Professional Documents
Culture Documents
Kanser
Kanser
ekil 1. a) Etidinyum Bromr (Etidinyum bromr (EB) karakteristik balanma zellikleri ile
en hassas floresans ulardan biridir ve DNAya interkelasyon ile balanr) b) Etidinyum
Bromrn DNA ift sarmalna interkelasyonla balanmas
nterkelatrler genellikle maksimum istiflenmeyi ve baz iftleriyle hidrofobik etkileimleri
salayan polisiklik aromatik halkalardan olumaktadr. Ancak bu tanma uymayan istisnai
interkelatrler de bulunmaktadr. Gerekte birok interkelatr ya pozitif ykldr ya da
fizyolojik artlarda protonlanabilecek bazik gruplara sahiptir. nk; pozitif ykl ksmlar
DNA interkelasyonunda daha etkilidir. lk aamada bu ksmlar negatif ykl DNA ekerfosfat iskeleti ile daha iyi etkilemekte ve ayrca interkelasyon fosfat grubu ile ilikili olan
Na+ gibi ykl yaplar serbest brakmaktadr. Bu durum interkelasyon iin nemli bir itici
gtr; nk birbirine ok yakn olan kart ykler arasndaki itme kuvvetlerini azaltr.
7-Aminokumarin
Fenantiridin
Proflavin(acridine orange)
Etidinyum bromr
Thiazole orange
Metilen mavisi
(a)
(b)
ou interkelatr 2-4 baz ifti ile etkilemektedir ve dizin seimli interkelasyonla beraber
hcrede seimli bir toksisiteye sahiptir. nterkelasyonun baka tr DNA balanma trleri ile
kombine edilmesi veya sentezlenen molekllerin sahip olaca enzim inhibisyonu
(Topoizomeraz I ve Topoizomeraz II) zellikleri ile DNA interkelatrlerinin kullanmndaki
bu snrlamann stesinden gelinebilir. rnein interkelatrn ayn zamanda bir topoizomeraz
inhibitr olduu yaplar kanserli hcrenin oalmasn farkl iki adan engellemeyi
hedeflemektedir. Mitoxantrone, daunorubicin, doxorubicin, dactinomycin gibi sklkla
kullanlan antikanser ajanlarnn etki mekanizmalarndan biri de interkelasyon yapmalardr.
Bu bileiklerin topoizomeraz II enzimi zerinde etkili olarak ya da singlet oksijen reterek de
DNAya zarar verdii bilinmektedir.
Bunun dnda yine sklkla kemoterapi ajan olarak kullanlan bleomycin, bakteriden izole
edilen bir glikopeptit antibiyotik olup, yapda bir interkelasyon blgesi iermekte ve bununla
DNAya balanmaktadr.
H 2N
O
H
H
N
H
N
CONH 2
N
O
H 2N
CH 3 NH
O
HO
SM e2
NH 2
HO
O
HO
O
N
H
N
H CH
3
CH 3 O
H H
N
HO H
NH
N
NH
CH 3
N
S
S
nterkelasyon blgesi
H
O
N
H
O
HO
OH
OH
O
HO
O
NH 2
bleom ycin A 2
6.71
(rn: metallointerkelatrler, akridine alkil zincirleriyle bal cis platin) yapda interkelatr
zellii tayan gruplarn bal olduu sinergistik interkelatrler de sentezlenmektedir. Bu
dorultuda klinik almalarda kullanlan birok mono-interkelatrn esnek ve esnek olmayan
deiken karbon zincirleriyle birbirlerine balanmasyla akridin ve fenantridin temelli ok
sayda bis-interkelatr sentezlenmitir. Bu bis-interkelatrlerin mono- interkelatrlerinden
daha dk konsantrasyonda kullanld ve daha yksek sitotoksik etki gsterdii rapor
edilmitir.
H3CO
N
NH
N
H3CO
N
NH
Cl
Pt
Cl
Bisakridin
interkelatr
NH
N
H2
N
H
Diterkelinyum
ekil 5. Kare eklinde dzenlenen drt guanin moleklnn Hoogsteen hidrojen balar ile
birbirine balanm kararl G-drtl yaps ve ift sarmal DNA ile G-drtl yaps arasndaki
denge
Guaninlerin sin/anti konformasyonlar ve tek sarmal DNAnn ynelimine bal olarak farkl
G-drtls yaplar da mevcuttur.
ekil 6. Tek sarmal DNAnn molekl ii toplanmas sonucu Sandalye ve Basket ekli ve
alternatif olarak iki, veya drt DNA tek sarmalnn birleip molekller aras G-drtl
yaplarn oluturabilir.
