Professional Documents
Culture Documents
0027 2A Barocsi Attila A Biofizika Alapjai
0027 2A Barocsi Attila A Biofizika Alapjai
A BIOFIZIKA ALAPJAI
2011
Ismertet
Tartalomjegyzk
Plyzati tmogats
Gondoz
tankonyvtar.bme.hu
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
Tmogats:
Kszlt a TMOP-4.1.2-08/2/A/KMR-2009-0028 szm, a Termszettudomnyos (matematika
s fizika) kpzs a mszaki s informatikai felsoktatsban cm projekt keretben.
Kszlt:
a BME TTK Matematika Intzet gondozsban
Lektorlta:
Dr. Csintalan Zsolt PhD, hab. egyetemi docens, Szent Istvn Egyetem, Mezgazdasg- s
Krnyezettudomnyi Kar, Nvnytani s Nvnylettani Tanszk
ISBN: 978-963-279-465-5
Copyright:
20112016, Dr. Barcsi Attila PhD, egyetemi docens, BME TTK Atomfizika
Tanszk
A terminusai: A szerz nevnek feltntetse mellett nem kereskedelmi cllal szabadon
msolhat, terjeszthet, megjelentethet s eladhat, de nem mdosthat.
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
Tartalomjegyzk
TARTALOMJEGYZK
1.
2.
Bevezets ....................................................................................................................... 7
A biofizika biolgiai alapjai .......................................................................................... 8
2.1. Az let.................................................................................................................... 8
2.1.1.
Szaporods..................................................................................................... 8
2.1.2.
Nvekeds ..................................................................................................... 8
2.1.3.
Anyagcsere .................................................................................................... 9
2.1.4.
Mozgs .......................................................................................................... 9
2.1.5.
Vlaszreakci .............................................................................................. 10
2.2. Biolgiai elmletek.............................................................................................. 10
2.2.1.
Sejtelmlet ................................................................................................... 10
2.2.2.
Szerves fejlds (evolci) elmlete ........................................................... 11
2.2.3.
A biogenetika trvnye................................................................................ 11
2.2.4.
Egy gn egy enzim egy funkci......................................................... 11
2.3. A sejt.................................................................................................................... 11
2.3.1.
Sejtszervezds............................................................................................ 11
2.3.2.
Sejtek felptse........................................................................................... 11
2.3.3.
Az llati sejt felptse................................................................................. 12
2.3.4.
Nvnyi sejtek felptse............................................................................. 14
2.4.
A sejtciklus .......................................................................................................... 15
2.4.1.
Ellenrzsi pontok ....................................................................................... 15
2.4.2.
Szablyozk................................................................................................. 16
2.5.
Szmtart sejtosztds (mitzis) ......................................................................... 16
2.5.1.
A mitzist befolysol tnyezk ................................................................. 17
2.5.2.
A mitzis fzisai .......................................................................................... 17
2.6. Szmfelez sejtosztds (meizis) ...................................................................... 19
2.7. Sejt differencilds ............................................................................................ 19
2.8. Biolgiai osztlyozs........................................................................................... 19
2.8.1.
F kategrik ............................................................................................... 20
2.9. Mendel-fle (ler) genetika ................................................................................ 20
2.9.1.
Mendel-szablyok........................................................................................ 20
2.9.2.
Anyai hats .................................................................................................. 20
2.9.3.
Anyai (extrakromoszomlis) rklds....................................................... 21
3. Anyagszerkezet s funkci .......................................................................................... 22
3.1. Defincik ............................................................................................................ 22
3.1.1.
Molekulatmeg............................................................................................ 22
3.1.2.
A kmiai kts ............................................................................................. 22
3.2. Biolgiailag fontos ktstpusok ......................................................................... 22
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
A biofizika alapjai
3.2.1.
Kovalens (homopolris) kts..................................................................... 23
3.2.2.
Ionos (heteropolris) kts .......................................................................... 23
3.2.3.
Hidrognkts (H-hd)................................................................................. 24
3.2.4.
Van der Waals kts.................................................................................... 24
3.2.5.
Hidrofb klcsnhats................................................................................. 25
3.3.
Ktsek s a molekulk alakja ............................................................................ 25
3.4.
A vz .................................................................................................................... 26
3.4.1.
A vz szerepe az l struktrkban.............................................................. 27
3.4.2.
A vzmolekula ............................................................................................. 27
3.5.
Makromolekula alegysgek................................................................................. 28
3.5.1.
Szerves funkcionlis csoportok................................................................... 28
3.5.2.
Aminosavak................................................................................................. 30
3.5.3.
Nukleotidok................................................................................................. 31
3.6.
Biolgiai makromolekulk.................................................................................. 33
3.6.1.
Szacharidok ................................................................................................. 33
3.6.2.
Lipidek ........................................................................................................ 34
3.6.3.
Fehrjk (proteinek) .................................................................................... 35
3.6.4.
Nukleinsavak............................................................................................... 37
3.6.5.
Porfirinek..................................................................................................... 39
3.7.
Molekulris genetika ........................................................................................... 40
3.7.1.
A genetikai informci................................................................................ 40
3.7.2.
A genetikai kd ........................................................................................... 40
3.7.3.
A DNS replikci ........................................................................................ 40
3.7.4.
Transzkripci............................................................................................... 41
3.7.5.
Transzlci .................................................................................................. 42
3.7.6.
A biolgiai informciramls valsga..................................................... 43
4. Klcsnhats sugrzssal ............................................................................................ 44
4.1.
Klcsnhats atomi/molekulris rendszerekkel .................................................. 44
4.1.1.
Az elektromgneses spektrum optikai tartomnya...................................... 44
4.1.2.
Abszorpci .................................................................................................. 44
4.1.3.
Emisszi ...................................................................................................... 45
4.2.
Fnyelnyels biolgiai makromolekulkban....................................................... 45
4.2.1.
Abszorpci s pigmentmret....................................................................... 46
4.3.
A foto-gerjesztett molekulk viselkedse ........................................................... 48
4.3.1.
Sugrzsmentes tmenet ............................................................................. 48
4.3.2.
Lumineszcencia........................................................................................... 49
4.3.3.
Szinglettriplet tmenet............................................................................... 50
4.3.4.
Energiatranszfer .......................................................................................... 51
4.3.5.
Tltstranszfer............................................................................................. 52
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
Tartalomjegyzk
tankonyvtar.ttk.bme.hu
A biofizika alapjai
5.3.
Az l szervezet energiaforgalma ....................................................................... 79
5.3.1.
A szervezet hhztartsa ............................................................................. 79
5.3.2.
A szervezet hleadsa ................................................................................. 80
5.3.3.
A szervezet hszablyozsa ........................................................................ 81
5.3.4.
Az l sejt energiaforgalma......................................................................... 83
5.4.
Irreverzibilis termodinamika ............................................................................... 84
5.4.1.
Diszkrt rendszer......................................................................................... 85
5.4.2.
Folytonos rendszerek................................................................................... 86
5.4.3.
Rezisztv lineris rendszer........................................................................... 88
5.5.
A sejtszint energiatalakts krdsei................................................................ 88
5.5.1.
Az ATP mint biolgiai energiatrol .......................................................... 89
5.5.2.
Fotoszintzis................................................................................................ 90
5.5.3.
A fotoszintzis fnyszakasza....................................................................... 92
5.5.4.
A sznredukcis szakasz ............................................................................. 95
5.5.5.
Respirci.................................................................................................... 97
6. Anyagcsere s transzport............................................................................................. 98
6.1.
ramlsi jelensgek ............................................................................................ 98
6.1.1.
A kontinuitsi egyenlet................................................................................ 99
6.1.2.
A Bernoulli-trvny .................................................................................. 100
6.1.3.
Relis folyadkok laminris ramlsa....................................................... 101
6.1.4.
ramls csvekben ................................................................................... 102
6.1.5.
A keringsi rendszer.................................................................................. 103
6.1.6.
A szv munkja.......................................................................................... 105
6.1.7.
Turbulens ramls ..................................................................................... 106
6.1.8.
Gmb alak test mozgsa viszkzus kzegben......................................... 107
6.2. A molekulris mozgs jellemzi ....................................................................... 108
6.2.1.
A drift ........................................................................................................ 108
6.2.2.
A diffzi .................................................................................................. 109
6.2.3.
A diffzi mint bolyongs......................................................................... 111
6.3. A diffzi ltal szablyozott reakcik............................................................... 114
6.4.
A diffzi specilis esetei l szervezetekben .................................................. 115
6.4.1.
Laterlis diffzi biolgiai membrnokban .............................................. 116
6.5.
Az ozmzis........................................................................................................ 117
6.5.1.
A vant Hoff-trvny................................................................................. 117
6.5.2.
Az ozmzisnyoms biolgiai jelentsge ................................................. 118
6.6.
Anyagforgalom.................................................................................................. 118
6.6.1.
Gzok felvtele.......................................................................................... 119
6.6.2.
Folykony s szilrd anyagok felvtele s transzportja ............................ 119
6.6.3.
Szaporods s nvekeds .......................................................................... 119
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
Tartalomjegyzk
7.
tankonyvtar.ttk.bme.hu
A biofizika alapjai
8.1.
Az rzkels folyamatnak ltalnos trvnyszersgei .................................. 161
8.1.1.
Receptorok ................................................................................................ 161
8.1.2.
Az rzkels folyamata ............................................................................. 161
8.1.3.
Inger s rzet ............................................................................................. 162
8.2.
A lts................................................................................................................ 163
8.2.1.
Az emberi szem felptse......................................................................... 163
8.2.2.
A lts biofizikja...................................................................................... 165
8.2.3.
A ltsi ingerlet kialakulsa .................................................................... 166
8.3.
A halls.............................................................................................................. 168
8.3.1.
Az emberi fl felptse ............................................................................ 168
8.3.2.
A kzpfl ................................................................................................. 170
8.3.3.
A bels fl ................................................................................................. 171
8.3.4.
A halls receptoros mechanizmusa ........................................................... 173
8.3.5.
A szrsejtek erst szerepe s adaptcija............................................... 175
9. Kollektv jelensgek.................................................................................................. 177
9.1.
Kzlekedsszer (traffic-like) mozgsok ...................................................... 178
9.1.1.
Elmleti megkzeltsek ........................................................................... 179
9.1.2.
Egyed-alap modellek............................................................................... 180
9.2.
ASEP modellek ................................................................................................. 181
9.2.1.
TASEP modell nyitott hatrokkal ............................................................. 182
9.2.2.
Hibahelyek az ASEP tpus modellekben................................................. 183
9.3.
Molekulris motorok alapmechanizmusai ........................................................ 184
9.3.1.
Molekulris motorok ................................................................................. 184
9.3.2.
A Brown-fle kilincsmechanizmus ........................................................... 186
9.3.3.
Hibk modellezse reteszmotor esetn ..................................................... 188
9.3.4.
Molekulris motorok TASEP modellje..................................................... 188
10.
Felhasznlt irodalom ............................................................................................. 190
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
1. Bevezets
1.
BEVEZETS
Az elektronikus jegyzet feladata, hogy megismertesse az olvast az lettelen fizikai rendszerekhez kpest sokkal sszetettebb s vltozatosabb biolgiai rendszerekben (l szervezetekben) rvnyesl (pl. azok felptst, mkdst, fejldst meghatroz) legalapvetbb fizikai trvnyszersgekkel, illetve pldkkal illusztrlja az ilyen biolgiai
rendszerek fizikai modellezst s vizsglati mdszereit.
A biofizika trgykrt a hazai irodalom leginkbb az orvosi biofizika irnybl dolgozza fel. Azonban ennek terjedelme tlzan meghaladja jelen tananyag kereteit: bsgesen
trgyalja egyrszt a fizikai alapokat, msrszt a biofizikai ismereteket kvn korszer alkalmazsokat. A hivatkozott irodalmak alapveten ktfle problmt vetnek fel: 1) bizonyos irodalmak j kiadsai nem lteznek; 2) az j irodalmak nagy terjedelmek, sokkal
szlesebb ismeretanyaggal, mint szmunkra szksges jellemzen nem fizikus vagy
mrnk, hanem biolgus vagy orvostanhallgatk szmra. A szerz clja fordtott s deklarltan szkebb: a fizikai elvekhez tbb biolgiai httr informci biztostsa (s trstsa)
fknt mrnk s fizikus hallgatk szmra. Ez a megkzelts egyben a fizikai alapokat
ismertnek ttelezi fel. Az anyag kiegszl bizonyos szmunkra fontos tmakrkkel
(pl. fotoszintzis, kollektv mozgsok): cl ezeknek is az egysges szerkezetbe rendezse.
Vgl fontos megjegyezni, hogy az elektronikus jegyzet stlusban is szkebb, mint
egy nyomtatott knyv: br a tananyag igen sok ismeretet tartalmaz, azok magyarzata a
legtbb helyen tmr, helyenknt felsorols- vagy definciszer. Ehhez hasonlan az brk, egyenletek, levezetsek is csak a megrtshez legszksgesebb informcikat tartalmazzk.
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
2.
A biofizika alapjai
Az let
Az let: absztrakt definci l s lettelen megklnbztetsvel. Az l jellemzi: szaporods (reprodukci), nvekeds, anyagcsere (metabolizmus), mozgs (klnbz
szintjei), vlaszreakci (a klvilg ingereire).
2.1.1.
Szaporods
2.1.2.
Nvekeds
Brmilyen mdon jtt ltre, az utd nvekszik s kifejlett egyedd fejldik a szleihez
hasonl alakisggal s funkcikkal.
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
2.1.3.
Anyagcsere
Energiacserk s kmiai reakcik sszessge az l szervezeten bell, melyek annak nvekedst, fenntartst, kijavtst szolgljk. Az lland energia befektets az llnyek
alapvet jellegzetessge. A metabolizmus folyamata ktfle lehet:
Anabolikus: az l szervezet szmra szksges szerves vegyletek energiaignyes
szintzise egyszerbb kiindulsi (szerves) anyagokbl.
Katabolikus: szerves vegyletek oxidatv lebontsa ms (biokmiai) folyamatok
energiaignynek biztostsa cljbl.
Tpllkozsuk szerint az llnyek csoportostsa:
Nvnyek autotrf (nll tpllkozs) szervezetek: kpesek sajt szerves vegyleteiket krnyezetk (talaj, vz, leveg) szervetlen anyagaibl ellltani. Lteznek heterotrf parazita nvnyek is, s pldul minden csranvny heterotrf a
fotoszintzis beindulsig.
llatok heterotrf szervezetek: tpllkozsuk nagy rsze kzvetlenl vagy kzvetve nvnyeken alapszik.
2.1.4.
Mozgs
tankonyvtar.ttk.bme.hu
10
A biofizika alapjai
2.1.3. bra: llati sejt helyvltoztatsa (a piros rnykkp a sejt vghelyzett jelli)
2.1.5.
Vlaszreakci
Biolgiai elmletek
Ttel: Az lettel kapcsolatos jelensgek ugyanazon trvnyszersgeken alapulnak, amelyek a fizikai s a kmiai jelensgeket veznylik.
2.2.1.
Sejtelmlet
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
2.2.2.
11
Minden llny elzleg ltez egyszerbb szervezet fokozatos, az egymst kvet genercikban felhalmozd mdosulsval alakult ki (Darwin, 1859). Az evolci eszkze a
termszetes kivlasztds, alapeleme: kzdelem a ltrt.
Az evolci eredmnyezhet egyszerbb szervezetet is, pl. a parazitk esetben, mikor
is elvesznek a feleslegess vl funkcik, szervek.
2.2.3.
A biogenetika trvnye
Az embriolgusok megfigyelsei alapjn az embrionlis fejlds sorn a szervezetek mintegy ismtlik az evolcis seik egyes llapotait (pl. az emberi embri fejldse sorn halak, hllk, stb. embriira emlkeztet jegyeket visel).
2.2.4.
Beadle s Tatum elmlete szerint minden gn egy enzim szerkezett hatrozza meg, gy
egy adott biokmiai lpst kdol. Ez a megllapts pontostsra szorul, hiszen vannak tbb
alegysgbl ll enzimek, nem minden fehrje enzim (pl. szerkezeti fehrjk), s a genom
(a gnek sszessge) a sejtben tallhat sokfle RNS molekula (tRNS, rRNS, snRNS) gnjeit is tartalmazza. ( 3.6.4)
2.3.
A sejt
Sejtszervezds
Sejtek felptse
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
12
A biofizika alapjai
2.3.3.
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
13
Citoszkeleton: a sejtmag s sejtmembrn bels fellete kztti, ersen strukturlt fonalas fehrjevz. Tbb elklnl fonalrendszer alkotja: mikrofilamentum-hlzat (pteleme a~ 6 nm tmrj aktin szerepe a sejtmozgsban, sejthrtya stabilizlsban van); mikrotubulusok (alkotja a ~ 22 nm
tubulin szerepe a sejten belli trbeli elrendezds, valamint az organellumok
mozgshoz irnytplya kialaktsa) s kzbens (szerkezeti) filamentumok.
Az llati s a nvnyi sejtekben egyarnt megtallhatak a miozin filamentumok: az aktin s a miozin komplex a funkcionlis egysge a citoplazma ramlsrt s az organellumok mozgatsrt felels sejtvz komponensnek.
Endoplazmatikus retikulum (ER, protoplazmn belli hlzat): szalagformj, membrnos tubulusok szvevnye, melyek a sejtmagot hatrol membrntl
indulva sszekttetsben llnak egymssal s kzvetett mdon (az n.
endomembrn rendszer rvn) a plazmamembrnnal is. A durvafelszn ER felletn (riboszma-) rRNS alap riboszmk tallhatak a fehrjeszintzishez.
A simafelszn ER szerepe a kmiai reakcik helysznt ad membrnfellet
(gy az anyagcsere hatsfok) nvelse, mreganyagok lebontsa, valamint fehrjk s sejt-folyadkok transzportja a sejtmembrnhoz pl. azok sejten kvli
kivlasztshoz (szekrci).
Mitokondrium: ovlis, kettsmembrn fal respircis organellum a sejt energia-szksgleteit biztost ATP (adenozin-trifoszft) szintetizlsra akkumultor funkci. ( 5.5.1)
Golgi-kszlk: vkony lapos, dinamikusan talakul zskszer, membrnos
testek halmaza. Funkcii: vladk (szekrtum) kondenzlsa / membrnba
csomagolsa, szekrci, makromolekula szintzis, membrnkpzs, sejtfolyamatok szablyozsa, informcitvitel.
Centrilum: a sejtmaghoz kzeli, a sejt mozgsjelensgeit / osztdst irnyt
sejtkzpontban lv kt hengeres testecske, melyek a mitzis sorn osztdsi
kzpontokknt funkcionlnak.
Lizoszmk: lipoprotein membrn hatrolta bels llomnybl plnek fel.
Feladatuk a sejt sajt s bekebelezett anyagainak lebontsa (emsztse) / talaktsa s a keletkez salakanyagok eltvoltsa.
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
14
A biofizika alapjai
2.3.4.
Barcsi, BME
2.4.
15
A sejtciklus
2.4.1. bra: A sejtciklus fzisai (cy-X: az adott fzisra jellemz ciklin mennyisgnek maximuma)
s ellenrzsi pontjai ()
2.4.1.
Ellenrzsi pontok
Az ellenrzsi pontok legfbb szerepe, hogy a hibs sejtek ciklusa gtls al kerlhet, ezzel biztostva a genetikailag azonos sejteket. Az ellenrzsi pontok biolgiailag olyan fontosak, hogy az ellenrz gnek s termkeik (a szablyozk) felfedezsrt Hartwell, Hunt
s Nurse 2001-ben orvosi Nobel-djat kapott. A hrom ellenrzsi pont:
G1/S start pont a DNS srls rzkelsre;
G2/M pont a sikeres DNS replikci ellenrzsre;
M [M/A] pont a sikeres kromatid sztvlst ellenrzi.
A mitzisbl kilpett sejt csak akkor lp be a G1 fzisba, ha ezt a sejten kvli szablyoz molekulk ltal kzvettett n. mitogn jel (llati/emberi sejteknl adott sejttpusra
specifikus nvekedsi faktor jelenlte) kivltja. Nvekedsi faktor hinyban a sejt a nyugalmi G0 fzisba kerl: kilp a ciklusbl.
A nvekedsi faktorok a plazmamembrn specifikus fehrjemolekulin (a receptoraikon) ktdnek meg. A receptorok viszik t a mitogn jelet a sejt belsejbe, ahonnan jelkzvett molekulkkal jut a sejtmagba. A mitogn jel a sejtmagban a G1 fzisra jellemz
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
16
A biofizika alapjai
gneket aktivl: megkezddik a sejtciklust az S-fzis fel viv s egyben a citoplazma nvekedst serkent fehrjk szintzise. Az ily mdon kifejezd fehrjk kztt jelen van
valamely jabb nvekedsi faktor receptora is, mely rvidesen megjelenik a sejtfelsznen,
s ha a sejt krnyezetbl hozzjut specifikus nvekedsi faktoraihoz, akkor az elbbiekhez hasonl mdon tovbblpteti a sejtet a G1 fzisba.
A sejt vgl a G1/S ponton elktelezett vlik a DNS-szintzis megkezdsre: elkezddik az S-fzist vgrehajt molekulk (pl. DNS-polimerz) szintzise. Ezt a pontot megelzen a nvekedsi faktorok megvonsa a G1 fzis lellst eredmnyezi, utna viszont a
nvekedsi faktor restrikci mr hatstalan: a sejt mindenkppen S-fzisba lp.
2.4.2.
Szablyozk
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
17
2.5.1. bra: A mitzis folyamata. Homolg kromoszma: a kromoszmapr apai, ill. anyai eredet
tagjai klsleg azonosak, genetikai tartalmuk azonban klnbz.
2.5.1.
A mitzis fzisai
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
18
A biofizika alapjai
Metafzis: a kromoszmk a centrilumok (mint plusok) kztt az orsszlak kzepe tjn planris alakzatba (egyenlti skba) rendezdnek. A korai metafzisban
a kromoszmk egyenletesen oszlanak el: ilyenkor lthatk s tanulmnyozhatk a
legjobban. Ksbb a centromrk (befzdsek) sztvlnak, mg vgl kt azonos
kromoszma csatlakozik az orsszlakhoz.
Anafzis: a kromoszmaprok tagjainak ellenttes plusok fel haladsa a befzdsknl fogva. A fzis vgn minkt plus azonos kromoszma-kszletet
halmozott fel az anyasejtvel azonos genetikai informcival.
Telofzis: a kromoszmk krl sejtmag-membrn alakul s befzdseiknl megjelennek a magvacskk. A kt utdsejt kztt kialakul n. sejtlemez az egyenlti
skba rendezd a Golgi appartusrl szrmaz nagymret vezikulumok szszeolvadsval jn ltre, s alaktja ki az utdsejtek egymssal hatros j membrnjait (azaz nem az eredeti sejtmembrn befzdse hozza ket ltre, hisz a sejtmembrn nmagban ekkora megnylsra nem kpes). A Golgirl szrmaz
vezikulumok belsejben az utdsejteket sszetapaszt anyagok tallhatk. Amint a
membrnok mindkt oldalon befzdnek, s a kt sejt klnvlik, lezrul az osztds folyamata. Ekkor mindkt utdsejt teljes a szksges genetikai anyagokkal, valamint a protoplazma llomny egy rszvel.
