Univerzitet u Tuzli

Medicinski fakultet Tuzla

Predavanja iz predmeta Biohemija I

1. Aminokiselinskasekvencaodreuje
trodimenzionalnustrukturuproteina.
2. Funkcijaproteinazavisiodnjegovestrukture.
3. Jedanizolovaniproteinimajedinstvenuilipriblino
jedinstvenustrukturu.
4. Najvanijevezekojestabilizirajustrukturuproteina
sunekovalentneinterakcije.
5. Izmeuvelikogbrojajedinstvenihproteinskih
strukturamoemoprepoznatinekezajednike
strukturneuzorkekojinampomaudaorganiziramo
naerazumijevanjeproteinskearhitekture.

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Struktura
globularnog
proteina
himotripsina.
Radiusporedbe
veliinedesnoje
prikazanamolekula
glicina.

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Prostornirasporedatomazovesekonformacija.
Moguakonformacijaproteinaukljuujebilokoje
strukturnostanjebezcijepanjakovalentnihveza.
Konformacijakojaprevladavauodreenimuslovima
obinojetermodinamikinajstabilnija,imanajmanji
sadrajGibbsoveslobodneenergije.
Nativniproteinisuproteiniusvojojfunkcionalnoj
svijenojkonformaciji.

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Medicinski fakultet Tuzla

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Prof. Dr. Lejla Begi

Stabilnost proteina se moe definirati kao tenja proteina

da odri nativnu konformaciju.
Odreeni polipeptidni lanac moe teoretski poprimiti
bezbroj konformacija.
Konformacijska entropija i vodikove veze nastoje da
odre nesvijeno stanje proteina.
Disulfidne veze i slabe interakcije stabiliziraju nativnu
konformaciju.
Slabe interakcije su zbog svoje brojnosti dominantna
stabilizirajua snaga u strukturi proteina.

Univerzitet u Tuzli

Medicinski fakultet Tuzla

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Corey i Pauling 30-tih godina 20. vijeka analizirali

peptidnu vezu.
Atomi asocirani na peptidnu vezu su koplanarni.
Postoji rezonanca ili parcijalna podjela dva para
elektrona izmeu oksigena u >C=O i nitrogena u
>NH grupi.

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Medicinski fakultet Tuzla

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Prof. Dr. Lejla Begi

Usljed rezonancije peptidna veza ima karakter dvostruke

veze i usljed toga ne moe rotirati. Rotacija je mogua
oko N-C i C-C.

Univerzitet u Tuzli

Medicinski fakultet Tuzla

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Prof. Dr. Lejla Begi

Planarnepeptidnegrupe.
Catomisusjednihaminokiselinarazdvojenisusatrikovalentneveze.
Kimapolipeptidnoglancajeserijarigidnihpovrinakojeseizmjenjujusa
takomrotacijeokoC.
UgloviizmeuNCoznaenjekao(fi),aizmeuCC(psi).

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Dozvoljene
vrijednostiza
imoguse
odreditiiz
Ramachandran
dijagrama.

Ramachandran
dijagramzaostatke
Lalanina.

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Terminsekundarnastrukturaodnosisenaprostornu
organizacijupolipeptidnoglanca.
Jo1951.god.PaulingiCoreypredvidjelisupostojanje
sekundarnestruktureproteina,nekolikogodinaprijenego
tojeprvastrukturaproteinapotpunorazjanjena.

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Desnialfaheliks.
Povrinerigidnih
peptidnihveza
paralelnesusa
uzdunomosom
heliksa.Uzdunaosa
prikazanajekao
vertikalnitap.
Usvimproteinima
nalazisedesnialfa
heliks.

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Jedinicakojase
ponavljajejedan
okretheliksaduine
0,54nmisadri3,6
aminokiselinskih
ostataka.

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Hidrogenskevezese
formirajuizmeu
hidrogenatoma>NH
grupejedne
aminokiselinei
oksigenatomaiz
>C=Ogrupe4.
aminokiselineprema
Nterminusu.

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Alfaheliksprikazan
odozgopremadole.
Rgrupesuprikazane
kaopurpurnelopte
okrenutesuprema
vaniuodnosuna
heliksnukimu.

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Medicinski fakultet Tuzla

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Jednostavnimetod
zaodreivanje
desneilijeve
uzvojnice.

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Medicinski fakultet Tuzla

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Elektrinidipol
peptidnevezeprenosi
sedualfaheliksa
prekounutarlananih
hidrogenskihveza.
Rezultatjeheliksni
dipol.

