Caso de uso de la Web Semntica: Semantic Web Health

Care and Life Science Interest Group (HCLS IG)

Carolina Callejo Lavado
La Web Semntica es una tecnologa prometedora para la organizacin y representacin
del conocimiento en el campo de la Recuperacin de Informacin (RI), tanto a nivel general
como en el marco de la investigacin cientfica. Las posibilidades que la aplicacin de las
tecnologas de la web semntica proporciona a la actividad investigadora en los diferentes
dominios disciplinares son innumerables. Este trabajo presenta la actividad llevada a cabo
por el Semantic Web Health Care and Life Sciences Interest Group (HCLS IG), un grupo de
trabajo del W3 Consortium que investiga la aplicacin de las tecnologas de la web
semntica en Biomedicina. El objetivo final es ilustrar un caso prctico de uso de la web
semntica en un campo concreto y, en este caso, uno tan complejo como lo es el de las
ciencias biolgicas y mdicas.

Introduccin
El Semantic Web Health Care and Life Sciences Interest Group (HCLS IG) es un grupo de
trabajo de la Web Semntica (WS) en el rea de salud y ciencias de la vida que tiene como
misin desarrollar, defender y apoyar el uso de las tecnologas de la web semntica en los
mbitos de la salud, las ciencias biolgicas, la investigacin clnica y la medicina
transnacional. Porque tal y como sus miembros sostienen, estos dominios pueden obtener
enormes beneficios de la aplicacin de las tecnologas de la web semntica tanto a nivel
intra-dominio como inter-dominio, ya que stos dependen de la interoperabilidad de la
informacin entre muchas disciplinas1.
Este ltimo concepto es un elemento central en la actividad de este grupo de trabajo. La
interoperabilidad informativa, definida como la capacidad de compartir datos posibilitando
el intercambio de informacin y conocimiento, es fundamental para el desarrollo cientfico
en cualquier rea pero an ms en las de salud y ciencias biolgicas. Por eso, el HCLS IG
busca facilitar la investigacin y el anlisis clnicos en estas dos reas y su aplicacin al
contexto de la medicina transnacional, esto es, una medicina a travs de las naciones y
ms all de ellas en la que la prctica clnica e investigadora se puede ejercer sin
limitaciones geogrficas, ni informativas, ni de idioma.
Es aqu donde entra en juego la web semntica como herramienta destinada a la superacin
de las fronteras informativas que surgen como consecuencia de la ausencia de
interoperabilidad entre los diferentes sistemas de informacin Cmo? Gracias a la actividad
del grupo de trabajo en el rea de salud y ciencias biolgicas de la web semntica que se
materializa en:
1) Un medio para que los investigadores en ciencias biolgicas puedan hacer un uso
eficaz de los conocimientos adquiridos fruto de la investigacin cientfica,
compartiendo datos y conclusiones que a su vez promovern nuevos estudios.

Semantic Web Health Care and Life Sciences Interest Group Charter, 2015.

2) Un infraestructura informacional biomdica capaz de combinar los datos de la

investigacin mdica y la prctica clnica, con las infinitas ventajas que esto conlleva
para el avance de un campo cientfico tan importante para la vida humana como es
el de las Ciencias Mdicas.
3) Una base informativa de gran valor para el desarrollo de terapias personalizadas en
el mbito de la medicina transnacional.
Esto nos proporciona una idea del potencial de aplicacin de las tecnologas de la web
semntica en el campo de las ciencias de la vida y de la salud a dos niveles:
1) Dentro del propio dominio (intra-dominio). Dentro de cada dominio de
conocimiento el de las ciencias biolgicas, el de las mdicas o los sub-dominios que
representas las diferentes especialidadesdisponer de un sistema de informacin
global formado por sistemas de informacin interconectados2 ampla los horizontes
de la actividad cientfica y hace ms eficientes las rutinas investigadoras, lo que
resulta en una mayor produccin cientfica y de mejor calidad.
2) Entre dominios. El enfoque interdisciplinar, basado en el estudio de la realidad
desde diversas disciplinas3, es una tendencia cada vez ms creciente dentro de la
actividad investigadora. En este contexto, la interdisciplinariedad entre la Biologa y
la Medicina que fomenta la web semntica resulta clave en la medida en que la
primera disciplina constituye la base sobre la que se sustenta la segunda.
Todo esto se traduce en una mayor interoperabilidad informativa entre investigadores de
mltiples disciplinas, lo que debera (al menos en la teora) aumentar la produccin y
mejorar la calidad de la investigacin, influyendo positivamente en la prctica mdica.

El papel de la Web Semntica en Biomedicina

Ya hemos visto cules son las posibilidades tericas de aplicacin de la web semntica en el
mbito de la biomedicina pero cmo se materializa todo esto en la prctica? Qu
aplicaciones concretas tiene la web semntica dentro de la investigacin en este campo
cientfico? La respuesta a estas preguntas la encontramos en un documento del HCLS IG
sobre casos de uso de la web semntica en salud y ciencias de la vida4.
En el mismo, este grupo de trabajo explica que la web semntica se presta para una
perfecta integracin de datos multidisciplinares y los casos de uso de la misma deben ser
estudiados para cada dominio.