Telomerlerin ucundaki bu dzenlenme ayrntl olarak incelendiinde ok farkl G-tetrad
yaplarnn olabilecei gzlemlenmitir.
ekil 9. Ligand ile G-drtlsnn kararl hale gelmesi ile olas telomeraz aktivitesinin ve
onkojen oluumunun durdurulmasnn mekanizmas.
Telomerler ve Telomeraz
Telomerler dorusal kromozomlarn ulardr ve binlerce kez tekrarlanan ksa DNA dizileri
(insanda TTAGGG) ierirler. Telomerler, kromozom ularnn paralanmasn veya dier
kromozomlarla kaynamasn engelleyerek, kromozomlarn yapsal btnlnn
korunmasn salarlar. Telomerleri sentezleyen ve koruyan telomeraz enzimidir. RNA ieren
bu olaanst enzim, telomerik DNA dizilerini dorusal kromozomlarn ularna ilave eder.
Her replikasyon (yenileme) sonras kromozom ksalr; nk DNA polimeraz ana zincirinde,
3 ucunda yeni bir DNA sentezini balatamaz. Telomeraz, bu u-replikasyon problemini de
zmtr. Enzim, saysz telomerik tekrar dizilerini kromozomun 3 ucuna takarak
kromozomun ksalmasn engeller.
Telomeraz inhibitr olarak bilinen en nemli bileiklerden birisi BRACO19 (3,6,9trisbstite akridin)dur. Bu bileiin hcre ii ve dnda 1 mikromolar konsantrasyonun
altnda tmr bymesini durdurduu rapor edilmitir. BRACO19da akridin ana iskeletine
3,6-konumlarndan balanan, u amino sbstitentlerinin byklkleri insanda molekl ii
telomerik DNA drtlsne balanmada etkili bir faktrdr. Ayrca, ok yakn bir zamanda
sentezlenen baz bileikler, geleneksel alkilamino sbstitentlerinin yerine esneklii daha az
olan iki guanilhidrazon grubu iermektedir. Beklenmeyen bir ekilde bu bileiklerin yksek
G-drtl ilgisine ve kayda deer ekilde antitelomeraz aktiviteye sahip olduu rapor
edilmitir.
Berberin ve telomestatin gibi doal bileikler de insan telomeraz enziminin aktifliinin
durdurulmasna kar etki gstermitir. Ayrca, telomestatin hcre ii/dnda birok insan
tmr hcresinin bymesini azaltc bir etki gstermitir. G-drtl yaplarn zellikle
piperidino-berberin trevleri daha kararl klm ve daha iyi anti-telomeraz aktivitesi
gstermitir. Perilendikarboksiimidler, G-drtl yaplar ile etkileirerek farkl G-drtl
yaplarnn oluumu iin iyi bir eilim gsterirler. Bu yaplarn telomerazn aktifliinin
durdurmas ve drtl yapy kararl klmas imid azotuna bal olan yan zincirin bazikliine ve
uzunluuna baldr. Birok ligand imdiye kadar literatrde G-drtl yaplar kararl klan
ligandlar olarak nerildii halde, imdiye kadar aratrmalarda en ok katyonik porfirin
TMPyP4 bileii kullanlmtr.
KAYNAKLAR
1.Eckhardt, S., Recent progress in the development of anticancer agents, Curr. Med. Chem.Anti-Cancer Agents 2, 419439,(2002).
2. Lee, C. W., Hong, D. H., Han, S. B., Jong, S.-H., Kim, H. C., Fine, R. L., Lee, S.-H., Kim,
H. M., A novel stereo-selective sulfonylurea, 1-[1-(4-aminobenzoyl)-2,3-dihydro-1H-indol-6sulfonyl]-4-phenyl-imidazolidin-2-one, has antitumor efficacy in in vitro and in vivo tumor
models, Biochem. Pharmacol., 64, 473480,(2002).
3. Ihmels ,H., Otto, D., Intercalation of Organic Dye Molecules into Double-Stranded DNA
General Principles and Recent Developments, Top Curr Chem, vol 258, (2005) Pp:161204.
4. Thurston, D.E., Nucleic acid targeting: therapeutic strategies for the 21st century, Br J
Cancer 80, 65-85, (1999).
5. Hurley, L,H., DNA and its associated processes as targets for cancer therapy, Natl. Rev.
Cancer 2, 188-200, (2002).
6. Foye, W. O., Cancer chemotherapeutic agents. ACS, Washington, DC(ed) (1995)
7. Neidle, S., Thurston, D.E. In: Kerr DJ, Workman, P. (eds) New targets for cancer
chemotherapy. CRC Press, Boca Raton, FL, (1994), Pp: 159.