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Medicinski fakultet Tuzla

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Prof. Dr. Lejla Begi

Stabilnostheliksazavisiodaminokiselinskesekvence.
VelikiblokGludestabilizirauzvojnicu.
VelikiblokArgiliLysdestabilizirauzvojnicu.
ProiliGlyograniavajuformiranjeuzvojnice.Prouvodi
destabilizirajuepetljeualfauzvojnicu.
Usljedzavojakritineinterakcijeseodigravajuizmeu
AKostatakameusobnoudaljenihza3ili4AKostatkas
objestrane.
NegativnonabijeneAKubliziniaminoterminusa
stabilizirajuuzvojnicuiviceversa.

Univerzitet u Tuzli

Medicinski fakultet Tuzla

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Prof. Dr. Lejla Begi

NegativnonabijeneAKublizinikarboksiterminusa
destabilizirajuuzvojnicuiviceversa.
NastabilnostalfaheliksautieveliinaitipsusjednihR
skupina.
Rostacisemoguelektrostatskiprivlaitiiliodbijati.
.

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Betakonformacija
polipeptidnihlanaca
antiparalelna

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Organizira
polipeptidnelanceu
ravnepovrine.
Kimapolipeptidnog
lancapruaseucik
cakstrukturi.
Polipeptidnilancise
smjetajujedando
drugogiobrazuju
serijenabora.

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Vodikovevezese
formirajuizmeu
susjednihsegmenata
polipeptidnihlanaca.
RgrupesusjednihAK
streizcikcak
struktureusuprotnim
smjerovima.

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Uglobularnimproteinima1/3aminokiselinanalaziseu
okretimailipetljamaukojimapolipeptidnilanacmijenja
smjer.
Vanielementikojispajajusukcesivnenizovealfaheliksa
ilibetakonformacije.
.

Univerzitet u Tuzli

Medicinski fakultet Tuzla

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Prof. Dr. Lejla Begi

Okretsadri4
aminokiselinska
ostatka.

Strukturabetaokreta.

Univerzitet u Tuzli

Medicinski fakultet Tuzla

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Prof. Dr. Lejla Begi

Cisizomerprolinaestosejavljaubetaokretima.

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Sekundarnestrukture
imajukarakteristine
uglovevezai
aminokiselinskisastav.
Ramachandran
dijagramzarazliite
strukture.

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Relativna
vjerovatnoa
javljanja
pojedinih
aminokiselinau
triosnovnatipa
sekundarne
strukture.

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Cjelokupnitrodimenzionalniaranmansvih
atomauproteinupredstavljatercijernustrukturu
proteina.
Nekiproteinisadredvailiviepolipeptidnih
lanacakojimogubitiidentiniilirazliiti.
Aranmantakvihproteinskihpodjedinicau
trodimenzionalnimkompleksimapredstavlja
kvaternernustrukturu.

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Medicinski fakultet Tuzla

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Prilikomrazmatranjaviihnivoastrukture
korisnojeklasificiratiproteineu2glavne
grupe
1. Fibrilarneproteinei
2. Globularneproteine
Fibrilarniproteinisadrepolipeptidnelance
organiziraneudugenitiilipovri,dok
globularniproteinisadrepolipeptidnelance
svijeneuglobularniilisfernioblik.

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Medicinski fakultet Tuzla

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Fibrilarniproteiniseuglavnomsastojeodjednog
tipasekundarnestrukture.Sluezapotporu,
dajuoblikivanjskuzatitukimenjaka.
Globularniproteiniestosadrenekolikotipova
sekundarnestrukture.Uovugrupuspadaju
enzimi,regulatorniproteini,transportni
proteiniidr.

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Medicinski fakultet Tuzla

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Fibrilarniproteini(skleroproteini)suprilagoeni
zastrukturnufunkciju.
Sastavljenisuodbazinihjedinicajednostavnog
ponavljajuegelementasekundarne
strukture.
Netopivisuuvodiusljedvisokekoncentracije
hidrofobnihaminokiselina.

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Medicinski fakultet Tuzla

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Prof. Dr. Lejla Begi

Alfakeratinsenalaziusisaraiininajveidiosuhe
teinekose,vunenoktiju,kandi,bodlji,papakai
vanjskogdijelakoe.
Alfakeratinjelanvelikefamilijeproteinakojisezovu
proteiniintermedijernogfilamenta(IF).
Alfakeratinskiheliksjedesnoorijentiran.Dvaheliksa
suumotanajedanokodrugogiinesuperuzvojnicu
kojajelijevoorijentirana.Dvalancasuperheliksasu
paralelnaipovezanasuprekohidrofobnihostataka.