2.5.3. bra: A mitzis meta- (M), ana- (A) s telofzisa (T), valamint az interfzis (I) az osztds
befejezdsekor
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
2.6.
19
2.7.
Sejt differencilds
Biolgiai osztlyozs
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
20
A biofizika alapjai
F kategrik
Mendel-szablyok
Az Mendel-szablyok ltalnos rvnyek: szinte minden magasabb rend llnyre rvnyesek (jrafelfedezsk ~1900 krlre tehet). Az n. mendeli tulajdonsgokat sejtmagbeli gnek kdoljk, amelyek rszei a kromoszmknak, azokon bell pedig a DNS ketts
spirlnak.
2.9.1. bra: A Mendel-fle fenotpus ksrletek. Homozigta: a homolg kromoszmk kt sszetartoz alllje azonos; heterozigta: a homolg kromoszmk kt sszetartoz alllje eltr.
2.9.2.
Anyai hats
A petesejtek citoplazmja olyan molekulkat (mRNS, fehrje) tartalmaz, amelyek kpzdst az anya gnjei kdoljk: gy a molekulk a petesejtek rse sorn kpzdnek s vlnak a citoplazma alkotjv, azrt, hogy a megtermkenylst kveten irnytsk az embtankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
21
rik lett. Ennek egy bizonytka pl., hogy a sejtmag nlkli bkazigta gy osztdik,
mintha lenne sejtmagja (nhny szz sejtig), vagyis az els osztdsokhoz nincs szksg a
sejtmagban trolt gnekre, st mRNS sem kpzdik.
Pldul egy nmegtermkenyt csigafaj hznak tekeredsi irnya szokatlan
rkldsmenetet kvet (~1920). Jobbra tekered hz nstny (J) s balra tekered hz hm (b) esetn az F1 generci csak J (dominns) egyedeket tartalmaz. Az F2 generciban szintn csak J egyedek szletnek. Az F3 generciban megjelenik a mendeli 3:1
arny (1 generci ksssel). A csigahz tekeredst az anya genetikai tartalma hatrozza
meg a petesejt citoplazmjba helyezett molekulkkal! Ha az anya hordozza a J p gnt,
s petesejtjei a J gn termkt (olyan fehrjt, mely meghatrozza a zigta els osztdsi
orsjnak irnyt), akkor az utd hza J. Ha nincs J, csak annak funkcijt vesztett mutns
(b) vltozata, akkor a petesejtben nem lesz J-kdolt fehrje, gy az utdok csigahza b
annak ellenre, hogy az utd Jb.
2.9.3.
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
22
3.
A biofizika alapjai
ANYAGSZERKEZET S FUNKCI
Az l szervezetek bmulatosan vltozatosak, melynek molekulris alapjt millinyi vegylet kpezi. Kt egyszerst krlmny segti a rendszerezst:
Minden biolgiai makromolekula polimer: relatve kevs szm egyszerbb alapegysgbl (monomerbl) plnek fel.
Jl definilhat, ismtld reakcik sorozata fedezhet fel sejtszinten: ezek az n.
metabolikus tvonalak.
3.1.
3.1.1.
Defincik
Molekulatmeg
A kmiai kts
A kmiai kts az atomok kztt elssorban a vegyrtk-elektronok klcsnhatsa kvetkeztben kialakul sszetart er. Mindenkor az egyesl atomok kls elektronhja
gy alakul t, hogy a rendszer valamilyen energiaminimummal jellemezhet, stabilis llapotba jut. Kvantummechanikai ler mdszerek:
MO (molekulaplya): molekulaplykat szmolunk (pl. LCAO Linear
Combination of Atomic Orbitals), melyeket a kizrsi elv szerint tltnk be elektronokkal.
VB (vegyrtkkts): vltozatlan de tfed atomplyk miatt kts jn ltre (kmiai szemllet).
3.2.
A kmiai ktseknek kt tpusa van, az elsrend ktsek, amikor atomok vagy ionok kapcsoldnak ssze, valamint a molekulk kztt hat, az elsrendnl jval gyengbb msodrend ktsek. Az elsrend ktsek fajti a kovalens kts, az ionos kts s a fmes
kts. Msodrend kts a hidrognkts, illetve a diplus-diplus s a diszperzis klcsnhats (Van der Waals kts).
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
3. Anyagszerkezet s funkci
3.2.1.
23
Egyszeres vagy tbbszrs elsrend kmiai kts. Egyszeres kovalens kts esetn kt
atom (azonos valsznsggel) megoszt egy elektronprt. A ktsben rsztvev elektronok
szma jl meghatrozott (2, 4, vagy 6). A kts tisztn kovalens, ha az ellenttes elektromos tltsek kzppontja egybeesik. A kts nagy energij (3.2.1. tblzat).
A molekulaplyk kvantummechanikai ton meghatrozhat, molekulris elektronllapotokat (pl. tartzkodsi valsznsg) ler fggvnyek, tpusaik (3.2.1. bra):
-kts minden egyszeres kts (s, p, vagy ms llapot elektronok kztt). Az
atommagokat sszekt ktstengelyre forgsszimmetrikus: az atomok e tengely
krl elfordulhatnak. Kt atomra lokalizlt.
-kts csak tbbszrs ktseknl alakul ki (amelyek egyike mindig ), a ktsben s-elektronok nem vesznek rszt. Csak tkrszimmetrival rendelkezik: a szimmetriask metszi az atommagokat, rajta az elektronok tartzkodsi valsznsge
zrus, vagyis a molekula nem foroghat szabadon a ktstengely krl. Tbb atomra
kiterjedhet (delokalizlt molekulaplya).
HH (435)
CH (414)
CC (347)
C=C (606)
CC (828)
OH (464)
CO (355)
NH (389)
NC (305)
N=O (607)
NO (201)
NN (170)
N=N (418)
NN (941)
3.2.1. tblzat: Kovalens ktsek energii (kJ/mol). rdemes felfigyelni arra, hogy a ketts kts
energija kisebb, mint kt egyes kts, a hrmas kts energija pedig kisebb, mint egy egyes s
kt kettes kts.
3.2.1. bra: A kovalens kts kvantummechanikai modellje (a) hullmfggvnye, (b) energiadiagramja, (c) molekulaplyi (S: szimmetrikus, A: antiszimmetrikus, AO: atomplya, MO: molekulaplya)
3.2.2.
Egy vagy tbb elektron tkerl a msik atomhoz: az gy kialakult, ellenttesen tlttt ionok
kztt elektrosztatikus vonzs ltesl. ltalban gyengbb, mint a kovalens kts (100-400
kJ/mol). Mindig elektromos diplus jelleg.
Kovalens kts diplusmolekulk (klnnem tltsek kzppontja eltoldott) tmeneti jellegek a kovalens s ionos kts kztt (pl. H2O).
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
24
A biofizika alapjai
3.2.3.
Hidrognkts (H-hd)
Klcsnhat diplusmolekulk alkotta vegyletben az egy vegyrtk hidrogn kt atomhoz kapcsoldik (pl. H2O): az azonos molekuln belli oxignhez kovalens, a msik molekula oxignjhez a hidrognkts rvn. A ktsi energia jelents (12-29 kJ/mol). Kismret, nagy elektonegativits (elektronvonz kpessg), nemkt elektronprral rendelkez elem atomja szksges, amelyhez kzvetlenl kapcsoldik H-atom (7N, 8O, 9F).
1 vzmolekula egyszerre 4 H-ktst hozhat ltre (3.2.2. bra): kettt mint protondonor,
kettt mint protonakceptor.
3.2.4.
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
3. Anyagszerkezet s funkci
25
3.2.3. bra: A Van der Waals kts modellje s a ktstvolsg rtelmezse (A, B: a taszt- s a
vonzerbl szmolt potencilis energik egytthati)
3.2.5.
Hidrofb klcsnhats
Sokrszecsks rendszerek egyenslyra trekvse az entrpianvekeds (S 0) vagy rendezetlensg irnyba mutat: a vzmolekulk kizrjk a hidrofb molekulkat a rendezett
hatrfellet cskkentse rdekben (pl. hidrofb fehrjerszek tmrlse). A biolgiai
membrn molekulinak polris csoportjai vz fel, az apolris csoportok a membrn belseje
fel fordulnak.
3.3.
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
26
A biofizika alapjai
Kovalens ktsek esetn az s, p elektronok hibridizlnak (3.3.1. bra), mely egyenrtk sp-ktseket eredmnyez. Emiatt tetraderes alakzatra jellemz ktsszg
alakul ki (nem sp3 tetrader esetn is), mely alig fgg a gyktl (3.3.1. tblzat).
CH4
CH3OH
H2NCH2COOH
H2O
NH3
HCH
HCH
CCN
HOH
HNH
109,5
109,3
111,8
104,5
107,3
A vz
fajh, kJ/kg
4,18
2,41
1,74
prolgsh, kJ/kg
2256
1110
396
olvadsh, kJ/kg
333,7
83,7
127,3
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
3. Anyagszerkezet s funkci
3.4.1.
27
A vz szerepe az l struktrkban
A vzmolekula
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
28
A biofizika alapjai
3.4.2. bra: A vz nagy diplusmomentumnak kvetkezmnyei (a) hidratci, (b) hidrognktsekbl kialakul rcs, (c) elektron-, (d) elektron- s protontranszfer lnc
3.5.
Makromolekula alegysgek
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
3. Anyagszerkezet s funkci
29
- . Ha
Karbonil-csoport (H>C=O): 1 C s 2 H helyett. Polros ketts kts: C O
Karboxil-csoport (COOH): szerves savakat felpt csoport. Vzben csak kismrtkben disszocil (COOH COO + H+).
Zsrsav: a lncban ngynl tbb C van. Teltetlen, ha kzttk van tbbszrs kts, teltett, ha nincs.
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
30
A biofizika alapjai
3.5.4. bra: A zsrsavak. Az brn szerepl teltett zsrsav a sztearinsav (oktadeknsav, C18:0), a
teltetlen pedig a linolsav (oktadecndinsav, C18:2).
3.5.2.
Aminosavak
Karboxil- s amino-csoportot tartalmaznak (3.5.6a. bra), legtbbszr ugyanazon a sznatomon, melyhez ltalban H is csatlakozik (-aminosav). A maradk vegyrtket vltozatos felpts, az aminosavra jellemz csoport (R) foglalja el. A termszetben 20-fle fordul el, a legegyszerbb a glicin (Gly: R = H), ezt kveti az alanin (Ala: R = CH3).
Ikerionos szerkezetek (szilrd halmazllapotban s vizes oldatban is) a pozitv tlts
ammnium- s negatv tlts karboxilcsoport, a savas karboxilcsoport s a bzikus
aminocsoport klcsnhatsa kvetkeztben (3.5.6b. bra): szilrd anyagok nagyon magas
olvadsponttal (meg sem olvadnak, hanem az olvadsi hmrskleten bomlanak). Jl olddnak vzben (polros oldszer), de nem olddnak apolros szerves oldszerekben. Legtbb -aminosav optikailag aktv (kivve Gly), kt tkrkpi izomerje (L s D) lehetsges.
A fehrjept -aminosavak L-trszerkezetek s jobbra forgatnak (3.5.6c. bra).
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
3. Anyagszerkezet s funkci
31
3.5.6. bra: Az aminosavak szerkezeti kplete (a), ikerionos szerkezete (b) s trszerkezete (c)
3.5.3.
Nukleotidok
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
32
A biofizika alapjai
Bzisok: vizes oldatban lgos (alkli) reakcit adnak. Nitrognt tartalmaznak egyes
(pirimidin), v. ketts gyrben (purin). sszesen tfle tpus jelenik meg
(3.5.10. bra).
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
3. Anyagszerkezet s funkci
3.6.
33
Biolgiai makromolekulk
Az l rendszerek diverzitst (vltozatossgt) biztost vltozatos tpus, lncszer molekulk, melyekbl az lvilg kmijban alapvet 5 tpust trgyaljuk.
3.6.1.
Szacharidok
Diszacharid: kt egyszer cukor vzfelszabadulssal jr glikozidos ktssel kapcsoldik (pl.-D-glkz + -D-fruktz szacharz + H2O, 3.6.2. bra).
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
34
A biofizika alapjai
3.6.2.
Strukturlis poliszacharidok: mechanikai tmaszra/vdelemre szolglnak. Pldul a cellulz 300-3000 glkz elgazds nlkli lnca (5104-5105 molekulatmeg); aminoszrmazka a kitin; bonyolultabb szrmazkai llati szvetekben tallhatak.
Metabolikus poliszacharidok (akr 108 molekulatmeg): anyagcserben fontos
szerepk van; pl. glkz trolk: kemnyt (nvnyekben), glikogn (llatokban).
Lipidek
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
3. Anyagszerkezet s funkci
35
3.6.3. bra: A lipidek 3 f csoportja (a) foszfolipid, (b) triglicerid, (c) szteroid
3.6.3.
Fehrjk (proteinek)
Az l rendszerek f alkoti s funkcionlis anyagai (az llati szvet szrazanyag tartalmnak 75%-a fehrje). Szerkezetk: peptidktssel csatlakoz aminosavak hossz lnca
adja a lineris vagy elsdleges szerkezetet, az aminosav-sorrend hatrozza meg az adott
fehrjt. Nhny ezer aminosavbl is llhat, elkpeszt vltozatossgot biztostva.
Msodlagos szerkezet: a polipeptid lncon bell kialakul szablyos szerkezet szakaszok (3.6.4. bra), kt tpusa az -hlix s a -redzet. Az -hlix spirlisan felcsavarodott
(jobbmenet) alak, melynek vzt (kls oldalcsoportjait) hidrognktsek tartjk ssze. A
vz orientcija a spirl mentn azonos (0,15 nm / aminosav peptidktsek kztt; 0,54 nm
/ csavarmenet 3,6 aminosav / menet), a H-ktsek sorban az 1. aminosav karboxil- s a
4. aminosav aminocsoportjai kztt lteslnek.
A -redzet parallel vagy antiparallel mdon fut szlakbl ll, kzttk H-ktsekkel.
Az n. harmadlagos szerkezet (3.6.4. bra) az egy aminosavlncon bell a szablyos
s szablytalan szakaszok egymshoz viszonytott trbeli elrendezdsbl add trszerkezet (ez alapjn beszlhetnk pl. globulris vagy fibrillris fehrjkrl), melyet kovalens
diszulfid- (SS) ktsek rgztenek. A cisztein (Cys) SH csoportot tartalmaz, ezek ktdnek. Ksrletek szerint denaturldott (szthajtdott) fehrjk SS ktsei szinte mindig
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
36
A biofizika alapjai
3.6.4. bra: A fehrjk msod- s harmadlagos szerkezete (a) -hlix (mioglobin fehrje hem
csoport nlkl), (b) -red ( karboxi-peptidz A rszlete)
A fehrjk alkotta enzimek biolgiai kataliztorok (vegyi folyamat elsegtse felhasznldsuk nlkl): az l rendszer szinte sszes kmiai reakcijt mediljk (kzvettik) gy, hogy szobahmrskleten is j hatsfokkal lezajl reakcikat eredmnyeznek
(nlklk magasabb hmrsklet kellene!). A szubsztrt az az anyag, amelyen az enzim
kifejti hatst: az enzim nevt a szubsztrt (vagy termk) s a vgrehajtott reakci alapjn
kpezzk (-z): pl. szacharz szintetz, glicerinaldehid-3-foszft dehidrogenz.
Az enzimek specifikusak: csak adott reakcit (maximum reakcitpust) katalizlnak (a
nem biolgiai kataliztorok nem specifikusak!). A fehrje harmadlagos szerkezet specilis,
n. aktv centrumot eredmnyez, mely zrknt illeszkedik a szubsztrthoz mint kulcshoz (3.6.5. bra): az enzim-szubsztrt komplexben ekkor a reaktnsok olyan helyzetek,
hogy a reakci gyorsan lezajlik.
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
3. Anyagszerkezet s funkci
37
Nukleinsavak
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
38
A biofizika alapjai
Az RNS felptsben a DNS-hez hasonl, de (1) ribzt s (2) timin helyett uracilt (U)
tartalmaz, valamint (3) csak egyszeres spirlis lnc (3.6.7a. bra). Hrom alap RNS tpus
s tbb RNS csoport ismert, melyek a DNS egyik szlrl rdnak t (transzkripci) az
RNS-polimerz segtsgvel, komplementer (kiegszt) bzisprok ktdsvel (C:::G s
A::U). Minden szervezet RNS molekulk segtsgvel szintetizl fehrjket. Nhny egyszer szervezet (pl. vrusok) rktanyaga maga az RNS. Egyes RNS molekulk katalitikus tulajdonsgokkal brnak: enzimfunkci is (ribozim enzimek). Az egyes RNS tpusok:
mRNS (hrviv): lineris, vltoz hosszsg s tmeg, a sejtmagbeli DNS-ben
kdolt genetikai informci szlltsra a fehrjeszintzis helysznre, a riboszmkhoz. A sejtbeli sszes RNS tmegnek 5%-a.
rRNS (riboszomlis): az sszes RNS tmegnek 80%-a, a riboszmk felptsben
vesznek rszt (a fehrjk mellett).
tRNS (transzfer): ~75-80 nukleotidbl ll kicsi, de komplex molekulk az aminosavak riboszmkhoz szlltsra (3.6.7b. bra). Az sszes RNS tmegnek 15%-a.
Mind a 20, fehrjkben elfordul aminosavat legalbb egy specifikus tRNS kti
meg. Funkcionlisan legfontosabb 2 molekularszletk:
Aminosav-kthely (a molekula n. 3 vgn, ahol a nukleotid 3 sznatomjn
elhelyezked, OH-csoporthoz nem kapcsoldik foszft).
Templt-felismerhely (antikodon), mely az mRNS 3 nukleotidjhoz
(= 1 kodon) kapcsoldik. A kodont alkot nukleotidok sorrendjnek megfelel
specifikus tRNS ktdik a riboszmhoz, s szlltja a nvekv polipeptidlnc
soron kvetkez aminosav-egysgt. Klnbz fajok tRNS molekulinak kikristlyostott keverke rendezett kristlyszerkezetet ad, ebbl kvetkeztetheten alakjuk azonos.
Egyb RNS-csoportok (pl. kis sejtmagi snRNS, amely az RNS-tszabsban
splicing jtszik szerepet).
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
3. Anyagszerkezet s funkci
39
3.6.7. bra: Az RNS felptse (a) egyszeres spirl szerkezet, (b) tRNS
3.6.5.
Porfirinek
Szinte minden llat- s nvnyfaj ltal szintetizlt komplex, fmtartalm (Me), gyrs vegyletek (3.6.8. bra). Alegysgk a 4 szn-, valamint 1 nitrogn atomot tartalmaz
pirrolgyr. Kt legfontosabb tpusa a hemek (Me=Fe) s klorofillok (Me=Mg).
A hemek proteinkombincii: pl. hemoglobin (a vr oxignszllt pigmentje),
citokrmok (az enzimek s anyagcsere folyamatok fontos vegyletei, elektronszlltk).
A klorofillok a fotoszintzishez szksgesek (a, b, c, d tpus a nvnyben, melyek a
pirrolgyrkhz csatlakoz oldallncokban trnek el).
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
40
A biofizika alapjai
3.7.
3.7.1.
Molekulris genetika
A genetikai informci
replikci
DNS
transzkripci
(trs)
RNS
transzlci
(lefordts)
fehrje.
Ennek rtelmben a fehrje nem kdol RNS-t, s az RNS nem kdol DNS szekvencit!
Ksrleti altmasztsa van, s az Egy gn egy enzim egy funkci elmlet rsze
(minden egyes reakcispecifikus enzimet a DNS vezrel egyetlen gn segtsgvel: az
informci nemcsak a fehrjk szerkezetre vonatkozik, hanem azok szintzisnek menynyisgi / idbeli szablyozsra is; vgeredmnyben a sejtek csaknem valamennyi funkcija a DNS ellenrzse alatt ll).
3.7.2.
A genetikai kd
A genetikai kd egyrtelm[1], univerzlis[2], degenerlt[3], tfeds- s kihagysmentes bzishrmasokbl ll DNS triplet, mely mRNS kodonra (= triplet komplementer), majd
tRNS antikodonra (= kodon komplementer) rdik t.
A gnek szmos tripletet tartalmaz nukleinsav-szakaszok a kromoszmkban. A
tripletek szma = kdolt fehrje aminosav-szma + szablyoz tripletek. Az aminosavakat
egyedien[1] kdol tripletek egy-kt kivteltl eltekintve (mitokondrilis genetika) az let
sszes formjban megegyeznek[2]. 4-fle bzissal 43 = 64 triplet 20 aminosavra, vagyis a
kd redundns[3], de eltrs csak a 3. bzisban (ltygs) van, ennek szerepe a DNS hibajavts. sszesen 61 aminosavtriplet s 3 stopkodon van, startkodon nincs kln
(AUG=Met: metionin kddal kezddik minden szekvencia, ezt ksbb egy mechanizmus
eltvoltja).
A gnkifejezds (-expresszi): a szervezet sszes sejtje ugyanazzal a genetikai informcival rendelkezik. A differencilds folyamata hatrozza meg, mely sejtekben mely
gnek lpnek mkdsbe bizonyos funkcikat ellt fehrjk szintzisnek vezrlsvel.
Mr kialakult szvet sejtjeiben a csak ms szvetekben szerepet jtsz gnek inaktv llapotban vannak jelen.
3.7.3.
A DNS replikci
Barcsi, BME
3. Anyagszerkezet s funkci
41
3.7.4.
Transzkripci
A sejtmagban a DNS rtelmes (minta) szlnak egy gnnyi szakaszrl mRNS msolat
kszl (3.7.2a. bra). Erre azrt van szksg, mert a DNS nagy, gy nem jut ki a sejtmagbl
(vdelem).
Az trst (transzkripcit) az RNS-polimerz vgzi: felismeri a kezdszakaszt
(promoter), ahol a DNS-sel komplexet alkot. Ilyenkor is leolvashatv kell vlnia a DNSnek: az enzim addig halad a DNS-lncon, amg TATA szekvencihoz r, itt a DNS knnyen
despiralizldik. Az mRNS szintn 53 irnyban pl (~50 nukleotid/s), de itt nem ltest H-ktseket a DNS-mintval. Az enzim mgtt egybl zrul a ketts spirl: az pl
RNS kilg, mg a folyamat vgn teljesen le nem vlik a mintrl. Az trs a stopkodon
szlelsig tart.
A legyrtott (heterogn nukleris) hnRNS olyan szakaszokat (intronokat) is tartalmaz,
amire nincs ksbb szksg: rsi folyamat sorn vlik mRNS-s. Ez az n. splicing
snRNS segtsgvel (3.7.2b. bra). Az mRNS, a tRNS, s az rRNS szintzist hrom kBarcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
42
A biofizika alapjai
lnbz RNS-polimerz vgzi (I, II, s III). Intron kizrlag az mRNS kpzdshez vezet hnRNS-ekben fordul el.
3.7.5.