8. Propst, C.L, Perun, T. L. (eds) Nucleic acid targeted drug design. Dekker, New York,
(1992).
9. Baguley, B. C. Anti-Cancer Drug Design vol 6, 1, (1991).
10. Ihmels, H., Engels, B., Faulhaber, K., Lennarzt C., New Dyes Based on AminoSubstituted Acridizinium Salts-Synthesis and Exceptional Photochemical Properties,
Chem.Eur.J. 6,15, 2854-64, (2000).
11. Ihmels H.,Thomas L., in Materials Science of DNA Chemistry, (Ed.: J.-I. Jin), CRC
Press, Boca Raton, Chapter 4; Intercalation of Organic Ligands as a Tool to Modify the
Properties of DNA, in press.
12. Lakowicz, J.R., Principles of Fluorescence Spectroscopy, 3rd Edition, Blm 21, DNA
Technology, Springer Science, New York. (2006), Pp 705.
13. Wheatea, N.J., Brodiea, C.R., Collinsb, J.G., Kempa, S., Aldrich-Wrighta, J.R., MiniReviews in Medicinal Chemistry, DNA Intercalators in Cancer Therapy: Organic and
Inorganic Drugs and Their Spectroscopic Tools of Analysis 7, 627-648, (2007).
14.Martinez, R., Chacon-Garcia, L., The Search of DNA-Intercalators as Antitumoral Drugs:
What it Worked and What did not Work, Current Medicinal Chemistry, 12, 2, 127-151,
(2005).
15.Wheatea N.J, Brodiea C.R, Collins J.G, Kempa S and Aldrich-Wrighta J.R, Mini-Reviews
in Medicinal Chemistry, 2007, 7, 627.
16. T.C. Salk Bakanl Kanserle Sava Dairesi Bakanl Yaynlar, ULUSAL KANSER
PROGRAMI 2009-2015, Nisan 2009, Bakanlk Yayn No: 760, Editr, Murat Tuncer.
17.Wong, E.,Giandomenico, C. M. Chem. Rev., 1999, 99, 2451.
18.Barton, J. K., Odom, D. T., Erkkila, K. E. Chem. Rev., 1999, 99, 2777.
19.Biochemistry, Editr: Reginald H. Garrett and Charles M.Grisham, Saunders College
Publishing, Second Edition, 327-356.
20.J. D. Watson, F. H. C. Crick, Nature 1953, 171, 737.
21.M. Gellert, M. N. Lipsett, D. R. Davies, Proc. Natl. Acad. Sci.USA 1962, 48, 2013.
22.D. Rhodes, R. Giraldo, Curr. Opin. Struct. Biol. 1995, 5, 311.
23.J. L. Huppert, Chem. Soc. Rev. 2008, 37, 1375.
24. J. T. Davis, Angew. Chem. Int. Ed. 2004, 43, 668.
25. a) S. Burge, G. N. Parkinson, P. Hazel, A. K. Todd, S. Neidle, Nucleic Acids Res. 2006,
34, 5402; b) S. Neidle, G. N. Parkinson, Biochimie 2008, 90, 1184.
26.D. J. Patel, A. T. Phan, V. Kuryavyi, Nucleic Acids Res. 2007, 35, 7429.
27.S. Burge, G. N. Parkinson, P. Hazel, A. K.Todd, S. Neidle, Nucleic Acids Res. 2006, 34,
5402.
28. Luedtke N.W., Chimia, 2009, 134.
29.Hans J. Lipps, Rhodes D. Trends in Cell Biology 2009, 19(8), 414 (Review).
30.A. M. Zahler, J. R. Williamson, T. R. Cech, D. M. Prescott, Nature 1991, 350, 718.
31.S. Neidle, G. Parkinson, Nat. Rev. Drug Discov. 2002, 1, 383.
32.Slijepcevic P. Experimental Cell Research 1998, 244, 268.
33.Shay WJ, Wright WE. Current Opinion in Oncology 1996, 8, 66.
34.Franceschin M., Eur. J. Org. Chem. 2009, 2225.
35. Pommier Y., Cherfils J. "Interfacial inhibition of macromolecular interactions: nature's
paradigm for drug discovery." Trends Pharmacol. Sci. 26, 138-45, (2005).
36. Brana M. F., Ramos A., Curr. Med. Chem. Anticancer Agents 1: 237, (2001).
37. Avendano C., Menendez J. C., Medicinal Chemistry of anticancer drugs, Chapter 7: DNA
ntercelators and Topoisomerase Inhibitors, Elsevier, 199-228, (2008).