Univerzitet u Tuzli

Medicinski fakultet Tuzla

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Dvalancasuperheliksasuparalelnaipovezanasupreko
hidrofobnihostataka.

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Strukturakose.etiriprotofibrila(32lancaalfakeratina)
kombinirajuseuintermedijernifilament.

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Medicinski fakultet Tuzla

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Prof. Dr. Lejla Begi

Jainafibrilarnihproteinapoveavasekovalentnim
poprenimvezivanjempolipeptidnihlanacaunutar
multiheliksnihsnopovaiizmeususjednihlanacau
supramolekularnomrasporedu.
Ualfakeratinupoprenedisulfidnevezestabiliziraju
kvaternernustrukturu.

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Poprenipresjek
kose.

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Trajnaondulacijapredstavljabiohemijskiinenjering.

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

KOLAGEN
Dajevrstinustrukturama.Nalazi
seusvimtkivimaiorganima
kojimadajeoblikistrukturnu
jainu.
Nalaziseuorganskommatriksu
kostiju,korneioiju,zubima,
koi.

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Strukturakolagena.Alfa
lanackolagenailikolagenski
helikspredstavlja
poliprolinskuuzvojnicutipII
kojajejedinstvena
sekundarnastrukturalijevo
orijentirana.
Povrinapeptidneveze
okomitajenaosuheliksaza
razlikuodalfaheliksagdjeje
ovavezaparalelnasaosom.

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Ujednomokretuuzvojnice
nalazesetriaminokiselinska
ostatka.
Unutarheliksanemavodikovih
veza.
Redoslijedaminokiselinaunutar
heliksaje
GlyProYiliGlyXHyp
Trilancamolekulekolagena
uvijajusejedanokodrugog
formirajuisuperheliks.

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Ostaciglicinaokrenutisuprema
unutranjostiiinehidrofobnuivicu.
Lancisuperuzvojnicemeusobnose
drehidrofobnimvezamaivodikovim
vezamakojenastajuinterakcijom
peptidnihvezasusjednihlanaca.
Trikolagenskaheliksa(tropokolagen)
stabilizirajusepomousterikih
odbijanjapirolidonskihprstenova
prolinskihihidroksiprolinskih
ostataka.

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Zaenzimsku
hidroksilacijuprolina
ilizinaneophodanje
Cvitamin.

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Strukturafibrila
kolagena.Specifini
poredakkolagenskih
molekulaibroj
poprenihvezazavisi
odvrstetkivaidaje
karakteristinu
poprenuispruganostna
elektronmikrografu.

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Sastarenjemsepoveavakrutostikrtostvezivnogtkivausljed
akumulacijekovalentnihvezaufibrilima.

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Sisarisadrevieod30strukturnihvarijantikolagena.
Genetskidefektiustrukturikolagenailustrirajupovezanost
izmeustruktureifunkcije.
Osteogenesisimperfecta(abnormalnoformiranjekostijuu
beba)iEhlersDanlosovsindrom(labavizglobovi)posljedica
suzamjenejednogostatkaglicinasaveomaminokiselinom.
Glicinnemoebitizamijenjensadrugomaminokiselinom,a
danedoedobitnihtetapostrukturukolagena.

Univerzitet u Tuzli

Medicinski fakultet Tuzla

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Kolagenjeglikoprotein.
Sintetiziraseufibroblastima.Nakonsintezepolipeptidse
hidroksilira,glikoziliratestvaratrostrukuuzvojnicu.
Izfibroblastaseizluujeuoblikuprokolagena.
Nakonskraivanja,hidrolizompeptidnihveza,nastaju
snopovitropokolagenakojiselocirajunastaninoj
povriniuoblikuzrelogkolagenskogvlakna.

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Fibroinsvile
proizvodeinsektii
pauci.Polipeptidni
lancisupretenou
betakonformaciji.
BogatisuGlyiAla.

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Lancifibroina
(plavi)pauka
prikazaniobojenim
elekronskim
mikrografom.