Transzlci
Barcsi, BME
3. Anyagszerkezet s funkci
43
jabb transzportra), a msodik pedig a dipeptiddel tkltzik a P kthelyre: a riboszma jabb kodonnal elmozdul.
Terminci: Ha stop-kodon kerl az A kthelyhez, a tRNS nem tud kapcsoldni.
A riboszmhoz ktd felszabadt faktor fehrje szleli a stop-kodont, s az
utols aminosav beplse utn a polipeptidlncot levlasztja az utols tRNS-rl.
Egy mRNS-hez egyszerre tbb riboszma is ktdhet poliriboszma azaz egyszerre egy mRNS-rl tbb fehrjelnc is szintetizldhat: prhuzamos szintzis.
3.7.6.
Az jabb eredmnyek figyelembe vtelvel mdostott ttel (3.7.4. bra) szerint brmely
nukleinsav replikldhat s kdolhat fehrjt, s a nukleinsavak kztt mindkt irnyban
lehetsges az informci tvitel. A fordtott trs (RNSDNS) az n. retrovrusok esetn
vgbemen folyamat. Szmos vrus mkdse pedig RNS replikcin alapul.
A DNS ltal direkt vgrehajtott fehrje-transzlcit ksrleti sejtmentes krnyezetben
mr demonstrltk. A prionok fehrjken konformci-vltozst okoznak, ami szigoran
nem tekinthet fehrjefehrje kdolsnak, de felveti a krdst, hogy lehetsges-e fehrjrl indul fordtott informciramls.
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
44
4.
A biofizika alapjai
KLCSNHATS SUGRZSSAL
A sugrzsok biolgiai hatsnak alapja az l rendszer atomjainak/molekulinak gerjesztse vagy ionizlsa energiatads : kizrlag azon rszecskk/kvantumok fejtenek ki
biolgiai hatst, amelyek rszben vagy egszben tadjk energijukat a biolgiai objektumnak (az thalad sugrzsi energia nem fejt ki biolgiai hatst).
4.1.
Fnyrzetet a ~400-760 nm (lthat, VIS) tartomny ad, tgabb rtelemben fnynek nevezzk az IR (infravrs) UV (ultraibolya), n. optikai tartomnyt. A fny- s rntgensugrzs az atommagon kvli folyamatokban (elektronok, atomok, molekulk llapotvltozsaikor) ltrejv elektromgneses sugrzs. Az optikai tartomny felosztsa a
4.1.1. tblzatban tallhat.
A radiometria az optikai sugrzst mint energit szllt folyamatot fizikai mennyisgek formjban hatrozza meg. A fotometria a fnyrzet kelt fnyt rja le az tlagos nappali emberi ltsra jellemz sznkpi fggvnnyel korriglva. A sznmrs a sznszlelshez objektven mrhet mennyisgeket rendel.
100-280 nm
280-315 nm
315-400 nm
400-760 nm
760-1400 nm
1,4-3,0 m
3-1000 m
UV-C (tvoli)
UV-B* (kzps)
UV-A (kzeli)
(lthat, VIS)
IR-A (kzeli)
IR-B (kzps)
IR-C (tvoli)
4.1.2.
Abszorpci
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
4. Klcsnhats sugrzssal
45
Gerjeszti a rendszert bizonyos frekvenciatartomnyok esetn sokkal nagyobb idllandval (megengedett optikai tmenet:108 s, metastabil llapot: 103 s). A
gerjesztsi energia fotonknt emittldik (lumineszcencia), kmiai folyamatot idz
el (fotokmiai reakci), vagy fononknt emittldik (hv alakul, termikus relaxci). Az abszorpci sorn a rendszeren thalad fny intenzitsa cskken s spektrlis sszettele is megvltozik, melynek frekvencia szerinti eloszlsa jellemz az
abszorbens rendszerre.
Fnyelektromos hatst vlt ki. Rntgen- s -sugrzs esetn jelents lehet a
Compton-szrs s prkelts.
4.1.3.
Emisszi
A biolgiai makromolekulk igen komplex, sokelektronos rendszerek. Alapvet kvantummechanikai megfontolsokkal azonban sok optikai tulajdonsguk gy pl. az abszorpcijuk egyszeren modellezhet. Az abszorpci lersa lehetsget ad a molekulk egyb
tulajdonsgainak (pl. molekulamret, vagy a foto-gerjesztett molekula emisszis folyamatainak) becslsre. A modellt az egyszersg kedvrt lineris pigment molekulkra alkalmazzuk, de az kiterjeszthet gyrs szerkezetekre s bonyolultabb molekulkra is.
Tekintsk pldaknt a 4.2.1. bra pigmentjeit. Ezek a lineris molekulk a karotinok
csoportjba tartoznak, a gymlcsk s zldsgek sznmeghatrozi (a likopin pl. a paradicsomban, a -karotin pl. a srgarpban). Ers optikai abszorpcijuk szles (~100 nm-es)
svban mrhet, maximumuk ~450 nm-en jelentkezik a -karotin s 460 nm-en a likopin
esetben. szrevehetjk, hogy mindegyik vltakozva egyszeres s ketts () ktseket tartalmaz: ezeket konjuglt ktseknek nevezzk. A molekuln bell a ketts ktsek
kvziszabad elektronjai nem vletlenszeren, hanem a konjugci ltal kijellt (lineris)
tartomnyon mozognak hasonlan a nanodrt vezethz. A konjuglt molekulaszakaszt gy kezelhetjk, mint a szakasz hosszval azonos mret potencildobozt s meghatrozhatjuk a sajtllapotait.
A molekulamret s a konjuglt szerkezet felels az erteljes sznrt: a -karotin rvidebb, gy a lthat tartomnybl a kk hullmhosszakat elnyelve a zld s vrs keverkt,
a narancssznt ltjuk. A likopin hosszabb, vagyis a zld tartomnybl tbbet nyel el, gy az
rzkelt (visszaszrt) szn vrs.
Megjegyzend, hogy a delokalizlt elektronrendszer az a kzs sajtossg, ami a lineris, a gyrs (aroms) s bonyolultabb molekulknl is a fnyabszorpci alapja. Minl
tbb -elektron vesz rszt a delokalizciban, annl hosszabb hullmhossz fnnyel gerjeszthet a legkls kt molekulaplyn kering elektron.
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
46
A biofizika alapjai
4.2.1.
Abszorpci s pigmentmret
4.2.2. bra: A konjuglt szakasz paramterei, valamint az N = 10 elektron legalacsonyabb energij llapota s sajtllapotai
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
4. Klcsnhats sugrzssal
47
Az N szm elektron legalacsonyabb energij llapota az alapllapot, ekkor a legmagasabb betlttt molekulallapot (HOMO Highest Occupied Molecular Orbital):
nHOMO ( N /2) . A kvetkez llapot teljesen res (LUMO Lowest Unoccupied
Molecular Orbital): nLUMO ( N /2 1) . Megjegyzend, hogy pl. flvezetk esetn a HOMO
llapot megfeleltethet a vegyrtksvnak, a LUMO llapot a vezetsi svnak, a kt llapot
klnbsge pedig a tiltott svnak. A Pauli-elv rtelmben az abszorpcihoz szksges minimlis energia ezen kt llapot klnbsge:
Ee
2
2
(nLUMO
nHOMO
)h2
8 m e L2
(4.1)
ahol h = 6,6261034 Js a Planck-lland, me = 9,111031 kg az elektron tmege. A kifejezs a potencildoboz sajtllapotainak (mdusainak) ismeretben kaphat, aminek felttele:
2L
,
n
(4.2)
ahol e az elektron hullmhossza s n egsz szm. Innen az elektron impulzusa s kinetikus energija:
pe2
nh
n2 h 2
.
pe
Ee
e 2 L
2 m e 8 m e L2
h
(4.3)
[( N / 2 1) 2 ( N / 2) 2 ] h 2 ( N 1) h 2
.
8 m e L2
8 m e L2
(4.4)
hc
Ee
( N 1) h 2
,
8 m e L2
(4.5)
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
48
A biofizika alapjai
4.3.
Az elz alfejezetben trgyaltuk az abszorpci folyamatt. Mi trtnik azutn, hogy a molekula elnyelt egy fotont? Az elnyelt energia milyen relaxcis folyamatokban tvozik a
rendszerbl? A Kasha ltal (1953) megfogalmazott szably szerint a gerjesztett molekula a
gerjesztstl fggetlenl gyorsan (1 ps alatt) visszatr az els gerjesztett (LUMO) llapotba sugrzsmentes tmeneteken keresztl (4.3.2. bra). Vagyis a rendszert gy tekinthetjk, hogy a sugrz tmenetek mindig a LUMO s HOMO llapotok kztt alakulnak
ki. A molekulris tmenetek energiahelyes brzolsra szolgl az n. Jablonski-diagram
(4.3.1. bra). Az albbiakban sszefoglaljuk a foto-gerjesztett molekulk lehetsges relaxcis folyamatait.
4.3.1. bra: A Jablonski-diagram (a), valamint a szinglet s triplet spinllapotok rtelmezse (b)
4.3.1.
Sugrzsmentes tmenet
Sugrzsmentes tmenet (4.3.2. bra) sorn a gerjesztett rendszer magasabb energij llapotbl a legals gerjesztett (LUMO) llapotba, illetve innen alapllapotba kerlhet
(LUMOHOMO tmenet). A LUMO llapot fl gerjesztett elektron energija vibrcis
energiv (fononn) alakul. Ennek eredmnyekppen megn a molekula bels hmrsklete, amely gyorsan (<10 ps alatt) visszatr a krnyezeti rtkre gy, hogy a h a krnyezet
fel sugrzdik. A LUMOHOMO tmenet hasonlan zajlik, de lnyegesen hosszabb, ns
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
4. Klcsnhats sugrzssal
49
4.3.2.
Lumineszcencia
A lumineszcencia olyan fnykibocsts, mely nem a fonontr rovsra, hanem egyb gerjeszts kvetkezmnyeknt jelentkezik, s azt kveten 100 ps-nl hosszabb id utn kvetkezik be. A lumineszcencia centrumok nem egy idben emittlnak: jellemz a lumineszcencia lettartam (~s nhny nap). Mivel az Ilum lumineszcens s az Iterm hmrskleti sugrzs intenzitsa kztt adott hmrskleten fennll, hogy
Ilum(T) > Iterm(T),
ezrt a lumineszcens sugrzst hidegfny-nek is nevezik. Kt alapvet lumineszcens
tmenetet klnbztetnk meg:
Fluoreszcencia (4.3.3. bra) sorn az emisszi ugyanabbl a (szinglet) spinllapotbl trtnik, amibe az elektron a gerjesztssel jutott. A fluoreszcencia idllandja ns nagysgrend. Specilis esete a ksleltetett fluoreszcencia (gerjesztett llapot metastabil llapot termikusan ismt gerjesztett llapot emisszi).
Mestersges krnyezetben a biolgiai molekulk nagy rsze jelents fluoreszcencit mutat. Termszetes krnyezetben (in vivo) azonban a fluoreszcencia nagymrtkben cskken. Egyrszt ms molekulk reabszorbeljk, msrszt a gerjesztett
molekula a szomszdos molekulnak energit vagy gerjesztett elektront adhat t.
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
50
A biofizika alapjai
A gerjeszts mdja szerint a lumineszcencia lehet: foto- (fny) / radio- (ionizl sugrzs) / katd- (gyors elektron) / kemo- (kmiai folyamat) / tribo- (mechanikai trs, drzsls) / elektro- (elektromos tr). A lumineszcencia jelensge a makromolekula vizsglat
fontos eszkze: pl. fehrjkben lumineszkl aroms aminosavak (triptofn, tirozin,
fenilalanin) krnyezettel val klcsnhatsa befolysolja a lumineszcencia jellemzit (pl.
merev struktrban 1 s lettartam).
4.3.3.
Szinglettriplet tmenet
A Pauli-elv rtelmben a molekulk legnagyobb energij HOMO elektronijait gerjeszthetjk, vagyis a rendszer ktelektronosnak tekinthet. Ktelektronos rendszerek
spinllapota ktfle lehet. Mindkt elektron spinnel rendelkezik. Az egyik elektron spinje vagy egyirny, vagy ellenttes irny a msikval, gy az ered spin S=1, vagy S=0. Az
S=0 az n. szinglet llapot, mert csak egyflekppen kaphat (4.3.1. bra): a teljes spinhullmfggvny antiszimmetrikus lesz. Az S=1 esetn az ered spin vektor hromfle orientcij lehet: MS = {+1, 0, 1}, innen a triplet elnevezs. Ekkor a teljes spinhullmfggvny brmely lineris kombincija szimmetrikus. A Pauli-elv rtelmben a
rendszer teljes hullmfggvnye antiszimmetrikus kell, hogy legyen (biztostva az elektronok eltr kvantumllapotait). Mivel az alapllapot molekula ktplyja szimmetrikus,
az n=1 alapllapot minden esetben szinglet (antiszimmetrikus spin-hullmfggvnnyel).
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
4. Klcsnhats sugrzssal
51
A szinglettriplet tmenetben (4.3.5. bra) a gerjesztett llapot molekula szinglet llapotbl triplet llapotba kerl (vagy fordtva). Ezt az tmenetet ISC-nek is nevezhetjk
(Intersystem Crossing). A triplet llapotok hossz lettartamak (ms s). Addig lteznek,
amg ers elektromostr-vltozs, vagy msik triplet llapot rendszer hatsra vissza nem
alakulnak. Ilyen pl. a triplet normlllapot oxignnel trtn reakci:
T
4.3.4.
molekula TO 2 Smolekula SO 2
Energiatranszfer
Az energiatranszfer kt molekula kztt lezajl folyamat (4.3.6. bra): a gerjesztett llapot molekula tadja energijt egy szomszdos, alapllapot molekulnak. Foton-kibocsts
nem trtnik, az energiakicserlds mechanizmusa diplusdiplus csatols. Az energiatranszfer E idllandja s E hatsfoka a csatolsra jellemz hatodik hatvny szerint
fgg a molekulk r tvolsgtl:
1
,
1 (r / R0 ) 6
E ~
r6
,
R06
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
52
A biofizika alapjai
Az energiatads igen nagy jelentsg a fotoszintzisben. Az oldott klorofill hatkonyan fluoreszkl. Nvnyekben azonban a fluoreszcencia az energiatranszfer kvetkeztben kioltdik. A fotoszintetikus egysgekben tbb szz klorofill molekula helyezkedik el
egy fehrje-komplex, az n. reakcikzpont krl. A sztszrt molekulk az n. fnybegyjt komplexek (light harvesting complexes LHC), amelyek mintegy napkollektorknt
mkdnek; a reakci centrumhoz kzelebbi pigment (Chl-a)protein komplexeket (core
proteins CP) pedig antennknak nevezik, s lnyegi feladatuk az energiatranszfer: a begyjttt energit nhny ps alatt tovbbtjk a reakcikzpont fel (4.3.8. bra). A reakcikzpont aktv eleme 2 klorofillmolekula-alegysgbl ll dimer, mely csapdallapottal
rendelkezik. Az itt megkttt energia aztn fotokmiai reakcikat tpll.
4.3.5.
Tltstranszfer
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
4. Klcsnhats sugrzssal
53
A termszetben elfordul fnyinduklt tltstranszfer-reakcira j plda a fotoszintetikus reakcikzpont, amely gy pl fel, hogy a tltseket a rekombincis lettartamnl
gyorsabban sztvlassza, gy biztostva elektronokat a tovbbi reakcikhoz.
4.4.
D ( ) I ( ) t ,
(4.6)
2. fotokmiai reakcik:
direkt
biolgiai hats szempontjbl fontos molekula gerjesztse:
mutci
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
54
A biofizika alapjai
q 1 .
(4.7)
Pldul uracilkristlyban a dimerek (4.4.1. bra) keletkezsre q(254 nm) = 0,5. A hullmhosszfgg kvantumhatsfok a hatsspektrum, mely hasonl a hatsban rsztvev molekula abszorpcis spektrumhoz (4.4.2. bra).
4.4.1.
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
4. Klcsnhats sugrzssal
55
h
6 H2O 6 CO2
(HCOH)6 6 O2 .
(4.8)
cukor
A nvnyi szervezetek kifejldse megteremtette a lehetsgt az olyan (llati) szervezetek evolcijnak, amelyek fotoszintzisre nem kpesek, st fenntartsukban azzal ellenttes folyamat, a lgzs, illetve az gets jtszik szerepet. Utbbihoz a szksges oxign a
fotoszintzissel keletkezik s vgs soron a nvnyi szerves anyagokbl nyerik az llati
szervezetek az letfenntartshoz szksges energit ( 5), illetve ezek talaktsval ptik
fel sajt szerves anyagaikat.
A nvnyek is llegeznek, st elbb lteztek a heterotrf, mint a fotoszintetizl szervezetek. A termszetben pl. a mikrobk szmra rengeteg egyb energiaforrs llt rendelkezsre a napenergin kvl (reduklt szervetlen vegyletek, 5.3.4) mindaddig, mg a
fotoszintzis mellktermke, az oxign mindent el nem oxidlt 2-2,5 millird vvel ezeltt, megvltoztatva az si oxignben szegny Fld lgkrt.
4.4.2.
Behatolsi mlysg
A fny brre gyakorolt biolgiai hatsa attl fgg, hogy a fny a behatolsi mlysg
fggvnyben (4.4.4. bra) milyen festkmolekulkban nyeldik el:
UV-C,B: vdelem az alsbb brrtegek szmra. A lgkri zon elnyeli, de a
sztratoszfrikus zonrteg elvkonyodsa, mestersges fnyforrsok miatt brpr
alakulhat ki.
UV-A,B: brpr, pigmentkpzs (melanocitk festkanyagainak fotopolimerizcija), mely UV vdelmet biztost, de rosszindulat brdaganatok is kialakulhatnak.
UV-B elnyelk pl. a nukleinsavak, az aroms aminosavak s szrmazkaik (pl.
melanin).
UV-A, VIS elnyelk: hemoglobin, karotinok, bilirubin, melanin.
IR-A,B,C: az irha al is behatol, gsi srlseket okozva.
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
56
A biofizika alapjai
4.5.
A lzerfny specilis tulajdonsgai miatt biolgiai hatsai kln emltst rdemelnek. Ngy alapvet hatsmechanizmust klnbztethetnk meg.
4.5.1.
Hhatsok
A termikus hatsok a vibrcis relaxci energijbl addnak, nem specifikusak, hullmhossz-fggsk gyenge:
Biostimulci: Loklis hevts, amely sorn a szvetben csak reverzibilis kmiai
folyamatok zajlanak ~45 C-ig. A diffzi s az anyagcsere gyorsul.
Fotopirolzis: A hmrsklet emelkedsvel (60-90 C) a clszvet fehrjiben (fknt irreverzibilis) morfolgiai vltozsok jelennek meg (kicsapds fotokoagulci); dma, irreverzibilis kmiai vltozsok, helyi gs, hegeseds alakul ki.
Fotovaporizci: 100 C-on a lgy szvetekbl az inter-/intracellulris, a kemny
szvetekbl az intersticilis vz elprolog, destruktv fzistalakulst eredmnyezve: a trfogat nvekszik, a nagy szvetelemek disszocilnak, az ablatv hats ersdik (pl. fogszvet vgsnl). Magasabb hmrskleten vgbemegy a karbonizci (~150 C) s a teljes szvet elprolgsa (~300 C).
4.5.2.
A fotoplazmolzis sorn rvid (<100 s Nd:YAG, Er:YAG) impulzusok hatsra igen magas hmrsklet alakul ki s robbansszer expanzi kvetkezik be mikroszveti s molekulris szinten. A fototermolzis velejrja, amikor is a nagy elektromos trerssg s teljestmnysrsg (>1010 W/cm2) ionizl hatsra plazma alakul ki. Lgy szvetekben direkt
(foton-), kemny szvetekben termionikus (h hatsra kialakul) ionizci zajlik fnyfelvillansok s pattog hang ksretben.
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
4. Klcsnhats sugrzssal
57
A fotoplazmolzis elnye, hogy extrm nagy ablatv energia llthat el, htrnya a
plazma rnykol hatsa a clszvetre (az elektromgneses energit szuper-abszorbensknt elnyeli). Terpiban a fotoplazmolzis ritka.
4.5.3.
Fotomechanikus hats
Ionizldott szvetmolekulk hatsra akusztikus (~GPa nyoms) lkshullm keletkezik, mely sztzzza a szvetet (fotodiszrupci zzs).
4.5.4.
Fotokmiai hatsok
A fotoablci fotodekompozci sorn a szvet rvid impulzusidej (10-20 ns), nagyenergij UV sugrzs (~6,4 eV) hatsra hkpzds nlkl atomizldik (disszocildik:
CH ktsi energia 4,3 eV). Kis hatsmlysg (~1 m).
A fotodinamikus terpia PDT alapja, hogy az intravnsan bevitt fotoszenzitv anyag
(hematoporfirin szrmazk) szelektven koncentrldik a metabolikusan aktv daganatszvetben s megfelel hullmhosszsg lzerfny hatsra ebbl citotoxikus anyag szabadul fel, amely elpuszttja a daganatszvetet. A szveti hats nagymrtkben fgg a szvet
felmelegedstl: a krosods elkerlshez rvid idej, nagyenergij fotonokbl ll
lzerfnyt kell hasznlni (UV, pl. excimer lzerek hideg vgs).
4.6.
Rntgensugrzs akkor keletkezik, amikor elg nagy sebessg tlttt rszecskk (gyakorlatban elektronok) valamilyen testbe tkznek s lefkezdnek (4.6.1. bra). A primer hats az atomok gerjesztse/ionizcija, melyet kzvetett (szekunder, tercier, ) hatsok
kvetnek, melyekben a sugrzs energija ms energiafajtv alakul:
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
58
A biofizika alapjai
4.6.1.
Abszorpci
(4.9)
m =m (fotoeffektus) + m (Compton-effektus).
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
4. Klcsnhats sugrzssal
59
4.6.2.
Fotoeffektus
(4.10)
az elnyelst cskkenti).
4.6.3.
Compton-effektus
(4.11)
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
60
A biofizika alapjai
4.7.
Sugrbiolgia
Az ionizl sugrzs biolgiai hatsa s tadott energia kztt arnytalansg tapasztalhat: pl. egsz testet r 0,25 C/kg besugrzsi dzis adott id utn hallhoz vezet, mikzben
az tadott energia ~8,5 J/kg (75 kg = 640 J), amely 1 pohr vz hmrsklett mindssze
1C-kal emeln!
A fatlis elvltozs magyarzata, hogy a hats molekulris szinten jtszdik le: az
egyes letfontossg molekulk szerkezete megvltozik, gy nem kpesek normlis biolgiai feladatuk elltsra.
A krosods mrtke szerint a sugrhats lehet reverzibilis vagy irreverzibilis. Mechanizmusa szerint (4.7.1. bra) a sugrkrosods sztochasztikus (a krosods mrtke nem
dzisfgg) vagy determinisztikus (a krosods mrtke dzisfgg).
4.7.1.
Fizikai dzis
(4.12)
tankonyvtar.ttk.bme.hu
q 1 q
m V
[C/kg] .