As es la forma en que concibo la web semntica en el contexto de la recuperacin de informacin,

como el soporte de un gran sistema de informacin (un sistema de organizacin del conocimiento)
universal que est constituido a su vez por diferentes sistemas de informacin (bases de datos,
ontologas, tesauros) interconectados entre s y capaces de relacionarse, con la finalidad de
proporcionar al usuario una respuesta relevante a su consulta.
3

En la investigacin interdisciplinar el acercamiento al objeto de estudio se realiza desde la perspectiva

de diferentes disciplinas cientficas que se nutren unas de otras, se retroalimentan.
4

Semantic Web Use Cases in Health Care and Life Sciences, 2011.

Dos de los ejemplos ms ilustrativos del HCLS IG que muestran el papel que la web
semntica puede desarrollar en el campo de la biomedicina son el desarrollo de frmacos y
la difusin de resultados experimentales estructurados. En el primer caso, la unificacin de
fuentes informativas sobre funciones biolgicas, compuestos qumicos, biomarcadores,
vas teraputicas, etc. permitir responder ms eficazmente a las consultas de investigacin
y descubrimiento en el campo farmacutico, y obtener as ms y mejores resultados de
manera exponencial. En el segundo caso, la disponibilidad de una fuente de informacin
estructural reutilizable mediante la creacin de cuadernos electrnicos de laboratorio
permitir que los datos obtenidos de los experimentos de laboratorio sean fcilmente
compartidos y puedan ser reutilizados por otros investigadores.

Cmo contribuyen las tecnologas de la web semntica a la investigacin

biomdica
La web semntica parece ser una va factible para alcanzar los ideales de interoperabilidad
informativa y acceso a los datos tan valiosos para la actividad cientfica en el campo de la
biomedicina pero cmo pueden asistir las tecnologas de la web semntica a este objetivo?
Por un lado, la descripcin de los recursos electrnicos mediante URIs elimina los
problemas causados por la multiplicacin de identificadores locales para las entidades de
inters biomdico5. Por otro lado, RDF y OWL proporcionan la flexibilidad, extensibilidad y
descentralizacin6 necesarias para el manejo de informacin tan compleja como la derivada
de la Biologa y la Medicina, y posibilitan la gestin de las relaciones entre ambos dominios.
As, la aplicacin de las tecnologas de la web semntica es idnea para la Recuperacin de
Informacin (RI) en biomedicina, en la medida en que proporcionan un marco homogneo
y de alcance global para la descripcin y recuperacin de recursos electrnicos, lo que
necesariamente culmina en una recuperacin informativa ms precisa. En el marco de la
investigacin biomdica esto se traduce en un proceso ms rpido y eficaz de recuperacin
informativa (se reduce el tiempo necesario y se obtienen respuestas ms precisas), lo que
significan rutinas investigadoras ms eficientes y, por tanto, mejores resultados y ms
beneficios sociales, econmicosde la investigacin.

Conclusiones
El empleo de las tecnologas de la web semntica en el mbito de la investigacin
biomdica constituye una va prometedora para superar limitaciones que frenan la actividad
y la produccin cientficas y que son consecuencia de la ausencia de interoperabilidad
informativa dentro de y entre los dominios de esta rea. La causa de estas limitaciones
que impiden que la actividad investigadora desarrolle todo su potencial reside en las
restricciones geogrficas, informativas y de idioma que conlleva un sistema de informacin
basado en su mayor parte en bases de datos aisladas que funcionan bajo distintos
estndares.
5

Ruttenberg, Alan et. al., 2007, p. 4.

Ibdem.

El proyecto del HCLS IG, tal como est planteado, conseguira integrar y homogeneizar los
diferentes sistemas de informacin biomdicos y hacerlos accesibles mediante una especie
de base de datos unificada linked data que estara sustentada sobre la base tecnolgica
que proporciona la web semntica.
En esta lnea, cabe sealar las ventajas que esta tecnologa conlleva en cuanto a la
recuperacin de informacin grfica y lo que eso supone en un campo como el de las
ciencias biomdicas, en el que el formato visual resulta vital. Adems, si visualizamos este
proyecto en el marco de movimientos en auge como el open data y el open access las
fronteras se expanden an ms, porque ya no solo quedaran superadas las limitaciones
antes mencionadas, sino tambin las econmicas.
No obstante, y pese a lo prometedor del asunto, lo cierto es que la aplicacin de las
tecnologas de la web semntica en la investigacin biomdica adolece de la misma
flaqueza que el propio proyecto de la web semntica, y es que se trata de un querer
hacer que en teora es factible pero cuya aplicacin prctica solo podremos ver a largo
plazo. De nosotros depende que la web semntica se convierta en una realidad. Desde los
mbitos cientfico y acadmico se tiene que continuar trabajando en el proyecto y no cesar
en el empeo, porque siempre es mejor fracasar que no haberlo intentado.

Informacin adicional sobre el HCLS IG

Pgina web del proyecto
Pgina web del grupo de trabajo
Pgina wiki pblica

Bibliografa
Ruttenberg, Alan et. al. (2007). Advancing translational research with the Semantic Web.
BMC Bioinformatics [en lnea]. Vol. 8 (suppl. 3):S2. Disponible en Internet:
http://www.biomedcentral.com/1471-2105/8/S3/S2.
Semantic Web Health Care and Life Sciences Interest Group Charter [en lnea]. W3
Consortium: actualizado el 02/02/2015 [consultado el 15/02/2015]. Disponible en Internet:
http://www.w3.org/2011/09/HCLSIGCharter.
Semantic Web Use Cases in Health Care and Life Sciences [en lnea]. W3 Consortium:
actualizado el 08/09/2011 [consultado el 15/02/2015]. Disponible en Internet:
http://www.w3.org/2011/05/HCLSIGUseCases.