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Elastinseubrajaufibrilarneproteinezbogfunkcijei
relativnenetopivosti.
Nalaziseuligamentima,pluima,zidovimaarterijai
koi.
Elastinnemapravilnusekundarnustrukturu.
Sadrinesreenustrukturuukojojsuaminokiselinski
ostacivisokomobilni.
Proteinposjedujekinetikislobodneiekstenzivno
poprenovezanestrukturekojemudajuelastinost
slinugumi.

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Dezmozin
kovalentno
povezuje
poprene
polipeptidne
lanceu
vlaknima
elastina.

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Medicinski fakultet Tuzla

Predavanja iz predmeta Biohemija I

HumaniserumalbuminMr64500ima585
aminokiselinskihostatakaujednomlancu.

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Tercijernastruktura
mioglobinakita.
Kendrewisar.50tih
godina20.vijekaotkrili
strukturumioglobina
pomoudifrakcijexzraka.
Prviputjeuoenaveza
izmeustruktureifunkcije.

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Metodezaodreivanje3Dstruktureproteinasudifrakcijaxzrakai
NMRspektroskopija.

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Uzorcizadifrakcijuxzrakapripremajuseodkristalaproteina.

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Komplementarna
metodazaodreivanje
trodimenzionalne
strukture
makromolekulaje
NMR.
Prednostovetehnikeu
odnosunadifrakcijux
zrakajedaseizvodina
makromolekulamau
otopini.

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Globularniproteiniimajurazliite
trodimenzionalnestrukture.
Citohromcjehemprotein.
Sastojiseodjednog
polipeptidnoglancasa104AK
ostatka(Mr12.400).
40%lancajeuoblikualfaheliksa

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Lizozimjeenzim
Sastojiseodjednog
polipeptidnoglancasa
oko129AKostataka(Mr
14.600).
40%lancajeuoblikualfa
heliksa,a12%uobliku
betakonformacije.
etiridisulfidneveze
stabilizirajusstrukturu.

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Ribonukleazajemaliglobularni
proteinkojiseizluujeiz
pankreasautankocrijevo.
Sastojiseodjednog
polipeptidnoglancasaoko124
AKostataka(Mr13.700).
26%lancajeuoblikualfa
heliksa,a35%uoblikubeta
konformacije.
etiridisulfidnevezestabiliziraju
strukturu.

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Analizamnogobrojnihglobularnihproteinaotkrivazajednike
strukturneuzorke.
Razumijevanjekompletne3Dstrukturegradiseprekoanalize
njenihdijelova.
Supersekundarnestrukture,motiviilinabori(folds)su
posebnostabilniaranmaninekolikoelemenatasekundarne
struktureivezaizmeunjih.
ProteiniizgraeniizviestotinaAKostatakaestosesvijaju
udvijeiliviestabilnihglobularnihjedinicakojesezovu
domeni.Razliitidomeniobinoimajuirazliitefunkcije.

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

StrukturnidomeniutroponinuC.Ovajproteinkojiveekalcijumimaodvojene
domenezavezanjekalcijuma.Domenisuoznaeniplavoiljubiasto.

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Medicinski fakultet Tuzla

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Stvaranjeveihmotivaizmanjih./jeestmotivkojise
stvaraponavljanjemjednostavnihmotivatzv.petlji.

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Proteinskimotivisuosnovazastrukturnuklasifikacijuproteina
(SCOP).
SCOPjebazapodatakaukojojsusviproteinipodijeljeniu4klase:
1. sve
2. sve
3. /
4. +
Usvimproteinimapostojimanjeod1000uzorakasvijanja.
.

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Proteinisasignifikantnomslinouprimarnesekvencei/ili
dokazivoslinomstrukturompripadajuistojfamiliji.
Dvijeiliviefamilijasmalomslinouuprimarnojsekvenci
mogukoristitiisteglavnestrukturnemotiveitakoimati
funkcionalnuslinost.Ovakvefamilijegrupirajuseu
superfamilije.

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Proteinskimotivisuosnova
zastrukturnuklasifikaciju
proteina(SCOP).

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Proteinskekvaternernestruktureproteuseodjednostavnihdimera
dovelikihkompleksa.
Multimersadriod2100podjedinica.
Oligomersadrismonekolikopodjedinica.
Protomerjejedinicakojaseponavlja.

Univerzitet u Tuzli

Medicinski fakultet Tuzla

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Kvaternernastrukturadeoksihemoglobina.

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

.Identinepodjedinicemultimernihproteinaaraniranesuu

ogranienisetsimetrinihuzoraka.

Simetrijamoebitirotacijskaiheliksna.
Postojegraniceuveliiniproteina.