Barcsi, BME
4. Klcsnhats sugrzssal
61
E
[J/kg Gy Gray] .
m
LET s
E
x
(4.13)
E
x
V
1 s 1
Ds
s
sm .
m
m
A m A A
sugrzs tpusa
- s rntgen-sugrzs
-sugrzs
neutronsugrzs
-sugrzs
LET, keV/m
0,310
0,515
20 50
80 250
f 0 33,7 J/C .
Az elnyelt energia fgg az anyag abszorpcis egytthatjtl. Mivel a testszvetek effektv rendszma (6C, 8O, 7N, 1H) a levegvel kzel azonos (8O, 7N), az abszorpcis viszonyok hasonlak, ez j kzelts. Korrekci:
Dszvet m,szvet 1,1 (lgy szvet)
Dlev
m, lev
3,51,3 (csont, 100 400 keV)
Nagy energij, indirekt ton ionizl sugrzs energiavesztesge nem azonos az elnyelt energival, mert a msodlagos sugrzs is nagy energij, gy kilp a trfogatelembl. Ezrt clszer megadni a kzlt dzist, amely a besugrzott egysgnyi tmeg trfogatelemben felszabadtott sszes tlttt rszecske kezdeti kinetikus energija:
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
62
A biofizika alapjai
Dk
Ek , 0
[Gy] .
m
Biolgiai dzisfogalmak
sugrzs tpusa
- s rntgen-sugrzs
elektronok (>30 keV)
elektronok (<30 keV)
lass (termikus) neutronok (<10 keV)
gyors neutronok / protonok (<10 MeV)
-sugrzs, nehz magok, hasadvnyok
wR
1
1
~1,7
35
~2
~20
wT
1.
A fiatal s osztd sejtek (pl. csontvel, alsbb brrtegek, ivarmirigyek) a legrzkenyebbek, lehetsget adva a krosan szaporod sejtek visszaszortsra (pl. rosszindulat daganatok kezelse).
szvet
ivarmirigyek
csontvel, bl, td, gyomor
br, csontfelszn
egyb szvetek
wT
0,20
0,15
0,01
0,05
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
4. Klcsnhats sugrzssal
4.8.
63
A sugrhats dzisfggse
ln
N
f ( D) ,
N0
(4.14)
Tallatelmlet
A direkt hats elmlet (target theory, Dessauer 1922) szerint sugrhats akkor kvetkezik
be, ha az ionizl rszecske eltallja a biolgiai objektumot. Ez akkor jelent tallatot (hit),
ha a rszecske eltallja a 3-dimenzis trfogatot (cltblt) s ott ionizl is. Az elmlet
vezetett a sugrdzis okozta biolgiai hatsok legtbb rszletnek feldertsre.
A legegyszerbb modell az egy cltbla, amikor az inaktivcihoz (sugrkrosodshoz) n tallat szksges. D dzis esetn a V sugrrzkeny trfogatban ltrejtt ionizcik
(tallatok) szma i. Mivel i igen nagy, azok helye egymstl fggetlen s annak valsznsge, hogy adott ionizci pp adott cltblba esik, igen kicsi: a Poisson-eloszls adja
annak Pn valsznsgt, hogy V trfogatot pp n tallat rte D dzis mellett, (V i) vrhat
rtkkel (ionizcik tlagos szma):
Pn
n
n!
(Vi) n Vi
( wD ) n wD
.
e
e
i ~ D : w V (i0 /D0 )
n!
n!
e
N0 k 0 k !
A D50 = D1/2 = D(1/2) a flhatsos dzis, amikor az objektumok fele tll. D37 = D(1/e)
dzis esetn 37% a tll. Specilisan n = 1 esetben (mr 1 tallat inaktivl) k = 0:
N
( wD ) 0 wD
N
e
e wD ln
wD .
N0
0!
N0
(4.15)
tankonyvtar.ttk.bme.hu
64
A biofizika alapjai
M = V NA,
(4.16)
ami j egyezst ad az ismert molekula- vagy polimer-alegysg tmegekkel (4.8.2. bra): pl.
ribonuklezra s miozinra = 1,3 g/cm3, Mribon-z= 30 000 g/mol; Mmio= 250 000 g/mol. A
biolgiailag aktv molekulk szles krre igaz az n = 1 feltevs. Pl. a Na-K-ATP-z enzim
molekulatmegt a vrsvrtest-membrnban elszr sugrzssal hatroztk meg hiteles
pontossggal.
Tbb target esetn mindegyikben tbb tallat szksges: a modell bonyolultabb.
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
4. Klcsnhats sugrzssal
4.9.
65
Vzaktivlsi elmlet
Radioaktv sugrzsnak kitett hg vizes oldatokban a vzmolekulk sokkal nagyobb valsznsggel ionizldnak (nagyobb szmban vannak jelen), mint az oldott anyag molekuli:
h
H2O
H2O e vz .
(4.17)
e H 2 O H OH .
A H s OH gykk kzvetlenl gerjesztssel (~7 eV 1,121018 J) s az azt kvet diszszocicival is keletkezhetnek (radiolzis). A vz gykk rekombincija H2, H2O, H2O2
molekulkat eredmnyez. A hidratlt evz elektronok kln biolgiai jelentsge, hogy
krnyezetk vzmolekulit polarizlva stabilizldnak, gy nagy tvolsgra eljutva reaglhatnak biolgiailag fontos molekulkkal ( 3.4.2).
4.9.1.
Indirekt sugrhats
R H 2
R H H
,
R H 2
R H 2 O
R H OH
R HOH
2,6
0,6
2,6 (*)
0,45
0,75
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
66
A biofizika alapjai
4.9.2.
Hgtsi effektus
Azonos besugrzsi dzis esetn a hgabb oldat oldott molekulinak nagyobb hnyada
inaktivldik (4.9.1. bra). Ennek oka, hogy az egysgnyi trfogatban oldott molekulk
szma cskken, vagyis molekulnknt tbb szabadgyk van jelen.
Adott hgts utn a sugrhats teltdik. Ekkor az oldott molekulk tvolsga annyira
megn, hogy a reaktv gykk rekombinldnak, mieltt elrnk ket.
4.9.3.
Energiavndorls
Svedberg s Brohult (1938) ~106 molekulatmeg hemocianin ris fehrjemolekulk vizes oldatt bombzta -sugarakkal, amelyek mindig pontosan kzpen trtek el! Mindig itt
eltallni valszntlen, ezrt feltteleztk, hogy a molekulnak tadott energia addig vndorol, mg kisebb ktserssg helyhez r, amit felbont. Biolgiai rendszerben energiatranszfer folyamat nem csak ionizl sugrzs hatsra jhet ltre.
Az intramolekulris energiatranszfer pontos lersa kvantumkmiai szmtsokkal trtnik, rtelmezse szerint tfed elektronhjak szintjn zajlik. A sugrzs gerjesztette
elektron az alapllapotba nem sugrzssal, hanem a szomszdos atom elektronjnak gerjesztsvel jut: a molekuln tovaterjed gerjesztsi hullm alakul ki. Ha az elektron kiszakad, helyn krnyezethez kpestpozitv tlts lyuk marad vissza, mely szintn
kpes vndorolni (lyuktranszfer). Nagyobb energij sugrzsoknl ez gyakoribb.
Az intermolekulris energiatranszfer sorn az abszorbel molekula az energit msik
molekulnak adja t. Tbb polipeptidlncbl ll fehrjemolekula esetn fordul el, leggyakrabban H gykk rvn.
4.10.
Barcsi, BME
4. Klcsnhats sugrzssal
67
A sugrzsok direkt hatst a DNS-en knny szlelni (az energiaelnyels helyn ktsfelszakads, gykkpzds), az indirekt hats viszont jval bonyolultabb. Mindkt eset okozta srlsek kategorizlhatk (4.10.1. bra):
A purin-/pirimidinbzisok funkcionlis csoportjai irreverzibilisen srlnek: a DNSduplikci sorn a lncba inkorrekt bzis pl be. Nagyobb srlsk sorn el is
tnhetnek a DNS-bl, itt bzismentes helyek keletkeznek.
A bzisokon kpzd gykk (gyktranszferrel) eljutva a dezoxiribz-foszftszter
lnchoz ott szltrst okoznak.
A srls kzvetlenl egyszl lnctrshez vezet.
Megfelel kzelsgben tbb szltrs a DNS ketts szl trshez vezet.
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
68
A biofizika alapjai
( D ) ,
va
N0
D
(4.18)
Sugrrzkenysg
Az llati s nvnyi fajok, ezen bell egyedek klnbz sugrrzkenysggel rendelkeznek (4.11.1. tblzat).
Az emlsk tllsi grbi azt mutatjk, hogy az inaktivlshoz szmos tallat kell. A
dzist nvelve a legnagyobb vltozs (meredeksg) akkor trtnik, amikor az llatok fele
elpusztul (D50, 30 napon bell: D50/30), eltte is s utna is a grbe lapos (4.11.1. bra). Ez
normlis eloszls valsznsgi vltoz eloszlsfggvnye, vagyis az eltr dzisoknl
jelentkez hats az egyedek sugrrzkenysgben lv klnbsgek (biolgiai variabilits) s nem a tallatok vletlen eloszlsnak eredmnye.
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
4. Klcsnhats sugrzssal
faj
kutya
majom
egr
ember
Escherichia coli
69
D50Z Gy
3-4,3
5
4-6,5
5-8
5,6
faj
denevr
leszt
amba
B. mesentericus
Paramaecium
D50, Gy
150
300
1000
1500
3000
Az egyedeken bell klnbz sejtalkotk, sejtek, szvetek s szervek sugrrzkenysge is eltr. A cskken rzkenysg sorrendjben:
(1) nyirokszvet, (2) fehrvrsejtek, csontveli retlen vrsvrsejtek, (3) gyomor-,
bl-nylkahrtya, (4) ivarsejtek, (5) br osztd rtege, (6) erek, (7) mirigyszvetek, mj, (8) ktszvet, (9) izomszvet, (10) idegszvet
A sugrzs mint fizikai hats az alapjelensgek szintjn nem specifikus, vagyis a klnbz sugrrzkenysg nem fizikai, hanem biolgiai jelleg. A rksejtek s ltalban a
gyorsan osztd sejtek rzkenyebbek, mint a lass anyagcserjek. A rntgensugarak
annl intenzvebben hatnak, minl nagyobb fok a sejtek szaporodsi kszsge, minl
hosszabb a sejtmag osztdsi peridusa s minl kevsb differencilt.
A sugrrzkenysg fgg a sejtciklustl (4.11.2. bra). Ennek oka a srlsjavt mechanizmusok sejtciklus-fgg intenzitsa (legrzkenyebb az M s G2, legkevsb az S
fzis). A sugrzs befolysolja a ciklus idbeli lefolyst (a sejtek tmenetileg a G2 fzisban llnak meg).
Patkny elhrt felttlen reflext alacsony (2,5103 C/kg) dzissal trstva feltteles
reflex alakul ki, ingere a sugrzs, vagyis a kzponti idegrendszer rzkenyen reagl a sugrzsra (Hunt s mtsai).
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
70
A biofizika alapjai
4.11.1.
A sugrzs minsge az ionizcis srsgen s thatol-kpessgen keresztl befolysolja az rzkenysget. A kemny rntgen- s -fotonok kevsb hatsosak, mint a nagyszm iont ltrehoz s rvid thosszon elnyeld -, - s neutronsugrzs (utbbi f
veszlye, hogy radioaktivitst induklhat aktivls). Kis LET esetn egyes ionizcik
egymstl messze trtnnek, a ketts lnctrs valsznsge kicsi. Nagy LET esetn a
srn bekvetkez ionizcik miatt a kromatinbeli egylpses ktszl trs valsznsge
megugrik.
Adott dzist rvidebb id alatt abszorbelva a sugrrzkenysg n (idfaktor). A dzist felaprzva bizonyos idkzkre (frakcionls, 4.11.3a. bra) a sugrrezisztencia nvelhet. Ez pl. rosszindulat daganatok gygytsban nagy jelentsg (minl tbb rszre
bontjuk a dzist minl nagyobb sznetekkel, annl kevsb veszlyes az sszdzis a biolgiai objektumra).
Anyagcsere s hmrsklet. Magasabb hmrskleten az anyagcsere fokozdik: a sugrrzkenysg n (de vannak ezzel ellenttes tapasztalok is). Lappang rtalom: pl. ktltt lehtve sugrrzkenysgk cskken. Azonban a besugrzs utn hamar felmelegtve a
besugrzs olyan eredmnyes, mintha szobahmrskleten trtnt volna, vagyis krosodshoz anyagcsere folyamatnak le is kell jtszdnia. Lassabb anyagcsere esetn a sejtciklus
(pl. osztds) lassul, tbb id van a DNS molekulris restitcijra.
Az oxign hatsa (4.11.3b. bra) leginkbb rntgen- s-sugrzs esetn tapasztalhat
s a vzaktivlsi elmlettel jl magyarzhat. Az O2 jelenlte elsegti a rekcikpes szabadgykk (klnsen a rendkvl rtalmas H2O2) keletkezst. Az O2 parcilis nyomsnak cskkentse (pl. nitrognatmoszfra) cskkenti a sugrhatst. E. coli aerob, illetve
anaerob krlmnyek kztt mutatott sugrrzkenysge kztt ~5 nagysgrend a klnbsg! A oxignhinyos (hipoxis) emlssejtek sugrrzkenysge kisebb ezt a krlmnyt
a rkos szvetek sugarazsakor is figyelembe kell venni, hiszen azok vrelltottsga rossz
(hipoxis krlmnyek).
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
4. Klcsnhats sugrzssal
71
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
72
5.
A biofizika alapjai
BIOENERGETIKA
5.1.1.
Termodinamikai alapok
Termodinamikai rendszer
kus s a szerkezeti (kmiai) energia sszege a bels energia (E, fizikai kmiban jele U),
mely llapotfggvny:
dE 0 .
(5.1)
(5.2)
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
5. Bioenergetika
73
extenzv llapotjelzk
elektromos tlts (q)
molris komponens mennyisge (i)
trfogat (V)
entrpia (S)
intenzv llapotjelzk
elektromos potencil ()
kmiai potencil (i)
nyoms (p)
hmrsklet (T)
munka
Wq = q
W = i i
WV = pV
QT = T S
(elektromos)
(kmiai)
(mechanikai)
(termikus: h)
5.1.2.
A Hess-ttel
(5.3)
(5.4)
(5.5)
(5.6a)
dH dE p d V V d p .
(5.6b)
differencilisan:
(5.7)
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
74
A biofizika alapjai
5.1.3.
Izollt rendszerben csak olyan spontn folyamatok jtszdnak le, amelyekben az egyes
klcsnhatsokat jellemz intenzv mennyisgek kiegyenltdni igyekeznek az extenzv
mennyisgek rama rvn ( 6).
A II. fttel kvantitatv megfogalmazsa az entrpia bevezetsvel (entrpia ttel)
lehetsges. Termikus klcsnhatsnl (makroszkopikus mrsek szerint) az energiaramlson kvl nem ramlik ms extenzv mennyisg. Az egysges trgyals rdekben formlis
hozzrendels:
QT T S ,
(5.8)
1 1
E1 E2
E1 .
T1
T2
T1 T2
(5.9)
Ha T1> T2, akkor az 1. rszrendszer lehl (1), ha T1< T2, akkor pedig felmelegszik (2):
(1) E1 0, ( ) 0
S 0 ,
(2) E1 0, ( ) 0
(5.10)
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
5. Bioenergetika
5.1.4.
75
Termodinamikai valsznsg
Spontn folyamatban a rendszer a legvalsznbb llapotba megy t (w = wmax). Termodinamikai egyenslyban: S = Smax, vagyis S s w kapcsolata: S = f (w). Az S extenzv
llapotjelz (1), a w valsznsgi vltoz (2):
(1) S S1 S 2
S ~ ln w S k B ln w ,
(2) w w1w2
(5.11)
dST 0
d QT
T
T 0
dW p
R
dV
dV
T
T
V
V2
w
R ln 2
V1
w1
V1,2
R
NA
( mol)
w{1,2} w{1,2}
w{1,2} (1 atom)
kB .
Velemi
N
A
w
S (ln w2 NA ln w1 NA ) NA ln 2
w1
S
S2 (V2 V1 )
S1 (V1 )
dS R ln
Egyenslyi (kr-, reverzibilis) folyamatokra S = 0. Spontn irreverzibilis folyamatokra S > 0. Krnyezetvel anyag- s energiacsert folytat l rendszerre S < 0 (valamilyen krnyezeti tnyez entrpia nvekedse rn).
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
76
A biofizika alapjai
5.2.
Potencilfggvnyek
Bels energia
(5.12)
(5.13)
E (Yi X i X i Yi ) E ( X i Yi ) .
i
X i Yi 0 .
(5.14)
5.2.2.
Entalpia
5.2.3.
Szabadentalpia
(5.15)
Barcsi, BME
5. Bioenergetika
77
H ( S , p, ) G (T , p, ) :
G ( E pV ) TS
G ( H TS ) (E pV Vp ) TS ST
( Vp | p ) ST |T .
5.2.4.
Kmiai potencil
5.2.5.
(5.16)
Tekintsnk pl. kt rszre osztott, egykomponens (nem felttlenl izollt) rendszert izobr + izoterm folyamatban:
GT , p ,1 1 1 , GT , p , 2 2 2
GT , p ,1 ( 1 2 ) 1 .
mlszm lland: 1 2
Ha 1 > 2, akkor az 1. rszbl a 2-esbe anyag ramlik (1), ha pedig 1 < 2, az 1. rszbe ramlik anyag a 2-esbl (2):
(1) 1 0, ( ) 0
GT , p 0 .
(2) 1 0, ( ) 0
(5.17)
(5.18)
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
78
A biofizika alapjai
5.2.6.
Elegyek
i i
.
i
(5.19)
Gi Gi(0)
ci
ci(0)
(5.20)
c
R T i ln (0i ) .
ci
V (0) V (1 mol).
S S A( 0) A S B( 0) B S A S B
S S A( 0) A S B( 0) B R A ln xA R B ln xB .
i
V
xi
~ xi ,
( xA M A xB M B ) /
x
[( Ei(0) pVi(0) TSi(0) ) R T ln x (0i ) ] i
i A, B
i i
i A, B
tankonyvtar.ttk.bme.hu
i i( 0) R T ln
xi
.
1
Barcsi, BME
5. Bioenergetika
79
5.3.
Az l szervezet energiaforgalma
Az lvilg kzvetve vagy kzvetlenl a Nap sugrz energijt hasznlja fel. Az llatvilg a sznhidrtok, zsrok, fehrjk lebontsakor felszabadul szabadenergit hasznlja.
A termodinamika I. fttele biolgiai folyamatokra is rvnyes. A biokalorimter olyan
a krnyezettl lehetsg szerint izollt rendszer, amelyben az llat letfelttelei rvidtvon biztostottak. Ebben a kezdeti s j egyensly belltakor mrthmrskletek klnbsgt az llat htermelse okozza, mely a mrsek szerint arnyos a felvett tpllk energiatartalmval. A mdszerrel az energia megmarads elve 0,2% pontossggal igazolhat.
Embereken indirekt kalorimetrit alkalmaznak, ami O2-fogyaszts s/vagy CO2kibocsts mrsn alapul alapanyagcsere-vizsglat. Az 5.3.1. tblzatbl lthat, hogy az
egysgnyi oxignfogyasztsra es energia a klnbz szerves anyagok esetn kzel lland, vagyis ez az anyagcsere j mrszma. Az alapanyagcsere nyugalmi llapotban,
~12 h hezs utn vgbemen (krlbell a szervezet vltozatlan llapotban tartshoz
szksges) anyagcsere, mely 70 kg-os felnttre ~7100 kJ / 24 h = 82 W. Az tlagember
huzamos munkavgzskor ~74 W teljestmnyre kpes, ez ~2664 kJ / 10 h / nap, amely
= 47% hatsfoknak felel meg. A termodinamika II. fttele hergpre: =(T2T1)/T2,
vagyis T22T1=600 K lenne a munka befejezsekor.
A szervezetek hatsfoka sokkal jobb, mint a hergpek, vagyis a II. fttel nem alkalmazhat mivel a szervezet nem zrt rendszer. A nyitott rendszerek termodinamikja
knlja az eszkzt a modellezsre (fejld tudomnyg).
szerves anyag
sznhidrt
zsr
fehrje
alkohol
O2, liter/g
0,81
1,96
0,94
1,46
kJ/g
17,2
38,9
16,7
29,7
CO2, liter/g
0.81
1,39
0.75
0,97
kJ/liter O2
20,9
19,7
18,8
20,5
5.3.1. tblzat: Az oxignfogyaszts, a h- s szndioxid-termels, valamint az egysgnyi oxignfogyasztsra es energia klnbz szerves anyagok esetn
5.3.1.
A szervezet hhztartsa
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
80
A biofizika alapjai
A szervezet hleadsa
tankonyvtar.ttk.bme.hu
(5.21)
Barcsi, BME
5. Bioenergetika
81
(5.22)
ahol Tk a krnyezet hmrsklete. Az emberi test fellete A 1,2 m2, emisszija j kzeltssel 1. Norml T = 37 C = 310 K hmrsklet testre, Tk = 25 C = 298 K esetn
Pe 92 W. Ez a nyugalomban lv felntt ~120 W energiatermelsnek ~75%-a.
H leadhat a vz brn t s a lgzs sorn trtn prologtatsval. A hleads mrtke fgg a prologtats mrtktl, amit viszont a leveg pratartalma hatroz meg (100%
pratartalomnl nincs prolgs, mg 0% pratartalomnl a prolgs maximlis). 1 g vz
elprologtatshoz 2,4 kJ energia szksges. Izzadskor tlagosan 0,6 liter vz prolog naponta, ami 60 kJ/h hvesztsnek felel meg. Szlssges viszonyok kzepette 2 liter/h is
lehet a vzveszts, ami ~130 W leadott teljestmnynek felel meg (~4800 kJ/h). rdemes
megjegyezni, hogy a vizelettel s a szklettel is tvozik h.
Hvezets testen bell, vagy kt, egymssal (termikus) kontaktusban lv test kztt
jn ltre. Tipikusan az emberi test a krnyezetnl melegebb, gy a h a krnyez leveg,
vagy ms testek fel ramlik. A hvezetssel leadott teljestmny:
Pc
A (T 4 Tk4 )
d
(5.23)
A szervezet hszablyozsa
A szervezet hszablyozst az agy hipotalamusz rsze vgzi. A hipotalamusz gyakorlatilag a szervezet minden fontos lettani mkdst befolysolja (a hormonlis rendszer vezrlsn keresztl). Koordinlja az autonm idegrendszer s az endokrin (bels elvlaszts) rendszer mkdst, alapvet szerepet jtszik a szervezet homeosztzisnak (bels
krnyezeti sszetevk dinamikus llandsgnak) fenntartsban gy pl. a testhmrsklet szablyozsban s a testfolyadkok kzel lland sszettelnek biztostsban, valamint a tpllk- s vzfelvtel elsegtsben.
