEDAD
2
16,7%
-1,6
1
16,7%
-1,0
9
52,9%
2,3
12
34,3%
4
36,4%
-,3
3
27,3%
-1,0
13
48,1%
1,2
20
40,8%
Hombre
EVOLUCIO
++
+++
4
6
33,3%
50,0%
-,8
2,8
3
2
50,0%
33,3%
,4
,7
8
0
47,1%
,0%
,5
-3,1
15
8
42,9%
22,9%
5
2
45,5%
18,2%
,2
,2
4
4
36,4%
36,4%
-,5
2,0
12
2
44,4%
7,4%
,2
-1,9
21
8
42,9%
16,3%
Total
12
100,0%
3
15,0%
-1,4
2
18,2%
-,6
7
43,8%
2,1
12
25,5%
3
30,0%
-1,2
6
37,5%
-,9
12
63,2%
1,9
21
46,7%
6
100,0%
17
100,0%
35
100,0%
11
100,0%
11
100,0%
27
100,0%
49
100,0%
Mujer
EVOLUCIO
++
+++
10
7
50,0%
35,0%
-,1
1,6
8
1
72,7%
9,1%
1,6
-1,3
6
3
37,5%
18,8%
-1,3
-,5
24
11
51,1%
23,4%
4
3
40,0%
30,0%
-,2
2,2
10
0
62,5%
,0%
2,0
-1,8
5
2
26,3%
10,5%
-1,8
-,1
19
5
42,2%
11,1%
Total
20
100,0%
11
100,0%
16
100,0%
47
100,0%
10
100,0%
16
100,0%
19
100,0%
45
100,0%
- 22 -
Pruebas de chi-cuadrado
INGRESO
Programado
GENERO
Hombre
Mujer
Urgencias
Hombre
Mujer
Chi-cuadrado de Pearson
Razn de verosimilitud
Asociacin lineal por
lineal
N de casos vlidos
Chi-cuadrado de Pearson
Razn de verosimilitud
Asociacin lineal por
lineal
N de casos vlidos
Chi-cuadrado de Pearson
Razn de verosimilitud
Asociacin lineal por
lineal
N de casos vlidos
Chi-cuadrado de Pearson
Razn de verosimilitud
Asociacin lineal por
lineal
N de casos vlidos
4
4
Sig. asinttica
(bilateral)
,019
,005
9,501
,002
35
7,033b
6,935
4
4
,134
,139
3,670
,055
47
5,089c
4,774
4
4
,278
,311
1,509
,219
49
9,694d
10,415
4
4
,046
,034
3,683
,055
Valor
11,792a
14,805
gl
45
Podemos observar que en algunos casos, la relacin deja de ser significativa. Parte de
este cambio es debido a la falta de casos, sin descartar totalmente la posibilidad de
interacciones significativas que determinen una evolucin distinta en cada tipo de
paciente. Por lo tanto, seria conveniente disear un estudio ms completo y utilizar
tcnicas estadsticas ms potentes (multivariantes) para explorar el problema.
120
75
37
110
100
90
CONC2
2.4
80
N=
84
92
Hombre
Mujer
GENERO
- 23 -
Podemos ver que existen diferencias apreciables. Podemos completar esta descripcin
mediante el clculo de ndices muestrales:
Informe
CONC2
GENERO
Hombre
Mujer
Total
Media
104,4
93,9
98,9
Desv. tp.
6,1
6,3
8,1
Error tp. de
la media
,7
,7
,6
Mnimo
90,6
83,5
83,5
Mximo
118,2
110,6
118,2
N
84
92
176
Debemos definir los cdigos de la variable gnero para definir los grupos que queremos
comparar:
El resultado es:
Prueba de muestras independientes
Prueba de Levene
para la igualdad de
varianzas
F
CONC2
Se han asumido
varianzas iguales
No se han asumido
varianzas iguales
,032
Sig.
,858
gl
Sig. (bilateral)
Diferencia
de medias
Error tp. de
la diferencia
95% Intervalo de
confianza para la
diferencia
Inferior
Superior
11,208
174
,000
10,439
,9314
8,6004
12,2770
11,225
173,434
,000
10,439
,9299
8,6033
12,2742
- 24 -
120
110
100
90
CONC2
2.5
15
80
N=
65
79
32
++
+++
EVOLUCIO
Indicando que puede existir una relacin significativa entre el nivel de conc2 y la
evolucin, sin que ello implique necesariamente una relacin causa-efecto. Podemos
estimar el valor medio de conc2 para cada nivel de evolucin. Para ello utilizaremos:
Grficos>Barras de error>Simple:
- 25 -
120
95% IC CONC2
110
100
90
N=
65
79
32
++
+++
EVOLUCIO
- 26 -
Obtenemos:
120
110
95% IC CONC2
100
GENERO
90
Hombre
Mujer
80
N=
32
33
36
43
++
16
16
+++
EVOLUCIO
- 27 -