Veliinajelimitiranasa2faktora:
1.kapacitetomnukleinskihkiselinadakodirajuproteine
2.tanousintezeproteina

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Virusnikapsidi.Proteinskiomotapoliovirusaimaikosaedarskustrukturu.

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Virusnikapsidi.
Mozainivirus
duhanaima
heliksnustrukturu.

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Gubitakstruktureproteinadovodido
gubitkafunkcije.
Denaturacijajenaruavanje
trodimenzionalnestruktureproteina
kojidovodidogubitkafunkcije.
Denaturacijajeireverzibilanproces
Ponovnouspostavljanjenativne
konformacijeuklanjanjemdenaturanata
nazivaserenaturacija(desnoAnfinsenov
eksperimentsaribonukleazom).

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Medicinski fakultet Tuzla

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Denaturiraniproteinpostojikaoskupdjeliminosvijenih
oblika.
Odvijanjeproteinajekooperativniproces.
Toplinadjelujenahidrogenskeveze.
EkstremnipHmijenjanetonabojproteina.Dovodido
elektrostatskihodbijanjaicijepanjahidrogenskihveza.
Organskaotapala(alkohol,aceton),urea,gvanidini
deterdentidjelujunahidrofobneinterakcije.

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Medicinski fakultet Tuzla

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Prof. Dr. Lejla Begi

Polipeptidisesvijajubrzopomouprocesakojiseodvija
korakpokorak.
Svijanjejehijerarhijskiproces.Prvoseformiralokalna
sekundarnastruktura,azatiminterakcijamanaveim
rastojanjimastvarajusupersekundarnestrukture.Processe
nastavljaformiranjemdomenaikonanonastajekompletno
svijeniprotein.

Univerzitet u Tuzli

Medicinski fakultet Tuzla

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Kompjuterskasimulacijasvijanjaproteina.

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Medicinski fakultet Tuzla

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Prof. Dr. Lejla Begi

Svijanjezapoinjespontanimkolapsompolipeptidau
kompaktnostanjekojeseformirahidrofobniminterakcijama
izmeunepolarnihostataka.
Stanjehidrofobnogkolapsamoeimativisoksadraj
sekundarnestrukture,alibonilanciaminokiselinanisuu
potpunostifiksirani.
Kolapsnostanjeestosenazivamoltenglobulestaljene
globule.

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Termodinamika
proteinskogsvijanja
moeseprikazati
pomoutzv.lijevka
slobodneenergije.

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Defektiusvijanju
proteinamogubiti
molekularnaosnovaza
velikibrojgenetsih
poremeajauljudi.
Cistinufibrozuizaziva
poremeajnaproteinu
kojisezoveCFTR
transmembranski
regulatorprovodljivosti
kojiimaulogukanalaza
hloridneione.

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Mutacijakojadovodido
cistinefibrozeje
delecijaPhenapoziciji
508uCFTR.Mutacija
izazivaneadekvatan
foldingproteina.
Mutacijeukolagenu
dovodedobolesti.
Prionskebolestinastaju
zbogpogrenogsvijanja
prionskogproteina.To
sudegenerativnebolesti

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Prionskebolestinastaju
zbogpogrenogsvijanja
prionskogproteina.To
sudegenerativnebolesti
mozga,spongiformne
encefalopatijeukoje
spadaju:
kravljeludilo,
CreutzfeldtJacobova
bolest,scrapie,kuru.

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Medicinski fakultet Tuzla

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Nekimproteinimajepotrebnapomoprilikomsvijanja.
Molekularniaperonisuproteinikojireagujusa
djeliminosvijenimilineadekvatnosvijenim
proteinima.Takoerseveuzaproteinedabisprijeili
njihovoprijevremenosvijanje.Veusezanesvijena
mjestabogatahidrofobnimostacima.
PrvaklasaaperonasuHsp70heatshockproteini.
Drugaklasasutzv.aperonini.Tosuproteinski
kompleksineophodnizasvijanjeelijskihproteinakoji
senemoguspontanosviti.

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Naslicije
prikazanciklini
putkojim
aperoniveui
oslobaaju
polipeptide.

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Naslicije
prikazana
uloga
aperonina
usvijanju
proteina.

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi

Univerzitet u Tuzli

Predavanja iz predmeta Biohemija I

Povrinai
uzdunipresjek
GroEL/GroES
kompleksa
E.coli.

Medicinski fakultet Tuzla

Prof. Dr. Lejla Begi