A szervezet a magas hmrskletekre a kvetkez mdokon reagl:
rtguls. A keringsi rendszer a vrplazma rvn ht is szllt. A test belsejben a
vr ht vesz fel, s a testfelszn fel szlltja. Ez a folyamat rendkvl fontos a vgtagok melegtsben (a hideg vgtag a rossz hcsere kvetkezmnye). A felletrl a
h a krnyezet fel disszipldik. Ha a testhmrsklet az optimum fl emelkedik,
tbb vr ramlik a br fel gy, hogy a brfelszni hajszlerek kitgulnak
(5.3.2b. bra). Akr a szv fell rkez vr egyharmada is tirnythat szlssges
esetben s a brn t trtn hvezets a 8-szorosra is nvelhet (a 20 C-on
mrthez kpest).
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
82
A biofizika alapjai
5.3.2. bra: A br vrkeringsnek vzlata (a) alacsony s (b) magas hmrskleteken. Az (a) bra
a libabr kialakulst is szemllteti
Barcsi, BME
5. Bioenergetika
83
Didergses htermels: a szervezet gyors vlasza hideg ingerre, mely sorn a htermels ~4-szeresre is nhet (~2-szeres oxignfogyaszts, s ~6-szoros anyagcsere
mellett). Az ide sorolhat mechanizmusok: izomtnus fokozds (izmok kemnyedse), akaratlan reszkets (a vzizomzat nem kontrolllt gyors kontrakcija
kvetkeztben), akaratlagos izommozgs, valamint a libabr (piloerekci)
(5.3.2a. bra). A libabr kialakulsval a testet krlvev szigetel lgrteg vastagsga nvelhet, ami az (5.23) szerint cskkenti a vezetssel leadott ht. llatoknl
ez a mechanizmus a bunda vagy tollazat felborzolst jelenti. A libabr tekinthet evolcis visszatekintsnek is: szrsebb seinknl bizonyosan hatkonyabban
mkdtt.
Didergsmentes htermels: minden az alapanyagcsern s didergsen kvli htermels. A hormonok arra sztnzhetik a sejt anyagcsere folyamatait, hogy ATP
szintzis helyett tbb ht termeljenek (fokozott anyagcsere). A fknt izombeli s
mjbeli zsrszvetek, rvidtv energiaraktrak (glikogn = glkz poliszacharid)
lebontsa. A barna zsrszvet felhasznlsa. Ez utbbi a zsrszvet sttebb rnyalat, erekkel bvebben elltott rgija, amely megtallhat jszlttekben s
hibernld llatokban. A sejtjeiben szmos mitokondrium van (innen a barns
szn), a zsrjaibl pedig gyorsabban s nagyobb mennyisgben szabadthat fel henergia (fleg a hiberncit kveten, vagy fiatal llatok hidegstressze alatt).
5.3.4.
Az l sejt energiaforgalma
Tekintsk a sejtet kzvetlen krnyezetvel egytt, mellyel energia- s anyagcsert folytat s egyttesen zrt rendszert kpeznek, vagyis a bels entrpia cskkensnek legalbb
akkora krnyezeti entrpia nvekeds felel meg (Schrdinger: az llnyek negatv entrpin lnek):
S k S b 0,
Barcsi, BME
Gk Gb 0 .
tankonyvtar.ttk.bme.hu
84
A biofizika alapjai
Gk H b
.
T
310 K
H b(1 g) H b /(6 12) 39 kJ/g
5.4.
Irreverzibilis termodinamika
A klasszikus egyenslyi (reverzibilis) termodinamika rvnyessge egyenslyra vezet energiatviteli lpsekbl ll folyamatokra terjed ki. Megjsolja a megzavart egyensly
eredmnyekppen ltrejv reakci irnyt, de a sebessgre nem ad felvilgostst (pl.
vgllapot elrse olyan lassan trtnik, hogy az kvzi-egyenslyi llapotok sorozatval
kzelthet).
A nem-egyenslyi (irreverzibilis) termodinamika sszekapcsolja a termodinamikai
egyenslytl val eltrs mrtkt az energiatvitel sebessgvel. ltalnos elmlete nincs,
folyamatosan s intenzven kutatott terlet. Az egyenslytl val kis eltrsekre (perturbcikra) azonban olyan egyenletrendszer fellltst teszi lehetv, amely az ramok s potencilok kztt ltalnos kapcsolatot teremt. Adott extenzv mennyisg J ramsrsge
felrhat, mint az L vezetsi egytthat s az F termodinamikai er szorzata
(5.4.1. tblzat):
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
5. Bioenergetika
85
J LF ,
(5.24)
F grad(Y ) Y .
raml extenzv
mennyisg
elektromos tlts
(dq/dt)
komponens mennyisg
(di/dt)
trfogat (dV/dt = A)
energia (dE/dt)
fenntart
potencil
Elektromos
potencil ()
kmiai potencil
ci
nyoms (p)
hmrsklet (T)
(5.25)
ramsrsg
dimenzi
trvny
Jq =
A/m2
Ohm
J = D ci
mol/(m2s)
Fick I.
JV = Vp
JE = T
m/s
W/m2
HagenPoiseuille
Fourier
Egy extenzv mennyisg ramt nemcsak a hozztartoz intenzv mennyisg inhomogenitsa, hanem elvileg a rendszerbeli sszes termodinamikai er befolysolhatja. Ezek
felelsek a kereszteffektusok kialakulsrt, amelyek teljes lerst az Onsager-fle lineris
egyenletrendszer szolgltatja. Skalris alakban az egyenletrendszer a kvetkezkppen
rhat:
J k Lkj F j .
(5.26)
Kt paramter-tpus szksges az irreverzibilis folyamatok lershoz: 1. a folyamatot indt (s fenntart) termodinamikai (vagy n. ltalnostott) er; 2. a folyamatban az
er hatsra vltoz paramter.
5.4.1.
Diszkrt rendszer
(5.27)
(5.28)
tankonyvtar.ttk.bme.hu
86
A biofizika alapjai
E E ( S ,V , i ) dE T dS p dV e,i d i ,
illetve entrpia reprezentciban:
S S ( E ,V , i ) S ( X 0 , X 1 ,...)
dS
~
1
p
dE dV e,i d i Fk d X k .
T
T
T
k
(5.29)
A termodinamikai er extenzv mennyisg transzportjt indtja el, mely jellemzse annak ramval (fluxusval) trtnik:
Ik
d X k (t )
.
dt
(5.30)
(5.31)
Az egyenlet bal oldaln az entrpia-termels sebessge, jobb oldalon megmarad mennyisgek llnak. Innen az ltalnostott erk:
~
1
d F0 d(1/ T ) 2 d T ,
T
~
1
d F1 d( p / T ) |T d p,
T
~
1
d F2 d( e,1 / T ) |T d e,1 , ...
T
5.4.2.
Folytonos rendszerek
Jk
d Ik
.
dA
(5.32)
Barcsi, BME
5. Bioenergetika
87
~
~
~
~
Fk
d Fk
gradFk Fk .
r
(5.33)
Hogyan definiljuk az entrpit nem-egyenslyi TDR-ben? Ttelezzk fel az egyenslyi egyenletek rvnyessgt: ez csak loklisan egyensly (loklis s pillanatnyi llapotjelzk mellett). Trjnk t loklis srsgekre:
Xk
dX k
dS
k , S
s s s ( E , V 1, ,i ) .
dV
dV
(5.34)
Fk
s ~
t
t
Fk (J k ) .
k (r, t )
t
(2)
div J k (r, t ) 0
t
(1)
(5.35)
~
Vegyk szre, hogy a jobb oldalon kapott mennyisg az Fk J k szorzatfggvny derivltjnak egy tagja, vagyis:
~
~
~
Fk (J k ) ( Fk J k ) Fk J k .
(5.36)
(5.37)
Az entrpia folytonossgi egyenlete szerint az entrpia-termels a loklis entrpianvekeds s a tartomnyt elhagy entrpia sszege:
~
ds s
J S Fk J k .
dt t
(5.38)
(5.39)
ahol
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
88
A biofizika alapjai
~
1
F0 (1 / T ) 2 (T ),
T
~
1
F1 T ( p / T ) p,
T
~
1
F2 T ( e,1 / T ) ( e,1 ), ...
T
5.4.3.
(5.40)
J k
~
(F j )
~
F j
~
, Lkji
2Jk
~
~
(F j ) (Fi )
(5.41)
.
~
F j ,i
~
Nagyon sok fizikai folyamat lerhat a lineris tartomnyban, ekkor csak az Lkj tag marad:
(5.42)
5.5.
(5.43)
Barcsi, BME
5. Bioenergetika
89
5.5.1.
ADP foszforil
ATP .
G 29 kJ/mol,
foszftcsoport
negatv, ami azonban nem szabadul fel hknt, hanem csoport-transzfer reakci jtszdik
le:
transzferz enzim
A - B C - D
A - C B - D .
ATP4 H2O
ADP3 HO - PO32 H .
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
90
A biofizika alapjai
5.5.2.
Fotoszintzis
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
5. Bioenergetika
91
Valban a nvnyek alkalmazkodtak volna a fny lthat tartomnyhoz? Mirt nevezzk az elektromgneses sugrzs 400780 nm kz es tartomnyt lthatnak? Vletlenl, vagy trvnyszer knyszersgbl ltjuk pp ezt a tartomnyt, s mirt ugyanezt a
tartomnyt nyelik el a nvnyek is a fotokmiai reakci elidzshez? A rvidebb hullmhossz sugrzs mr szigmaktseket hasthat fel (energija * tmenetet indukl),
azaz roncsolhatja a molekulkat, a hosszabb hullmhossz meg pp csak szrdik a molekulkon, de csak a lthat tartomny alkalmas a -elektronok (akr a rodopszin, akr a klorofillok, akr a karotinoidok, akr ms sznes molekulk) gerjesztsre (HOMOLUMO
tmenet). A knyszer a kvantummechanika, azaz esly sincs az alkalmazkodsra.
A fotoszintzis akkor hatkonyan, ha (a tbbi biokmiai folyamathoz hasonlan) trben
elklnl a sejt ms rsztl (5.5.4. bra). A fotoszintzis helyszne a szntest, melyet ketts membrnrendszer pt fel:
A kls membrn hatrozza meg az alakjt s mrett (5-10 m) s elvlasztja a
szntest vizes alapllomnyt (sztrma) a sejtplazmtl. A sztrmban zajlik a fotoszintzis stt szakasza.
A bels membrn a szntest hossztengelyvel prhuzamosan betremkedik a
sztrmba, majd ezek a bels membrnlemezek lefzdnek, magukba zrva a
membrnkzi trbl ered anyagok egy rszt, amibl a tilakoidlemezek membrnnal krlzrt tere (lumen) jn ltre, anlkl, hogy a sztrmval valaha is kapcsolatba kerlne. A tilakoid-membrn nagy fellet, gy nagymennyisg pigmentrendszert tartalmaz. A hatkony trkitlts rdekben (sztrmatilakoidokkal sszekttt) oszlopokba rendezd lapos membrnkorongokra (grnum) tagoldik, melyek felsznn a fotoszintzis fnyszakasza, a lumenben pedig tbbek kztt a
fotolzis zajlik.
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
92
A biofizika alapjai
5.5.3.
A fotoszintzis fnyszakasza
A fnyszakasz reakciegyenlete:
h
6 ( 2 H 2 O 2 NADP 3 ADP 3 Pi
2 NADPH 2 H 3 ATP O 2 ) .
A tilakoidba gyazott fehrjealap PSI, PSII fotorendszerek (5.5.5. bra) a szerkezetknek megfelel hullmhossz fny energijt elnyelik, s tovbbtjk a reakcikzpontjuk fel. A tbbletenergitl a klorofill-a elektront ad le (oxidldik), amely szlltmolekulkra kerl. A kt eltr sszettel fotorendszer kztt munkamegoszts van; mindkett
energiacsapdaknt (antenna) mkdik. Klnbsg:
A PSII ers oxidl- (P680+ [Chl-a+]) s gyenge reduklszert (P680* [Chl-a*]) termel. Redox potencilja +1,1 V, amely rtk a termszetes biolgiai rendszerekben a
legnagyobb: ez egyben a vz oxidcijnak felttele.
A PSI gyenge oxidl- (P700+) s ers reduklszert (P700*) termel (NADP+-t reduklja).
A gerjesztett llapot lettartama ~109 s, a reakcikzpont feladata, hogy ezalatt eljuttassa az elektront a szlltrendszerhez. Minthogy az elektrontranszport a H2O molekulrl
szlltja az elektronokat a NADP+-ra, tulajdonkppen a P680 s a P700 is egy-egy klnleges elektronszllt, azaz integrns rszei az elektrontranszportnak. Annyiban klnlegesek, hogy kpesek megnvelni a szlltott elektron energijt a fnyabszorpci rvn.
A kt fotorendszerbl kilpett elektronok ms-ms utat jrnak be.
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
5. Bioenergetika
93
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
94
A biofizika alapjai
A nem ciklikus elektronram. A PSI leadott elektronja rvid elektronszllt rendszerre kerl, ami oxidcis-redukcis folyamatok rvn elvezeti a vgs elektronfelvevhz (NADP+), amitl az semlegess, egy jabb elektrontl pedig negatv tltsv vlik
(NADP). A PSI-ben a folyamat sorn elektronhiny lp fel: ezt ptolni kell, mert klnben
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
5. Bioenergetika
95
5.5.4.
A sznredukcis szakasz
A fnyszakaszban kpzdtt NADPH+H+ (5.5.8. bra) s ATP molekulk mkdtetik a fotoszintzis msik nagy folyamat-egyttest a sznredukcis szakaszt, vagy Calvin-(Benson)
ciklust (5.5.9. bra): itt trtnik a glkz ellltsa:
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
96
A biofizika alapjai
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
5. Bioenergetika
5.5.5.
97
Respirci
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
98
6.
A biofizika alapjai
ANYAGCSERE S TRANSZPORT
6.1.
ramlsi jelensgek
V
[m3 /s] .
t
(6.1)
A trfogati ramerssgbl szrmaztathat a perctrfogat [liter/perc]. Pl. a vr IV meghatrozsa a kvetkez mdszerekkel trtnhet:
Dilci (hgts): a detektlhat indiktor vrramba juttatsa, majd detektlsa az
rplya ksbbi szakaszn (teljesen elkeveredve koncentrci mrsvel):
ci
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Vi
Vi
IV
.
ci t
V
Barcsi, BME
6. Anyagcsere s transzport
99
6.1.1.
A kontinuitsi egyenlet
V A t
A .
t
t
(6.2)
Relis folyadkra (pl. vr) definiljunk az adott keresztmetszetre vonatkoz tlagsebessget gy, hogy
IV A .
(6.3)
Merev cs mentn a tmegmegmarads alapjn a trfogati ramerssg lland (1). A folyadk sszenyomhatatlansgbl trfogatvltozs nincs (2). Vgeredmnyben:
I V konstans
A konstans .
V konstans
(6.4)
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
100
A biofizika alapjai
rszakasz
aorta
artrik
arteriolk
kapillrisok
vnk
venae cavae
tmr, cm
2,4
0,4
0,003
0,0007
0,4
3,4
hossz, cm
40
15
0,2
0,07
15
40
gak szma
1
160
5,7107
~1010
200
2
Assz, cm2
4,5
20
400
4500
40
18
, cm/s
23
5
0,25
0,022
2,5
6
6.1.2.
A Bernoulli-trvny
A munkattel rtelmben:
W Ek E p .
Az (A1, A2) kztti hossz folyadktest energiavltozst csak V1 s V2 adja (a
kztes tartomny kzs, gy ezek jrulka kiesik). Mivel m = V s A11 = A22:
1
1
Ek 2 ( A2 2 t ) 22 2 ( A11t )12
Ep ( A22 t ) g h2 ( A11t ) g h1
p 2 2 g h konstans ,
tankonyvtar.ttk.bme.hu
(6.5)
Barcsi, BME
6. Anyagcsere s transzport
101
6.1.3.
Relis folyadkokban a molekulk klcsnhatsa miatt az elmozdul rtegek kztt srlds lp fel, mely nem elhanyagolhat. Ennek jellemzsre szolgl a viszkozits, ().
A srlds molekulris rtelmezse:
A gzrszecskk kztt gyenge a klcsnhats, mgis van srlds: a hmozgs
kvetkeztben a lassbb rtegek rszecski a gyorsabbakat fkezik (avagy fordtva), mely impulzuscservel jr (impulzustranszport). Vgeredmnyben a hmrsklettel n.
A folyadkmolekulk egymshoz kzelebb vannak, gy a klcsnhats miatt rvidtv rendezettsg alakul ki. Az elcsszst a kialakul hibahelyek (lyukak) teszik lehetv, melyek koncentrcija a Boltzmann-eloszlst kveti. Vgeredmnyben a
viszkozits a hmrsklettel cskken: ~ 1/exp[E/(kBT)].
A Newton-fle srldsi trvny alkalmazsa pl. skprhuzamos lemezek kztti folyadk mozgsra (6.1.5. bra): mekkora ervel lehet a nyugv als lemeztl kis tvolsgra
lv, A fellet fels lemezt d sebessggel elcssztatni?
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
102
A biofizika alapjai
F = Fs = lland,
F A
d
, [Pa s] .
dh
(6.6)
Az egyszer folyadkok (vz, ~vizelet) newtoninak tekinthetk: = lland. Az sszetett folyadkok nem newtoniak (pl. vr): = (). sszehasonltsul nhny anyag viszkozitst a 6.1.2. tblzat foglalja ssze.
anyag
, mPas (20 C)
leveg
vz
etanol
vr
glicerin
mz
6.1.4.
ramls csvekben
Hatrozzuk meg az viszkozits folyadk sebessgprofiljt vges (nem tl nagy) tmrj hengerszimmetrikus csben (6.1.6. bra): az r sugar, d hossz folyadkhenger ramlst a vglapjain p1 > p2 nyoms hajtja, a srlds fkezi. Stacionrius esetbenF = 0:
d p p2 p1 0 d p (r 2 ) (2r d)
dr
d
dp
r Kr
d r 2 d
K 2
r .
2
1
KR 2
2
1
dp
K (R2 r 2 )
(R2 r 2 ).
2
4 d
(6.7a)
(r R ) 0 0
tankonyvtar.ttk.bme.hu
(6.7b)
Barcsi, BME
6. Anyagcsere s transzport
103
IV dA ( 0 2 Kr 2 )(2r ) dr 0 R 2 4 R 4 K 2 0 R 2
1
2 0 .
IV
R2 dp
dp
R4
JV
V p .
dp
RV
8 d
8 d
(6.8)
Az Ohm-trvny analgijra kiszmolhatjuk a sorba, illetve prhuzamosan kapcsolt csvek ered ramlsi ellenllst:
R V R V ,i ,
i
1
1
.
R V ||
R
V ,i
i
(6.9)
A keringsi rendszer
A vr nem newtoni folyadk s szvhez kzel ramlsa nem stacionrius (de tvolabb kzelten igen). Ennek ellenre a HagenPoiseuille-trvny mgis j kzelts az rplya
adott (kzel stacionrius) szakaszain!
Az R4 fggs kvetkezmnyei:
Az tmrvel a szervek vrelltsa hatkonyan szablyozhat.
De pl. relmeszeseds esetn, ha az tmr cskken, sokkal nagyobb vrnyoms
kell ugyanakkora ramerssg fenntartshoz!
A nagyvrkr prhuzamosan ltja el vrrel a szerveket (azokon a nyomsess azonos),
vagyis a teljes vrram a szervek ellenllsnak fggvnyben oszlik meg (elektromos
ramkri modell):
A fokozott vrelltst ignyl szervet ellt erek keresztmetszete n.
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
104
A biofizika alapjai
A szv bal kamrjban kialakul nyomsklnbsg pmax = 1316 kPa, mely kzel lland rtk (ahogy annak 1 idtartama is, 6.1.7. bra), de az tlagos nyomsklnbsg ersen
fgg a2 sznetarnytl: ez a szvfrekvencival jl szablyozhat. A nagyvrkr vgn, a
jobb pitvarba torkoll vnkban p ~ p0.
1
n
2 .
R V || ~
2
nA
Assz
Assz n A
1
A2
n
1
R V || R V
RV ~
(6.10)
Barcsi, BME
6. Anyagcsere s transzport
105
A vrramls nem mindentt stacionrius, hanem pulzl. Az ramlsi cs rugalmassga fontos: az aorta s az artrik fala rugalmas, vagyis nyomsnvekedsre
kitgulnak (ezltal tbb vrt vesznek fel, tovbb csillaptjk a pillanatnyi nyomsnvekedst). A rugalmas energia troldik, mely nyomsminimumnl visszakerl
az ramlsba. Ennek elnyei:
A szv okozta nyomsvltozsok csillaptsa.
Egyenletesebb ramls alakul ki, mely a kapillrisokban kzel lland, lehetv
tve a folytonos anyagcsert optimlis ramlsi krlmnyek kztt.
Kisebb max cskkenti a turbulencia kockzatt.
Azonos szvmunknl IV nagyobb, mint merev csnl.
6.1.6.
A szv munkja
A keringst a szv munkja tartja fenn a gravitci, a negatv mellri nyoms (nagyvnk
szvhatsa) s leveg nyomsa ellenben. Elernyedskor a billentyk gtoljk a visszaramlst (6.1.10. bra).
Kamra sszehzds (systole) alatt (~0,3 s) a szv ~70 cm3 vrt pumpl az aortba, vagyis
a trfogati munka (p = 12,6 kPa = 95 Hgmm):
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
106
A biofizika alapjai
WV = pV 0,9 J PV = 3 W.
A gyorstsi munka ( 40 cm/s):
1
A jobb kamra trfogati munkja a bal kamrnak ~1/5-e. Az tlagos 70 pulzus/perc rtkkel
szmolva a percenknti munkavgzs:
W = 6/5WV 76 J/perc.
Egy tlagosan 70 vig l ember szve ezek szerint ~2780 MJ munkt vgez (ami megfelel
egy ~2 tonns mhold 140 km magasba emelsnek).
6.1.7.
Turbulens ramls
,
r
(6.11)
ahol RE az n. Reynolds-szm. Pl. sima fal csre RE = 1160, rdes falra RE kisebb. Az
aortra kritikus 40 cm/s. Mivel kritikus ~ 1/r, de ~ r2, az r cskkentsvel a turbulencia
kockzata nhet!
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
6. Anyagcsere s transzport
107
6.1.8.
F Fs 6 r ,
u
(6.12)
(6.13)
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
108
A biofizika alapjai
F Fs A
d
( 4 r 2 ) 4 r .
dh
r
Turbulencia kialakulsa. A dinamikus nyomsbl a gmbre Ft fkezer hat, melynek ellenereje ahhoz kell, hogy a feltorldott kzeget adott sebessgre gyorstsa. Az az ramls
stabilizldik, aminl a srlds nagyobb:
1
2
2
12
Ft 2 (r )
.
1 kritikus
6 r
Fs
r
A biolgiai rendszer molekulinak egy rsze (idlegesen) struktrhoz kttt, ennek hinyban a termikus energia fggvnyben lland mozgsban vannak. Az l szervezet
jelents rsze vz: a mozgsok legtbbszr folyadkfzisban (vizes kzeg) vagy a nagyobb
rendezettsg membrnokban (lipid fzis) trtnnek. A molekulris elmozdulsok leggyakoribb formi:
Diffzi vletlenszer Brown-mozgs (random walk, bolyongs).
Drift kitntetett irny mozgs kls ertr hatsra.
6.2.1.
A drift
Tekintsnk pl. egy ionokat tartalmaz folyadkkal teli, A keresztmetszet csvet, melynek
kt vgre U = feszltsget kapcsolunk: az E trerssg irnya a csvel prhuzamos,
amelynek hatsra ionmozgs (elektromos ram) indul el. Az m tmeg, (ze) tlts ionok
a
F z eE
m
m
drift | | | a |
J
z e
z e ( d )
E
m
m
dx
d 2
cV
cdrift .
dt d A At
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
6. Anyagcsere s transzport
109
6.2.2.
drift
F
A diffzi
A diffzi koncentrciklnbsgek hatsra, azok kiegyenltdst eredmnyez anyagramlsi folyamat. Tbbkomponens rendszer (pl. tbbfle iont tartalmaz oldat) nincs
egyenslyban, ha brmely komponensnek rszecskesrsge (koncentrcija) a rendszer
egyes rszeiben eltr. Elszigetelt, magra hagyott rendszerben teht spontn rszecskeram
indul, mely az egyensly bellst (a komponensek koncentrciinak kiegyenltdst)
eredmnyezi.
Fick I. trvnye rtelmben a diffzis rszecske- vagy anyagram (-srsg) idelis
oldat egy komponensre egy dimenziban:
IN
dN
dt
dN
d
,
N Ad t d t
dI
dn
dI
dn
dc
J D
D
,
J N N D
dA
dx
dA
NAd x
dx
(6.14)
(6.15)
Inhomogn koncentrci esetn tbb rszecske mozog a nagyobb koncentrcij helyrl a kisebb fel, vagyis ered rszecskeram alakul ki. Tetszleges x pontbeli felleten a
nem tkz (az tlagos szabad thossznl kzelebbi) rszecskk haladnak t (x) s (x)
irnyba (6.2.1. bra):
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
110
A biofizika alapjai
T , N n V n T A t
(6.16)
J N J N, J N, 6 T [ n( x ) n( x )].
Az 1/6 szorz jelzi, hogy az (x, y, z) irnyok egyenrtkek. A szabad thossz kis rtkeire:
n( x ) n ( x )
dn
dn
1
J N J N, J N, 3 T
dx
dx
1
D 3 T .
A mozgkonysggal sszevetve kapjuk az n. Einstein-sszefggst:
D T2 m
k BT .
u
3
(6.17)
k BT
.
6 r
(6.18)
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
6. Anyagcsere s transzport
rszecske
H+
(M = 1)
Na+
(23)
K+
(39)
Mg2+ (24)
Ca2+
(40)
111
D, 109 m2/s
9,31
1,33
1,96
0,71
0,79
rszecske
Cl
(35)
COOH (45)
H2O
(18)
O2
(32)
vrus (4107)
D, 109 m2/s
2,03
1,09
2,2
1,9
0,0046
Fick II. trvnye a koncentrci trbeli s idbeli vltozst kapcsolja ssze. A kontinuitsi egyenlet ltalnostsval (6.2.2. bra) t id alatt az Ax trfogatba beraml
anyagmennyisg:
J c
.
x
t
D 2 .
x
t
t
x
6.2.3.
(6.19)
Milyen messzire jut egy rszecske a kiindulsi helytl (elg hossz id alatt)? Megolds a
kvetkez felttelekkel:
2 lps kztt a tvolsg az tlagos szabad thossz, melynek megttele ideig tart.
A mozgsnak nincs kitntetett irnya: N lps utn RN sugar krt kapunk
(6.2.3. bra):
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
112
A biofizika alapjai
1
(1 cos2,i ),
n n
1
cos 2,i 0 R22 2 2 ,
n n
2 t T 3Dt .
(6.20)
A rszecskk tvolodst (sztterjedst) eloszlsfggvny rja le, pl. a normlis eloszls (1 dimenziban, 6.2.4. bra):
c ( x, t )
tankonyvtar.ttk.bme.hu
c0 x
2 x2 (t )
ex
/( 2 x2 )
x (t ) 2 Dt .
Barcsi, BME
6. Anyagcsere s transzport
113
Vegyk pldnak az emlsk vr s td kztti gzcserjt: az O2 koncentrci a tdhlyagocskkban sokkal nagyobb, mint a kzeli kapillrisok vrsvrtesteiben (a tdtl
tvoli perifris szvetekben pedig kisebb). A CO2 koncentrci fordtott, gy a gzcsere
diffzival trtnik (6.2.6. bra). Tbb hatrol rtegen is t kell haladniuk, egyttesen
~1 m diffzis tvolsgot adva. A diffzis egytthatkbl szmolt idk:
D(O2) 109 m2/s t(O2) 500 s,
D(CO2) 6109 m2/s t(CO2) 80 s.
A td-kapillrisokban a vrramls gyors, a trrszben a vrsvrtestek tlagos tartzkodsi ideje ~0,5 s. A diffzis tr specilis felptsbl add rvid tvolsg mgis hatkony gzcsert biztost.
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
114
A biofizika alapjai
6.3.
D
k1
A B
AB X .
k D
(6.21)
[ AB]
([ A][B])
k D [ A][B],
k D [ AB] ,
t
t
[ X ]
k1[ AB].
t
tankonyvtar.ttk.bme.hu
(6.22)
Barcsi, BME
6. Anyagcsere s transzport
115
(6.23)
kD
[ A][B].
k D k1
(6.24)
Ha kD << k1, akkor k2 kD: a reakci sebessge diffzikontrolllt (pl. szubsztrt csak
lassan diffundl a komplexbl). Ha az aktivlsi energia nagy, akkor k1 << kD s a reakci
aktivcikontrolllt lesz:
k2
k1k D
k1 K e ,
kD
Ke
[ AB]
,
[ A ][B]
(6.25)
l szervezetekben a gzmolekulk, ionok, egyb oldott molekulk diffzija vizes fzisban zajlik, mely tulajdonsgai jelentsen eltrnek a tiszta vz mint oldszer tulajdonsgaitl (nagyobb, loklisan vltoz , nagy makromolekula-srsg). A sejtek / organellumok
tartalmt lipid kettsrtegbl felpl, klnbz funkcij fehrjket is tartalmaz membrnok hatroljk. Ezek diffzis gtat (barrier) alkotnak. A membrnon keresztl trtn
diffzi ersen szelektv a szelektv anyagcsere biztostsra. A membrnon keresztli
anyagtranszport (mai tudsunk szerint) 3 csoportba sorolhat, (melyekrl kln fejezetben
szlunk 7.2):
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
116
A biofizika alapjai
Passzv diffzi.
Facilitlt (kzvettett) diffzi pl. inger / vlasz kzvettshez szksges ionok
(Ca2+, Na+, K+) transzportja, melyek mretk / tltsk / polros termszetk miatt
nem kpesek passzv diffzira.
Aktv transzport negatv koncentrci gradienssel szemben mkdik.
A makromolekulk szlltsa gy nem lehetsges, az ezekre szolgl biolgiai folyamatok:
Exocitzis: a plazma- s vezikulamembrn fzijval a vezikula tartalma az
extracellulris trbe rl.
Endocitzis: a membrn befzdssel extracellulris folyadkot zr be, amely sorn
intracellulris vezikula kpzdik.
6.4.1.
A fluidits (1/) biztostsra a molekulk laterlis (~107 helycsere/s) s forg mozgst, a rtegek kztt csert (flip-flop), a lipid-zsrsavlncok csapkod mozgst vgeznek (6.4.1. bra). Mindezek meghatrozzk a fontos mechanikai tulajdonsgokat (alak,
kplkenysg, deformlhatsg): lsd pl. a kapillrisokban gyorsan raml, nagy ignybevtelnek (nyrs / srlds) kitett vrsvrtesteket. Mivel azonban a foszfolipidek egyik
rtegbl a msikba trtn diffzija szinte teljessggel lehetetlen az apolros bels tr s
a polros kls molekularsz miatt (~4107 flip/s = 1 flip/h), tfordulsukat foszfolipid
transzloktor nev enzimek vgzik (flippzok s skramblzok, 7.1).
A sejtmembrnok biztostjk a biolgiai folyamatok vltozatossgt / specificitst, valamint elsdleges clpontok (vrus / allergn / baktrium / gygyszer). A specifikus felismersben / megktsben, majd biokmiai jeltovbbtsban a laterlis mozgs alapvet:
pl. biztostja az ezekben rszt vev receptor-fehrjk komplexbe rendezdst. A membrnalkotkra vonatkoz Dlaterlis diffzis egytthat:
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
6. Anyagcsere s transzport
117
Az ozmzis
6.5.1. bra: Az ozmzis jelensge. Nagymret oldott molekult (piros) s csak oldszert (kk)
tartalmaz tartlyt (balra) sszenyitva, az oldott molekula koncentrcija a teljes trfogatban kiegyenltdik (kzpen). Az oldott molekulra tjrhatatlan hrtya esetn viszont az sszenyitskor
csak az oldszer kpes azon tjutni (jobbra).
Vv ( p1 p0 )
v,1 v,2 .
v
( 0)
v ( p0 , T ) RT ln
Vv ( p 2 p 0 )
v cuk
v,1 v(0) ( p0 , T ) RT ln
v,2
(6.26)
6.5.1.
v
RT
.
ln
Vv v cuk
(6.27)
A vant Hoff-trvny
Hg oldatok ozmzisnyomsa (anyagtl fggetlenl) ugyanakkora, mint amekkort az oldott anyag az oldattal azonos trfogaton s hmrskleten gzalakban kifejtene:
p
Barcsi, BME
v
R T coldat R T ,
V
(6.28)
tankonyvtar.ttk.bme.hu
118
A biofizika alapjai
v
v cuk
cuk
cuk
ln 1
cuk
v cuk
v
v cuk
RT cuk
RT cuk
pozm
RT cuk RTcoldat .
Vv v
(V2 / v ) v
V2
6.5.2.
Anyagforgalom
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
6. Anyagcsere s transzport
119
A bels anyagforgalmak a transzportfolyamatok rdekes formi: pl. a szervezet izotnis vrbl az ozmzisnyoms ellenre hipertnis vizeletet, hipotnis nylat kpes kivlasztani. A vese kivlaszt munkjnak fiziolgiai magyarzata ma sem teljes.
6.6.1.
Gzok felvtele
i
p , p p i .
i
6.6.2.
6.6.3.
Szaporods s nvekeds
Az alapvet biolgiai folyamatok lersra az llnyek nagysgtl/fejlettsgtl fggetlen biolgiai trvnyszersg adhat. Pldul az E. coli baktrium szaporods- (egyedszm) s nvekeds- (tmeg) idfggvnye exponencilis jelleg.
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
120
A biofizika alapjai
dN
N A mf
= 2167 s1.
= 2.6106
M
dt
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
7. Biolgiai membrnok
7.
121
BIOLGIAI MEMBRNOK
7.1.
A biolgiai membrn
COO
tankonyvtar.ttk.bme.hu
122
A biofizika alapjai
7.2.
7.2.1.
Passzv diffzi
Ha adott rszecske koncentrcija klnbz a membrn kt oldaln s a membrn a rszecske szmra tjrhat, diffzi jn ltre a membrnon keresztl (7.2.1. bra):
J D
dc
D
m (cm, k cm, b )
dx
dm
(7.1)
Pm cm Pm c P c ,
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
7. Biolgiai membrnok
123
A membrnbeli cm s vizes kzegben mrt c koncentrci nem azonos (a koncentrcifggvny szakadsos a vz-membrn hatrfelleten). Stacionrius ramlsra azonban:
cm (0) cm (d m )
Pm Peffektv P .
cb
ck
(7.2)
1
c
c
x
c
.
L RT
D
J L RT
c
x
x
x
c
( 0)
RT ln ( 0)
c
J LF L
(7.3)
7.2.3.
c k Dk ( e,k )
RT
x
diff
drift
J , k J , k J , k ,
e,k ( k z k F ) 1
c k
RT
zk F
x
x
ck
x
x
J ,k Lk Fk Lk
(7.4)
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
124
A biofizika alapjai
c
z F
.
J ,k Dk k ck k
x
T
x
(7.5)
7.2.4.
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
7. Biolgiai membrnok
125
Barcsi, BME
[B (tjutott) ]
t
(7.6a)
tankonyvtar.ttk.bme.hu
126
A biofizika alapjai
(7.6b)
[ AB]
k D [B][ A]
[B][ A]
.
k D k1 k D [B] k D k1
[B]
kD
(7.7)
k1[ AB]
7.2.5.
k1[B][ A]
,
K M [B]
KM
k D k1
.
kD
(7.8)
Aktv transzport
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
7. Biolgiai membrnok
127
7.3.
Az ingerelhet membrn
Idegrendszer s idegsejt
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
128
A biofizika alapjai
7.3.2.
A szinapszis
Barcsi, BME
7. Biolgiai membrnok
129
A kmiai szinapszis (7.3.4. bra) szigoran egyirny informcitovbbtst tesz lehetv kmiai tviv anyagok (neurotranszmitterek) segtsgvel. A transzmitterek a sejttestben szintetizldnak s axonlis transzporttal kerlnek a preszinaptikus terminlisokba,
ahol membrnnal burkolt hlyagocskkban (szinaptikus vezikula) vrjk az akcis potencilt. Az akcis potencil (kalciumbelps) hatsra a vezikulk az aktv znban a sejtmembrnnal sszeolvadva felnylnak, ekkor a neurotranszmitter a szinaptikus rsbe rl. A
posztszinaptikus membrnban a transzmitterek megktsre alkalmas specilis fehrjestruktrk (receptorok) helyezkednek el: a transzmitterreceptor kapcsolds sorn az ioncsatornk kinylnak s sszetett mechanizmusok rvn a posztszinaptikus sejt elektromos
llapota (membrnpotencil, konduktancia) megvltozik (7.3.5. bra).
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
130
A biofizika alapjai
A kmiai szinapszisok kt leggyakoribb fajtja a szimmetrikus s az aszimmetrikus szinapszis: a szimmetrikus tpus ltalban gtl, az aszimmetrikus tpus ltalban serkent.
Ha a szinaptikus hats a membrnpotencil abszolt rtkt nveli (eljelesen kisebb,
mint a nyugalmi rtk), a membrn hiperpolarizldik: gtl szinapszis. Ha a hats a
membrnpotencil abszolt rtkt cskkenti (eljelesen nagyobb, mint a nyugalmi rtk),
akkor a membrnt depolarizlja: serkent szinapszis (7.3.5. bra).
Amikor a sejtet r (serkent + gtl) hatsoktl a membrn-depolarizci nagyobb,
mint a kszbrtk, a posztszinaptikus sejtben (is) akcis potencil alakul ki: a neuronhlzaton az ingerlet sejtrl sejtre tovaterjed.
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
7. Biolgiai membrnok
7.4.
131
Elektromos jelensgek
Mreteik miatt az els ksrletek tintahal ris axonon (tbb 10 mm hossz) s preparlt
izomsejteken trtntek.
7.4.1.
Nyugalmi membrnpotencil
b ,
(7.9)
Tovbbi defincik
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
132
A biofizika alapjai
(7.10)
7.4.3.
A NernstPlanck-egyenlet megadja, hogy adott tpus ion mozgsa mekkora ered ramot
eredmnyez. A molrisrl az elektromos ramsrsgre ttrve egyetlen ionfajtra:
dc
z F d
.
J zF J zF D c
RT dx
dx
(7.11)
Mikor ll be az egyensly? Stacionrius llapotban a Nernst-egyenlet segtsgvel adhat meg: ha diffzis s drift ramok eredje zrus (7.4.2. bra), vagyis a (7.11) zrjeles
tagjaira:
dc
z F d
c
0
dx
RT dx
ck
cb
RT
d zF
R T ck
N b 0
ln .
k
zF c b
dc
c
(7.12)
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
7. Biolgiai membrnok
133
ion
Na+
K+
Ca2+
Cl
10,4
125,0
109
2,4
+59
99
+125
99
50,0
400,0
109
40,0150
+55
75
+145
6633
tankonyvtar.ttk.bme.hu
134
A biofizika alapjai
m
ln
ln
mF [Kat m ]b
nF [ Ani n ]b
(7.13)
1 [Kat m ]k 1 [ Ani n ]b
ln
ln
.
m [Kat m ]b n [ Ani n ]k
[Kat m ]
b
m [ Ani n ]b
[ Ani n ]
n
.
(7.14)
Pl. bka izomrost-membrn nyugalmi llapotban csak K+ s Cl ionok szmra tjrhat. A Donnan-szablybl:
[K ]k
[K ]b
[Cl ] b
[Cl ]k
[K ]b [Cl ]b [ Ani ]b 2
[K ]b [K ]k
2
[K ]b [K ]k [ Ani ]b [K ]b
[Cl ]b [Cl ]k
[K ]k [Cl ]k
7.4.5.
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
7. Biolgiai membrnok
135
tankonyvtar.ttk.bme.hu
136
A biofizika alapjai
A membrnkapacits fegyverzete a lipid kettsrteggel rintkez vkony (dion) extras intracellulris folyadkrteg, tltseit a benne oldott ionok szolgltatjk. Az r dielektromos llandj szigetel maga az ionokra tjrhatatlan lipid kettsrteg.
A membrnban tallhat ioncsatorna Ri ellenlls (vagy gi vezetkpessg) vezetvel modellezhet. Adott ion koncentrciklnbsge olyan koncentrcis elem, amelynek
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
7. Biolgiai membrnok
137
feszltsge (elektromotoros ereje) ppen az adott ion Nernst-potencilja: UN,i = N,i. Ekkor
a membrnon tfoly rezisztv ram:
IR = gi (Um UN,i).
(7.15)
dU m U m U rev
JC .
R A, m
dt
(7.16)
7.5.1.
NP | e RT
J
zF
e RT
Dm
zF
z F e RT
zF
dc z F c d
d RT
z F
ce
dx
dx R T d x
(7.17)
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
138
xdm
x 0
A biofizika alapjai
zF
e RT
c m ( 0) c b
cm ( d m ) ck
zF m
dx z F c e RT
Dm
J zF
( 0 ) b
(d m ) 0
ck cb
dm
zF b
e RT
zF
e RT
Dm
(7.18)
dx
7.5.2.
zF
e RT
Dm
dx
dm
zF
U
(U x )
RT
dm
Dm
m
zF
U
zF
RTd
(U x )
RTd m RT U
R
T
d
m
m
dx
1 .
e
e
Dm zFU
Dm zFU
ck cb e RT
J zF
zF
RTd m RT U
1
e
Dm zFU
z 2 FP
(7.19)
z
ck cb e
c c e
z 2 FP b k z
z
e 1
1 e
cb 1 k e z
cb
.
z 2 FP
z
1 e
cb
,
1 e z
J be z 2 FP
c k e z
.
1 e z
(7.20)
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
7. Biolgiai membrnok
139
7.5.3.
i {K ,Na ,Cl }
Pi i z i2 F
1 e z i i
(7.21)
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
140
A biofizika alapjai
P ([K
K
1 e
y w e
.
F
1 e
(7.22)
Milyen felttelekkel lesz a membrnon keresztl foly ered ram zrus? Akkor, ha a
szmll zrus:
y we 0 e
FU
(7.23)
(7.24)
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
7. Biolgiai membrnok
141
A pumpa mkdskor 3 Na+ iont pumpl ki, egyidejleg 2 K+ iont pumpl a sejtbe:
= 1,5. Egyensly ll be, amikor a passzv s a pumpk ltal ltrehozott ionramok sszege zrus:
J Na J Na, P 0
ionokra
egyes
J J i J P 0 az
J K J K , P 0 J K J Na 0 ,
A kt feszltsg eltrse (3,1 mV) megadja, mennyivel jrul hozz a Na+-K+ pumpa a
membrnpotencilhoz (5%). Viszont: ingerlet hatsra megvltozik a membrn
permeabilitsa, miutn Na+ csatornk nyitdnak ki. Ez depolarizcihoz vezet, amit az ioncsatornk zrdsa utn az ionpumpa mkdse llt vissza az eredeti nyugalmi potencilra. Azaz az ionpumpa hozzjrulsa a nyugalmi membrnpotencilhoz a depolarizcit
kveten ennl az rtknl sokkalta nagyobb.
7.6.
Nemlineris membrn
A membrnok id- s feszltsgfgg vltozsai (akcis / szinaptikus potencil) az ingerlkeny sejtek legfontosabb jellemzi. Lersuk az ramkri modell bvtsvel trtnik,
ami ekkor a teljes membrnra vagy egyes ioncsatornkra is alkalmazhat.
7.6.1.
Fogalmak
7.6.2.
Modellek
tankonyvtar.ttk.bme.hu
142
A biofizika alapjai
Tbbszrs energiagt modell ha a csatornban tbb klcsnhat helyet is feltteleznk. Alapja a szilrdtestek (flvezetk) lersra szolgl periodikus potencil
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
7. Biolgiai membrnok
143
modell (7.6.2. bra). Elektromos tr nlkl csak diffzi, elektromos tr jelenltben diffzi s drift is jelen van.
7.6.3.
dU
gi (U U N,i ) .
dt i {K,Na,Cl}
(7.25)
Barcsi, BME
(7.26)
tankonyvtar.ttk.bme.hu
144
A biofizika alapjai
7.6.4.
A prhuzamos konduktancia modell (7.25) egyenletbl az ered membrnram az idfggs figyelembe vtelvel az albbi mdon kaphat:
I I C I K I Na I L
Cm
dU
g i (U , t ) (U U N,i ) g L (U U L ) ,
dt i {K,Na}
(7.27)
nyitott (1)
zrt (2) ,
k
21
tankonyvtar.ttk.bme.hu
P(1) y,
P(2) 1 y,
k12 ~ eU / U1 ,
k 21~ e U / U 2 .
(7.28)
Barcsi, BME
7. Biolgiai membrnok
145
(7.29)
7.6.5.
Az ingerelhet sejt ingerkszb alatti ingerlsre, vagy az izopotencilis sejt vlasza megfelel egy RC-kr feltltsi/kislsi jelleggrbjnek (7.6.6. bra). A vlasz-amplitd arnyos az ingerl jel amplitdjval hiper- (U < U0) s depolarizci (U > U0) esetn is
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
146
A biofizika alapjai
(7.6.7. bra). Az ilyen sejtek lersra a (7.27) egyenlet alkalmas, mivel a membrnra
helytl fggetlen:
I (t ) I m (t ) I C (t ) I K (t ) INa (t ) I L .
(7.30)
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
7. Biolgiai membrnok
7.7.
147
Az akcis potencil
Az akcis potencil az idegsejtek axonjn / bizonyos izom- s mirigysejtek felsznn gyorsan, lland sebessggel s amplitdval vgigterjed elektromos llapotvltozs, mely az
informcitovbbts egyik legfontosabb eleme (7.7.1. bra). Alakja, sebessge klnbz
idegsejtekben ms s ms. Az idegysg alatti akcis potencilok szma (tzelsi frekvencia) s idbeli lefutsa fggvnyben ugyanaz a neuron klnbz zeneteket (vagy azok
sorozatt) tudja tovbbtani a vele szinaptikus kapcsolatban ll sejtekhez.
7.7.1.
A Noble nevhez fzd modell a kvetkez egyszerst felttelek bevezetsvel alkalmas az idegsejtek ingerlsi tulajdonsgainak flkvantitatv (illusztratv) lersra
(7.7.2. bra):
Az ionram csak az INa ntrium- s IK kliumramtl fgg.
A tintahal risaxonban IK feszltsgfggse linerisnak tekinthet (ez nem szksgkppen igaz ms sejtekre).
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
148
A biofizika alapjai
Barcsi, BME
7. Biolgiai membrnok
149
membrn nehezen hozhat ingerletbe (relatv refrakter idszak). A nyugalmi llapot elrse utn a membrn ismt ingerletbe hozhat.
7.7.2.
A jelalak egyes szakaszai a 7.7.3. brn kvethetk. A jelalakot az elz szakaszban ismertetett folyamatok idbelisge hatrozza meg, amit most ismt sszefoglalunk ioncsatorna
szinten. Nyugalomban az ioncsatornk zrva vannak.
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
150
A biofizika alapjai
(7.31)
4 b Rb
[ / m] ,
d2
(7.32)
Barcsi, BME
7. Biolgiai membrnok
151
A kt elektrdt egymstl az elektromosan nem tkletes szigetel membrn (esetnkben az axonmembrn) vlasztja el, amit idelis kondenztorral prhuzamosan kapcsolt
ellenllssal rhatunk le. A hosszegysgre es cm membrnkapacits s rm membrnellenlls a specifikus (felleti) s a teljes mennyisgekkel kifejezve:
cm d C A, m
R
Cm
[F/m], rm A, m Rm [ m] ,
(7.33)
(7.34)
ahol ib = Ib (x, t) az rb paramteren tfoly bels (axilis) ram. A negatv eljel mutatja,
hogy a feszltsg az x-tengely irnyban cskken. Mivel a membrnon keresztl is szivrog ram, az axilis ram nem lland, hanem az i,m = I,m (x, t) hosszegysgen tfoly
(loklis) membrnram fggvnye:
ib
i , m .
x
(7.35)
r
i
.
b
b , m
, m
x
rb x 2
x 2
(7.36)
Lineris kbelre a teljes jm = Jm (x, t) membrnram-srsg a loklis ram s a hengerpalst kerletnek hnyadosa:
jm
i , m
d
(7.37)
d 2u m
.
4 b x 2
(7.38)
A membrnram-srsgre kapott (7.38) kifejezst a prhuzamos konduktancia modellel kapott (7.31) ramegyenletbe rva a hely- s idfggsre
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
152
A biofizika alapjai
d 2u m
u
C A, m m jK jNa J L .
2
4 b x
t
(7.39)
A kapott differencilegyenlettel definilt lineris kbelmodellt egsztsk ki a HH modellel gy, hogy az ionram-srsgeket a feszltsgfgg konduktancik specifikus rtkeivel adjuk meg:
d 2u m
u
C A, m m g A,i (um , t )(um U N,i ) g A, L (um U N, L ) .
2
4 b x
t i {K ,Na}
(7.40)
A (7.40) egyenlet az axon olyan aktv modellje, amely megoldsval az akcis potencil regeneratv (torzuls- s vesztesgmentes) terjedse a peremfelttelek (a kbelgeometria, a passzv membrnparamterek, a konduktancik feszltsg- s idfggvnyinek, valamint a stimulus idbeli lefutsnak) megadsa esetn kvantitatvan szmolhat. A
msodrend parcilis differencilegyenlet ltalnos analitikus megoldsa nem ltezik,
megoldsa tetszleges paramterek (nemcsak axon, hanem pl. bonyolultabb dendritstruktrk megadsa) esetn numerikus mdszerekkel lehetsges.
Az egyenlet megoldsa specilis esetre, az akcis potencil regeneratv terjedsnek lersra viszont megadhat. Ksrleti tapasztalatok alapjn, az akcis potencil konstans
sebessggel s amplitdval halad vgig az olyan axonon (vagy szakaszon), amelynek d
tmrje lland (7.7.1. bra). Ekkor a megolds
um ( x, t ) um [ x(t )] um ( x a t )
(7.41)
alakban kereshet, ahol a a [m/s] az n. vezetsi sebessg, amivel a kialakult potencileloszls halad. A fggvny tulajdonsga, hogy brmely x(t) = x at helyen s idben rtke az x(t=0) kezdeti rtkkel egyezik meg. Az ilyen fggvnyek id s hely szerinti derivltja a hullmegyenlettel rhat le, mely esetnkben egydimenzis:
2u m
1 2u m
.
x 2
a2 t 2
(7.42)
(7.43)
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Kd
~ d,
4 b C A, m
(7.44)
Barcsi, BME
7. Biolgiai membrnok
153
Amint lthat, az akcis potencil jelalak lland amplitdjnak fenntartsa aktv erstsi folyamatot ignyel, amit a feszltsgfgg ioncsatornk vgeznek. Az erstsi folyamat
azonban egyrszt idignyes, msrszt a nagy ioncsatorna-srsg helyeken nagy a
membrnkapacits rtke (~1 F/cm2), ami lelasstja a jel terjedst. Ennek kikszblsre kis kapacits, az extracellulris trtl jl elszigetelt szakaszok helyezkednek el az axon
mentn. A j szigetelst az n. myelin hvely biztostja, ami az axonmembrn kls oldaln helyezkedik el. Ennek eredmnyekppen mind a szivrg ram, mind a membrnkapacits lecskken utbbi tbb mint kt nagysgrendet (~5 nF/cm2). Az ilyen szakaszokon a
csatornasrsg is jval kisebb, biztostva a gyors jelterjedst. Ennek ra viszont az aktv
jelregenerls hinya, aminek kvetkeztben a jel amplitd a terjeds irnyban (exponencilisan) cskken. Ennek feloldsra a myelin hvely helyenknt az n. Ranvierbefzdseknl hinyzik, lehetsget teremtve a jelerstsre. Miutn a gyors, de csillapod s lass, de erstett jelterjeds vltakozik az axon mentn, az ilyen terjedst ugrl
(szaltatrikus) ingerletvezetsnek nevezzk (7.7.5. bra).
7.8.
Feszltsg-clamp mrstechnikk
A korbbi alfejezetek rmutattak, hogy a membrnpotencil-vltozs gy az akcis potencil htterben a membrn ionramainak megvltozsa ll, ami az ioncsatornk ionos
konduktancijnak vltozsval jellemezhet. Ennek megfelelen nagyon fontos a konduktancik meghatrozsa. Ehhez olyan mrsi sszelltsra van szksg, amely segtsgvel
a feszltsg ramfggse vagy az ram feszltsgfggse megadhat.
Amikor feszltsg ramfggst vizsgljuk, meghatrozott nagysg ramot injektlunk a sejt belsejbe (ramgenertor vagy ram-rgzts: current-clamp), s a hatsra ltrejv feszltsgvltozst mrjk (7.6.6. bra). Ekkor a sejtbe helyezett elektrda
(7.4.1. bra) mr nem csak a membrnpotencil vltozsnak szlelsre kell, hogy alkalmas legyen, hanem egyben ram injektlsra is. A loklis raminjekci kvetkezmnyeknt azonban nem csak ionram fog folyni a membrnon, hanem jelents kapacitv ram
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
154
A biofizika alapjai
is. Tovbb az alkalmazott ram nem csak a membrnon keresztl, hanem oldalirnyban is
elfolyik.
Feszltsg-rgzts (feszltsg-clamp) sorn a folyamat fordtott (7.6.6. bra). Adott
feszltsget knyszertnk a membrnra, s a membrnon tfoly ramot mrjk. A feszltsg-rgzts elnye, hogy a kezdeti rvid tranziens idintervallumtl eltekintve a feszltsgnek idbeli vltozsa nincsen, teht a kapacitv ramkomponenstl eltekinthetnk
(dUm/dt = 0), gy az ionos konduktancia tisztn idfgg vltozsa mrhetv vlik.
7.8.1.
Mrs mikroelektrdkkal
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
7. Biolgiai membrnok
7.8.2.
155
On-cell. A patch-pipetta alatti kis membrnfelletet vizsgljuk gy, hogy a potenciljt lptetjk s mrjk a rajta tfoly ramot. A pipetta keresztmetszetbl (~2 m) a specifikus konduktancia szmthat Ez a fellet oly kicsi, hogy egyetlen csatorna nylsa/zrdsa is jelents ramvltozst okoz. Egyetlen ioncsatorna adott idpillanatban nyitott vagy zrt s az llapot-tmenet igen gyors, vagyis az ramvltozs ugrsszer. Azonos
tpus csatornk esetn az ugrsok nagysga azonos, ennek alapjn egyetlen csatorna n.
elemi konduktancija () kiszmthat. Az elemi konduktancia, a nyitott llapot hossznak
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
156
A biofizika alapjai
7.8.3. bra: Egyedi, acetilkolin-vezrelt ioncsatornk patch-clamp regisztrtumai bka izomrostban (a) egyetlen csatorna rama nyugalmi membrnpotencilon; (b) az elemi ramok amplitdeloszlsa (egyetlen maximum egyfle aktv csatornatpus jelenltre utal); (c) 3 aktv csatorna
sszrama (lland elemi konduktancia esetn Um vltozsval az i elemi ram nagysga is megvltozik).
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
7. Biolgiai membrnok
7.9.
157
Az idegi informcitovbbts
Az elz alfejezetek az ingerelhet membrn alapjelensget s az akcis potencil kialakulst s terjedst trgyaltk egyetlen, illetve kt szinapszissal sszekapcsolt sejt szintjn.
Azonban az agy s az idegrendszer minden funkcijt (az rzkelt informci feldolgozsa, motoros s rzelmi vlaszok kialaktsa, informcitrols, stb.) hlzatba kapcsolt
idegsejtek klnbz csoportjai vgzik. A legalapvetbb szinten ezek a kapcsoldsok gy
kezelhetk, mint jeltovbbtsra alkalmas elektromos ramkrk. A kvetkezkben nhny
ltalnos szrevtelt tesznk a legegyszerbb ramkr, a trdreflex alapjn (7.9.1. bra).
7.9.1.
A trdreflex olyan rendszerre plda, ahol a hatst a szenzoros (rzkel) neuron s a motoros (beavatkoz, vagy effektor) neuron kzvetlen kapcsolata vezrli. A trdkalcs megtse meghzza a comb feszt izmhoz kapcsold inat, aminek hatsra a fesztizom megnylik. Ezt az informcit az izomnylst rzkel receptor fell a szenzoros neuron a
kzponti idegrendszer fel tovbbtja. A gerincvelben a szenzoros neuron kzvetlenl a
fesztizmot sszehz motorneuronra hat. Az izomsszehzs hatsra a lbszr felfel
lendl. Emellett a szenzoros neuron indirekt mdon n. interneuronon keresztl a hajltizom motorneuronjra is hatssal van. A hats gtl, ezltal megakadlyozza a hajltizom sszehzdst. A kt hats egyttesen vltja ki a reflexviselkedst.
Ez az egyszer ramkr is hrom klnbz funkcij neuront tartalmaz. Elsknt rdemes kiemelni, hogy brmilyen tpus idegsejtrl is legyen sz, mindegyik sorrendben 4
klnbz jelet generl klnbz funkcionlis terletein (7.9.2. bra):
A bemeneti komponens a stimulussal arnyos loklis jelet generl, amit receptorpotencilnak neveznk. A stimulus hathat kzvetlenl pl. a szenzoros neuron receptor terletn, vagy ms neuronok dendrit oldali szinaptikus kapcsolatain.
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
158
A biofizika alapjai
Barcsi, BME
7. Biolgiai membrnok
159
A trdreflex olyan egyszer viselkedsi forma, amelyet kt idegsejt-tpus serkent kapcsolata hoz ltre. Azonban itt is (s az idegi funkcik ms fontos jeleinl is) fontos szerepe
van a gtl kapcsolatnak. Kt alapvet gtlsi kapcsolat jhet ltre (7.9.4. bra):
Elrecsatolt (feed-forward) gtls esetn az afferens neuronok nemcsak a feszthanem a hajltizom motorneuronjait is gerjesztik mindig ellenttesen. Az ilyen
kapcsolat megnveli a hatkonysgt egy aktv gnak gy, hogy a vele ellenttesen
hat gat letiltja.
Visszacsatolt (feed-back) gtls nszablyoz, negatv visszacsatolst hoz ltre,
mely megakadlyozza, hogy az aktv g stimulusa adott kritikus maximum fl kerljn.
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
160
A biofizika alapjai
7.9.4. bra: A gtl interneuronok elrecsatolt (a) vagy visszacsatolt (b) gtlst hozhatnak ltre
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
8. rzkszervek biofizikja
8.
161
AZ RZKSZERVEK BIOFIZIKJA
8.1.
8.1.1.
Receptorok
A receptorok specilis ingerhatsra (adott fny-hullmhossz, molekula-alak, vibrci, hmrsklet, stb.) szakosodott rzkelsejtek, melyek specilis rzkszervekben (retina, csiga, zlelbimb, szaglsejt) koncentrldnak. Ingerleti llapotban a receptorhoz kapcsold idegsejt
tzel (akcis-potencil sorozatot generl): az idegrost az gy kdolt informcit a gerincvelbe/agyba tovbbtja.
A receptorok tpusait az rzkelt inger, vagy elhelyezkedsk, vagy bonyolultsguk szerint csoportosthatjuk (8.1.1. tblzat).
receptor (-csoport)
fotoreceptor
kemoreceptor
fizikai/kmiai mennyisg
fny (I,)
Kmiai anyagok (c)
termoreceptor
mechanoreceptor
baroreceptor
exteroreceptor
interoreceptor
proprioceptor
ltalnos rzkszerv
specilis rzkszerv
plda
retina (szem)
zlelbimbk (nyelv), szaglsejtek (orr),
vrkoncentrci (O2, CO2) receptorok
br (mint hrzkel)
br, szr
rfal (arteria carotis)
szem, fl, orr, nyelv, br
rfali baroreceptor, izomfeszls,
fjdalomrzkel
izomors, zlet
h, tapints
szem, fl, orr, nyelv
8.1.2.
Az rzkels folyamata
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
162
A biofizika alapjai
8.1.3.
Inger s rzet
(8.1)
tankonyvtar.ttk.bme.hu
k lg
.
0
(8.2)
Barcsi, BME
8. rzkszervek biofizikja
163
k ,
0
(8.3)
ahol n rzkels fajtjra jellemz (n < 1 esetn kompresszv, n > 1 esetn expanzv fggvny). Pldul (n) rtkei: hallshangossg
(0,3),
ltsfnyessg
(0,33),
lts
hosszsgbecsls (1), hrzkelskrnyezeti hmrsklet (1), nyomsrzet (1,1), zlels (cukorra 0,8; sra 1,3), elektromos ramts (brn 3,5).
8.2.
A lts
A szem a legfontosabb rzkszervnk: az informcik ~90%-t ltssal szerezzk. Az elektromgneses spektrum ~400-800 nm tartomnya alkalmas erre a clra. Sokrt szerepet tlt be
a ltsban: optikai lekpezs; alkalmazkods a vltoz fnyintenzitsokhoz; fny elektrokmiai jel idegimpulzus talakts; a kpi informci elzetes feldolgozsa.
8.2.1.
A szem felptse a 8.2.1. brn lthat. Gmb alak, tmrje ~2,5 cm, melynek nagy rszt
az vegtest foglalja el, benne ~p +15 Hgmm = +2 kPa tlnyoms uralkodik. Az nhrtya
vlasztja el a szemet a tbbi szvettl a szervezetben, bels oldaln az rhrtyval, amely
biztostja az oxign- s tpanyag-elltst, valamint a salakanyagok elszlltst. Az rhrtya
barna pigmentjei megakadlyozzk a fnyszrdst. A szem fotoreceptor sejtjei a csapok s a
plcikk (8.2.2. bra), melyek az ideghrtyban (retina) foglalnak helyet.
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
164
A biofizika alapjai
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
8. rzkszervek biofizikja
165
8.2.2.
A lts biofizikja
A fny mieltt elri a retint, thalad a szem klnbz optikai elemein. A kpalkots folyamatt a fizikai s geometriai optika trvnyszersgei hatrozzk meg (pl. trsi trvnyek).
A pupilla a belp rs, amelyen t a fny a szembe jut. tmrje a fnyviszonyoktl fggen vltozik, szablyozza a beraml fny mennyisgt. Ers fnynl beszkl, kevs fnynl kitgul: a kt szls llapothoz tartoz intenzitsok arnya ~1:16.
A szem optikai rendszere: szaruhrtya csarnokvz lencse vegtest. A szemlencse
grblete gy fkusztvolsga a trgytvolsgtl fggen vltoztathat, hogy les kp
keletkezzen a retinn. Vkony lencsnek tekintve a szem teljes trereje ~63 dioptria, amelyben a szaruhrtya kls fellete >40 dioptrival vesz rszt. A lencse kevsb hatkony, mivel
mindkt oldalrl hasonl trsmutatj kzegek hatroljk.
A szem elmleti felbontkpessge a diffrakci-limitlt ltszgbl szmolhat:
d ( , d ) 1,22
d pupilla
(8.4)
A trbeli pixelezettsg miatt kt pontot akkor tudunk megklnbztetni, ha azok kpe legalbb 2 pixel tvolsgra van egymstl (8.2.3. bra). A csapok tlagos mrete ~2 m (ez egy-
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
166
A biofizika alapjai
ben a pixelmret is), amelyek a fovea krnykn szorosan pakolt hatszgletes (mhsejt) alakzatban tallhatak. Ekkor a csaptvolsg (pixeltvolsg) megegyezik a pixelmrettel). Azaz,
kt pont megklnbztetshez 2P 4 m tvolsg kell. A >5 m tvolsgban lv trgyakra
akkomodlt szem reduklt modelljbl (ekkor a teljes rendszert j kzeltssel egyetlen trfellettel helyettestjk) a kptvolsg K = 17 mm. Ezekkel az adatokkal a minimlis trszg:
P ( 2 P, K )
2P
P (4 m, 17 mm) 0,85" .
K
(8.5)
8.2.3.
A plcikk ingerlett mr 1-2 foton kivltja, de ltsrzetet csak ~25 plcika egyttes ingerlse okoz (konvergencia = trbeli sszegzs + idbeli integrls). A csapok ingerkszbe nagyobb, rvidebb ideig integrlnak, konvergencijuk kisebb ennek megfelelen felbontkpessgk nagyobb.
A receptorsejtek olyan rvidek, hogy nincs szksg akcis potencilra a sejten belli jeltovbbtshoz. A retinra es fny ltal elindtott fotokmiai folyamat a receptorsejtek lland
neurotranszmitter-szekrcijt kzvetlenl modulljk. Ennek kvetkeztben a ltidegen
keresztl ingerleti hullm jut az agyba ott ltsrzetet kivltva. Az ideghrtya a kzponti
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
8. rzkszervek biofizikja
167
Eion
ne m
.
h
Efoton
Pldaknt 550 nm-es fnyre a foton energija Efoton= 3,6 eV, az ionok szma n = 106, a kivltott membrnpotencil-vltozs |m| = 60 mV (e az elemi tlts). Ennek alapjn az ersts:
AE =1,7104.
A negatv visszacsatols szerepe: a cGMP szint cskkenssel a Ca2+ szint is cskken de
ksleltetve aminek kvetkeztbena cGMP termels fokozdik. Ennek hatsra a Na+ csatornk ismt kinyitnak.
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
168
A biofizika alapjai
Ers-fny adaptci: ers megvilgtsnl olyan opszinszablyozfehrje komplex alakul ki, aminek hatsra a transzducin aktivls megsznik!
8.3.
A halls
Az emberi fl felptse
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
8. rzkszervek biofizikja
169
A kls fl kls rsze a flkagyl, mely felptse olyan, hogy a hanghullmokat optimlisan fogja fel s tovbbtja a halljraton keresztl a kzpflbe. A flkagyl a klnbz
irnyokbl rkez hangokat eltr mdon reflektlja, ezrt irny szerint eltr intenzits s
spektrum rezgs rkezik a halljratba. Vagyis a sztere halls kiegsztsben van szerepe.
A kls halljrat a dobhrtyhoz vezet, fizikailag egyik vgn zrt rezontor. Ennek
megfelelen alapmdusnak hullmhossza a halljrat hossznak ngyszerese (a nyitott vgen
csompont van):
L
Barcsi, BME
0
4
f0
a a
.
0 4 L
tankonyvtar.ttk.bme.hu
170
A biofizika alapjai
a 332 0,6 T[ C]
f 0 3,5 kHz .
T 36 C
p
, p p patm , p0 p0 20 Pa ,
p0
(8.6)
I
p 2
, I a ,[dB] 10 log a ,
Za
I a ,0
(8.7)
Z a 0 a .
A kzpfl
A dobhrtya rezgseit a hallcsontocskk (ll, kalapcs s kengyel) adjk tovbb egy kisebb
hrtyra (ovlis ablak), a bels fl fel. A kls s kzpfl kzege leveg, mg a bels fl
folyadkkal telt. A leveg (l) vz (v) hatrfelleten igen nagy a hang Ra reflexija a nagy
akusztikus-impedancia klnbsg miatt:
Z l (35 C) 1,144 kgm 3 350 ms 1
400
3
,
3
1
Zv
10 kgm 1440 ms
1,44 106
I
Z Zl
Ra l , refl v
I l , be Z v Z l
1 Ra 0,0011.
tankonyvtar.ttk.bme.hu
0,9989;
(8.8)
Barcsi, BME
8. rzkszervek biofizikja
171
Fov 1,3 p Ad
22,3 p .
Aov
Aov
Innen az intenzitsarnyokra:
Iv
p2 / Z
v 2 v 0,138 .
I l p / Z l
Vagyis az impedancia (22,3)2-szeresre transzformldik. Ezt sszevetve (8.8)-cal, az elrt
ersts 0,138/0,0011=125-szrs.
A hallcsontocskk tmege, valamint felfggeszt izmaik rugalmassga (direkcis ereje)
s bels srldsa (csillaptsi tnyezje) olyan rezgrendszert alkot, amelynek kiemelse
1 kHz-re, hatrfrekvencija 20 kHz-re esik.
8.3.3.
A bels fl
A csiga (cochlea) 2,5 fordulatos csigavonalban feltekered, folyadkkal teli cs (8.3.2. bra),
melyet hosszban a ~10 m vastag alaphrtya oszt kett. Az alaphrtya felett helyezkedik el a
csigacsatorna, amely nagy viszkozits folyadkkal van kitltve. A csigacsatornt mindkt
oldalon egy-egy tovbbi folyadktr ksri: a fels csatorna az alaphrtya felett s a dobi csatorna az alaphrtya alatt. Ez a kt jrat kevsb viszkzus folyadkkal van tltve, s a csigacscsban tallkoznak: a kt trfl kztt a folyadk kzlekedhet. A fels csatorna az ovlis
ablak membrnjnl kezddik, a dobi csatorna pedig a dobreg faln vgzdik, pontosan a
kerek ablak hrtyjnl. A csiga kitertett hossza ~35 mm.
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
172
A biofizika alapjai
A csiga- s a fels csatornt vkony, rugalmas hrtya (Reissner-) vlasztja el. A hang ltal
okozott trfogat-elmozduls a hrtya kitrst okozza, amit a folyadk az alaphrtyra visz t,
innen pedig a dobi csatorna folyadka kzvetti a kerek ablakhoz. A Reissner- s az alaphrtya teht egy temben rezeg. A kls flbl rkez hang csak az ovlis membrnt gerjeszti: a
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
8. rzkszervek biofizikja
173
fenti folyamat eredmnyekppen a kerek membrn ppen ellenkez irnyba domborodik, azaz
differencilis mdus jel keletkezik. A test keltette zaj (vrram, srlds) mindkt membrnt
egy irnyba (kzs mdusban) gerjeszti: ennek eredmnyekppen a csigban keletkez zajrezgsek amplitdja sokkal kisebb (kzs mdus elnyoms, 8.3.3. bra).
tankonyvtar.ttk.bme.hu
174
3)
4)
5)
6)
A biofizika alapjai
nk bezrdst eredmnyezi. Nyugalmi llapotban brmelyik szr (egyetlen) K+csatornjnak nyitsi valsznsge 510%.
A beraml ionok depolarizljk a szrsejtet. A csatornk zrdsa hiperpolarizcit
okoz.
A feszltsgvezrelt Ca2+-csatornk a depolarizcira kinyitnak, a Ca2+ ionok az
extracellulris trbl a sejtbe ramlanak. A hiperpolarizci a Ca2+-csatornk bezrdst eredmnyezi.
A Ca2+-koncentrci emelkedsre a vezikulk serkent neurotranszmittert rtenek a
szinaptikus rsbe. A Ca2+-koncentrci cskkensre a transzmitterleads cskken.
A serkent neurotranszmitter hatsra az afferens (elmen) neuron depolarizldik:
tzelsi frekvencija megn. A transzmitterleads cskkense a tzels frekvencijt
cskkenti.
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
8. rzkszervek biofizikja
175
8.3.5.
tankonyvtar.ttk.bme.hu
176
A biofizika alapjai
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
9. Kollektv jelensgek
9.
177
KOLLEKTV JELENSGEK
tankonyvtar.ttk.bme.hu
178
A biofizika alapjai
kal tbb felttelezsre pl, mint a kollektv fizikai rendszerek tanulmnyozsa. A biolgiai
kollektv jelensgek nhny fajtja:
rajzs csoportos, rendezett mozgs (halak, madarak, emberek, );
zaj (kls perturbci, fehr zaj) hatsra rendezetlen mozgs (pl. pnik);
hlzatok (pl. tpllklnc anyagcsere tvonalai, idegrendszer kapcsoldsai, fehrjk
reakcihlzata);
szinkronizci (a viselkeds fzisa sszehangoldik, pl. vastaps; vagy a baktriumtelep egyedei egyszerre nnek s gyorsabban, mint a szeparlt egyedek).
Lthat, hogy a kollektv jelensgek tmakrei igen szertegazak lehetnek. Ezrt ebben az anyagban egyetlen de sokoldalan hasznlhat modellt emelnk ki: a kzlekedsszer (traffic-like) mozgsokat.
9.1.
A mozgs az let egyik ismrve (2.1. fejezet). A sejtbeli molekulris transzporttl az amba
lass helyvltoztatsn t a madarak replsig, halak szsig szmtalan biolgiai megjelensi formja van. Mindnek kzs eleme, hogy a mozgkony egysg (a tovbbiakban rszecske) valamilyen energit alakt t mechanikai energiv.
A kzlekedsszer mozgsokat az klnbzteti meg minden ms mozgsformtl, hogy
mozgs (kzlekeds) valamilyen a rszecske szmra kijellt tvonalon (svon, nyomvonalon, stb.) trtnik. A kvetkezkben azokat az ltalnos alapelveket foglaljuk ssze, amelyek a biolgiai szervezds minden szintjre jellemzek. A szervezds legals szintje a molekulris motorok mozgsa (filamentumokon), ahonnan eljuthatunk egszen a kzssgben
l rovarok (pl. hangyk) s gerincesek mozgsig (adott nyomvonalon).
A biolgiai kzlekedsszer mozgsok kzl nhnyat felsorol a 9.1.1. tblzat nvekv
szervezdsi szint szerint.
mozgkony rszecske
kinezin fehrje
dinein fehrje
miozin fehrje
DNS helikz
RNS polimerz
riboszma
MMP-1
hangya
tvonal
mikrotubulusok (MT)
mikrotubulusok
aktin szl
DNS
RNS
mRNS
kollagn
feromon svny
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
9. Kollektv jelensgek
179
Olyan idfgg tvonal, amelyet a vndorl rszecske lerombolhat (pl. MMP-1 feladata szerint felemszti sajt kollagn tvonalt).
9.1.1.
Elmleti megkzeltsek
(9.1)
9.1.1. bra: Biokonvekci. A fototaxis miatt a sejtek a fny fel (felfel) sznak. Mivel srsgk nagyobb a vznl, a felsznen hidrodinamikailag instabil srsginverzi jn ltre (a). A gravitci a
sejtrtegbl vkony gakat kpez (b), amelyek elrve a feneket sztterjednek (c) s gyrket alkotnak
(d). A vzfelszn letisztul, de a fototaxis ismt felfel hajtja a sejteket (szaggatott nyl), gy folytonos
ramlsi mintzat alakulhat ki.
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
180
A biofizika alapjai
9.1.2.
Egyed-alap modellek
dv
Fkls v Fzaj (t ) .
dt
(9.2)
Gyakran kiderl, hogy a kizrlag a valdi erk nem tudjk lerni a rszecskk megfigyelt dinamikjt: ilyen esetben n. szocilis erk figyelembe vtele szksges,
amelyek definilsa igen nehz. Azt is rdemes kiemelni, hogy ezek a mozgkony alkotk aktv Brown-fle (bolyong) rszecskk.
Hibrid modell. Tekintsk a rszecskk olyan halmazt, amely U [ ( x)] potenciltrben mozog, ahol a potencilt tetszleges x helyen a rszecskk kztti kommunikcira szolgl vegylet (x) loklis srsge hatrozza meg (pl. a hangyk ltal kibocstott feromon). A newtoni modellbl ismert kzegellenllssal (ami itt adott irny
sodrdst jelent) s zajjal (pl. norml eloszls fehrzaj) kiegsztve:
x x U [ ( x)] fehr (t ) .
(9.3)
A potenciltr azonban nem statikus, hiszen a (x) loklis srsggel jellemzett rszecskk mindegyike a sajt pillanatnyi helyn kibocst egysgnyi id alatt adott g
mennyisget. A feromont D diffzis s prolgsi tnyezvel jellemezve:
2 ( x, t )
( x, t )
g ( x ) ( x, t ) .
D
t
x 2
(9.4)
Vgl a potencilfggvny alakjra is felttelezssel kell lni. Hangyk esetn egy lehetsges alak az 1/ n. kapacitssal kifejezve:
U [ ( x)] ln1
.
1
Sztochasztikus sejtautomatk. Mindkt fenti modell numerikus megoldsa a tr s id
diszkretizlst kvnja. Alternatv mdszer knlkozik gy, a modellezs kezdetn
diszkrt hely s idlpseket vezetnk be. Az elmlt vekben a mdszer igen elterjedt
gy, hogy a rendszer helyi s idbeli lptetst megfelel frisstsi szablyokkal vgezzk. Ez az eljrs a sejtautomata (CA), vagy rcs-gz (lattice-gas, LG) modell. A
modellnek tbb elnye van a biolgiai rendszerek szempontjbl. Biolgiailag relis
azt felttelezni, hogy a rszecske a loklis krnyezetre egy sor cselekedettel reagl.
Ezen magatartsi vlaszok rszletes ismeretnek hinyt a CA frisstsi szablyok
kompenzljk. Egyszerbb egy sor logikai szablyt fellltani, mint hipotetikus effektv erket definilni. Tovbb a CA s LG szimulcik nagy sebessge szmos lehet-
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
9. Kollektv jelensgek
181
sges elrendezst lefuttatsra ad lehetsget, ami egybknt lehetetlen volna. A kvetkezkben ezen modell ltalnos elveivel foglalkozunk.
9.2.
ASEP modellek
A legfontosabb transzport tulajdonsg a rszecskeram s a rszecskesrsg kapcsolata: ennek brzolsa a fundamentlis diagram (9.2.1. bra).
9.2.1. bra: TASEP fundamentlis diagram prhuzamos (a) s sorosvletlen (b) frisstssel
Az aszimmetrikus egyszer kizrs (asymmetric simple exclusion process, ASEP) egyszer rszecske ugrsi modell, amelyben a rszecskk adott valsznsggel ugrik egyik rcspontbl a msikba amennyiben az res. Az egyszer kizrs teht nem engedi meg a tbbszrsen betlttt helyeket. A modell aszimmetrikus, mert a rszecske preferlt mozgsirnynyal rendelkezik. A modell teljes defincija rdekben szksges megadni annak sorrendjt,
ahogy a loklis szablyt az egyes rcspontokra alkalmazzuk. A kt legalapvetbb frissts a
sorosvletlen s a prhuzamos:
A sorosvletlen algoritmus szerint a frisstend rcspontokat vletlenszeren vlasztjuk egyms utn.
A prhuzamos algoritmus az sszes helyet egyszerre (szinkron) frissti.
Legtbbszr egydimenzis modellt alkalmazunk, amelyben a rszecskk L helyet tartalmaz lineris tvonalon haladhatnak. Ha a mozgs csak egy irnyban megengedett, a modell
teljesen aszimmetrikus (totally ASEP: TASEP).
Legyen p annak valsznsge, hogy a rszecske a (j) helyrl a (j+1) helyre ugrik: legegyszerbb esetben a helyek tvolsga egyenl s p fggetlen a rszecske helyzettl.
Ilyen irnytott diffuzv rendszerben a peremfelttelek megadsa kritikus:
Ha periodikus peremfelttelt adunk meg, az (1) s az (L) hely szomszdoss vlik. Ekkor a fundamentlis diagramra a 9.2.1. brn lthat egzakt megolds adhat.
Nyitott hatrok esetn (9.2.2. bra) a rszecske megfelel tartlybl a (j=1) helyre
valsznsggel lphet ha az res. A (j=L) helyet elfoglal rszecske a rendszerbl
valsznsggel lphet ki. Klnbz (frisstsi) dinamikk llandsult llapotai egzaktul megkaphatk. A 9.2.3. bra fzisdiagramja az ASEP modell prototpusa.
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
182
A biofizika alapjai
9.2.3. bra: Prhuzamosan frisstett ASEP fzisdiagramja. Az egyes tartomnyok kis kpei a megfelel
srsgprofil-diagramok. A szaggatott vonal mentn a srsgprofil konstans
9.2.1.
A 9.2.3. bra szerint klnbz peremfelttelekkel 3 fzis klnthet el: (a) kis srsg
fzis ( < {, p}), (b) nagy srsg fzis ( < {, p}), s (c) a maximlis ramhoz tartoz
fzis (p < {, }). A fzisok megjelense knnyen rthet. A kis srsg (LD) fzisban az
ram csak az belpsi valsznsgtl fgg, ami kevsb hatkony, mint a transzport a
rendszer tbbi rszn gy ez a rendszer viselkedst meghatroz paramter. A nagy srsg (HD) fzisban a kimenet a szk keresztmetszet, vagyis az ram csak -tl fgg.
A maximlis ram (MC) tartomnyban a transzportcsatorna a szk keresztmetszet, vagyis az ram fggetlen lesz a bemenet s kimenet tulajdonsgaitl. Nagysgt a fundamentlis
diagram maximuma adja. Hatresetben p = 1 (szigor kizrs), amelyre egyszer sszefggsek adhatk a tmbi (vgpontoktl tvoli) srsg s ram kapcsolatra
I (1 ) ,
(9.5)
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
9. Kollektv jelensgek
183
LD ,
HD 1 ,
1
2
MC ,
I LD I ( ) (1 ),
I HD I ( ) (1 ),
(9.6)
I MC I max ( ) [ 14 ].
Tekintsnk egy nylt rendszert vletlen eloszls rszecskkkel. A rendszer komplex viselkedse kvetkeztben nemegyenslyi fzistmenetek (klnbz srsg tartomnyokat
elvlaszt domnfalak) alakulnak ki. A rendszer fizikjnak megrtsben a domnfalak s a
peremfelttelek tulajdonsgai alapvetek. Egy nagysrsg (betlttt) tartomny mrett a
domnfal mozgsa vltoztatja meg, amelynek drift- (vagy sokk-) sebessge a bemeneti paramterek fggvnye:
s .
(9.7)
Ha < , a domnfal jobbra toldik (s fordtva: 9.2.4. bra). Ha = , a fal pozcija fluktul, de nincs nett drift.
A msik fontos paramter egy adott pontban keltett loklis perturbci terjedsi sebessge
(az. n. kollektv sebessg). A kzlekedst tekintve, ha az autk srsge kicsi, a perturbci
(pl. jonnan az tra hajt aut) pozitv sebessggel haladhat (az ramls irnyba). Azonban
nagy srsg tartomnyban ez a perturbci az traml rszecskk perturbci mgtti torldst eredmnyezi (kzlekedsi dug), ami vgeredmnyben a perturbci tmegkzppontjnak negatv kollektv sebessgt eredmnyezi.
9.2.4. bra: Vletlen frissts ASEP modell domnfallal (p=1 esetben). A klnbz srsgek rzkeltetshez csak minden 10. rszecske van felrajzolva (tls vonalak). A szimulci idtartomnya
t={02000}, a rcs kiterjedse x={01000}
9.2.2.
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
184
A biofizika alapjai
9.2.5. bra: Hibahelyek smi ASEP modellekben: (a) tvonalhoz kttt hibahely (szk keresztmetszet), (b) rszecskhez kttt idfggetlen, eltr valsznsgek, (c) msik rszecskhez csatolt dinamikj hiba
9.3.
9.3.1.
Molekulris motorok
kapcsolt
1
, kapcsolt
, teljes
,
teljes
motor
rATP z [db ATP /s]
(9.8)
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
9. Kollektv jelensgek
185
ge fel haladnak (de van fordtva halad is). Az izomban tallhat konvencionlis
miozin nem processzv: a munkaciklus nagy rszben sztkapcsolt llapot
(9.3.1. bra).
Mikrotubulus alap motorok:
A dineinek lineris mozgst vgeznek mikzben rakomnyt szlltanak a
tubulusok mnusz vge fel (amely tbbnyire a sejt belseje fel irnyul).
Kinezin szupercsald: a mikrotubulus mentn a plusz vg irnyba szlltjk rakomnyukat (amely tbbnyire a sejt perifrii fel irnyul). ATP-hidrolzissel mkdnek (vagyis ATP-z enzimek).
A dinaminok az endocitzisrt felels mikrotubulus-aktivlt GTP-z enzimek, melyek tbbek kztt a vezikulk lefzdsben, transzportjban s fzijban
jtszanak szerepet.
A DNS alap motorok a DNS mentn mozdulnak el s fejtenek ki ert. Ide tartoznak a
DNS s RNS polimerzok, s pl. a vrustok-csomagol motor.
A rotcis motorok a lineris motorokkal ellenttben forg mozgst hoznak ltre.
Egyik legismertebb az ATP-szintetz enzim (5.5.8b. bra), de ide tartoznak az ostorral,
csillkkal trtn mozgsrt felels motorok is (pl. a baktrium, vagy a hmivarsejtek
halad mozgsrt felels flagellum motor).
Mechanoenzim komplexek: legfontosabb a riboszma.
tankonyvtar.ttk.bme.hu
186
A biofizika alapjai
9.3.2.
A Brown-fle kilincsmechanizmus
Egsztsk ki a (9.2) mozgsegyenletet a molekulris motort hajt kmiai potencilbl szrmaz ervel s alkalmazzuk a motor ltal szlltott rakomnyra:
m
dv
Fkls v grad{C } FBrown (t ) ,
dt
(9.9)
ahol {C } az aktulis kmiai llapothoz tartoz kmiai (szerkezeti) energia, pl. ATP-hidrolzis
esetn:
{C } {res, ATPkttt , ADP foszft, ADP} .
Vagyis (9.9) szerint a rakomnyra hromfle sztochasztikus er hat: a motor ltal kifejtett
(kmiai eredet) er, valamint a krlvev folyadktl szrmaz viszkzus kzegellenlls s
Brown-fle (termikus) er. A motorer sztochasztikus, hiszen mind hely- mind kmiai llapot
fgg. A kls er konzervatv s valamilyen kls hatstl szrmazik ilyen lehet pl. az
optikai csipesz ltal kifejtett er (csapda). A rakomnyba betpllt teljestmnyek a
9.3.2. brn lthatk, mrlegk:
PM Q ki Q be Pkls ,
PC r ( GC ),
(9.10)
(9.11)
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
9. Kollektv jelensgek
187
Br a rakomny szlltshoz szksges teljestmnyt nyilvnvalan a kmiai reakci adja, de nem egyedl felels a rakomny mozgatsrt. A viszkzus er mindig a mozgs irnyval ellenttes. Ha a motorer ppen kiegyenlti ezt a komponenst, a rakomny elre halad
kizrlag a Brown-mozgsnak ksznheten.
Tekintsnk most egy Brown-mozgst vgz rszecskt, amelyik a kzegellenllson kvl idfgg potencilteret rzkel (9.3.3. bra). A potenciltrnek periodikusan kt llapota
van: kikapcsolt s frszfog alak bekapcsolt. Kikapcsolt llapotban a rszecskre nem hat
er. A frszfog aszimmetrikus s trben is periodikus, de minden frszfog-gdrben a rszecskre hat tlagos er zrus:
1 U
U (0) U ( )
0.
dx
0 x
(9.12)
Ennek ellenre a rszecske a lanksabb lejt irnyba es halad (de zajjal terhelt) mozgst
vgezhet a kvetkezk miatt. Kikapcsolt trnl a rszecske bolyong mozgst vgez, a paszszv diffzis paramtereinek megfelelen. Ha a diffzis szabad thossza meghaladja a frszfog meredekebb szakasza hossznak ktszerest (vagy a potenciltr lassabban kapcsol
vissza, mint ahogy a profil sztterjed, a rszecske tkerlhet a potencilmaximum jobb oldalra. Bekapcsolva a teret, a rszecske mr nem kerlhet vissza az eredeti (bal oldali) potencilgdrbe. Bekapcsolt tr esetn a gdr tetszleges helyrl a rszecske a gdr aljra
driftel.
A mechanizmus rdekessge, hogy a rszecske nem a r hat erk eredjeknt mozdul el,
hanem bolyongsa kvetkeztben. Termszetesen a folyamat energiaignyes (nem egyenslyi), hiszen a teret periodikusan kapcsolni kell. Ms szval az aszimmetrikus kapcsolt tr a
rszecske bolyong mozgst egyenirnytja! A kilincskerk (retesz) idbeli periodicitst
a {C } kmiai ciklus biztostja, az aszimmetrikus jelleget pedig az tvonalak (filamentumok)
s a kapcsold motorok aktv kthelyeinek trbeli irnytottsga.
A mechanizmus jelentsge a mikroszkopikus rendszerekben igen nagy. Annak eldntsre, hogy a motor mennyire dugattys, mennyire reteszes, a motor (leadott) s kmiai (felvett)
teljestmnynek arnya ad becslst:
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
188
A biofizika alapjai
f dugatty
PM
P
, f retesz 1 M .
PC
PC
(9.13)
Jegyezzk meg, hogy az arnyok 1-nl (100%-nl) nagyobbak is lehetnek, de a kt mechanizmus eljeles sszege 1-et kell adjon (az energiai-megmarads trvnye rtelmben).
A kilincskerk mechanizmus pl. polimerizcit vgz motornl igen jelents, jellemz
szabadentalpia rtkekkel megadva:
GC 16 k B T , GT 20 k B T
WM GC GT 4 k B T ,
f retesz 1
( 4 )
16
125%, f dugatty
( 4 )
16
25% .
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME
9. Kollektv jelensgek
189
A K1F1A kinezin lersa korbban az ATP-ciklus szerinti 4 llapottal trtnt. Az egyszerbb 3-llapot, ASEP-szer modell (9.3.5. bra) egybevg a ksrletekkel, amelyek szerint
mind a csupasz, mind az ATP-vel kttt kinezin szisztematikusan ktdik a mikrotubulushoz
(1. llapot). A hidrolzis utn a termk instabil s hirtelen levlik a tubulusrl a foszftcsoport
levlsval ksrve. Az ADP-vel kttt kinezin visszaktdik a tubulusra s diffz bolyongst
vgez (2. llapot). Vgl az ADP felszabadul, amikor az aktivlt kinezin reteszelt mozgssal
elre lp a mikrotubulus mentn visszatrve a csupasz llapotba. A 0. llapot az res rcshely.
Barcsi, BME
tankonyvtar.ttk.bme.hu
190
10.
A biofizika alapjai
FELHASZNLT IRODALOM
1. A.L. Stanford: Foundations of Biophysics (Academic Press, 1975,
ISBN 0-12-663350-9)
2. DamjanovicsFidySzllsi (szerk.): Orvosi biofizika (Medicina Kiad, 2006, 2007,
ISBN 963-226-024-4)
3. DamjanovicsMtyus: Orvosi biofizika (Medicina Kiad, 2003,
ISBN 963-242-847-1)
4. RontTarjn: A biofizika alapjai (Semmelweiss Kiad, 2002)
5. CzhPuskr: Cellulris neurobiolgia (Dialg-Campus, 2001, ISBN: 963-912-350-1)
6. E. R. Kandel, J. H. Schwartz, T. Jessell: Principles of Neural Science (ed.4, McGraw
Hill, 2000, ISBN: 0-83-857701-6)
7. Biolgiai lexikon 1-4 (Akadmiai kiad, 1978-1987)
8. H. B. Callen: Thermodynamics and an introduction to thermostatistics (2nd ed.,
Wiley, 1985, ISBN 0-471-86256-8
9. Czirk A., Sejtek nszervezdsnek fizikja, Fizikai Szemle 2007/6, 201 (2007)
10. D. Chowdhury, A. Schadschneider, K. Nishinari, Physics of transport and traffic phenomena in biology: from molecular motors and cells to organisms, Physics of Life
Reviews, 2, 318-352 (2005); Traffic and Granular Flow05, Part II, ed: Schadschneider, Pschel, Khne, Schreckenberg, Wolf (Springer Berlin Heidelberg, 2007, ISBN:
978-3-540-47640-5)
11. A. B. Kolomeiskyy, G. M. Schtz, E. B. Kolomeiskyx, J. P. Straleyk, Phase diagram
of one-dimensional driven lattice gases with open boundaries, J. Phys. A: Math. Gen.
31, 69116919 (1998)
12. H. Wang, G. Oster, Ratchets, power strokes, and molecular motors, Appl. Phys. A
75, 315323 (2002)
13. K. Thompson, M. Stewart, J. Rodriguez, Lecture Notes Biophysics & Bio-imaging,
online jegyzet, Centenary College of Louisiana (2009)
tankonyvtar.ttk.bme.hu
Barcsi, BME